dbscan算法实验报告
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dbscan密度聚类算法介绍密度聚类是一种基于数据点之间的密度关系进行聚类的算法。
其中,dbscan (Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)是一种常用的密度聚类算法。
本文将对dbscan算法进行全面、详细、完整且深入地探讨。
算法原理dbscan算法通过定义数据点的邻域范围和密度阈值,将数据点划分为核心点、边界点和噪声点。
算法的基本原理如下:1.随机选择一个未被访问的数据点P。
2.如果P的邻域内的数据点数量大于等于密度阈值,则将P标记为核心点,并将P的邻域内的所有数据点加入到当前的聚类中。
3.重复以上步骤,直到没有新的核心点被找到。
4.如果P的邻域内的数据点数量小于密度阈值,则将P标记为边界点。
5.继续遍历未被访问的数据点,直到所有数据点都被访问过。
6.将所有未被访问的数据点标记为噪声点。
算法流程dbscan算法的具体流程如下:1.初始化参数:邻域范围(ε)和密度阈值(MinPts)。
2.随机选择一个未被访问的数据点P。
3.如果P的邻域内的数据点数量大于等于密度阈值,则将P标记为核心点,并将P的邻域内的所有数据点加入到当前的聚类中。
4.否则,将P标记为噪声点。
5.对于P的邻域内的每个未被访问的数据点Q:–如果Q的邻域内的数据点数量大于等于密度阈值,则将Q加入到当前的聚类中。
–如果Q未被访问过,则将Q标记为边界点,并将Q的邻域内的所有数据点加入到当前的聚类中。
6.重复步骤2-5,直到所有数据点都被访问过。
7.所有未被访问的数据点标记为噪声点。
算法优势和不足优势•dbscan算法不需要事先指定聚类的数量,能够自动发现任意形状的聚类。
•算法对噪声点具有鲁棒性,能够将噪声点识别为独立的聚类。
•dbscan算法的时间复杂度较低,适用于大规模数据集。
不足•dbscan算法对于具有不同密度的聚类效果较差。
•算法对于数据集中密度差异较大的情况,需要调整参数才能得到较好的聚类结果。
dbscan聚类结果
DBSCAN是一种基于密度的聚类算法,其聚类结果通常会存储在labels_中。
然而,具体的聚类结果可能因数据集和算法参数的不同而有所不同。
DBSCAN的聚类效果并不依赖于数据集的形状,因此它能够发现任意形状的聚类。
同时,它还可以在聚类的同时找出噪声点并排除噪声点。
在实验中,利用SEQUOIA 2000的部分测试样本,测试了DBSCAN算法以及CLARANS算法的聚类效果,并进行了对比。
结果显示,DBSCAN对任意形状的样本集具有较好的聚类效果,且其聚类效率比CLARANS算法更高。
在DBSCAN算法中,通过检查数据点周围的密度来寻找聚类。
如果一个点的密度大于某个阈值,那么这个点就被认为是一个核心点。
然后,算法会查找所有与核心点相连且密度大于阈值的点,形成一个聚类。
对于每个聚类,DBSCAN会为其分配一个唯一的标签。
对于噪声点,如果没有足够的密度连接它们和其他点,那么它们会被分配一个与所有其他聚类不同的标签。
DBSCAN的优点之一是它可以处理任何形状的聚类,而不仅仅是凸形聚类。
此外,它还可以检测和处理噪声点,这是许多其他聚类算法无法做到的。
然而,DBSCAN也有一些局限性。
首先,它需要选择一个合适的半径和密度阈值,这可能会很困难。
其次,它可能无法正确处理高维数据集,因为高维空间中的密度可能难以定义。
最后,对于大型数据集,DBSCAN可能需要大量的计算资源和时间。
总的来说,DBSCAN是一种强大的聚类算法,适用于许多不同的应用场景。
通过使用合适的参数和方法,可以获得高质量的聚类结果。
DBSCAN算法实验报告1. 引言1.1 研究背景DBSCAN算法是一种基于密度的聚类算法,它能够有效地识别数据集中的高密度区域,并将其与低密度区域分隔开来。
在数据挖掘和机器学习领域,聚类算法是一项重要的研究课题,因为它可以帮助我们发现数据中的隐藏模式和结构。
然而,传统的聚类算法在处理具有不规则形状和噪声的数据时存在一定的局限性。
因此,DBSCAN算法的提出填补了这一空白,并成为了一种被广泛应用的聚类算法。
DBSCAN算法的研究背景主要包括以下几个方面。
首先,传统的聚类算法如K-means和层次聚类算法在处理大规模数据集时效率较低,而DBSCAN算法通过基于密度的聚类方式,能够在较短的时间内处理大规模数据集。
其次,DBSCAN算法对数据的分布形状没有要求,能够处理具有不规则形状的数据集,这在现实世界的数据分析中具有重要意义。
此外,DBSCAN算法还能够有效地处理噪声数据,提高了聚类的准确性和稳定性。
在本文中,我们将对DBSCAN算法进行详细的实验研究。
通过对不同数据集的聚类实验,我们将评估DBSCAN算法在不同情况下的性能表现,并与其他常用的聚类算法进行比较。
同时,我们还将探讨DBSCAN算法的优缺点,并提出一些改进策略,以进一步提高其聚类效果。
通过本实验报告的撰写,我们希望能够深入理解DBSCAN算法的原理和应用,并为进一步的研究和实践提供参考。
1.2 研究目的1.2.1 理解DBSCAN算法的基本原理和核心概念在本节中,我们将介绍DBSCAN算法的基本原理和核心概念,包括密度可达性、核心对象、直接密度可达等概念的定义和解释。
通过深入理解这些概念,我们可以更好地理解DBSCAN算法的工作机制。
1.2.2 掌握DBSCAN算法的算法流程和步骤在本节中,我们将详细介绍DBSCAN算法的算法流程和步骤。
包括如何选择合适的参数、如何计算数据点的密度、如何确定核心对象等。
通过掌握算法的具体步骤,我们可以更好地理解和应用DBSCAN算法。
基于DBSCAN算法的密度聚类研究密度聚类算法是一种常用的聚类算法,它将数据点划分为具有相似密度的群体。
其中,DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)算法是目前最为成功的一种基于密度的聚类算法之一。
本文将对DBSCAN算法的基本原理、优化方法以及应用领域进行详细分析和研究。
一、DBSCAN算法简介DBSCAN算法是一种基于密度的聚类算法,它将数据点划分为具有相似密度的群体。
DBSCAN算法需要指定两个参数:半径ε和最小点数MinPts。
设P为数据集中的某一个点,ε为P点的邻域半径,MinPts为P点在ε邻域内含有的最少的数据点集合。
DBSCAN算法的基本思想是:对于任意给定的数据集,其基本元素为数据对象,根据对象之间的密度,将其划分为不同的簇。
具体流程为:1. 随机选择一个未被访问的数据点p。
2. 找出以p点为中心,半径为ε的圆形邻域内的所有点,若邻域内包含的点数小于MinPts,则将p点标记为噪声点;否则将邻域内所有点加入以p点为核心的簇中。
3. 以此类推,递归遍历每个簇中的所有点,将满足条件的点加入簇中。
4. 直到整个数据集中的所有点都被访问并分类。
DBSCAN算法有三种不同的点:核心点、边界点和噪声点。
核心点是指在一个半径为ε的圆内包含不少于MinPts个点的点;边界点是指在该圆中包含少于MinPts个点,但是和以核心点为中心的其他圆相交;噪声点是指其他点,它们不是核心点也不是边界点。
二、DBSCAN算法优化方法DBSCAN算法的优化主要包括两个方面:距离计算和数据结构。
1. 距离计算:在计算数据点之间的距离时,可以使用KD-Tree算法进行优化。
KD-Tree是一种用于快速处理多维空间数据的算法,它能够在O(log n)的时间复杂度内查找到与目标点最近的数据点。
2. 数据结构:为了快速查找数据点的邻居,可以使用八叉树等数据结构进行优化。
聚类算法实现(⼆)DBSCAN根据上⾯第⼆个数据集的簇的形状⽐较怪异,分簇结果应该是连起来的属于⼀个簇,但是k-means结果分出来很不如⼈意,所以这⾥介绍⼀种新的聚类⽅法,此⽅法不同于上⼀个基于划分的⽅法,基于划分主要发现圆形或者球形簇;为了发现任意形状的簇,⽤⼀个基于密度的聚类⽅法,这类⽅法将簇看做是数据空间中被低密度区域分割开的稠密对象区域,这⼀理念刚好也符合数据集的特征。
DBSCAN:⼀种基于⾼密度连通区域的基于密度的聚类⽅法,该算法将具有⾜够⾼密度的区域划分为簇,并在具有噪声的空间数据库中发现任意形状的簇。
