ADx-ARMS方法检测晚期非小细胞肺癌患者胸水标本癌细胞基因突变的临床意义
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非小细胞肺癌中EGFR基因突变和扩增的检测及其临床意义张小红;王红民【摘要】目的探讨非小细胞肺癌中EGFR基因突变和扩增的检测方法及其临床意义。
方法收集200例肺癌组织,通过聚合酶链反应扩增DNA直接测序法检测肺癌DNA中EGFR基因突变和扩增,重点是检测肺癌中EGFR外显子19~21在性别不同中的突变和扩增情况以及在分化不同的癌症中的突变和扩增情况,同时分析其在临床中的意义。
结果经聚合酶链反应扩增DNA直接测序法检测发现,非小细胞肺癌中EGFR基因总的突变和扩增数为68例,突变和扩增率为34%,肺癌中EGFR外显子20无明显突变和扩增情况发生,外显子19突变和扩增情况最多有49例,占总数的72.1%,外显子21突变和扩增情况较多有19例,占总数的27.9%,其中女性肺癌患者的EGFR基因突变和扩增情况多于男性肺癌患者,同时基因突变和扩增在腺癌和腺鳞混合癌中发生情况最多,其他次之。
结论非小细胞肺癌中EGFR基因突变和扩增多发生于女性肺癌患者,其中又以外显子19和21发生较多,多发生伴有腺癌和腺鳞混合癌的情况下,同时聚合酶链反应扩增DNA直接测序法技术稳定可靠,为临床研究提供有效的依据。
【期刊名称】《中国现代药物应用》【年(卷),期】2014(000)014【总页数】2页(P43-44)【关键词】非小细胞肺癌;基因突变;基因扩增【作者】张小红;王红民【作者单位】450052 郑州大学附属郑州中心医院/郑州市中心医院呼吸内科;郑州大学第一附属医院呼吸内科/河南省高等学校临床医学重点学科开放实验室【正文语种】中文肺癌是我国发病率和死亡率增长最快、对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一[1]。
肺癌在组织学上可以分为非小细胞肺癌 (NSCLC)和小细胞肺癌 (SCLC)两大类 , 又以非小细胞肺癌占肺癌总发生率的 85%[2]。
本次研究就探讨非小细胞肺癌中EGFR基因突变和扩增的检测方法及其临床意义,将收集的 200 例组织进行检测 , 现报告如下。
胸水细胞块EGFR基因突变检测在非小细胞肺癌中的临床意义禹乐;朱启淦;杨立民;温路生;魁国菊;潘羡心;孟加榕【摘要】Objective To explore the clinical significance of EGFR mutations in positive pleural effusion cell block of non-small cell lung cancer by RT-PCR.Methods Sixty cases of biopsy tissue specimens and pleural effusion from non-small cell lung cancer patients were collected.Cell blocks of pleural effusion specimens were made.DNA was extracted to detect EGFR mutation in exon 19 (19-Del) and exon 21 (L858R) in biopsy tissue specimens and pleural effusion by RT-PCR.The mutation rate of EGFR was analyzed between pleural effusion and biopsy tissue specimens.Results The mutation rate of EGFR in pleural effusions was 35% (21/60),including 11 cases of 19-Del mutation,9 cases of L858R mutation,and 1 case of 19-Del and L858R double mutations.The mutation rate of EGFR in biopsy tissue specimens was 36.7% (22/60),including 12 cases of 19-Del mutation,9 cases of L858R mutation,and 1 case of 19-Del and L858R double mutations.The rates of EGFR mutation was not significantly different between the two types of specimens (P > 0.05).The EGFR mutation types in pleural effusion were the same as that of the tissue specimen.Conclusion Pleural effusion cell block and biopsy tissue specimen show high consistency in EGFR mutation.