反转录说明书
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通用型一步法RT-PCR试剂盒说明书前言本试剂盒适用于对各种动、植物、病毒RNA进行PCR 检测。
用户可根据被分析基因,配合一对引物,或同时采用Taqman 荧光探针,先将提取的RNA反转录(reverse transcription).成cDNA,再经过聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction)技术对特异性片段进行扩增,进行电泳或实时荧光分析。
一步法RT-PCR可使RT及PCR过程在单管中完成,比分开进行RT及PCR更方便。
由于不需要在RT完成后打开反应管,尽可能地避免了样品间的相互污染。
规格20人份适用仪器适用于各种普通PCR仪器和实时荧光PCR仪器。
试剂盒组成试剂准备根据下表配制反应液:振荡混匀后,按每管 40 μl(可根据需要调整)分装,备用。
PCR扩增将均一化后的RNA提取样本10 μl加入各反应管,混匀、离心后,置普通PCR仪器或实时荧光PCR仪器上进行扩增及实时检测。
结果判断扩增产物可直接进行电泳检测;实时荧光检测可根据相应仪器的配套软件进行结果分析。
保存及有效期-20℃保存,有效期为6个月。
注意事项1. 开始检测前请仔细阅读本说明书全文。
2. 整个检测过程中,反应体系的配制、样本处理及加样、PCR扩增(荧光检测)应分区进行以避免污染。
3. 操作人员应戴口罩,经常更换一次性手套,以避免RNA酶的污染;实验中所用器具均应经过除RNA酶处理。
4. 试剂盒组成中的试剂使用前应充分融化并混匀。
5. 进行实时荧光分析时,应使用透光性能较好的一次性薄壁离心管;.荧光探针应避光保存,加入缓冲液中后,应尽快进行扩增。
6. 注意适当处理检测中遗留的样品、扩增产物及可能被污染的试剂。
生产企业:上海蓝创生物科技发展有限公司。
使用试剂盒时所有的试剂要放置在冰上转录反应步骤和孵育1.解冻冷冻的试剂把RNA聚合酶混合物放置在冰上,它在甘油中保存,没有被保存在-20。
vortex10×reaction buffer和2×NTP/CAP至完全溶解,一旦解冻,反应过程中把2×NTP/CAP 放在冰上,10×reaction buffer保存在室温,所有的试剂在打开之前都应该短暂的微微离心,以防丢失或污染到离心管边缘的物质。
2.室温下转录反应如果反应在冰上进行,10×reaction buffer中的亚精胺可以与模板中的DNA共沉淀,离心管中加入水和核苷酸后再加入10×reaction buffer。
以下是一个20ul的反应体系,可按需要放大或缩小。
当RNA长度为300base-5kb时采用以下反应体系(用0.1-0.2ug PCR产物模板或0-1ug线性质粒模板)对于更长或更短的转录,参考20页的“Optimizing yield of long transcripts’’和“Optimizing yield of short transcripts”部分。
当合成转录的长度大于5或6KB时,限制GTP生成率,会导致产量降低、过早终止转录。
为了避免这种情况,可能需要补充额外的GTP支持反应。
下面是添加特定体积的GTP对普通转录反应的影响。
(对于T7和T3试剂盒,提供的GTP为30mM。
对于SP6,为20mM.)应该添加多少额外的GTP?对于5-8KB的长度,我们建议最初测试加入1ul的GTP,对于更长的模板应该试试滴定额外的GTP确定所需的最小值。
添加GTP将减少转录合成加帽的比例,但将引起产量升高。
加帽转录的比例与反应中GTP中CAP的模拟物的比率成正比。
RNA产量与良好的加帽效率之间的平衡在网织红细胞溶解物中,我们测试了GTP不同比例的CAP模拟物对转录反应的RNA产量和产生RNA的翻译效率的影响。
提取组织RNA,反转录,qPCR流程图⼀、Total RNA的提取:1.取出样本,放⼊灭过菌的研钵中,倒⼊液氮,研磨,整个过程要始终保持有液氮,10min左右,研磨充分后加⼊1.5ml的EP管,加⼊1ml Trizol,充分匀浆。
(另⼀种,加⼊trizol会冻起来,就⼀直研磨,直到最后化成液体。
