聚丙烯酰胺凝胶电泳凝胶的配方
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聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳法1.仪器装置通常由稳流电泳仪和圆盘或平板电泳槽组成。
其电泳室有上、下两槽,每个槽中都有固定的铂电极,铂电极经隔离电线接于电泳仪稳流挡上。
2.试剂(1)溶液A 取三羟甲基氨基甲烷36.6g,四甲基乙二胺0.23ml,加0.1mol/L盐酸溶液48ml,再加水溶解并稀释至100ml,置棕色瓶内,在冰箱中保存。
(2)溶液B 取丙烯酰胺30.0g、次甲基双丙烯酰胺0.74g,加水溶解并稀释至100ml,滤过,置棕色瓶内,在冰箱中保存。
(3)电极缓冲液(pH8.3) 取三羟甲基氨基甲烷6g、甘氨酸28.8g,加水溶解并稀释至1000ml,置冰箱中保存,用前稀释10倍。
(4)溴酚蓝指示液取溴酚蓝0.1g,加0.05mol/L氢氧化钠溶液3.0ml 与90%乙醇5ml,微热使溶解,加20%乙醇制成250ml。
(5)染色液取0.25%(W/V)考马斯亮蓝G<[250]>溶液2.5ml,加12.5%(W/V)三氯醋酸溶液至10ml。
(6)稀染色液取上述染色液2ml,加12.5%(W/V)三氯醋酸溶液至10ml。
(7)脱色液 7%醋酸溶液。
3.操作(1)制胶取溶液A2ml,溶液B5.4ml,加尿素2.9g使溶解,再加水4ml,混匀,抽气赶去溶液中气泡,加0.56%过硫酸铵溶液2ml,混匀制成胶液,立即用装有长针头的注射器或细滴管将胶液沿管壁加至底端有橡皮塞的小玻璃管(10×0.5cm)中,使胶层高度达6~7cm, 然后徐徐滴加水少量,使覆盖胶面,管底气泡必须赶走,静置约30分钟,待出现明显界面时即聚合完毕,吸去水层。
(2)标准品溶液及供试品溶液的制备(3)电泳将已制好的凝胶玻璃管装入圆盘电泳槽内,每管加供试品或标准品溶液50~100μl,为防止扩散可加甘油或40%蔗糖溶液1~2滴及0.04%溴酚蓝指示液1滴,也可直接在上槽缓冲液中加0.04%溴酚蓝指示液数滴,玻璃管的上部用电极缓冲液充满,上端接负极、下端接正极。
6 %变性聚丙烯酰胺凝胶电泳实验试剂及配制:a, 40 %丙烯酰胺单体凝胶贮存液。
丙烯酰胺38 g,甲叉双丙烯酰胺 2 g,加双蒸水定容至 100mL,过滤,贮存于棕色瓶中。
b,变性剂。
1 M NaOH 1 mL,甲酰胺 95 mL,溴酚蓝 0. 05 g,二甲苯青 0. 05 g,加双蒸水定容至100 mL。
C, 固定液。
100 mL 冰醋酸溶于双蒸水定容至1 000 mL。
d, 银染液。
硝酸银 1 g, 37 甲醛 1. 5 mL,加双蒸水定容至1000 mL。
f, 显影液。
无水碳酸钠 30 g, 37 甲醛 1. 5mL, 10 mg /mL 硫代硫酸钠 200 μL,加双蒸水定容至 1 000 mL。
DNA 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的操作流程6 %变性凝胶的制备:40 %的凝胶贮存液 11. 2 mL,尿素36.36g, 5 × TBE 15mL,加双蒸水定容至 75 mL。
预冷至 4 ℃后,加入500 μL 10 过硫酸铵和 50 μL TEMD 混合均匀,灌胶。
灌胶完毕,插入样品梳,在室温下聚合 30 ~60 min。
聚合完全后,梳齿下可见二条折光线。
电泳:安装电泳装置,在电泳槽中加入1 × TBE缓冲液,使缓冲液覆盖样品孔。
拔出样品梳,用移液器吸取适量缓冲液冲洗样品孔。
打开变压器,恒定功率 60 W 预电泳 15 ~30 min。
预电泳结束后,用移液器将 DNA 样品小心注入样品孔中( 加样量为 3 ~ 5 μL) ,电泳直至带型分开。
固定:关闭电源,卸下玻璃板,剥离玻璃板,将胶板置于固定液中固定 30 min,直到指示剂颜色褪去。
漂洗:将胶板转移到双蒸水中漂洗三遍,每次 2 ~ 3 min。
染色:转移胶板至染色液中,在摇床上摇动染色 30 ~ 40 min。
显影:将胶板在双蒸水中漂洗 5 ~ 10 s 后立即放入预冷为 4 ℃~ 10 ℃的显影液中,摇动显影直到带型完全出现。
实验四蛋白质的聚丙烯酰胺凝胶电泳最广泛使用的不连续缓冲系统最早是由Ornstein(1964) 和Davis(1964) 设计的, 样品和浓缩胶中含Tris-HCl(pH 6.8), 上下槽缓冲液含Tris-甘氨酸(pH 8.3), 分离胶中含Tris-HCl(pH 8.8)。
系统中所有组分都含有0.1% 的SDS(Laemmli, 1970)。
