逆转录
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单细胞测序逆转录
单细胞测序(Single-cell sequencing)是一种用于研究单个细胞的基因组学、转录组学和表观基因组学的技术。
在单细胞测序中,逆转录(Reverse Transcription)是其中一个关键步骤,主要用于将细胞中的RNA转录成相应的cDNA,以便后续的测序和分析。
逆转录的步骤通常包括以下几个方面:
1.RNA提取:从单个细胞中提取总RNA。
这可以通过不同的方
法实现,如细胞裂解、酶解或使用特定的细胞捕获技术。
2.逆转录反应:使用逆转录酶(reverse transcriptase)对RNA进
行逆转录,将RNA转录成相应的cDNA。
逆转录酶能够合成cDNA链,其方向是与RNA模板相反的。
3.RNA降解:通过加入RNase(核酸酶)等酶来降解RNA模板,
使得只有cDNA链得以保留。
4.二次合成:对得到的cDNA进行二次合成,以增加cDNA的数
量。
在单细胞测序中,逆转录的效率和准确性对后续的数据分析至关重要。
由于单细胞样本的RNA量非常有限,逆转录过程的优化是确保从单个细胞获取高质量数据的关键步骤之一。
单细胞测序技术的不断发展使得研究者能够更全面地理解单个细胞的基因表达和功能,为理解生物学的复杂性提供了强大的工具。
逆转录的概念
逆转录是一种生物学过程,指的是将RNA模板转化为DNA
的过程。
在逆转录过程中,逆转录酶(reverse transcriptase)
催化RNA的逆转录反应,将RNA转录成为相应的DNA串。
这个过程与正常的转录过程相反,正常的转录过程是将DNA
模板转录为RNA。
逆转录在病毒和某些真核生物中普遍存在。
在病毒中,逆转录是病毒复制过程中的关键步骤。
病毒通过侵害寄主细胞,将其RNA转录成为DNA,并将这段DNA插入
寄主基因组中,从而在细胞分裂过程中被复制并传递给细胞的后代。
在某些真核生物中,逆转录也扮演着重要的角色。
例如,在人类体内,逆转录酶参与垂直传递病毒(如HIV)和转座子
(如长末端重复元件,也称为LINE和SINE)的遗传物质。
逆转录是重要的研究工具,可以用于合成cDNA(互补DNA),这是一种重要的实验室技术,用于将RNA转录为相
应的DNA,以便进行基因表达和功能研究。
此外,逆转录酶
还在分子生物学的研究中用于扩增和克隆基因序列。
逆转录的原理和过程
逆转录是一种生物学过程,它将RNA的信息转录回DNA形式。
逆转录的主要步骤包括:
1. 逆转录酶的结合:逆转录酶是一种特殊的酶,它能够将RNA 作为模板,合成相应的DNA链。
逆转录酶首先与RNA结合,形成一个RNA-酶复合物。
2. RNA链的降解:RNA链在逆转录酶的作用下被降解,生成单链RNA和DNA链的杂交。
3. DNA链合成:逆转录酶利用RNA链作为模板,合成相应的DNA 链。
它通过在RNA链的3"端引导DNA链的合成,逐渐延伸DNA链。
4. RNA链的去除:逆转录酶具有核酸酶活性,它可以将合成的RNA链去除。
5. DNA链的延伸:逆转录酶继续合成DNA链,直到达到整个RNA 链的末端。
6. DNA链的修复:在逆转录过程中,DNA链可能会受到一些损伤,逆转录酶会对DNA链进行修复,确保其完整性。
