OsRUS2.1酵母双杂交猎物载体的构建及其细胞毒性和自激活作用检测
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人肝再生增强因子的酵母双杂交诱饵载体的构建及自激活作用检测佟明华;陈思强;孔祥平;姚汝华;易学瑞;杨联萍【期刊名称】《实用临床医学(湖北)》【年(卷),期】2003(017)002【摘要】目的构建肝再生增强因子的酵母双杂交诱饵质粒,为进一步研究其相互作用蛋白奠定基础。
方法将人肝再生增强因子的编码序列重组入pGBKT载体中,经酶切及序列分析鉴定构建正确后,转化酵母AHl09菌株,转化子在SD/-His/-Trp选择培养基上培养;滤纸法β-半乳糖苷酶活性测定;Westem blot检测目的蛋白表达情况。
结果正确地构建了人肝再生增强因子的酵母双杂交诱饵质粒pGBKT7-hALR,其酵母AHl09转化菌在SD/-Trp培养基上30℃培养65h,长出φlmm菌落,而在SD/-Trp-His培养基上不生长,β-半乳糖苷酶活性检测呈阴性。
Westem blot结果显示目的蛋白以35KD的融合蛋白形式表达。
结论诱饵质粒pGBKT7-hALR对宿主菌AHl09没有毒性作用,能稳定表达目的蛋白,不能自身激活报告基因,可用于酵母双杂交的筛选工作。
【总页数】3页(P16-18)【作者】佟明华;陈思强;孔祥平;姚汝华;易学瑞;杨联萍【作者单位】解放军第458医院传染病中心,广州510602;毕南理工大学生物工程系【正文语种】中文【中图分类】Q784【相关文献】1.玉米ZmMPK5酵母双杂交诱饵载体的构建及自激活作用检测 [J], 马芳芳;王瑞云;蒋明义2.西瓜食酸菌TA基因酵母双杂交诱饵载体的构建及其自激活作用的检测 [J], 胡金凤;黄成文;刘君3.VSV糖蛋白酵母双杂交诱饵载体的构建及其自激活作用的检测 [J], 韩岩岩;宋德光4.组蛋白酵母双杂交诱饵载体的构建及其自激活作用检测 [J], 李玮妮;李法曾;张浩;陈立涵;程龙;徐小洁;刘婕;叶棋浓5.OsRUS1酵母双杂交诱饵载体的构建及其自激活作用检测 [J], 潘家强;侯学文因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
VSV糖蛋白酵母双杂交诱饵载体的构建及其自激活作用的检测韩岩岩;宋德光【摘要】构建水泡性口炎病毒糖蛋白(VSV-G)酵母双杂交诱饵载体,检测其在酵母细胞中的表达和自激活作用,为进一步研究酵母双杂交系统筛选与VSV-G相互作用蛋白奠定基础。
通过RT-PCR方法从水泡性口炎病毒(VSV)克隆糖蛋白(G)基因, BamH I和Sal I双酶切后连接诱饵载体pSos,获得诱饵质粒pSos-VSV-G,经测序鉴定后pSos-VSV-G转化到酵母菌株cdcH25(α),在营养缺陷培养基中观察pSos-VSV-G的自激活作用和毒性作用,同时利用蛋白印迹法分析诱饵蛋白的表达。
成功扩增VSV-G基因,并准确克隆入pSos中,诱饵载体pSos-VSV-G成功转化到酵母菌株cdcH25(α)中,经表型筛选检测无自激活作用和毒性作用,蛋白印迹法检测证实pSos-VSV-G在酵母细胞中表达诱饵蛋白。
可以利用酵母双杂交系统筛选与VSV-G相互作的蛋白质。
%It was to construct a bait vector for vesicular stomatitis virus glycoprotein(VSV-G)and detect its protein expression and self-activation activity in yeast cells, as a basis for further study of screening and VSV-G protein interaction in two hybrid system. Fragment of VSV-G gene were amplified using RT-PCR and directly ligated to pSos vector, insert-contained plasmid was confirmed by restriction endonuclease analysis and DNA sequencing. The self-activation and toxicity of the bait plasmid transformed into the yeast cellscdcH25(α)was observed in selective culture medium, and the bait protein was confirmed by Western blot. Results showed that VSV-G gene was found in the reconstructed plasmid pSos-VSV-G by sequencing. Yeast two-hybrid tests showed that yeast ce lls cdcH25(α)transfected with pSos showed that VSV-G had no self-activation and toxicity, the expression of bait protein was confirmed by Western blot. The yeast two-hybrid system can be applied to screen the interacting proteins of VSV-G.【期刊名称】《生物技术通报》【年(卷),期】2014(000)004【总页数】6页(P109-114)【关键词】水泡性口炎病毒;糖蛋白;酵母双杂交;诱饵载体【作者】韩岩岩;宋德光【作者单位】遵义医学院公共卫生学院,遵义563003;吉林大学畜牧兽医学院,长春 130062【正文语种】中文水泡性口炎病毒(Vesicular stomatitis virus,VSV)是引起人和多种哺乳动物水泡性口炎(Vesicular stomatitis,VS)的病原[1]。