样品和浓缩胶中的氯离子形成移动界面的先导边界而甘氨酸分子则组成尾随边界,在移动界面的两边界之间是一电导较低而电位滴度较陡的区域, 它推动样品中的蛋白质前移并在分离胶前沿积聚。
此处pH值较高,有利于甘氨酸的离子化,所形成的甘氨酸离子穿过堆集的蛋白质并紧随氯离子之后,沿分离胶泳动。
从移动界面中解脱后,SDS-蛋白质复合物成一电位和pH值均匀的区带泳动穿过分离胶,并被筛分而依各自的大小得到分离。
SDS与蛋白质结合后引起蛋白质构象的改变。
SDS-蛋白质复合物的流体力学和光学性质表明,它们在水溶液中的形状,近似于雪茄烟形状的长椭园棒,不同蛋白质的SDS复合物的短轴长度都一样(约为18Å,即1.8nm),而长轴则随蛋白质分子量成正比地变化。
这样的SDS-蛋白质复合物,在凝胶电泳中的迁移率,不再受蛋白质原有电荷和形状的影响,而只是椭园棒的长度也就是蛋白质分子量的函数。
由于SDS和巯基乙醇的作用,蛋白质完全变性和解聚,解离成亚基或单个肽链,因此测定的结果只是亚基或单条肽链的分子量。
SDS聚丙烯酰胺凝胶的有效分离笵围取决于用于灌胶的聚丙烯酰胺的浓度和交联度。
在没有交联剂的情况下聚合的丙烯酰胺形成毫无价值的粘稠溶液,而经双丙烯酰胺交联后凝胶的刚性和抗张强度都有所增加,并形成SDS蛋白质复合物必须通过的小孔。
这些小孔的孔径随“双丙烯酰胺~丙烯酰胺”比率的增加而变小,比率接近1:20 时孔径达到最小值。
SDS聚丙烯酰胺凝胶大多按“双丙烯酰胺~丙烯酰胺”为1:29 配制,试验表明它能分离大小相差只有3% 的蛋白质。
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
一、材料准备1M Tris-HCl, pH8.8、10% SDS、Ammonnium persulfate (过硫酸铵)和1M Tris-HCl, pH6.8室温保存。
30% Acr-Bis (29:1)和TEMED 4℃避光保存。
过硫酸铵配制成10%溶液后,分装成小管-20℃保存,通常半年内有效。
1.10%十二烷基硫酸钠(SDS):阴离子去污剂,可与蛋白质结合,形成SDS-蛋白质复合物。
由于SDS带有大量负电荷,当与蛋白质形成复合物后好比蛋白质穿上带负电的“外衣”,蛋白质本身带有的电荷则被掩盖,即消除了蛋白质分子之间电荷差异。
作用有四:去蛋白质电荷、解离蛋白质之间的氢键、取消蛋白分子内的疏水作用、去多肽折叠。
配制方法:10g SDS,用双蒸水溶解并定容至100ml,室温保存。
2.10%过硫酸铵(Ap):引发剂。
能产生自由氧基,使丙烯酰胺聚合。
配制方法:0.1 g过硫酸铵溶解于 1ml双蒸水中。
过硫酸铵会缓慢分解,应新鲜配制。
过硫酸铵配制成10%溶液后,应当-20℃保存。
同时应尽量减少室温存放时间,以防失效。
3.N、N、N’、N’-四甲基乙二胺(TEMED):促凝作用,加速聚丙烯酰胺的凝固,其碱基催化AP产生氧自由基,激活单体形成自由基,发生聚合。
TEMED易挥发,使用后请盖紧瓶盖。
另外凝胶凝聚的速度和温度及光照关系密切,可通过适当调节TEMED的用量,控制在不同的室内环境下凝胶凝聚的速度。
配制方法:原液使用。
应使用电泳级TEMED。
4.30%丙烯酰胺凝胶贮液(Arc-Bis贮液) :含有29的丙烯酰胺和1的甲叉基聚丙烯酰胺。
丙烯酰胺单体(Arc)在交联剂作用下形成聚丙烯酰胺。
N,N’-甲叉双丙烯酰胺(Bis),交联剂。
丙烯酰胺与为蛋白质电泳提供载体,其凝固的好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境密切相关。
聚丙烯酰胺凝胶配制方法聚丙烯酰胺凝胶配制方法5×tbe(组份浓度:5×tbe,ph8.3;配制量:1l):称取53.9gtris,27.5g硼酸,量取20ml0.5mol/ledta(ph8.0),置于1l烧杯中;加入约800ml超纯水,充分搅拌溶解;加超纯水将溶液定容至1l;室温保存。
10%过硫酸铵(组份浓度:10%(w/v)过硫酸铵;酿制量:10ml):称取1g过硫酸铵,放在10~50ml烧杯中;重新加入约8ml超纯水,烘烤熔化;提超纯水将溶液定容至10ml;4℃留存(留存时间为2周左右,少于期限过硫酸铵将丧失催化作用)。
30%丙烯酰胺(组份浓度:30%(w/v)丙烯酰胺;配制量:1l):称取290g丙烯酰胺,10gn,n'-亚甲基双丙烯酰胺,置于1l烧杯中;加入约600ml超纯水,水浴加热至37℃,充分搅拌至溶解;加超纯水将溶液定容至1l,用0.45μm滤膜过滤除去杂质;并检测该溶液ph值应不大于7;棕色瓶4℃保存。
0.1%agno(0.1%(w/v)agno3;酿制量:1l):称取1gagno3,3组份浓度:放在1l烧杯中;重新加入约800ml超纯水,;提超纯水将溶液定容至1l;棕色瓶室温留存。