)2.室温静置10min,12000g,4度,5min,上清转移到新的1.5ml的EP管中3.加⼊1/4体积的氯仿,振荡混匀,室温静置15min,12000g,4度,15min,上清转移⾄新管;4.加⼊等体积的异丙醇,轻轻摇匀,室温静置10min,12000g,4度,10min5.弃上清,留沉淀,加⼊1ml的75%⼄醇清洗沉淀,7500g,4度,5min,弃上清保留沉淀。
重复三次6.弃上清留沉淀,⾃然风⼲(5~10min),加⼊32ul DEPC处理过的⽔,测OD260/280的值,根据结果调整⾄1µg/µl=1000ng/µl,⽴即进⾏反转录,剩余的RNA标好号存放在-80℃下。
附:1OD260=40µg/ml⽤样本跑电泳,确定RNA的完整性,注意在这之前把胶配好。
(可⽆)可见明显的两条带,并且28S是18S亮度的两倍,还有下边⼀条不太明显的5SRNA的条带。
证明RNA完整⽆降解。
⼆、反转录:说明书:10 µl 反应体系可最⼤使⽤500 ng 的Total RNA。
20/1µg(以前⽤的40,下次⽤20)20ul的体系:先把buffer和RNase Free dH20和enzyme 配成mix 5×PrimeScript Buffer(for Real Time):4µlPrimeScript RT Enzyme Mix I :1µlOligo dT Primer(50 µM):1µlRandom 6 mers(100 µM):1µl总RNA :1µl(1µg/µl)RNase Free dH2O :12µl反转录反应条件如下:37℃15 min (反转录反应)85℃5 sec(反转录酶的失活反应)4℃-20℃分装保存(尽量不要反复冻融,avoid freeze-thaw cycles)三、内参检测β-actin 50µl体系PCR 反应条件:扩增1 kb 的DNA ⽚段的PCR 反应条件如下:预变性:95℃,3min98℃10 sec.55℃30 sec.(下次60℃,去掉⾮特异性)72℃30 s(对于80bp的内参来说是不是可以省去)72℃5min.4℃保存电泳:2%琼脂糖凝胶,125V,15min,注意换成20bp的marker,不要加太多。
RACE cDNA反转录说明书1.准备cDNA合成反应液2.0 ul 5×First-Strand Buffer1.0 ul DTT (20uM)1.0 ul dNTP Mix (10mM)总共体积:4ul2.准备以下试剂:5’-RACE-cDNA: 1.0—2.75ul RNA, 1.0ul 5’-CDS Primer A3’-RACE-cDNA: 1.0—3.75ul RNA, 1.0ul 5’-CDS Primer AControl-cDNA: 只需要1ul mouse heart total RNA(1ug/ul)3.加入H2O于上一步反应液至5’-RACE为3.75ul,3’-RACE为4.75ul,然后轻轻吸打混匀。
4.放入PCR仪反应:72℃3min,42℃2min然后14000g离心10s。
5.对于5’-RACE-cDNA的合成,加入1ul SMARTerⅡA oligo至4.75ul。
6.配混合液: 4.0ul Buffer mix from step 10.25ul RNase inhibitor (40U/ul)1.0ul SMARTScribe reverse transcriptase (100U)总体积:5.25ul7.将第6步混合液加入第2步微离心管中,使总体积达到10ul。
用枪轻轻吸打混匀。
8.42℃反应90min,然后70℃反应10min。
9.用Tricine-EDTA buffer稀释反应产物:如果:起始RNA<200ng,加入20ul;起始RNA>200ng,加入100ul;Poly A+ RNA,加入250ul。
10. 将稀释好的cDNA模板保存于-20℃,最长时间达3个月。
takara反转录试剂盒说明书说明书一、产品简介takara反转录试剂盒是一种高效、可靠的反转录试剂盒,适用于转录RNA为cDNA的实验操作。
本试剂盒由takara公司制造,经过严格的质量控制,确保产品的稳定性和可靠性。