酵母双杂交诱饵表达载体pGBKT7-cide-3的构建、鉴定以及毒性、自激活酵母双杂交诱饵表达载体pGBKT7-cide-3的构建、鉴定以及毒性、自激活效应的检测闵婕;李青;马楠;康艳霞;李娜【期刊名称】《现代肿瘤医学》【年(卷),期】2013(021)003【摘要】Objective;To construct a bait vector containing human cide -3 gene in yeast two -hybrid system in order to screen the human liver cDNA library. Methods; The fragment including all exons of cide -3 gene was amplified by RT-PCR and was inserted into the multiple cloning sites of the shuttle vector pGBKT7. After confirmation with restricted endonuclease digestion and sequence analysis,by using PEG/LiAC method,the plasmid pGBKT7 - cide -3 was transformed into yeast AH109. The plasmid and protein isolated from the positive yeast AH109 clone was tested its expression,toxicity and transcriptional activation. Results:The human cide -3 cDNA was amplified. The restrictive endonuclease digestion and DNA sequencing proved that the plasmid pGBKT7 - cide - 3 was obtained. The yeast AH109 clone transformed with pGBKT7 - cide - 3 was screened out by the SD/ - Trp nutritional media. Sequence analysis revealed that the fragment was correctly inserted into pGBKT7 with a right reading frame and its expression in yeast was verified. Conclusion; The bait plasmid pGBKT7 -cide -3 constructed expresses correctly,and can not activate the transcription of。
SIGIRR胞内区酵母双杂交诱饵质粒的构建及自激活作用检测陈旭昕;冯华松;段蕴铀;吴学玲;钱桂生【期刊名称】《重庆医学》【年(卷),期】2014(43)10【摘要】目的:构建单免疫球蛋白白细胞介素-1受体相关蛋白(SIGIRR)胞内区酵母双杂交诱饵质粒,并检测其是否存在自激活作用。
方法聚合酶链反应(PCR)扩增人SIGIRR胞内区基因片段(480~1230 bp),并将此基因片段重组入pSos 载体中,构建诱饵质粒pSos-SIGIRR ,经酶切及测序鉴定构建正确后,将重组质粒与对照质粒共转化感受态酵母菌cdc25H ,接种于25℃SD/Glucose(-UL)和SD/Galactose(-UL)平板以及37℃ SD/Glucose(-UL)和SD/Galactose(-UL)平板上,连续观察6 d酵母菌生长状况;用Western blot法检测目的蛋白表达情况。
结果正确构建了人SIGIRR胞内区酵母双杂交诱饵质粒pSos-SIGIRR ,pSos-SIGIRR在酵母双杂交系统中无自激活及毒性作用。
Western blot结果显示,目的蛋白以170×103的融合蛋白形式表达。
结论诱饵质粒pSos-SIGIRR可应用于酵母双杂交系统中,为在人肺互补脱氧核糖核酸(cDNA )文库中寻找与SIGIRR相互作用蛋白奠定了重要基础。
%Objective To construct the bait plasmid of pSos-single immunoglobin IL-1 receptor related protein (SIGIRR) in Cy-toTrap yeast two hybrid system ,and to test its self-activation .Methods The cDNA fragments of SIGIRR(480 -1 230 bp) were amplified from pReceiver-LV19-SIGIRR and ligated into the bait plasmid pSos to generate the plasmid pSos-SIGIRR .The pSos-SI-GIRR was identified by DNA sequencing and dual-site endonuclease digestion .Thenthe recombinant plasmid and control plasmid were introduced into the yeast cell cdc25H .The transformants were inoculated on plates of 25 ℃/SD/Glucose(-UL) ,25 ℃/SD/Ga-lactose(-UL) ,37 ℃ /SD/Glucose(-UL) and 37 ℃ /SD/Galactose ,res pectively and the proliferation ability of transformant was ob-served for 