核酸分离纯化及鉴定
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核酸提取与纯化试剂配方核酸提取和纯化是分子生物学研究中常用的重要步骤。
核酸提取与纯化试剂包括溶解、提取、纯化和测定等步骤。
下面将详细介绍核酸提取与纯化试剂的配方和使用方法。
1. 细胞裂解缓冲液的配方:- 25mM Tris-HCl pH 8.0- 50mM EDTA- 1% SDS- 100μg/ml RNase A将以上试剂按比例混合制备成细胞裂解缓冲液,用于裂解细胞并保护核酸的完整性。
2. 提取缓冲液的配方:- 0.1M Tris-HCl pH 8.0- 0.14M NaCl- 0.001M EDTA- 1% SDS将以上试剂按比例混合制备成提取缓冲液,用于将细胞裂解液中的核酸与蛋白质分离。
3. 过滤缓冲液的配方:- 5M ammonium acetate- 100% isopropanol将5M乙酸铵与等量的100%异丙醇混合制备成过滤缓冲液,用于将核酸从提取液中沉淀。
4. 洗涤缓冲液的配方:- 70% ethanol将绝对乙醇与等量的去离子水混合制备成洗涤缓冲液,用于洗涤核酸沉淀,去除残留的盐类和蛋白质。
5. 纯化缓冲液的配方:- 10mM Tris-HCl pH 8.0- 1mM EDTA将以上试剂按比例混合制备成纯化缓冲液,用于重溶核酸并去除污染物。
使用步骤如下:1. 将待提取的细胞悬浮在细胞裂解缓冲液中,彻底裂解细胞膜。
2. 加入RNase A,在室温下孵育30分钟,酶解RNA。
3. 加入等体积的提取缓冲液,混合均匀后离心,将上清液转移至新离心管,保留上清液,其中含有DNA。
4. 加入等体积的过滤缓冲液,混合均匀后离心,将上清液抽取并丢弃,沉淀中包含核酸。
5. 加入洗涤缓冲液,混合均匀后离心,将上清液抽取并丢弃,重复一次洗涤步骤,确保去除残留的盐类和蛋白质。
6. 倒掉洗涤缓冲液,将离心管倒置在吸水纸上,待离心管底部的液滴完全干燥,避免残留的洗涤缓冲液影响纯化后的核酸。
7. 加入适量的纯化缓冲液,将沉淀重溶,确保核酸的完整性。
《核酸的分离纯化》课件课程目标:1. 理解核酸分离纯化的意义和重要性。
2. 掌握核酸分离纯化的基本原理和步骤。
3. 学习核酸分离纯化的实验操作技巧。
4. 了解核酸分离纯化在科学研究和临床诊断中的应用。
第一部分:核酸分离纯化的意义和重要性1. 核酸的定义和功能核酸是生物体内携带遗传信息的分子,包括DNA和RNA。
核酸在遗传信息的传递、基因表达调控和疾病发生中起着重要作用。
2. 核酸分离纯化的意义核酸分离纯化是研究核酸结构和功能的基础。
核酸分离纯化有助于研究基因表达调控、基因突变和基因功能。
核酸分离纯化在临床诊断和疾病治疗中具有重要意义,如病原体检测、基因突变筛查和个体化治疗。
第二部分:核酸分离纯化的基本原理和步骤1. 核酸分离纯化的基本原理根据核酸的物理化学性质,如大小、电荷、亲和性和稳定性等,进行分离纯化。
常用的分离纯化方法包括离心、电泳、亲和色谱和质谱等。
2. 核酸分离纯化的基本步骤样品处理:收集含有核酸的样品,如细胞裂解、核提取等。
核酸释放:通过机械或化学方法将核酸从样品中释放出来。
核酸沉淀:通过盐析、酒精沉淀等方法将核酸从溶液中沉淀下来。
核酸洗涤:去除沉淀中的杂质,如蛋白、RNA等。
核酸纯化:通过柱层析、亲和色谱等方法进一步纯化核酸。
核酸鉴定:通过紫外线吸收、琼脂糖凝胶电泳等方法检测核酸的质量和数量。
第三部分:核酸分离纯化的实验操作技巧1. 样品处理技巧细胞裂解:使用酶或化学方法裂解细胞,释放核酸。
核提取:使用盐水或缓冲液提取核酸。
