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浙江大学药学院硕士学位论文连翘有效成分的提取分离和肠道菌群代谢研究姓名董珂申请学位级别硕士专业药剂指导教师梁文权李士敏20080501浙江大学以同等学力申请硕士学位论文连翘有效成分的提取分离和肠道菌群代谢研究浙江大学药学院药剂学姓名董珂导师梁文权教授李士敏副教授摘要连翘为木犀科连翘属植物连翘的干燥果实分为青翘和老翘。
连翘具有抗菌抗病毒、解热镇吐、降压利尿、抗肝损伤、抗内毒素等作用。
常用连翘治疗风热感冒、痈肿疮毒、淋巴结结核、尿路感染等症为我国临床常用传统中药之一具有较高的药用价值。
连翘主要含有萜类、苯乙醇及其苷类、木脂素类、黄酮类和一些醇、酯、醚、醛、酮等类化合物其中连翘苷、连翘脂素、齐墩果酸、芦丁、连翘酯苷是其作用的主要有效成分。
本论文研究了连翘有效成分的提取分离肠菌代谢作用。
具体工作主要有以下几个方面利用大孔树脂和制备型高效液相色谱对连翘进行了提取分离从中得到个化合物通过理化常数测定波谱数据分析及化学方法等鉴定了个化合物的结构分别是连翘酯苷芦丁。
结果表明使用大孔树脂富集有效成分的同时可除去大量杂质为进一步操作提供方便。
制各型高效液相色谱不仅能够得到高纯度的化合物单体而且破坏少操作方便便于收集。
观察和比较大鼠、家兔肠道菌群对连翘苷和芦丁单体的代谢作用。
采用大鼠、家兔的新鲜粪便℃厌氧培养用—方法对代谢成分进行分离定量分析。
结果家兔肠道菌群对连翘苷和芦丁的代谢较快而大鼠肠道茵群对连翘苷和芦丁的代谢过程相比较慢。
在离体条件下连翘苷和芦丁可以被大鼠、家兔的肠道菌群代谢但不同种属动物之间存在差异。
浙江大学以同等学力申请硕士学位论文观察和比较大鼠、家兔肠道菌群对双黄连口服液中连翘苷和芦丁的代谢作用。
采用大鼠、家兔的新鲜粪便。
厌氧培养用—方法对代谢成分进行分离定量分析。
结果家兔肠道菌群对连翘苷和芦丁的代谢较快而大鼠肠道菌群对连翘苷和芦丁的代谢过程相比较慢。
在离体条件下双黄连口服液中连翘苷和芦丁可以被大鼠、家兔的肠道菌群代谢但不同种属动物之间存在差异。
中医药与肠道微生物群的相互作用及其作用机制研究概览：肠道微生物群是指存在于人体肠道中的各种微生物的综合体，包括细菌、真菌、病毒等。
肠道微生物群与人体健康密切相关，它们在人体中发挥着重要的调节作用。
而中医药作为中国传统的医学体系，具有千年的历史和丰富的临床经验，其药物与肠道微生物群之间的相互作用引起了广泛的研究兴趣。
本文将详细讨论中医药与肠道微生物群的相互作用及其作用机制。
一、肠道微生物群与中医药的相互作用肠道微生物群与中医药之间的相互作用是指中医药对肠道微生物群的调节作用以及肠道微生物群对中医药的代谢和药效的影响。
1.1中医药对肠道微生物群的调节作用中医药作为天然药物，通过纠正人体协调失衡，调整人体机能，从而调节肠道微生物群的结构和功能。
中医药的常用调节方法包括利湿降火、活血化瘀、理气和胃等，这些方法可以调整肠道微生物群的菌群结构，增加有益菌数量，减少致病菌数量，促进肠道菌群的平衡。
1.2肠道微生物群对中医药的代谢和药效的影响肠道微生物群对中医药的代谢和药效具有重要作用。
一方面，肠道微生物通过代谢中医药中的活性成分，可以改变其构象和性能，影响药物的吸收和转化，从而调节其药效。
另一方面，肠道微生物产生的代谢产物，如短链脂肪酸、胆汁酸、多酚等，可以增强药物的生物利用度和药效，加强中医药的疗效。
二、中医药与肠道微生物群相互作用的作用机制2.1肠道菌群结构的调节中医药可以通过调整肠道微生物群的菌群结构来发挥调节作用。
中医药中的一些药物成分可以抑制一些致病菌的生长，同时增加有益菌的数量。
另外，中药中的一些组分可以抑制肠道菌群的菌群失衡，维持菌群的平衡。
