基因敲除方法专题-郭..
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基因敲除技术的方法
基因敲除技术是一种利用CRISPR-Cas9系统对细胞基因进行定向编辑和删除的新技术。
该技术可以帮助研究人员研究基因功能和疾病发生机制,以及开发新的治疗方法。
基因敲除技术的方法主要包括以下几个步骤:
1. 设计sgRNA:首先需要选择待敲除的基因,然后设计合适的sgRNA序列。
sgRNA是一种小RNA分子,能够将Cas9蛋白精确地指向目标基因,并切割该基因的DNA序列。
2. 转染sgRNA和Cas9:将sgRNA和Cas9蛋白导入目标细胞中。
通常采用的方法有脂质体转染、电穿孔转染等。
3. 筛选细胞:利用细胞内的修复机制,CRISPR-Cas9系统会在目标基因处切割DNA序列,并引起细胞的修复。
通过筛选,可以获得已经敲除目标基因的细胞。
4. 鉴定敲除效果:可以采用PCR、Western blot、qPCR等技术检测目标基因是否已被完全删除。
通过基因敲除技术,研究者能够研究目标基因对某种生物功能的影响,以及对疾病发生的贡献。
这一技术被广泛应用于生命科学研究领域,并在基因治疗等领域也具有广阔的应用前景。
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基因敲除实验步骤嘿,咱今儿就来讲讲基因敲除实验这档子事儿!你想啊,这基因就好比是生物体的一套神秘密码,而基因敲除呢,就是要去修改或者删掉其中的一些关键部分。
这可不容易,但别怕,咱一步一步来。
首先呢,得选好你要敲除的那个基因,这就像是在茫茫密码本里找到你要动的那一部分,得精准,可不能找错咯。
然后,设计出专门针对这个基因的工具,就像是一把特制的小钥匙,能准确地去开启或者关闭这个基因。
接下来,就是把这个工具送到细胞里面去。
这可不是随便就能送进去的呀,得用些巧妙的办法,比如利用一些载体,就好像给这把小钥匙找了个合适的交通工具,让它能顺利到达目的地。
到了细胞里,这工具就开始发挥作用啦!它会找到目标基因,然后按照我们的设计,要么把它删掉,要么让它失去功能。
这过程中,可得时刻留意着,看看是不是真的敲除成功了。
怎么看呢?那就得用各种检测手段啦,就像给细胞做个体检,看看那个基因是不是真的被搞定了。
你说这像不像一场和基因的小战斗?我们就是那指挥作战的将军,得精心策划每一步,稍有不慎可就前功尽弃啦!而且啊,这实验可不是一次就能成功的哟,有时候可能得反复尝试好多回呢。
就跟你学骑自行车似的,一开始总会摔倒,但多练几次不就会了嘛。
在做基因敲除实验的时候,还得特别小心,别一不小心敲错了其他基因,那可就麻烦大啦!这就好比你本来想去剪个头发,结果一剪刀下去,把耳朵给剪了,那可不行呀!总之呢,基因敲除实验是个精细活儿,需要我们有耐心、有技术、还要有那么一点点运气。
但一旦成功了,那可就太有成就感啦!说不定还能为科学研究做出大贡献呢!所以呀,别害怕,大胆去尝试,说不定你就是下一个基因敲除大师哟!。
基因敲除技术的原理、方法和应用2010-01-24 17:03:43 来源:易生物实验浏览次数:6302 网友评论 0 条1.基因敲除概述2.实现基因敲除的多种原理和方法:2.1.利用基因同源重组进行基因敲除 2.2利用随机插入突变进行基因敲除。
2.3.RNAi引起的基因敲除。
3.基因敲除技术的应用及前景4.基因敲除技术的缺陷关键词:基因敲除1.基因敲除概述:基因敲除是自80年代末以来发展起来的一种新型分子生物学技术,是通过一定的途径使机体特定的基因失活或缺失的技术。
通常意义上的基因敲除主要是应用DNA同源重组原理,用设计的同源片段替代靶基因片段,从而达到基因敲除的目的。
随着基因敲除技术的发展,除了同源重组外,新的原理和技术也逐渐被应用,比较成功的有基因的插入突变和iRNA,它们同样可以达到基因敲除的目的。