%目的探讨应用实时荧光定量PCR方法检测非小细胞肺癌阳性胸水细胞块EGFR突变的临床意义. 方法收集具有组织标本作为对照的非小细胞肺癌阳性胸水60例,制作细胞块,提取DNA,应用实时荧光定量PCR法同时对细胞块和组织标本的EGFR第19外显子(19-Del)和21外显子(L858R)突变进行检测,分析细胞块与组织标本的EGFR突变率的差异.结果胸水细胞块中EGFR突变率为35% (21/60),其中19-Del突变11例,L858R突变9例,19-Del和L858R双突变1例;组织标本中EGFR突变率为36.7% (22/60),其中19-Del突变12例,L858R突变9例,19-Del和L858R双突变1例.两种标本的EGFR突变率差异无统计学意义(P>0.05);胸水细胞块EGFR突变类型与其对应的组织标本相一致. 结论胸水细胞块与组织样本在EGFR基因突变上具有较高的一致性.【期刊名称】《山西医科大学学报》【年(卷),期】2017(048)005【总页数】5页(P462-466)【关键词】肺癌;胸水;细胞学;EGFR基因【作者】禹乐;朱启淦;杨立民;温路生;魁国菊;潘羡心;孟加榕【作者单位】解放军第175医院,厦门大学附属东南医院病理科,漳州363000;解放军第175医院,厦门大学附属东南医院病理科,漳州363000;解放军第175医院,厦门大学附属东南医院病理科,漳州363000;解放军第175医院,厦门大学附属东南医院病理科,漳州363000;解放军第175医院,厦门大学附属东南医院病理科,漳州363000;解放军第175医院,厦门大学附属东南医院病理科,漳州363000;解放军第175医院,厦门大学附属东南医院病理科,漳州363000【正文语种】中文【中图分类】R734.2目前,肺癌不仅在欧美等发达国家居恶性肿瘤发病率及死亡率之首[1,2],也已成为我国城市居民死亡率首位的恶性肿瘤,且有逐年上升的趋势[3]。
非小细胞肺癌中表皮生长因子受体基因突变 ADx -ARMS分析及其与临床病理特征的相关性楚慧丽;魏炎;毕经旺【期刊名称】《现代肿瘤医学》【年(卷),期】2016(0)5【摘要】目的:回顾性分析非小细胞肺癌(NSCLC)中采用 ADx -ARMS 法检测的表皮生长因子受体(EGFR)的基因突变率、突变分布特征及其与临床病理特征的相关性。
方法:收集 NSCLC 标本共139例,其中包括手术切除样本83例、穿刺活检样本27例、胸腔积液样本18例及血液样本11例。
所有样本均采用ADx -ARMS法检测 EGFR 基因酪氨酸激酶编码区第19至21号外显子的突变。
结果:在139例 NSCLC 标本中共检测出EGFR 基因突变53例,突变率为38.1%;第19至21号外显子的突变率分别为43.4%(23/53)、0(0/53)和56.6%(30/53);年龄大于等于中位年龄(60岁)与小于中位年龄的患者EGFR 基因突变率分别为35.6%(26/73)和40.9%(27/66),差异无统计学意义(P >0.05);女性患者中 EGFR 基因突变率(49.0%,25/51)高于男性患者基因突变率(31.8%,28/88,P <0.05);腺癌中的基因突变率(41.8%,46/110)显著高于鳞癌(15.0%,3/20,P <0.01),而与未能分型的患者(37.5%,3/8)差异无统计学意义(P >0.05)。
在手术切除、穿刺活检、胸腔积液以及血液样本中 EGFR 基因突变检出率分别为42.2%(35/83)、37.0%(10/27)、38.9%(7/18)和9.1%(1/11)。
结论:ADx -ARMS 法是检测 NSCLC 中 EGFR 基因突变的快速有效方法,但不能检测未知突变类型。
EGFR 基因的总突变率与年龄无显著相关性;EGFR 基因突变在女性和腺癌中多见;EGFR 基因突变检出率与样本类型密切相关,对无法取得切除样本的患者,穿刺活检及胸腔积液样本是检测 EGFR 基因突变的有效样本。
应用ARMS PCR法检测非小细胞肺癌EGFR基因突变及其临床意义周 怡,陆明洋,王 琦,郑 晓,孙 青(苏州大学附属第三医院肿瘤生物诊疗中心,江苏常州213003)DOI:10.11748/bjmy.issn.1006-1703.2020.07.017收稿日期:2019 12 24;修回日期:2020 02 14基金项目:国家自然科学基金青年基金项目(编号:81902386);常州市应用基础研究项目(编号:CJ20160021,CJ20179048);江苏省检验医学重点实验室开放基金(编号:JSKLM 2014 003)作者简介:周怡(1985—),女,硕士,主管检验师。
研究方向:肿瘤分子生物学及免疫学。
通讯作者:孙青。
Email:sunqingedu@163.com摘要:目的 探讨依据ARMS法原理,采用实时荧光定量PCR法检测非小细胞肺癌EGFR基因突变的可行性并分析检测的临床意义。