2.2代谢产物的产生肠道微生物对于中药中的活性成分具有代谢作用，产生多种代谢产物。
这些代谢产物可以改变中药的构象和性质，从而影响药物的吸收和转化。
同时，代谢产物还可以增强中药的生物利用度和药效。
2.3免疫调节肠道微生物群与免疫系统之间存在着紧密的相互作用。
中医药可以通过调节肠道微生物群，增强免疫系统的功能，提高机体的抵抗力。
中药药效物质的生物转化与代谢研究随着人们对中药疗效的认识日益深入，对中药中药效物质的生物转化与代谢研究也逐渐受到重视。
中药药效物质的生物转化与代谢研究涉及到化学、药理学、生物学等多个学科，对于揭示中药疗效机制、优化药物治疗效果具有重要意义。
本文将介绍中药药效物质的生物转化与代谢研究的背景、研究方法以及研究进展。
一、中药药效物质的生物转化中药药效物质的生物转化是指在生物体内，中药化学成分通过代谢作用，转变为其他物质以发挥药效。
中药药效物质的生物转化不仅涉及到化合物的分解、合成、氧化还原等一系列反应，还涉及到药物在体内的吸收、分布、代谢、排泄等过程。
研究中药药效物质的生物转化有助于理解中药的药理学作用机制，为中药的临床应用提供理论依据。
二、中药药效物质的代谢途径中药药效物质的代谢途径主要有两种，即化学转化和生物转化。
化学转化是指药物在生物体内经过化学反应转化为其他物质。
生物转化是指药物在生物体内被酶系统代谢成更容易排泄的代谢产物。
其中，生物转化是中药药效物质代谢的主要途径，也是产生药效的重要手段。
三、中药药效物质的代谢酶及其研究方法中药药效物质的代谢酶是指参与药物代谢的酶类。
药物代谢酶的研究对于理解中药的药效及其生物转化过程至关重要。
目前，常用的研究方法主要有以下几种：1. 酶学方法：通过酶的分离纯化、酶动力学测定等方法，研究药效物质代谢酶的特性。
2. 酶基因研究：通过克隆、表达和研究药效物质代谢酶基因，揭示药效物质代谢酶的结构与功能。
3. 组织/细胞切片法：通过使用正常或转基因动物的组织、细胞切片进行代谢酶研究，可以模拟生物体内的代谢过程。
四、中药药效物质的生物转化与代谢研究进展近年来，随着研究手段的不断更新和发展，中药药效物质的生物转化与代谢研究取得了一系列重要进展。
具体包括以下几个方面：1. 代谢途径解析：通过体外和体内实验，研究中药药效物质的代谢途径，为合理应用中药提供理论依据。
2. 代谢酶研究：对中药药效物质代谢酶的研究进行深入，鉴定代谢酶的种类、功能及其在中药代谢中的作用。
中药对肠道菌群调节作用的实验研究摘要：肠道菌群在维持人体健康和代谢平衡方面起着重要作用。
近年来，中草药作为一种潜在的调节肠道菌群平衡的方法受到了广泛关注。
本文通过综合分析近年来的实验研究，就中药对肠道菌群的调节作用进行了探讨。
研究发现，许多中药能够显著影响肠道菌群的组成、丰度和功能，从而对人体健康产生积极的影响。
然而，现有研究中存在的一些局限性和不足也需要引起重视。
未来的研究还需要进一步验证和探索中药对肠道菌群调节作用的机制，并结合临床实践，从而为中药的应用提供更加可靠的理论依据。
关键词：中药，肠道菌群，调节作用，实验研究引言:肠道菌群是一种由不同种类的细菌、真菌和古菌组成的微生物群落，在人体内起着重要的代谢和免疫调节功能。
它与多种疾病的发生和发展有着密切的关联，如肠道炎症疾病、代谢性疾病和肠道异常菌群。
调节肠道菌群的平衡被认为是一种重要的治疗策略。
中药在中国传统医学中被广泛应用，具有调节人体内环境和维护健康的作用。
近年来，中药对肠道菌群调节的研究也越来越多，但仍存在一些争议和不确定性。
本文旨在通过对当前研究的综合分析，评估中药对肠道菌群调节作用的实验研究，并进一步讨论其潜在机制和应用前景。