通过逆转录,RNA的信息可以被转录回DNA的形式,这个过程在一些病毒和真核生物的某些细胞类型中发生。
逆转录是一种重要的机制,它使得RNA能够在转录后被稳定保存,并可以在需要时转录回DNA形式。
逆转录的模板逆转录是一种生物学过程,它将RNA转录成DNA。
这个过程在病毒、真核生物和原核生物中都有发现。
逆转录酶是完成这个过程的主要酶类。
本文将详细介绍逆转录的定义、机制、应用以及相关技术。
一、定义1. 逆转录的概念逆转录是指将RNA模板反向转录成DNA的过程。
这个过程由逆转录酶催化完成。
2. 逆转录酶的特点逆转录酶是一种特殊的RNA依赖性DNA聚合酶。
它具有以下特点:(1)能够识别RNA模板并合成相应的DNA链;(2)能够利用RNA为模板合成单链或双链DNA;(3)具有核酸水解酶活性,可切割RNA或DNA链;(4)具有多种修复和修剪功能,可保证DNA复制准确性。
二、机制1. 逆转录的步骤逆转录包括以下几个步骤:(1)将RNA模板与逆转录酶结合形成复合物;(2)逆转录酶利用RNA作为模板合成单链cDNA;(3)逆转录酶利用RNA作为模板合成另一条cDNA链,形成双链cDNA;(4)逆转录酶切割RNA模板,并在DNA链上填补缺失的核苷酸;(5)逆转录酶利用DNA为模板合成第二条DNA链,形成完整的双链DNA。
2. 逆转录的影响因素逆转录的效率和准确性受到多种因素的影响,如:(1)RNA模板的结构和序列;(2)逆转录酶的活性和特异性;(3)反应条件,如温度、pH值、离子浓度等。
三、应用1. 逆转录在研究中的应用逆转录广泛应用于研究中,如:(1)mRNA检测:利用RT-PCR技术检测mRNA水平;(2)基因克隆:将mRNA反向转录成cDNA作为基因克隆的起始材料;(3)基因表达分析:研究基因表达调控机制等。
2. 逆转录在临床中的应用逆转录也有着广泛的临床应用,如:(1)病毒检测:利用逆转录将病毒RNA转录成cDNA,从而检测病毒感染;(2)肿瘤诊断:利用RT-PCR技术检测癌细胞中的特定基因表达水平。
四、相关技术1. RT-PCR技术RT-PCR是一种将RNA反向转录成cDNA,再利用PCR技术扩增目标序列的方法。
逆转录的原理及应用1. 原理介绍逆转录是指通过逆转录酶(reverse transcriptase)将RNA转录为DNA的过程。
这个过程是细胞内某些病毒和真核生物特有的,它使得RNA可以被进一步转录为DNA,并被插入到宿主基因组中。
逆转录的主要步骤包括RNA为模板合成cDNA,cDNA合成双链DNA,并将其插入宿主基因组DNA中。
2. 逆转录的应用逆转录在生物学和医学领域有广泛的应用,下面列举了一些常见的应用:•病毒研究:逆转录是研究RNA病毒的重要工具。
通过逆转录可以将RNA病毒的RNA转录为cDNA,进而进行序列分析、表达基因等功能研究。
•基因表达分析:逆转录可以将RNA转录为cDNA,使用特定引物进行扩增,从而得到RNA的复制品。
这种转录的产物可以用来定量检测特定基因的表达水平,并用于研究基因调控。
•反转录聚合酶链式反应(RT-PCR):RT-PCR是一种将RNA转录为cDNA,然后利用PCR技术扩增的方法。
它可用于检测低水平的RNA表达,并对特定基因的变化进行定量分析。
•病毒检测:逆转录可以用于检测病毒感染。
例如,结合逆转录和PCR技术,可以检测HIV、流感病毒等病毒的感染情况。