显色液(组份浓度:2%(w/v)naoh,0.04%(w/v)na2co3,0.4%(w/v)37%甲醛;配制量:1l):称取20gnaoh,0.4gna2co3,置于1l烧杯中;加入约800ml超纯水,充分搅拌溶解;加4ml37%甲醛溶液,加超纯水将溶液定容至1l;室温保存。
10%冰乙酸(组份浓度:10%冰乙酸;酿制量:1l):量挑100ml冰乙酸,放在1l烧杯中;重新加入约800ml超纯水,烘烤搅匀;提超纯水将溶液定容至1l;室温留存。
2.2.6电泳检测2.2.6.1玻璃板清洗首先用去污粉将电泳用玻璃板、胶垫、梳子等反反复复冲洗;然后用ⅲ级蒸馏水冲洗2~3次,直到玻璃板表面发生光滑水膜,既不T4300水滴,也未成股泣不成声;再用超纯水冲洗1次,晒干;最后用无水乙醇冲洗,晒干水泵[74]。
SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳实验目的:测定蛋白质亚基的分子量及纯度实验原理:在样品介质和聚丙烯酰胺凝胶中加入离子去污剂和强还原剂后,蛋白质亚基的点泳迁移率主要取决于亚及分子量的大小,而电荷因素可以被忽略。
当蛋白质的分子量在15KD到200KD之间时,电泳迁移率与分子量的对数呈线性关系,可以用来测定蛋白质亚基的分子量。
基本过程:制胶、电泳、检测试剂:(储液由专业人员配置)30%丙烯酰胺单体储液、10%过硫酸铵、TEMED、1.5mol/L Tris-HCl, pH8.8、1.0mol/L Tris-HCl, pH6.8、10%SDS、10XTris-甘氨酸系统的电泳缓冲液、2Xloading buffer、水饱和正丁醇器材:灌胶支架、玻璃板、梳子、电源、加热器、电泳槽、扫描仪实验操作程序:1.安装灌胶模具,依照说明书进行2.按照配方配置一定量(7cm模具配置1mm厚的胶配置5ml)的分离胶溶液和浓缩胶溶液(2ml),过硫酸铵和TEMED在用前加入。
3.分离胶溶液充分混匀后从一侧加入灌胶模具,上方留约1.5-2cm用于加浓缩胶,小心的在分离胶的表面加一层水饱和正丁醇(或水饱和的异丙醇、水),封住胶面,以促使聚合并保持胶面平整。
4.室温放置40分钟到1小时后,可以看到一个界面,去掉上层覆盖液,用浓缩胶缓冲液淋洗胶面,然后灌制浓缩胶,并插入与模具大小相同,凝胶厚度相当的梳子。
5.静止放置40-60分钟使凝胶聚合,电泳液清洗样品孔。
6.制备好的蛋白质样品用2Xloading buffer 1:1混合,与分子量marker 一起100℃煮3-5min, 12000rpm离心5-10min,(7cm模具、1mm厚度、10孔、考染上样量30ug)7.加入下槽液,把夹有凝胶的玻板转移到电泳槽,加入上槽液,上样。
8.连接电源,5-10mA/胶开始电泳,待溴酚蓝前沿到达分离胶后加大电流到10-15mA/胶,9.溴酚蓝前沿到达玻璃板底部时停止电泳,取出凝胶,做好标记,准备染色。
分子生物学实验报告实验名称:SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳班级:生工xxx姓名:xxx同组人:xxx学号:xxxx日期:xxxxSDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳1 引言SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)是目前分离蛋白质亚基并测定其分子量的常用方法,为检测电泳后凝胶中的蛋白质,一般使用考马斯亮蓝(CBB)染色[1]。
本次实验的目的在于学习聚丙烯酰胺凝胶电泳的原理,并掌握聚丙烯酰胺凝胶垂直板电泳分离蛋白质的操作技术。
2 材料和方法2.1实验原理2.1.1 聚丙烯酰胺凝胶的性能及制备原理2.1.1.1 性能聚丙烯酰胺凝胶的机械性能好,有弹性,透明,相对地化学稳定,对pH和温度变化比较稳定,在很多溶剂中不溶,是非离子型的,没有吸附和电渗作用。
通过改变浓度和交联度,可以控制孔径在广泛的范围内变动,并且制备凝胶的重复性好。
由于纯度高和不溶性,因此还适于少量样品的制备,不致污染样品。
2.1.1.2 制备原理聚丙烯酰胺凝胶是用丙烯酰胺(Acr)和交联剂甲叉双丙烯酰胺(Bis)在催化剂的作用下聚合而成。
聚丙烯酰胺凝胶聚合的催化系统有化学聚合和光聚合两种。
本实验是用化学聚合。
化学聚合的催化剂通常多采用过硫酸铵(AP)或过硫酸钾,此外还需要一种脂肪族叔胺作加速剂,最有效的加速剂是N,N,N’,N’-四甲基乙二胺(TEMED)。
在叔胺的催化下,由过硫酸铵形成氧的自由基,后者又使单体形成自由基,从而引发聚合反应。
