基于线粒体细胞色素氧化酶基因序列的飞蝗属4亚种系统发育关系分析(摘要)

基于线粒体DNA全序列11个蛋白编码基因拼接序列的鳞翅目昆虫系统发育研究李青青;段焰青;李地艳;李加敏;刘晓飞;徐怀亮;李佛琳;周汝敏;曹能;叶辉【期刊名称】《云南农业大学学报：自然科学版》【年(卷),期】2010(025)002【摘要】目前已测定线粒体DNA全序列的鳞翅目昆虫有12种。

由于高变异性和强核苷酸组成偏好性，去除了两个蛋白基因和两个物种，最终以10个鳞翅目物种的11个蛋白编码基因拼接序列对鳞翅目分子系统发育关系进行了研究。

与前人的结果一致，基于11个蛋白编码基因拼接序列数据所构的最大似然树支持鳞翅目，鳞翅目内各总科和各科均为单系群。

与MINET基于形态学数据的结果相同，各总科的系统发育关系为{卷蛾总科＋[螟蛾总科＋（尺蛾总科＋蚕蛾总科）]}。

蚕蛾总科内各科系统发育关系类似于REGIER等的结论。

【总页数】6页(P213-218)【作者】李青青;段焰青;李地艳;李加敏;刘晓飞;徐怀亮;李佛琳;周汝敏;曹能;叶辉【作者单位】云南师范大学生命科学学院云南昆明650092;红云红河烟草（集团）有限责任公司技术中心云南昆明650202;四川农业大学动物科技学院四川雅安625014;云南大学生命科学学院云南昆明650091;云南农业大学烟草学院云南昆明650201【正文语种】中文【中图分类】Q963【相关文献】1.基于线粒体DNA D-loop区全序列分析藏鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究 [J], 贾晓旭;唐修君;陆俊贤;顾荣;葛庆联;高玉时;苏一军2.基于rbcL蛋白质序列的石斛属植物系统发育研究 [J], 宁静;陈惠娟;钟一文;宁正元3.基于2种核蛋白编码基因序列研究16种对虾系统发育关系 [J], 易啸;毛勇;苏永全4.基于COII全基因序列对蜻科部分昆虫的分子系统发育分析(蜻蜓目:差翅亚目) [J], 查岭生;张大治;郑哲民5.基于线粒体DNAD-loop区全序列分析大围山微型鸡遗传多样性及其起源进化关系的研究 [J], 贾晓旭;唐修君;陆俊贤;顾荣;葛庆联;高玉时;苏一军因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

