植物基因克隆的策略与方法
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植物遗传工程中的基因克隆与转化技术植物遗传工程是指通过改变植物的遗传物质,以达到改良、改变或创新植物性状的目的。
其中基因克隆与转化技术是植物遗传工程中的关键技术之一。
基因克隆指的是通过将特定基因从一个生物体中分离并扩增形成DNA片段,使其能够在其他生物体中稳定表达。
转化技术则是将克隆的基因导入到目标植物体内,使其能够在植物表达并产生相应的功能。
一、基因克隆技术基因克隆技术是植物遗传工程中的关键环节。
首先需要从源生物体中分离出目标基因。
常用的方法有PCR扩增、限制酶切片段分离等。
通过PCR扩增技术,可以快速、高效地扩增目标基因,提供足够的DNA片段用于后续的克隆工作。
限制酶切片段分离则是利用特定的酶将目标基因从源DNA片段中切割出来。
接下来,克隆基因需要被插入到适当的载体中,常用的载体包括质粒和病毒等。
将基因插入载体后,需要通过转化技术将其导入目标植物体内。
二、转化技术转化技术是将克隆的基因导入到目标植物体内的关键步骤。
常见的转化技术主要有基因枪法、农杆菌介导法和化学法等。
基因枪法是通过将DNA微粒射入植物细胞,使基因得以导入的方法。
此方法简单、高效,对不同植物都适用,因此被广泛应用于植物遗传工程中。
农杆菌介导法则是利用农杆菌将目标基因导入植物细胞。
这种方法克服了基因枪法的一些限制,可以导入更长的DNA片段,但受适用植物种类的限制。
此外,化学法也是一种常用的转化技术,通过利用化学物质使植物细胞的细胞壁通透性增强,从而实现目标基因的导入。
三、应用前景与挑战基因克隆与转化技术在植物遗传工程中具有广阔的应用前景。
通过基因克隆和转化技术,可以实现对植物农艺性状的改良,提高植物的抗病虫害能力、耐逆性和产量,从而促进农业的可持续发展。
此外,利用基因克隆和转化技术还可以为植物生物制药、环境修复等领域提供解决方案。
然而,基因克隆与转化技术在应用过程中也面临一些挑战。
首先,对于目标基因的选择和定位仍然是一个复杂的问题。
植物转基因技术的原理和方法
1、植物转基因技术的原理
植物转基因技术是指将外源DNA片段插入到植物细胞的过程,从而改变植物的表型特征。
在植物转基因技术中,将外源DNA插入到植物细胞的过程包括以下几个步骤:
(1) DNA片段的生产和收集:DNA片段的生产和收集是通过一系列的生物技术手段来实现的,比如PCR扩增技术、染色体复制,等等。
(2)特異性克隆:特異性克隆是一种利用抗原受体系统的分子生物学技术,主要是通过聚合酶链反应的方法,将无菌的DNA片段植入到宿主细胞中,从而使改变细胞表型性状的抗原受体获得潜在的克隆特异来源。
(3) 载体特异性转染:载体特异性转染是将DNA片段植入到宿主细胞中的过程,它通常是利用哺乳动物质粒等载体将外源DNA片段植入到宿主细胞中。
(4) 转化:转化是植物细胞在受到DNA片段植入后,能够形成含有外源基因的植物的过程。
2、植物转基因技术的方法
(1) 诱导细胞抗性:植物转基因技术可以利用一些诱导剂,如多聚糖、双链RNA等,通过诱导植物细胞的自然抗性,让其增加免疫反应及抗外源性抗原的能力,从而提高转基因植物的转化效率。
(2) 共价结合技术:共价结合技术是一种利用化学方法将外源DNA植入植物细胞的技术,它通常利用某种活性稀释剂将DNA片段与
植物细胞表面形成稳定的共价结合,从而使外源DNA片段能够植入宿主细胞。
(3) 转化抗性:转化抗性是一种利用抗生素来抑制植物细胞的自然抗性,从而促进植物细胞内部外源DNA的转化。
一般常用的抗生素有青霉素和环丙沙星。
