崇明薄皮甜瓜种质资源鉴定与分析
- 格式:pdf
- 大小:144.73 KB
- 文档页数:2
江西农业学报2010,22(12):30~33A c t a A g r i c uhu r ae J i angxi薄皮甜瓜表型性状的主成分分析胡建斌,马肖静,李琼(河南农业大学园艺学院,河南郑州450002)摘要:对不同来源的34份薄皮甜瓜品种的19个表型性状进行了主成分分析。
结果表明,果实形态和品质相关性状变异系数较大,是薄皮甜瓜表型变异的主要来源,其中果形指数变异系数最大,达80.13%。
19个表型性状可归为6个主成分,即果形因子、植株生长因子、品质因子、熟性因子、单果重因子和种子形态因子,其累计贡献率为80.832%。
根据主成分值对供试材料的主要性状进行综合评价,王海、十道梨、金巴齿、甜梨王、花脆瓜等10个品种综合表现优良。
关键词:薄皮甜瓜;表型性状;主成分分析中图分类号:$652文献标识码:A文章编号:1001—8581(2010)12—0030—04Pr i nci pal C om ponent A nal ysi s of Phe not ypi c C ha r a c t e r s i n Thi n--pe el M e l onH U J i a n—bi n,M A X i ao—j i ng.L I Q i ong(C ol l ege of H or t i cul t ur e,H enan A gr icul t u r al U ni ver si t y,Z he ngzhou450002,Chi na)A bs t r act:Pr i nci pal c om pone nt anal ysi s w a s us Pd t o st ud y t he19phenot ypi c char act er s of34t hi n—peel m el on euhi var s w i th di f-f er e n t or i gi ns.T he r es ult s sh ow e d t hat t he var iat i on c o e f fi c ie nts of t he t r ai t s r el at ed t o fr ui t sh ape and f rui t qu',di t y w er e m uc h hi gh,and t hes e t r ai t s w er e t he m aj or s our ces of pheno t ypi c var i at i on s i n t hi n—peel m el on.O f t hes e t ra i ts.f hit sh ape i ndex had m a xi m al va r i a-t ion coe f f i ci ent(80.13%).Ni net e en phenot ypi c char act er s coul d be clas si f i ed t o s i x pr i n ci pal com ponent s w i th a cum ul at i ve c ontr i but ion r at e of80.832%。
2022年3月 热带农业科学第42卷第3期Mar. 2022 CHINESE JOURNAL OF TROPICAL AGRICULTURE Vol.42, No.3收稿日期 2021-11-29;修回日期 2021-12-15基金项目 2019年三亚市农业科技创新项目(No.2019NK15);2019 年海南省重大科技计划项目(No.zdkj201901)。
第一作者 梁昕景(1988—),女,农艺师,主要研究方向为西甜瓜栽培管理、品种改良及分子育种,E-mail :136****************。
通讯作者 杨小锋(1977—),男,研究员,主要研究方向为设施园艺与无土栽培,E-mail :*******************。
基于隶属函数法对34份黄皮厚皮甜瓜种质资源的综合评价梁昕景 夏玲 王学林 曹明 杨小锋(三亚市南繁科学技术研究院 海南三亚 572000)摘 要 为筛选出适合海南地区种植的黄皮类型厚皮甜瓜品种,利用方差分析和隶属函数法,对供试的34个黄皮类型厚皮甜瓜品种的产量及品质等性状进行综合评价。
结果表明:34个品种中27个肉色为红色,果形指数范围1.03~1.79,肉质以脆为主;火凤凰6号产量最大,为63 000 kg/hm 2,显著高于其他品种;蜜①、Ds-85、k2-3、ST19-4、Ds-69心糖含量显著高于其他品种,分别为17.47%、17.50%、17.57%、17.60%、17.67%;ST19-5、k2-3边糖含量显著高于其他品种,分别为13.07%和13.43%;隶属函数法综合评价表明,火凤凰6号总隶属函数值最大,排名第1;k2-1、k2-4、君网蜜3号、k2-3位居前5,可以重点引进。
关键词 黄皮甜瓜;品种比较;隶属函数;综合评价中图分类号 S652 文献标识码 A DOI: 10.12008/j.issn.1009-2196.2022.03.008Comprehensive Evaluation of 34 Varieties of Yellow-skinned MuskmelonBased on the Membership Function MethodLIANG Xinjing XIA Ling WANG Xuelin CAO Ming YANG Xiaofeng(Sanya Academy of Nanfan Scientific Research and Technology, Sanya, Hainan 572000, China)Abstract In order to screen out yellow-skinned muskmelon varieties suitable for planting in Hainan, 34 varieties of yel-low-skinned muskmelon were selected to evaluate their yield and quality traits comprehensively by using variance analysis and the subordinate function method. The results showed that 27 of the 34 muskmelon varieties were red and mostly crispy in fruit flesh, with the fruit shape index ranging from 1.03 to 1.79. Muskmelon ‘Huofenghuang 6’ yielded the highest, 63 000kg ha ‒1, which was significantly higher than that of the other varieties. The muskmelon varieties Mi , Ds ①-85, k2-3, ST19-4 and Ds-69 were significantly higher in soluble solids content in the center of the fruit flesh than the other varieties, which were 17.47%, 17.50%, 17.57%, 17.60% and 17.67%, respectively. The varieties ST19-5 and k2-3 had significantly higher soluble solids contents in the outer portion of the fruit flesh than the other varieties, which were 13.07% and 13.43%, respectively. Comprehensive evaluation of all the varieties by the membership function method showed that the variety ‘Huofenghuang 6’ was the highest in total membership function value, followed by the varieties k2-1, k2-4, Junwangmi 3 and k2-3. The top 5 varieties can hence be considered for introduction.Keywords yellow-skinned muskmelon; cultivar comparison; membership function; comprehensive evaluation甜瓜(Cucumis melo L.)是葫芦科(Cucurb-itaceae )黄瓜属(Cucumis )一年生蔓性植物,我国栽培甜瓜分为2大类:薄皮甜瓜和厚皮甜瓜[1]。
