高性能计算和并行算法-计算物理课件
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高性能计算与并行算法高性能计算(High Performance Computing,HPC)指的是利用计算机技术和算法来解决科学、工程、商业和其他复杂问题的计算过程。
随着计算机科学与技术的发展,高性能计算已经成为许多领域进行大规模计算和数据处理的重要工具。
本文将介绍高性能计算的概念、并行算法的特点和应用,并探讨其中的挑战与发展趋势。
一、高性能计算简介高性能计算通常指的是在短时间内解决大规模问题所需的计算能力。
它通过使用并行计算、分布式系统、超级计算机等技术手段,提高计算效率和处理速度。
高性能计算的应用领域广泛,包括天气预报、气候模拟、医学影像处理、基因组学研究等。
二、并行算法的特点并行算法是实现高性能计算的关键。
与串行算法相比,它充分利用多核处理器、分布式计算平台等并行计算架构,提高计算效率。
并行算法的特点如下:1. 分解与并行性:将问题分解成多个子问题,并行处理各个子问题,最后将结果合并。
2. 通信与同步:并行计算过程中需要进行数据交换和同步操作,确保计算的正确性和一致性。
3. 负载均衡:合理分配计算任务和数据,以最大程度地利用计算资源,避免负载不平衡导致性能下降。
三、并行算法的应用1. 矩阵计算:在科学计算和工程领域中,矩阵运算是非常常见的操作。
并行算法可以显著提高矩阵计算的效率,加快求解速度。
2. 图像处理:图像处理是一项计算密集型任务,如人脸识别、图像分割等。
并行算法可以将图像分割成多个子区域,分别进行处理,最后合并结果,提高处理速度和准确性。
3. 大规模数据分析:随着大数据时代的到来,处理海量数据已经成为许多领域的挑战。
并行算法可以将数据分割成多个部分,同时进行分析,提高数据处理效率。
4. 科学模拟:在物理学、化学等科学领域,模拟物理过程是一项重要任务。
并行算法可以将物理模型分解为多个计算单元,并行进行模拟,加快计算速度。
四、挑战与发展趋势高性能计算和并行算法仍面临一些挑战。
首先,如何合理利用不同硬件架构和计算资源,对算法进行优化,是一个需要解决的难题。
物理计算中的高性能计算与并行计算技术随着科技的不断发展,物理计算在各个领域中扮演着越来越重要的角色。
而在物理计算中,高性能计算与并行计算技术则是不可或缺的关键因素。
本文将探讨高性能计算与并行计算技术在物理计算中的应用以及其对科学研究的影响。
高性能计算是指通过利用并行计算技术,将计算任务分解为多个子任务,同时在多个计算资源上进行计算,以提高计算速度和效率的一种计算方式。
在物理计算中,高性能计算的应用广泛而深远。
例如,在天体物理学中,高性能计算可以模拟宇宙的演化过程,研究黑洞的形成和演化规律;在量子物理学中,高性能计算可以模拟量子系统的行为,解决薛定谔方程等复杂问题;在材料科学中,高性能计算可以模拟材料的结构和性质,加速新材料的研发过程。
而并行计算技术则是实现高性能计算的关键。
它通过将计算任务分解为多个子任务,并在多个计算资源上同时进行计算,以提高计算速度和效率。
并行计算技术有多种形式,例如共享内存并行计算、分布式并行计算和GPU并行计算等。
在物理计算中,这些并行计算技术都得到了广泛应用。
共享内存并行计算是指多个处理器共享同一块内存,通过并行执行多个线程来提高计算速度。
这种技术适用于那些需要频繁的数据交换和通信的计算任务。
在物理计算中,共享内存并行计算可以用于解决一些复杂的数值计算问题,例如求解偏微分方程、模拟流体力学等。
分布式并行计算是指将计算任务分发到多个计算节点上进行计算,通过协同工作来提高计算速度和效率。
这种技术适用于那些可以将计算任务分解为独立子任务的计算问题。
在物理计算中,分布式并行计算可以用于解决一些大规模的计算问题,例如模拟地震波传播、模拟大气环流等。
GPU并行计算是指利用图形处理器(GPU)进行并行计算,通过将计算任务分发到多个GPU核心上进行计算,以提高计算速度和效率。
这种技术适用于那些需要大量计算的计算任务。