方法 收集苏州大学附属第三医院2010年9月至2011年12月确诊为NSCLC患者标本64例,DNA提取后,采用ARMS PCR法对标本进行EGFR基因突变检测并分析EGFR基因突变与患者临床病理参数的关系。
结果 本研究发现64例NSCLC患者的EGFR总突变率为23.4%,均为19号外显子缺失(19 Del)和21号外显子(L858R)突变;女性EGFR突变率高于男性,腺癌高于鳞状细胞癌。
结论 EGFR基因突变检测有助于规范表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂(EGFR TKI)在NSCLC患者中的临床应用。
关键词:表皮生长因子受体; 基因突变; 肺癌; 表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂; 探针扩增阻碍突变系统PCR法中图分类号:Q344+.12;R734.2 文献标识码:ATheDetectionofEGFRGeneMutationinNon smallCellLungCancerUsingARMS PCRandItsClinicalSignificanceZHOUYi,LUMingyang,WANGQi,ZHENGXiao,SUNQing(DepartmentofTumorBiologicalTreatment,theThirdAffiliatedHospitalofSoochowUniversity,Changzhou213003,China)Abstract:ObjectiveThisworkintendstoinvestigatethefeasibilityofreal timequantitativePCRindetectingEGFRgenemutationinnon smallcelllungcancerbasedontheprincipleofARMS.Itisalsoaimedtoanalyzetheclinicalsignificanceofthedetection.MethodsSixty fourpatientspecimenswithNSCLCwerecollectedintheThirdAffiliatedHospitalofSoochowUniversityfromSeptember,2010toDecember,2011.AfterDNAextraction,theEGFRgenemutationwasdetectedbyARMS PCR.Furthermore,therelationshipbetweenEGFRgenemutationandclinicalpathologicalfeatureswasanalyzed.ResultsItwasfoundthat64patientswithNSCLChadatotalEGFRmutationrateof23.4%,allofwhichwereexon19deletion(19 Del)andexon21(L858R)mutation.FemaleEGFRmutationratewashigherthanmale.Adenocarcinomawashigherthansquamouscellcarcinoma.ConclusionEGFRgenemutationdetectioncontributestoregulatingtheclinicalapplicationofepidermalgrowthfactorreceptortyrosinekinaseinhibitor(EGFR TKI)inpatientswithNSCLC.Keywords:EGFR; Genemutation; Lungcancer; EGFR TKI; ARMS PCR 肺癌是当今世界死亡率最高的恶性肿瘤之一,其中非小细胞肺癌(non smallcelllungcarcinoma,NSCLC)约占所有肺癌的80%~85%,多数患者在首次诊断时已是中晚期(IIIb/IV期),5年生存率不足20%[1 3]。
非小细胞肺癌患者胸水标本 EGFR基因突变检测分析摘要:目的探讨EGFR突变在NSCLC患者胸水中的检出率及突变与NSCLC患者临床病理参数的关系。
方法收集莆田学院附属医院2016年5月至2019年11月NSCLC患者送检的胸水113例,ARMS PCR检测EGFR基因状态。
结果 NSCLC胸水标本中驱动基因总突变率为58.41%,EGFR-TKI敏感突变为53.10%,其中19-Del突变率为28.32%,L858R突变率为19.47%,T790M突变率为3.54%。
结论NSCLC胸水标本的EGFR基因突变检测可以用于临床指导NSCLC的靶向治疗。
关键词:胸水;非小细胞肺癌;ARMS PCR;EGFR肺癌已经成为临床上最常见的恶性肿瘤,现居癌症死亡原因的第一位[1],其中约85%为非小细胞肺癌[2](NSCLC)。