Vegetables 2021.4新优品种都市型薄皮甜瓜品种比较试验张静、哈雪姣2,贾文红2,乔媛媛3,郝敬虹\李婷(1.北京农学院植物科学技术学院/农业应用新技术北京市重点实验室,北京102206 ,2.北京市大兴区农业技术推广站,北京102600 ;3.北京通州通农种业有限公司,北京101149, 4.北京市农业技术推广站,北京100029)摘要:为筛选出适宜在北京种植的优质都市型薄皮甜瓜品种,选取8个品种的薄皮甜瓜为试验材料,对比分析其田间长势及果实品质。
结果表明:8个参试品种田间长势及果实品质均有显著差异,其中梨形 瓜中丘比特果实大,外观好,果肉最厚,心糖最高,综合果实品质最优秀;长筒形瓜中博洋9号果实外观 及品质较优秀,单果质量最大,果形指数好,心糖最高。
综合看来,丘比特和博洋9号这2个品种可在北 京地区进一步推广种植。
关键词:薄皮甜瓜;生长;品种;品质Comparative Test of Urban Thin-skinned Melon Cultivars ZHANG Jing1, HA Xuejiao2, JIA Wenhong2, QIAO Yuanyuan3, HAO Jinghong1, LI Ting4*(1.Plant Science and Technology College,Beijing University of Agriculture/Beijing Key Laboratory of NewTechnology in Agricultural Application,Beijing102206, China;2.Beijing Daxing District Agricultural Technology Extension Station,Beijing102600, China;3.Beijing Tongzhou Tongnong seeds Co.,Ltd.,Beijing 101149, China;4.Beijing Agricultural Technology Extension Station,Beijing100029, China)Abstract:In order to select high-quality urban thin-skinned melon cultivars suitable for planting in Beijing, eight cultivars of thin-skinned melon were selected as experimental materials,and their field growth vigor and fruit quality were compared and analyzed.The results showed that there were significant differences in field growth vigor and fruit quality among the eight cultivars,among the pear-shaped melons,the 'Qiubite'fruit had the best appearance,the fruit had the thickest inner flesh,the thickest core sugar and the best comprehensive fruit quality,while the'Boyang No.9'fruit had the best appearance and quality whose single fruit weight,fruit shape index was good and the content of core sugar was the highest.In conclusion,'Qiubite'and'Boyang No.9'could be further popularized and cultivated in Beijing area.Keywords:thin-skinned melon;growth;cultivar;quality甜瓜(Cu c u mL m d o L.)属于葫芦科黄瓜 悠久,在国际上甜瓜也多年稳居十大畅销果品之属甜瓜种,在我国多地广泛栽培且栽培历史十分 列m。
甜瓜白粉病病原菌鉴定及抗病种质资源筛选
陈建军;王锋;陈积豪;梁其干;符小发;范蓉;张浩;王敏
【期刊名称】《中国蔬菜》
【年(卷),期】2024()3
【摘要】三亚是海南甜瓜的重要产区,也是甜瓜白粉病的高发区。
利用镜检法、分子生物学方法以及国际通用的13个标准鉴别寄主对三亚甜瓜试验基地自然发病的白粉病病原菌进行生理小种鉴定,并从自主选育的第4代甜瓜种质资源中挑选30个材料进行白粉病苗期抗病性鉴定和筛选。
结果表明,通过病原菌孢子的形态特征分析、ITS序列比对以及13个标准寄主对白粉病病原菌接种的感抗反应,综合判定该病原菌为瓜单囊壳白粉菌(Podosphaera xanthii)的Race 2France生理小种。
另外,从30份厚皮甜瓜材料中筛选出对白粉病免疫的材料2份(22-7-2、22-16-1),对白粉病高抗的材料3份(06-4-1、14-8-1、23-8-1);2份免疫材料均为黄皮、椭圆、网纹类型,3份高抗材料均为网纹类型。
【总页数】8页(P67-74)
【作者】陈建军;王锋;陈积豪;梁其干;符小发;范蓉;张浩;王敏
【作者单位】海南省农业科学院三亚研究院;新疆农业科学院海南三亚农作物育种
试验中心;新疆农业科学院哈密瓜研究中心
【正文语种】中文
【中图分类】S43
【相关文献】
1.番茄白粉病苗期抗病性鉴定方法及抗病种质资源筛选
2.甜瓜白粉病的抗病基因、鉴定寄主及种质资源
3.宁夏甜瓜白粉病室内苗期抗病性鉴定方法及抗性种质资源筛选
4.宁夏西瓜、甜瓜白粉病病原菌鉴定及抗性种质资源筛选
5.广西厚皮甜瓜根腐病病原菌鉴定及抗病种质筛选
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
薄皮甜瓜品种的早熟特性鉴定初探
陈海荣
【期刊名称】《上海蔬菜》
【年(卷),期】2001(000)005
【摘要】@@ 薄皮甜瓜是上海地区栽培的传统瓜果类蔬菜,栽培历史悠久,以海冬青、十棱黄金瓜、亭林雪瓜等最为有名,在初夏西瓜上市以前供应市场,深受市民喜爱.上个世纪80年代中期开始,由于受厚皮甜瓜的冲击,薄皮甜瓜的上市量越来越少.另外,由于作物复种指数提高和病虫的危害及不良气候条件的影响,薄皮甜瓜在本市郊区的栽培难度也越来越高,仅在远郊崇明县、青浦县有少量栽培.如果利用薄皮甜瓜苗期耐低温,全生育期短,较适应本地区气候等品种特点进行早熟栽培,就可以避开病虫害发生高峰期,使薄皮甜瓜的栽培获得成功并赢得市场.所以笔者从1994年开始进行国内外薄皮甜瓜品种材料的引进、品种早熟特性的鉴定及适宜栽培技术的研究,本文报道的是其中品种早熟特性鉴定的内容.
【总页数】2页(P15-16)
【作者】陈海荣
【作者单位】上海市农业科学院园艺研究所,201106
【正文语种】中文
【相关文献】
1.早熟薄皮甜瓜新品种r——唐甜10号 [J], 刘刚
2.早熟薄皮甜瓜品种比较试验 [J], 刘洋;李婷;陈文钊;刘立娟;王震
3.嘉鱼县早熟薄皮甜瓜品种应用现状及潜力品种推荐 [J], 鲁运江
4.福建培育的两薄皮甜瓜品种首次通过国家新品种鉴定 [J],
5.福建两个薄皮甜瓜品种首次通过国家新品种鉴定 [J], 李明玉
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