6 d .The Western blot was adopted to detect the expression of target protein .Results The pSos-SIGIRR vector was cor-rectly constructed and proved of no self-activation and toxic action .The Western blot showed that the target protein was expressed in a form of fusion protein of 170KD .Conclusion The bait plasmid containing SIGIRR cytoplasmic tail can be applied to the yeast two-hybrid system and lays the important foundation for seeking the interacting protein with SIGRR from the human lung cDNA li-brary in .【总页数】4页(P1164-1167)【作者】陈旭昕;冯华松;段蕴铀;吴学玲;钱桂生【作者单位】中国人民解放军海军总医院呼吸内科,北京100037;中国人民解放军海军总医院呼吸内科,北京100037;中国人民解放军海军总医院呼吸内科,北京100037;第三军医大学新桥医院呼吸内科,重庆400037;第三军医大学新桥医院呼吸内科,重庆400037【正文语种】中文【相关文献】1.玉米ZmMPK5酵母双杂交诱饵载体的构建及自激活作用检测 [J], 马芳芳;王瑞云;蒋明义2.西瓜食酸菌TA基因酵母双杂交诱饵载体的构建及其自激活作用的检测 [J], 胡金凤;黄成文;刘君3.VSV糖蛋白酵母双杂交诱饵载体的构建及其自激活作用的检测 [J], 韩岩岩;宋德光4.防御素HNP-3成熟肽酵母双杂交诱饵质粒的构建及自激活和毒性检测 [J], 马生秀;邓璐霞;罗林;彭媛媛;路会侠;张敏;熊文碧;冯云;吴琦;王伯瑶;黄宁5.香蕉束顶病毒nsp酵母双杂交诱饵质粒的构建及自激活验证 [J], 王祥;张秀春;余乃通;梁洁;周朋;刘志昕因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
盐藻酵母双杂交诱饵载体的构建及自激活鉴定李照熙;杨瑞;林艳;杨保胜;王天云【期刊名称】《生物技术通报》【年(卷),期】2011(000)012【摘要】构建用于杜氏盐藻核基质结合区结合蛋白(matrix attachment region binding protein,MBP)酵母双杂交试验的诱饵栽体,进行自激活及毒性验证.以含有盐藻MBP质粒为模板,经PCR扩增后连接pMD 18-T栽体,经测序鉴定正确后,EcoR Ⅰ/Nde Ⅰ双酶切获得目的基因MBP,克隆入经同样双酶切的酵母栽体pGBKT7,转化酵母菌株AH109及Y187,检测其自激活以及毒性.结果显示,成功扩增出盐藻MBP基因,重组质粒pGBKT7-MBP经酶切、测序表明序列正确,转化酵母菌株无自激活,无毒性.【总页数】4页(P188-191)【作者】李照熙;杨瑞;林艳;杨保胜;王天云【作者单位】新乡医学院生命科学技术系,新乡453003;新乡医学院生命科学技术系,新乡453003;新乡医学院生物化学与分子生物学教研室,新乡453003;新乡医学院生物化学与分子生物学教研室,新乡453003;新乡医学院生物化学与分子生物学教研室,新乡453003【正文语种】中文【相关文献】1.酵母双杂交诱饵表达载体pGBKT7-cide-3的构建、鉴定以及毒性、自激活效应的检测 [J], 闵婕;李青;马楠;康艳霞;李娜2.人肠三叶因子酵母双杂交诱饵载体的构建及其自激活作用鉴定 [J], 王林;孙勇;王臻;张勇;吴炜;吕尚军;彭曦3.人DOC-2氨基端PID结构域酵母双杂交诱饵载体的构建及自激活鉴定 [J], 刘淑娟;杨力军;王涛;吴元明4.杜氏盐藻S腺苷高半胱氨酸水解酶酵母双杂交诱饵载体的构建及自激活和毒性检测 [J], 柴丹丹;李庆华;阎赟梦;毛丽红;李靓;朱立强;薛乐勋5.杜氏盐藻寡糖基转移酶亚基stt3a酵母双杂交诱饵载体的构建及自激活和毒性检测 [J], 侯永杰;李杰;李庆华;王建人;薛乐勋因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
酵母双杂实验步骤2.1.1酵母双杂交2.1.1.1Gateway入门克隆设计Gateway引物时,在上游引物的5'端加上B1序列:GGGG-ACA-AGT-TT G-TAC -AAA-AAA-GCA-GGC-TNN-,下游引物的5'端加上B2序列:GGGG-ACC-ACT-TT G-T AC-AAG-AAA-GCT-GGG-TN-。
其中,5'-GGGG序列是保护碱基,防止引物的重要部分被降解,下划线加粗的部分是在整个的Gateway克隆中可以保存下来的序列,3'端的碱基N是为了保证经过入门载体构建目的载体时阅读框的正确性,一般建议为C。
通过PCR扩增获得带有att B位点的基因片段,扩增体系和条件见3.2.2.2,其中将退火温度改为65℃。
获得扩增产物后对其进行回收纯化,测定纯化后DNA 的质量和浓度后进行下一步的BP反应,反应体系如下:att B-PCR产物(≥10 ng/μL)1-7μLpDONR221 (150 ng/μL)1μLTE buffer, pH 8.0 补足8μL将上述混合物加入离心管中,加入2μL BP反应酶,加入之前需将其在涡旋仪上轻轻振荡两次,所有组分混匀离心后,25℃反应1h,加入1μL蛋白酶K后,混匀离心,37℃反应10min终止BP反应,将BP 反应产物参照3.2.2.6进行转化,由于pDONR221载体为Kan抗性,所以选用含有50μg/mL Kan抗生素的LB平板进行阳性克隆筛选,参照3.2.2.7检测阳性克隆,然后根据3.2.2.8中的方法提取重组质粒,测定质量和浓度后送至测序公司进行测序。