随着分子病理诊断技术的高速发展以及非小细胞肺癌驱动基因的靶向治疗获得的明显的疗效,其驱动基因状态的检测成为了NSCLC靶向治疗的指向性指标,包括EGFR、c-MET、KRAS、BRAF基因突变、ALK和c-ROS-1融合/重排、及免疫治疗指标PD-1和PD-L1等[3],其中EGFR是NSCLC治疗的重要靶点。
部分无法获取组织标本的患者产生的恶性胸水是其驱动基因状态检测的首选目标。
1材料与方法1.1材料收集本院2016年6月至2019年11月送检的NSCLC恶性胸水113例,所有样本均制备成细胞块,HE及免疫组化染色,由莆田学院附属医院病理科副主任医师明确诊断为NSCLC。
1.2方法1.2.1细胞块的制备胸水送检后,静置30min,弃部分上清,将剩余部分摇匀,取45mL于50mL离心管中,3000r/min离心5min,弃上清,加入10%中性缓冲福尔马林45mL悬浮固定2h,3000r/min离心5min,弃上清,取出细胞团,棉纸包裹后脱水包埋制成细胞块。
1.2.2核酸提取及相关基因检测将细胞块各切取5卷5μm的石蜡卷于1.5mLEP管中,加入1mL二甲苯震荡至石蜡完全溶解,12000r/min离心2min,加入1mL无水乙醇,12000r/min离心2min,弃上清,按照石蜡组织标本DNA提取试剂盒(厦门艾德生物医药科技股份有限公司)说明书提取细胞块基因组DNA。
胸水、血液EGFR基因突变检测在非小细胞肺癌治疗中的应用价值黄健;王于理;代平;孟娟娟;李晶;马晓平;巩平【摘要】目的分析非小细胞肺癌(NSCLC)患者胸水、血液中表皮生长因子受体(EGFR)基因突变检测的临床价值.方法收集40例经组织学检测明确EGFR基因突变状态的肺癌患者胸水及血液标本和21例EGFR酪氨酸激酶抑制剂(EGFR-TKI)治疗耐药后患者的胸水和血液标本,制作胸水细胞块,常规提取各样本DNA,应用ADx-ARMS法观察EGFR基因突变情况.结果 NSCLC患者胸水中EGFR基因突变23例(57.5%),与组织中EGFR基因检测一致率为92.5%(Kappa=0.843),灵敏度为88.46%(约登指数=0.885).血液中EGFR基因突变阳性13例(32.5%),与组织中EGFR基因检测一致率为67.5%(Kappa=0.412),灵敏度为50%(约登指数=0.500).胸水与血液中EGFR基因检测阳性率比较P<0.01.EGFR-TKI治疗耐药的21例胸水标本检出14例T790M突变、突变率66.7%(14/21),血液标本检出11例T790M突变、突变率52.4% (11/21).结论对于无法获取组织活检的晚期NSCLC 患者,可用胸水、血液标本替代组织检测EGFR基因突变状态,并且胸水比血液更有优势.动态监测胸水、血液标本中EGFR基因突变状态,可指导EGFR-TKIs的临床应用.【期刊名称】《山东医药》【年(卷),期】2018(058)006【总页数】3页(P61-63)【关键词】非小细胞肺癌;表皮生长因子受体基因;基因突变;胸水;血液【作者】黄健;王于理;代平;孟娟娟;李晶;马晓平;巩平【作者单位】石河子大学医学院第一附属医院,新疆石河子832000;石河子大学医学院第一附属医院,新疆石河子832000;石河子大学医学院第一附属医院,新疆石河子832000;石河子大学医学院第一附属医院,新疆石河子832000;石河子大学医学院第一附属医院,新疆石河子832000;石河子大学医学院第一附属医院,新疆石河子832000;石河子大学医学院第一附属医院,新疆石河子832000【正文语种】中文【中图分类】R730.43非小细胞肺癌(NSCLC)占肺癌的80%~85%,是我国最常见的恶性肿瘤之一[1],发现时多数患者已是晚期,失去手术机会,且放化疗效果难尽人意。
ARMS法与测序法检测127例非小细胞肺癌组织EGFR基因突变的结果对比分析摘要】目的:本文通过两种方法,即直接测序法与扩增突变阻滞系统(ARMS)法,对表皮生长因子受体(EGFR)基因突变检测进行对比。
方法:收集2011年7月—2012年11月在第三军医大学附属大坪医院病理科通过病理标本活检确诊为非小细胞肺癌的患者127例,采用ARMS法和直接测序法检测该人群EGFR基因的突变情况。
结果:综合两种方法,最终确定有突变的患者为64例,ARMS法检出60例,敏感性为93.75%,测序法检出33例,敏感性为51.56%。
ARMS法的检测突变率为47.2%,而直接测序法检测突变率为26.0%.通过两种方法四格表的,得出两种方法的差别具有统计学意义。
结论:ARMS法的突变检出率要明显高于测序法(P<0.05),可见ARMS法是更适合临床应用的方法。
