鸡IL-15基因的克隆及序列分析

鸡传染性贫血病毒广西株全基因组的克隆与序列分析

邓显文;谢芝勋;谢丽基;刘加波;谢志勤;庞耀珊

【摘 要】为了解鸡传染性贫血病毒(CIAV)广西分离株全基因变异情况,设计3对特异性引物,对CIAV广西分离株(GXC060821)的全基因进行PCR扩增、克隆和序列分析.结果显示,广西分离株的全基因为2 292个核苷酸,含有3个互相重叠的开放阅读框(ORF).序列分析表明,本CIAV分离株与国内外其他31个CIAV毒株比较核苷酸的同源性在96.1%～98.5%之间,推导氨基酸的同源性在89.8%～94.2%之间.全基因系统发育进化树分析显示,广西分离株和中国的TJBD40株、LF4株都处于一个分支,它们的亲缘关系较近,而与美国的98D06073分离株及中国的HA4分离株的亲缘关系较远.

【期刊名称】《动物医学进展》

【年(卷),期】2011(032)004

【总页数】4页(P19-22)

【关键词】鸡传染性贫血病毒;全基因组;克隆;序列分析

【作 者】邓显文;谢芝勋;谢丽基;刘加波;谢志勤;庞耀珊

【作者单位】广西兽医研究所,广西南宁530001;广西兽医研究所,广西南宁530001;广西兽医研究所,广西南宁530001;广西兽医研究所,广西南宁530001;广西兽医研究所,广西南宁530001;广西兽医研究所,广西南宁530001

【正文语种】中 文

【中图分类】S852.659.2;S858.31

鸡传染性贫血(Chicken infectious anemia,CIA)是由鸡传染性贫血病毒(CIAV)引起的,可引起3周龄以内的鸡严重贫血、出血,骨髓和淋巴器官严重萎缩[1]。随着鸡年龄增长对CIAV的抵抗力增强,成年鸡感染后不出现任何临床症状,但种鸡可将CIAV垂直传播给其子代,引起子代发生传染性贫血;临床上CIAV感染鸡群常伴发或继发其他疾病,甚至引起疫苗免疫失败等。近几年的流行病学调查表明,CAIV在我国鸡群中的感染非常普遍,感染率高达40%～96%[2-3],导致了巨大经济损失。

巴什拜羊ISG15基因的克隆与序列分析

崔茹鹏;沈文;鲁海富;孙延鸣

【摘 要】本研究旨在了解新疆巴氏拜羊类泛素蛋白ISG15基因的序列特征.采集巴什拜羊外周血液,从中分离得到淋巴细胞并提取RNA,设计特异性引物进行RT-PCR,克隆出巴什拜羊ISG15基因序列,回收PCR产物与pMD18-T载体连接后转化DH5α,检测阳性克隆、测序并进行序列分析.结果表明,克隆的巴什拜羊ISG 15基因编码区全长为522 bp,编码172个氨基酸.BLAST结果表明,巴什拜羊ISG15基因与绵羊、山羊、小尾寒羊、水牛、牛和野猪的ISG15基因序列同源性分别为99％、98％、95％、94％、94％和82％.构建基因进化树分析结果显示,巴什拜羊与绵羊先聚为一类,再与小尾寒羊聚为一类,然后和牛聚为一类.该聚类结果与生物学上的分类一致.%In order to study the molecular construction of the ISG15

gene from Xijiang Bashibai sheep, RNA was extracted from the lymphocyte,

which was isolated from the peripheral blood of the Bashibai sheep. The

specific primer designed was amplified by the RT-PCR method. Then

cloned the gene order of Bashibai sheep, PCR products that were

reclaimed were cloned into pMD18-T vector, and then transformed into

DH5α, detected masculine clone, proceeded sequence analysis. The

６　中国兽医杂志２００７年（第４３卷）第６期　Ｃｈｉｎｅｓｅ　Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　Ｖｅｔｅｒｉｎａｒｙ　Ｍｅｄｉｃｉｎｅ　

鸡病毒性关节炎病毒Ｂ一９８株Ｓ　１基因的　

克隆与序列分析　

张晓凤　，常继涛　，关平原　，李海念　，鸟日罕　，马立峰　，菊　花　

（１．内蒙古农业大学动物科学与医学学院，内蒙古呼和浩特０１００１８；　２．内蒙古动物疫病预防与控制中心，内蒙古呼和浩特０１００１０）　

摘要：本试验对鸡病毒性关节炎病毒（ＡＶＡＶ）包头地区分离株（Ｂ一９８株）进行总ＲＮＡ的提取。参考ＧｅｎＢａｎｋ中ＡＲＶ—　ｓ１１３３株ｓ１基因组序列设计两对引物，应用ＲＴ—ＰＣＲ技术特异性地扩增病毒的ｓ１基因的ｅＤＮＡ片段，将ｓ１基因ｅＤＮＡ克隆到　ｐＧＥＭ—ＴＥａｓｙ载体后进行测序。ＡＲＶ　ｓ１基因包含３个开放阅读框（０ＲＦ１，ＯＲＦ２和ＯＲＦ３），分别编码Ｐ１０、Ｐ１７和ＳｉｇｍａＣ蛋　白。应用计算机软件把所测得的序列与参考毒株ＡＲＶ一１７６，ＡＲＶ一１３８，ＡＲＶ—ｓｌ１３３，Ｍｕｓｃｏｖｙ　ｄｕｃｋ　ｒｅｏｖｉｒｕｓ　ｓｔｒａｉｎ　ＹＪＬ　（ＭＤＲＶ—ＹＪＬ）的ｓ１基因３个阅读框的核苷酸序列进行比较分析。结果表明：ＡＶＡＶ　Ｂ一９８株与ＡＲＶ一１７６株Ｐ１０、Ｐ１７和ＳｉｇｍａＣ　蛋白的核苷酸序列的同源性最高，与ＡＲＶ—ｓｌ１３３株、ＭＤＲＶ—ＹＪＬ株的同源性次之，与ＡＲＶ一１３８株的同源性最低。　关键词：鸡病毒性关节炎病毒；ｓ１基因；克隆；序列分析　