(4) 小麦内含体技术:小麦内含体技术是一种利用小麦内含体将外源DNA植入植物细胞的技术,它通常利用小麦内含体外质壁偶联(ECC)促进外源DNA的转化。
植物基因克隆的策略及方法首先,PCR是植物基因克隆的重要策略之一、PCR(聚合酶链反应)是一种体外复制DNA片段的方法,可以在短时间内扩增大量的特定DNA序列。
通过PCR可以快速准确地克隆植物基因。
PCR的基本原理是利用DNA 聚合酶酶学合成原理,在DNA片段两侧设计引物,将其与DNA片段的两侧结合,在适当的条件下进行DNA的聚合酶链反应,从而扩增目标基因。
PCR方法主要包括加热解性、引物连接、扩增和酶切等步骤。
其次,限制性酶切也是植物基因克隆的重要方法。
限制性酶切是指利用特定的限制性酶将DNA分子切割成特定序列的片段。
通过限制性酶切,可以将目标基因从植物DNA中剪切出来,然后进行进一步处理。
限制性酶切的基本原理是将特定的限制性酶加入反应体系中,该酶能识别和切割DNA的特定序列,从而将目标基因从DNA中剪切出来。
限制性酶切方法主要包括选择合适的限制性酶、反应条件的优化、酶切产物的回收和检测等步骤。
连接是植物基因克隆的另一种重要方法。
连接是指将目标基因连接到特定的载体DNA上,以便在目标植物中稳定地表达。
连接方法主要包括两个步骤:首先,需要处理载体DNA和目标基因的末端,以便它们能够相互连接;其次,利用DNA连接酶将载体和目标基因连接起来。
连接步骤中的处理涉及到DNA末端的修饰和处理,可以通过多种方法如限制性内切酶切割、引物扩增、酶切等进行。
最后,转化是植物基因克隆的最后一步。
转化是指将连接好的目标基因插入到目标植物的基因组中,使其能够在植物体内稳定表达。
转化的方法有多种,包括农杆菌介导的转化、基因枪转化、电穿孔转化等。
其中,农杆菌介导的转化是最常用的方法之一、农杆菌介导的转化是利用农杆菌作为载体将外源DNA导入到目标植物细胞中,通过农杆菌的自然寄生习性以及在植物细胞中特定的植物基因的活性表达,实现目标基因的稳定表达。
总的来说,植物基因克隆的策略和方法包括PCR、限制性酶切、连接和转化。
通过这些方法,可以快速准确地克隆植物基因,实现对植物遗传特性的改变和优化,为农业生产和植物遗传研究提供有力的技术支持。
植物生物技术中的基因克隆与基因工程技术植物生物技术的快速发展为人们改良和改造植物基因提供了广阔的空间。
基因克隆和基因工程技术成为植物生物技术中的两个重要方面。
本文将以“植物生物技术中的基因克隆与基因工程技术”为题,探讨这两个方面的内容。
一、基因克隆基因克隆是指通过复制和扩增DNA序列,从而制备大量相同DNA分子的过程。
基因克隆是植物生物技术中最早也是最常用的技术之一。
1. PCR技术PCR技术(聚合酶链反应)是一种能够扩增DNA片段的方法,它可以制备大量具有相同DNA序列的片段。
在基因克隆中,PCR技术被广泛应用于检测和扩增目标基因,为基因工程技术的开展提供了基础。
2. 限制性内切酶限制性内切酶是一类能够识别特定DNA序列并对其进行切割的酶。
基因克隆中,通过选择性地使用限制性内切酶来切割DNA,将目标基因从其它无关基因中分离出来,实现基因的纯化与提取。
3. DNA连接DNA连接是将经过切割的DNA分子重新连接起来的过程。
连接后的DNA可以通过转化等方法引导其进入植物细胞,实现外源基因的导入。
二、基因工程技术基因工程技术是通过直接改变植物基因组中的DNA序列,对植物基因进行修改和调控的技术。
它在改良植物性状、提高植物品质等方面具有广泛应用价值。
1. 基因转化基因转化是指将外源基因导入植物细胞并使其稳定表达的过程。
通过选择合适的基因载体和转化方法,将目标基因导入植物细胞的染色体中,实现基因的稳定遗传。
