PTGS2基因单核苷酸多态性与肿瘤的关联研究进展
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PTPN22 C1858T单核苷酸多态性在自身免疫性疾病发病中
的作用
曹娅丽;李文歌;章友康
【期刊名称】《中日友好医院学报》
【年(卷),期】2012(026)004
【摘要】自身免疫性疾病是由于各种原因导致免疫调节功能紊乱,免疫系统无法识别自体的细胞和组织而引起的一系列疾病,包括1型糖尿病(type 1
diabetes,T1D)、类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)、炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)、多发性硬化(multiple sclerosis,MS)
以及抗中性粒细胞胞浆抗体(anti-neutrophil cytoplasmic antibodies,ANCA)相关性小血管炎等。
【总页数】3页(P231-232,247)
【作者】曹娅丽;李文歌;章友康
【作者单位】中日友好医院肾内科,北京100029;中日友好医院肾内科,北京100029;北京大学第一医院肾内科,北京100034
【正文语种】中文
【中图分类】R392.11;R593.2
【相关文献】
1.PTPN22 C1858T与自身免疫性疾病相关性的研究进展 [J], 孔晓彤;王丽华;王健健;单雪;李千;张荟雪
2.Wnt信号通路在自身免疫性疾病中的作用研究进展 [J], 陈爽;张晓敏
3.PD-1/PD-L1在自身免疫性疾病中作用的研究进展 [J], 何红霞;范恒;杨佳
4.IL-17在神经系统自身免疫性疾病中作用的研究进展 [J], 李卓含;时鹏;年娣
5.PTPN22单核苷酸多态性在自身免疫性疾病中的研究进展 [J], 冯雪;李永哲因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
COX-2基因单核苷酸多态性rs3218625与胃癌的关联研究耿照静;高芳;张彬;贾彦彬【期刊名称】《包头医学院学报》【年(卷),期】2013(029)006【摘要】目的:探讨环氧化酶2(COX-2)基因单核苷酸多态性(SNP)rs3218625 G>A与胃癌的关系.方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法在253例胃癌患者和243例正常对照中进行基因分型,并用非条件性Logistic回归分析SNP rs3218625与胃癌发病风险的关系.结果:SNP rs3218625与胃癌关联,AG基因型携带者胃癌的发病风险增高(OR=2.463,95 % CI=1.027~5.910).结论:SNP rs3218625可能在胃癌的发病中起到一定作用.【总页数】2页(P5-6)【作者】耿照静;高芳;张彬;贾彦彬【作者单位】包头医学院,内蒙古,包头,014060;北京丰台区中西医结合医院重症医学科;包头医学院,内蒙古,包头,014060;包头医学院,内蒙古,包头,014060;包头医学院,内蒙古,包头,014060【正文语种】中文【相关文献】1.COX-2 单核苷酸多态性与胃癌生物学行为相关性研究 [J], 殷霞丽;谢丽;魏嘉;禹立霞;刘宝瑞2.中国汉族人群GAD1和GABRB3基因启动子区单核苷酸多态性与精神分裂症的关联研究 [J], 李娜; 安宇; 张永录; 丁志杰; 吴柏林; 兰小平3.TLR4基因单核苷酸多态性与中国汉族人群原发性开角型青光眼关联研究 [J], 舒意;徐嘉欣;杨辰;陈伊莲;罗谦;龚波;杨正林;黄果4.HRAS基因单核苷酸多态性与精神分裂症及非典型抗精神病药物疗效的关联研究[J], 李睿;曾端;和申;沈一峰;李华芳5.NLRP3基因rs10754558位点单核苷酸多态性与慢性阻塞性肺疾病的关联研究[J], 伍慧妍;蔡洁琳;周泳琳;杨欣;彭亮因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
单核苷酸多态性与放射性损伤
张莉;王绿化
【期刊名称】《癌症进展》
【年(卷),期】2008(6)2
【摘要】对于放射治疗中发生的急性和晚期放射性损伤,目前尚未能建立临床适用的预测放射性损伤模型.各种研究希望通过探寻DNA损伤、修复基因的多态性与放射性损伤之间的关系来了解放射性损伤的分子机制.基因的多态性不但可以改变蛋白的功能,还可能影响到个体正常组织对受损DNA修复的能力.ATM、XRCC1、BRCA1/2、ERCC2、SOD2、DNA ligase Ⅳ和TGF-β1等基因的SNPs与增加放射性损伤可能性相关,这些基因是目前有关放射性损伤研究的活跃领域.未来在放射性损伤相关性的研究中,只能依靠大样本量、严格的对照研究才能获得确实意义的结论.
