标准的-定量Q-PCR仪器的具体使用步骤和操作方法
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荧光定量PCR仪操作规程1.开机程序(1)打开电脑,进入桌面。
(2)打开PCR仪器的电源开关(注:该仪器有两个电源开关,一个控制PCR 仪,一个控制光源系统)。
(3)双击桌面上的软件图标,点击“yes”,进入软件的主菜单。
(4)或打开开关,视窗上显示“SELF TEST”,显示10秒中后,显示RUN-ENTER 菜单:“RUN ENTER PROGRAM”准备执行程序。
2.关机程序(1) 保存数据,退出软件的主菜单。
(2) 关掉电脑,关闭PCR仪器的电源开关。
3.程序文件的设置及打开(1)实验程序已预先设定点击软件左方主目录中的“Library”,进入该界面后。
选择“ViewProtocol(查看协议)”页面,根据路径,找到预存的程序文件。
放入样本管,关紧盖子。
运行已经编好的程序,则直接按《Proceed》,用箭头键选择已储存的程序,按《Proceed》,则屏幕显示:“-ENABLE DISABLE HEATED LID” 按《Proceed》选择ENABLE,则开始执行程序。
(2)创建新的程序文件点击软件左方主目录中的“Workshop”,进入该界面。
选择“Edit Prot ocol”页面,输入相应的温度、时间、重复的循环数(Repeats),增加或删除步骤(Cycle和Step),在“Select data collection step(s)”中选择需要进行荧光收集的步骤。
完成后,在“Protocol Filename”中输入程序的文件名,点击“Save this protocol”。
如果要输入新的程序,则在RUN-ENTER菜单上用箭头键选择ENTER PROGRAM,按《Proceed》,屏幕显示“ -NEW LIST EDIT DELET”,按《Proceed》,1)选择NEW,命名新的程序,最多8个字母,输入后按《Proceed》确认。
输入程序步骤:名字输入后,显示“ STEP1TEMP GOTO OPITON END”,按《Proceed》则可以输入温度(0~100℃),按《Proceed》确认后,则可以输入孵育时间,用《Select》键移动光标,输入数字,完成后按《Proceed》确认,跳到下一步,输入方式同上。
pCR仪操作流程PCR(聚合酶链反应)仪是一种广泛应用于分子生物学实验室的设备,用于扩增和复制DNA序列。
正确的操作流程对于获得准确的实验结果至关重要。
本文将介绍pCR仪的基本操作流程,以确保您能够正确操作和利用该设备。
1. 准备实验材料和试剂在进行pCR实验之前,确保准备齐全所需的实验材料和试剂。
这些包括DNA模板、引物、dNTPs(脱氧核苷酸三磷酸盐)、聚合酶、反应缓冲液、电泳试剂等。
确保所使用的试剂和材料都在保质期内,并按照实验要求进行储存。
2. 设定PCR参数根据实验需要,设置PCR参数,包括温度和时间控制。
一般来说,PCR反应需要进行一系列的循环,每个循环包括三个主要的步骤:变性、退火和延伸。
根据模板DNA的GC含量和引物的特异性,可以确定合适的变性温度和时间,引物的退火温度和延伸温度。
确保参数的设定符合实验要求。
3. 加入试剂和混合根据PCR反应的体积要求,将所需试剂和混合物精确配制。
通常情况下,将DNA模板、引物、dNTPs、聚合酶和反应缓冲液组合在一起,并轻轻混合。
通过离心操作,使反应混合物沉淀在管底,减少液面上的气泡。
4. 加热反应混合物将反应混合物置于已预热的PCR仪中。
确保反应管的盖子紧闭,以防止外界的污染和蒸发。
根据设定的PCR参数,在仪器中进行加热和循环操作。
确保温度的变化符合实验要求,以保证DNA的扩增和复制过程能够进行顺利。
5. 检测PCR产物PCR反应完成后,取出反应管,并将反应产物进行检测。
最常用的方法是利用琼脂糖凝胶电泳,将PCR产物在电泳仪中进行分离。
通过比较PCR产物与分子量标准品之间的迁移距离,可以确定扩增的目标DNA片段的大小。
6. 结果分析和记录根据电泳结果,分析PCR反应的结果。
正常情况下,目标DNA片段应该有明确的条带出现。
记录结果,并进行数据分析和解读。
如果实验结果不符合预期,可能需要重新优化PCR反应的条件或调整试剂的浓度。
总结:pCR仪操作流程涉及到实验前的准备、PCR参数的设定、试剂的加入和混合、反应体系的加热、PCR产物的检测、结果分析和记录等步骤。
荧光定量PCR仪使用方法
(1)开机:荧光定量PCR仪、与之相连的电脑
(2)放样:点击PCR仪上的“Eject”,放入已离心过的八连管样品,再缓慢关闭接样台。
(3)点击电脑上的“E盘”,找到“qRT-PCR“文件夹,找到相对应的应用程序,如做蓝耳,就选择”PRRSV”文件夹中的程序;腹泻则为“PEDV”.