1. 中药对肠道菌群组成的调节作用1.1 中药干预菌群组成的实验研究不同的中药在调节肠道菌群组成方面有不同的效果。
例如，某些中药能够显著增加有益菌群如乳酸菌和双歧杆菌的丰度，从而改善肠道菌群的平衡。
然而，有些中药可能会增加有害菌群的数量，导致不良反应的发生。
在选择中药治疗肠道菌群失调时，需要根据患者的具体情况进行个体化的治疗。
1.2 中药对菌群多样性的影响菌群多样性是衡量菌群健康和稳定的指标之一。
中药对菌群多样性的影响也是研究的重点之一。
一些实验表明，中药能够显著提高菌群的多样性指数，从而增强菌群的稳定性和功能。
然而，其他研究则显示，中药可能对菌群多样性没有显著影响。
对于不同的中药和菌群群落来说，其调节多样性的机制可能不同。
中药与肠道菌群相互作用的研究进展健康人肠内菌群的平衡是相当稳定的。
肠内菌群平衡对人的健康至关重要，菌群失调往往导致各种胃肠道等消化道疾病的发生。
肠内菌微生物种类繁多，含酶丰富，对中药成分的转化有着相当重要的作用；同时，许多中药对肠道菌群的平衡也有着重要的影响。
中药和肠道菌群的相互作用对于中药现代化研究具有重要意义。
[Abstract] The balance of intestinal flora is very stable in healthy people. It is essential to human health. The dysbacteriosis often leads to a variety of gastrointestinal tract and other gastrointestinal diseases. Intestinal tract contains a wide range of intestinal bacteria and abundant enzymes, and plays a very significant role in the transformation of Chinese medicine. Meanwhile the traditional Chinese medicine is essential to the balance of intestinal flora. The mutual interaction between traditional Chinese medicine and intestinal flora is very important for us to investigate the mutual interaction between traditional Chinese medicine and intestinal flora.[Key words] Traditional Chinese medicines; Intestinal flora; Medicine metabolism; Interaction; Dysbacteriosis人体肠道是一个庞大而富有活力的细菌菌群的栖息地，人类肠道中约有100兆个细菌，99%以上为厌氧菌，其中拟杆菌族（Bacteriodacae）、链状细菌（Cattenabacterium）、消化链球菌（Peptostreptococcus）、螺菌属（Spirillaceal）等专性厌氧菌和乳酸菌及双歧杆菌占优势[1]。
中药对肠道菌群的调节作用研究一、引言众所周知，肠道菌群在人体健康中起着重要作用。
近年来，随着人们对中药的关注和研究深入，越来越多的研究表明，中药对肠道菌群的调节具有显著的效果。
本文将就中药对肠道菌群的调节作用进行深入探讨。
二、中药对肠道菌群的影响1. 中药调节肠道菌群的机制中药对肠道菌群的调节作用主要通过以下几个方面来实现：（1）改变菌群的多样性：许多中药具有调节肠道微生物群落结构的作用，从而增加菌群的多样性，维持菌群的稳态。