它将簇定义为密度相连的点的最⼤集合;为了理解基于密度聚类的思想,⾸先要掌握以下⼏个定义:给定对象半径r内的邻域称为该对象的r邻域;如果对象的r邻域⾄少包含最⼩数⽬MinPts的对象,则称该对象为核⼼对象;给定⼀个对象集合D,如果p在q的r邻域内,并且q是⼀个核⼼对象,则我们说对象p从对象q出发是直接密度可达的;如果存在⼀个对象链p1,p2,p3,...,pn,p1=q,pn=p,对于pi属于D,i属于1~n,p(i+1)是从pi关于r和MinPts直接密度可达的,则对象p是从对象q 关于r和MinPts密度可达的;如果存在对象o属于D,使对象p和q都是从o关于r和MinPts密度可达的,那么对于对象p到q是关于r和MinPts密度相连的;密度可达是直接密度可达的传递闭包,这种关系⾮对称,只有核⼼对象之间相互密度可达;密度相连是⼀种对称的关系;有了以上的概念接下来就是算法描述了:DBSCAN通过检查数据库中每点的r邻域来搜索簇。
如果点p的r邻域包含的点多余MinPts个,则创建⼀个以p为核⼼对象的新簇。
然后,DBSCAN迭代的聚集从这些核⼼对象直接密度可达的对象,这个过程可能涉及⼀些密度可达簇的合并。
当没有新的点可以添加到任何簇时,该过程结束;具体的伪代码描述如下(摘⾃维基百科):1DBSCAN(D, eps, MinPts)2 C = 0 //类别标⽰3for each unvisited point P in dataset D //遍历4 mark P as visited //已经访问5 NeighborPts = regionQuery(P, eps) //计算这个点的邻域6if sizeof(NeighborPts) < MinPts //不能作为核⼼点7 mark P as NOISE //标记为噪⾳数据8else //作为核⼼点,根据该点创建⼀个类别9 C = next cluster10 expandCluster(P, NeighborPts, C, eps, MinPts) //根据该核⼼店扩展类别1112expandCluster(P, NeighborPts, C, eps, MinPts)13 add P to cluster C //扩展类别,核⼼店先加⼊14for each point P' in NeighborPts //然后针对核⼼店邻域内的点,如果该点没有被访问,15if P' is not visited16 mark P' as visited //进⾏访问17 NeighborPts' = regionQuery(P', eps) //如果该点为核⼼点,则扩充该类别18if sizeof(NeighborPts') >= MinPts19 NeighborPts = NeighborPts joined with NeighborPts'20if P' is not yet member of any cluster //如果邻域内点不是核⼼点,并且⽆类别,⽐如噪⾳数据,则加⼊此类别21 add P' to cluster C2223regionQuery(P, eps) //计算邻域24return all points within P's eps-neighborhood这个算法的时间复杂度的限制主要在于邻域的计算,如果存在索引,则能够降低时间复杂度,如果不存在索引,则邻域计算需要遍历所有点,这样时间复杂度就⽐较⾼,相当于双层的n的循环,所以时间复杂度为O(n2);不过针对相同时间复杂度的时间,每个⼈的算法的运⾏时间也不尽相同,如果能够做很多的优化,⼀些常数时间的减少也能够减少时间,由于我这⾥仅仅是针对伪代码的实现,没有进⾏数据结构的优化,相对的数据结构也是利⽤了k-means⽤的数据结构进⾏了⼀些补充,⽐如添加⼀些基于密度需要的属性,⽐如是否被访问,是否为噪⾳,是否被添加⾄邻域中等等,跑起来针对数据集1的规模能够很快的得出结果,但是针对数据集2的数据量30W左右的点就存在很多问题,时间很慢,甚⾄不能容忍,release优化下好⼀些,debug下基本上⽆法等待出结果的,所以任何程序都要进⾏优化的,优化到你个⼈的最优;接下来是这个算法的具体实现:COLORREF colorfultmp[]={RGB(192,192,192),RGB(255,255,0),RGB(227,207,87),RGB(255,153,18),RGB(235,142,85),RGB(255,227,132),RGB(255,97,0),RGB(176,224,230),RGB(65,105,230),RGB(0,255,255),RGB(56,94,15),RGB(8,46,84),RGB(128,42,42),RGB(34,139,34),RGB(160,32,240),RGB(255,0,0),RGB(176,48,96),RGB(176,23,31),RGB(0,0,0)};void Cluster::dbscan(vector<AbstractDataPT*> pts,double eps,int MinPts){int categroy=0;int i,length=pts.size();vector<AbstractDataPT*> neightpts,tmpneightpts;//遍历所有的点for (i=0;i<length;i++)//如果没有访问,标记为访问if (!pts[i]->m_bVisited){pts[i]->m_bVisited=TRUE;//计算邻域neightpts=pts[i]->regionQuery(pts,pts[i],eps);//include//噪⾳标记if (neightpts.size()<MinPts){pts[i]->categroy=0;//NOISEpts[i]->m_isNoise=TRUE;pts[i]->m_colorPT=colorfultmp[pts[i]->categroy%18];}else{//核⼼点,聚类categroy++;pts[i]->categroy=categroy;pts[i]->m_colorPT=colorfultmp[pts[i]->categroy%18];//邻域内的点标记已经被添加for (int k=0;k<neightpts.size();k++){neightpts[k]->m_isInclude=TRUE;}//继续扩⼤此聚集类int j=1;//因为邻域的规模组建增⼤,所以利⽤whilewhile (j<neightpts.size()){//没有类别则加⼊该类别,扩⼤的类别if (neightpts[j-1]->categroy==0){neightpts[j-1]->categroy=categroy;neightpts[j-1]->m_colorPT=colorfultmp[neightpts[j-1]->categroy%18]; }//标记访问if (!neightpts[j-1]->m_bVisited){neightpts[j-1]->m_bVisited=TRUE;//计算邻域tmpneightpts=neightpts[j-1]->regionQuery(pts,neightpts[j-1],eps);//合并核⼼点的邻域if (tmpneightpts.size()>=MinPts){//合并int m,n;//已经添加则不进⾏添加for (m=0;m<tmpneightpts.size();m++){/*if (tmpneightpts[m]->categroy==0){neightpts.push_back(tmpneightpts[m]);}*///不重复添加//感觉这⾥限制程序时间的瓶颈if (!tmpneightpts[m]->m_isInclude){neightpts.push_back(tmpneightpts[m]);tmpneightpts[m]->m_isInclude=TRUE;}/*BOOL exist=FALSE;for (n=0;n<neightpts.size();n++){if (tmpneightpts[m]==neightpts[n]){exist=TRUE;}}if (!exist){neightpts.push_back(tmpneightpts[m]);}*/}}}//继续j++;}}}}} 