(4)编辑:点开任一程序后,点击“Sample Editor“编辑所放样品的地址以及信息。
(5)存档:点击“File“选择”Saveas“,存到相对应的文件夹;务必修改名称(日期、时间)。
(6)传出:打开编辑好的程序,点击“T ool”→“Instrument Manager”,待灯变绿后(5-7s),再点击“Send/Receive Experiment”,找到要运行的程序,再点击>,便传到荧光定量PCR仪上。
(7)运行:选中荧光定量PCR仪上要工作的程序,点击“Start”开始工作。
(8)传入:待PCR结束后,打开运行程序,点击“T ool”→“Instrument Manager”,待灯变绿后(5-7s),再点击“Send/Receive Experiment”,选中相对应的文件夹,找到已结束程序,再点击<,便传到电脑上。
(9)实验结果分析:点击已保存已完成的程序,点击“Analysis”,便可进行实验结果的分析。
(10)关机:点击PCR仪上“Eject”,取出八连管;点“Exit”→”YES’退出,关闭电源,拔下插头即可。
另用专用塑料袋套上,以免灰尘侵入缩短使用寿命。
Q-PCR仪器使用具体步骤1.首先将Mx3000P电源打开,大约1min,将会听到启动的声音。
然后打开桌面上的“Mx3000P软件”,确定软件界面右下面的联机标志呈绿色。
如果不是绿色而是红色,软件会提示Instrument to PC communications have failed ,这时只需稍等片刻,待仪器自检完成,会自动连接计算机;2.在“Mx3000P软件”的“New Experiment type”弹出框中选择需要的实验类型:通常选择“SYBR? Green(with dissociationcurve),点击“OK键”;3.确定“Mx3000P软件”界面上面(Selection命令下)的卤钨灯已经打开。
绿色说明已经打开,黄色说明正在预热,红色说明没有打开;4.最好在仪器与光源预热20min后开始实验;5.在“Plate Setup”里,对96孔板的各空进行设定。
设定Standard(标准品)、NTC(阴性对照)、Unknown(样品)等,并选择正确的通道(FAM,HEX,ROX,Cy5).对于标准品,设定其模板浓度,还需要对不同的样品进行编号。
或者点击“Import”,导入以前使用的96孔板设定。
具体为:●首先选择Welltype中的Unknown,然后选择下方的ROX、SYBR;●选择Reference dye的ROX●用Replicate symbol对每个样品进行标记(1,2,3,XXX等)6. 切换至“Thermol pro ”界面,进行PCR 循环的设定。
可以改变各者点击“Import ”, 一步结束时采集荧光信号,采集荧光信号,一般用作溶解曲线分析。
7. “ Thermol pro ”设定结束后,点击软件界面右上方的“Run ”,软件界面右下方会出现运行状态显示框“Run Status ”, 可以选择“Turn lamp off at end of run ”,点击“start ”开始实验,弹出“保存文件的对话框”,选择后保存,弹出另外一个对话框,选择第二个(预热之后跑),另外在运行过程中可通过点击“Add cycles ”来增加扩增的循环数,在PCR 运行结束后软件将自动关闭卤钨灯。
PCR仪操作规程一、PCR仪的准备工作1.将PCR仪放置在坚固平稳的工作台上。
2.确保PCR仪能够正常通电,并连接稳定的电源。
3.检查PCR仪是否有足够的耗材,如:PCR试剂盒、PCR板、PCR管等。
4.确保PCR仪的外壳干净整洁,无尘。