2. 核酸沉淀技巧盐析:加入高盐浓度使核酸沉淀。
酒精沉淀:加入酒精使核酸沉淀。
3. 核酸洗涤技巧离心:使用离心机去除沉淀中的杂质。
洗涤缓冲液:选择适当的洗涤缓冲液去除杂质。
4. 核酸纯化技巧柱层析:使用固定相和流动相进行核酸纯化。
亲和色谱:利用核酸与特定配体之间的亲和力进行纯化。
5. 核酸鉴定技巧紫外线吸收:测量核酸在紫外线波段的吸光度。
琼脂糖凝胶电泳:将核酸样品在琼脂糖凝胶上进行电泳,观察核酸的迁移率和条带形状。
实验名称:核酸分离纯化实验实验日期:2023年X月X日实验地点:实验室一、实验目的1. 学习核酸分离纯化的原理和方法。
2. 掌握DNA和RNA的提取、纯化技术。
3. 熟悉实验操作步骤和注意事项。
二、实验原理核酸分离纯化是指将DNA和RNA从细胞或组织样品中提取出来,并去除其中的蛋白质、多糖、脂类等杂质。
常用的方法有苯酚-氯仿法、柱层析法、磁珠法等。
三、实验材料1. 样品:细胞或组织样品2. 试剂:Tris-HCl缓冲液、EDTA、SDS、酚、氯仿、异戊醇、LiCl、无水乙醇等3. 仪器:离心机、移液器、试管、烧杯、磁力搅拌器等四、实验步骤1. 样品处理将细胞或组织样品加入Tris-HCl缓冲液和EDTA,加入SDS,充分混匀,高温处理,使蛋白质变性。
2. 离心将混合液离心,取上清液。
3. 脱蛋白在上清液中加入酚和氯仿,充分混匀,静置,离心。
4. 回收核酸将上层水相转移到新的试管中,加入LiCl,充分混匀,静置,离心。
5. DNA/RNA沉淀将上清液转移到新的试管中,加入无水乙醇,充分混匀,静置,离心。
6. 洗涤弃去上清液,用70%乙醇洗涤沉淀,离心。
7. 干燥弃去上清液,将沉淀干燥。
8. 溶解将干燥的DNA/RNA沉淀用Tris-HCl缓冲液溶解。
五、实验结果通过以上步骤,成功提取并纯化了DNA和RNA。
在紫外分光光度计下检测,A260/A280值在1.8-2.0之间,说明DNA/RNA纯度较高。
六、实验讨论1. 实验过程中,样品处理和离心速度对DNA/RNA的提取和纯化有较大影响。
样品处理要充分,离心速度要适中,以确保DNA/RNA的完整性和纯度。
2. 在脱蛋白过程中,酚和氯仿的加入量要适中,过多会影响DNA/RNA的提取和纯化。
3. 在DNA/RNA沉淀过程中,无水乙醇的加入量要适中,过多会导致DNA/RNA沉淀不完全,过少则会影响DNA/RNA的溶解。
4. 实验过程中,要注意实验操作的规范性和无菌操作,以防止DNA/RNA的污染。
核酸提取纯化方法引言核酸提取是分子生物学研究中的一个重要步骤,它主要包括纯化 DNA 和 RNA 两种核酸的过程。
在研究领域,纯化高质量的核酸样品对于准确分析和解读生物信息至关重要。
本文将介绍几种常用的核酸提取纯化方法,包括酚-氯仿法、离心柱法和磁珠法,并对每种方法的优缺点进行评述。
1. 酚-氯仿法酚-氯仿法是一种传统的核酸提取纯化方法,它基于核酸在酚和氯仿两相体系中具有不同溶解度的原理。
具体步骤如下:1.收集待提取的样品,如细菌培养物或组织样品。
2.加入等体积的酚-氯仿溶液,同时加入破碎剂(如玻璃珠或硅胶),彻底混合。
3.离心样品,使得酚相和氯仿相分离。
4.分离上层透明的水相,其中富含 DNA 或 RNA。
5.加入冷异丙醇或乙醇,沉淀核酸。
6.通过离心将沉淀的核酸分离。
7.用缓冲液溶解核酸沉淀,获得纯化后的 DNA 或RNA 样品。
酚-氯仿法提取的核酸样品质量较高,适用于小规模样品的提取。
然而,由于该方法对操作者的技巧要求较高,并且在操作过程中可能存在酚和氯仿对人体的损害风险,所以目前已逐渐被离心柱法和磁珠法取而代之。