【总页数】7页(P141-146,162)
【作者】张莉;王绿化
【作者单位】中国医学科学院,中国协和医科大学,肿瘤医院放疗科,北京,100021;中国医学科学院,中国协和医科大学,肿瘤医院放疗科,北京,100021
【正文语种】中文
【中图分类】R730.55
【相关文献】
1.XRCC1单核苷酸多态性与鼻咽癌患者晚期放射性损伤的相关性 [J], 翟小明;王建平;顾科;张军宁;宋云风;王宜宗
2.自我参与式康复对舌癌放化疗患者放射性损伤及生活质量的影响 [J], 翟凤钰
3.影像学鉴别胶质瘤术后复发与放射性损伤 [J], 杨婷;肖新兰
4.宫颈癌根治性放疗致阴道放射性损伤的危险因素调查及防护 [J], 莫杏能;陆秋云;唐敏;杨艳
5.单核苷酸多态性敏感分子开关在基因组单核苷酸多态性检测中的特异性分析 [J], 彭翠英;胡卫民;周翠兰;陈琳玲;刘俊;肖莉;殷宇芳;李凯;廖端芳
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与肿瘤耐药有关的P-gp、GST蛋白在K562/ADM和转MDR基因K562/MDR中的表达李娇;郝立宏;孔力【期刊名称】《解剖科学进展》【年(卷),期】2004(10)B08【摘要】化疗是血液系统恶性肿瘤和部分实体瘤的重要治疗手段之一,但耐药性的产生是癌症化疗失败的主要因素之一。
本实验应用免疫细胞化学技术(SP-ICC)、分光光度法检测并比较慢性粒细胞白血病急性变细胞株K562、人工用阿霉素(ADM)诱导建成的肿瘤耐药细胞株K562/ADM和用逆转录病毒转染MDR基因建成的肿瘤耐药细胞株K562/MDR三种细胞株细胞表面的P-gp和细胞内GST 的表达和GST比活力的改变,【总页数】2页(P38-39)【关键词】MDR基因;P-gp;K562/ADM;肿瘤耐药;表达;GST;细胞株;比活力;蛋白;转染【作者】李娇;郝立宏;孔力【作者单位】大连医科大学组织学与胚胎学教研室,大连116027【正文语种】中文【中图分类】Q965.9;R733【相关文献】1.mdr1基因shRNA表达载体逆转白血病耐药细胞系K562/ADM多药耐药的实验研究 [J], 干惠珠;张桂珍;卢振霞;卜丽莎;杨绍娟;高申;郑德明2.靶向siRNA沉默mdr1基因表达及对白血病耐药细胞系K562/ADM的耐药逆转作用 [J], 魏虎来;高丽萍;景涛;赵怀顺;易娟;孙静;韩俭3.诱导耐药K562/ADM和转基因耐药K562/MDR细胞株的生物学行为和耐药机制的比较研究 [J], 李姣;丁艳芳;赵瑾瑶;杨佩满;孔力4.The expression of P-gp and GST protein in K562/ADM and K562/MDR cell lines [J], JiaoLi; LihongHao; LiKong5.维生素E琥珀酸酯下调mdr1/P-gp表达逆转K562/ADM耐药细胞的凋亡抑制[J], 郭璐;魏虎来;张亚莉;刘建民因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
MRP2基因单核苷酸多态性对晚期卵巢癌铂类化疗敏感性的影响杨兴升;关根正幸;仓田仁;田中宪一【期刊名称】《实用妇产科杂志》【年(卷),期】2004(20)3【摘要】目的:探讨MRP2基因单核苷酸多态性与晚期卵巢癌对铂类化疗敏感性的关系.方法:本研究包括89例晚期卵巢癌患者,其中Ⅲ期77例,Ⅳ期12例.所有患者均行肿瘤细胞减灭术,术后常规化疗6~8疗程,均用顺铂加紫杉醇及其他药物化疗.89例患者中,完全缓解(CR)或部分缓解(PR)62例,肿瘤无变化(NC)或进展(PD)27例.采用单核苷酸延伸技术,检测肿瘤组织中MRP2基因促进子(C-24T)、第10外显子(G1249A)及第28外显子(C3972T)的单核苷酸多态性.观察其对铂类化疗敏感性的影响.结果:MRP2基因促进子及第28外显子单核苷酸多态性对卵巢癌患者对铂类化疗反应无明显影响,而MRP2基因第10外显子突变型与铂类化疗敏感性密切相关(P<0.05).结论:MRP2基因第10外显子单核苷酸多态性影响晚期卵巢癌患者对铂类化疗的敏感性.【总页数】3页(P153-155)【作者】杨兴升;关根正幸;仓田仁;田中宪一【作者单位】山东大学齐鲁医院,山东,济南,250012;日本新潟大学;日本新潟大学;日本新潟大学【正文语种】中文【中图分类】R737.31【相关文献】1.Caspase8及caspase3单核苷酸多态性与晚期非小细胞肺癌铂类化疗敏感性的相关性 [J], 阎瑾;哈敏文2.XRCC1和XPD单核苷酸多态性预测晚期NSCLC铂类化疗敏感性的研究 [J], 宋德刚;刘杰;王哲海;宋宝;李长征3.XRCC1基因Arg399Gln位点多态性对卵巢癌患者铂类药物化疗敏感性及临床预后影响的Meta分析 [J], 向安玲;庄瑞春;章卓;彭玲4.基因单核苷酸多态性对非小细胞肺癌铂类化疗敏感性影响的研究进展 [J], 赵钢涛;杨凡;丁媛媛;郑绯;曾明;赵维娟;许景峰5.XRCC1单核苷酸多态性预测晚期NSCLC铂类药物化疗的敏感性 [J], 宋德刚;刘杰;王哲海;宋宝;李长征因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
单核苷酸多态性与肿瘤转移的关系
乔宇峰;冯玉梅
【期刊名称】《国际肿瘤学杂志》
【年(卷),期】2005(032)006
【摘要】单核苷酸多态性(SNP)是基因重要的变异方式之一,对肿瘤的影响不可忽视,特别与肿瘤转移存在密切关系,并可进一步影响到肿瘤的治疗及预后.现综述近年来SNP性与肿瘤转移关系的研究进展.