5.检查PCR仪的温控系统是否正常运作,温度探头是否正确连接。
二、程序设置1.打开PCR仪的电源,等待仪器启动。
2.进入PCR仪的操作界面,在设置中选择需要运行的PCR程序。
3.设置PCR程序的相关参数,包括:反应体系、产物大小、温控方式、梯度设置等。
4.确认无误后,保存设置。
三、样本处理1.根据实验需求,准备所需的样本和试剂。
2.将待测样本和控制样本分别加入PCR管中,并按照试剂盒说明书的要求,分别加入PCR试剂。
3.小心混匀,避免产生气泡。
4.使用电动移液器,将样品转移到PCR板的相应孔中。
5.确保试管盖扣紧并密封,避免蒸发和污染。
四、样品放置1.使用PCR板架,将PCR板放入PCR仪中。
2.确保PCR板放置稳定,不晃动。
3.在关闭仪器时,检查所有的孔位是否已经满。
4.根据实验要求选择合适的PCR模式。
五、运行PCR程序1.确保PCR仪处于关机状态,将PCR板放入PCR仪中。
2.关闭PCR仪的盖子,并轻轻按下,确保盖子紧密贴合。
3.打开PCR仪的电源,启动PCR程序。
4.开始运行程序后,定期检查PCR仪的运行状态,确保温度的稳定和反应的正常进行。
5.在PCR反应过程中不要移动或震动PCR仪。
6.必要时对PCR反应进行监测,可使用实时荧光PCR功能。
六、PCR反应后处理1.PCR反应结束后,停止PCR程序运行。
2.打开PCR仪盖子,取出PCR板。
3.将PCR板置于洗涤台上,进行样本的后续处理。
4.根据实验要求,可以选择对PCR产物进行凝胶电泳分析或进一步测序。
七、清洁和维护1.每次使用后,将PCR仪的工作台面、盖子等部位用75%乙醇擦拭干净。
2.定期清洁PCR仪的内部,检查温控系统的工作情况。
PCR仪操作指南
引言:
PCR(聚合酶链反应)是一种常用的分子生物学技术,用于检测和扩
增特定DNA序列。
PCR仪是进行PCR实验的必备设备之一,本操作指南将
详细介绍PCR仪的使用流程和操作注意事项,旨在帮助使用者正确操作PCR仪,提高实验的成功率。
一、实验前的准备工作:
1.根据实验需要,选择合适的引物,设计PCR反应体系。
2.准备好PCR反应物,包括DNA模板、引物、核酸酶、脱氧核苷酸三
磷酸、聚合酶等。
3.根据PCR仪的使用手册,检查设备的工作状态,保证设备正常运行。
4.准备PCR反应管,确保干净无污染。
二、操作步骤:
1.打开PCR仪电源,启动设备。
根据使用手册,设置合适的温度和时
间参数,并选择合适的热启动模式(立即开始或延迟开始)。
2. 调整PCR仪的温度设置。
根据PCR实验需要,设置热循环的温度
范围和时间参数,包括Denaturation(变性)、Annealing(退火)和Extension(延伸)步骤的温度和时间。
3. 预热PCR仪至所需的初始温度。
根据实验需要,将PCR仪的温度
调整至Denaturation步骤所需的温度(通常为95℃)。
4.添加PCR反应物至PCR反应管中。
按照预先设计的PCR反应体系,
将DNA模板、引物、核酸酶、脱氧核苷酸三磷酸、聚合酶等加入PCR反应
管中。
5.将PCR反应管放置在PCR仪的样品架中。
确保PCR反应管放置稳定,避免管内反应物溢出。
6.关闭PCR仪的上盖。