在物理计算中,GPU并行计算可以用于解决一些需要高性能计算的计算问题,例如分子动力学模拟、量子化学计算等。
第十章高性能计算和并行算法§10.1 引言计算机的运算速度在日新月异地增长,计算机的市场价格却不断地下降。
当前的计算机技术仍然远远不能满足物理问题计算的需要。
高性能计算机是一个所有最先进的硬件,软件,网络和算法的综合概念,“高性能”的标准是随着技术的发展而发展的。
高性能计算系统中最为关键的要素是单处理器的最大计算速度,存贮器访问速度和内部处理器通讯速度,多处理器系统稳定性,计算能力与价格比,以及整机性能等。
传统的计算机是冯.纽曼(Von Newmann)计算机,它是由中央处理器、内存器和输入/输出设备构成。
为了要超越这个冯.纽曼“瓶颈”,人们发展了两种计算机体系结构和相关软件技术的应用原则。
一个是并行算法(parallelism),另一个是流水线技术(pipelining)。
由于高性能计算机与当前能够应用的新计算技术相关联,因而它与并行算法和流水线技术有着密切的联系。
§10. 2并行计算机和并行算法并行计算机是由多个处理器组成,并能够高速、高效率地进行复杂问题计算的计算机系统。
串行计算机是指只有单个处理器,顺序执行计算程序的计算机,也称为顺序计算机。
并行计算作为计算机技术,该技术的应用已经带来单机计算能力的巨大改进。
并行计算就是在同一时间内执行多条指令,或处理多个数据的计算。
并行计算机是并行计算的载体。
为什么要采用并行计算呢?z并行计算可以大大加快运算速度,即在更短的时间内完成相同的计算量,或解决原来根本不能计算的非常复杂的问题。
z提高传统的计算机的计算速度一方面受到物理上光速极限和量子效应的限制,另一方面计算机器件产品和材料的生产受到加工工艺的限制,其尺寸不可能做得无限小。
因此我们只能转向并行算法。
z并行计算对设备的投入较低,既可以节省开支又能完成计算任务。
实际上,许多物理计算问题本身就具有并行的特性,这就是需要并行算法的最朴素的原因。
通常的冯.纽曼计算机是属于SISD(Single Instruction Single Data stream computers) 单指令单数据流计算机类型计算机,它的结构只有一个处理器,同时可以处理一个单数据流。
高性能计算与并行计算高性能计算(High-Performance Computing,HPC)是指利用计算机技术和资源,通过并行计算和分布式计算等手段,实现高速、高效、大规模的数据处理和计算的过程。
在当今信息时代,高性能计算已经成为了科学研究、工程设计、数据处理等领域中不可或缺的工具。
一、高性能计算的概念与意义高性能计算是指通过利用大型计算机集群或超级计算机等强大的计算资源,配合高度并行化的计算架构,实现大规模数据计算的过程。
它能够显著提高计算速度和计算效率,缩短科学研究、工程设计和数据分析等过程所需的时间。
高性能计算主要应用于以下领域:1. 科学研究:高性能计算在物理、化学、生物等科学领域中扮演着重要角色。
科学家可以利用高性能计算的能力,模拟和预测各种复杂的科学现象,并为科学研究提供有力的支持。
2. 工程设计:高性能计算在航空航天、汽车、建筑等工程设计领域中有着广泛应用。
通过高性能计算,工程师可以进行大规模的模拟计算和优化设计,提高产品的性能和可靠性。
3. 数据处理:随着大数据时代的到来,数据分析和处理成为了重要任务。
高性能计算可以加快大规模数据处理的速度,并提供更准确的分析结果。
二、并行计算的基本原理在高性能计算中,实现快速计算的关键是并行计算。
并行计算是指将一个大问题拆分成许多小问题,然后在多个计算单元上同时进行计算,最后将计算结果进行整合。
并行计算采用了以下几种并行方式:1. 任务并行:将一个大问题划分成多个小任务,并在多个处理器上同时执行。
每个处理器独立计算,最后将计算结果合并得到最终结果。
2. 数据并行:将数据划分为若干部分,每个处理器负责处理部分数据。
通过数据的并行处理,可以加快计算速度,并提高计算效率。
3. 流水线并行:将一个大任务划分为多个子任务,并通过流水线的方式依次处理。