【总页数】4页(P403-406)
【作者】乔宇峰;冯玉梅
【作者单位】300060,天津医科大学附属肿瘤医院生物及分子生物学室国家教育部乳腺癌防治重点实验室;300060,天津医科大学附属肿瘤医院生物及分子生物学室国家教育部乳腺癌防治重点实验室
【正文语种】中文
【中图分类】R73-37;Q523.1
【相关文献】
1.单核苷酸多态性与肿瘤转移的研究进展 [J], 王瑜;杨磊;丁彦青
2.ACTN3基因单核苷酸多态性与运动能力的关系及与生化指标的关系 [J], 李立青;田亚平;董矜;张阳东;温新宇;董振南
3.Bmi1和METTL3在胆管癌中的临床意义及与肿瘤转移的关系 [J], 赵臣;张江华;王金;贾聿明
4.结直肠癌患者组织中miR-99a和miR-100表达水平与肿瘤转移的关系 [J], 郏
鹏;潘冰;汪洋;赵武华
5.恶性肿瘤与肿瘤转移第6讲肿瘤转移与前列腺素的关系 [J], 过邦辅
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单核苷酸多态性与肿瘤化疗敏感性的研究进展作者:王新国刘丽萍阚锳本巴吉韩军赞梅来源:《健康必读·下旬刊》2012年第08期【中图分类号】R735.34 【文献标识码】A 【文章编号】1672-3783(2012)08-0488-01【关键词】单核苷酸多态性;肿瘤;化疗敏感性单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)是指在基因组内某一特定核苷酸位置上存在的碱基突变(包括转换、颠换、插入、缺失),其在群体中的分布频率均不低于1%。
SNPs在人类基因组中广泛存在,平均每500-1000个碱基对中就有1个,估计其总数达300万个甚至更多。
理论上讲,SNP既可能是二等位多态性,也可能是三或四等位多态性,因为这种变异可以是C-T (在其互补链上则为G-A)转换,也可以是C-A、G-T、C-G、A-T 颠换。
实际上,三或四等位多态性的情况较少见,几乎可以忽略,通常所说的SNP都是二等位多态性。
C-T转换的发生率总是明显高于其它几种变异,具有转换型变异的SNP约占2/3,这种SNP是决定人类疾病(尤其是多基因疾病)易感性[1]和药物反应差异性(敏感性)[2],作为第三代分子遗传标记,具有比第一代、第二代遗传标记高密度、稳定和易于分型检测的优势,已成为一类新的遗传标记,因而在疾病特别是多基因疾病研究领域显示了巨大的优势。
SNP有以下几点特性:1、 SNP 适于快速、自动化的筛查和基因分型:SNP是二等位基因,即二态性标记,在基因组筛查中SNP往往只需+/-的分析,而不用分析片段的长度,有利于自动化技术的应用。
2、 SNP在基因组中的相对稳定性:SNP是高度稳定的,尤其是处于编码区内的SNP(cSNP),能广泛应用于遗传分析或基因诊断。
3、用于基因分型及等位基因频率的估算:SNPs的二等位多态性特点使我们对疾病易感基因进行基因型和等位基因频率分布的研究统计中变得简便易行。
单核苷酸多态性及其检测方法的新进展
程祺;吴获
【期刊名称】《实用肿瘤学杂志》
【年(卷),期】2008(022)005
【摘要】@@ 单核苷酸多态性(single nucleotide polymor-phisms,SNPs)被认为是继限制性片段长度多态性(RFLP)和微卫星多态性(microsatellitepolymor-phisms)之后的第三代遗传标记,近几年被广泛应用于生物以及医学研究的诸多领域,SNPs的研究有助于解释个体间的表型差异、不同群体及个体对疾病,
【总页数】4页(P494-496,493)
【作者】程祺;吴获
【作者单位】吉林省肿瘤医院中西医结合科,长春,130012;吉林省肿瘤医院中西医结合科,长春,130012
【正文语种】中文
【中图分类】R736.1
【相关文献】
1.基因突变和单核苷酸多态性分析技术新进展 [J], 廖晓兰;朱水芳;罗宽
2.高尿酸血症和痛风易感基因单核苷酸多态性研究新进展及应用 [J], 熊安;姚麒;余晶波
3.PLCE1及其单核苷酸多态性功能研究新进展 [J], 原晋阳;贾彬;闫慧明
4.单核苷酸多态性检测方法的新进展 [J], 赵广荣;扬帆;元英进;高秀梅;张军平
5.家禽单核苷酸多态性研究与应用新进展 [J], 卢立志;李进军;田勇;傅衍