一、总RNA提取流程适量超低温冻结的动物组织,研钵内加液氮研磨,至粉末状♓加入适量(100mg组织加1ml)RNAiso Plus,将研磨成粉末状的样品完全覆盖♓室温静置,直至样品完全融化,再用研杵继续研磨至裂解液呈透明状♓将匀浆液转移至离心管,室温静置5min,12000g 4℃离心5min♓小心吸取上清液,移入新的离心管中(切勿吸取沉淀)♓加入氯仿(为RNAiso Plus 的1/5 体积量),盖紧离心管盖,用手剧烈震荡15s♓室温静置5min,12000g 4℃离心15min♓匀浆液分为3层,吸取无色上清液至新离心管中♓上清液中加入等体积的异丙醇,上下颠倒离心管充分混匀,在15-30℃下静置10min♓12000g 4℃离心10min,离心后,底部会出现沉淀,即为RNA♓小心弃去上清,沿管壁加入1ml 75%乙醇,轻轻上下颠倒洗涤离心管管壁♓12000g 4℃离心15min,小心弃去乙醇,超净台内干燥2-5min♓加入适量(一般40-50ul试沉淀大小)DEPC处理水中,必要时可用移液枪轻轻吹打沉淀♓待RNA沉淀完全溶解后于-80℃保存二、RT-PCR1、冰上在一个管子中制备如下反应混合物:2、轻柔混合,微量离心机离心3-5秒。
70°C孵育混合物5min,冰冷却,短暂离心,收集沉淀。
3、管子置于冰上,按指定顺序加入以下成份:1. 合成适合PCR 扩增的第一链cDNA①冰上在一个管子中制备如下反应混合物:模板RNA*:总RNA 0.1-5μg或poly(A)+ RNA 10ng- 0.5μg或特异RNA 0.01pg - 0.5μg引物:oligo(dT)18引物(0.5μg/μl) 1μl或随机六聚物引物(0.2μg/μl) 1μl或序列特异性引物15–20pmolDEPC处理过的水to 12μl轻柔混合,微量离心机离心3-5秒。
②70°C孵育混合物5min,冰冷却,短暂离心,收集沉淀。
QS7 实时荧光定量PCR仪操作规程及注意事项
操作程序
1.开机顺序:先开电脑,待电脑完全启动后再开启仪器。
等到仪器自检完成进入菜单界面后(约三分钟),即可打开QS7软件,进行实验。
2.开启QS7软件:双击QS7软件icon,点击instrument console,将net work 上仪器add to My Instrument。
3.当软件开启后,按培训规范设定软件,plate, run method。
结果保存在D:/q-PCR data 文件夹中。
否则仪器维护过程中丢失,平台概不负责。
4.实验结果必须刻录在自备光盘中,严禁使用U盘。
5.关机顺序:确认实验结束后,点击instrument console,将My Instrument上仪器remove from 到net work。
然后关闭QS7软件,在关掉仪器电源,关闭电脑。
6.实验结束后带走自己的样品板,清理实验台。
注意事项:仪器使用者必须预约使用。
1.使用正确的Block, Heated Cover和Tray Adapter:
QS7可以使用96wells(0.2ml)和384wells两种模块,按照培训操作正确更换模块。
2.使用正确的实验耗材:
QS7可以使用:96孔板(0.2ml);0.2ml光学反应板;0.2ml八联管;384孔板。
3.在样品制备和配置反应液过程以及仪器操作过程中,必须戴无粉手套。
4.按照正确的开关机顺序操作,有助于延长仪器使用寿命,减少仪器故障频率。
范围和适用性本实验适用于使用StepOnePlus™实时PCR仪对DNA PE、DNA PE Index、SE 文库以及Exon Capture组、转录组、表达谱、Small RNA组、表观遗传组等制备的文库进行上机前的精确定量。
摘要荧光定量PCR实验是以Agilent 2100 Bioanalyzer对文库的检测结果为参照, 使用StepOnePlus™实时PCR仪对文库进行定量,得出待测文库浓度,为之后的Cluster制备提供浓度依据。
该实验的主要内容包括:(1)梯度稀释标准品;(2)按实验要求稀释样品;(3)配制反应预混液;(4)加样;(5)设置反应程序;(6)运行实验;(7)分析实验结果,计算待测样品浓度。