进行BP反应时,需注意以下几项:(1)对于BP反应来说,最高效的是采用线性的att B-PCR产物和超螺旋的att P入门载体;(2)为了提高BP反应的效率,可以将建议的25℃反应1h适当延长至4-6h,可以将效率提高2-3倍,或者延长至过夜反应,可以将效率提高5-10倍,对于长片段克隆来讲,适当的延长反应时间是非常必要的;(3)提高体系中PCR产物的量可以增加反应效率,但每10μL体系中PCR产物最好不要超过250ng。
酵母双杂交实验报告一、实验目的酵母双杂交技术是一种用于研究蛋白质之间相互作用的分子生物学方法。
本次实验的目的是通过构建酵母双杂交载体,转化酵母细胞,筛选出与目标蛋白相互作用的蛋白质,从而深入了解蛋白质在细胞内的功能和调控机制。
二、实验原理酵母双杂交系统基于真核转录调控因子的结构和功能特点。
转录调控因子通常由两个结构域组成:DNA 结合结构域(BD)和转录激活结构域(AD)。
这两个结构域单独存在时不能激活转录,但当它们在空间上足够靠近时,则能够协同作用,激活报告基因的表达。
在酵母双杂交系统中,将编码目标蛋白(“诱饵”蛋白)的基因与BD 构建融合表达载体,将待检测的蛋白(“猎物”蛋白)的基因与 AD 构建融合表达载体。
如果“猎物”蛋白与“诱饵”蛋白相互作用,那么 BD 和 AD 就能够在空间上靠近,从而激活报告基因的表达。
通过检测报告基因的表达情况,就可以判断“猎物”蛋白与“诱饵”蛋白是否存在相互作用。
三、实验材料与试剂1、菌株与载体酵母菌株:AH109载体:pGBKT7(含 BD 序列)、pGADT7(含 AD 序列)2、工具酶与试剂盒限制性内切酶:EcoRI、BamHI 等T4 DNA 连接酶质粒提取试剂盒PCR 试剂盒3、培养基YPD 培养基SD 缺失培养基(Leu、Trp、His、Ade 等)4、试剂氨苄青霉素卡那霉素XαGal3-AT(3-氨基-1,2,4-三唑)5、实验仪器恒温培养箱离心机PCR 仪电泳仪凝胶成像系统四、实验步骤1、目的基因的扩增通过 PCR 技术从 cDNA 文库或基因组 DNA 中扩增出目标蛋白和待检测蛋白的编码基因。
设计合适的引物,在引物的 5'端引入限制性内切酶的酶切位点。
2、载体的构建分别用限制性内切酶对目的基因和载体进行双酶切,然后通过 T4 DNA 连接酶将目的基因连接到载体上。
将连接产物转化到大肠杆菌感受态细胞中,筛选出阳性克隆,提取质粒进行酶切鉴定和测序验证。
Peroxiredoxin Ⅱ酵母双杂交诱饵载体的构建及自激活效应检测刘萍;奚玲;陶海鹰;卢运萍;马丁【期刊名称】《武汉大学学报:医学版》【年(卷),期】2007(28)4【摘要】目的:应用酵母双杂交体系,构建人peroxiredoxinⅡ(PrxⅡ)蛋白酵母双杂交诱饵载体,并检测该载体的表达产物对酵母细胞有无毒性作用及对报告基因有无激活作用。
方法:用PCR扩增PrxⅡ基因cDNA中编码完整开放阅读框的基因片段;将该基因片段与pGBKT7载体定向重组;用酶切和测序鉴定重组质粒;用醋酸锂法(Li-Ac)将序列正确的重组质粒pGBKT7-PrxⅡ转化入AH109酵母菌株,在缺陷性培养基上观察pGBKT7-PrxⅡ在AH109中的表达情况,检测诱饵载体有无毒性作用和单倍体及二倍体自激活功能。
结果:成功构建pGBKT7-PrxⅡ重组质粒。
转化有重组质粒和pGBKT7空载体的酵母菌都能在SD/-Trp/X--αgal平板上长出粉红色菌落,在SD/-His/-Trp/X--αgal,SD/-Ade/-Trp/X--αgal平板上不能生长,两种酵母菌在SD/-Trp液体培养基中培养16 h后,菌液的OD600均值均为0.9,说明AH109[pGBKT7-PrxⅡ]转化成功,对酵母菌株AH109无毒性且不具自主激活报告基因的功能。
结论:成功获得了在酵母细胞中正确表达,并对酵母细胞无毒性且未自主激活报告基因的诱饵表达载体pGBKT7-PrxⅡ,该载体可作为酵母双杂交系统中的“诱饵”,该诱饵载体可应用于酵母双杂交系统3筛选PrxⅡ相互作用蛋白。
【总页数】6页(P413-417)【关键词】Peroxiredoxin;Ⅱ;酵母双杂交系统;基因;克隆【作者】刘萍;奚玲;陶海鹰;卢运萍;马丁【作者单位】华中科技大学同济医学院附属同济医院肿瘤生物医学中心;武汉大学人民医院骨科【正文语种】中文【中图分类】Q554.6;Q782【相关文献】1.羊布鲁氏菌16M Omp25蛋白酵母双杂交诱饵表达载体的构建及其毒性和自激活效应检测 [J], 屈海龙;王海浪;李晓燕;张瑞;王秀然;陈思;钱晶;王兴龙2.CMV2b和TOMV CP酵母双杂交诱饵表达载体的构建及自激活效应检测 [J], 王子华;郑银英;崔百明;向本春3.酵母双杂交诱饵表达载体pGBKT7-cide-3的构建、鉴定以及毒性、自激活效应的检测 [J], 闵婕;李青;马楠;康艳霞;李娜4.香蕉ROP1基因酵母双杂交体系的诱饵载体构建及毒性与自激活效应检测 [J], 王卓;杨景豪;张建彬;刘菊华;金志强;徐碧玉5.拟南芥MAPKKK16酵母双杂交诱饵载体的构建及毒性和自激活效应检测 [J], 雷柯煜;邓治;吴文冠;程汉因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
小鼠Dnd1酵母双杂交系统诱饵载体的构建及自身激活检测3张 菁1,罗 畅2,丁小凤2,张 健23,彭小宁13(1.湖南师范大学医学院,湖南长沙 410006;2.湖南师范大学生命科学学院基因敲除与转基因动物实验室,湖南长沙 410081) [摘要] 目的:构建用于酵母双杂交系统的诱饵载体pDBLeu 2Dnd1,并检测其是否有自身激活作用。
方法:设计引物引入Sal Ⅰ、Not Ⅰ酶切位点,使用PCR 方法从质粒pcDN A3.12Dnd1中扩增小鼠Dnd1基因的编码区序列,连至p MD182T 载体。
酶切验证及测序正确后,用Sa l Ⅰ,Not Ⅰ内切酶分别消化p MD 2T 2Dnd1及p DBLeu 载体而后构建诱饵载体pDBLeu 2Dnd1,并检测其在GI BC O /BRL 公司的酵母双杂交系统中的自身激活作用。
结果:成功构建诱饵载体pD BLeu 2Dnd1,并证明其在该系统中无自身激活作用。