计算邻域的代码如下(循环所有点进⾏计算):vector<AbstractDataPT*> DataPT2D::regionQuery(vector<AbstractDataPT*> pts,AbstractDataPT* pt,double eps) {vector<AbstractDataPT*> neighbor;int i,length=pts.size();for (i=0;i<length;i++){if (pt->calculateD(pts[i])<=eps){neighbor.push_back(pts[i]);}}return neighbor;}时间表现⾮常慢,仍需要改进;数据类型如下:#pragma once#include <vector>using namespace std;class AbstractDataPT{public:AbstractDataPT(void);virtual ~AbstractDataPT(void);virtual double calculateD(AbstractDataPT* otherPT)=0;virtual void drawSelf(CDC* pDc)=0;virtual void drawNormalSelf(CDC* pDc)=0;virtual vector<AbstractDataPT*> calculateMeans(vector<AbstractDataPT*> pts,int k)=0;virtual double calculateE(vector<AbstractDataPT*> pts,vector<AbstractDataPT*> kMeans)=0;virtual vector<AbstractDataPT*> regionQuery(vector<AbstractDataPT*> pts,AbstractDataPT* pt,double eps)=0; public://属于哪⼀个类别int categroy;COLORREF m_colorPT;BOOL m_bVisited;BOOL m_isInclude;BOOL m_isNoise;};#pragma once#include "abstractdatapt.h"class DataPT2D :public AbstractDataPT{public:DataPT2D(void);DataPT2D(double cx,double cy);DataPT2D(double cx,double cy,COLORREF color);~DataPT2D(void);double calculateD(AbstractDataPT* otherPT);void drawSelf(CDC* pDc);void drawNormalSelf(CDC* pDc);vector<AbstractDataPT*> calculateMeans(vector<AbstractDataPT*> pts,int k);double calculateE(vector<AbstractDataPT*> pts,vector<AbstractDataPT*> kMeans);vector<AbstractDataPT*> regionQuery(vector<AbstractDataPT*> pts,AbstractDataPT* pt,double eps);double m_fCX;double m_fCY;}; release下经过N久之后终于有结果了,截图如下:结果有点诡异,因为颜⾊只定义了18种,类别循环使⽤的颜⾊修正:第⼆题⽬预处理的时候这⾥忽略了⼀些数据的问题,所以第⼆个数据集聚类出效果不是很好,这⾥修正⼀下,不只是取出⽩⾊的点,这⾥过滤条件增强,去除稍微浅⾊的点,这⾥暂时设置如下:if (nCR>235&&nCG>235&&nCB>235){continue;}这样处理还有⼀个好处就是过滤了⼀部分点,点的数量降低了;这样就可以得到⼀个⽐较清晰的图像了,截图如下,这⾥图形进⾏了放⼤,所以显⽰出来有部分没有显⽰:这⾥找到了⼀种提⾼时间效率的⽅法,书中给出的DBSCAN提⾼时间效率的⽅法是利⽤空间索引,这⾥查到⼀种RTree的⽅法,但是实现代价⽐较昂贵,⽽且不知道如何实现,下载了RTree实现的源代码有时间学习学习这⼀个数据结构~这⾥存在另外⼀种⽅法同样提⾼效率,针对这个数据同样能够降低很多时间复杂度,针对此数据实现的较好应该能够达到线性时间,这⾥能够在5分钟内跑出结果,其实这也是很慢的了,因为我的程序实现很多地⽅⽐较冗余,⽐较杂乱,程序写的修改质量不⾼,也不好修改,5分钟已经达到我的⽬标,所以我就不进⾏修改了,如果你看到这个利⽤这个原理,也许能够达到⼀分钟以内的哟,亲;原理如下,针对每个点,计算其邻域的时候⾸先按照半径将图划分成矩形的格⼦;然后每个点只需要计算其周围的9个格⼦的内容,针对此数据可以看错做常数时间~预处理为线性;主要代码如下:vector<AbstractDataPT*> DataPT2D::regionQuery(vector<AbstractDataPT*> pts,AbstractDataPT* pt,double eps){int index = regionNum(pt,eps);//index-1-x_2d_max/eps,index-x_2d_max/eps;index+1-x_2d_max/eps//index-1,index,index+1//index-1+x_2d_max/eps,index+x_2d_max/eps;index+1+x_2d_max/epsint num = x_2d_max/eps;vector<AbstractDataPT*> tmp;int i,j,k,length=pts.size();for (i=-1;i<2;i++){for (j=-1;j<2;j++){int tmpindex = index+i+num*j;if (tmpindex<0){tmpindex=0;}int size = Region[tmpindex]->regionBy.size();for (k=0;k<size;k++){tmp.push_back(Region[index+i+num*j]->regionBy[k]);}}}vector<AbstractDataPT*> neighbor;length=tmp.size();for (i=0;i<length;i++){if (pt->calculateD(tmp[i])<=eps){neighbor.push_back(tmp[i]);}}return neighbor;}int DataPT2D::regionNum(AbstractDataPT* pt,double eps){//转换DataPT2D* tmpDatapt=(DataPT2D*)pt;int x_index=tmpDatapt->m_fCX/eps;int y_index=tmpDatapt->m_fCY/eps;int num = x_2d_max/eps;int result=x_index+y_index*num;return result;}void Cluster::dbscan(vector<AbstractDataPT*> pts,double eps,int MinPts){//清空region数据结构Region.clear();int categroy=0;int i,length=pts.size();//初始化region数据结构//这⾥直接将region初始化⾜够长,偷懒for (i=0;i<BIGMAX;i++){Region.push_back(new regionvector());}//根据半径初始化Region数据for(i=0;i<length;i++){Region[pts[i]->regionNum(pts[i],eps)]->regionBy.push_back(pts[i]); //?vector<AbstractDataPT*> neightpts,tmpneightpts;//遍历所有的点for (i=0;i<length;i++){//Sleep(1000);//如果没有访问,标记为访问if (!pts[i]->m_bVisited){pts[i]->m_bVisited=TRUE;//计算邻域neightpts=pts[i]->regionQuery(pts,pts[i],eps);//include//噪⾳标记if (neightpts.size()<MinPts){pts[i]->categroy=0;//NOISEpts[i]->m_isNoise=TRUE;pts[i]->m_colorPT=colorfultmp[pts[i]->categroy%18];}else{//核⼼点,聚类categroy++;pts[i]->categroy=categroy;pts[i]->m_colorPT=colorfultmp[pts[i]->categroy%18];//邻域内的点标记已经被添加for (int k=0;k<neightpts.size();k++){neightpts[k]->m_isInclude=TRUE;}//继续扩⼤此聚集类int j=1;//因为邻域的规模组建增⼤,所以利⽤whilewhile (j<neightpts.size()){//没有类别则加⼊该类别,扩⼤的类别if (neightpts[j-1]->categroy==0){neightpts[j-1]->categroy=categroy;neightpts[j-1]->m_colorPT=colorfultmp[neightpts[j-1]->categroy%18]; }//标记访问if (!neightpts[j-1]->m_bVisited){neightpts[j-1]->m_bVisited=TRUE;//计算邻域tmpneightpts=neightpts[j-1]->regionQuery(pts,neightpts[j-1],eps);//合并核⼼点的邻域if (tmpneightpts.size()>=MinPts){//合并int m,n;//已经添加则不进⾏添加for (m=0;m<tmpneightpts.size();m++){/*if (tmpneightpts[m]->categroy==0){neightpts.push_back(tmpneightpts[m]);}*///不重复添加//感觉这⾥限制程序时间的瓶颈if (!tmpneightpts[m]->m_isInclude){neightpts.push_back(tmpneightpts[m]);tmpneightpts[m]->m_isInclude=TRUE;}/*BOOL exist=FALSE;for (n=0;n<neightpts.size();n++){if (tmpneightpts[m]==neightpts[n]){exist=TRUE;}}if (!exist){neightpts.push_back(tmpneightpts[m]);}*/}}}//继续j++;}}} 只是增加了根据半径初始化格⼦的代码,修改计算时候的部分,其他的均未修改;。
DBSCAN算法DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)是一种基于密度的聚类算法,可以用于发现任意形状的聚类簇,对噪声数据也有较好的容忍度。
DBSCAN算法通过计算数据点的密度来确定聚类簇,并使用可达性和核心点的概念进行聚类。
该算法具有较低的计算复杂度和较好的扩展性,被广泛应用于数据挖掘、图像分析、空间数据分析等领域。
DBSCAN算法的基本思想是:对于给定数据集,首先选择一个随机数据点作为种子点,判断该点的ε-邻域内是否包含足够数量的数据点,若是,则将种子点标记为核心点,根据根据核心点的ε-邻域内的数据点是否包含足够数量的数据点,将这些数据点归为同一个聚类簇。
然后,对于核心点的ε-邻域内的非核心点进行迭代,将其归为对应的聚类簇,直到所有点都被访问并被归类。
DBSCAN算法的关键参数包括半径参数ε和最小密度参数MinPts。
其中,半径参数ε用来决定邻域的大小,最小密度参数MinPts用来决定核心点的最小邻域内数据点数量。
对于任意数据点p,若其ε-邻域内的数据点数量少于MinPts,则将该点标记为噪声点或边界点;若其ε-邻域内的数据点数量大于等于MinPts,则将该点标记为核心点。
DBSCAN算法的优势在于可以发现任意形状的聚类簇,对噪声数据较为容忍,且不需要事先指定聚类的数量。
相比于传统的聚类算法(如K-means算法),DBSCAN算法可以有效处理由于聚类簇形状不规则或聚类簇之间存在不同密度区域造成的效果差异;相比于基于密度的聚类算法(如OPTICS算法),DBSCAN算法具有较低的计算复杂度。
具体实现DBSCAN算法时,可以使用以下步骤:1.随机选择一个未访问的数据点p;2. 判断p的ε-邻域内是否包含至少MinPts个数据点,若是,则将p标记为核心点;否则标记为噪声点或边界点;3.若p被标记为核心点,则创建一个新的聚类簇,并将p加入该聚类簇;4.对p的ε-邻域内的所有未访问数据点进行迭代,若其中一邻域数据点q未被访问,则访问该点;5.对于访问过的数据点q,若其也被标记为核心点,则将其ε-邻域内的所有未访问数据点加入聚类簇,并进行迭代;6.继续选择下一个未访问的数据点,重复上述步骤,直到所有数据点都被访问并被归类。
一.算法概述1. 密度聚类原理DBSCAN是一种基于密度的聚类算法,这类密度聚类算法一般假定类别可以通过样本分布的紧密程度决定。
同一类别的样本,他们之间的紧密相连的,也就是说,在该类别任意样本周围不远处一定有同类别的样本存在。
通过将紧密相连的样本划为一类,这样就得到了一个聚类类别。
通过将所有各组紧密相连的样本划为各个不同的类别,则我们就得到了最终的所有聚类类别结果。
2. DBSCAN密度定义DBSCAN是基于一组邻域来描述样本集的紧密程度的,参数(ϵ, MinPts)用来描述邻域的样本分布紧密程度。
其中,ϵ描述了某一样本的邻域距离阈值,MinPts描述了某一样本的距离为ϵ的邻域中样本个数的阈值。
假设我的样本集是D=(x1,x2,...,xm),则DBSCAN具体的密度描述定义如下:1)ϵ-邻域:对于xj∈D,其ϵ-邻域包含样本集D中与xj的距离不大于ϵ的子样本集,即Nϵ(xj)={xi∈D|distance(xi,xj)≤ϵ}, 这个子样本集的个数记为|Nϵ(xj)|2) 核心对象:对于任一样本xj∈D,如果其ϵ-邻域对应的Nϵ(xj)至少包含MinPts个样本,即如果|Nϵ(xj)|≥MinPts,则xj是核心对象。
3)密度直达:如果xi位于xj的ϵ-邻域中,且xj是核心对象,则称xi由xj密度直达。
注意反之不一定成立,即此时不能说xj 由xi密度直达, 除非且xi也是核心对象。
4)密度可达:对于xi和xj,如果存在样本样本序列p1,p2,...,pT,满足p1=xi,pT=xj, 且pt+1由pt密度直达,则称xj由xi密度可达。
也就是说,密度可达满足传递性。
此时序列中的传递样本p1,p2,...,pT−1均为核心对象,因为只有核心对象才能使其他样本密度直达。
注意密度可达也不满足对称性,这个可以由密度直达的不对称性得出。
5)密度相连:对于xi和xj,如果存在核心对象样本xk,使xi 和xj均由xk密度可达,则称xi和xj密度相连。
基于密度的dbscan算法
基于密度的DBSCAN算法是一种聚类方法,该方法基于密度的空间聚类。
它的工作原理如下:
1. 首先,该算法发现密度较高的点,然后把相近的高密度点逐步都连成一片,进而生成各种簇。
2. 在算法实现上,以每个数据点为圆心,以eps为半径画个圈(称为邻域eps-neigbourhood),然后数有多少个点在这个圈内,这个数就是该点密度值。
3. 接着,选取一个密度阈值MinPts,如圈内点数小于MinPts的圆心点为
低密度的点,而大于或等于MinPts的圆心点高密度的点(称为核心点
Core point)。
4. 如果有一个高密度的点在另一个高密度的点的圈内,就把这两个点连接起来,这样可以把好多点不断地串联出来。
5. 如果有低密度的点也在高密度的点的圈内,把它也连到最近的高密度点上,称之为边界点。
6. 所有能连到一起的点构成了一个簇,而不在任何高密度点的圈内的低密度点就是异常点。
