大学生物化学课件 蛋白质的四级结构
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基础生物化学Basic Biochemistry3 蛋白质(Protein)化学3.1 氨基酸3.2 肽3.3 蛋白质的分子结构3.4 蛋白质结构与功能的关系3.5 蛋白质的重要性质、分类蛋白质的超二级结构(super-secondary structure)和结构域(Domain)☐超二级结构和结构域都是介于蛋白质构象中二级结构与三级结构之间的一个层次。
⑴超二级结构(super-secondary structure)超二级结构是多肽链内顺序上相互邻近的若干二级结构单元在空间折叠中靠近,相互作用形成规则的在空间上能辨认的结构组合体(combination)锌指(Zine finger,ZF) 亮氨酸拉链(Leucine Zipper)EF手(EF-hand)⑵结构域(domain)多肽链在超二级结构基础上进一步绕曲折叠而成的相对独立的三维实体称结构域。
小分子蛋白质的结构域和三级结构往往是同一个意思。
由4个βαβ组成的α/β桶结构域免疫球蛋白(IgG)由12个结构域组成,其中两个轻链上各有2个,两个重链上各有4个;补体结合部位与抗原结合部位处于不同的结构域。
蛋白质的三级结构蛋白质的三级结构是多肽链在各种二级结构的基础上,通过侧链基团的相互作用,借助次级键维系,进一步盘绕折叠形成具有一定规律的三维空间结构。
稳定蛋白质三级结构的主要是次级键,包括:氢键、疏水键、盐键以及范德华力等。
这些次级键可存在于一级结构序列相隔很远的氨基酸残基的R基团间,因此蛋白质的三级结构主要指氨基酸残基侧链间的结合。
氢键范德华力疏水作用盐键次级键都是非共价键,易受环境中pH、温度、离子强度等的影响,有变动的可能性。
二硫键不属于次级键,但在某些肽链中能使远隔的二个肽段联系在一起,对于蛋白质三级结构的稳定上起着重要作用。
蛋白质的三级结构是指蛋白质分子主链折叠盘曲形成构象的基础上,分子中的各个侧链所形成一定的构象。
侧链构象主要是形成结构域。
四、蛋白质四级结构1、二级结构·参与肽键的6个原子C1,C,O,N,H,C2位于同一平面。
C-N键不同于单键有40%双键性质。
(1)α-螺旋·螺旋方向为顺时针走向·每3.6个氨基酸上升一圈·维持因素为氢键·螺距为0.54nm·肽键的N-H键与第4个肽键的羰基氧形成H键与轴平行。
脯氨酸无法形成氢键而不存在于α。
(2)β-折叠·分子内相距较远的两个肽段可通过折叠形成相同或通过回折形成走向。
·肽链间肽键羰基氧和亚氨基氢形成氢键而稳固β-折叠结构。
(3)β-转角☆由4个氨基酸残基组成,1残基的C=O与4残基的N-H形成氢键。
而第二残基常为脯氨酸。
(4)无规卷曲:不是没有规则的随意变化,而是规律未确定的肽链结构。
☆模体:蛋白质分子中具有特定空间构象与特定功能的结构成分。
超二级结构:几个二级结构结合成的有规则的二级结构组合。
2、三级结构(1)整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。
(2)次级键:疏水键(主要)、离子键、氢键、范德华力。
(3)结构域:蛋白质上折叠成的多个结构较紧密且稳定的区域,并各行其功能。
(4)☆分子伴侣:辅助一级结构是合成中的蛋白质折叠为正确空间构象的蛋白。
·只有在特定条件下,一级结构决定高级结构,高级结构再决定生物学功能。
3、四级结构亚基间以非共价键相连接结合力:氢键、离子键驱动力:疏水键每个亚基均有三级结构,但无生物学功能。
·同二聚体·异二聚体五、蛋白质结构与功能1、一级结构(1)一级结构是空间构想基础,只要一级结构未破坏,就有可能恢复至原来三级结构。
(2)一级结构相似的蛋白有相似的高级功能(3)物种越相近,一级结构越相似。
(4)重要氨基酸残基缺失替代,会严重影响构想及生理功能而引起疾病。
2、特定空间结构·血红素:Fe2+含6个配位键,4个与卟啉环4个N相连,第5个:肽链中F8组氨基酸残基还与Fe2+配位结合,则血红素辅基可与蛋白质部分结合稳定。