2. 离心柱法离心柱法是一种基于硅胶膜和纤维素膜的核酸提取纯化方法,凭借其简单、快速和高效的特点已经成为目前最常用的核酸提取方法之一。
具体步骤如下:1.添加细胞裂解缓冲液到待提取样品中,通过细胞裂解将核酸释放到溶液中。
2.准备离心柱,将离心柱放入收集管中。
3.将样品溶液加到离心柱中,使其通过硅胶膜或纤维素膜。
4.通过洗涤液洗去杂质。
5.加入低盐缓冲液或水,洗脱核酸。
6.将洗脱的核酸收集到新的收集管中。
离心柱法的优点在于简单、快速且对样品的处理量较大,能够同时提取多个样品。
然而,该方法对于某些特殊样品(如富含多酚化合物或多糖的样品)可能会产生一定的干扰。
3. 磁珠法磁珠法是一种新兴的核酸提取纯化方法,它利用了磁珠的磁性和高亲和性,能够快速、高效地提取纯化核酸。
具体步骤如下:1.准备磁珠混悬液,并加入样品。
简述核酸分离纯化的主要步骤核酸分离纯化的主要步骤其实就是一场与基因的“亲密接触”。
我们就像是在进行一场精密的科学“约会”,只不过对象是DNA或RNA,而不是人。
好啦,咱们来看看这个过程如何进行的吧。
1. 材料准备
1.1 样品收集
首先,你得找点样品,可能是植物、动物,甚至是细菌。
想象一下,就像挑选食材一样,你需要挑选新鲜的“原料”。
1.2 细胞裂解
接下来,咱们要“破壳”了!通过加入一些裂解缓冲液,把细胞膜弄开,释放出里面的核酸。
这个过程就像是打开一个“宝箱”,哇,里面可真丰富!
2. 去除杂质
2.1 去除蛋白质
这一步,你得用一些蛋白酶,把细胞里的蛋白质都搞定。
想象一下,就像是把不需要的东西清理出去,只留下最闪亮的宝物。
2.2 沉淀核酸
然后,咱们需要加入酒精,通常是乙醇。
核酸会跟酒精“亲密接触”,沉淀下来。
这个时候你会发现,核酸就像是被请出舞池的主角,闪闪发光!
3. 洗涤与重溶
3.1 洗涤
在沉淀后的核酸上,加点洗涤液,就像给它洗个澡,把残留的杂质都冲走。
你得小心翼翼,别让它“滑了”!。
3.2 重溶
最后一步,是把洗净的核酸重新溶解在缓冲液中。
这个过程就像是给核酸穿上新衣服,焕然一新,准备出门见客!
完成这些步骤后,你的核酸就“出炉”啦!感觉就像是一场成功的约会,满载而归。
希望这个过程能让你对核酸分离纯化有个更轻松的了解。
就这样,你成功地和基因建立了“深厚的友谊”,为后续的实验打下了良好的基础!。
核酸分离与纯化的技术路线与原则核酸包括DNA 、RNA两类分子,在细胞内均与蛋白质结合成核蛋白。
真核生物基因组中,95%DNA 为双链线性分子,存在于细胞核中,5%为双链环状分子,存在于细胞器中;原核生物DNA 及质粒DNA 为双链或单链环状分子;RNA 为单链线性分子,主要存在于细胞质中。
DNA 与RNA 性质的不同导致对其分离与纯化的条件也不相同。
一、核酸分离与纯化的原则(1)保证核酸一级结构的完整性。
生物的遗传信息全部贮存在核酸一级结构中,而且核酸的一级结构还决定其高级结构的形式及和其他大分子结合的方式。
所以,所提取的核酸一级结构的完整性直接影响着后续实验中对其结构与功能研究的质量。
因此,在制备核酸的过程中,要做到:尽量简化操作程序,缩短提取过程;避免过酸、过碱等化学因素对核酸链中磷酸二酯键的破坏,在pH 值4~10条件下进行操作;操作时动作要轻缓,提取的样品小包装保存,以免诸多的物理因素对核酸的降解;避免细胞内及环境中核酶对核酸的生物性降解。
(2)排除其他生物大分子的污染,如蛋白质、多糖和脂类分子的污染应尽可能降低到最低程度,特别是提取DNA 分子时应除去RNA 分子,反之亦然。
(3)排除核酸样品中有机溶剂和过高浓度的金属离子。