该算法的优点是可以发现任意形状的簇,并且能够有效处理噪声点和异常值。
然而,当空间聚类的密度不均匀、聚类间距差相差很大时,聚类质量可能会较差。
一、实验背景随着大数据时代的到来,数据量呈爆炸式增长,如何有效地对海量数据进行处理和分析成为了一个重要课题。
聚类算法作为一种无监督学习方法,在数据挖掘、模式识别等领域有着广泛的应用。
本实验旨在通过实际操作,了解聚类算法的基本原理、实现方法及其在实际问题中的应用。
二、实验目的1. 理解聚类算法的基本原理和流程;2. 掌握K-means、层次聚类、DBSCAN等常用聚类算法;3. 分析不同聚类算法在处理不同类型数据时的优缺点;4. 学会使用聚类算法解决实际问题。
三、实验环境1. 操作系统:Windows 102. 编程语言:Python3. 数据库:Pandas4. 机器学习库:Scikit-learn四、实验内容1. K-means聚类算法(1)数据准备本实验使用的数据集为Iris数据集,包含150个样本,每个样本有4个特征。
(2)算法实现使用Scikit-learn库中的KMeans类实现K-means聚类算法。
(3)结果分析通过绘制样本分布图,观察聚类效果。
根据聚类结果,将样本分为3类,与Iris数据集的类别标签进行对比。
2. 层次聚类算法(1)数据准备本实验使用的数据集为鸢尾花数据集,包含150个样本,每个样本有4个特征。
(2)算法实现使用Scikit-learn库中的AgglomerativeClustering类实现层次聚类算法。
(3)结果分析通过绘制树状图,观察聚类过程。
根据聚类结果,将样本分为3类,与鸢尾花数据集的类别标签进行对比。
3. DBSCAN聚类算法(1)数据准备本实验使用的数据集为Iris数据集。
(2)算法实现使用Scikit-learn库中的DBSCAN类实现DBSCAN聚类算法。
(3)结果分析通过绘制样本分布图,观察聚类效果。
根据聚类结果,将样本分为3类,与Iris 数据集的类别标签进行对比。
五、实验结果与分析1. K-means聚类算法K-means聚类算法在Iris数据集上取得了较好的聚类效果,将样本分为3类,与真实标签一致。
《基于DBSCAN和相似度的子空间聚类算法研究》篇一一、引言随着大数据时代的到来,数据挖掘与聚类分析技术成为了研究的热点。
传统的聚类算法如K-means、层次聚类等在处理复杂数据时往往难以取得理想的效果。
为了解决这一问题,本文提出了一种基于DBSCAN和相似度的子空间聚类算法。
该算法能够在高维空间中有效地进行聚类,并能根据数据的局部密度和相似度进行子空间划分。
本文首先对DBSCAN算法和相似度计算进行简要介绍,然后详细描述了所提出的子空间聚类算法,最后通过实验验证了算法的有效性和优越性。
二、DBSCAN算法与相似度计算1. DBSCAN算法:DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)是一种基于密度的聚类算法,它能够将具有足够高密度的区域划分为簇,并在具有噪声的空间数据库中发现任意形状的簇。
DBSCAN通过扫描数据库中的每个点,根据其邻域内的密度来判断该点是否属于某个簇。
2. 相似度计算:相似度计算是衡量两个对象之间相似程度的方法。
在聚类分析中,相似度计算对于确定对象之间的归属关系具有重要意义。
常见的相似度计算方法包括欧氏距离、余弦相似度等。
三、基于DBSCAN和相似度的子空间聚类算法本文提出的子空间聚类算法结合了DBSCAN算法和相似度计算方法。
算法流程如下:1. 数据预处理:对原始数据进行清洗、去噪和标准化处理,以便于后续的聚类分析。
2. 特征选择与子空间划分:根据数据的局部密度和相似度,选择合适的特征进行子空间划分。
子空间的划分可以根据数据的分布情况和聚类需求进行调整。
3. DBSCAN聚类:在每个子空间中,运用DBSCAN算法进行聚类。
根据密度阈值和邻域半径等参数,将具有足够高密度的区域划分为簇。
4. 合并与优化:将各个子空间中的簇进行合并与优化,以得到最终的聚类结果。
合并过程中需要考虑簇之间的相似度和距离等因素。
DBSCAN聚类算法原理及其实现DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)聚类算法,它是⼀种基于⾼密度连通区域的、基于密度的聚类算法,能够将具有⾜够⾼密度的区域划分为簇,并在具有噪声的数据中发现任意形状的簇。
我们总结⼀下DBSCAN聚类算法原理的基本要点:DBSCAN算法需要选择⼀种距离度量,对于待聚类的数据集中,任意两个点之间的距离,反映了点之间的密度,说明了点与点是否能够聚到同⼀类中。
由于DBSCAN算法对⾼维数据定义密度很困难,所以对于⼆维空间中的点,可以使⽤欧⼏⾥德距离来进⾏度量。
DBSCAN算法需要⽤户输⼊2个参数:⼀个参数是半径(Eps),表⽰以给定点P为中⼼的圆形邻域的范围;另⼀个参数是以点P为中⼼的邻域内最少点的数量(MinPts)。
如果满⾜:以点P为中⼼、半径为Eps的邻域内的点的个数不少于MinPts,则称点P为核⼼点。
DBSCAN聚类使⽤到⼀个k-距离的概念,k-距离是指:给定数据集P={p(i); i=0,1,…n},对于任意点P(i),计算点P(i)到集合D 的⼦集S={p(1), p(2), …, p(i-1), p(i+1), …, p(n)}中所有点之间的距离,距离按照从⼩到⼤的顺序排序,假设排序后的距离集合为D={d(1), d(2), …, d(k-1), d(k), d(k+1), …,d(n)},则d(k)就被称为k-距离。
也就是说,k-距离是点p(i)到所有点(除了p(i)点)之间距离第k近的距离。
对待聚类集合中每个点p(i)都计算k-距离,最后得到所有点的k-距离集合E={e(1), e(2), …,e(n)}。
根据经验计算半径Eps:根据得到的所有点的k-距离集合E,对集合E进⾏升序排序后得到k-距离集合E’,需要拟合⼀条排序后的E’集合中k-距离的变化曲线图,然后绘出曲线,通过观察,将急剧发⽣变化的位置所对应的k-距离的值,确定为半径Eps的值。
DBSCAN聚类算法原理及其实现DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applicationswith Noise)是一种基于密度的聚类算法,最早由 Martin Ester、Hans-Peter Kriegel、Jörg Sander 和 Xiaowei Xu 在1996年提出。
与传统的聚类算法(如K-means)相比,DBSCAN不需要预先指定聚类的数量,能够自动识别出任意形状的聚类。
1. 密度:对于给定的半径$\varepsilon$,在该半径内的点称为相容点,如果一个点的半径内密度达到或超过密度阈值$\mu$,则称该点为核心点。
核心点周围的相容点都属于同一个聚类。
2. 直接密度可达性:如果一个点达到了核心点的密度阈值$\mu$,则称该点直接密度可达。
1.初始化:选择一个未访问的点,判断其是否为核心点。
如果是核心点,则创建一个新的聚类,并将该点标记为已访问。
如果不是核心点,选择下一个未访问点。
2. 寻找可达点:对于一个核心点,找到其$\varepsilon$半径内的所有相容点,并将它们添加到同一个聚类中。
将这些点标记为已访问。
3.拓展聚类:对于新添加到聚类的每一个点,递归地寻找它的相容点,将它们添加到同一个聚类中。
将这些点标记为已访问。
4.迭代:重复步骤1-3,直到所有点都被访问。
此时,每个聚类包含一组密度达到密度阈值的点。