2. 基因编辑基因编辑是指直接对植物基因组中特定基因进行修改和编辑的技术。
通过CRISPR/Cas9等工具,可以对植物基因组中的目标位点进行特定的编辑,实现基因的精确调控。
3. 基因沉默基因沉默是通过RNA干扰等方法,对特定基因的转录或翻译进行抑制的过程。
通过基因沉默技术,可以实现对植物性状的精确调控,提高植物产量和抗病能力等。
三、植物生物技术的应用前景基因克隆和基因工程技术在植物生物技术中的应用前景巨大。
研究植物基因功能的策略和方法研究植物基因功能主要有两种策略:正向遗传学(forward genetics)和反向遗传学(reverse genetics)策略。
正向遗传学即通过生物个体或细胞基因组的自发突变或人工诱变,寻找相关表型或性状改变,然后通过图位克隆并结合一些基因差异表达筛选技术(如差减杂交、差异显示PCR、差异显示分析等)从这些特定性状变化的个体或细胞中找到对应的突变基因,并揭示其功能,例如遗传病基因的克隆。
反向遗传学的原理正好相反,人们首先是改变某个特定的基因或蛋白质,然后再去寻找与之有关的表型变化,例如基因剔除技术或转基因研究。
简单地说,正向遗传学是从表型变化研究基因变化,而反向遗传学则是从基因变化研究表型变化。
研究植物体内基因功能的方法主要有以下几种:(1)基因功能丧失或减少,即筛选目的基因功能部分丧失或全部丧失的突变体,比较其与野生型的表型差异来确定该基因功能;(2)基因功能增加或获得,即筛选目的基因高水平表达的植株,比较其与相应对照植株(野生型植株,功能丧失突变体或模式植物植株)差异,观察其表型性状变化来鉴定基因功能;(3)基因异位表达(Ectopic expression),通过定向调控靶基因的时空表达模式来研究基因功能;(4)微阵列(Microarray)是一种在全基因组水平对基因表达进行高通量检测的技术;(5)酵母双杂交技术(Yeast two-hybrid system)用于分析基因产物即蛋白质之间的互作。
1 基因功能丧失或减少以前,通常通过筛选自然突变体来获得基因功能部分或全部丧失的突变体,但概率较低;现在一般通过各种人工方法来获得合适突变体。
人工产生基因功能丧失的方法有插入突变、反义抑制(antisense suppression)、共抑制(cosuppression)、双链RNA干扰(double-stranded RNA interference, dsRNAi)。
植物光合作用相关基因的克隆与表达植物光合作用是指在光的作用下,植物体内的叶绿素吸收光能,将其转化成化学能,从而产生能量和氧气的过程。
植物光合作用是生命的基础能量来源之一,也是维持生态系统平衡的重要过程。
植物光合作用的相关基因克隆和表达,是近年来植物学研究的热点之一。
这一研究方向主要集中在植物光合作用的细胞生物学、分子生物学和基因组学等方面。
细胞生物学角度,植物体内的光合细胞有两种类型:一种是负责光合作用的叶绿体细胞,另一种是负责运输产物的质体细胞。
这两种细胞在外形和功能上有所不同,其内部的基因表达和调控也存在差异。
因此,研究植物光合作用相关基因的克隆和表达,需要从细胞类型的角度进行分析。
分子生物学角度,植物光合作用相关基因的克隆和表达研究,主要探索基因的结构、功能和调控等方面。
例如,利用PCR技术和基因克隆技术,可以获得植物体内的光合作用相关基因,然后通过生物信息学工具对基因序列、编码蛋白质和表达谱进行分析。
另外,还可以应用转基因技术构建基因敲除或添加的重组植物株系,进一步揭示光合作用相关基因在植物体内的作用和机理。
基因组学角度,随着高通量测序技术的发展和基因组数据的丰富,研究人员可以在全局范围内分析植物光合作用相关基因的基因组学特征、进化关系和功能注释。