叔胺要处于自由碱基状态下才有效,所以在低pH时,常会延长聚合时间;分子氧阻止链的延长,妨碍聚合作用;一些金属也能抑制聚合;冷却可以使聚合速度变慢。
通常控制这些因素使聚合在1小时内完成,以便使凝胶的性质稳定。
聚丙烯酰胺凝胶电泳和SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳有两种系统,即只有分离胶的连续系统和有浓缩胶与分离胶的不连续系统,不连续系统中最典型、国内外均广泛使用的是著名的Ornstein-Davis高pH碱性不连续系统,其浓缩胶丙烯酰胺浓度为4%,pH = 6.8,分离胶的丙烯酰胺浓度为12.5%,pH = 8.8。
5×TBE(组份浓度:5×TBE,pH 8.3;配制量:1 L):称取53.9 g Tris,27.5 g硼酸,量取20 ml 0.5 mol/L EDTA(pH 8.0),置于1 L烧杯中;加入约800 ml超纯水,充分搅拌溶解;加超纯水将溶液定容至1 L;室温保存。
10% 过硫酸铵(组份浓度:10% (W/V) 过硫酸铵;配制量:10 ml):称取1 g过硫酸铵,置于10~50 ml烧杯中;加入约8 ml超纯水,搅拌溶解;加超纯水将溶液定容至10 ml;4 ℃保存(保存时间为2周左右,超过期限过硫酸铵将失去催化作用)。
30% 丙烯酰胺(组份浓度:30% (W/V)丙烯酰胺;配制量:1 L):称取290 g丙烯酰胺,10 g N,N'-亚甲基双丙烯酰胺,置于1 L烧杯中;加入约600 ml超纯水,水浴加热至37 ℃,充分搅拌至溶解;加超纯水将溶液定容至1 L,用0.45 μm滤膜过滤除去杂质;并检测该溶液pH值应不大于7;棕色瓶4 ℃保存。
0.1% AgNO3(组份浓度:0.1% (W/V) AgNO3;配制量:1 L):称取1 g AgNO3,置于1 L烧杯中;加入约800 ml超纯水,;加超纯水将溶液定容至1 L;棕色瓶室温保存。
显色液(组份浓度:2% (W/V) NaOH,0.04% (W/V) Na2CO3,0.4% (W/V) 37%甲醛;配制量:1 L):称取20 g NaOH,0.4 g Na2CO3,置于1 L烧杯中;加入约800 ml超纯水,充分搅拌溶解;加4 ml 37%甲醛溶液,加超纯水将溶液定容至1 L;室温保存。
10% 冰乙酸(组份浓度:10% 冰乙酸;配制量:1 L):量取100 ml冰乙酸,置于1 L烧杯中;加入约800 ml超纯水,搅拌混匀;加超纯水将溶液定容至1 L;室温保存。
2.2.6 电泳检测2.2.6.1 玻璃板清洗首先用去污粉将电泳用玻璃板、胶垫、梳子等反复清洗;然后用Ⅲ级蒸馏水漂洗2~3次,直至玻璃板表面出现均匀水膜,既不聚成水滴,也不成股流下;再用超纯水漂洗1次,晾干;最后用无水乙醇擦拭,晾干备用[74]。
prp凝胶制作方法PRP凝胶是一种常用于生物学和医学领域的实验工具,用于分离和纯化蛋白质,核酸和其他生物大分子。
本文将介绍PRP凝胶的制作方法。
PRP凝胶的制作方法如下:材料准备:1. 聚丙烯酰胺凝胶(可以购买现成的凝胶片,也可以自制)2. 缓冲液(如Tris缓冲液、PBS等)3. 提取物样品4. SDS-PAGE电泳缓冲液步骤:1. 准备聚丙烯酰胺凝胶:a. 如果使用现成的凝胶片,将其从包装中取出并放入电泳槽中。
b. 如果需要自制凝胶,可以根据所需的凝胶浓度和尺寸配制聚丙烯酰胺凝胶。
具体的配方和步骤可以参考相关实验室手册或文献。
c. 将凝胶放入电泳槽中,并确保凝胶与电极缓冲液接触。
2. 准备缓冲液:a. 根据实验需求选择合适的缓冲液,并按照相应的配方将其配制好。
b. 加入适量的抗氧化剂(如DTT)和蛋白酶抑制剂(如PMSF)以保护样品的完整性。
3. 样品处理:a. 将提取物样品加入适量的SDS-PAGE电泳样品缓冲液中。
b. 加热样品混合物,以使其变性并断裂氢键。
c. 将样品混合物离心,以去除悬浮在液体中的固体颗粒。
4. 电泳:a. 将样品注入凝胶孔中。
b. 将电泳槽盖上,并连接电源。
c. 根据所需的电流和时间进行电泳,以使样品分离并迁移至凝胶的特定位置。
5. 凝胶固化:a. 电泳结束后,将凝胶从电泳槽中取出。
b. 将凝胶放入固化缓冲液中,使其固化。
c. 根据需要,在凝胶固化前后进行染色处理,以可视化目标分子。
6. 结果分析:a. 使用适当的分析工具(如蛋白质分析仪、核酸分析仪)对凝胶进行分析。
b. 根据所需的目的,选择适当的分析方法和软件进行数据处理和解读。
PRP凝胶的制作方法简单易行,可以根据实验需求进行调整和优化。
通过对样品的电泳分离和凝胶固化,可以有效地分离和纯化目标分子,为后续的实验和分析提供基础。
