基于线粒体COI与16S rRNA基因序列探讨贻贝属的系统发育

基于线粒体COI序列分析对紫贻贝群体遗传多样性的研究分析沈玉帮;张俊彬;冯冰冰;李家乐【期刊名称】《海洋通报》【年(卷),期】2011(030)004【摘要】本文采用线粒体COI基因序列分析对我国沿海6个紫贻贝群体124个个体的遗传多样性和群体结构进行了初步研究.在紫贻贝6个群体中共发现13个单倍型和33个核苷酸多态位点.青岛群体单倍型数目是最多的,温州群体、丹东群体和宁德群体次之.6个紫贻贝群体的基因多样性为0.569～0.821,核苷酸多样性为0.015 5～0.051 0,表现出较低的遗传多样性.紫贻贝不同群体之间的遗传分化较小,所有群体之间没有发生显著的遗传分化.分子方差分析表明,紫贻贝的变异主要存在于群体内.该研究为紫贻贝的可持续开发和资源保护提供了一定的理论依据.%Genetic biodiversity of Mytilus galloprovincialis was estimated, based on sequence analyses of the mitochondrial cytochrome oxidase I (mfDNA COI) gene, employing 124 individuals of 6 groups along the coast of eastern and southern china. 13 haplotypes and 33 variation sites were observed in the sequences of the 124 individuals. QD population had the greatest number of haplotypes, while secondary for WZ population, DD population and ND population. Among all six populations, gene diversities ranged from 0.569 to 0.821, and the nucleotide diversities from 0.0155 to 0.0510, suggesting that M. Galloprovincialis has low genetic diversity. The pairwise estimates of FST between M. Galloprovincialis populations weresmall, and no significant genetic differentiation was observed between populations. AMOVA analysis showed that a large proportion of variation was attributed within population of M. Galloprovincialis. This study provides objective data for the sustainable exploitation and fishery management of M. Galloprovincialis.【总页数】6页(P435-440)【作者】沈玉帮;张俊彬;冯冰冰;李家乐【作者单位】上海海洋大学教育部水产动物种质资源的挖掘与利用重点实验室,上海201306;上海海洋大学教育部水产动物种质资源的挖掘与利用重点实验室,上海201306;上海海洋大学教育部水产动物种质资源的挖掘与利用重点实验室,上海201306;上海海洋大学教育部水产动物种质资源的挖掘与利用重点实验室,上海201306【正文语种】中文【中图分类】S917.4【相关文献】1.紫贻贝野生群体与养殖群体线粒体COI基因的遗传比较分析 [J], 庞宇杰;李继姬;郭宝英2.基于线粒体COⅢ基因分析厚壳贻贝（Mytilus coruscus）养殖群体遗传多样性[J], 周超;郭宝英;吴常文;叶莹莹;李继姬;冯广朋3.基于线粒体D-loop区和COI基因序列研究2个禾花鲤群体和野生鲤群体的遗传多样性与系统进化关系 [J], 潘贤辉; 罗辉; 叶华; 林勇; 周康奇; 陈忠; 杜雪松; 黄姻; 覃俊奇; 文露婷; 潘志忠; 邓潜4.基于线粒体COI序列的中华绒螯蟹养殖群体与野生群体遗传多样性与遗传结构分析 [J], 轩中亚;薛竣仁;陈修报;姜涛;刘洪波;杨健5.基于线粒体COI序列的矛尾复虾虎鱼5个野生群体的遗传多样性分析 [J], 祝斐;应博凯;贾超峰;孟乾;高波;孙瑞健;宋双双;徐大凤;卢瑶瑶;张志伟;陈淑吟;张志勇;陈心因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

基于16S rRNA部分序列探讨部分鳚亚目鱼类的分子系统进化关系张源真;王伟;姜志强;张钊【期刊名称】《海洋科学》【年(卷),期】2012(000)009【摘要】通过PCR扩增获得了3科5属6种中国黄渤海海域的鳚亚目(Blennioidei)鱼类的线粒体16S rRNA基因序列片段约669bp碱基,结合来自GenBank的5种鳚亚目其他科鱼类的相应基因片段,并以眼斑雪冰鱼(Chionodraco rastrospinosus)为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA 4.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比、转换/颠换值等,应用最大简约法(MP)和邻接法(NJ)构建系统发育树.结果显示：在鳚亚目鱼类的16S rRNA 片段生成的序列矩阵中发现有碱基的插入缺失现象,共有207 bp变异位点,转换/颠换值为0.8,碱基平均差异为3.36；支持绵鳚(Enchelyopus elongates)归于鳚亚目绵鳚科(Zoarcidae),鳚(Azuma emmnion)归于鳚亚目线鳚科(Stichaeidae)；方氏云鳚(Enedrias fangi)和云鳚(Enedrias nebulosus)种间遗传距离只有0.01,亲缘关系最近.【总页数】7页(P89-95)【作者】张源真;王伟;姜志强;张钊【作者单位】大连海洋大学生命与水产学院农业部海水增养殖学重点开放实验室, 辽宁大连 116023;大连海洋大学生命与水产学院农业部海水增养殖学重点开放实验室, 辽宁大连 116023;大连海洋大学生命与水产学院农业部海水增养殖学重点开放实验室, 辽宁大连 116023;大连海洋大学生命与水产学院农业部海水增养殖学重点开放实验室, 辽宁大连 116023【正文语种】中文【中图分类】Q959【相关文献】1.基于ITS-1序列的部分鳚亚目鱼类的分子系统进化关系研究 [J], 张源真;王伟;姜志强2.基于16S rDNA部分序列探讨中国近海30种石斑鱼类的分子系统进化关系 [J], 丁少雄;王颖汇;王军;庄轩;苏永全;尤颖哲;李祺福3.基于线粒体16S rRNA基因部分序列探讨贵州9种菊头蝠(翼手目:菊头蝠科)的分子系统进化关系 [J], 宋华;王会;陈学平;谷晓明4.基于16SrRNA部分序列探讨中国近海十三种石首鱼类的分子系统进化关系 [J], 张永;马春艳;马凌波;倪勇;沈盎绿5.基于16S rRNA部分序列探讨12种鲹科鱼类的分子系统进化关系 [J], 郑文娟;朱世华;邹记兴;杨迎春;沈锡权因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。