•遗传疾病诊断:某些遗传性疾病由单一基因突变所致,逆转录可以被用来检测这些突变。
例如,逆转录荧光PCR技术可以用于检测遗传性疾病的突变,如囊性纤维化等。
3. 逆转录酶逆转录酶是逆转录反应中的关键酶。
它是一种RNA依赖DNA聚合酶,在逆转录过程中将RNA模板转录为cDNA。
逆转录酶广泛存在于病毒和真核生物中,包括HIV的逆转录酶、Telomerase等。
逆转录酶的特点是具有RNA依赖的DNA聚合能力和RNA酶H活性。
4. 逆转录实验方法逆转录实验主要由以下几个步骤组成:1.RNA提取:从细胞或组织中提取RNA,常用方法包括TRIzol法、RNeasy Mini Kit等。
2.逆转录反应:将RNA作为模板,使用逆转录酶合成相应的cDNA。
逆转录的基本过程逆转录(reverse transcription)是以RNA为模板合成DNA的过程,即RNA指导下的DNA合成。
此过程中,核酸合成与转录(DNA到RNA)过程与遗传信息的流动方向(RNA到DNA)相反,故称为逆转录。
逆转录过程是病毒的复制形式之一,如RNA病毒中的逆转录病毒,DNA 病毒中的拟逆转录病毒的复制均需要经过逆转录。
逆转录过程在真核细胞中也同样存在,例如逆转座子和端粒DNA的延长均存在逆转录过程,需逆转录酶的催化,端粒酶即为真核细胞中的逆转录酶。
逆转录过程的揭示是分子生物学研究中的重大发现,是对中心法则的重要修正和补充。
人们通过体外模拟该过程,以样本中提取的mRNA为模板,在逆转录酶的作用下,合成出互补的cDNA,构建cDNA文库,并从中筛选特异的目的基因。
该方法已成为基因工程技术中最常用的获得目的基因的策略之一。
逆转录过程由逆转录酶催化,此酶也称依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。
合成的DNA链称为与RNA互补DNA(complementary DNA, cDNA)。
逆转录酶在生物界存在于逆转录病毒以及真核细胞(如端粒酶)中,逆转录病毒没有单独的逆转录酶,其DNA聚合酶带有逆转录酶的活性,可能与病毒的恶性转化有关。
人类免疫缺陷病毒(HIV)就是一种逆转录病毒,含有逆转录酶。
在小鼠及人的正常细胞和胚胎细胞中也有逆转录酶,例如端粒酶就是一种逆转录酶,推测可能与细胞分化和胚胎发育有关。
大多数逆转录酶都具有多种酶活性,主要包括以下几种活性。
①DNA聚合酶活性;以RNA为模板,催化dNTP聚合成DNA的过程。
此酶需要RNA为引物,多为赖氨酸的tRNA,在引物tRNA 3'-末端以5'→3'方向合成DNA。
反转录酶中不具有3'→5'外切酶活性,因此没有校正功能,所以由反转录酶催化合成的DNA出错率比较高。
逆转录的原理、所需试剂和耗材、实验仪器、准备工作、实验方法及注意事项如下:一、原理逆转录(reverse transcription)是指以RNA为模板合成DNA的过程。
在某些RNA病毒中,逆转录是一种必要的复制过程。
在细胞中,逆转录也参与基因表达的调节。
逆转录过程由逆转录酶(reverse transcriptase)催化,该酶具有两种活性:1)DNA聚合酶活性,即以DNA为模板合成DNA;2)RNA酶活性,即以RNA为模板合成cDNA。
在逆转录过程中,逆转录酶首先识别并结合到特定的RNA序列(通常是mRNA)上,然后以RNA为模板按照碱基互补配对原则合成cDNA。