浙江农业学报!"#$!%&'"()#(&$*+,*-'$.%*./'/!!"!#!#$"%#$&$(&)&<"#*++,$--.../012345/62寿伟松!何艳军!沈佳!等/甜瓜NR D D [基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析&7'/浙江农业学报!!"!#!#$"%#$&$(&)&<"#/89:$&";#(<(-1/=>>2/&""'?&$!';!"!!"('#收稿日期 !""<?!#基金项目 浙江省第三次全国农作物种质资源普查与收集行动"&&&C!&#"&#$'"$!"#"#(浙江省农业"蔬菜新品种选育#新品种选育重大科技专项"!"!&\"!"<$?#?!#(国家自然科学基金"#&C%!&#"#作者简介寿伟松"&(%!+#!男!浙江绍兴人!硕士!副研究员!主要从事西甜瓜育种与栽培,D ?E F =G $>*H V.>I0F F >/F 6/62甜瓜X Y!!?基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析寿伟松 何艳军 沈K 佳 许昕阳"浙江省农业科学院蔬菜研究所!浙江杭州#&""!&#摘K 要 糖外排转运子">VS F ]>.=G G W `W 2+VF G G 35W W 4,H ]+W ^+]F 2>,H ]+W ]!NR D D [#是一类新型的糖转运蛋白!其在植物生长发育%植物与病原体互作以及植物胁迫耐受性方面都起着重要作用,基于甜瓜中还未有该家族基因的相关报道!本研究开展\E NR D D [的全基因组鉴定和生物信息学分析,通过同源性搜索!总共鉴定到&%个甜瓜9C 4^M M D 基因,这些基因分布于甜瓜C 条染色体上!具有典型的g +T #->F G =`F 结构域,系统发育树将拟南芥%黄瓜和甜瓜的NR D D [蛋白分为'个进化分支!其中亚族%是甜瓜和黄瓜独有的亚族,基因启动子区域的顺式作用元件显示!9C 4^M M D 含有许多与植物激素和应激相关的调节元件!暗示了9C 4^M M D 在参与调节甜瓜生长发育以及环境适应性方面有重要作用,基因表达量分析表明!大部分9C 4^M M D 基因在花"雌花和雄花#和根中高表达!部分9C 4^M M D 基因在果实发育时期表达量较高,此外!a T O ?NW J 结果暗示!9C 4^M M D 基因可能参与对尖孢镰刀菌和白粉病菌侵染的抗性响应,本研究为今后探究\E NR D D [蛋白在甜瓜生长发育过程以及响应生物和非生物胁迫中的分子功能奠定了坚实的基础,关键词 甜瓜(糖外排转运子(全基因组鉴定(进化分析(表达分析中图分类号 N<$!文献标志码 O 文章编号&""'?&$!'"!"!##"%?&$(&?&#M #+'6#5:)(#)(#+%)")$,%)'+,+(8)')+"'*6,%)$&,+,0/&)&'"X Y!!?1#+#",6)0/)+6#0'+NY 9XR W =>H 2S !Y D@F 21V2!NY D T7=F !Q XQ =23F 2S"0./#'#(#*12K *%*#$S )*/!+,*-'$.%!"$A*C 812!%&'"()#(&$)4"'*."*/![$.%:,1(E>;;Y>!9,'.$#78&%*,$%$NVS F ]>.=G G W `W 2+VF G G 35W W 4,H ]+W ^+]F 2>,H ]+W ]"NR D D [#=>F 2H `W G B F E =G 3H B >VS F ]+]F 2>,H ]+W ]>+*F +F ]W =2?`H G `W ^=2,G F 2+S ]H .+*F 2^^W `W G H ,E W 2+!,G F 2+?,F +*H S W 2=2+W ]F 6+=H 2!F 2^>+]W >>+H G W ]F 26W /8VW +H +*W G F 6d H B ]W ,H ]+>H B NR D D [B F E =G 3S W 2W >=2E W G H 2!+*=>>+V^36F ]]=W ^H V++*W S W 2H E W ?.=^W =^W 2+=B =6F +=H 2F 2^5=H =2B H ]E F +=6>F 2F G 3>=>H B \E NR D D [/O+H +F G H B &%E W G H 29C 4^M M D S W 2W >.W ]W =^W 2+=B =W ^53*H E H G H S 3>W F ]6*/[*W >W S W 2W >+*F +^=>+]=5V+W ^H 2C 6*]H E H >H E W >F G G *F `W F +3,=6F G g +T #->F G =`F ^H E F =2/_*3G H S W 2W +=6F 2F G 3>=>6G F >>=B =W ^+*W NR D D [,]H +W =2>H B O ]?F 5=^H ,>=>!6V6VE 5W ]F 2^E W G H 2=2+H B H V]W `H G V+=H 2F ]36G F ^W >!H B .*=6*>V5B F E =G 3%=>V2=JVW +H E W G H 2F 2^6V6VE ?5W ]/[*W "'/?F 6+=2S W G W E W 2+>=2+*W S W 2W ,]H E H +W ]]W S =H 2>*H .W ^+*F +\E NR D D [6H 2+F =2>E F 23]W S VG F +H ]3W G W E W 2+>]W G F +W ^+H ,G F 2+*H ]E H 2W >F 2^>+]W >>!>VS S W >+=2S +*F +\E NR D D [,G F 3>F 2=E ,H ]+F 2+]H G W =2]W S VG F +=2S S ]H .+*F 2^W 2?`=]H 2E W 2+F G F ^F ,+F +=H 2=2E W G H 2/[=>>VW ?>,W 6=B =6F 2F G 3>=>>*H .W ^+*F +E H >+H B +*W 9C 4^M M D S W 2W >.W ]W *=S *G 3W 4?,]W >>W ^=2B W E F G W F 2^E F G W B G H .W ]>F 2^]H H +>!F 2^>H E W 9C 4^M M D S W 2W >.W ]W *=S *G 3W 4,]W >>W ^^V]=2S B ]V=+^W `W G H ,?E W 2+/A V]+*W ]E H ]W !a T O ?NW J ]W >VG +>>VS S W >+W ^+*F +9C 4^M M D S W 2W >E =S *+5W =2`H G `W ^=2]W >=>+F 26W +H B (/$&'(CH43>,H]VEF2^,H.^W]3E=G^W.=2B W6+=H2/[*=>>+V^3G F3>F>H G=^B H V2^F+=H2B H]B V+V]W]W>W F]6*=2+H+*W=]E H G W6VG F] B V26+=H2H B\E NR D D[=2E W G H2^W`W G H,E W2+F G,]H6W>>W>F2^]W>,H2>W>+H5=H+=6F2^F5=H+=6>+]W>>W>/9#/:'*(&$E W G H2(>VS F]>.=G G W`W2+VF G G35W W4,H]+W^+]F2>,H]+W](S W2H E W?.=^W=^W2+=B=6F+=H2(,*3G H S W2W+=6F2F G3? >=>(W4,]W>>=H2F2F G3>=>KK糖作为光合作物的产物!为植物的营养生长和生殖生长提供主要能量来源,作为糖代谢的最初底物!蔗糖在光合器官中被合成!然后通过韧皮部的装载和卸载系统被转运到储藏细胞!进而参与核酸%蛋白质%脂质和次级代谢物的合成与代谢&&',糖不仅参与代谢过程!还是植物抗逆%渗透压调节%信号识别和大分子转运等过程的关键调节因子&!',但是!由于不能独立运输!糖必须由合适的糖转运蛋白协助转运,目前!在植物中已有#个糖转运蛋白家族被鉴定!包括蔗糖转运蛋白"NX[>#%单糖转运蛋白"g N[>#和糖外排转运子"NR D D[#,在这#个家族中!NR D D[是最后一个被发现的基因家族!其可介导韧皮部薄壁组织中的糖流入或流出韧皮部质外体&#)'',与NX[>和g N[>需要能量才能通过质膜运输糖不同!NR D D[蛋白可以不依赖质子梯度和,Y协助糖在细胞膜和液泡膜上扩散&$)%',NR D D[蛋白通常含有一个保守的由#个跨膜结构域组成的g+T#p>F G=`F或_n?P99_结构&C',真核生物中的NR D D[蛋白通常含有%个跨膜结构域!