结论:pDBLeu 2Dnd1可应用该酵母双杂交系统筛选与之相互作用的蛋白。
[关键词] Dnd1基因;酵母双杂交系统;自身激活作用[中图分类号]Q789 [文献标识码]A [文章编号]1673-016x (2008)01-0001-04C on str ucti on an d Act i va tio n of “Ba it P l a s m i d ”C on ta in ing M ouseDnd1Gen e i n Y ea st Two 2hybr i d Syste mZHA N G J ing 1,LUO Chang 2,D I N G Xiao 2feng 2,ZHA N G J ian 23,PENG Xiao 2ning 13(1.M edi cine School ,Hunan N or ma lU niversity ,Changsha 410006,China;2.Gene Kno ck 2out and T ransgenic Ani m a l s L ab,College of Science,Hunan N or m al U niversity ,Changsha 410081,China )[Abstra ct]O bject ive To construct a ba it vect or c ontaining mouse Dnd1gene in yeast t wo 2hybrid sistem in or der to sc r een the c DN A libr a r y of mouse 10.5d embryo .M ethod s The DNA fragment of coding Dnd1wa s am 2plified by PCR with de signed p ri m er fr om the pla s m id of pc DNA3.12Dnd1and then cl oned int o pMD182T vec t or.After verified with restric ti on endonuclease digesti on of Sal Ⅰand Not Ⅰ,the right gr ag m ent of Dnd1gene dete r 2m ined by sequencing wa s subcloned int o the bait vect or of pDBLeu .Then right fragment of r ecombinant pla s m id pDBLeu 2D nd1tested by both the sa m e endonuclease and sequence analysis was transf or m ed int o the yeast cell MaV203and its self 2activation was tested .R esu lt s The pDBL eu 2Dnd1plas m id wa s successfully c onstructed and had no aut onomous activati on.C onc lusi on The bait pla s m id of pDBLeu 2Dnd1was pr oved t o be suitable for the further research on the interac t ors with DND1in the yeast t wo 2hybrid sestem.[Key words]Dnd1gene;yeast t wo 2hybrid system;self 2activa tion 小鼠Dnd1(dead end homol og 1,Dnd1)基因是导致睾丸生殖细胞瘤(testicula r ger m cell tumors,TG CTs )的候选因子[1]。
酵母双杂交系统检测相互作用原理基本流程及注意事项基本原理酵母双杂交系统由Fields和Song等首先在研究真核基因转录调控中建立 i 。
典型的真核生长转录因子,如GAL4、GCN4、等都含有二个不同的结构域: DNA结合结构域(DNA-binding domain)和转录激活结构域(transcription-activating domain)。
前者可识别DNA上的特异序列,并使转录激活结构域定位于所调节的基因的上游,转录激活结构域可同转录复合体的其他成分作用,启动它所调节的基因的转录。
二个结构域不但可在其连接区适当部位打开,仍具有各自的功能。
而且不同两结构域可重建发挥转录激活作用。
酵母双杂交系统利用杂交基因通过激活报道基因的表达探测蛋白-蛋白的相互作用。
主要有二类载体: a 含DNA -binding domain的载体; b 含DNA-activating domain的载体。
上述二类载体在构建融合基因时,测试蛋白基因与结构域基因必须在阅读框内融合。
融合基因在报告株中表达,其表达产物只有定位于核内才能驱动报告基因的转录。
酵母双杂交系统的建立与发展是基于对真核生物转录调控起始过程的认识。
真核生物中存在一种上游激活序列(upstream activating sequence, UAS),其作用是和激活蛋白结合并大大增加启动子的转录速度,从而在转录水平对靶基因表达进行调控。
真核细胞转录起始需要反式转录激活因子的参与。
很多真核生物的位点特异性转录激活因子是组件式的,通常具有两个可分割开的结构域,即DNA特异性结合结构域(DNA-binding domain, BD)与转录激活结构域(transcriptional activation domain, AD)。
这两个结构域即使分开时仍各具功能,互不影响。
但一个完整的某个特定基因的转录激活因子必须同时含有这两个结构域,否则无法完成激活功能。
只有将这两部分通过适当的途径在空间上接近才能恢复其激活转录的能力。