每个子任务在不同的处理器上执行,通过流水线的方式可实现任务的并行处理。
三、高性能计算的挑战与发展高性能计算虽然带来了许多优势和便利,但也面临着一些挑战。
第十章高性能计算和并行算法
§10.1 引言
计算机的运算速度在日新月异地增长,计算机的市场价格却不断地下降。
当前的计算机技术仍然远远不能满足物理问题计算的需要。
高性能计算机是一个所有最先进的硬件,软件,网络和算法的综合概念,“高性能”的标准是随着技术的发展而发展的。
高性能计算系统中最为关键的要素是单处理器的最大计算速度,存贮器访问速度和内部处理器通讯速度,多处理器系统稳定性,计算能力与价格比,以及整机性能等。
传统的计算机是冯.纽曼(Von Newmann)计算机,它是由中央处理器、内存器和输入/输出设备构成。
为了要超越这个冯.纽曼“瓶颈”,人们发展了两种计算机体系结构和相关软件技术的应用原则。
一个是并行算法(parallelism),另一个是流水线技术(pipelining)。
由于高性能计算机与当前能够应用的新计算技术相关联,因而它与并行算法和流水线技术有着密切的联系。
§10. 2并行计算机和并行算法
并行计算机是由多个处理器组成,并能够高速、高效率地进行复杂问题计算的计算机系统。
串行计算机是指只有单个处理器,顺序执行计算程序的计算机,也称为顺序计算机。
并行计算作为计算机技术,该技术的应用已经带来单机计算能力的巨大改进。
并行计算就是在同一时间内执行多条指令,或处理多个数据的计算。
并行计算机是并行计算的载体。
为什么要采用并行计算呢?
z并行计算可以大大加快运算速度,即在更短的时间内完成相同的计算量,或解决原来根本不能计算的非常复杂的问题。
z提高传统的计算机的计算速度一方面受到物理上光速极限和量子效应的限制,另一方面计算机器件产品和材料的生产受到加工工艺的限制,其尺寸不可能做得无限小。
因此我们只能转向并行算法。
z并行计算对设备的投入较低,既可以节省开支又能完成计算任务。
实际上,许多物理计算问题本身就具有并行的特性,这就是需要并行算法的最朴素的原因。
通常的冯.纽曼计算机是属于SISD(Single Instruction Single Data stream computers) 单指令单数据流计算机类型计算机,它的结构只有一个处理器,同时可以处理一个单数据流。
并行计算机若采用与某种网络相关的多处理器结构,则会使其性能得到改善。
如今广泛使用的结构分成以下类型:
z SIMD(Single Instruction Multiple Data stream computers)单指令多数据流计算机;
z MIMD(Multiple Instruction Multiple Data stream computers)多指令多数据流计算机。
单/多指令指的是可以同时在计算机上执行的指令数,而单/多数据流指的是计算机同时可处理的一个或多个数据流。
SIMD和MIMD 体系结构对并行计算机十分重要。
z SIMD计算机具有处理器器件阵列,它通过单个控制单元来控制功能设备。
这个控制单元向所有处理器发出相同的执行指令,随后所有处理器对进入的不同数据流进行相同的操作。
z MIMD计算机具有可以同时独立运行多条指令,对不同的数据进行操作。
例如对数组的如下运算A=B*C+D+E+F/G,可以分解为乘法(B*C),加法(D+E)和除法(F/G)直接交给MIMD计算机的直接处理部分同时进行计算。
按照同时执行程序的不同并行计算机又可以分为:
SPMD(Single Program Multiple Data Stream Computers)单程序多数据流并行计算机, SPMD并行计算机一般是由多个相同的计算机或处理器构成;
MPMD(Multiple Program Multiple Data Stream Computers)多程序多数据流并行计算机。
MPMD并行计算机内计算机或处理器的地位是不同的,根据分工的不同,它们擅长完成的工作也不同,因此可以根据需要将不同的程序放到MPMD并行计算机上执行,使得这些程序协调一致地完成给定任务.