【关键词】非小细胞肺癌;表皮生长因子;基因突变;测序法;扩增突变阻滞系统【中图分类号】R730.4 【文献标识码】A 【文章编号】2095-1752(2018)18-0040-02Comparing analysis ARMS and sequencing in detecting 127 NSCLC EGFR mutation Li Hui1,Wang Qiushi2, Li Zengpeng2, Chen Weixian1(Correspondence author).1 Clinical laboratory of second hospital of Chongqing medical university, Chongqing , 400000,China;2 Department of Pathology of daping hospital, Chongqing, 400042,China【Abstract】Objective This article aims to explore the accurate ,sensitive and convenient method for clinical use in China by compairing direct sequencing and amplification refractory mutation systerm(ARMS),helping to screen out a proper trerapeutic regimen for people. Methods ARMS and Sequencing. Results Soothe two detection metheds are to some extent coincident(K=0.53,P<0.05).Integrating detection results by two metheds,there are 64 cases identified as mutated EGFR.The sensitivityof ARMS is 93.75%,whereas the sensitivity of direct sequencing is 51.56% . The mutation detection rate of ARMS is significantly higher than that of direct sequencing (47.2% vs 26.0%,P<0.05). Conclusion ARMS methed is more sensitive and higher mutantion rate.【Key words】Non-small-cell lung cancer; Epidermal growth factorreceptor;Gene mutation;Direct sequencing;Amplification refractory mutation systerm EGFR基因位于第七号染色体短臂上(7p12),长约118 kb,由28个外显子组成。
运用ARMS法检测非小细胞肺癌表皮生长因子受体基因突变钟芳芳;唐喜玉;王璟;沈丽娟;周炜根【期刊名称】《昆明医科大学学报》【年(卷),期】2015(036)009【摘要】目的探讨应用突变特异性扩增系统法(ARMS)检测非小细胞肺癌(NSCLC)表皮生长因子受体(EGFR)基因突变.方法收集20例芜湖中医院2014年1月至12月NSCLC患者肿瘤样本,采用ARMS法检测EGFR基因18、19、20、21号外显子突变情况.结果在20例NSCLC患者中,18例ARMS法检测成功;ARMS法检测本群患者EGFR突变率为44.4%(8/18).在所有突变类型中,19外显子缺失突变3例,20外显子1例插入突变(S768I),20号外显子T790M错义突变2例,21号外显子错义突变(L858R)3例,其中1例同时出现20号外显子T790M突变及21号外显子(L858R)突变.结论ARMS法检测EGFR基因突变敏感,整个实验过程小于3h,操作简单,能够满足临床快速检测的要求,易于普及,而且ARMS可以检测到1%含量的突变DNA,敏感性高.特别是对于小标本及肿瘤组织含量少的标本有明显的优势.【总页数】4页(P24-26,35)【作者】钟芳芳;唐喜玉;王璟;沈丽娟;周炜根【作者单位】芜湖中医院病理科基因诊断实验室,安徽芜湖241000;芜湖中医院脾胃内科,安徽芜湖241000;芜湖中医药高等专科学校,安徽芜湖241003;芜湖中医院病理科基因诊断实验室,安徽芜湖241000;芜湖中医院病理科基因诊断实验室,安徽芜湖241000【正文语种】中文【中图分类】R446.1【相关文献】1.ARMS法检测非小细胞肺癌表皮生长因子受体基因突变及临床意义 [J], 徐慧英;洪炜龙;谢双双;潘晓东;白永恒;林向阳;陈必成2.ARMS 法在检测肺癌晚期患者肿瘤组织和血浆表皮生长因子受体基因突变中的应用 [J], 徐韫健;高俊;林勇平;黄晓彬;黄养松3.直接测序法和ARMS法检测非小细胞肺癌表皮生长因子受体基因突变的比较 [J], 李辰晨;吴建中;王卓;冯继锋4.运用ARMS法检测非小细胞肺癌表皮生长因子受体基因突变 [J], 钟芳芳;唐喜玉;王璟;沈丽娟;周炜根;5.Super-ARMS法检测肺腺癌患者血浆循环肿瘤DNA表皮生长因子受体T790M 基因突变的临床研究 [J], 周傲雪;史亮;李琨;车南颖;刘喆因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。