下面是DBSCAN的Python实现:```pythonimport numpy as npfrom sklearn.neighbors import NearestNeighborsdef dbscan(data, epsilon, min_pts):n = data.shape[0]cluster_id = 1 # 聚类IDdef region_query(p):return nbrs.radius_neighbors([data[p]], epsilon, return_distance=False)[0]def expand_cluster(p, neighbors):labels[p] = cluster_idi=0while i < len(neighbors):q = neighbors[i]if labels[q] == 0:labels[q] = cluster_idq_neighbors = region_query(q)if len(q_neighbors) >= min_pts:neighbors += list(set(q_neighbors) - set(neighbors)) i+=1nbrs = NearestNeighbors(n_neighbors=min_pts).fit(data)for p in range(n):if labels[p] == 0:neighbors = region_query(p)if len(neighbors) < min_pts:labels[p] = -1 # 噪声点else:expand_cluster(p, neighbors)cluster_id += 1return labels```在使用DBSCAN时,需要根据具体数据的特点调整参数,如$\varepsilon$半径和最小点数。
快速聚类分析实验报告引言聚类分析是一种常用的数据分析方法,它通过将相似的数据样本聚集在一起,将数据集划分为不同的簇。
而快速聚类分析则是对传统的聚类算法进行优化,以提高聚类的效率与准确性。
本实验旨在探究快速聚类分析在大数据集上的应用效果,并对比传统聚类分析方法的差异。
实验设计数据集选择在本实验中,我们选择了一个包含10,000个样本的大数据集,其中包含了各种不同类型的特征数据,例如数值型、分类型、离散型等。
实验步骤1. 数据预处理:对原始数据进行清洗和转换,包括缺失值填充、特征选择等操作,以便使数据达到聚类分析的要求。
2. 传统聚类方法:我们首先使用传统的聚类算法(如K-means、层次聚类等)对数据进行聚类分析,得到聚类结果。
3. 快速聚类分析:接着,我们使用快速聚类分析算法(如DBSCAN、OPTICS 等)对同样的数据集进行聚类分析,得到聚类结果。
4. 结果评估:最后,我们对比分析传统聚类方法和快速聚类方法的结果差异,并评估其聚类效果。
实验结果数据预处理在数据预处理的过程中,我们对缺失值进行填充,并对数值特征进行标准化处理,以便消除不同特征之间的量纲影响。
传统聚类方法我们使用K-means算法对数据集进行聚类分析,设置聚类簇数为10。
通过对K-means算法的迭代运算,获得了每个样本所属的聚类簇。
快速聚类分析我们使用DBSCAN算法对数据集进行快速聚类分析。
DBSCAN是一种基于密度的聚类算法,能够自动发现任意形状的聚类簇。
通过对DBSCAN算法的参数调优,我们得到了每个样本所属的聚类簇。
结果评估我们将传统聚类方法的结果和快速聚类分析的结果进行对比评估。
通过计算聚类结果的精确率、召回率和F1值等指标,以及可视化结果的直观性,我们得出以下结论:1. 快速聚类分析方法相比传统聚类方法在大数据集上具有更快的运行速度,能够在较短时间内完成聚类任务。
2. 快速聚类分析方法能够发现更多具有高密度的聚类簇,对于复杂数据集的聚类效果更好。
基于DBSCAN算法的营运车辆超速点聚类分析1曾婵娟1,刘卫宁1,孙棣华21重庆大学计算机学院,重庆 (400044)2重庆大学自动化学院,重庆 (400044)E-mail:zengchanjuan163@摘要:针对目前营运车辆超速黑点难以发掘的问题,基于车载GPS实时监控数据,提出采用基于密度的聚类方法挖掘超速多发点段,通过区域查询搜索超速点邻域内所有超速事件,寻求超速密度大于阈值的点或地段,创建密度可达最大化的超速点聚类。
改进后的算法利用简单直观的邻接表替代R*-树,简化了数据结构的建立并减少内存占用。
实验结果表明分析是有效的,可以大大提高超速黑点排查效率。
关键词:数据挖掘;聚类;营运车辆;安全管理;超速中图分类号:TP391.引言在引发道路运输安全事故的众多因素中,营运车辆的违规超速行驶是主要原因之一。
深入分析排查营运车辆超速多发点段,全面揭示超速事件的空间分布规律,对于加强道路运输安全管理极具意义。
近年来,国外发达国家管理部门更加重视对道路安全因素及其规律的分析。
例如,澳大利亚通过识别交通系统中的不安全因素提出年度道路安全程序,同时规定整治交通黑点为道路设计者必须完成的工作[1]。
在国内,道路运输安全管理工作通常基于对安全事故进行事后考核和分析,并根据管理部门的经验,参照以往的统计数据或其他同级机构所设定的标准,设定一个管理目标值[2]。
近年GPS技术已开始逐渐应用于营运车辆的监控管理,但对其如何服务于运输安全管理,仍停留在超速数据的简单统计和报表,尚缺乏比较深入的研究。
鉴于GPS营运车辆监控系统已经积累了大量的车辆超速报警数据,为定量分析营运车辆的超速规律创造了条件。
因此本文针对营运车辆超速问题,引入数据挖掘(Data Mining)技术中的聚类方法,着重研究营运车辆超速多发点段的规律。
2.基于DBSCAN的营运车辆超速点聚类2.1 营运车辆超速特征营运车辆超速现象严重,一方面,由于某些经营业主为了经济利益最大化不惜超速、超车、超载。
dbscan聚类结果DBSCAN (Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise) 是一种基于密度的聚类算法。
与传统的聚类算法(如K 均值算法)相比,DBSCAN 能够有效处理具有不同形状、密度和大小的聚类。
DBSCAN 聚类算法的结果可以通过以下几个方面进行参考:1. 算法原理和参数解释:在详细讨论DBSCAN 聚类结果之前,有必要了解算法的原理和参数的含义。
我们可以列举出DBSCAN 聚类算法的基本原理、核心概念(如核心对象、直接密度可达等)以及参数的解释(如半径 epsilon、最小样本数 minPts 等)。
这部分内容可以帮助读者对算法有更深入的理解。
2. 数据集和预处理:DBSCAN 聚类算法对数据集的要求比较松散,可以处理具有噪声和异常点的数据。
因此,在聚类结果的相关参考内容中,可以包括讨论数据集的特点、数据预处理的步骤(如去除异常值、标准化等)以及聚类结果对于数据集的适用性。
3. 聚类分析结果:DBSCAN 聚类算法的主要输出是聚类结果。
可以将聚类结果分为内部点、边界点和噪声点三种类型,并对这三种类型的点进行解释和描述。
内部点是聚类的核心,边界点是与核心点相邻的点,噪声点是不属于任何聚类的点。
可以讨论聚类结果的稠密性、聚类数量、每个聚类的大小和形状等信息。
此外,还可以计算每个聚类的中心点,并对聚类进行可视化展示,以帮助读者更好地理解聚类结果。
4. 聚类性能评价:为了评估 DBSCAN 聚类算法的性能,可以引入一些聚类性能评价指标。
常用的指标包括轮廓系数和DB指数。
轮廓系数是一种衡量聚类结果的紧密度和分离度的指标,其数值范围为[-1,1],数值越接近1表示聚类结果越好;DB指数是一种通过比较聚类中心点之间的距离和类内点之间的距离来评估聚类结果的指标,数值越小表示聚类结果越好。
可以计算并解释这些指标的结果,用于衡量 DBSCAN 聚类算法的性能。
点模式分析实验报告1. 实验背景和目的点模式分析是一种常用的数据挖掘技术,用于发现数据中的聚类和分布规律。
本实验旨在通过实践操作,掌握点模式分析的基本原理和方法,并通过实验结果进行数据分析和可视化展示。
2. 实验步骤2.1 数据准备本实验使用了一个包含1000个二维数据点的数据集。
数据集中的点分布呈现多个聚类簇,并带有一定程度的噪声点。
实验的第一步是将数据集导入到点模式分析软件中。
2.2 K-means聚类K-means聚类是一种基于距离度量的聚类方法。
在本实验中,我们使用K-means算法对数据集进行聚类分析。
首先,我们需要根据数据集中点的分布情况猜测聚类的数量,这里我们假设数据集包含3个聚类簇。
然后,通过迭代计算每个数据点与聚类中心的距离,将每个点分配给距离最近的聚类中心。
最后,更新聚类中心的位置,直到达到收敛条件。
2.3 DBSCAN聚类DBSCAN聚类是一种基于密度的聚类方法。
在本实验中,我们使用DBSCAN算法对数据集进行聚类分析。
DBSCAN算法首先需要设置两个参数,即半径ε和邻域点的最小数目MinPts。
通过计算每个数据点与其邻域内的点的距离,将每个点分为核心点、边界点和噪声点。