二、试剂盒组成本试剂盒包含以下组分:1. 反转录酶:高效反转录酶,能在广泛的实验条件下进行反转录反应。
2. 基质:提供反应所需的核酸和其他辅助物质。
3. 标记物:用于标记反转录产物的荧光染料或放射性同位素。
4. 缓冲液:维持试剂盒中酶的活性,调节反应条件的缓冲体系。
5. 控制样品:用于检验试剂盒的反应效果和稳定性。
三、实验操作1. 准备工作在进行实验前,请准备所需的实验仪器和试剂,确保实验环境的清洁和无菌,避免污染对实验结果的影响。
2. RNA提取使用适当的方法提取目标RNA样本,并在提取过程中避免RNA的降解。
3. 反转录反应将提取的RNA样本与反转录试剂盒中的反转录酶、基质和缓冲液按推荐比例混合,并在适当的温度下进行反应。
反应时间根据样本的RNA含量和实验要求确定。
4. 停止反应通过停止反应来终止反转录反应,一般使用热敏感性酶来达到这个目的。
5. 产物处理反转录产物可以直接用于下游实验,如实时定量PCR、聚合酶链式反应等,也可以进行储存和后续处理。
四、实验结果解读根据试剂盒的使用目的和实验设计,对反转录产物进行相应的分析和解读。
常见的分析方法有凝胶电泳、实时定量PCR和测序等。
根据实验结果,可以得到RNA的表达情况、差异表达基因等相关信息。
五、注意事项1. 试剂保存:请按照试剂盒上的说明保存试剂,避免暴露在高温、冻融循环和光照等不利条件下。
2. 操作规范:请按照本说明书中提供的实验操作步骤进行操作,避免实验误差对结果的影响。
3. 质量控制:在每次实验中,请使用合适的阳性和阴性对照样品,以确保实验结果的准确性和可靠性。
4. 废弃物处理:请将使用过的试剂和实验废弃物按照相关规定进行处理,避免对环境造成污染。
产品目录号:M1701 M1705M-MLV 反转录酶简明操作步骤注意:这是节选操作步骤,详细英文说明书见 /tbs/9pim170/9pim170.html 本简明操作步骤电子版见cDNA 第一链合成操作步骤:请使用者准备:z 重组RNasin®核酸酶抑制剂 (目录号N2511) z dATP ,10mM(目录号U1201,100mM) z dCTP ,10mM(目录号U1221,100mM) z dGTP , 10mM(目录号U1211,100mM) z dTTP , 10mM(目录号U1231,100mM) z 无核酸酶的水(目录号P1193)1. 在一支无核酸酶污染的小离心管中加入:RNA2ug引物 1ug 无核酸酶水补齐至 15ul加热离心管到70℃,5分钟,这样可以打开模板的二级结构。
然后立即在冰上冷却,以避免重新形成二级结构。
短暂离心,使溶液归于管底。
2. 按以下顺序在复性的引物/模板管(即以上小离心管)中加入下列组分:注意:不要改变引物与mRNA 的比例。
M-MLV 5XReaction Buffer 5ul dATP ,10mM 1.25ul dCTP ,10mM 1.25ul dGTP , 10mM 1.25ul dTTP , 10mM 1.25ul 重组RNasin®核酸酶抑制剂 25units M-MLV 反转录酶 200units 加无核酸酶水补齐至 25ul3. 轻弹离心管混合溶液。
若使用随机引物,在37℃孵育60分钟进行反转录反应;若使用其它引物(Oligo (dT)或基因特异引物),则在42℃孵育60分钟进行反应。
4. 第二条链合成可使用您选择的操作方法,也可参考: Sambrook, J., Fritsch, E.F. and Maniatis, T. (1989) In: Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, 8.64.注意:M-MLV 反转录酶缓存液与许多下游应用相容。
b、按以下条件进行PCR反应94℃3m i n94℃30s25-35循环***37℃-65℃**30s72℃****45s-7min72℃5min注:*RT产物可增加至5μl 。
**退火温度根据引物Tm值调整,一般为Tm-5℃。
Control引物退火温度为55℃。
*** 当实验样品RNA特别稀少时,可将循环数增加至40-45循环。
**** 延伸时间根据PCR产物大小确定,一般1kb/min 。
Control引物延伸时间45s。