2.实现基因敲除的多种原理和方法:2.1.利用基因同源重组进行基因敲除基因敲除是80年代后半期应用DNA同源重组原理发展起来的。
80年代初,胚胎干细胞(ES细胞)分离和体外培养的成功奠定了基因敲除的技术基础。
1985 年,首次证实的哺乳动物细胞中同源重组的存在奠定了基因敲除的理论基础。
到1987年,Thompsson首次建立了完整的ES细胞基因敲除的小鼠模型 [1]。
直到现在,运用基因同源重组进行基因敲除依然是构建基因敲除动物模型中最普遍的使用方法。
2.1.1利用同源重组构建基因敲除动物模型的基本步骤(图1):a.基因载体的构建:把目的基因和与细胞内靶基因特异片段同源的DNA 分子都重组到带有标记基因(如neo 基因,TK 基因等)的载体上,成为重组载体。
基因敲除是为了使某一基因失去其生理功能,所以一般设计为替换型载体。
b.ES 细胞的获得:现在基因敲除一般采用是胚胎干细胞,最常用的是鼠,而兔,猪,鸡等的胚胎干细胞也有使用。
常用的鼠的种系是129及其杂合体,因为这类小鼠具有自发突变形成畸胎瘤和畸胎肉瘤的倾向,是基因敲除的理想实验动物。
简述基因敲除技术操作方法
基因敲除技术是将某一特定基因在细胞或生物体中进行完全或部分去除或失活的一种基因编辑技术。
操作步骤:
1. 设计sgRNA:首先,为目标基因设计合适的sgRNA (single guide RNA)序列。
sgRNA由两个部分组成,一个是能够结合到Cas9蛋白上的常规RNA序列,另一个是与目标基因靶向结合的特定RNA序列。
2. 获得Cas9蛋白:将Cas9基因导入目标细胞中,通过蛋白质合成过程获得Cas9蛋白。
3. sgRNA和Cas9蛋白配对:将sgRNA分别与Cas9蛋白组装在一起,形成"CRISPR-Cas9复合物"。
4. 将CRISPR-Cas9复合物导入目标细胞:利用一些常见的基因转染技术或选择性培养细胞系等方法将该复合体导入目标细胞。
5. 分析基因敲除效果:使用PCR,Western印迹、等手段来确定基因是否被去除、缺失或失活。
需要注意的是,基因敲除技术可以有效地诱导基因缺失或失活,但有时它也可能导致同源重组或非同源重组,使得去除那些不想去除的基因或区域。
因此,在实验操作时,必须谨慎考虑sgRNA的设计和基因敲除效果的确定方法。
基因敲除技术的主要方法和步骤有哪些?基因敲除是用含有一定已知序列的DNA片段与受体细胞基因组中序列相同或相近的基因发生同源重组,整合至受体细胞基因组中并得到表达的一种外源DNA导入技术。
它是针对某个序列已知但功能未知的序列,改变生物遗传基因,令特定的基因功能丧失,从而使部分功能被屏蔽,并可进一步对生物体造成影响,进而推测出该基因的生物学功能。
目前能实现基因敲除的方法有:1.运用基因同源重组进行基因敲除(1)步骤方法A 构建基因载体:把目的基因和与细胞内靶基因特异片段同源的DNA 分子都重组到带有标记基因的载体上,使之成为重组载体,常用的标记基因有:neo 基因、TK 基因等。
根据实验目的不同,打靶载体分为全基因敲除、条件敲除、基因敲进、诱导性基因敲除等打靶载体。
B获得胚胎干细胞:现在基因敲除一般采用是胚胎干细胞,最常用的是鼠,而兔、猪、鸡等的胚胎干细胞也有使用。
基因敲除一般应用于鼠,常用的鼠的种系是129及其杂合体,因为这类小鼠具有自发突变形成畸胎瘤和畸胎肉瘤的倾向,是基因敲除的理想实验动物。
有些科研机构和单位已经运用C57BL/6遗传背景的小鼠的胚胎干细胞进行基因打靶,广泛运用于免疫学、神经学、癌症等领域。
C同源重组:将重组载体通过一定的方式(电穿孔法或显微注射)导入同源的胚胎干细胞(ES cell)中,使外源DNA 与胚胎干细胞基因组中相应部分发生同源重组,将重组载体中的DNA 序列整合到内源基因组中,从而得以表达。
一般来说,显微注射命中率较高,但技术难度较大,电穿孔命中率比显微注射低,但操作便利。