原核生物中含有#个跨膜结构域,但在植物基因组中也检测到具有#或'个跨膜结构域的NR D D[&(',另外!在葡萄和水稻中也发现了分别由&'和&$个跨膜结构域组成的新型NR D D[!表明NR D D[蛋白跨膜结构域的多样性&()&"',4^M M D基因已在多种植物中被鉴定!包括拟南芥&#'%水稻&&&'%小麦&&!'%大豆&('%高粱&&#'%黄瓜&&''%番茄&&$'%西瓜&&<'%卷心菜&&%'%葡萄&&C'和苹果&&('等,NR D D[蛋白的功能不仅限于在细胞外或细胞内区室转运糖!它们还参与多种生理过程!包括花粉发育&!"'%植物衰老&!&'和种子灌浆&!!'等,另外!NR D D[在植物与病原体相互作用过程中也发挥一定的作用!?/4^M M D&&和/4^M M D&'是水稻和白叶枯病互作中的负调节因子&!#',在甘薯中过表达0S4^M M D&"发现其对尖孢镰刀菌表现出更强的抗性!而a T O=植物表现出敏感表型&!'',另外!NR D D[蛋白也参与植物对激素和非生物胁迫的响应,在水稻中9>N? R D D[#F既可以转运葡萄糖!也可以转运赤霉素"Z O#,?/4^M M D#$基因的敲除和过表达均显示发芽和茎发育缺陷!而这种表型可以通过外源赤霉素添加恢复&!$',Q.4^M M D&!基因在油菜中会被油菜油菜素甾醇"i a#%Z O和脱落酸"O i O#诱导&!<',除此之外!!#4^M M D'%!#4^M M D&&%!#N4^M M D&!%!#4^M M D&$基因被报道在植物耐寒中起重要作用&!%)#"',而!#4^M M D&$基因也可被渗透压%干旱%盐和冷胁迫诱导!过表达!#4^M M D&$植物根中会表现出加速衰老和细胞活力降低等表型&#"',甜瓜是一种重要的经济作物!糖在发挥甜瓜经济价值中起重要作用,4^M M D基因已被证明在许多植物生长发育%植物病原体以及植物环境相互作用中发挥重要作用!但尚未在甜瓜中对其进行研究,在本研究中!我们对甜瓜中的4^M M D基因进行了全基因组鉴定与分析!主要包括染色体分布%基因结构%基序分布%系统进化树%顺式调控元件%时空表达模式!以及响应生物和非生物胁迫的表达,本研究初步揭示了甜瓜中4^M M D基因家族的特性!为未来开展4^M M D 基因与甜瓜生长发育%抗病和抗逆等相关等研究提供指导,&K材料与方法&;&K甜瓜9C4^M M D基因的鉴定从_*3+H0H E W网站"*++,$--,*3+H0H E W/1S=/^H W/S H`-,0-,H]+F G/*+E P#下载已知的NR D D[蛋白序列!然后将这些序列导入到\VZ W28i数据库中!并在甜瓜数据库"*++,$--6V6V]5=+S W2H E=6>/H]S-H]S F2=>E-&C#中进行i P O N[_,然后将假定的甜瓜NR D D[蛋白提交到_B F E数据库"*++,$--,B F E/4B F E/H]S->W F]6*->W JVW26W#,利用_B F E的NR D D[保守结构域序列生成隐马尔可夫模型-!($&-浙江农业学报K第#$卷K第%期"Y g g#,用Y g g D a#;"软件对甜瓜NR D D[蛋白进行Y g g D a搜索,最后!去掉冗余序列以保留特异的甜瓜NR D D[蛋白,从\VZ W28i网站获取甜瓜9C4^M M D基因的染色体位置信息并用\O8软件绘制定位图,利用i=H Q g软件计算甜瓜NR D D[蛋白的分子量和等电点,利用R H P A_NN9a[网站预测蛋白亚细胞定位,利用Ng O a[数据库"*++,$-->E F]+/W E5G?*W=^W G5W]S/ ^W#对\E NR D D[蛋白的跨膜结构域进行分析,&;!K基因结构 蛋白保守基序分析 进化分析和启动子顺式作用元件分析应用N+]V6+V]W8=>,G F3NW]`W]!;"在线软件"*++,$--S>^>/S F H?G F5/H]S-#对甜瓜9C4^M M D的基因结构进行分析,采用g D g D在线网站"*+?+,>$--E W E W?>V=+W/H]S-E W E W-^H6-E W E W/*+E G#分析\E NR D D[蛋白中的保守基序,从拟南芥基因组数据库"*++,>$--.../F]F5=^H,>=>/H]S-#%黄瓜基因组数据库"*++,$--6V6V]5=+S W2H E=6>/H]S-H]S F2=>E-!"#和甜瓜基因组数据库下载所有的NR D D[蛋白!并将其导入到g D Z O$;"在线软件中利用邻接法"置信值为&"""#进行同源性分析并构建进化树,利用_G F2+\O a D在线网站"*+? +,$--5=H=2B H]E F+=6>/,>5/VS W2+/5W-.W5+H H G>-,G F2+?6F]W-*+E G-#分析甜瓜4^M M D基因上游!"""5,的顺式作用元件,&;#K9C4^M M D基因的表达分析从甜瓜数据库网站"*++,$--6V6V]5=+S W2H E? =6>/H]S-]2F>W J-*H E W#下载\*F]W2+F=>组织表达"_a7T O#C#C#"#%果实不同发育时期"_a7T O!C<&!"#%尖孢镰刀菌侵染T O8和\*F]W2+F=>?["_a7D i&$$$&#和白粉病菌侵染a H6*W+"_a7T O'#'$#C#的a T O?NW J数据!将9C N4^M M D的基因表达量数据导入到[i+H H G>!制作响应热图,!K结果与分析!;&K甜瓜9C4^M M D基因的鉴定采用蛋白质局部定位工具i P O N[_与Y g g 两种方式进行甜瓜全基因组搜索!结果共鉴定出&%个4^M M D基因,根据这些基因在染色体上的位置!将其命名为9C4^M M D"&M9C4^M M D&%,这些9C4^M M D基因分布在除了甜瓜染色体&%<%C和&"之外的C条染色体上,其中!染色体$和&!各包含#个9C4^M M D基因(染色体!%'和(包含!个9C4^M M D基因(染色体#%%和&&各包含&个9C4^M M D基因"图&#,另外!这些\E NR D D[蛋白的氨基酸长度范围在&$&M!(%F F!蛋白分子量在&<;$(M##;#$dV!蛋白等电点在';$"M&";!",除\E NR D D["&和\E?NR D D["!含有'个跨膜结构域外!多数\E?NR D D[蛋白含有$M%个跨膜结构域,亚细胞定位结果显示!大部分\E NR D D[蛋白定位在细胞膜上!\E NR D D["!和\E NR D D[&"定位在液泡膜上!而\E NR D D[&$定位在内质网上"表&#,!;!K甜瓜9C4^M M D基因结构 蛋白结构域和保守基序分析基于Z N8N网站分析基因结构!结果显示!甜瓜中的9C4^M M D基因的内含子数目在#M<, 9C4^M M D"&%9C4^M M D"!%9C4^M M D&"%9C N 4^M M D&#和9C4^M M D&%基因含有#个内含子! 9C4^M M D"#%9C4^M M D"'%9C4^M M D"(%9C N4^M M D&&%9C4^M M D&!和9C4^M M D&<含有'个内含子!9C4^M M D"$%9C4^M M D"<%9C4^M M D"C和9C4^M M D&$含有$个内含子!仅9C4^M M D"%含有<个内含子"图!#,比对\E NR D D[蛋白序列并分析甜瓜其成员保守的结构域显示!甜瓜中的\E NR D D[蛋白均至少含有一个g+T#->F G=`F结构域!&%个蛋白中的&#个蛋白含有!个g+T#->F G=`F结构域!只有\E NR D D["&%\E NR D D["!%\E NR D D[&"%\E? NR D D[&#只含有&个g+T#->F G=`F结构域"图##,K利用g D g D网址分析\E NR D D[蛋白序列的保守基序"图'#!结果显示!除\E NR D D[&<外!其他蛋白都含有'个以上的保守基序,其中!\E NR D D[&$和\E NR D D["'含有全部的C 个基序,另外!基序'被&<个蛋白所含有!是含有量最多的基序(而基序C仅有#个蛋白含有!是含有量最少的基序,此外!结果还显示具有相同或者相似保守基序的蛋白!比如\E NR D D["#% \E NR D D["C和\E NR D D["(!\E NR D D[&&和\E NR D D[&!!