c、反应结束后,取3-5 μl PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,确认PCR反应产物。
如果此PCR产物需用于以后实验,应将PCR产物冷冻保存。
RNA control反应时,退火温度55度,30个循环,扩增片段大小为500bp。
使用提示1. RNA模板可以采用总RNA或mRNA,建议使用Biozol(BSC51M1)制备高质量RNA;2. RT实验应避免RNase污染,可采用以下措施:1)因人的皮肤表面和唾液都有RNase,因此实验中应戴一次性手套和口罩;2) RT实验应使用专门的仪器和耗材,建议在专门区域操作RNA;3) RT实验相关耗材应使用干热灭菌(180℃,60分钟)或用0.1% DEPC(焦碳酸二乙酯)水溶液在37℃处理12小时后在121℃高压灭菌30分钟;3. AMV逆转录酶,DNA聚合酶和RNase抑制剂在取用之前应离心后再吸取,吸取时动作要慢,使用后应尽快放回-20℃;4. dNTP应避免反复冻融以免失效;5. 引物的选择可根据具体情况,Oligo-dT适用于具有PolyA尾的RNA(一般是真核生物的mRNA),Random Hexamer Primer适用于所有RNA(包括mRNA,rRNA,tRNA等),尤其适用于有复杂二级结构的RNA,特异性引物适用于已知模板序列的RNA;6. PCR反应中MgCl2浓度可依据不同条件进行调整,当目的片段长度大于2kb时,我们建议增加MgCl2浓度,以0.5mM间隔梯度增加。
RT-PCR实验步骤一.实验器具:1.移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2.5μl2.吸头:1ml、200μl、20μl3.匀浆管:5ml4.EP管:1.5ml、500μl、200μl5.试剂瓶:棕色试剂瓶(广口,放75%乙醇)6.量筒:100ml7.容量瓶:1000ml8.试管架:5ml、1.5ml、20μl9.铝制饭盒:1-2个10.大瓷缸:1个11.锡泊纸:一卷12.卷纸:2卷13.三角烧瓶:带盖,稍大二.实验器具处理1.塑料制品:(包括枪头、EP管、匀浆管等)先将DEPC水从容量瓶中倒入瓷缸中,将塑料制品逐个浸泡其中(注意:小枪头要充分浸泡,必要时需要针筒打入DEPC水),过夜后取出(注意:DEPC水很难自然晾干,所以建议先将刚取出的DEPC物品甩干,枪头装入枪头盒后甩干,EP管和匀浆管装入饭盒后甩干,然后在37度孵箱烘干)。
高压后烤干备用。
如果DEPC处理过的物品时间已超过一个星期,再次使用前应再次高压。
2.玻璃制品:泡酸过夜,冲洗干净,先泡1‰DEPC过夜,再蒙锡纸烤干备用。
3.匀浆器:(包括剪刀、镊子)先洗净后,超声消毒即可(不需要泡DEPC)。
三.试剂配制1.DEPC水:吸出1ml DEPC放在1000ml容量瓶中加双蒸水定容至1000ml,配成1‰DEPC水,并充分振荡混匀备用。
2.75%乙醇:用无水乙醇+DEPC水配,然后放-20℃保存(DEPC水需先高压,高压时注意:1.装DEPC水的瓶子在盖子和瓶之间要放上线头;2.高压时间在40-45分钟,所以水要适当多加一点;3.高压结束后,不要强行放气,要让压力自然下降,不然水会喷出)。
3.异丙醇:放入棕色瓶中。
4.氯仿:放入棕色瓶中。
5.琼脂糖四.缓冲液配制1.电泳缓冲液(5×TBE贮存液):Tris 54g、硼酸 27.5g、0.5M EDTA 20ml pH8.0、加蒸溜水至1000ml。
使用时,将5×TBE稀释10倍成0.5×TBE就可以在电泳时使用(工作浓度) 2.上样缓冲液(6×缓冲液,4℃保存):0.25%溴酚蓝、0.25%二甲苯青FF、30%甘油五.琼脂糖凝胶配制1.1.0%:1.0g琼脂糖+100ml电泳缓冲液,微波炉加热至沸腾(如果首次煮胶,一定要煮透,以不出现泡沫为标志),熔化的琼脂物冷却至60℃时加入10mg/ml溴化乙锭2.5μl,充分混匀,将温热的凝胶倒入已置好梳子的胶膜中,在室温下放置30-45min(可以放入4度冰箱加快琼脂糖凝固)后现进行电泳。