D筛选已表达的细胞:由于基因转移的同源重组自然发生率极低,因此要从众多细胞中筛出真正发生了同源重组的胚胎干细胞。
目前常用的方法有:正负筛选法(PNS法)、标记基因的特异位点表达法以及PCR 法,其中应用最多的是PNS法。
E 性状观察:通过观察重组小鼠的生物学形状的变化进而了解目的基因变化前后对小鼠的生物学形状的改变,达到研究目的基因的目的。
基因敲除的方法
基因敲除是一种实验手段,通过干扰或删除某个基因来研究其对生物体的功能和表达的影响。
以下是常见的基因敲除方法:
1. RNA干扰(RNAi):通过引入特定的双链RNA分子,可以在细胞中诱导RNA干扰复合物(RISC),使其与特定的mRNA序列结合并导致其降解或抑制翻译。
这种方法可以通过合成小分子RNA片段作为外源性RNAi分子,或者通过转染质粒表达RNAi分子来实现基因敲除。
2. 质粒介导的基因敲除:通过构建质粒载体,将基因的反义序列整合到质粒中,并将其导入到目标细胞中。
质粒中的反义序列可以与目标基因的mRNA互补配对,形成双链结构,从而抑制基因的翻译或引起mRNA降解。
3. CRISPR/Cas9系统:CRISPR(Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats)/Cas9
(CRISPR-associated protein 9)系统是一种常用的基因敲除技术。
它利用Cas9酶与特定的单链RNA(sgRNA)结合,形成复合物,该复合物可以与目标基因的DNA序列互补配对,并导致DNA双链断裂。
当细胞修复这些断裂时,可能会引入错误的碱基,导致基因的敲除或功能丧失。
4. 胚胎干细胞敲除:通过基因敲除技术,可以在胚胎干细胞中敲除特定的基因,从而生成敲除该基因的小鼠模型。
这种方法可以用于研究特定基因的功能和生理学过程。
这些基因敲除方法可以在体外或体内进行,并根据具体研究需求
选择最适合的方法。
基因敲除技术(组图)一.概述:基因敲除是自80年代末以来发展起来的一种新型分子生物学技术,是通过一定的途径使机体特定的基因失活或缺失的技术。
通常意义上的基因敲除主要是应用DNA 同源重组原理,用设计的同源片段替代靶基因片段,从而达到基因敲除的目的。
随着基因敲除技术的发展,除了同源重组外,新的原理和技术也逐渐被应用,比较成功的有基因的插入突变和iRNA ,它们同样可以达到基因敲除的目的。
二.实现基因敲除的多种原理和方法:1.利用基因同源重组进行基因敲除基因敲除是80年代后半期应用DNA 同源重组原理发展起来的。
80年代初,胚胎干细胞(ES细胞)分离和体外培养的成功奠定了基因敲除的技术基础。
1985年,首次证实的哺乳动物细胞中同源重组的存在奠定了基因敲除的理论基础。
到1987年,Thompsson首次建立了完整的ES细胞基因敲除的小鼠模型[1]。
直到现在,运用基因同源重组进行基因敲除依然是构建基因敲除动物模型中最普遍的使用方法。
(1)利用同源重组构建基因敲除动物模型的基本步骤(图1):①.基因载体的构建:把目的基因和与细胞内靶基因特异片段同源的DNA 分子都重组到带有标记基因(如neo 基因,TK 基因等)的载体上,成为重组载体。
基因敲除是为了使某一基因失去其生理功能,所以一般设计为替换型载体。
②.ES 细胞的获得:现在基因敲除一般采用是胚胎干细胞,最常用的是鼠,而兔,猪,鸡等的胚胎干细胞也有使用。
常用的鼠的种系是129及其杂合体,因为这类小鼠具有自发突变形成畸胎瘤和畸胎肉瘤的倾向,是基因敲除的理想实验动物。
而其他遗传背景的胚胎干细胞系也逐渐被发展应用。
[2,3]③.同源重组:将重组载体通过一定的方式(电穿孔法或显微注射)导入同源的胚胎干细胞(ES cell)中,使外源DNA 与胚胎干细胞基因组中相应部分发生同源重组,将重组载体中的DNA 序列整合到内源基因组中,从而得以表达。
一般地,显微注射命中率较高,但技术难度较大,电穿孔命中率比显微注射低,但便于使用。