整个流程需要3-4小时。
缩写词和SOP中专业术语的解释实验材料及方法1 实验试剂和耗材1.1试剂表1-1 实验所需试剂1.2 耗材表1-2 实验所需耗材2 实验仪器设备表2-1 实验所需仪器设备3 实验操作流程3.1 填写Q-PCR实验登记表样品的交接按照《质控组样品交接管理规程》执行。
实验前,先在“表单准备区”将要检测的样品在《Q-PCR实验登记表》中填写好,并根据“文库交接检测”文件夹中《____组文库检测结果》中的待测样品的顺序按顺序填到《Q-PCR 实验登记表》上,并在右上角注明批次后打印出来。
然后将需要检测的样品的样品名和文库号按照《Q-PCR实验登记表》上的顺序粘贴到“文库核对&存放位置”文件夹中的《文库检测前核对表》Excel表中,等待核对样品信息。
3.2 稀释标准品开始实验前,到-20℃冰箱和冰柜中将实验所需的标准品和样品取出,并按Q-PCR实验登记表上的顺序排好,并到表单准备区,用扫描枪将样品的文库号扫描到“文库核对&存放位置”文件夹中的《文库检测前核对表》Excel表中进行核对,核对结果为“错错错错”,则样品不正确需重新找取样品信息相同的样品;核对结果为“对”,则样品正确。
PCR仪的使用步骤及原理引言聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,简称PCR)是一种在分子生物学研究中广泛应用的技术。
PCR仪作为PCR操作的关键工具,能够快速无误地扩增目标DNA 序列,为科学研究和临床诊断提供了重要的支持。
本文将介绍PCR仪的使用步骤及原理。
PCR仪的使用步骤以下是PCR仪的使用步骤:步骤一:准备反应体系1.准备PCR反应液,包括DNA模板、引物、核酸酶、缓冲液等。
2.将反应液分配到PCR试管中,确保每个试管的反应体系一致。
3.在一个试管中加入水作为空白对照。
步骤二:设置PCR仪的程序1.打开PCR仪,确保仪器处于正常工作状态。
2.设置PCR仪的反应程序,包括温度、时间等参数。
根据不同的PCR实验设计,设置合适的程序。
步骤三:装载样品1.将准备好的PCR试管放置在PCR仪的样品架上。
2.检查样品架是否放置正确,确保试管紧密接触PCR仪的加热块。
步骤四:运行PCR程序1.关闭PCR仪的盖子,启动程序运行。
2.PCR仪将根据设定的程序依次进行加热、变性、退火和延伸等反应步骤。
3.在PCR反应结束后,PCR仪会保持在设定温度,以保持PCR产物的稳定。
步骤五:PCR产物分析1.关闭PCR仪的电源,打开PCR试管。
2.可通过凝胶电泳、PCR产物可视化试剂等方法对PCR产物进行分析。
3.根据实验需求,进一步处理PCR产物。
PCR仪的原理PCR仪采用了温度循环技术,利用特定的酶(聚合酶)和核酸引物来引导DNA链的复制。
其原理主要包括以下三个步骤:1.变性(Denaturation):通过升高温度(通常为95℃),使DNA双链分离成两条单链DNA。
2.引物结合(Annealing):降低温度(通常为55-60℃),使引物与目标序列的单链DNA互补结合。
3.延伸(Extension):增加温度(通常为72℃),使聚合酶在引物的引导下合成新的DNA链。
通过不断重复这三个步骤,PCR仪可以在短时间内扩增特定的DNA序列。
Q-PCR仪器使用具体步骤
1.首先将MX3000P电源打开,大约1min,将会听到启动的声音。
然后打
开桌面上的“ MX3000P软件”,确定软件界面右下面的联机标志呈绿色。
如果不是绿色而是红色,软件会提示Instrumdht to PC
Com muni catio ns have failed , 一| 这时只需稍等片刻,待仪器自检完成,会自动连接计算机;