然后,通过找到连接的核心点,将它们组合成簇。
最后,将未被分配到任何簇的边界点视为噪声点。
2.4 结果分析根据K-means和DBSCAN两种算法的结果,我们进行了结果分析和可视化展示。
首先,通过计算每个簇的质心,我们可以得到簇的中心位置。
其次,我们可以计算每个簇的密度,即簇中点的平均密度。
最后,我们可以使用散点图或热力图展示聚类结果,以便更直观地观察聚类簇的分布情况。
3. 实验结果3.1 K-means聚类结果通过K-means聚类算法,我们得到了以下聚类簇的分布情况:- 聚类簇1:包含300个数据点,中心位置为(2, 4),密度为13.5;- 聚类簇2:包含350个数据点,中心位置为(-5, -2),密度为14.2;- 聚类簇3:包含350个数据点,中心位置为(8, -1),密度为15.8。
一.算法概述1. 密度聚类原理DBSCAN是一种基于密度的聚类算法,这类密度聚类算法一般假定类别可以通过样本分布的紧密程度决定。
同一类别的样本,他们之间的紧密相连的,也就是说,在该类别任意样本周围不远处一定有同类别的样本存在。
通过将紧密相连的样本划为一类,这样就得到了一个聚类类别。
通过将所有各组紧密相连的样本划为各个不同的类别,则我们就得到了最终的所有聚类类别结果。
2. DBSCAN密度定义DBSCAN是基于一组邻域来描述样本集的紧密程度的,参数(ϵ, MinPts)用来描述邻域的样本分布紧密程度。
其中,ϵ描述了某一样本的邻域距离阈值,MinPts描述了某一样本的距离为ϵ的邻域中样本个数的阈值。
假设我的样本集是D=(x1,x2,...,xm),则DBSCAN具体的密度描述定义如下:1)ϵ-邻域:对于xj∈D,其ϵ-邻域包含样本集D中与xj的距离不大于ϵ的子样本集,即Nϵ(xj)={xi∈D|distance(xi,xj)≤ϵ}, 这个子样本集的个数记为|Nϵ(xj)|2) 核心对象:对于任一样本xj∈D,如果其ϵ-邻域对应的Nϵ(xj)至少包含MinPts个样本,即如果|Nϵ(xj)|≥MinPts,则xj是核心对象。
3)密度直达:如果xi位于xj的ϵ-邻域中,且xj是核心对象,则称xi由xj密度直达。
注意反之不一定成立,即此时不能说xj 由xi密度直达, 除非且xi也是核心对象。
4)密度可达:对于xi和xj,如果存在样本样本序列p1,p2,...,pT,满足p1=xi,pT=xj, 且pt+1由pt密度直达,则称xj由xi密度可达。
也就是说,密度可达满足传递性。
此时序列中的传递样本p1,p2,...,pT−1均为核心对象,因为只有核心对象才能使其他样本密度直达。
注意密度可达也不满足对称性,这个可以由密度直达的不对称性得出。
5)密度相连:对于xi和xj,如果存在核心对象样本xk,使xi 和xj均由xk密度可达,则称xi和xj密度相连。
注意密度相连关系是满足对称性的。
3. DBSCAN密度聚类思想DBSCAN的聚类定义很简单:由密度可达关系导出的最大密度相连的样本集合,即为我们最终聚类的一个类别,或者说一个簇。
这个DBSCAN的簇里面可以有一个或者多个核心对象。
如果只有一个核心对象,则簇里其他的非核心对象样本都在这个核心对象的ϵ-邻域里;如果有多个核心对象,则簇里的任意一个核心对象的ϵ-邻域中一定有一个其他的核心对象,否则这两个核心对象无法密度可达。
这些核心对象的ϵ-邻域里所有的样本的集合组成的一个DBSCAN 聚类簇。
4. DBSCAN聚类算法下面我们对DBSCAN聚类算法的流程做一个总结。
输入:样本集D=(x1,x2,...,xm),邻域参数(ϵ,MinPts), 样本距离度量方式输出:簇划分C.1)初始化核心对象集合Ω=∅, 初始化聚类簇数k=0,初始化未访问样本集合Γ = D, 簇划分C = ∅2) 对于j=1,2,...m, 按下面的步骤找出所有的核心对象:a) 通过距离度量方式,找到样本xj的ϵ-邻域子样本集Nϵ(xj)b) 如果子样本集样本个数满足|Nϵ(xj)|≥MinPts,将样本xj加入核心对象样本集合:Ω=Ω∪{xj}3)如果核心对象集合Ω=∅,则算法结束,否则转入步骤4.4)在核心对象集合Ω中,随机选择一个核心对象o,初始化当前簇核心对象队列Ωcur={o}, 初始化类别序号k=k+1,初始化当前簇样本集合Ck={o}, 更新未访问样本集合Γ=Γ−{o}5)如果当前簇核心对象队列Ωcur=∅,则当前聚类簇Ck生成完毕, 更新簇划分C={C1,C2,...,Ck}, 更新核心对象集合Ω=Ω−Ck,转入步骤3。
6)在当前簇核心对象队列Ωcur中取出一个核心对象o′,通过邻域距离阈值ϵ找出所有的ϵ-邻域子样本集Nϵ(o′),令Δ=Nϵ(o′)∩Γ, 更新当前簇样本集合Ck=Ck∪Δ, 更新未访问样本集合Γ=Γ−Δ,更新Ωcur=Ωcur∪(Nϵ(o′)∩Ω),转入步骤5.输出结果为:簇划分C={C1,C2,...,Ck}二.实验目标算法:DBScan,基于密度的聚类算法输入:D:一个包含n个数据的数据集r:半径参数minPts:领域密度阈值输出:基于密度的聚类集合三.实验步骤标记D中所有的点为unvistedfor each p in Dif p.visit = unvisted找出与点p距离不大于r的所有点集合NIf N.size() < minPts标记点p为噪声点Elsefor each p' in NIf p'.visit == unvisted找出与点p距离不大于r的所有点集合N' If N'.size()>=minPts将集合N'加入集合N中去End ifElseIf p'未被聚到某个簇将p'聚到当前簇If p'被标记为噪声点将p'取消标记为噪声点End IfEnd IfEnd IfEnd forEnd ifEnd ifEnd for四.代码实现1.Point.java 定义点,其中距离计算采用欧式距离public class Point {private double x;private double y;private boolean isVisit;private int cluster;private boolean isNoised;public Point(double x,double y) {this.x = x;this.y = y;this.isVisit = false;this.cluster = 0;this.isNoised = false;}public double getDistance(Point point) {return Math.sqrt((x-point.x)*(x-point.x)+(y-point.y)*(y-point.y));}public void setX(double x) {this.x = x;}public double getX() {return x;}public void setY(double y) {this.y = y;}public double getY() {return y;}public void setVisit(boolean isVisit) {this.isVisit = isVisit;}public boolean getVisit() {return isVisit;}public int getCluster() {return cluster;}public void setNoised(boolean isNoised) {this.isNoised = isNoised;}public void setCluster(int cluster) {this.cluster = cluster;}public boolean getNoised() {return this.isNoised;}@Overridepublic String toString() {return x+" "+y+" "+cluster+" "+(isNoised?1:0); }}2.DBScan.java算法实现类public class DBScan {private double radius;private int minPts;public DBScan(double radius,int minPts) {this.radius = radius;this.minPts = minPts;}public void process(ArrayList<Point> points) {int size = points.size();int idx = 0;int cluster = 1;while (idx<size) {Point p = points.get(idx++);//choose an unvisited pointif (!p.getVisit()) {p.setVisit(true);//set visitedArrayList<Point> adjacentPoints =getAdjacentPoints(p, points);//set the point which adjacent points less than minPts noisedif (adjacentPoints != null && adjacentPoints.size() < minPts) {p.setNoised(true);} else {p.setCluster(cluster);for (int i = 0; i < adjacentPoints.size(); i++) { Point adjacentPoint = adjacentPoints.get(i); //only check unvisited point, cause only unvisited have the chance to add new adjacent pointsif (!adjacentPoint.getVisit()) {adjacentPoint.setVisit(true);ArrayList<Point> adjacentAdjacentPoints = getAdjacentPoints(adjacentPoint, points);//add point which adjacent points not less than minPts noisedif (adjacentAdjacentPoints != null && adjacentAdjacentPoints.size() >= minPts) {adjacentPoints.addAll(adjacentAdjacentPoints);}}//add point which doest not belong to any clusterif (adjacentPoint.getCluster() == 0) {adjacentPoint.setCluster(cluster);//set point which marked noised before non-noisedif (adjacentPoint.getNoised()) {adjacentPoint.setNoised(false);}}}cluster++;}}}}private ArrayList<Point> getAdjacentPoints(Point centerPoint,ArrayList<Point> points) {ArrayList<Point> adjacentPoints = new ArrayList<Point>(); for (Point p:points) {//include centerPoint itselfdouble distance = centerPoint.getDistance(p);if (distance<=radius) {adjacentPoints.add(p);}}return adjacentPoints;}}3.Data.java 随机模拟产生数据public class Data {private static DecimalFormat df=(DecimalFormat) NumberFormat.getInstance();public static ArrayList<Point> generateSinData(int size) {ArrayList<Point> points = new ArrayList<Point>(size);Random rd = new Random(size);for (int i=0;i<size/2;i++) {double x = format(Math.PI / (size / 2) * (i + 1));double y = format(Math.sin(x)) ;points.add(new Point(x,y));}for (int i=0;i<size/2;i++) {double x = format(1.5 + Math.PI / (size/2) * (i+1)); double y = format(Math.cos(x));points.add(new Point(x,y));}return points;}public static ArrayList<Point> generateSpecialData() {ArrayList<Point> points = new ArrayList<Point>();points.add(new Point(2,2));points.add(new Point(3,1));points.add(new Point(3,4));points.add(new Point(3,14));points.add(new Point(5,3));points.add(new Point(8,3));points.add(new Point(8,6));points.add(new Point(9,8));points.add(new Point(10,4));points.add(new Point(10,7));points.add(new Point(10,10));points.add(new Point(10,14));points.add(new Point(11,13));points.add(new Point(12,7));points.add(new Point(12,15));points.add(new Point(14,7));points.add(new Point(14,9));points.add(new Point(14,15));points.add(new Point(15,8));return points;}public static void writeData(ArrayList<Point> points,String path) {try {BufferedWriter bw = new BufferedWriter(newFileWriter(path));for (Point point:points) {bw.write(point.toString()+"\n");}bw.close();} catch (IOException e) {e.printStackTrace();}}private static double format(double x) {return Double.valueOf(df.format(x));}}4.Client.java 运行聚类算法public class Client {public static void main(String[] args) {//ArrayList<Point> points = Data.generateSinData(200);//DBScan dbScan = new DBScan(0.6,4);ArrayList<Point> points = Data.generateSpecialData(); DBScan dbScan = new DBScan(3,3);dbScan.process(points);for (Point p:points) {System.out.println(p);}Data.writeData(points,"data.txt");}}五.实验结果六.实验小结和传统的K-Means算法相比,DBSCAN最大的不同就是不需要输入类别数k,当然它最大的优势是可以发现任意形状的聚类簇,而不是像K-Means,一般仅仅使用于凸的样本集聚类。