合成的cDNA链再经过DNA修复和扩增等过程最终得到大量DNA分子。
二、所需试剂和耗材1.逆转录试剂盒或逆转录酶。
2.RNA酶抑制剂(可选)。
3.Oligo(dT)引物或随机引物。
4.dNTPs(脱氧核糖核苷三磷酸)。
5.缓冲液(如Tris-HCl、KCl等)。
6.MgCl2(镁离子)。
7.DEPC水或无RNA酶水。
8.RT-PCR仪(若要进行PCR扩增)。
9.离心管、移液器、微量离心管等实验容器。
三、实验仪器1.离心机:用于RNA和DNA的分离、沉淀等。
2.水浴锅:用于逆转录反应保温。
3.PCR仪:用于cDNA的扩增。
4.电泳仪和电泳槽:用于检测和分析DNA。
5.显微镜:观察细胞和组织样品。
6.分光光度计:用于测量RNA和DNA的浓度。
四、准备工作1.实验前应熟悉逆转录的相关知识及操作流程。
2.准备好所需的试剂和耗材,确保其在有效期内且未受污染。
3.实验操作前需清洗实验器具,保证无核酸酶或其他污染源残留。
4.为减小误差,实验过程中应尽量使用随机对照。
五、实验方法1.从细胞或组织中提取总RNA。
2.在逆转录反应中加入所需的原料和缓冲液,包括RNA、Oligo(dT)引物或随机引物、dNTPs、缓冲液、MgCl2等。
3.在适当的温度和时间下进行逆转录反应,合成cDNA。
逆转录名词解释逆转录是指RNA的逆转录过程,即从RNA分子复制成DNA 分子的过程。
在正常的生物细胞中,DNA通过转录的过程生成RNA,而逆转录则是某些病毒的特殊机制,它使得RNA能够通过逆向的转录反应产生DNA。
逆转录发现于20世纪60年代,这是一项重要的科学发现,因为它帮助人们对病毒的传播和复制机制有了更深入的了解,并为病毒疾病的治疗提供了一些思路。
逆转录的过程一般可分为三个主要步骤:逆转录起始、逆转录转录和逆转录合成。
首先,逆转录起始就是由于特殊的酶反应来实现的。
这些逆转录酶具有催化选择性,仅在模板链的RNA上结合和催化反应。
然后,在逆转录转录阶段,逆转录酶通过将RNA链作为模板,合成相应的DNA链。
最后,在逆转录合成阶段,逆转录酶再一次使用RNA链作为模板,用DNA作为模板从三个碱基残基中以DNA为模板一次性合成一个完整的DNA链。
逆转录在病毒生命周期中起着重要作用。
它使得一些病毒能够通过逆向的途径将其遗传物质嵌入宿主的基因组中,从而在细胞分裂和复制过程中被保留和传递给后代细胞。
这种机制使得病毒能够长期感染宿主细胞,增加病毒的传播和复制机会。
逆转录还有助于解释一些病毒的突变和逃逸机制,因为逆转录过程中的错误可能导致DNA链的突变,从而增加了病毒对宿主免疫系统的逃逸能力。
逆转录对于疾病的治疗也具有重要的意义。
逆转录酶在逆转录过程中扮演了重要的角色,因此抑制逆转录酶的活性可能成为治疗病毒感染的一种策略。
目前,有一些抗逆转录药物已被开发出来,并被广泛用于治疗艾滋病和其他逆转录病毒感染。
这些药物通过抑制逆转录酶的活性,阻断病毒复制和传播,从而减缓疾病的发展。
逆转录的研究还有助于提供有关病毒演化和传播的重要信息,为病毒疫苗和抗病毒药物的研发提供理论基础。
总之,逆转录是RNA转录为DNA的过程,它在病毒生命周期中起着重要作用,同时也为病毒疾病的治疗提供了一些思路。
对逆转录过程的研究有助于我们更好地理解病毒的复制和传播机制,为疾病的治疗和预防提供科学依据。
逆转录名词解释是什么意思?