NDRG家族成员酵母双杂交诱饵载体的构建,表达及自激活检测张璟;张健;刘娜;王立峰;李霞;刘新平;药立波【期刊名称】《第四军医大学学报》【年(卷),期】2005(026)005【摘要】目的:构建NDRG家族4个成员的酵母双杂交诱饵载体,验证其在酵母中的表达并检测其自激活作用,为用酵母双杂交方法寻找与NDRG家族相互作用的分子奠定实验基础. 方法:用PCR方法获得NDRG家族4个成员cDNA全长,将4个片段按正确读框插入酵母表达质粒PGBKT7中,经限制性酶切鉴定正确后,PEG/LiAc法转化酵母菌株AH109,Western验证4个分子的正确表达,用表型筛选法及颜色筛选法检测其自激活作用. 结果:构建了NDRG家族4个成员的酵母双杂交诱饵载体,并在酵母中正确表达,除NDRG4-B外NDRG1,2,3均无自激活作用. 结论:NDRG1,2,3可以用酵母双杂交方法钓取与之相互作用的分子. NDRG4-B 由于有自激活作用不能用于酵母双杂交的筛选.【总页数】4页(P385-388)【作者】张璟;张健;刘娜;王立峰;李霞;刘新平;药立波【作者单位】第四军医大学基础部生物化学与分子生物学教研室,陕西,西安,710033;第四军医大学基础部生物化学与分子生物学教研室,陕西,西安,710033;第四军医大学基础部生物化学与分子生物学教研室,陕西,西安,710033;第四军医大学基础部生物化学与分子生物学教研室,陕西,西安,710033;第四军医大学基础部生物化学与分子生物学教研室,陕西,西安,710033;第四军医大学基础部生物化学与分子生物学教研室,陕西,西安,710033;第四军医大学基础部生物化学与分子生物学教研室,陕西,西安,710033【正文语种】中文【中图分类】Q781【相关文献】1.甘蔗条纹花叶病毒 HC-Pro、P3N-PIPO、CP 和 VPg基因酵母双杂交诱饵表达载体的构建及自激活检测 [J], 翟玉山;彭磊;杨永庆;邓宇晴;程光远;郑艳茹;徐景升2.拟南芥At4g05060基因的酵母双杂交诱饵表达载体的构建、表达及自激活检测[J], 萨娜瓦尔·艾比布拉;陈全家3.西瓜食酸菌TA基因酵母双杂交诱饵载体的构建及其自激活作用的检测 [J], 胡金凤;黄成文;刘君4.红麻酮脂酰辅酶A合成酶(KCS)酵母双杂交诱饵载体构建及自激活检测 [J], 张高阳;邓接楼;黄思齐;李德芳5.拟南芥MAPKKK16酵母双杂交诱饵载体的构建及毒性和自激活效应检测 [J], 雷柯煜;邓治;吴文冠;程汉因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
酵母双杂交步骤酵母双杂交是一种常用的实验方法,用于研究基因之间的相互作用以及确定基因功能。
这种方法可以帮助科学家更好地理解生物学系统的复杂性,并为疾病的研究提供重要线索。
下面将介绍酵母双杂交的步骤及其意义。
进行酵母双杂交实验需要准备两个重要的构建:酵母表达载体和融合蛋白质的基因。
酵母表达载体通常包含启动子、选择标记基因和复制起点等元件,可以在酵母细胞中稳定表达外源基因。
而融合蛋白质的基因则是由研究人员设计合成,其中包含感兴趣的基因片段与激活结构域的融合。
将融合蛋白质的基因克隆到酵母表达载体中,构建成表达载体。
然后将这些表达载体分别转化到两株不同的酵母菌株中,形成两个亲本菌株。
接着,将这两个亲本菌株进行交配,使它们在同一酵母细胞内共存。
接下来,通过培养这个双杂交菌株,观察融合蛋白质是否发生相互作用。
如果两个融合蛋白质相互结合,可能会激活报告基因的表达,从而产生可检测的信号。
通过检测这些信号,可以初步判断这两个蛋白质之间是否存在相互作用。
为了验证这种相互作用的真实性,通常需要进行一系列的对照实验和进一步的验证。
例如,可以利用突变体蛋白质来确认相互作用位点,也可以通过共沉淀实验证明这种相互作用在细胞内是否真实发生。
酵母双杂交实验是一种简单而有效的方法,可以帮助科学家快速筛选出潜在的蛋白质相互作用,并为后续的深入研究提供基础。
通过这种方法,研究人员可以更好地理解生物学系统的复杂性,揭示基因之间的相互关系,为疾病的研究和治疗提供新的思路。
总的来说,酵母双杂交是一种重要的实验方法,对于生物学研究具有重要意义。
通过这种方法,科学家们可以揭示基因之间的相互作用,探索生物学系统的奥秘,为人类健康和疾病治疗提供新的思路和方法。
希望未来能有更多的科研工作者投入到这一领域,共同推动生命科学的发展和进步。
IHHNV编码蛋白酵母双杂交诱饵载体的建及自激活研究彭敏;苏绍萍;陈秀荔;杨春玲;朱威霖;王建平;曾地刚;李咏梅;赵永贞【期刊名称】《西南农业学报》【年(卷),期】2016(029)008【摘要】应用酵母双杂交体系,构建凡纳滨对虾IHHNV 3个开放阅读框的酵母双杂交诱饵载体,并对该载体的表达产物对酵母细胞的毒性及其对报告基因的自激活作用进行检测,为运用酵母双杂交文库筛选与病毒互相作用的蛋白提供参考.对凡纳滨对虾IHHNV病毒3个开放阅读框的基因片段进行PCR特异性扩增,并运用In-Fusion技术将该基因片段与双酶切的酵母双杂交诱饵质粒pGBKT7进行连接,获得重组质粒pGBKT7-CP、pGBKT7-NS1和pGBKT7-NS2,并进行自激活和毒性检测.结果表明,pGBKT7-CP、pGBKT7-NS1和pGBKT7-NS2等3个重组质粒对MEL1报告基因无自激活性;对AUR1-C报告基因无自激活作用,pGBKT7-CP,pGBKT7-NS1,pGBKT7-NS2和空载体的酵母菌在SD/-Trp液体培养基中培养16 h后,菌液的OD600均大干0.8,说明诱饵载体无毒性且不具自主激活报告基因的功能,所获得的无自激活作用的诱饵载体可用于酵母双杂交试验.