\E NR D D["<和\E NR D D["%被聚集到相同的组中的可能性更大,-#($&-寿伟松!等/甜瓜NR D D[基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析图;<甜瓜9C4^M M D基因在染色体上的定位=)1>;K[*W6*]H E H>H E W G H6F G=0F+=H2H B9C4^M M D=2E W G H2表;<甜瓜9C4^M M D基因的特征,80#;K\*F]F6+W]=>+=6>H B+*W9C4^M M D S W2W>=2E W G H2基因名称Z W2W2F E W 基因:8Z W2W:8染色体位置\*]H E H>H E WG H6F+=H2氨基酸长度_]H+W=2G W2S+*-F F跨膜结构域[]F2>E W E5]F2W^H E F=2>亚细胞定位NV56W G G VG F]G H6F G=0F+=H2蛋白分子量g H G W6VG F].W=S*+-dV等电点:>H W G W6+]=6,H=2+9C4^M M D"&g D P9#\"!%"%<;!6*]""$!##&"<'//!###(C#"b#!"''细胞膜_G F>E F E W E5]F2W!!;$#C;#C9C4^M M D"!g D P9#\"""!"";!6*]""$&"<C""'<//&"<C!$<<"b#&(#'液泡膜j H6VH G W E W E5]F2W!&;<&C;"!9C4^M M D"#g D P9#\"!<&C';!6*]"!$!<C<$'%!//!<C<%#(%")#!(<%细胞膜_G F>E F E W E5]F2W##;"&(;$(9C4^M M D"'g D P9#\"!<&C#;!6*]"!$!<C%!'#&//!<C%'&"$")#!(%%细胞膜_G F>E F E W E5]F2W##;#$C;<(-'($&-浙江农业学报K第#$卷K第%期续表&\H 2+=2VW ^[F 5G W &基因名称Z W 2W 2F E W基因:8Z W 2W :8染色体位置\*]H E H >H E W G H 6F +=H 2氨基酸长度_]H +W =2G W 2S +*-F F跨膜结构域[]F 2>E W E 5]F 2W ^H E F =2>亚细胞定位NV56W G G VG F ]G H 6F G =0F +=H 2蛋白分子量g H G W 6VG F ].W =S *+-dV 等电点:>H W G W 6+]=6,H =2+9C 4^M M D "$g D P 9#\""C'&%;!6*]"#$$%'('#&//$%$%%C#"b #!$!%细胞膜_G F >E F E W E 5]F 2W !%;<<';$"9C 4^M M D "<g D P 9#\""(($&;!6*]"'$!%C'!%'#//!%C'%(%$")#!'C %细胞膜_G F >E F E W E 5]F 2W !C;!"C;("9C 4^M M D "%g D P 9#\""(($";!6*]"'$!%C$$"!%//!%C$%$%"")#!#'%细胞膜_G F >E F E W E 5]F 2W!<;"!C;<<9C 4^M M D "C g D P 9#\""C<%';!6*]"$$&<(!!//&<(!<%"#")#!<!%细胞膜_G F >E F E W E 5]F 2W#";"((;#'9C 4^M M D "(g D P 9#\"#&!#!;!6*]"$$&<('"&'!//&<('##""")#!&!<细胞膜_G F >E F E W E 5]F 2W!';#"&";!"9C 4^M M D &"g D P 9#\""';!6*]"$$!$###(($//!$##$<%#")#&$&$液泡膜j F 6VH G W E W E 5]F 2W&<;$(C;C'9C 4^M M D &&g D P 9#\"&<!$(;!6*]"%$!!C'"&$C //!!C'#&<!"b #!<!%细胞膜_G F >E F E W E 5]F 2W!(;"C (;!C 9C 4^M M D &!g D P 9#\""$%$C;!6*]"($!'"!##''//!'"!$(<<"b #!<$%细胞膜_G F >E F E W E 5]F 2W!(;&$&";"'9C 4^M M D &#g D P 9#\""$C<(;!6*]"($!'C%&&%%//!'C%'"&C "b #!"C $细胞膜_G F >E F E W E 5]F 2W!#;$&(;&$9C 4^M M D &'g D P 9#\"!!#'&;!6*]&&$#!(C"&$$//#!(C!'CC ")#!%#<细胞膜_G F >E F E W E 5]F 2W#";CC (;#%9C 4^M M D &$g D P 9#\""!#C&;!6*]&!$!''$&'(#//!''$#'"#"b #!(&%内质网D 2^H ,G F >E =6]W +=6VG VE#!;C%<;($9C 4^M M D &<g D P 9#\""!#C";!6*]&!$!''<&<($//!''<#<'""b #!'!$细胞膜_G F >E F E W E 5]F 2W!%;#C (;!!9C 4^M M D &%g D P 9#\""!!$<;!6*]&!$!$#"%$#<//!$#"C%%$")#&C#$细胞膜_G F >E F E W E 5]F 2W!&;"#(;<%图@<甜瓜9C 4^M M D 基因结构分析=)1>@KZ W 2W >+]V6+V]W F 2F G 3>=>H B 9C 4^M M D =2E W G H 2-$($&-寿伟松!等/甜瓜NR D D [基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析蓝色方块代表跨膜结构域/i G VW >JVF ]W >]W ,]W >W 2++]F 2>E W E 5]F 2W ^H E F =2>/图A<甜瓜\E NR D D [蛋白结构=)1>A K_]H +W =2>+]V6+V]W H B \E NR D D [=2E W G H2O !甜瓜\E NR D D [蛋白进化分析(i !甜瓜\E NR D D [蛋白保守基序分析,O !_*3G H S W 2W +=6+]W W H B \E NR D D [=2E W G H 2(i !\H 2>W ]`W ^E H +=B >H B \E NR D D [=2E W G H 2/图B<甜瓜\E NR D D [蛋白进化和保守基序分析=)1>B K_*3G H S W 2W +=6F 2F G 3>=>F 2^6H 2>W ]`W ^E H +=B >H B \E NR D D [=2E W G H 2!;#K植物中NR D D [蛋白的系统进化分析本研究利用拟南芥%黄瓜和甜瓜中NR D D [蛋白构建了系统发育树!来阐明该家族在植物中的进化关系,进化树表明!这些NR D D [蛋白被-<($&-浙江农业学报K 第#$卷K 第%期分成'个亚族"图$#,绝大多数成员被聚类在亚族#和$中,其中!亚族#包含C个O+NR D D[蛋白%C个\>NR D D[蛋白和%个\E NR D D[蛋白,亚族$含%个O+NR D D[蛋白%<个\>N? R D D[蛋白和%个\E NR D D[蛋白,亚族-包含!个O+NR D D[%!个\>NR D D[和!个\E NR D D[,而亚族%成员最少!且只包含来自甜瓜的&个"\E NR D D["&#和黄瓜的&个"\>NR D D[&%F#成员!这表明亚族%很可能是一个葫芦科特有的亚族!在进化和功能上具有特异的作用,!;'K甜瓜9C4^M M D基因的顺式作用元件分析为了解9C4^M M D基因对各种因素的响应!我们分析了9C4^M M D基因上游启动子的顺式调节元件,结果发现!在9C4^M M D基因启动子中发现许多与激素响应%应激响应%发育相关以及光响应的元件"表!%表#%表'#,激素响应元件包含!种脱落酸响应元件"O i a D和Z\?E H+=B#%&种生长激素响应元件"[Z O?W G W E W2+#%!种茉莉酸甲酯响应元件"\Z[\O?E H+=B和[Z O\Z?E H+=B#%!种赤霉素响应元件"Z O a D?E H+=B和_?5H4#和&种水杨酸响应元件"[\O?W G W E W2+#"表!#,其中!脱落酸响应元件"O i a D#数目最多!