二、分离与纯化的技术路线(一)核酸的释放通常情况下DNA 及RNA 均位于细胞内,因此核酸分离与纯化的第一步就是制备单个细胞,再破碎细胞,从而释放核酸。
破碎细胞的方法包括机械法与非机械法两大类。
机械法又可分为液体剪切法与固体剪切法;非机械法可分为干燥法与溶胞法。
由于溶胞法采用适宜的化学试剂与酶,能有效地裂解细胞,方法温和,能保证较高的核酸获得率,并能较好地保持核酸的完整性,从而得到广泛的应用。
(二)核酸的分离与纯化利用核酸与其他物质性质上的差异,可以分离与纯化核酸。
这种差异包括细胞定位与组织分布上的差异,物理、化学性质上的不同,以及各自独特的生物学特性。
操作过程中,既可以从复杂样品中抽提出核酸分子,也可以将样品中的非核酸成分(非核酸的生物大分子、非需要的核酸分子及在操作过程中加入的溶液与试剂)逐步清除。
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教学秘书 教研室主任 教学院长 制表日期
2015-2016学年第二学期
2013级临床医学八年制《基因工程实验技术》教学日历 教室安排:8号楼三楼 分子生物学实验室 (27学时) 116人
第一实验室: 喻红/杜芬 (39); 第二实验室: 张百芳/汪敏(39); 第三实验室: 苗丽霞/范成鹏(38)
2016年 课 程 内 容
学时 4月17日 周日 1. 概述基因工程基本流程及在医学中的应用(目的基因的获取;质粒载体在基因工程中的应用;重组体的连接(重
点:质粒PCR 定点突变及TA 克隆)、转化;筛选转化子的方法;原核表达体系及真核表达体系,外源基因的
表达和产物分离纯化;亚克隆;基因工程与医学实践的结合; PAGE 电泳和层析技术的介绍);
2. 提供细菌A 液提取的质粒DNA 经PCR 定点诱变后的产物纯化溶液;提供T 载体Kit ,进行连接反应;
3. 制备含Amp 的LB 固体培养平皿;
4. 提供感受态DH5a ,将重组连接后的DNA 溶液转化、Amp 平板铺菌,培养过夜(<18h,下午开始做)(周一课
间来观察转化结果:Amp 筛选平板上的单菌落,或-4度密封保存平板至下周六)
5. 提供小量液体培养过夜的细菌B 液;转新锥形瓶,液体培养3-4h 后加IPTG 1mM 诱导表达(5h ),收集诱导
后的菌体沉淀(诱前0.5ml 两管,诱后1ml 两管和3-4ml 的若干管,用于目标蛋白的纯化)
6. 重组质粒DNA 的质粒提取及限制性内切酶双酶切图谱的鉴定(周日下午做,过夜,周一转存-20度冰箱);
9 4月23日 周六 1. 原核表达体系中GST 融合蛋白的诱导表达及鉴定:先进行SDS-PAGE 的灌制凝胶;再将诱导前后的菌体蛋白,
进行SDS-PAGE 检测外源蛋白的诱导表达水平;
2. Western Blotting 鉴定特异蛋白的表达水平(SDS-PAGE (第一块胶)、转膜、封闭、I 抗(抗GST-Ab )孵育过夜);
3. 外源GST 融合蛋白的分离纯化(介绍层析技术;上午开始做):诱导后的细菌沉淀采用溶菌酶法裂解细菌(>1h ),
Glu-Agarose beads 亲和层析法分离纯化GST 融合蛋白(提供50 ul beads ,Ep 管离心洗涤法,每班共10组),
4. SDS-PAGE 鉴定GST 融合蛋白纯化(下午跑第二块胶,考马斯亮蓝染色>0.5h ,漂洗脱色过夜)
9 4月24日 周日 1.
酶切目的DNA 片段的非变性PAGE 鉴定 2.
Western blotting (续):洗膜、II 抗孵育1~2 h ,漂洗、DAB 显色。
3.
SDS-PAGE 考马斯亮蓝染色后的脱色结果观察 4. 实验报告与总结,结果分析及讨论:(真核基因在原核生物中的表达策略)
9。