逆转录技术手册本文档中的信息如有更改,恕不另行通知。
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目录逆转录 | iii仅供科学研究使用1 逆转录 (1)1.1 发现 (1)1.2 发展 (1)1.3 应用...........................................................22 建立逆转录反应 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32.1 步骤 (3)2.1.1 RNA 模板制备 (3)2.1.2 基因组DNA 去除 (6)2.1.3 选择引物 (6)2.1.4 进行逆转录 (8)2.1.5 基因组DNA 去除 (9)2.2 常见逆转录酶及性质 (9)2.2.1 DNA 聚合酶活性 (9)2.2.2 RNase H 活性 (10)2.2.3 热稳定性 (11)2.2.4 持续合成能力 (12)2.2.5 保真度 (14)2.2.6 末端转移酶(TdT )活性 (14)2.3 常见问题及解决建议 (15)2.3.1 RT -(q)PCR 扩增量低或未扩增 (15)2.3.2 RT -(q)PCR 非特异性扩增 (16)2.3.3 cDNA 截短 (17)2.3.4 cDNA pool 覆盖率低 (18)2.3.5 cDNA 测序错误 (19)3 应用 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 203.1 逆转录聚合酶链式反应(RT -PCR ). . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 203.1.1 RT -PCR (20)3.1.2 定量RT -PCR (27)3.1.3 直接RT -qPCR (28)3 .2 cDNA克隆和文库构建 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .293.3 cDNA末端快速扩增 (32)3.4 基因表达芯片 (34)3.5 RNA测序 (36)3.6 逆转录环介导等温扩增(RT-LAMP) (38)iv | 逆转录仅供科学研究使用1 逆转录本章内容涵盖逆转录基础、cDNA合成、酶选择、常见问题处理技巧以及cDNA在分子生物学研究中的应用,是适用于各种层级研究人员的学习资源。
行业文档TaKaRa Code:DRR014APrimeScript™ RT-PCR Kit(50次量)目录内容页码●制品说明 1●制品内容 1●保 存 2●原 理 2●试剂盒特点 3●RNA样品制备 3●使用注意 4●反转录引物的选择 5●实验操作 5●实验例 7 ●Q&A8●制品说明PCR(Polymerase Chain Reaction;聚合酶链式反应)是一种体外扩增DNA的简单而有效的方法。
虽然原理上PCR法是扩增DNA,RNA不能直接被扩增,但是经过反转录酶的作用把RNA反转录成cDNA 后,PCR法便可应用于RNA的解析了。
迄今为止,此方法已广泛应用于RNA的构造解析、cDNA的克隆及RNA水平上的表达解析等多种领域。
PrimeScript™ RT-PCR Kit是具有良好的延伸性能与高扩增效率的2 Step RT-PCR试剂盒。
反转录反应使用了TaKaRa独自开发的新型反转录酶PrimeScript™ RTase;PCR反应使用了扩增性能良好的Hot Start 型DNA聚合酶TaKaRa Ex Taq TM HS。
本试剂盒具有以下优点:1.进行高效的RT-PCR扩增。
2.在标准的RNA反转录反应温度(42℃)下,便可使具有复杂结构的RNA进行良好的延伸,可以避免RNA在高温条件下的降解。
3.能有效抑制非特异性的PCR扩增。
4.使用本试剂盒扩增得到的目的产物3′端附有一个A碱基,可以直接克隆于T-Vector中。
本试剂盒含有反转录反应及PCR扩增反应所需的全部试剂。