例如,通过对一些重要植物基因的全基因组序列比较,可以发现在多个物种中保守的部位和变异的部位,进而获得这些基因在植物演化中的起源和分化过程。
此外,研究人员也可以利用系统生物学的方法,将各个基因的作用和调控网络进行拼凑和模拟,从而模拟出更加细致的植物光合作用模型。
总之,植物光合作用相关基因的克隆和表达研究,对于理解植物生物学和解决环境保护和农业生产中的问题,具有重要意义。
希望未来能够有更多的研究成果和创新突破。
植物基因克隆的策略与方法基因的克隆就是利用体外重组技术,将特定的基因和其它DNA 顺序插入到载体分子中。
基因克隆的主要目标是识别、分离特异基因并获得基因的完整的全序列,确定染色体定位,阐明基因的生化功能,明确其对特定性状的遗传控制关系。
通过几十年的努力由于植物发育,生理生化,分子遗传等学科的迅速发展,使人们掌握了大量有关植物优良性状基因的生物学和遗传学知识,再运用先进的酶学和生物学技术已经克隆出了与植物抗病、抗虫、抗除草剂、抗逆,育性、高蛋白质及与植物发育有关的许多基因。
我们实验室对天麻抗真菌蛋白基因作了功能克隆的研究(舒群芳等,1995;舒群芳等,1997),为了克隆植物基因也探讨了其它克隆方法,本文论述基因克隆的策略、方法及取得的一些进展。
1 功能克隆(functionalCloning)功能克隆就是根据性状的基本生化特性这一功能信息,在鉴定和已知基因的功能后克隆(Collis,1995) 。
其具体作法是:在纯化相应的编码蛋白后构建cDNA 文库或基因组文库,DNA 文库中基因的筛选根据情况主要可用二种办法进行,(1)将纯化的蛋白质进行氨基酸测序,据此合成寡核苷酸探针从cDNA 库或基因组文库中筛选编码基因,(2) 将相应的编码蛋白制成相应抗体探针,从cDNA 入载体表达库中筛选相应克隆。
功能克隆是一种经典的基因克隆策略,很多基因的分离利用这种策略。
Hain 等从葡萄中克隆了两个编码白藜芦醇合成的二苯乙烯合成酶基因(Vst1和Vst2),葡萄中抗菌化合物白藜芦醇的存在,可以提高对灰质葡萄孢(Botrytiscinerce) 的抗性,在烟草和其它一些植物中无二苯乙烯合成酶,因此克隆该基因经过转基因后,对有些植物产生对灰质葡萄孢的抗性很有意义(Hain等,1985)。
Kondo等1989年对编码水稻巯基蛋白酶抑制剂的基因组DNA 做了克隆和序列分析(Kondo 等,1989)。
周兆斓等构建了水稻cDNA 文库,分离了编码水稻巯基蛋白酶抑制剂的cDNA( 周兆斓等,1996)。
植物蛋白酶抑制剂是一类天然的抗虫物质,它可抑制摄食害虫对蛋白质的消化,使害虫因缺乏所需氨基酸而导致非正常发育或死亡。
胡天华等人从烟草中分离出流行于我国的黄瓜花叶病毒(CucumberMosaicvirus)(CMV), 并克隆了编码该病毒外壳蛋白的cDNA 基因(胡天华等,1989)。
王春香等从感病的烟草叶片中分离纯化了马铃薯x病毒(potatovirusX,pvx),克隆了完整的马铃薯x病毒外壳蛋白基因,并将外壳蛋白基因转入马铃薯中,以期获得抗pvx 病毒的栽培种马铃薯(王春香等,1991)。
病毒外壳蛋白(Coatproteincp) 基因的成功克隆,可使转基因植物中产生病毒外壳蛋白基因介导的抗性(CoatProteinMediatedResistanceCPMR) 或病毒CP-RNA 介导的抗性。
Vankan 报道从真菌中成功的克隆出无毒基因Avr9, 可直接利用此基因介导广谱高效的基因工程植物(VanKan 等,1991) 。
我们1995 年构建了天麻cDNA 文库,制备抗体探针成功地分离了编码天麻抗真菌蛋白基因的cDNA 克隆,为抗真菌基因在农业、医药等方面的应用打下了基础(舒群芳等,1995; 舒群芳等,1997) 。