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COX-2基因单核苷酸多态性与结直肠腺瘤遗传易感性的关系阮玉凤;孙璟;吴方;江石湖【期刊名称】《国际消化病杂志》【年(卷),期】2013(033)002【摘要】目的探讨环氧合酶-2(COX-2)基因多态性与结直肠腺瘤(CRA)易感性的关系.方法采用病例对照研究方法,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术(PCR-RFLP)和错配聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术(PIRA-PCR),分别检测110例CRA患者和120名健康人群的COX-2基因-765G>C、-1195G>A、8473T>C 3个多态位点,采用x2检验比较不同基因型与CRA易感性的关系.结果CRA组和对照组的COX-2-765 G>C、-1195G>A 2个位点的3种基因型频率分布差异无统计学意义(P=0.972,P=0.313);两组间COX-2 8473T>C位点的3种基因型分布差异有统计学意义(P=0.034),Logistic回归分析显示,携带突变等位基因C的个体(8473TC+CC) CRA的易感性显著降低(OR=0.500,95 %CI:0.274-0.913,P=0.024).结论 COX-2-765G>C、-1195G>A可能与CRA易感性无关,COX-2 8473T>C与CRA易感性相关.%Objective To investigate the relationship between cyclooxygenase-2 (COX-2) single nucleotide polymorphisms (SNP) and the susceptibility of colorectal adenoma (CRA). Methods We used polymerase chain reaction-restricted fragements length polymorphism (PCR-PFLP) and the primer-introduced restriction analysis (PIRA)-PCR assay to genotype the COX-2 -765G>C、-1195G>A、8473T>C polymorphisms in a case-control study of 110 CRA cases and 120 adenoma-free controls in Chinese population. Results The distribution ofthe genotype frequencies of -765G>C and -1195G>A were not statistically different between the cases and controls (P = 0. 972 for -765G >C and P = 0. 313 for -1195G> A). Polymorphism of COX-2 8473T>C were associated with the susceptibility to CRA. Logistic regression analyses revealed that the individuals with the 8473C allele had a decreased risk of CRA (OR = 0. 500, 95%CI: 0. 274-0. 913, P = 0. 024). Conclusions Polymorphisms of COX-2 -765G>C and -1195G>A are not associated with the susceptibility to CRA. However, COX-2 8473T>C can reduce the risk of CRA.【总页数】4页(P132-135)【作者】阮玉凤;孙璟;吴方;江石湖【作者单位】上海交通大学医学院附属瑞金医院消化科【正文语种】中文【相关文献】1.TAGLN2基因单核苷酸多态性与广西扶绥县肝癌高发家系遗传易感性的关系 [J], 郭辉;魏斐斐;蒋群湘;谢裕安2.广西扶绥县壮族人群MASP1基因单核苷酸多态性与肝癌遗传易感性的关系 [J], 郭辉;魏斐斐;蒋群湘;谢裕安3.TLR4基因rs7873784单核苷酸多态性与肝癌遗传易感性关系 [J], 李唯源;张志;李昂;付宁;宋琴琴;刘冲;吕澜;张浩良;张雪梅4.TLR4基因rs7873784单核苷酸多态性与肝癌遗传易感性关系 [J], 李唯源;张志;李昂;付宁;宋琴琴;刘冲;吕澜;张浩良;张雪梅5.血管表皮生长因子基因单核苷酸多态性与子宫内膜异位症遗传易感性的关系 [J], 徐群群;曹阳;卢敏;张婷婷;谭蕾;戴德英;束兰娣;孙兆贵;季培英;王唯迪;庄梦斐;夏馨因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