同时,使用合适的分析工具和方法,可以对凝胶结果进行定量和定性分析,获得准确可靠的实验数据。
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳标准操作规程(12%胶,)1电泳各试剂的配制1.1凝胶贮液:Acrylamide/Bis (30%T,%C)——为聚丙烯酰胺取丙烯酰胺acrylamide g、双丙烯酰胺N′N′-bis-methylene-acrylamide g至100mL量瓶中,加去离子水至刻度,摇匀,过滤。
4℃避光储存。
即10%的过硫酸铵 10%APS(临用现配)称取过硫酸铵(ammonium persulfate)100 mg,加1mL去离子水溶解。
Tris-HCl,pH称取Tris base g 于量瓶中,加去离子水80mL,用HCl 调节pH ,再加去离子水至总体积100mL。
4℃储存。
%(w/v)溴酚蓝:溴酚蓝,去离子水定容至100mL。
Tris-HCl,pH :称取Tris (三羟甲基氨基甲烷)6 g 于量瓶中,加去离子水60mL,用HCl 调节pH ,再加去离子水至总体积100mL。
4℃储存。
10%(w/v)SDS:称取10g SDS至100ml量瓶中,加90ml去离子水,缓慢搅拌至溶解,再加去离子水至刻度。
凝胶配制按下表比例配制凝胶分离胶及浓缩胶按上表比例配好后,均需脱气15 min。
临灌胶前,往分离胶中加入100 μl 10%APS及10 μl TEMED;往浓缩胶中加入100 μl 10%APS及20 μl TEMED(各试剂按比例增减)。
其中:TEMED为催化剂10×电极缓冲液,pH称取Tris base g、Glycine(甘氨酸) 144 g、SDS g于1000 mL量瓶中,溶解,加去离子水至刻度,不调pH。
4℃储存。
临用前,取出放至室温,10倍稀释,混匀,即为电极缓冲液。
样品溶解液S去离子水;0.5M Tris-HCl,pH ;glycerol (甘油)10% (w/v) SDS%(w/v)溴酚蓝总体积为 mL。
室温储存。
临用前加50 μlβ-巯基乙醇(β-Mercaptoethanol)于950 μl样品缓冲中,即为样品溶解液。
聚丙烯酰胺凝胶电泳凝胶的配置表1 配制Tris-甘氨酸SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶电泳分离胶所用溶液溶液成分不同体积(ml)凝胶液中各成分所需体积(ml)5101520253040508%水 2.3 4.6 6.99.311.513.918.523.2 30%丙烯酰胺溶液 1.3 2.74 5.3 6.7810.713.3 1.5 mol/L Tris(pH8.8) 1.3 2.5 3.85 6.37.51012.5 10% SDS0.050.10.150.20.250.30.40.5 10%过硫酸铵0.050.10.150.20.250.30.40.5 TEMED0.0030.0060.0090.0120.0150.0180.0240.03 10%水 1.94 5.97.99.911.915.919.8 30%丙烯酰胺溶液 1.7 3.35 6.78.31013.316.7 1.5 mol/L Tris(pH8.8) 1.3 2.5 3.85 6.37.51012.5 10% SDS0.050.10.150.20.250.30.40.5 10%过硫酸铵0.050.10.150.20.250.30.40.5 TEMED0.0020.0040.0060.0080.010.0120.0160.02 12%水 1.6 3.3 4.9 6.68.29.913.216.5 30%丙烯酰胺溶液246810121620 1.5 mol/L Tris(pH8.8) 1.3 2.5 3.85 6.37.51012.5 10% SDS0.050.10.150.20.250.30.40.5 10%过硫酸铵0.050.10.150.20.250.30.40.5 TEMED0.0020.0040.0060.0080.010.0120.0160.02 12.5%水 1.5 3.1 4.65 6.37.89.412.515.6630%丙烯酰胺溶液 2.1 4.2 6.258.310.412.516.720.84 1.5 mol/L Tris(pH8.8) 1.3 2.5 3.85 6.37.51012.5 10% SDS0.050.10.150.20.250.30.40.5 10%过硫酸铵0.050.10.150.20.250.30.40.5 TEMED0.0020.0040.0060.0080.010.0120.0160.02 