（2）抗菌作用：某些中药富含抗菌活性成分，可以对肠道内的有害细菌起到杀菌作用，从而减少有害细菌对菌群的影响。
（3）营养调节：中药中的一些活性成分可以为有益菌提供合适的营养物质，帮助其生长繁殖，从而调节菌群的平衡和稳定。
（4）免疫调节：某些中药具有免疫调节功能，可增强机体的免疫力，提高抵抗力，减少炎症反应，有利于肠道菌群的调节。
2. 具体中药对肠道菌群的调节作用（1）黄连：黄连具有明显的抗菌作用，可以抑制肠道内的有害细菌的生长，减少菌群紊乱。
（2）柴胡：柴胡具有清热解毒的作用，可以调节肠道菌群的平衡，减少炎症反应。
（3）当归：当归富含多种生物活性成分，可以促进肠道菌群的生长，增加菌群的多样性。
（4）枸杞：枸杞中的多糖成分可以提高机体的免疫力，增加有益菌的数量，维持肠道菌群的稳定。
三、中药对肠道菌群调节作用的临床应用1. 中药在肠道菌群紊乱治疗中的应用由于现代生活方式的改变，肠道菌群紊乱成为一种常见的健康问题。
中药作为传统医学的重要组成部分，具有独特的优势。
许多中药被广泛应用于调节肠道菌群紊乱，取得了显著的疗效。
2. 中药促进益生菌发展的应用益生菌作为一种有益菌群，可以促进肠道菌群的平衡和稳定。
中药中的一些活性成分被发现对益生菌的生长有明显的促进作用。
因此，将中药应用于益生菌的培养和生产中，有助于提高益生菌的生长速度和产量，对益生菌的应用具有重要意义。
四、总结与展望中药对肠道菌群的调节作用已经受到研究者的广泛关注。
中草药对胃肠微生物群调节作用的研究胃肠道微生物群是在肠道内繁殖生长的大量微生物的总称，这些微生物的数量众多，种类繁多，对人体健康有着重要的作用。
中草药作为传统的中医药物，对胃肠微生物群的调节作用也引起越来越多的关注。
本文将对中草药在胃肠微生物群调节方面的研究进展进行归纳总结。
一、中草药的胃肠微生物群调节作用的研究背景近年来，由于生活方式和饮食结构的改变，胃肠疾病已成为全球社会负担的重要组成部分。
而胃肠道微生物群是体内代谢、免疫等多种生理功能的重要参与者，因此人们开始探索其与胃肠疾病之间的关系。
中草药作为利用天然植物来治疗疾病的方法，近年来被广泛研究，其中也包括其对胃肠微生物群的调节作用。
目前的研究显示，中草药的广泛应用和微生物调节作用之间有着密不可分的联系。
二、中草药在胃肠微生物群调节方面的应用1. 泽泻泽泻是中药里的常用药材，被广泛用于润肠通便、去湿利水等治疗上。
研究表明，泽泻中含有丰富的黄酮类化合物，这些物质能够有效地调节肠道菌群，促进有益菌的生长，减少有害菌的繁殖，从而起到调节胃肠微生物群的作用。
2. 黄连黄连是一种广泛使用的中药材，在临床上常用于治疗肝胆疾病、消化系统疾病等。
近年来的研究表明，黄连有着抗炎、抗氧化等生理活性，对胃肠道微生物群的调节作用也十分明显。
研究发现，黄连可以减少有害菌的数量，增加有益菌的比例，从而改善肠道微生态。
3. 枳壳枳壳是中药材的一种，主要用于平喘、止泻等症状的治疗，也被广泛应用于胃肠道疾病。
研究表明，枳壳中含有较多的黄酮类化合物和苦杏仁苷等成分，这些物质对肠道微生物菌群的结构具有较强的调节作用，可以促进肠道菌群的平衡。
4. 天然黄酮天然黄酮是一种生物活性物质，常见于大豆、黄芪、芦荟等植物中。
研究表明，天然黄酮具有多种生理活性，对肠道微生物群的调节作用也被证实。
天然黄酮可以促进有益菌的增长，减少有害菌的繁殖，从而发挥调节肠道微生态的作用。
三、中草药对胃肠微生物群调节作用的发展前景中草药对胃肠微生物群的调节作用已得到了充分的研究和肯定。
