质粒DNA的提取与PCR
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一、大肠杆菌质粒DNA的提取质粒DNA的提取是从事基因工程工作中的一项基本实验技术,但提取方法有很多种,以下介绍一种最常用的方法:碱裂解法:此方法适用于小量质粒DNA的提取,提取的质粒DNA可直接用于酶切、PCR扩增、银染序列分析。
方法如下:1、接1%含质粒的大肠杆菌细胞于2ml LB培养基。
2、37℃振荡培养过夜。
3、取1.5ml菌体于Ep管,以4000rpm离心3min,弃上清液。
4、加0.lml溶液I(1%葡萄糖,50mM/L EDTA pH8.0,25mM/L Tris-HCl pH8.0)充分混合。
5、加入0.2ml溶液II(0.2 mM/L NaOH,1%SDS),轻轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。
6、加入0.15m1预冷溶液III(5 mol/L KAc,pH4.8),轻轻翻转混匀,置于冰浴5 min 。
7、以10,000rpm离心20min,取上清液于另一新Ep管8、加入等体积的异戊醇,混匀后于?0℃静置10min。
9、再以10,000rpm离心20min,弃上清。
10、用70%乙醇0.5ml洗涤一次,抽干所有液体。
11、待沉淀干燥后,溶于0.05mlTE缓冲液中煮沸法1、将1.5ml培养液倒入eppendorf管中,4℃下12000g离心30秒。
2、弃上清,将管倒置于卫生纸上几分钟,使液体流尽。
3、将菌体沉淀悬浮于120ml STET溶液中, 涡旋混匀。
4、加入10ml新配制的溶菌酶溶液(10mg/ml), 涡旋振荡3秒钟。
5、将eppendorf管放入沸水浴中,50秒后立即取出。
6、用微量离心机4℃下12000g离心10分钟。
7、用无菌牙签从eppendorf管中去除细菌碎片。
8、取20ml进行电泳检查。
[注意] 1. 对大肠杆菌可从固体培养基上挑取单个菌落直接进行煮沸法提取质粒DNA。
2. 煮沸法中添加溶菌酶有一定限度,浓度高时,细菌裂解效果反而不好。
有时不同溶菌酶也能溶菌。
质粒DNA的提取1. 引言质粒DNA提取是在分子生物学研究中常用的实验操作之一。
质粒是一类圆环状的DNA分子,存在于原核生物中。
质粒DNA提取的目的是为了获取纯度高的DNA样品,以便进行后续的实验操作,如聚合酶链式反应(PCR)、限制性酶切、测序等。
2. 实验材料在进行质粒DNA提取实验前,需要准备以下实验材料:•细菌培养液:含有所需质粒的培养液。
•碱裂解液:用于裂解细胞并释放质粒DNA的实验液。
•高盐含量的溶液:用于提取DNA。
•蛋白酶K:用于消化蛋白质。
•硅胶粉末:用于吸附DNA。
•乙醇:用于沉淀DNA。
•TE缓冲液:用于溶解和储存提取的质粒DNA。
3. 实验步骤3.1 细菌培养与收获首先,需进行细菌培养和收获,以获取含有所需质粒的培养液。
培养液中的细菌应为含有目标质粒的菌株,如大肠杆菌。
3.2 细胞破碎与质粒DNA释放将收获的细菌培养液进行离心,去除培养液并沉淀细胞。
然后将细胞重悬于碱裂解液中,用震荡器在适当的温度和时间条件下裂解细胞,释放质粒DNA。
3.3 蛋白质消化为了去除细胞中的蛋白质,加入适量的蛋白酶K,进行蛋白消化。
消化的时间和温度应根据实验要求进行调整。
蛋白消化完成后,通过离心将蛋白质沉淀分离。
3.4 DNA提取将消化液中的DNA溶液转移到其它离心管中,并加入高盐含量的溶液。
通过离心将DNA与其他杂质分离。
此步骤中,DNA会被溶液中的硅胶粉末吸附,以去除杂质。
3.5 DNA沉淀将去除杂质的DNA溶液转移到新的离心管中,加入冰冷的乙醇。
通过离心,将沉淀的DNA分离出来。
注意,在沉淀过程中,应避免DNA的过度离心,以免损坏DNA分子。
3.6 DNA溶解和储存将DNA沉淀后,溶解在适量的TE缓冲液中。
TE缓冲液具有适当的pH值和离子浓度,能够稳定DNA分子,并提供良好的保存条件。
4. 实验注意事项在质粒DNA提取实验中,需要注意以下几点:•操作过程应严格遵守无菌操作,避免外源性DNA的污染。
实验一、质粒DNA的提取及检测【实验目的】1、掌握碱裂解法提取质粒的原理和步骤2、掌握琼脂糖凝胶电泳检测DNA的方法和技术3、学会PCR操作的基本技术第一部分质粒DNA的提取一、实验原理:碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们。
在pH值介于~这个狭窄的范围内,线性的DNA双螺旋结构解开而被变性,尽管在这样的条件下,共价闭环质粒DNA的氢键会被断裂,但两条互补链彼此相互盘绕,仍会紧密地结合在一起。
当加入的乙酸钾高盐缓冲液恢复pH至中性时,共价闭合环状的质粒DNA的两条互补链仍保持在一起,因此复性迅速而准确,而线性的染色体DNA的两条互补链彼此已完全分开,复性就不会那么迅速而准确,它们缠绕形成网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。
二、仪器与试剂1、仪器恒温摇床、台式离心机2、试剂溶液I、溶液Ⅱ、溶液Ⅲ、无水乙醇、TE缓冲液、胰RNA酶、酚、氯仿三、实验步骤1、将2mL含相应抗生素(Amp:50μg/mL)的LB液体培养基加入到试管中,接入含pUC19质粒的大肠杆菌,37℃振荡培养过夜。
2、取培养物倒入微量离心管中,4000r/min离心2min。
3、吸去培养液,使细胞沉淀尽可能干燥。
4、将细菌沉淀悬浮于100μL溶液I中,充分混匀,室温放置10 min。
5、加200μL溶液Ⅱ(新鲜配制),盖紧管皿,混匀内容物,将离心管放冰上5min。
6、加入150μL溶液Ⅲ(冰上预冷),盖紧管口,颠倒数次使混匀。
冰上放置15min。
7、12000r/min,离心15min,将上清转至另一离心管中。
8、向上清中加入等体积酚:氯仿(1:1)(去蛋白),反复混匀,12000r/min,离心5min,将上清转移到另一离心管中。
9、向上清加入2倍体积无水乙醇,混匀后,室温放置5~10min。
12000r/min,离心5min。