15%水 1.1 2.3 3.4 4.6 5.7 6.99.211.5 30%丙烯酰胺溶液 2.557.51012.5152025 1.5 mol/L Tris(pH8.8) 1.3 2.5 3.85 6.37.51012.5 10% SDS0.050.10.150.20.250.30.40.5 10%过硫酸铵0.050.10.150.20.250.30.40.5 TEMED0.0020.0040.0060.0080.010.0120.0160.02表2 配制Tris-甘氨酸SDS-PAGE聚丙烯酰胺凝胶电泳5%积层胶所用溶液溶液成分不同体积(ml)凝胶液中各成分所需体积(ml)1234568105% 水0.68 1.4 2.1 2.7 3.4 4.1 5.5 6.8 30%丙烯酰胺溶液0.170.330.50.670.831 1.3 1.7 1.0 mol/L Tris(pH6.8)0.130.250.380.50.630.7501.25 10% SDS0.010.020.030.040.050.060.080.1 10%过硫酸铵0.010.020.030.040.050.060.080.1 TEMED0.0010.0020.0030.0040.0050.0060.0080.01相关溶液贮液的配制30% 聚丙烯酰胺贮液:丙烯酰胺 150g甲叉双丙烯酰胺 4gMilliQ水 500ml 滤纸过滤后,棕色瓶4℃冰箱保存。
D N A非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳银染配方及步骤(总3页) -CAL-FENGHAI.-(YICAI)-Company One1-CAL-本页仅作为文档封面,使用请直接删除DNA非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳银染配方及步骤最近需要做DNA非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,需要用银染显示条带,但是找不到具体的配方和步骤,不知和蛋白PAGE电泳银染有什么差别,哪位师兄师姐有配方可否发一份,十分感谢!一、电泳试剂:1、30%聚丙烯酰胺(29:1)丙稀酰胺29克,Bis1克,水100ml。
2、10%过硫酸胺过硫酸胺1克,水10ml。
3、TEMED4、5xTBETris 27克,硼酸13.75克,0.5M EDTA(pH 8.0) 10ml,定容至500ml。
二、银染试剂1、固定液:100ml无水乙醇,5ml冰醋酸,定容至1000ml。
2、0.2% AgNO3:AgNO3 1克,水500ml。
3、1.5% NaOH:NaOH 7.5克,水500ml。
4、37%甲醛。
三、配胶(6%):30%聚丙烯酰胺(29:1) 8ml,5xTBE 8ml,定容至40ml,加10%过硫酸胺 200ul;TEMED 20ul。
室温凝固时间>1小时。
四、银染:1、固定液固定10m。
2、水洗2m x3次。
3、0.2% AgNO3 100ml +37%甲醛50ul,混匀,避光染色30~50m。
4、水洗 20秒x2次。
5、1.5% NaOH 100ml,加37%甲醛 0.5ml,混匀,显色3~10m。
6、水洗若干次,终止显色。
电泳时间:150v x3h,溴酚兰的位置相当于40bp。
银染后胶面积将膨胀10%。
在终止显色过程中,将依惯性继续显色,所以不等显色到位即可进行终止显色。
显色到位后立即拍摄,水浸泡过夜将使背景加深转贴!!!聚丙烯酰胺凝胶电泳是分子生物学常用的一种技术。
我们实验室应用该项技术进行基因组甲基化的筛选,取得了一定结果。
因为全基因组的筛选需要很高的灵敏度,背景干扰降到最低,因此在对凝胶进行染色时,往往采用同位素法或银染法,而且配制的胶往往很大,我们配制的是大约40×35cm的胶,0.4mm厚。
聚丙烯酰胺凝胶电泳电泳(electrophoresis) 是指带电颗粒在电场中向着与其本身所带电荷相反的电极移动的现象。
在生物化学及分子生物学中,主要是根据生物大分子所带电荷的数量及其在分子表面排布的不同来对它们进行分离和鉴定。
电泳现象早在1809年就被发现,但将这种现象用于生物化学领域却萌芽于十九世纪初,1907年,有人曾研究过白喉毒素在琼脂中的电泳;1937 年,瑞典的Tiselius 建立了“移界电泳法”(moving boundary EP),成功地将血清蛋白质分成5个主要成分,即清蛋白、a 1-、a 2-、B -和丫-球蛋白。
其后的几十年,电泳技术发展很快,各种类型的电泳技术相继诞生。