中药有效成分与肠道菌群相互作用的研究进展中药中很多有效成分必须经过肠道菌群代谢后才能被吸收而发挥药理作用，参与肠肝循环的药物经肝脏解毒后其代谢物随胆汁分泌到肠道后，再次与肠道菌群接触，也可能再次被肠。
因此，肠道菌群对中药的代谢转化具有非常重要的影响，例如增强有效成分的吸收，提高生物利用度，进而提高药效;甚至对中药有毒成分具有减毒或增毒的作用。
同时中药能够保护胃肠道黏膜屏障功能，促进益生菌的繁殖，抑制有害菌的生长，对维持肠道微生态系统平衡起着关键作用。
以下将对中药与肠道菌群的相互作用等方面进行综述。
菌群对中药活性成分代谢影响肠道细菌在生长繁殖过程中能产生多种糖苷酶、硝基还原酶偶氮还原酶以及各种碳水化合物酶等，这些酶参与中药多种成分的降解，其代谢途径主要以水解为主，氧化和还原为辅中药有效成分被肠道菌群产生的特定代谢酶代谢转化后生成新的活性代谢产物，进而对机体产生不同的生物学效应。
菌群增强中药的吸收，提高药效大黄和番泻叶中都含有蒽酮苷类化合物番泻苷，而番泻苷本身无泻下作用，口服后在小肠中几乎不被吸收，真正发挥泻下的活性成分是番泻苷元，这是由肠道内双歧杆菌分泌的葡萄糖苷酶水解生成番泻苷元后经小肠吸收才发挥泻下作用的，而且代谢产物大黄酸蒽酮的致泻作用最强[1]。
肠道菌群对番泻苷的代谢途径同样含有蒽酮骨架的葡萄糖苷化合物芦荟大黄素苷本身也没有泻下作用，研究发现人粪便中的细菌Eubacuteriuln sp，BAR可水解芦荟大黄素苷的C-C糖苷键，将其代谢为苷.元芦荟大黄酸蒽酮，后者具有显著的泻下作用[2]。
黄芩苷是黄芩的主要活性成分，大量研究证明其具有抗菌消炎抗感染等药理作用，研究发现黄芩苷经人肠道菌群代谢后产物主要为去糖基化的黄芩素和甲基化苷元木蝴蝶素A，而且黄芩素和木蝴蝶素A通过抗组胺作用改善小鼠瘙痒反应的效果强于黄芩苷。
肠道菌群对黄芩苷的代谢途径人参中的皂苷类成分是其主要的活性成分，主要有抗炎抗肿瘤降血糖及降血脂等多种药理作用研究表明人参皂苷类在体内难以吸收，在肝脏内基本不代谢，主要在肠道中降解通过离体和整体实验研究发现人参皂苷Rg1在人及大鼠的肠内细菌作用下均可被代谢，但沿不同的代谢途径进行代谢，血液中也主要以代谢物的形式存在，这可能是人参皂苷在体内发挥药效的真正生物活性成分[3]肠道菌群对人参皂苷Rg1的代谢途径菌群对中药成分的减毒或增毒作用肠道菌群除了能够生物转化中药的有效成分，将其代谢为新的生物活性代谢产物外，还能对中药有毒成分产生减毒或增毒的作用。
中药对肠道微生物群落的调节作用研究近年来，人们对肠道微生物群落的研究越发重视。
肠道微生物群落是指寄生于肠道内的各类微生物的集合体，包括细菌、真菌、病毒等。
这些微生物对人体的健康和免疫系统具有重要影响。
而中药作为传统的治疗方法之一，其对肠道微生物群落的调节作用日渐受到关注。
本文将深入探讨中药对肠道微生物群落的调节作用，并归纳总结相关研究成果。
一、中药在维持肠道微生物稳定性中的作用1.1 调节益生菌数量益生菌是指对宿主有益的微生物，如双歧杆菌和乳酸菌。
中药中的一些成分能够促进益生菌的繁殖和生长，维持肠道内益生菌的平衡。
例如，黄芩、黄连等中药成分能够增加双歧杆菌的数量，改善肠道微生物群落的稳定性。
1.2 抗菌作用中药中的一些成分具有抗菌作用，可以抑制不利菌群的生长，维护肠道微生物群落的稳定性。
例如，苦参中的某些活性成分具有抗菌活性，可以有效地抑制肠内有害细菌的生长。
二、中药对肠道疾病中微生物群落的调节作用2.1 肠炎肠炎是一种常见的肠道疾病，中药在其治疗中发挥了重要的作用。
研究发现，中药能够通过调节肠道微生物群落的平衡，减少病原菌的数量，缓解肠炎症状。
2.2 肠道感染肠道感染是由病原微生物引起的一类疾病，中药对其具有一定的预防和治疗作用。
中药中的一些成分能够抑制病原微生物的生长，同时增加有益微生物的数量，加强人体免疫力，降低感染发生的几率。
