实习九 近交系数与亲缘系数的计算汇编
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医学遗传学亲缘系数
亲缘系数又称血缘系数、亲属间遗传相关系数、亲缘相关系数,是指将群体中个体之间基因组成的相似程度用数值来表示。
具体来说,亲缘系数反映的是两个个体间的遗传相关(亲缘)程度,与近交系数不同。
近交系数$F_{\chi}$是说明$x$这个个体本身是什么程度的近交产生的,而亲缘系数则是反映两个个体间的遗传相关程度。
亲缘关系有两种,一种是直系亲属即祖先与后代的关系,另一种是旁系亲属的关系,即两个体既不是祖先又不是后代的关系,如兄弟姐妹、堂(表)亲属间的关系等。
亲缘系数在医学遗传学中具有重要的应用价值,可以用于研究亲属间的遗传关系,评估遗传风险等。
亲缘系数引言在人类社会中,亲情关系一直被认为是最为重要和深厚的一种关系。
亲缘系数是一种量化亲属之间关系的指标,通过这个指标我们可以了解亲戚之间的亲近程度。
在亲缘系数的概念中,亲缘表示某人与他人之间的血缘或结婚关系。
通过计算亲缘系数,我们可以更直观地了解亲属之间的关系。
亲缘系数的计算方法亲缘系数的计算方法主要分为两种,一种是基于血缘关系的计算,另一种是基于结婚关系的计算。
基于血缘关系的计算在血缘关系的计算中,亲缘系数一般通过遗传学的知识来计算。
例如,一对父子之间的亲缘系数为50%,一对兄弟姐妹之间的亲缘系数也为50%。
通过这种方法,可以清晰地看出亲缘关系的亲近程度。
基于结婚关系的计算在结婚关系的计算中,亲缘系数一般通过家庭成员之间的关系来计算。
例如,夫妻之间的亲缘系数为100%,兄弟的亲缘系数为0%。
通过这种方法,可以清晰地了解结婚关系对于亲缘系数的影响。
亲缘系数的影响因素亲缘系数受多种因素影响,包括遗传因素、环境因素和心理因素等。
遗传因素遗传因素是决定亲缘系数的重要因素之一。
亲缘系数的计算主要基于遗传学的知识,遗传因素决定了亲缘关系的亲近程度。
环境因素环境因素也会对亲缘系数产生影响。
例如,家庭环境、社会环境等都会影响亲缘系数的计算结果。
心理因素心理因素是人类社会中不可忽视的因素之一。
人们的情感、意愿等心理因素会对亲缘系数产生影响。
亲缘系数的意义亲缘系数的计算可以帮助我们更直观地了解亲缘关系。
通过亲缘系数的计算,我们可以更加深入地了解亲戚之间的亲近程度,有利于维系家庭关系和增进家庭成员之间的感情。
结语亲缘系数作为一种量化亲缘关系的指标,在人类社会中具有重要的意义。
通过亲缘系数的计算,我们可以更清晰地了解家庭成员之间的亲缘关系,有助于促进家庭成员之间的感情交流和增进亲情。
希望本文对您有所帮助。
•区别与联系近交系数:一个个体的两个配子同源相同(identical by descent, IBD )的概率。
亲缘系数(relationship coefficient):两个有亲缘关系的个体间的加性基因效应间的相关。
近交系数和亲缘系数的计算dsAA d s SDA A Cov r σσ),(=)(b a P =YX A n n XYF F F r +++=∑+11)1()2/1(21∑+=++)1()2/1(121A n n X F F d s sd X F F r F ++=1121DS XSD F F F r ++=112根据此公式,进行计算两个个体间的加性遗传相关(additivegenetic relationship):是指在它们的基因组中具有同源相同基因的比例,或者说从个体x 的基因组中随机抽取的一个基因在个体y 的基因组中也存在的概率。
用a XY 表示 [])()()()(21d b P c b P d a P c a P =+=+=+=YX A n n XYF F F r +++=∑+11)1()2/1(21a XY 即亲缘系数的分子DS X X X a F 21=4(1)近交系数的计算公式:F X 为个体X 的近交系数;n 1为由该个体的父亲到共同祖先A 的世代数; n 2为由其母亲到A 的世代数; F A 是共同祖先A 的近交系数;Σ则表示当个体的父亲和母亲有多个途径造成亲缘相关时, 则要对由所有途径所造成的近交求和。
∑+=++)1()2/1(121A n n X F F 通径法2014/11/21 5(2)近交系数的计算CXBADE HGI首先,找出A 、B 的共同祖先:I 、G 、E2014/11/216(2)近交系数的计算CXB ADE HGI确定共同祖先的近交系数: 显然I 、G 的近交系数为0, 而F E =0.53=0.125。
2014/11/217(2)近交系数的计算CXBADE HGI确定连接A 和B 的通径链:B←E→C→AB←E→D→A B←E←G→D→AB←E←H←I→G→D→A通径链 共同祖先的近交系数n 1+n 2+1通径链的系数 B←E→C→A 4 B←E→D→A 4 B←E←G→D→A F G =0 5 B←E←H←I→G→D→AF I =07F X = 23/1288•最后,将各通径链的系数累加即得X 的近交系数。
亲缘系数与近交系数的区别与联系人类在生物进化的过程中,一直在追求种群的改良和进化,研究如何来提高物种的适应性和有效改良种群的进化稳定性,可以避免突变引起的种群适应性不足产生的相关风险。
因此,种群遗传学就研究与考察种群遗传变异,以及相关性质的研究成为重要的内容。
亲缘系数和近交系数是种群遗传学中最常用的两个指标,两者的区别和联系也是研究的重要内容。
亲缘系数是指两个个体之间的关系,也就是它们之间有共同的原始基因,以及由共同的基因导出的各种表现形式的关系。
而亲缘系数的数值表示的是,两个个体共有的有效基因的比例,0表示没有共有的有效基因,而1表示两个个体完全一样,属于同一个个体。
例如,父母和子女之间的亲缘系数约为0.5,亲兄弟姐妹之间的亲缘系数一般约为0.25。
近交系数指的是两个个体之间有共同的基因,但是较低的多态性程度,也就是说,它们的遗传池可能有共同的基因,但是没有像亲缘系数那样有多样性,抑或者种群有强迫等其他因素,会导致种群基因池出现偏差或者多态性更低等现象,这时候就会导致近交系数出现偏高的现象,通常近交系数大于0.4就已经足以认为存在近交现象,种群中如果存在这种现象,会出现健康状况降低,生物多样性消失等现象。
亲缘系数和近交系数的主要区别在于,亲缘系数反映的是两个个体之间的完整关系,着重于反映亲密程度;而近交系数反映的是两个个体之间共有的基因,但是没有多样性,抑或者有其他强迫等现象,导致其偏高的现象。
另外,亲缘系数和近交系数也有联系,亲缘系数大的两个个体之间有可能存在近交现象,但是亲缘系数越低的两个个体之间近交的可能性就越小。
另外,虽然有可能会存在亲缘系数较低的两个个体之间会发生近交,但是这种近交的机会也会越来越小。
综上所述,亲缘系数和近交系数之间有着千丝万缕的联系,它们都反映着种群中遗传多样性和新基因的更新水平,当种群中多态性减少,或者存在其他强迫等因素时,会使得近交现象发生,影响种群的多样性和适应性,反之,当种群中亲缘系数越高,近交可能性就越小,这时候,种群的适应性和多样性会更好。