2.在“ Mx3000P软件”的“ New Experiment type ”弹出框中选择需
要的实验类型:通常选择“SYBRGreen(with dissociation
curve), 点击“ OK键”;
3.确定“Mx3000P软件”界面上面(Selection命令下)的卤钨灯已经
打开。
绿色说明已经打开,黄色说明正在预热,红色说明没有打开;
4.最好在仪器与光源预热20min后开始实验;
5.在“ Plate Setup ”里,对96孔板的各空进行设定。
设定
Standard(标准品)、NTC(阴性对照)、Unknown样品)等,并选择正确的通道(FAM,HEX,ROX,Cy5.对于标准品,设定其模板浓度,还需要对不同的样品进行编号。
或者点击“Import ” ,导入以前使用的96孔板设定。
具体为:
首先选择Welltype中的Unknown然后选择下方的ROXSYBR;
选择Referenee dye 的ROX
用Replicate symbol对每个样品进行标记(1,2,3 ,XXX等)
6.切换至“ Thermol profile setup ”界面,进行PCF循环的设定。
可以改变各项温度、时间、循环数等,或者删除、添加特定步骤和循环。
或者点击“Import ”,导入以前设定的PC A程序。
表示表示在这一步结束时采集荧光信号N D * 代表在这一步的全
过程中都采集荧光信号,一般用作溶解曲线分析。
7.“Thermol profile setup ”设定结束后,点击软件界面右上方
的“ Run",软件界面右下方会出现运行状态显示框“ Run
Status ”
可以选择“ Turn lamp off at end of run ”,点击“ start ”开始
实验,弹出“保存文件的对话框”,选择后保存,弹出另外一个对话框,选择第二个(预热之后跑),另外在运行过程中可通过点击
“Add cycles ”来增加扩增的循环数,在PCR运行结束后软件将自动关闭卤钨灯。
8.在PCR运行的过程中可以点击“ RawData plots ” ,观察样品的实
时扩增原始结果。
9.PCR运行结束后,点击“ Analysis ” ,在点击“ Results ” ,软件
将会自动进行结果分析,也可以点击「
手动进行结果分析。
结果分析:
1.将Q-PCF结果从电脑中拷出来,在电脑上打开文件;
2.点击菜单栏的“ File ”命令,选择“ Con vert to New Experime
nt
type ”子命令,弹出“ Selection new Experiment type ”对话框;
3.在“Selection newExperiment type ” 对话框中选择“Comparative
Quantitation(Calibrator) 命令,将文件转化成分析结果的模式,点击OK键;
4.弹出“ Mx3000P软件”界面,在“ Plate Setup ”界面中“首先选
择Welltype中的Un known然后选择下方的ROX SY BR选择
Reference dye 的ROX
5.将96孔板中的Actin 样品选中,然后在Nomalizing assay 中选
择SYBR;
6.然后对相同模板的样品标记相同的字母,对相同引物的样品标记相同
的数字;
7.最后任意(通常选最左侧的)选择一列,在Well type 中选择
“Calibrator ” , 然后可以进行所含特异引物的样品的选择,选择后,点击“ Analysis ”命令,在点击“ Results ”即可对结果进行可视化的各项分析。