2.3 肠易激综合征肠易激综合征是一种常见的肠道功能紊乱疾病，中药在其治疗中也发挥了一定的作用。
中药通过调节肠道微生物群落，减少有害菌群的数量，改善病情。
三、中药与肠道微生物群落调节的相关研究进展3.1 益生菌与中药的联合应用近年来，益生菌与中药的联合应用在肠道微生物群落调节方面得到了广泛关注。
研究发现，益生菌与中药相互作用，能够增强中药的疗效，提高肠道微生物群落调节的效果。
3.2 中药在肠道微生物群落中的代谢调节作用中药中的一些活性成分被肠道微生物群落代谢后，形成有益代谢产物，对肠道健康具有积极影响。
通过中药成分的肠内细菌生物转化和/或代谢研究中药北京大学药学院·天然药物及仿生药物国家重点实验室杨秀伟一、肠内细菌与人和中药自古以来，中医用药的特色之一是以汤剂的形式口服用药。
实际上，这种经口服用的传统汤剂（复方）在发挥药效作用之前，除了在炮制、煎煮过程中会产生动态变化而外，进入机体后亦要发生动态变化。
这种变化的第一个过程是在消化道内被消化液和人肠内细菌生物转化和/或代谢。
前者包括胃液、十二指肠液，等等。
后者包括构成人肠内微生态环境的细菌。
现代科学研究证明人和动物的肠内菌丛99％是厌氧性细菌，亚种和血清型水平以下的细菌达 100种以上。
不同个体肠内菌丛构成不同，但总的趋势是类同的，同一个体相对稳定。
在人的胃内，链球菌和乳杆菌为优势菌群；在十二指肠，韦荣球菌、乳杆菌和链球菌为优势菌群；在回肠，韦荣球菌、乳杆菌、链球菌、双岐杆菌和消化链球菌为优势菌群；在盲肠和直肠，拟杆菌科细菌、链条杆菌、双岐杆菌和消化链球菌为优势菌群。
根据肠内细菌与宿主之间的关系，可将其分为共生性细菌和病原性细菌以及介于两者之间的细菌。
这些细菌产生各种各样的酶，可将诸如食物、食品、中药等中的化学物质转换为变异原性物质或致癌物质等，使药物失活。
同时，它们亦可使无活性型药物转换为活性型药物，即所谓“药物活化”，使有害物质无毒化。
在维持人体健康、增强机体免疫力、预防老年疾病等方面起着十分重要的作用。
已有研究证明：以干粉形式吞服的中药，这些干粉细胞在消化液和肠内菌作用下破壁后向消化道释放出内含化学物质；而以汤剂形式口服的中药，化学物质直接进入消化道。
这些化学物质包括分子态或离子态、大分子或小分子、结合型或游离型。
由于中药基源复杂→成分复杂→性质复杂→作用复杂（多系统、多途径、多成分、多靶点→整体效应）→生物效应复杂；有肠内发生的，有体液和组织中发生的；有物理性相互作用，有化学性相互作用，更有生物性相互作用，因此，以化学物质为基础、以生物效应为现象，组成了庞大而复杂的体系。
这种庞大、复杂体系的“进口”是消化道。
外来异物性化学物质在消化道内的行为包括：①以原形化合物形式吸收入血；②以消化道生物转化和/或代谢物形式吸收入血；③以原形或生物转化物和/或代谢物形式直接随粪便排出体外；④刺激消化道壁引发免疫激活产生生物效应；⑤一种外来化学物质促进另一种外来化学物质的吸收；⑥刺激肠内微生态引发生物活性物质分泌（如双岐杆菌因子）产生生物效应；⑦破坏肠内微生态平衡而促进新的平衡系统建立。
其中，肠内细菌对中药成分结构的生物转化和/或代谢在中药药效上有举足轻重的作用。
（一）、健康人肠内菌丛及其作用一个人的肠内栖息约有100兆个细菌，构成了肠内菌丛。
健康人小肠菌丛细菌数目较少，且种类单一；盲肠内的细菌数增至 1011/ ml。
健康成人粪便内的最优势细菌有拟杆菌属(Bacteroides)、真杆菌属(Eubacterium)、消化球菌科(Peptococcaceae)、梭菌属(Clostridium)和双岐杆菌属 (Bifidobacterium) 等细菌。
