基因工程实验报告
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基因工程实验报告
生命学院
生技114班
摘要:
一、本次试验内容概况如下:
(1)准备植物材料:小麦幼苗 (2)对基因进行双酶切,准备的载体进行双酶切,转移Top10菌株。
(3)进行PCR检测,查看检测结果是否成功,成功则证明转入了BL21菌株,进行表达过程。
(4)进行电泳。(目的蛋白的大小会知道,高诱导。证明符合预期结果。说明此区域该目的基因大量表达,其他区域目的基因没有大量表达。)
(5)用Weatern杂交去证明。因为载体是已知的,在相应位置杂交出杂带,证明的该目的基因确实克隆到了载体上,并且蛋白质进一步进行了表达。
二、实验流程:
用Trizol 法提取小麦总RNA→用RT-PCR技术扩增GAPDH截短体基因→用琼脂糖凝胶电泳进行片段胶回收→表达载体pGEX4T—1的构建→表达菌株转化→诱导表达→Western杂交
关键词:RNA提取、RT-PCR扩增目的基因cDNA、琼脂糖电泳、质粒提取、表达载体的目的片段的酶切、载体和外源DNA的连接、感受态细胞的制备及转化、重组质粒的筛选、鉴定及转化、目的基因诱导表达、Western Blotting检测、DNA的传化与回收、培养基制备和细菌培养
具体实验过程:
一、小麦总RNA提取
1、材料设备:小麦幼苗、高速冷冻离心机、低温冰箱、核酸电泳设备、液氮罐、研体、剪刀、镊子。
2、试剂:
(1)0.1%的DEPC H2O(DEPC:焦碳酸二乙酯)
(2)器具处理:试剂瓶、量筒、研钵、大小枪头和1.5ml和0.2ml 的EP管等用纱布包裹,在0.1%的DEPC H2O中浸泡过夜(37℃),高压灭菌,80℃烘干备用。剪刀、镊子和药匙等160℃烘烤6h以上。
(3)无RNA酶灭菌水(DEPC H2O):用将高温烘烤的玻璃瓶装重蒸馏水,按0.01%的DEPC(体积/体积),处理过后高压灭菌。
(4)Trizol
(5)75%乙醇:用新打开的无水乙醇和DEPC处理过的水配制75%乙醇(用高温灭菌器皿配制),然后装入高温烘烤的玻璃瓶中,存放于低温冰箱。
(6)氯仿
(7)异丙醇
3、操作步骤:
(1)取400ug小麦,放在液氮中磨成粉末,每组100ug放入已经常有1mL的Triol液的EP管中,充分混匀。
(2)液氮挥发完之前,倒入含有1 毫升TRIpure的离心管中,迅速反复倒置混匀,室温放置5min。
(3)加入200ul氯仿,剧烈反复倒置混匀15s,室温放置5min。
(4)12000转下离心15分钟。
(5)吸管取约上清至新的EP管中(注意避免吸取界面上的蛋白)。
(6)加入500异丙醇混匀,温和颠倒混匀,放置10min。 (7)12000转下离心10分钟。
(8)倒掉上清,加入1ml75%乙醇洗涤涡旋混匀,12000转4度下离心5分钟。
(9)重复上述操作。
(10)倒掉上清,室温或真空干燥5min晾干。加入DEPC水30ul溶解RNA必要时放入55-60度水浴10min置于-70度保存。
RT-PCR扩增GAPDH目的基因
1、实验试剂:
(1)RNA 模板
(2)Olig(dT)18
(3)反转录缓冲液
(4)dNTP
(5)M-MULV 反转录酶
(6)RNA 抑制剂(RNasin)
(7)Premix EX Taq DNA 聚合酶
(8)PCR 特异引物
2、设备:PCR扩增仪、电泳仪、台式离心机、恒温水浴、微量转移器
3、操作步骤:
(1)RNA 的反转录
采用 Thermo Scientific(Fermentas) RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit
Total RNA 6µL(需加入 RNA 约 1mg)
Oligo dT primer 1µL
H2O(nuclease-free) 5µL
Total 12µL
65℃ 5min,补加下列试剂:
5× Reaction buffer 4µL
Ribolock RNase Inhibitor 1µL
10mM dNTP Mix 2µL
RevertAid M-MuLV Reverse Transcriptase 1µL
Tatal 20µL 42℃ 60min
70℃,5min,﹣20℃保存
(2) PCR 扩增目的基因
用表达引物扩增目的基因(25µL 体系)
2×PCR Mix 25μl 95℃ 1min
cDNA 2μl 95℃ 10s 35cycles
引物GAPDH1-1+GAPDH1-2 2μl 58℃ 65s
H2O 21μl 72℃ 10min
total 50μl 16℃ ∞
PCR扩增结果的凝胶电泳检测及胶回收
PCR胶回收:
(1)柱平衡步骤:向吸附柱CB2加入500ul的平衡液BL,12000rpm离心1分钟,倒掉收集管得废液,将吸附柱重新放入收集管中。
(2)将单一的目的DNA片段从琼脂糖凝胶中切下,放入干净的离心管中称重。