【总页数】5页(P2004-2008)【作者】彭敏;苏绍萍;陈秀荔;杨春玲;朱威霖;王建平;曾地刚;李咏梅;赵永贞【作者单位】广西壮族自治区水产科学研究院,广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西南宁 530021;广西壮族自治区水产科学研究院,广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西南宁 530021;广西壮族自治区水产科学研究院,广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西南宁 530021;广西壮族自治区水产科学研究院,广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西南宁 530021;广西壮族自治区水产科学研究院,广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西南宁 530021;广西大学动物科学技术学院,广西南宁530005;宁波市海洋与渔业研究院,浙江宁波315010;广西壮族自治区水产科学研究院,广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西南宁 530021;广西壮族自治区水产科学研究院,广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西南宁 530021;广西壮族自治区水产科学研究院,广西水产遗传育种与健康养殖重点实验室,广西南宁 530021【正文语种】中文【中图分类】S945.1【相关文献】1.加工番茄PVY N:O HC-Pro、STV RdRp酵母双杂交r诱饵载体的构建及自激活验证 [J], 路遥;周东;郑银英2.Stra8酵母双杂交诱饵载体的构建及自激活活性分析 [J], 郑英;张露萍;王海燕3.PIAS-NY酵母双杂交诱饵载体的构建及其自激活活性分析 [J], 郑英;张露萍;王海燕;孙红亚;梁虹;王建军4.红麻酮脂酰辅酶A合成酶(KCS)酵母双杂交诱饵载体构建及自激活检测 [J], 张高阳;邓接楼;黄思齐;李德芳5.拟南芥MAPKKK16酵母双杂交诱饵载体的构建及毒性和自激活效应检测 [J], 雷柯煜;邓治;吴文冠;程汉因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
OsRUS2.1酵母双杂交猎物载体的构建及其细胞毒性和自激活作用检测潘家强;侯学文【摘要】采用 PCR 技术扩增水稻根UV‐B 敏感基因2.1(ROOT UV‐B S EN S IT IV E 2.1,RUS2.1)四个不同片段[OsRUS2.1(1‐1317),OsRUS2.1(1‐138),OsRUS2.1(139‐879),OsRUS2.1(880‐1317)],连接到 T 载体pMD18‐T‐Simple 上,测序无误后分别亚克隆到猎物表达载体 pGADT7上.结果表明:四个OsRUS2.1基因片段的表达载体构建成功,读码框正确;分别转化这四个猎物表达载体于酵母感受态细胞 Y187中,用 LacZ 、M EL1活性检测法和营养缺陷型培养基SD‐Leu‐DO 培养法进行自激活检测和毒性检测,结果表明构建的四个OsRUS2.1不同片段的猎物表达载体对酵母菌株 Y187均没有转录激活活性和毒害作用,可用于后续研究.%Four fragments of rice(Oryza sativa)ROOT UV‐B SENSIT IV E 2 .1(OsRUS2 .1) ,OsRUS2 .1(1‐1317) , OsRUS2 .1(1‐138) ,OsRUS2 .1 (139‐879) ,OsRUS2 .1 (880‐1317) ,were amplified by PCR from cloned OsRUS2 .1 plasmid ,and were ligated with pMD18‐T‐simple vector ,then transformed to E .coli TOP10 competent cell .The posi‐tive clones were selected and sequenced .The confirmed fragments were subcloned to prey vector pGADT 7 .The four constructed pGADT7 prey vectors were further confirmed by enzyme digestion and sequencing . The confirmed 4 types of pGADT7 prey vectors were transformed to Y187 yeast c ompetent cells .The self‐activation and toxicity of the plasmids to host yeast Y187 were detected by LacZ and MEL1 activity assays and culturing in auxotroph medium SD‐Leu ‐DO .Results showed that the fourconstructed plasmids had no self‐transcriptional a ctivity and not toxicity to yeast strain Y187 ,and they could be used in the following yeast two‐hybrid experiments .【期刊名称】《广西植物》【年(卷),期】2013(000)001【总页数】6页(P76-81)【关键词】水稻根对敏感基因 2.1;猎物载体;酵母双杂交;自激活;毒性检测【作者】潘家强;侯学文【作者单位】华南农业大学生命科学学院分子植物生理研究室,广州 510642;华南农业大学生命科学学院分子植物生理研究室,广州 510642; 华南农业大学生命科学学院植物功能基因组与生物技术重点实验室,广州 510642【正文语种】中文【中图分类】Q782UV-B是太阳辐射的组成部分,它能够穿过大气层到达地表,但到达地表的UV-B 辐照强度与季节、云层厚度以及大气层臭氧含量有关。
近几十年来,随着大气中臭氧含量逐渐下降导致到达地表的UV-B强度有增强的趋势(任健等,2005)。
UV-B 对植物的生理效应根据UV-B辐射强度的不同具有明显的双重效应,即在强度较高时(>1 μmol·m-2·s-1)就作为逆境因子对植物造成伤害;在较低强度下(<1μmol·m-2·s-1)却是一个信号调控因子参与植物的多种光形态建成(Frohnmeyer & Staiger,2003)。