肠杆菌科 (Enterobacteriaceae) 和链球菌属(Strepto-ccoccus) 细菌等亦常常检出，但其菌数不超过108。
健康人肠内菌丛是相当稳定的。
内、外因，如食饵急剧变化、感染、胃功能紊乱、肠蠕动紊乱、癌、外科手术、免疫功能低下、精神应激、抗菌素的使用、老化以及温度的急剧变化等原因都影响着肠内菌丛的平衡。
但其变动是非特异的，表现为小肠内细菌，特别是肠杆菌科和链球菌属细菌显著增加；大肠内双岐杆菌属细菌虽然减少或消失，但肠杆菌科和链球菌属细菌显著增加，产气荚膜梭菌亦常常增加。
肠内细菌具有在肠内进行各种各样生物转化和/或代谢的酶，借酶的作用可产生对宿主有用或有害的物质。
细菌毒素以及细菌细胞壁成分修饰着宿主的免疫功能；某些种肠内细菌起到防御对肠管有害细菌的增殖和感染的作用。
另一方面，自发性感染的病原菌，在宿主抵抗性减弱的时候发挥病原性作用。
因此，肠内菌丛影响着宿主健康和疾病，即营养、生理机能、药效、癌症、免疫反应、抗感染性、老化等等。
所谓肠内菌丛与宿主的健康和疾病的密切相关性，亦即肠内菌丛中有益菌对于宿主的健康长寿来说是相当重要的。
换言之，肠内有害菌成为优势菌会导致肝脏和肾脏功能的紊乱、动脉硬化、高血压、癌症、老化等各种疾病。
因此，通过摄取对于肠内细菌丛平衡有益的食饵、维生素Ｃ和 E、食物纤维、发酵乳等促进有益菌的发育；或者摄取能够抑制肠内有害菌增殖的食饵等都能够达到维持宿主健康的目的。
随着基因重组技术的发展，如果能够培育出在肠内定植性和耐酸性都很强、且兼有能够将致癌物质无活性化的菌株，把其作为食饵来应用，或作为生菌剂来摄取，都能够改善肠内菌丛平衡以及肠内细菌的生物转化和/或代谢，这对于增强人体健康是十分有益的。
胃肠道（食道、胃、十二指肠、空肠、回肠、盲肠和结肠）和粪便中的细菌，随各部位结构不同，构成了不同的内生态环境，也导致了各部位的微生物种群和数量各不相同。
人消化道的细菌总数大约为1014/g，主要在结肠部分，约为1010 ～1011/g。
人胃肠道主要细菌数量及分布见表 1。
表 1 人体胃肠道主要细菌数量及分布(Log/g)菌群胃空肠回肠粪便总菌数肠杆菌肠球菌葡萄球菌乳杆菌酵母菌拟杆菌双歧杆菌梭菌优杆菌0 ～ 30 ～ 20 ～ 30 ～ 20 ～ 30 ～ 2少少少少0 ～ 50 ～ 30 ～ 40 ～ 30 ～ 40 ～ 20 ～ 20 ～ 3少少3 ～ 72 ～ 62 ～ 62 ～ 52 ～ 52 ～ 33 ～ 73 ～ 52 ～ 4少10 ～ 124 ～ 105 ～ 104 ～ 76 ～ 102 ～ 610 ～ 128 ～ 126 ～ 119 ～ 12食道由于所处位置原因——位于口腔和胃之间，导致了其上部的微生物与口腔接近，下部的与胃接近，其中的乳酸菌为过路菌。
在胃中，胃酸明显影响微生物的类型和数量，正常的胃液 pH 为 3.0（2.2～4.4），来自食物和唾液里的大部分微生物被胃液中的盐酸杀死，仅剩下大约103/ml 的细菌。
除胃酸以外，微生物还受到蠕动和抗体等影响。
在胃内容物中，可以分离到乳杆菌、链球菌、双岐杆菌、梭菌、韦荣菌、大肠杆菌、念珠菌和酵母菌等，但大多是过路菌。
乳杆菌和酵母菌数量较多，它们可能是土著菌，酵母菌在分泌区定植，乳酸菌在非分泌区定植。
一个人在餐后 1 ~ 2小时，胃内的细菌从105/克内容物降至101 ~ 103/克内容物。
一般来说，即使胃内的生理状况有微小的变化，如pH升高，都可引起细菌数量增加。
细菌数量的增加可能会导致许多外源性异物在到达小肠之前即被生物转化。
与人和家兔相比，小鼠和大鼠胃内的主要菌群包括乳酸菌、拟杆菌和双岐杆菌，此可能与不同动物种属胃内 pH 不同有很大关系。
从十二指肠开始，细菌数目逐渐增加，但绝对数量仍然较少，占优势地位的是一些口腔革兰阳性球菌，一般只作短暂的定殖。