在&'个9C N4^M M D基因的启动子上均被检测到,应激响应元件包含了&种厌氧响应元件"O a D#%!种干旱响应元件"g i N和g@\#%&种伤害响应元件"R X T?E H+=B#和#种防御和胁迫响应元件"g@i% R?5H4和[\?]=6*W G W E W2+#"表##,其中!g@\和g@i元件在所有的9C4^M M D基因的启动子上均图C<基于拟南芥 黄瓜和甜瓜中的NR D D[蛋白的系统发育树=)1>C K_*3G H S W2W+=6+]W W H B NR D D[>B]H EO]F5=^H,>=> 6V6VE5W]F2^E W G H2-%($&-寿伟松!等/甜瓜NR D D[基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析有分布!这暗示了9C 4^M M D 基因可能参与甜瓜干旱和防御的响应过程,光响应元件涉及种类众多!9C 4^M M D 基因的启动子上均有分布"表'#,其中!i H 4'和Z ?5H 4是9C 4^M M D 基因的启动子上含有的最多的!个元件,发育相关的响应元件包含与分生组织表达相关"\O [?5H 4#%昼夜节律调节"6=]6F ^=F 2#%叶肉细胞分化"Y 8?e =,:#%黄酮类生物合成"g i N:#%玉米醇溶蛋白代谢调节"9!?>=+W #%胚乳发育相关"Z \T 'pE H +=B #和种子特异性调节"a @?W G W E W 2+#响应元件,这些结果表明!9C 4^M M D 基因通过各种环境适应参与多种生理过程,!;$K 甜瓜9C 4^M M D 基因的组织表达以及响应枯萎病和白粉病的表达分析为研究9C 4^M M D 基因在不同器官中的转录表达水平!本研究对其在甜瓜品种\*F ]W 2+F =>的表@<甜瓜9C 4^M M D 基因启动子上激素和应激相关顺式作用元件,80#@K 9'/?W G W E W 2+>=2+*W ,]H E H +W ]>H B ,V+F +=`W 9C 4^M M D S W 2W >+*F +F ]W ]W G F +W ^+H *H ]E H 2W F 2^>+]W >>]W >,H 2>W >基因名称Z W 2W 2F E W激素响应相关元件数量T VE 5W ]H B *H ]E H 2W ]W >,H 2>W ?]W G F +W ^W G W E W 2+应激响应相关元件数量T VE 5W ]H B >+]W >>]W >,H 2>W ?]W G F +W ^W G W E W 2+O i a D [Z O ?W G W E W 2+\Z [\O ?E H +=B[Z O \Z ?E H +=B Z O a D ?E H +=B _?5H 4[\O ?W G W E W 2+O a DZ \?E H +=B g i N[\?]=6*]W ,W F +>R X T ?E H +=B g @i g @\R?5H 49C 4^M M D "&""&&""&"""&"!&"9C 4^M M D "!#"&&&""&""&"#!"9C 4^M M D "##"&&&"&#"&""'!&9C 4^M M D "'&""""&&!""""'#"9C 4^M M D "$#""""""&""""<&"9C 4^M M D "<"&!!"""&"&&"!'&9C 4^M M D "%&!&&""""""""&!"9C 4^M M D "C %!"""""#&"""&#"9C 4^M M D "(&!&&""'$""&&#'#9C 4^M M D &"""&&"""#""!$&'"9C 4^M M D &&&"!!""""""!"!%"9C 4^M M D &!&"!!""&!""""!!"9C 4^M M D &#!""""!"&""""''&9C 4^M M D &'&""""&&&"&&"!'"9C 4^M M D &$#""&"&"!"""&&!&9C 4^M M D &<&&"""&&!""&"!!"\E4^M M D &%""""""&#"&&"'#"表A<甜瓜9C 4^M M D 基因启动子上光响应相关顺式作用元件,80#A K 9'/?W G W E W 2+>=2+*W ,]H E H +W ]>H B ,V+F +=`W 9C 4^M M D S W 2W >+*F +F ]W ]W G F +W ^+H G =S *+]W >,H 2>W基因名称Z W 2W 2F E W光响应相关元件数量T VE 5W ]H B G =S *+]W >,H 2>W ?]W G F +W ^W G W E W 2+Z O [O ?E H +=BO [\?E H +=B Z F ,?5H 4O \D i H 4'g a D #?O A &5=2^=2S >=+W Z O ?E H +=B [\\\?E H +=B O [\[?E H +=B :?5H 4P ?5H 4[\[?E H +=B Z ?5H 46*>?\g O &F O [&?E H +=B O D ?5H 4Z [&?E H +=B O O O \?E H +=B9C 4^M M D "&!"""C """"&"""&&&""&9C 4^M M D "!"""""""""""""!"""""9C 4^M M D "#""""""""""""&#&""!"9C 4^M M D "'&"""'"""""&""!"""&&9C 4^M M D "$""""!"""&"""&#&&"&"9C 4^M M D "<!""&'""&&"!""""""""9C 4^M M D "%""""%"""""""!&"""!"9C 4^M M D "C &"""'"""""&"&#""&""9C 4^M M D "(""""!&&"""""&&"""""9C 4^M M D &"&"""#!&"""""'""""""9C 4^M M D &&#"""&&""""""!&"""""9C 4^M M D &!&""&!"""""&""&""&&"9C 4^M M D &#!"""&&"""""""!&""!"9C 4^M M D &'""&"!"""""""!&""&""9C 4^M M D &$""&&%&"""""&!'"&"!"9C 4^M M D &<!"""!""&&""""&"""'"\E 4^M M D &%"&""'&"&"&""""&"!""-C ($&-浙江农业学报K 第#$卷K 第%期表B<甜瓜9C 4^M M D 基因启动子上发育相关顺式作用元件,80#B K 9'/?W G W E W 2+>=2+*W ,]H E H +W ]>H B ,V+F +=`W 9C 4^M M D S W 2W >+*F +F ]W ]W G F +W ^+H ^W `W G H ,E W 2+基因名称Z W 2W 2F E W 发育相关元件数量T VE 5W ]H B ^W `W G H ,E W 2+?]W G F +W ^W G W E W 2+\O [?5H 46=]6F ^=F 2Y 8?e =,&g i N:9!?>=+W Z \T 'pE H +=B a @?W G W E W 2+9C 4^M M D "&&""""""9C 4^M M D "!"""""""9C 4^M M D "#""""&""9C 4^M M D "'"""""""9C 4^M M D "$""&"&""9C 4^M M D "<&&"""""9C 4^M M D "%"""""&"9C 4^M M D "C """""""9C 4^M M D "("&"""""9C 4^M M D &""""&"""9C 4^M M D &&&""""""9C 4^M M D &!"""""""9C 4^M M D &#"&""&"&9C 4^M M D &'""""&""9C 4^M M D &$"""&&""9C 4^M M D &<"""&"""\E 4^M M D &%"&"""""根%叶%果实以及雌花和雄花中的a T O ?NW J 数据进行了分析,热图反映了9C 4^M M D 基因的表达模式!结果显示!除了9C 4^M M D "C 和9C N 4^M M D "(!其他9C 4^M M D 成员都可以在一个或者几个器官组织中被检测到"图<?O #,相比于叶和果实!雌花%雄花和根中检测到的基因较多,其中!9C 4^M M D "$和9C 4^M M D &'在雄花中有显著的E a T O 积累!9C 4^M M D &#在果实中的表达量较高,为了进一步探究9C 4^M M D 基因在果实不同发育时期的表达情况!