功能克隆的特点是用基因表达的产物蛋白质来克隆基因、虽然某一性状的编码基因是未知的。
如果对其生理生化及代谢途径研究的比较清楚,就可以分离和纯化控制该性状的蛋白质。
因此功能克隆的关键是分离出一个纯度很高的蛋白质。
只要有一个纯的蛋白质, 得到十分特异的探针,这一策略是行之有效的。
采用功能克隆方法虽然已经克隆了很多基因,但由于绝大多数基因的产物目前还不知道。
所以大多数基因难以用这一经典的方法来克隆。
随着分子生物学技术的发展,一条新的基因克隆策略逐渐形成,这就是定位克隆。
2 定位克隆(Positionalcloning)根据遗传连锁分析,染色体步移将基因定位到染色体的一个具体位置上后不断缩小筛选区域进而克隆该基因,研究该基因的功能或抗性的生化机制,这样一种策略叫定位克隆(Monaco,1994) 。
连锁分析即通过基因与DNA 标记之间的重组系数来估计这两者之间的距离若某种性状的基因与DNA 标记在子代不分离,即有连锁在一起的趋势。
根据这一原理可将与已知的某一DNA 标记连锁的基因在染色体上定位。
由于连锁分析需要依赖特定的基因作为连锁标记,即标记基因与待研基因之间存在连锁关系,而满足与待研基因相连锁的基因实在太少,所以连锁分析对克隆大多数基因存在着一定的困难。
RFLP的出现使多态性基因标记存在于整个基因组内,解决了连锁分析中难以克服的困难。
1980 年Wyman 等科学家首次建立了限制酶切片段长度多态性RFLP(restrictionfragmentlengthpolymorphism), 使对任何一种表型相关的基因的定位成为可能。
限制酶切片段长度多态性是用限制性内切酶切割后产生的DNA 片段长度的多态性呈孟德尔式遗传,是存在于全基因组的独特的多态标记,RFLP使基因定位变得易行(Wyman 等,1980)。
目前定位克隆一般是用RFLP等分子标记制作遗传图谱,寻找与待测基因连锁的RFLP标记,获得基因在染色体上的定位然后克隆基因。
所以RFLP和后来发展起来的RAPD技术的建立,可将待测基因相对准确地定位,利用已知的基因可分离与之连锁的未知基因。
其基本程序是构建一个基因组文库、用已知的 A 基因为探针,从基因组文库中筛选出与其有同源序列的a克隆,再用a克隆为探针从基因组文库中筛选出与 a 克隆有同源序列的 b 克隆,然后以此类推最后筛选出未知基因并把它分离出来。
目前已在番茄、烟草、大麦、水稻、大豆、玉米等植物中发现了与抗病基因紧密连锁的RFLP 标记并构建了遗传图谱(Figdore等,1988;Heun 等,1991;Smith,1991;Diers 等,1992)。
用这种方法已分别克隆到拟南芥菜、番茄、水稻等植物中的有关抗病基因(Martin 等,1993;Bent 等,1994;Mindrinos等,1994;Wenyuan 等,1995)。
Martin 等1993年最早用定位克隆技术克隆出番茄pto 基因,pto 基因负责对带有无毒基因Avrpto 的细菌, 丁香假单胞菌(pseudomonassyringaepv) 菌株的抗性,Pto 基因导入感病番茄后转基因植株增强了对病原菌的抗性(Martin 等,1993) 。
Wenyuan等1995年用这一技术克隆了水稻Xa21基因,Xa21基因对真菌Xanthomonasoryzaepvoryzae(Xoo) 具有抗性(Wenyuan 等,1995)。
3 转座子标记法(transposontagging)转座子是可从一个基因位置转移到另一位置的DNA 片段。