基于线粒体基因对直翅目昆虫系统发育学的研究
马婷婷;陈光
【期刊名称】《吉林农业大学学报》
【年(卷),期】2011(033)005
【摘要】简要概述了线粒体基因组的结构和特点,同时基于线粒体基因组中的13个蛋白编码基因,选螳螂目、蜚蠊目、等翅目及螳脩目的5个种为外群,对直翅目34个种进行系统发育学研究.结果表明直翅目与外群分开,形成单系群.直翅目内部形成螽亚目与蝗亚目2个单系群.在螽亚目内部形成螽次亚目与蟀次亚目2个分支,且驼螽总科与螽斯总科形成姐妹群,但蚁蟋科与蝼蛄科形成1支,并不支持蟋蟀总科的单系性.在蝗亚目内部形成(蚤蝼总科+(牛蝗总科+(锥头蝗总科+蝗总科)))的系统进化关系.
【总页数】6页(P494-499)
【作者】马婷婷;陈光
【作者单位】吉林农业大学生命科学学院,长春130118;吉林农业大学生命科学学院,长春130118
【正文语种】中文
【中图分类】Q969.26
【相关文献】
1.大蚕蛾科绢丝昆虫线粒体基因组A+T丰富区序列及其系统发育研究 [J], 沈兴家;陈丽媛;唐顺明;孙孝龙;赵巧玲;朱晨;郭锡杰
2.基于线粒体基因组的东方鲀属系统发育学及群体遗传学 [J], 周志雄;刘波;宫杰;
白玉麟;阳俊逸;徐鹏
3.直翅目昆虫线粒体基因组的特征及应用 [J], 刘静;边迅
4.蝗总科昆虫雌性下生殖板及系统发育关系研究(直翅目) [J], 许升全;郑哲民
5.小车蝗属Oedaleus Fieber昆虫的种间系统发育关系支序分析(直翅目:斑翅蝗科) [J], 廉振民;胡玉琴;乔永民
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9期
程汉良
等： 基于线粒体细胞色素 c 氧化酶亚基 I 基因序列的帘蛤科贝类分子系统发育研究
2745
which 334 were parsimonyinformative sites，with 72 transitions （ si ） and 93 transversions （ sv） （ si / sv = 0． 8 ） ． Meanwhile， no indels （ insertions / deletions ） were detected in the COI sequences from any samples． The percentage of interspecific sequence divergence within the same genus， intergeneric sequence divergence within the same subfamily， and those between 19． 7% —29． 0% and 29． 2% ，respectively． The COI subfamilies were analyzed． The mean values were 12． 5% — 27． 3% ， fragment encodes 235 amino acids，of which 100 sites were variable． A phylogenetic tree of 35 Veneridae clams was constructed based on the COI nucleotide sequences，with Mactra chinensis as an outgroup species． Tree topologies showed that all species of Veneridae are in the same group，forming a clade distinct from the outgroup species． Within Veneridae， six species of the subfamily Dosininae formed a clade with a bootstrap value of 75% ． Two species of the subfamily Venerinae formed another clade with a bootstrap value of 93% ． All species of the subfamily Meretricinae formed a monophyletic group with a bootstrap value of 70% ，in which M． meretrix，M． lusoria and Meretrix petechialis were first clustered with a high bootstrap value of 99% ． This result indicated that M． meretrix， M． lusoria， and M． petechialis have a closer relationship than other species． An analysis of tree topology and sequence alignment indicated that M ． lusoria，M． petechialis，and M． meretrix are closely related species． The data support the viewpoint that M． petechialis and M． lusoria should be treated as synonymous with M． meretrix，and may be described as two geographical subspecies． The data also support the perspective that Dosinia corrugata and Dosinia angulosa are two distinct species． The validity of Paphia undulata and Paphia textile as different species is also supported． This result reveals that the COI gene is an appropriate marker for studies in phylogeny and phylogeography of the Veneridae clams． Key Words： veneridae； mitochondrial DNA； cytochrome c oxidase subunit I； phylogeny

（大理大学农学与生物科学学院，云南大理 671003）
［摘要］基于线粒体 COⅠ基因 538 bp 片段重建了斑腿蝗科中 4 亚科（卵翅蝗亚科、稻蝗亚科、禿蝗亚科和黑蝗亚科）10 属 37 种
和锥头蝗科 1 属 1 种（外群）的系统发育关系。结果显示：（1）4 亚科的亲缘关系为（（（卵翅蝗亚科、稻蝗亚科）秃蝗亚科）黑蝗亚
大理大学学报
JOURNAL OF DALI UNIVERSITY
［DOI］10. 3969 / j. issn. 2096-2266. 2016. 12. 014
第1卷 第12期 2016年12月 Vol.1 No.12 Dec. 2016
基于线粒体 COⅠ基因序列探讨卵翅蝗亚科系统发育关系
胡 洲，徐吉山，毛本勇*
较差的碱基后，使用 ClustalX 软件〔14〕进行同源性比 对，共得到平均长度为 619 bp 的数据集，序列采用 MEGA4.0〔15〕进行序列组成及饱和度分析，之后采用 ML 法构建系统发育树。见表 1。
表 1 样品来源及其 COⅠ基因序列 GenBank 登录号
亚科
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ïïLeabharlann ï扩增体系为：DNA 模板 3 μL、上游引物 2 μL、下 游引物 2 μL、Taq 酶 1 μL、Buffer 10 μL、DNTP 2 μL、 H2O 30 μL。
PCR 反应条件：95 ℃预变性 3 min，运行循环： 95 ℃变性 30 s，60 ℃退火 1 min，72 ℃延伸 1 min，共 35 个循环，72 ℃延伸 10 min，25 ℃保存。个别样品 在实验中出现非特异的条带，且经优化条件无法去
目前缺乏针对卵翅蝗亚科开展的分子系统学 研究，或仅见涉及该亚科个别属的 1~2 个物种的报 道，所以有必要在增加属级单元和物种数量以加大