本研究分析了绿肉和橙肉甜瓜"来源于8VG 6W 与[F E ?8W .杂交的A #群体#的a T O ?NW J 数据,结果发现!9C N 4^M M D "&%9C 4^M M D "#%9C 4^M M D &&和9C N4^M M D &#在甜瓜不同果实发育时期的表达量均比较高!而9C 4^M M D "$在果实发育早期表达量较高!9C 4^M M D &#在果实成熟期表达量较高,除此之外!其他9C 4^M M D 基因在果实发育时期表达量都较低"图<?i #,为了探究9C 4^M M D 基因对生物胁迫的响应!本研究分析了抗病品种T O 8和感病品种)S ]W W 2p *和)H ]F 2S W p *表示8VG 6W 与[F E ?8W .杂交的A #群体中的绿肉和橙肉甜瓜,)S ]W W 2p *F 2^)H ]F 2S W p *]W ,]W >W 2+S ]W W 2?F 2^H ]F 2S W ?B G W >*W ^E W G H 2>=2+*W A #,H,VG F +=H 26]H >>W ^5W +.W W 28VG 6W F 2^[F E ?8W ./图D<甜瓜9C 4^M M D 基因在不同组织 O 和不同果实发育时期 i 的表达热图=)1>D KD 4,]W >>=H 2*W F +E F ,H B 9C 4^M M D S W 2W >=2^=B B W ]W 2++=>>VW > O F 2^F +^=B B W ]W 2+B ]V=+^W `W G H ,E W 2+F G ,W ]=H ^> i-(($&-寿伟松!等/甜瓜NR D D [基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析\*F ]W 2+F =>?["\Y [#的茎组织对枯萎病响应的a T O ?NW J 数据,结果显示!感染尖孢镰刀菌!'*后!抗病品种T O 8中9C 4^M M D &!%9C 4^M M D &#%9C 4^M M D &'和9C 4^M M D &$有一个稍显著的表达下降外!其他9C 4^M M D 基因表达变化不大(感病品种\Y [中9C 4^M M D &'的表达量出现明显下降"图%?O #,感染尖孢镰刀菌'C *后!9C N 4^M M D "<%9C 4^M M D "%%9C 4^M M D &"%9C N 4^M M D &#和9C 4^M M D &$在抗病品种T O 8中表现出表达下降!而9C 4^M M D "$%9C N 4^M M D "<%9C 4^M M D "(%9C 4^M M &"和9C N4^M M &!在感病品种\Y [中则表现出上调表达,另外!本研究利用品种a H 6*W +幼叶的a T O ?NW J 数据分析其对白粉病的响应,结果显示!在白粉病菌G 1A1/O ,$*&$5$.#,''侵染!'*后!9C N 4^M M D "&%9C 4^M M D "!%9C 4^M M D "$和9C N 4^M M D &<的表达量上升(9C 4^M M D "'%9C N 4^M M D &"%9C 4^M M D &'和9C 4^M M D &$表达下调(侵染'C *后!整体情况与侵染!'*差不多!但9C 4^M M D &"却表现出表达上调(侵染%!*后!9C 4^M M D "&%9C 4^M M D "$和9C 4^M M D &'呈现出表达上调"图%?i #,T O 8和\Y [为甜瓜两个品种(A 9g 代表尖孢镰刀菌B ?3&;!侵染(6H 2+]H G 代表空对照(\E 代表9("(C '/C *)1(\U 代表空对照(_g 代表白粉病菌侵染,T O 8F 2^\Y [F ]W +.H `F ]=W +=W >H B E W G H 2(A 9g]W ,]W >W 2+>B (/$&'(C158/O 1&(CB ?3&;!=2H 6VG F +W ^(6H 2+]H G ]W ,]W >W 2+>E H 6d +]W F +E W 2+(\E]W ?,]W >W 2+>9("(C '/C *)1(\U]W ,]W >W 2+>E H 6d +]W F +E W 2+(_g ]W ,]W >W 2+>G 1A1/O ,$*&$5$.#,''=2H 6VG F +W ^/图E<甜瓜9C 4^M M D 基因在感染尖孢镰刀菌B ?3&;! O 和白粉病菌G 1A1/O ,$*&$5$.#,'' i 后的表达热图=)1>E KZ W 2W W 4,]W >>=H 2*W F +E F ,H B +*W W 4,]W >>W ^9C 4^M M D S W 2W >F B +W ]5W =2S =2B W 6+W ^.=+*B (/$&'(C 158/O 1&(C B ?3&;! O F 2^G 1A1/O ,$*&$5$.#,'' i#K结论与讨论糖是甜瓜果实积累的主要营养物质!也是甜瓜口感风味和商品价值的重要指标,NR D D [蛋白作为一个新发现的糖转运蛋白家族!可介导韧皮部薄壁组织中的糖流入或流出质外体!进而将糖输送到植物各个器官和组织&%!!"!#&',4^M M D基因已在多种植物中被鉴定!且许多研究表明!4^M M D 基因参与园艺作物果实的发育和成熟阶段的糖转运工作,但目前尚未有NR D D [家族基因在甜瓜中的研究报道,本研究鉴定甜瓜中的4^M M D基因将为今后深入探究4^M M D 基因功能和开发利用该基因家族以辅助甜瓜品质育种奠定基础,真核生物中NR D D [蛋白是由含!个g +T #->F G =`F 结构的%个跨膜结构域组成!不同于原核生物中的NR D D [蛋白仅包含&个g +T #->F G =`F 结构和#个跨膜结构域,Q VF 2等&C '认为!该现象表明真核生物中的NR D D [蛋白是原核生物的g +T #->F G =`F 结构域在进化过程中发生复制融合而形成,本研究通过全基因组搜索!共鉴定出&%个分布在(条染色体上的甜瓜NR D D [蛋白,蛋白结构显示!&%个\E NR D D [中有&#个具有!-""<&-浙江农业学报K 第#$卷K 第%期个完全保守的g+T#->F G=`F域!其余成员只拥有&个g+T#->F G=`F结构域"图##,相似地!在水稻和高粱中也发现一些4^M M D基因"?/4^M M D%$%/4^M M D%*%4S4^M M D#和4S4^M M D'#只含有&个g+T#->F G=`F结构域&&&',另外!与许多植物如大豆%黄瓜和西瓜中的部分4^M M D基因相似! 9C4^M M D"#和9C4^M M D"'%9C4^M M D"<和9C4^M M D"%%9C4^M M D"C和9C4^M M D"(%9C N4^M M D&$和9C4^M M D&<在相同的染色体上展现出串联重复排列"表&#&(!&<!!'',这些结果表明!NR D D[蛋白在进化过程中可能会发生复制%融合或遗传丢失,基于拟南芥NR D D[系统分类!甜瓜的NR D D[蛋白也被分为'个进化支"图$#,与此前分类不同的是!本研究中的分支#包含了拟南芥的#和$两个亚族!分支$与拟南芥的亚族%相同!分支-类与拟南芥的亚族-相同!唯有分支%不包含拟南芥任何一个NR D D[!仅含有黄瓜的\>NR D D[&%F和甜瓜的\E NR D D["&两个蛋白"图$#&!'',这种不同于十字花科的拟南芥中的系统进化现象!很可能是葫芦科植物"尤其是甜瓜和黄瓜上#特有的进化造成的,另外!拟南芥亚族-中的O+NR D D[&<和O+NR D D[&%蛋白被报告定位在液泡膜上!主要运输果糖&#&',本研究发现!与其聚类在同亚族的\E NR D D[!和\E NR D D[&"也被预测定位于液泡膜"表&#!这表明尽管本研究中的进化分类与拟南芥中的分类不同!但具有相似功能的蛋白依然被划分到同一个亚家族中,作为渗透压保护剂和分子开关!糖参与调节植物胁迫下的抗性和适应性&#!',研究发现!拟南芥的!#4^M M D'%!#4^M M D&&和!#4^M M D&!基因等参与响应各种非生物胁迫&!%)!C',在本研究中!所有的9C4^M M D基因的启动子区域都含有与胁迫"包括厌氧%干旱%伤害和防御#相关的元件!这表明9C4^M M D基因可能在参与调控甜瓜的非生物胁迫中起着重要作用,另外!9C4^M M D 基因的启动子区域还包含许多激素响应相关的元件!该发现不仅丰富了9C4^M M D基因的特点!