单核苷酸多态性的研究应用进展
周娟娟;洪素云
【期刊名称】《现代免疫学》
【年(卷),期】2004(24)6
【摘要】SNP作为第三代遗传标记具有数量多、分布广泛、比STR扩增更可靠、不产生假带、易于自动化批量检测、易于计算机分析结果等特点。
因此,它比第一、二代遗传标记更适合于对复杂性疾病遗传解析以及基于群体基因识别等方面的研
究 ,并将最终取代目前最常用的微卫星标记技术进入基因应用研究的领域。
本文就SNP的研究进展作一简要综述。
【总页数】3页(P523-525)
【关键词】单核苷酸多态性;遗传标记;基因分析
【作者】周娟娟;洪素云
【作者单位】厦门市中心血站
【正文语种】中文
【中图分类】R392.4
【相关文献】
1.基于标签单核苷酸多态性单倍型和单倍域的构建及其在关联研究中的应用 [J],
顾明亮;褚嘉祐
2.单核苷酸多态性在肿瘤易感性及临床应用中的研究进展 [J], 刘春玲;于典科;林东昕
3.应用下一代测序技术检测肿瘤单核苷酸多态性研究进展 [J], 吴慕云(综述);王希成(审校)
4.单核苷酸多态性在茶树中应用的研究进展 [J], 陈丝;郭燕;杨春;李燕
5.高尿酸血症和痛风易感基因单核苷酸多态性研究新进展及应用 [J], 熊安;姚麒;余晶波
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mTOR基因单核苷酸多态性对中国人群脑膜瘤发生
发展的影响的开题报告
一、研究背景
脑膜瘤是一种恶性肿瘤,发病率相对较低,但易侵犯神经系统导致
严重后果。
近年来,该肿瘤的发病率有所上升,其发病机制尚未完全明确。
mTOR是一种重要的调节基因,其在多种肿瘤的发生发展中扮演着
重要角色。
而mTOR基因的单核苷酸多态性(SNP)可能与脑膜瘤的发
生发展有关,但其在中国人群中的影响尚未有系统研究报道。
二、研究目的
本研究旨在探讨mTOR基因SNP(rs2536)在中国人群脑膜瘤发生
发展中的作用,为该肿瘤的早期诊断和治疗提供参考。
三、研究方法
本研究将通过病例对照分析的方法,选取来自中华人民共和国不同
地区的200名脑膜瘤患者和200名健康对照者,进行mTOR基因SNP的检测,并对两组数据进行比较分析。
通过多元逻辑回归分析与风险估计,分析SNP与脑膜瘤发生发展之间的关系。
四、研究意义
本研究的结果有望为中国人群脑膜瘤的早期诊断提供新的生物学标记,并为该肿瘤的治疗提供新的思路。
对于完善脑膜瘤发病机制的研究
也具有很大的意义。
DNA修复基因的单核苷酸多态性与铂类药物抵抗研究进展魏嘉刘宝瑞王亚平【主题词】药物遗传学;单核苷酸多态性;DNA切除修复【Subject words】pharmacogenetics; single nucleotide polymorphisms(SNPs); DNA repair目前肿瘤的“标准化疗”仍然是以解剖部位为基础选择化疗药物的治疗。
由于肿瘤本身以及个体之间异质性的存在,同一部位的肿瘤对“标准化疗”的敏感性和毒副作用差异很大。
长期以来,人们追求根据肿瘤自身药物敏感性为指导开展个体化的药物治疗。
最近3年,随着人类基因组计划的完成,恶性肿瘤的分子亚分类成为可能,以药物敏感相关基因为检测目标的药物基因组学(pharmacogenomics)、药物遗传学(pharmacogenetics)获得快速发展,使个体化的化疗成为可能。
2004年美国临床肿瘤学会(american society of clinical oncology, ASCO)年会上有人预测,未来5-10年将是由当今标准化疗向个体化疗的过渡期。
在化疗药物与相关基因的研究领域,铂类药物与DNA 修复基因的单核苷酸多态性研究是最受瞩目的内容之一。
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)作为个体差异的遗传学作者单位:210008 南京南京大学医学院附属鼓楼医院肿瘤中心(魏嘉、刘宝瑞),南京大学医学院(王亚平) 通讯作者:刘宝瑞(E-mail: baoruiliu@)基础已经受到高度重视,成为全新一代遗传标记,是基因组学及遗传学研究的主要工具之一。
SNP是人类和动物基因组中普遍存在的一种分子标记,通常是特定碱基位点的两个等位基因存在,其中较低的等位基因频率大于1/100时,该位点即为单核苷酸多态性位点。
通过检测SNP的遗传多态性标记揭示人群中不同个体对不同药物的敏感性差异的根本原因,是SNP在药物遗传学中的重要应用。