(3)向橡胶块中加入等体积的PC溶液,50摄氏度水浴10min左右,以确保期间不断的上下翻转离心管,以确保胶充分溶解。
(4)将上一步所得到的溶液加入一个吸附柱CB2中,12000rpm离心1min ,倒掉收集管的废液,将吸附柱放收集管中
(5)向吸附柱CB2加入600ul的漂洗液PW,12000rpm离心一分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CB2放入收集管中
(6)重复操作5
(7)将吸附柱CB2放入收集管中12000rpm离心2min,目地是将柱中的残余漂洗液去除,将吸附柱置于室温下数分钟,彻底晾干
(8)将吸附柱CB2放入干净离心管中,向吸附膜的中间部位加入50-100ul洗脱缓冲液EB,室温放置2min,12000rpm离心2min收集DNA溶液。(注意洗脱液的体积应该不少于40ul)
回收产物的双酶切及电泳检测
1、试剂:
(1)BamHⅠ
(2)SalⅠ (3)BamHⅠ buffer
(4)质粒提取试剂盒
2、设备:电泳仪系统、紫外灯、恒温水浴箱
(1)PCR双酶切
经过上步骤可回收40ul的PCR反应液。然后继续进行以下操作:
PCR回收液 40ul
ddH2O 2ul
10×BamhI Buf 5ul
Sal I 2ul
BamhI 1ul
加样后混匀,37摄氏度恒温水浴锅中过夜
(2)电泳检测
从PCR酶切反应液中回收DNA
1、操作步骤:
(1)柱平衡步骤:向吸附柱CB2加入500ul的平衡液BL(吸附柱放入收集管中),12000rpm离心1分钟,倒掉收集管得废液,将吸附柱重新放入收集管中。
(2)估计PCR反应液或酶切反应液的体积向其中加入等体积的PC溶液,充分混匀。
(3)将上一步所得到的溶液加入一个吸附柱CB2中,室温放置两分钟12000rpm离心1min ,倒掉收集管的废液,将吸附柱放收集管中
(4)向吸附柱CB2加入600ul的漂洗液PW,12000rpm离心一分钟,倒掉收集管中的废液,将吸附柱CB2放入收集管中
(5)重复操作4
(6)将吸附柱CB2放入收集管中12000rpm离心2min,目地是将柱中的残余漂洗液去除,将吸附柱置于室温下数分钟,彻底晾干
(7)将吸附柱CB2放入干净离心管中,向吸附膜的中间部位加入50-100ul洗脱缓冲液EB(如果回收的目的片段大于4kb,则洗脱缓冲液应放在65-70的水浴中加热),室温放置2min,12000rpm离心2min收集DNA溶液。(注意洗脱液的体积应该不少于40ul)
二、大肠杆菌质粒DNA的提取及凝胶电泳检测
1、试剂: (1)LB液体培养基:胰蛋白胨10g,酵母提取物5g,NaCl 10g,溶解于1000mL蒸馏水中,用NaOH调pH至7.0。高压灭菌20分钟。
(2)LB平板培养基:在每1000mL LB液体培养基中中加入15g琼脂,高压灭菌20分钟。
(3)溶液P1:50mmol/L 葡萄糖,10mmol/L EDTA,25mmol/L Tris-HCl(pH 8.0)。
(4)溶液P2:0.2mol/L NaOH,1% SDS。(必须新鲜配制)
(5)溶液P3:pH4.8的醋酸钾溶液(5mo1/L乙酸钾 60 ml,冰乙酸11.5 ml,水 28.5ml)。
(6)EB缓冲液
2、材料设备:含质粒的大肠杆菌、Eppendorf管、离心管架、10,100,1000μl液体加样器、台式高速离心机、摇床、高压灭菌锅。
3、操作步骤:
(1)培养细菌:
将带有质粒的大肠杆菌接种于LB平板培养基上,37℃培养24小时,然后从平板上挑取单菌落,接种于5ml液体培养基中,37℃培养12小时(老师做的)。
(2)提取步骤:
柱平衡步骤:向吸附柱CP3加入500ul的平衡液BL,12000rpm离心1分钟,倒掉收集管得废液,将吸附柱重新放入收集管中。
①将菌液移入1.4ml 离心管,离心1分钟(1000rpm,18度),倒去上清液,再加入1.5ml 菌液,重复2次,倒转于滤纸除净残液。
②加入250μl预冷的溶液PⅠ(含10ug/μl RNAase),用涡旋震荡器充分悬浮。
③加入250μl溶液P2,快速颠倒温和混匀6-8次。此时溶液应非常粘稠。
④加入350μl 预冷的溶液P3,温和混匀6-8次(此时应有白絮状沉淀),12000rpm离心10分钟。
⑤转移上清液至另一吸附柱CP3中注意不要吸出沉淀。12000rpm离心30-60秒,倒掉收集管的废液,将吸附柱CP3放入收集管中。
⑥向吸附柱CP3加入600ul的PW,12000rpm离心30-60秒倒掉收集管的废液,将吸附柱CP3放入收集管。
⑦重复步骤⑥
⑧将吸附柱CP3放入收集管中,12000rpm离心2min,目地是将柱中的残余漂洗液去除。
⑨将吸附柱CP3放入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位加入50-100ul洗脱缓冲液EB,室温放置2min,12000rpm离心2min将质粒溶液收集到离心管中。