基因敲除步骤范文基因敲除通过删除或抑制目标基因来研究该基因的功能和作用。
以下是基因敲除的基本步骤:1. 设计RNA干扰(RNAi)或小分子干扰(siRNA):-首先,需要了解目标基因的序列和结构。
可以使用基因组数据库来获取这些信息。
-设计能够特异性沉默目标基因的短RNA序列。
这些短RNA将会与目标mRNA的互补序列形成双链结构,并导致目标mRNA的降解或转译后调节。
- 确保设计的RNAi或siRNA具有足够的选择性,以避免对其他相关基因的影响。
2. 合成RNAi或siRNA:- 根据设计的RNAi或siRNA序列,可以使用化学合成方法合成RNAi或siRNA。
- 确保合成的RNAi或siRNA质量良好,并且没有污染物。
3.转染细胞或生物体:-使用的细胞系或生物体应该与目标基因相关,以确保敲除效果的有效性。
- 可以通过转染方法将合成的RNAi或siRNA导入细胞,如使用转染试剂或电穿孔。
4.分析基因沉默效果:- 在转染RNAi或siRNA后,需要进行一系列实验来分析基因的敲除效果。
-最常见的方法之一是实时定量PCR(qPCR),用于检测目标mRNA水平的降低。
- 另一种常用的方法是Western blot或免疫组织化学染色,用于检测目标蛋白质的水平。
5.分析表型变化:-基因敲除可能会导致细胞或生物体出现表型变化。
-可以使用细胞增殖、分化、凋亡等实验来分析这些表型变化。
-对于整个生物体,可以通过观察生物体级表型如外观、发育、行为等方面的变化来分析基因敲除的效果。
6.验证实验结果:-要验证基因敲除的效果,最好进行多个实验并使用不同的方法来检测目标基因的沉默。
-如果实验结果一致,可以得出结论基因敲除有效。
值得注意的是,基因敲除并不总是直接获得所需的结果。
有时候目标基因的功能可能是在特定的细胞或组织中发挥作用的,因此需要使用特异性的敲除方法。
另外,敲除一些基因可能导致细胞或生物体的死亡,所以在应用基因敲除的时候需要小心操作。
基因敲除方法和原理标题:基因敲除方法和原理引言:基因敲除是分子生物学中常用的一种实验方法,通过破坏或删除目标基因,来研究该基因对生物体的功能和表型的影响。
本文将介绍基因敲除的方法和原理,以及其在基因功能研究和疾病治疗中的应用。
一、基因敲除的方法基因敲除的方法主要有两种:第一种是通过体细胞敲除,第二种是通过胚胎干细胞敲除。
1. 体细胞敲除体细胞敲除是在体细胞中敲除目标基因的方法。
其步骤主要包括:选择目标基因,构建敲除载体,将敲除载体导入体细胞,筛选敲除细胞,验证敲除效果。
(1)选择目标基因:根据研究的需要,选择一个具有重要功能或表型的基因作为目标基因。
(2)构建敲除载体:利用重组DNA技术构建含有目标基因敲除所需序列的敲除载体。
敲除载体通常包括两个关键元素:敲除片段和选择标记。
(3)将敲除载体导入体细胞:采用适当的方法,如转染或电穿孔等,将敲除载体导入体细胞中。
(4)筛选敲除细胞:利用选择标记,如抗生素抗性基因,筛选出成功发生基因敲除的细胞。
(5)验证敲除效果:通过PCR、Southern blot等方法验证基因敲除的效果。
2. 胚胎干细胞敲除胚胎干细胞敲除是在胚胎干细胞中敲除目标基因的方法。
其步骤主要包括:选择胚胎干细胞,构建敲除载体,将敲除载体导入胚胎干细胞,筛选敲除细胞,验证敲除效果。
(1)选择胚胎干细胞:选择具有胚胎干细胞特性的细胞作为研究对象。
(2)构建敲除载体:同样利用重组DNA技术构建含有目标基因敲除所需序列的敲除载体。
(3)将敲除载体导入胚胎干细胞:采用适当的方法,如电穿孔或病毒导入等,将敲除载体导入胚胎干细胞中。
(4)筛选敲除细胞:利用选择标记,如抗生素抗性基因,筛选出成功发生基因敲除的胚胎干细胞。
(5)验证敲除效果:通过PCR、Southern blot等方法验证基因敲除的效果。
二、基因敲除的原理基因敲除的原理是通过破坏或删除目标基因,使其无法正常表达或产生功能缺陷,从而观察其对生物体的影响。