DNA修复基因单核苷酸多态性与铂类药物抵抗研究进展武玉国
【期刊名称】《中华腹部疾病杂志》
【年(卷),期】2006(6)9
【摘要】目前,肿瘤的标准化疗仍然是以解剖部位为基础选择化疗药物,但由于肿瘤本身以及病人个体之间异质性的存在,同一部位的肿瘤对标准化疗的敏感性及化疗产生的毒副反应差异很大。
以肿瘤自身药物敏感性为指导开展个体化的药物治疗成为多年来临床研究的热点。
随着人类基因组计划的完成,恶性肿瘤的分子亚分类成为可能,以药物敏感相关基因为检测目标的药物基因组学、药物遗传学获得快速发展,使个体化的药物治疗成为可能。
【总页数】3页(P700-702)
【作者】武玉国
【作者单位】山东省新泰市人民医院肿瘤科,271210
【正文语种】中文
【中图分类】R979.1
【相关文献】
1.DNA修复基因单核苷酸多态性预测铂类药物敏感性和预后 [J], 方桦;王兴元
2.DNA修复基因XRCC1单核苷酸多态性与铂类药物化疗对外周血白细胞的影响相关性分析 [J], 王宜宗;张军宁;王建平;陈彬
3.DNA修复基因单核苷酸多态性与肺癌易感性关系的研究进展 [J], 朱锦富;陈亦江
4.DNA损伤修复、TP53、ABCB1基因单核苷酸多态性与NSCLC铂类药物疗效关系的研究进展 [J], 王重娟;梁月琴;金醒昉
5.DNA修复基因单核苷酸多态性和膀胱癌易感性关系的研究进展 [J], 罗勇
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DNA 修复基因单核苷酸多态性在肿瘤化疗敏感性预测的应用进展33 基金项目:全军医学科学技术研究“十一五”计划基金(06MA111)、江苏省自然科学基金前期预演项目(BK2005203)、南京市医学科技发展项目(ZK X0427)1 210009 东南大学附属中大医院血液科2 通讯作者,E 2mail :S UNXCH505@yahoo 210009 南京 东南大学临床医学院 孙 宁,陈宝安1,孙新臣2 【关键词】 单核苷酸多态性; DNA 损伤修复; 肿瘤; 化疗敏感性中图分类号:R730145 文献标识码:A 文章编号:1009-0460(2008)01-0088-05 恶性肿瘤严重威胁着人类的健康,化学药物治疗在肿瘤的三大治疗方法中占有重要的地位。
同一药物在不同个体产生的效果不完全相同,这种不同是由人类基因组中的遗传多态性即遗传差异决定的。
人类基因组中一类普遍的遗传多态性是基因组中散在的单个碱基的不同,即单核苷酸多态性(single nucleotide poly mor phi m s,S NPs )[1],是继第一代限制性片断长度多态性(restricti on frag ment length poly mor 2phis m s,RF LP )和第二代微卫星多态性(m icr osatellite poly 2mor phis m s )之后的新一代遗传标记。
DNA 损伤修复基因在细胞的增殖、癌变以及与外环境因素的相互作用中发挥重要的作用。
肿瘤细胞修复基因S NPs 可导致化疗药物引起的DNA 分子损伤修复作用的个体差异,从而影响到肿瘤患者对化疗药物的敏感性。
1 S NPs 的概念和特点S NPs 是指不同个体的基因间以及同一个体的基因组DNA 中由单个核苷酸变异引起的DNA 序列差异,如果在人群中的发生频率超过1%,即为S NPs 。
虽然遗传密码由4种碱基组成,但实际在人类中S NP 通常只是一种二等位基因(biallelic )或二态的遗传变异。
PTGS2基因单核苷酸多态性与肿瘤的关联研究进展前列素内环氧化物合成酶2(prostaglandin endoperoxide synthase2 PTGS2)在人类许多良性癌前病变和恶性肿瘤中均有高表达,能促进肿瘤血管生成,上皮细胞去分化,增强肿瘤细胞侵袭转移潜能、抑制细胞凋亡等生物过程。
而全基因组关联研究发现单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism SNP)对临床多种疾病包括肿瘤的易感性和预后有重要意义。
本文对单核苷酸多态性与食管癌、乳腺癌、肝癌、肺癌、结直肠癌等的关系进行综述。
标签:PTGS2基因;单核苷酸多态性;预后PTGS2基因是一种诱导性即刻反应基因,在正常生理状态下,大多数组织细胞不表达,但在炎症或肿瘤等病理反应发生过程中,受某些细胞因子、生长因子、炎性介质、促癌因子、缺氧、激素等刺激因素作用,其表达迅速上调,而PTGS2主要产物前列腺素具有抑制细胞凋亡、促进细胞增殖、抑制免疫监视、促进血管生成等多种生物学活性。