空肠中的总菌数从102到105/克内容物，其中乳酸菌（主要是乳杆菌和肠球菌）占总菌数（最高105/克内容物）的 90%；此外还有草绿链球菌群(Viridian streptococci)。
回肠下部菌群类似于结肠，细菌数达到106 ~ 109/ 克内容物，乳酸菌通常只有 105/ 克内容物。
许多人的肠内菌丛失调与十二指肠和回肠的细菌分布变化相关。
以回盲瓣为界，以上的回肠内革兰阳性菌占优势，以下的结肠内革兰阴性厌氧杆菌占优势。
这种选择性可能反映了各部位抗细菌因素的不同；也可能随着从小肠过渡到大肠，微生物表面粘附因子与肠粘膜表面的互补作用发生了变化。
一旦穿越回盲“屏障”，盲肠和结肠中细菌数量发生了很大变化，高达1011/ 克内容物以上；种类也显著增加，超过60种。
但其中乳酸菌只有 106～ 1010/ 克内容物。
这里厌氧菌较需氧菌占优势，数量比可达 102～104/克内容物。
总之，从小肠开始细菌数逐渐增加。
小肠上部细菌数仍较少(1011～104/克内容物)，主要是乳杆菌属、链球菌属和韦荣球菌属等细菌。
在回肠下部延至大肠总细菌数增加，其菌丛主要由构成大肠菌丛的肠杆菌科、真杆菌属、拟杆菌科、消化球菌科等细菌和小肠上部的菌丛构成。
以回盲瓣为界，大肠内的菌丛发生了显著变化，细菌数急剧增加，达到1011/ 克内容物以上。
拟杆菌科、真杆菌属、消化球菌科、梭菌属和双岐杆菌属等厌氧性细菌成为最优势菌群。
肠菌科、肠球菌、乳杆菌属、韦荣球菌属和葡萄球菌属等细菌达到 105～107/克内容物，与粪便菌丛大体相同。
一般来说，粪便中的细菌量占粪便重量的1/3，每克干重含 2×1011～ 4×1011个细菌，厌氧菌和需氧菌的数量之比为 104 : 1。
在不同人群中，粪便的菌群组成因饮食等生活习惯不同而差异较大；就某一个体而言，其组成是基本固定的，即使饮食有较大改变也只有微小的变化。
粪便中分离到的乳酸菌有 104～ 109/g，其中的乳杆菌如嗜酸乳杆菌、发酵乳杆菌和唾液乳杆菌 (L. salivarius) 为常住菌，偶见的德氏乳杆菌乳酸亚种(L．delbrueckii subsp. lactis)、干酪乳杆菌 (L. casei)、植物乳杆菌 (L．plantarum)、布氏乳杆菌 (L．buchneri) 是过路菌，不能在肠内定植。
粪便中的乳酸菌是一群重要的菌群，其中的双岐杆菌属 (Bifidobacterium) 细菌也是肠道正常菌群中很重要的成员，占健康儿童和成人总菌落的 5% ～ 10%。
小肠上部几乎检测不到双岐杆菌，而在小肠下部的数量可达103～106/克内容物。
盲肠中数量较少，粪便中可达108～1012/克内容物。
在人肠道中已知的双岐杆菌主要有5种：两岐双岐杆菌 (B．bifidum)、长双岐杆菌 (B．longum)、婴儿双岐杆菌(B．infantis)、短双岐杆菌(B．breve)、青春双岐杆菌(B．adolescentis)。
此外，还有角双岐杆菌 (B．angulatum)、小链双岐杆菌 (B. catenula-tum)、假小链双岐杆菌 (B．pseudocatenulatum)、伪长双岐杆菌 (B．pseudolongum)、大双岐杆菌 (B．magnum)、高卢双岐杆菌 (B．gallicum) 等。
（二）、从幼儿到成人肠内菌丛的变化人们一直认为双岐杆菌是乳儿肠内最重要菌群。
离乳后，乳杆菌属细菌和大肠杆菌大大高于双岐杆菌。
现已明确，双岐杆菌是健康幼儿和成年人大肠内菌丛的主要菌群之一。
乳儿离乳后开始摄取食物，其肠内菌丛的革兰氏阴性杆菌优势模式与成年人的相近。
即粪便中总菌数的对数平均值为11.2/ g 内容物，双岐杆菌减少的数目大约是乳儿的1/10。