在转座过程中原来位置的DNA 片段(转座子)并未消失,发生转移的只是转座子的拷贝、基因发生转座可引起插入突变使插入位置的基因失活并诱导产生突变型或在插入位置上出现新的编码基因。
通过转座子上的标记基因(如抗药性等)就可检测出突变基因的位置和克隆出突变基因来。
转座子标记法是把转座子作为基因定位的标记和通过转座子在染色体上的插入和嵌合来克隆基因(Fedoroff 等,1984;Jones 等,1994) 。
利用转座子克隆植物基因的操作步骤主要应是以下几方面:(1)把已分离得到的转座子与选择标记构建成含转座子的质粒载体。
(2)把转座子导入目标植物。
(3) 利用Southern 杂交等技术检测转座子是否从载体质粒中转座到目标植物基因组中,这是转座子定位和分离目标基因所不可缺少的。
(4) 转座子插入突变的鉴定及其分离(Ellis 等,1992) 。
通常用于克隆植物基因的转座子有玉米的Ac.Mu,Smp 和Ds等。
Ac含有编码转座酶的基因,能够自主的转座,Ds不含转座酶所以不能自主的转座,但Ds-Ac 系统因Ac 为Ds 提供了转座酶就可以自主的转座了。
用转座子标记法进行植物基因的分离,首要的是把Ac 等转座子转化到要进行基因克隆的植物中,目前多数是利用土壤农杆菌介导的转化系统把转座子导入目标植物中(Keller等,1993;Bancroft等,1993) 。
目前已在玉米、烟草、番茄、亚麻等植物中克隆出抗性基因(Johal 和Briggs,1992;Whitham 等,1994;Jones等,1994;Gregory 等,1995)。
Johal和Brigge分离出抗灰色长蠕孢(Helminthosporiumcarbonum)1 号小种玉米的HMI 特异真菌抗性基因。
该基因存在于玉米的抗性品种中,能够分解长蠕孢 1 号小种产生的对玉米具特异致病性的HC毒素,该基因编码HC毒素脱毒酶可使植物具有抗病性(Johal 和Briggs,1992) 。
和转座子标记法的原理相似的还有T-DNA 标记法,两者都是由于一段基因的插入导致染色体结构发生变化产生突变体,而T-DNA 标记法产生的突变是由于T-DNA 插入导致的。
Kenneth 等利用T-DNA 插入标记培育出拟南芥矮化突变体(Kenneth 等,1989) 。
4 人工合成并克隆基因蜘蛛毒素是一种小肽,它只有37 个氨基酸,体外实验表明它能杀死多种对农作物有害的昆虫,蒋红等1995 年根据蜘蛛毒素的氨基酸序列,采用植物偏爱密码子、人工合成并克隆了此肽的基因(蒋红等,1995)。
Adang1995 年人工合成了苏云金杆菌毒蛋白(Bacillusthuringiensisinsecticidalcrystalprotein) 基因(Adang 等,1995)。
5 表型克隆(phenotypecloning)1995 年Jonsson 和Weissman 提出表型克隆概念(Jonsson 和Weissman,1995), 有些植物目前即不了解它的基因产物,也没有对它们进行基因定位,但已知植物在表型上存在差异, 利用表型差异或组织器官特异表达产生的差异来克隆植物基因就是表型克隆。
San 等用表型差异从拟南芥中克隆出赤霉素合成酶基因(Sun 等,1992)。
表型克隆在策略上试图将表型与基因结构或基因表达的特征联系起来,从而分离特定表型相关基因,力求不必事先知道基因的生化功能或图谱定位,根据基因的表达效应就直接分离该基因(Brown,1994) 。
6 mRNA 差异显示(mRNAdifferentialdisplay)1993 年Liang 和Averboukh 等科学家提出了mRNA 差异显示(mRNADD,mRNAdifferentialdisplay) 的方案(Liang 等,1993) 。