说明PTGS2在肿瘤的发生、发展过程中发挥着关键作用[1]。
在DNA序列的同一位点上,不同个体间存在的一个碱基的差异称为单核苷酸多态(SNP),在人群中这种变异的发生频率至少大于1%,是第三代多态性遗传标记。
在人类遗传基因的各种差异,有90%都可归因于SNP所引起的基因变异。
大多数SNPs对个体的表现型是无影响的.但是有的SNPs位于基因启动子中,导致基因转录活性的增强或减低,使该基因蛋白的表达量增加或减少,进一步影响其生物学活性.从而改变对特定环境或病因的反应敏感性。
肿瘤已证实是多基因和某些环境因子累加作用所致,这些基因的SNP相互协同或拮抗可能是造成疾病易感性及预后不同的重要原因之一。
因此,对肿瘤相关调节通路的候选基因进行SNP的关联研究,无疑是肿瘤的诊断及治疗研究取得突破的希望所在。
近年来的研究发现,PTGS2基因SNPs与肿瘤发生、发展密切相关,现本文对PTGS2启动子区的两个常见SNPs-765G>C、-1195G>A单核苷酸多态性与肿瘤相关性研究进展综述如下:1.PTGS2基因单核苷酸多态性PTGS2的表达与催化作用如何导致肿瘤形成的确切机制尚不十分清楚。
目前已证实,PTGS2表达的调控主要在转录水平上,而在PTGS2启动子区存在多种增强子和转录调控元件,如:TATA box、CAAT /C/EBP结合位点、NF-КB/NF-IL-6结合位点、AP-2、SP 1、CRE等,调控PTGS2的表达。
Szczeklik 等[2]研究发现,PTGS2启动子区-765G>C多态性处于转录因子SP1结合位点,G>C突变破坏了SP1结合位点而形成了另一个转录因子E2F的结合位点,使PGs 的生物合成增加。
但是Papafili等[3]却研究发现-765G>C多态性位于SP1结合位点,存在-765C等位基因变异的质粒在细胞转录中可能通过破坏SP1结合位点使PTGS2基因表达下降30%。
而PTGS2基因启动子区另一个多态性位点-1195G>A 的功能性研究显示该位点多态性产生了一个新的c-Myb结合位点并且可以使PTGS2基因在HeLa细胞中的表达明显增强。
这些研究表明PTGS2基因遗传多态性可能导致基因功能或其转录活性的改变,从而使得不同个体PTGS2表达水平及其对疾病的易感性及预后不同。
2. PTGS2基因单核苷酸多态性与肿瘤的关系2.1 PTGS2基因单核苷酸多态性与肺癌Bi Nan等[4] 对中国人群不可切除的局限进展期非小细胞肺癌患者与PTGS2基因多态性关系进行研究中,发现PTGS2基因-1195GA+GG基因型较AA基因型中位生存时间(20.2个月VS 15.7个月,HR=0.58,95%CI:0.39-0.86;P=0.006)和无进展生存时间(11.9个月VS 9.5个月,HR=0.66,95%CI:0.45-0.97;P=0.034)都明显延长;且在COX多因素风险模型分析中,-1195 G>A 基因多态性经过临床病理校正后可作为一个与总生存相关的独立因素,而-765G>C未发现与肺癌预后有显著影响。
与此相反,Liu 等[5]研究发现-1195G>A单核苷酸多态性对台湾与丹麦人群的肺癌患病风险均无显著相关性。
2.3 PTGS2基因单核苷酸多态性与胃癌一项PTGS2基因多态性与胃癌易感性关联的meta分析结果显示:携带-765C、-1195A等位基因可增加胃癌患病风险(OR=1.71,95%CI:1.01-2.90,P=0.05;OR:1.58,95%CI:1.05-2.38,P=0.03)。
Zhang Xuemei等[6] 在以中国人群为研究对象的病理-对照结果发现与-765GG基因型比较,-765GC基因型患胃癌的风险显著增加(OR=2.06,95%CI:1.29-3.29);-1195AA基因型患者较-1195GG基因型患者显著增加胃癌的发病风险(OR=1.50,95%CI:1.05-2.13)。
单体型分析显示:G-1195-G-765-AGly587Arg单体型(OR:1.71,95%CI:1.01-2.88)与A-1195-A-765-GGly587Arg(OR=2.49,95%CI:1.54-4.01)单体型发生胃癌的风险增高。
而蒋国军等[7] 的病例组-对照研究却未发现-1195G>A单核苷酸多态性与胃癌患病风险相关。
此外,在波兰人群中,Lifang Hou等[8]未发现-765G>C单核苷酸多态性与胃癌患病风险相关。
2.4 PTGS2基因单核苷酸多态性与结直肠癌在中国人群中,Tan Wen等[9]研究显示,与-765GG比较,-765GC基因型患结肠癌的风险增加(OR = 1.73,95% CI 1.23–2.43);-1195GA和-1195AA基因型较-1195GG基因型也增加患结肠癌的风险(OR分别为1.24、1.77,95% CI分别为1.00–1.54、1.38–2.25)。