这种划分依据的执行单位不是指令而是程序。
针对SPMD和MPMD并行计算机所设计的并行算法的思路与前面介绍的并行算法的思路有很大不同。
并行计算机也可以按照内存的结构来划分:
“分布式内存”和“共享式内存”两种基本结构的并行计算机。
根据并行计算任务的大小分为三类:
1.粗粒度并行算法;它所含的计算任务有较大的计算量和较复杂的计算程序。
2.细粒度并行算法;它所含的计算任务有较小的计算量和较短的计算程序。
3.中粒度并行算法;它所含的计算任务的大小和计算程序的长短在粗粒度和细粒度两种类型的算法之间。
根据并行计算的基本对象可以分为:
数值并行计算和非数值并行计算。
根据并行计算进程间的依赖关系可以分为:
(1) 同步并行算法;该算法是通过一个全局的时钟来控制各部分的步伐,将任务中的各个部分计算同步地向前推进。
(2) 异步并行算法;它执行的各部分计算步伐之间没有关联,互不同步。
对于SIDM并行计算机一般适合用同步并行算法,而MIMD并行计算机则适合用异步并行算法。
§10. 3并行编程
通常编程设计过程可以分为四步:
z任务划分(Partitioning)。
该阶段将整个使用域或功能分解成一些小的计算任务,它的目的是要揭示和开拓并行执行的机会;
z通信(Communication)分析。
由任务划分产生的各项任务一般都不能独立完成,可能需要确定各项任务中所需交换的数据和协调各项任务的执行。
通信分析可以检测在任务划分阶段划分的合理性;
z任务组合(Agglomeration)。
按照性能要求和实现的代价来考察前两个阶段的结果,必要时可以将一些小的任务组合成更大的任务以提高执行效率和减少通信开销;
z处理器映射(Mapping)。
这是设计的最后阶段。
要决定将每一个任务分配到哪个处理器上去执行。
目的是要最小化全局执行时间和通讯成本,并最大化处理器的利用率。
上述过程简称为PCAM设计过程。
目前最重要的并行编程模型有两种:
z数据并行(Data Parallel)模型(它的初衷是为了SIMD
并行机),
z消息传递(Message Passing)模型(其初衷是为了多计算
机)。
还有共享变量模型、函数式模型等,但是它们的应用都没有前面两种那样普遍。
数据并行的含义是将相同的操作同时作用于不同数据,因此不但适用于在SIMD计算机上实现,也可以在SPMD并行计算机上运行,这取决于粒度大小。
SIMD程序着重开发指令级中细粒度的并行性,SPMD程序着重开发子程序级中粒度的并行性。
并行语言的产生有三种方式:
z设计全新的并行语言;
z扩展原来串行语言的语法成分,使它支持并行特征;
z为串行语言提供可调节的并行库,并不改变串行语言。
目前常用的是第(2)和(3)两种方式,最常用的是第(3)种。
对FORTRAN和C语言的扩充是最常见的并行语言产生办法。
The End。