以所采用的固体支持物区分,有纸电泳、醋酸纤维薄膜电泳、纤维素或淀粉粉末电泳,聚丙烯酰胺凝胶电泳,琼脂糖凝胶电泳1. 纸上电泳2. 醋酸纤维薄膜电泳3. 薄层电泳4. 非凝胶性支持体区带电泳支持体有:淀粉、纤维素粉、玻 璃粉硅胶、合成树脂粉末5. 凝胶支持体区带电泳(1) 淀粉胶(2) 聚丙烯酰胺① 圆盘电泳法② 平板法③ SDS-凝胶电泳法(3) 琼脂糖凝胶电泳(4) 琼脂凝胶电泳1.双向电泳2.电泳一层析相结合用支持体的电泳技术其他用法包括常压、高压电泳(水平式或垂直式)水平式或垂直式(平板法、柱形法及线丝法)垂直式(柱形法)垂直式或水平式垂直式(测分子量)平板法或柱形法3. 交叉电泳纸4. 连续低电泳等;以电泳形式区分,有在液体介质中进行的,有将支持物做成薄膜或薄层的,有板形或柱形的等(表1)。
电泳由于与光学装置、自动记录仪及自动部分收集器结合,又组成了等电点聚焦仪、等速电泳仪等等,80年代末发展起来的毛细管电泳(capillary electrophoresis) 是在毛细管中装入缓冲液,在其一端注入样品,在毛细管两端加直流高电压实现对样品的分离,, 这些都极大地发展和扩大了电泳技术的应用范围。
电泳按其分离的原理大致可分为四类:区带电泳(zone EP,ZEP)、移界电泳(moving boundary EP, MBEP)等速电泳(isotachophoresis ,ITP) 和等电聚焦(isoelectric focusing ,IEF)。
实验7 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验7 聚丙烯酰胺凝胶电泳原理一聚丙烯酰胺凝胶电泳(polyacrylamide gel electrophoresis,简称PAGE),由称盘状电泳。
这种电泳是在区带电泳的基础上,以孔径大小不同的聚丙烯酰胺凝胶作为支持物,采用电泳基质的不连续体系(即凝胶层的不连续性、缓冲液离子成分的不连续性、pH的不连续性及电位梯度的不连续性),使样品在不连续的两相间积聚浓缩成很薄的起始区带(厚度为10-2cm),然后再进行电泳分离。
圆盘电泳名称来源即由于此法的原理是依靠基质的不连续性(discontinuity),凑巧在垂直柱形凝胶上分散出的区带也很象圆盘状(discoid shape),取“不连续性”和“圆盘状”的英文字头“disc”。
因此英文名称为“disc electrophoresis”,中文直译为盘状电泳。
仪器装置:如图A所示,上下两个槽为圆形或方形,其中注入缓冲液(图中曲线表示缓冲液面)。
上下槽的缓冲液分别有正负电极通入。
下槽外壳在必要时可通入冷水促使降温,水流方向用箭头表示。
上槽底部有许多小孔,可插入装有聚丙烯酰胺的玻璃管。
图A在圆盘电泳过程中有三种物理效应:①样品的浓缩效应,②凝胶的分子筛效应,③一般电泳分离的电荷效应。
由于这三种物理效应,使样品分离效果好,分辨率高。
下面就圆盘电泳过程中的三种物理效应的原理加以说明:1. 样品的浓缩效应:由于电泳基质的4个不连续性,使样品在电泳开始时,得以浓缩,然后再被分离。
(1)凝胶层的不连续性:浓缩胶:为大孔凝胶,有防止对流的作用。
分离胶:为小孔凝胶,也有防止对流的作用。
样品在其中进行电泳和分子筛分离。
蛋白质在大孔凝胶中受到的阻力小,移动速度快。
进入小孔凝胶时遇到的阻力大,速度就减慢了。
由于凝胶的不连续性,在大孔胶与小孔胶的界面处就会使样品浓缩,区带变窄。
(2)缓冲离子成分的不连续性。
(3)电位梯度的不连续性。
(4)pH的不连续性:在浓缩胶和分离胶之间有pH的不连续性,浓缩胶应有的pH应为8.3,分离胶应有的pH为8.9。
非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶制备4.1 清洗玻璃板、灌胶用量筒和烧杯,玻璃板气干(制胶用玻璃板为硫化玻璃,灌胶面必须干净无水分,否则灌胶时容易产生气泡;烧杯、量筒和玻璃板如果有水,由于胶与水不相溶,易使胶不能牢固粘在玻璃板上);4.2将平口玻璃板和凹口玻璃板放在桌面的支撑物(瓶盖等)上,给玻璃板滴少量100%乙醇,用质量好的纸均匀擦洗制胶面,气干;4.3 平口玻璃板和凹口玻璃板的三个边均匀的涂抹适量凡士林(凡士林太多不容易清洗);放上需要厚度的板条,此步应注意密封好板条的相接处,用手将三边和接茬处按牢固,否则容易漏胶;然后用夹子(夹子夹在板条中间)将玻璃板固定于灌胶架上;4.4 配胶(8%非变性聚丙烯酰胺凝胶,Acr:Bis=37.5:1)、灌胶;将以下母液按量混合均匀保存于4℃,一般一周内用完,溶液 120ml 240ml40%Acr 24ml 48ml2%Bis 12.84ml 25.68ml10XTBE(8.3) 12ml 24mlddH2O 