而在荷兰人群中,Juli?t H Hoff等[10] 研究发现,携带-765GC基因型个体发生结肠癌的风险增加降低(OR=0.69,95%CI:0.49-0.97),-1195G>A 在病例组与对照组中发病风险无显著差异,但GG/AC单体型可减少发生结肠癌的风险。
而Pereira,C等[11]对吸烟进行分层分析后所得的研究结果与以上研究均不相同,研究显示男性及曾经吸烟者携带-1195G 等位基因(AG+GG)增加结肠癌进展风险(分别OR=2.58;95% CI:1.29-5.15;:OR:10.3;95% CI:3.37-31.2)。
而曾经吸烟的男性患者携带-1195G 等位基因结肠癌发病风险增加9倍(95% CI: 2.94-27.6);未发现-765G>C单核苷酸多态性与结肠癌患病风险相关。
之前国内外关于PTGS2单核苷酸多态性与结直肠癌的关系的多项研究也未发现-765G>C与结直肠癌发病风险有直接关系。
2.5 PTGS2基因单核苷酸多态性与乳腺癌Juliana S等研究巴西国家癌症研究所606位乳腺癌女性PTGS2基因单核苷酸多态性与乳腺癌预后的关系时,发现-765GC基因型和CC基因型在组织学表达ER(-)、PR(-)、HER2阳性患者的表达(分别为OR=1.75,95% CI:1.15-2.57,P=0.005;OR=1.56,95% CI:1.09-2.22,P=0.010;OR=1.80,95% CI:1.04-3.13,P=0.025)均高于携带-765GG基因型的患者;而携带-1195位点G等位基因(AG+GG)是一种保护性因素,在组织学ER(-)组表达降低(OR=0.57,95% CI:0.33-0.98,P=0.03)。
提示携带-765 C等位基因或-1195 G等位基因对乳腺癌患者的预后有一定的预测作用。
而其他如Piranda等[12]在研究巴西和中国人群时,均未发现-765G>C或-1195G>A单核苷酸多态性与乳腺癌患病风险相关。
但Gao等研究单倍体分析显示A一1195-A-765-T8473 单倍体型增加个体乳腺癌患病风险(OR=9.16,95% CI:1.14-73.51)。
2.6 PTGS2基因单核苷酸多态性与肝癌许东奎等[13]研究中国人群PTGS2启动子区SNP位点,与原发性肝癌遗传易感性的关系发现,-1195AA和-765GC基因型与肝癌风险增高相关,OR值分别为1.57(95%CI:1.01-2.44)和2.89(95%CI:1.65-5.08);单体型分析显示:与A一1290-G-ll95-G-765相比较,含有-1195A等位基因的A一1290-A-ll95-G-765和A一1290-A-ll95-C-765两种单体型发生肝癌的相对风险增高,OR值分别为1.27(95%CI:1.01-1.60)和7.95(95%CI:1.76-36.02)。
同时包含-1195A等位基因和-765C等位基因的单体型发生肝癌的OR值较高。
另一项在中国湖北汉族人群关于-1195A>G与乙型肝炎相关性肝细胞性肝癌的关系的病例-对照研究发现,携带-1195A等位基因的HBV感染者可增加患肝细胞性肝癌的风险(OR=0.72;95% CI:0.548–0.946)。
最近Chang等报道在台湾人群中,PTGS2-1195G>A及-765G>C单核苷酸多态性与肝细胞性肝癌无关[14]。
3、小结国内外大量研究发现PTGS2基因单核苷酸多态性与多种肿瘤发生发展密切相关,但是结果不能统一。
可能是由于1.种族差异的遗传背景和环境因素的影响;2.癌症是一种多基因复杂疾病,可能存在一些未被识别但同样参与了癌症的发生发展的基因,与PTGS2基因共同作用;3.其他因素作为混杂因子如吸烟、酒精摄入、非甾体抗炎药等,与PTGS2基因-1195G>A、-765G>C多态性存在交互作用;4.还有实验设计不恰当、选择偏倚等都会影响了结果的判断。
PTGS2基因单核苷酸多态性在肿瘤发生、发展中起作用的具体途径、表达调控和临床应用等方面尚需大样本、多中心及多个基因多态性位点联合研究,结合科学合理的研究设计及统计学分析。
进一步阐述PTGS2基因单核苷酸多态性促进肿瘤发生发展的机制及与肿瘤易感性及预后的关系,对肿瘤的诊断、治疗、靶向药物的研究及筛选肿瘤高危易感及预后不良的人群有重要意义。
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