Brown & Jenkins(2008)的研究表明,在拟南芥中存在UVR8依赖和UVR8非依赖的UV-B信号传导途径,近年来对UVR8依赖的UV-B信号传导途径研究取得了很大进展,相继发现这一途径中的几个成员(Brown et al.,2005;Gruber et al.,2010),特别是确认UVR8就是UV-B受体(Rizzini et al.,2011)及其感受UV-B的机理(Wu et al.,2012)。
UVR8非依赖的UV-B信号传导途径的研究进展较慢,对于这一途径涉及哪些基因,目前尚不清楚。
ROOT UV-B SENSITIVEs(RUSs)是近年来在拟南芥中发现的与极低强度UV-B信号传导有关的基因(Tong et al.,2008),但它与目前已知的UV-B信号传导途径的关系目前在进一步研究中。
RUS的共同特点是具有一个功能未知的结构域DUF647,采用酵母双杂交技术表明AtRUS1与AtRUS2能通过该结构域互作(Leasure et al.,2009)。
在拟南芥研究的基础上,经生物信息学分析发现水稻基因组中也具有6个OsRUS基因。
我们已用OsRUS1构建了酵母双杂交诱饵载体(潘家强等,2012),并从水稻cDNA文库中筛选到了一些互作基因,研究结果在进一步分析中。
OsRUS2.1开放阅读框(ORF)全长1 317 bp,结构域DUF647位于138~879 bp,为研究OsRUS2.1是否能与OsRUS1互作以及它们之间通过哪一个结构域互作,我们在已构建好的四个OsRUS1不同片段酵母双杂交诱饵载体的基础上,本文根据OsRUS2.1结构域DUF647的分布情况,构建了四个OsRUS2.1不同片段酵母双杂交猎物载体,并进行毒性及自激活检测,以便用于后续的酵母双杂交技术实验。
酵母(Saccharomyces cererisiae)Y187菌株,pGADT7质粒,阳性对照质粒pGBKT7-53和pGADT7-T,阴性对照质粒pGBKT7-Lam(美国Clontech公司),大肠杆菌TOP10菌株及已克隆的OsRUS2.1基因pMD18-T-S-BamHI-OsRUS2.1cDNA-1317-HindIII由本实验室保存;YNB和蛋白胨(Difco公司),SD-Leu-DO(美国Clontech公司),酵母提取物(OXOID公司),DNA限制性内切酶和T4DNA连接酶(TaKaRa公司),KOD-Plus-Neo DNA聚合酶和dNTPs(TOYOBO公司),DS2000 Marker(东盛生物公司),DNA胶回收试剂盒(普博欣生物公司),2X power Taq PCR Mix(Microanalysis公司),X-β-gal(BBL 公司),X-α-gal(GOLDBIO公司)。
本实验所用的引物名称及引物序列:OsRUS2.1 cDNA-EcoRI-1-F:5′-CGAATTCATGAACATACTCGAGAGGATAC-3′;OsRUS2.1 cDNA-BamHI-138-R:5′-AGGATCCTTACAGAGACTCTGCCGGCGT-3′;OsRUS2.1 cDNA-EcoRI-139-F:5′-GGAATTCAAAGTTATCCAAGATTCGAGAC-3′;OsRUS2.1 cDNA-BamHI-879-R:5′-TGGATCCGGAAACCTTTCCACTCTTGAT-3′;OsRUS2.1 cDNA-EcoRI-880-F:5′-GGAATTCAGCCCAGCTGAGCTAAGATATCG-3′;OsRUS2.1 cDNA-BamHI-1317-R:5′-CGGATCCTCATAAAGCACTACCGCTGA-3′;Matchmaker 5′ AD LD-insert screening amplimer:5′-CTATTCGATGATGAAGATACCCCACCAAACCC-3′;Matchmaker 3′ AD LD-insert screening amplimer:5′-GTGAACTTGCGGGGTTTTTCAGTATCTACGATT-3′。
以本实验室已克隆并测序的pMD18-T-S-BamHI-1-OsRUS2.1cDNA-1317-HindIII为模板,分别以OsRUS2.1cDNA-EcoRI-1-F/OsRUS2.1 cDNA-BamHI-1317-R,OsRUS2.1cDNA-EcoRI-1-F/OsRUS2.1cDNA-BamHI-138-R,OsRUS2.1 cDNA-EcoRI-139-F/OsRUS2.1cDNA-BamHI-879-R,OsRUS2.1cDNA-EcoRI-880-F/OsRUS2.1cDNA-BamHI-1317-R为引物,采用高保真酶KOD-Plus-Neo DNA聚合酶反应体系,扩增获得OsRUS2.1cDNA 的四个不同片段。
将这四个片段加A后与pMD18-T-Simple连接,转化E.coli TOP10感受态,筛选获得阳性克隆,并经测序确认无突变。
将上述克隆并验证的pMD18-T-S-EcoRI-1-OsRUS2.1cDNA-1317-BamHI、pMD18-T-S-EcoRI-1-OsRUS2.1cDNA-138-BamHI、pMD18-T-S-EcoRI-139-OsRUS2.1cDNA-879-BamHI和pMD18-T-S-EcoRI-880-OsRUS2.1cDNA-1317-BamHI及空载体pGADT7用EcoRI/BamHI双酶切,经琼脂糖凝胶电泳检测酶切正确后,按照常规分子生物学连接、转化、筛选,获得pGADT7-EcoRI-1-OsRUS2.1cDNA-1317-BamHI、pGADT7-EcoRI-1-OsRUS2.1cDNA-138-BamHI、pGADT7-EcoRI-139-OsRUS2.1cDNA -879-BamHI和pGADT7-EcoRI-880-OsRUS2.1 cDNA-1317-BamHI 四个重组表达载体,分别采用双酶切鉴定及测序确认读码框正确。