●制品内容(50次量*1)1.PrimeScript™ RTase(for 2 Step)2.5×PrimeScript™ Buffer3.RNase Inhibitor(40 U/μl)4.dNTP Mixture(10 mM each)5.Oligo dT Primer(2.5 μM)6.Random 6 mers(20 μM)7.TaKaRa Ex Taq TM HS(5 U/μl)8.10×PCR BufferⅡ9.Control F-1 Primer*2(20 μM)10.Control R-1 Primer*3(20 μM)11.Positive Control RNA(2×105 copies/μl)12. RNase Free dH2O25 μl 200 μl 25 μl 150 μl 50 μl 50 μl 25 μl 250 μl 10 μl 10 μl 20 μl 1 ml*1 反转录反应20 μl 、PCR反应50 μl体系时可使用50次。
mRNA反转录操作手册
1、在操作过程中应避免mRNA污染,防止mRNA降解或实验中的交叉污染,建议在专门的区域进行mRNA操作,使用专门的仪器和耗材,操作人员带口罩和一次性手套并经常更换手套。
2、实验尽量使用一次性塑料器皿,若使用玻璃器皿,应使用0.1%DEPC(焦碳酸二乙酯)水溶液在37℃处理12小时,并在120℃下高压灭菌30分钟后使用,或者将玻璃器皿在180℃下干热灭菌60分钟后使用。
实验中用到的无菌水应使用0.1%的DEPC处理后进行高压灭菌。
3、本试剂盒中的所有试剂使用前请上下颠倒轻轻混匀,尽量避免起泡,并经短暂离心后使用。
所涉及的酶类使用后应尽快放回20℃,避免反复冻融。
4、若起始mRNA的量小于50ng,建议加入mRNA酶抑制剂。
BeyoRT M-MuLV反转录酶产品编号产品名称包装M-MuLV反转录酶 2000U D7153 BeyoRT产品简介:¾BeyoRT M-MuLV反转录酶(BeyoRT M-MuLV Reverse Transcriptase)是一种经过改造和优化的M-MuLV反转录酶。
和普通的M-MuLV反转录酶相同,BeyoRT M-MuLV反转录酶也是一种依赖于RNA或DNA模板的DNA聚合酶,可以以RNA或DNA为模板在引物存在的情况下完成互补DNA链的合成;同时具有Ribonuclease H (RNase H)酶活性,可以选择性剪切RNA和DNA杂合双链中的RNA,但不剪切单链RNA或双链RNA。
¾特点:BeyoRT M-MuLV反转录酶可以合成长达13kb的cDNA,而普通的M-MuLV反转录酶仅能合成长达9kb的cDNA;BeyoRT M-MuLV反转录酶的最适反应温度为42℃并且在50℃时仍然有很高活性,可以避免普通的M-MuLV反转录酶在37℃反应时的一些不足。
¾用途:BeyoRT M-MuLV反转录酶常用于在获得总RNA或mRNA后cDNA第一条链的合成。
BeyoRT M-MuLV反转录酶合成的cDNA第一条链后续可以用于PCR、real-time PCR、cDNA第二条链的合成等。
BeyoRT M-MuLV反转录酶也可以用于DNA探针的标记,以及通过引物延伸(primer extention)来分析RNA。
¾来源:本BeyoRT M-MuLV反转录酶由大肠杆菌表达,表达的基因为经过突变优化的编码Moloney Murine Leukemia Virus reverse transcriptase的pol基因片断。
¾活性定义:One unit of the enzyme incorporates 1 nmol of dTMP into a polynucleotide fraction in 10 min at 37℃. Enzyme activity is assayed in 50 mM Tris-HCl (pH 8.3), 6 mM MgCl2, 10 mM DTT, 40 mM KCl, 0.5 mM dTTP, 0.4 MBq/ml [3H]-dTTP,0.4 mM polyA•oligo(dT)12-18.¾纯度:不含DNA内切酶、外切酶和磷酸酯酶,不含BeyoRT M-MuLV反转录酶本身含有的RNase H酶活力以外的RNA酶,满足常规反转录合成cDNA第一条链等的需要。