也为后期开展9C4^M M D基因通过介导激素参与调节甜瓜生长发育研究提供了思路,许多研究表明!4^M M D基因多在花"尤其是雄花#和果实中高表达,在本研究中!多个9C N4^M M D基因在雄花中的表达量高于其他组织!这与之前报道一致,其中!9C4^M M D"$%9C N4^M M D"%和9C4^M M D&'基因在雄花中的表达量显著高于其他组织!暗示了这#个基因可能参与花粉的发育和花蜜的分泌,值得注意的是!组织表达a T O?NW J数据显示!除了9C4^M M D&&和9C4^M M D&#!大多数的9C4^M M D基因在果实中的表达量较低!但果实发育不同时期转录组数据结果显示!部分9C4^M M D基因在果实膨大期或者成熟期有较高的表达,本研究猜测两个结果不一致源于组织取样的差异,而9C4^M M D"&% 9C4^M M D"#%9C4^M M D"$%9C4^M M D&&和9C N4^M M D&#基因在果实发育时期的高表达暗示它们在甜瓜果实的生长发育过程中起着重要作用,为了生长和繁殖!许多病原体已经进化出通过影响糖外排系统而从宿主获得葡萄糖的机制,因此!病原体能够改变感染部位的糖外排系统来调节植物免疫&#',枯萎病是由尖孢镰刀菌引起的一种主要的土壤传播疾病!它定居于根和茎组织的外维管系统!严重破坏甜瓜的生长&##',与许多作物中4^M M D表达相似!本研究中的9C N4^M M D基因在感染尖孢镰刀菌后在抗病品种和感病品种之间表现出不同的表达模式,在感染!'*后!抗病品种中有'个9C4^M M D基因下调表达(感病品种中只有9C4^M M&'基因下调表达,在感染'C*后!抗病品种中下调基因增加到$个!而感病品种中的部分9C4^M M D基因却表现出上调表达,其中!9C4^M M D"<和9C N4^M M D&"基因在抗病和感病品种中表现出相反的表达趋势!暗示它们可能在甜瓜抗枯萎病中发挥关键作用,白粉病是甜瓜生产中主要真菌病害之一!严重危害甜瓜产量与品质&#'',本研究发现有<个基因能够被白粉病菌侵染诱导表达"图%?i#!表明他们在白粉病侵染过程中发挥正调控作用,其中!9C4^M M"&和9C4^M M"$基因在白粉病侵染的早%中和晚期的表达量均会上调!暗示这!个基因在响应白粉病的过程中有重要作用,参考文献 H#"#*#+$#&&&'Ka X O T@P!7:T@!@O T Z@7!W+F G/NVS F]=2,V+!E W+F5H?-&"<&-寿伟松!等/甜瓜NR D D[基因家族的全基因组鉴定及生物信息学分析Copyright©博看网. All Rights Reserved.。
广西厚皮甜瓜根腐病病原菌鉴定及抗病种质筛选作者:叶云峰,解华云,杜婵娟,李天艳,赵廷昌,杨迪,覃斯华,黄金艳,洪日新,何毅,付岗来源:《中国瓜菜》2022年第04期摘要:根腐病是近年上升为广西地区大棚厚皮甜瓜生产上的重要病害,严重影响甜瓜产业的健康发展。
为明确该病害病原菌的分类地位并获得抗病种质材料,对病原菌进行分离纯化和致病性测定,结合形态学和分子生物学特征对病原菌进行分类鉴定,并通过苗期抗病性鉴定方法筛选抗病种质材料。
结果表明,致病菌株的菌落和分生孢子形态特征与前人报道的腐皮镰孢菌(Fusarium solani)一致。
基于rDNA-ITS序列构建系统发育树,致病菌株与腐皮镰孢菌聚于同一最小分支,据此将广西厚皮甜瓜根腐病的病原菌鉴定为腐皮镰孢菌。
从27份厚皮甜瓜种质材料中,筛选到抗性水平为高抗的材料3份,分别为M87、M102和M125;抗性水平为抗的材料6份,分别为M23、M78、M84、M100、M112和M123。
明确了广西地区的根腐病病原菌种类,筛选出高抗根腐病的厚皮甜瓜种质资源,为选育抗根腐病的厚皮甜瓜新品种奠定了基础。
关键词:厚皮甜瓜;根腐病;分离鉴定;腐皮镰孢菌;抗病性中图分类号:S652 文献标志码:A 文章编号:1673-2871(2022)04-027-06Pathogen identification and disease resistant germplasm screening of melon root rot in GuangxiYE Yunfeng1, XIE Huayun1, DU Chanjuan2, LI Tianyan1, ZHAO Tingchang3, YANG Di2, QIN Sihua1, HUANG Jinyan1, HONG Rixin1, HE Yi1, FU Gang2(1. Horticultural Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences, Nanning 530007, Guangxi, China; 2. Institute of Plant Protection, Guangxi Academy of Agricultural Sciences, Nanning 530007,Guagnxi, China; 3. Institute of Plant Protection, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Beijing 100093, China)Abstract: Melon root rot has become an important disease in Guangxi in recent years, which seriously affects the healthy development of melon production. In this study, the pathogen was isolated and purified, the pathogenicity was tested, and identification was performed using both morphological and molecular characteristics. Furthermore, melon germplasm materials were screened for resistance by seedling tests. The results showed that the morphological characteristics of colony and conidia of the pathogenic strains were consistent with those of Fusarium solani. The phylogenetic tree constructed based on rDNA-ITS sequence show that the pathogenic strains and F. solani clustered in the same smallest branch. Therefore, the pathogen causing melon root rot in Guangxi was F. solani. Among 27 melon germplasm tested, M87, M102 and M125 showed high resistance level to the pathogen, and M23, M78, M84, M100, M112 and M123 showed resistant level. The pathogen species of melon root rot in Guangxi area was determined, and the resistant melon germplasm were identified in this study. Our research laid the foundation for the breeding of melon varieties resistant to root rot.Key words: Muskmelon; Root rot; Isolation and identification; Fusarium solani; Disease resistance厚皮甜瓜(Cucumis melo L. ssp. melo)是廣西地区重要的园艺作物和经济作物,栽培面积约0.67万hm2,南宁市和北海市为主要种植区,柳州市、来宾市、桂林市等地区也有少量种植。