中图分类号：Ｑ７８　文献标识码：Ａ　文章编号：０５２９—６００５（２００７）０６—０００６—０２　

Ｃｌｏｎｉｎｇ　ａｎｄ　ｓｅｑｕｅｎｃｅ　ａｎａｌｙｓｉｓ　ｏｆ　ｔｈｅ　Ｓｌ　ｇｅｎｅ　ｏｆ　ａｖｉａｎ　ｖｉｒａｌ　

ａｒｔｈｒｉｔｉｓ　ｖｉｒｕｓ　Ｂ一９８（ＡＶＡＶ　Ｂ一９８）　

ＺＨＡＮＧ　Ｘｉａｏ—ｆｅｎｇ　，ＣＨＡＮＧ　ｊｉ—ｔａｏ　，ＧＵＡＮ　Ｐｉｎｇ～ｙｕａｎ　，ＬＩ　Ｈａｉ—ｎｉａｎ　，　

青岛农业大学学报（自然科学版）２７（４）：２６３～２６８，２０１０　Ｊｏｕｒｎａｌ　ｏｆ　Ｑｉｎｇｄａｏ　Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ【『ｎ　ｔ　ｅｒｓｉｔｙ（Ｎａｔｕｒａｌ　Ｓｃｉｅｎｃｅ）　

文章编号：１６７４—１４８Ｘ（２０１０）０４—０２６３—０６　

小鼠ＩＳＧ１　５基因５　调控区序列的克隆及序列分析　

滕美丽　，柳　林　，孙晓凤　，潘庆杰　

（１．青岛农业大学动物科技学院，山东青岛２６６１０９；２．烟台动物疾病预防与控制中心）　

摘要：采用ＬＡ—ＰＣＲ技术扩增小鼠ＩＳＧ１５基因１１９４ｂｐ的５　调控区序列，构建了重组克隆载体ｐＥＧＦＰ—Ｎ１一　ＩＳＧ１５，对阳性克隆进行了ＰＣＲ扩增、限制性酶切鉴定、ＤＮＡ测序及生物信息学分析。结果表明：试验成功构建了　包含小鼠ＩＳＧ１５基因５　调控区的重组质粒；经同源性比对发现ＩＳＧ１５基因５　调控区在不同物种中同源性不高，在转　

录起始位点近端的启动子区域中小鼠与人、牛、乌鳢的同源性分别为４１．３６％，３７．８９％，３８．７１％；经过预测该调控　区富含ＧＡＳ、ＧＲ、ＳＰ１、ＮＦ一１、ＣＢＦ—Ｂ等转录因子结合位点，有五处Ｅｎｈａｎｃｅｒ区、一处ＩＳＲＥ元件以及一处保守的　ＮＦ一－ｃＢ结合位点。本研究为进一步确定小鼠ＩＳＧＩ５基因核心启动子区域及该基因的表达调控奠定了理论基础。　

关键词：ＩＳＧ１５基　５　；调控　；序列分析　中图分类号：ｓ８１４．８　文献标识码：Ａ　ＤＯＩ：１０．３９６９／Ｊ．ＩＳＳＮ．１６７４—１４８Ｘ．２０１０．０４．００２　

Ｃｌｏｎｉｎｇ　ａｎｄ　Ａｎａｌｙｓｉｓ　ｏｆ　５　Ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ　Ｓｅｑｕｅｎｃｅ　ｏｆ　ＩＳＧ　１　５　Ｇｅｎｅ　ｆｒｏｍ　Ｍｏｕｓｅ　

ＴＥＮＧ　Ｍｅｉ—ｌｉ　，ＬＩＵ　Ｌｉｎ　，ＳＵＮ　Ｘｉａｏ—ｆｅｎｇ　，ＰＡＮ　Ｑｉｎｇ－ｊｉｅ　

（Ｃｏｌｌｅｇｅ　ｏｆ　Ａｎｉｍａｌ　Ｓｃｉｅｎｃｅ　ａｎｄ　Ｉ　ｈｎｏｌ０ｇｙ，ＱＡＵ，Ｑ　ｇｄａｏ　２６６１０９，Ｃｈｉｎａ；Ｙａｎｔａｉ　Ａｎｉｍａｌ　Ｄｉｓｅａｓｅ　Ｐｒｅｖｅｎｔｉｏｎ　ａｎｄ　Ｃｏｎｔｒｏｌ　Ｃｅｎｔｅｒ）　Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｔｏ　ｃｌｏｎｅ　ｔｈｅ　ｐｒｏｍｏｔｅｒ　ｒｅｇｉｏｎ　ｏｆ　ＩＳＧ１５　ｏｆ　ｍｏｕｓｅ，５　ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ　ｓｅｑｕｅｎｃｅ　ｏｆ　１　１９４ｂｐ　ｐｒｏｍｏｔｅｒ　ｒｅｇｉｏｎ　ｗａｓ