70.8ml 141.6ml针对所选用的胶的大小和厚度量取适量以上混合液倒入干净烧杯,加入适量10%APS(催化剂)和TEMED(加速剂),摇匀,灌胶,缓慢插入与胶厚度一致的梳子,同时避免梳齿下产生气泡,待胶凝固;(注:1 聚丙烯酰胺凝胶在凝固以前有毒,凝固后无毒,因此操作时应戴上手套; 2 板条和梳子厚度必须一致,否则将在点样孔中产生胶膜,影响点样和最后电泳质量)对于20cm x 17cm的玻璃板,除去板条尺寸,胶为16.5cm(宽) x 15.5cm(高) x 1mm(厚),配制如下:胶混合液10%APS TEMED一板胶30ml 180μL 80μL两板胶60ml 360μL 160μL制胶及电泳(1)胶板的准备:首先确定两块玻璃板是否平整,用去污剂和清水将玻璃板洗涤干净,并用蒸馏水冲洗,晾干后用95%乙醇擦拭。
1 用1~2 ml 95%的乙醇依次将长玻璃和短玻璃的正面擦拭干净、均匀;(以平整、光滑的一面为正面)(第一次用的玻璃板最好擦2~3次)2 用加样枪取1ml配置好的亲和硅烷均匀分布于长玻璃的正面,用纱布涂抹均匀;(第一次用的玻璃板最好用亲和硅烷擦2~3次)3 用加样枪取0.5~1ml配置好的剥离硅烷均匀分布于长玻璃的正面,用纱布涂抹均匀;(擦至感觉特别光滑为止)4 用1ml 95%的乙醇依次将长玻璃和短玻璃的正面擦拭均匀;(可使亲和硅烷和剥离硅烷分布更未均匀,也可擦去多余部分)5 检查玻璃板正面有误纱布绒毛之类的异物,若有,可吹走;取0.4mm的边条,用纱布擦净,置于长玻璃板的左右两侧,靠边放置,将短玻璃板压于长玻璃板上,调整边条和短玻璃板的位置,使边条刚好处于边缘位置,但不突出,且长短玻璃板刚好对其,用夹子固定住玻璃板的两侧;以1×TAE配制1%琼脂糖凝胶并封住玻璃板底部,待凝胶凝固后用医用胶带密封;将玻璃板凹槽向上小角度倾斜放置,准备灌胶。
1。
变性:二、聚丙烯酰胺凝胶电泳聚丙烯酰胺凝胶电泳适宜分离鉴定低分子量蛋白质、小于1Kb的DNA片段和DNA序列分析.其装载的样品量大,回收DNA纯度高.长度仅相差0.2%(即500bp中的1bp)的核苷酸分子即能分离.聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺单体,在催化剂TEMED(N,N,N,N'一四甲基乙二胺)和过硫酸铵的作用下,丙烯酰胺聚合形成长链,聚丙烯酰胺链在交联剂,N,N'一亚甲双丙烯酰胺参与下,聚丙烯胺链与链之间交叉联接而形成凝胶.聚丙烯酰胺凝胶孔径的大小是由丙烯酰胺的浓度决定的,不同浓度丙烯酰胺和DNA的有效分离范围见表 2. 丙烯酰胺(%)??有效分离范围(bp)??溴酚兰*??二甲苯青* 3.5??100~2000??100??460 5.0??80~500??65??260 8.0??60~400??45??160 12.0??40~200??30??7015.0??25~150??15??60 20.0??10~100??12??4 5*表中给出的数字为与指示剂迁移率相等的双链DNA分子所含碱基对数目(b p).(一)材料1.电泳仪器:电泳仪,垂直电泳槽及其附件. 2.准备工作:1。
必要时可用KOH/甲醇清洗玻璃板和间隔片2.用温热的去污剂溶液洗涤玻璃片和间隔片,再充分漂洗,先用自来水,再用去离子水,应拿取玻璃板的边缘部分或戴手套操作,以免手上的油脂残留再玻璃板的工作面上。
用乙醇冲洗玻璃板,并将其至于一边晾干。
3.安装玻璃与间隔片:将较大的(不带拗口)玻璃板平放在试验台上,在玻璃板的两侧将间隔片平行至于边缘放妥:用凡士林轻涂以帮组与间隔片在后面操作中保持原位;将那板在间隔片上放稳。
2.30%丙烯酰胺丙烯酰胺,29克N,N'一亚甲基双丙烯酰胺,1克H2O,加至100m l 装于棕色瓶内,4℃可保存二个月.3.10%过硫酸铵过硫酰铵,1克加水至,10m l 4℃可保存一周,-20℃可保存一个月.4.1X T B E电泳缓冲液:(89m m o l/l T r i s-硼酸,2mmol/lEDTA(ph8.0),TBE用5×储备液稀释即可,缓冲液P H8. 35.T E M E D(四甲基乙烯基二胺)35u l(二)聚丙烯酰胺凝胶的制备与电泳根据分离DNA片段的大小及需凝胶的容积,配制聚丙烯酰胺凝胶.1.按要求装配好垂直电泳板,两块玻璃板的两侧及底部用1%的琼脂糖封边,防止封闭不严而使聚丙烯酰胺液漏出.2.将装好的玻璃电泳板倾斜成45~60℃角.3.按表3配制所需%浓度凝胶的毫升数.4.将上述液体加入TEMED35ul后,立即混匀,缓缓倒入两玻璃板间的胶床中,直到液体接近溢出时为止.最后加入1mlH2O覆盖层,室温静置30min左右至分离胶凝聚,倾去覆盖层,并用吸水纸吸净。