逆转录名词解释是:由RNA复制DNA的过程。
有些RNA病毒的繁殖过程中,在特有的逆转录酶催化下合成与病毒RNA碱基配对的DNA链称互补DNA(cdna),再在逆转录酶的催化下使RNA-DNA杂交链解开,由cdna为模板合成另一条与其互补的DNA链,形成双链的DNA分子,称前病毒。
这种前病毒能与宿主细胞的基因组整合,成为宿主细胞基因的一部分。
这种基因可复制病毒,也可以引起宿主细胞的恶性变。
但也能静止(即不表达)而垂直向下传给子代。
目前已知艾滋病病毒就是一种逆转录病毒。
过程:
逆转录过程由逆转录酶催化,该酶也称依赖RNA的DNA聚合酶(RDDP),即以RNA为模板催化DNA链的合成。
合成的DNA链称为与RNA互补DNA(complementary DNA, cDNA)。
逆转录酶存在于一些RNA病毒中,可能与病毒的恶性转化有关。
人类免疫缺陷病毒(HIV)也是一种RNA病毒,含有逆转录酶。
在小鼠及人的正常细胞和胚胎细胞中也有逆转录酶,推测可能与细胞分化和胚胎发育有关。
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逆转录名词解释生物化学
逆转录是指一种生物化学反应,它将RNA转录成DNA。
这个过程是由一种酶类似物质——逆转录酶(reverse transcriptase)催化的。
逆转录酶是一种RNA依赖性DNA聚合酶,它能够将RNA作为模板,合成DNA链。
逆转录酶广泛存在于病毒中,包括HIV病毒。
逆转录是许多病毒复制的必要步骤,因此,逆转录是生物化学研究中一个非常重要的领域。
逆转录的过程分为两个步骤。
首先,逆转录酶将RNA转录成DNA 链的第一部分,称为cDNA(complementary DNA)。
这个过程是通过逆转录酶将RNA转录成单链cDNA。
单链cDNA随后被转化为双链cDNA,这个过程是通过DNA聚合酶和RNA酶H协同作用完成的。
得到的双链cDNA可以作为DNA分子在细胞中复制和转录。
逆转录被广泛应用于分子生物学研究。
它是一种将mRNA转化为cDNA的重要工具。
由于cDNA不含内含子,因此它可以用于表达基因的克隆和表达研究。
逆转录还可以用于病毒检测。
例如,HIV病毒的检测通常使用逆转录PCR技术。
逆转录还可以用于基因表达分析和基因组学研究。
逆转录是一个非常重要的生物化学过程。
它在病毒复制、基因表达和分子生物学研究中都扮演着重要的角色。
随着生物技术的进步,逆转录技术将会被广泛应用于医学和生物学领域。
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逆转录原理
逆转录,又称逆转录转座子,是一种DNA复制的遗传工具,其分子机制和DNA复制类似,但在实际操作过程中,所需的酶比DNA复制所需的酶要多。
RNA反转录是将RNA反转录成cDNA的过程,在这个过程中,RNA由一个核糖核酸分子聚合成双链DNA分子。
cDNA是逆转录酶把cDNA合成出来的“原材料”。
逆转录酶能催化RNA的合成,使cDNA分子的4种核苷酸聚合成双链。
当病毒感染细胞时,细胞膜上的受体蛋白(通常是病毒和宿主细胞的特异性受体)通过与病毒的结合而进入细胞内。
病毒DNA与受体蛋白结合后,形成互补链,再与相应的RNA结合形成双链。
双链通过内吞作用进入细胞内,然后进入细胞核内进行转录和复制。
由于双链上各碱基之间有一定比例(如腺嘌呤与胸腺嘧啶之比为1∶1),RNA在进入细胞核后形成两条单链RNA。
当逆转录酶把一条单链RNA降解成一段双链RNA后,就可以进行翻译了。
在这个过程中需要许多酶参与。
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逆转录的名词解释逆转录(reverse transcription)是一种生物学过程,指的是将RNA逆向转录成DNA的过程。
通常情况下,生物体的基因组是以DNA为模板进行转录产生RNA分子,再通过翻译作用生成蛋白质。
然而,有一类病毒(逆转录病毒)具有逆转录酶(reverse transcriptase)的能力,能够将其RNA基因转录成DNA,并将其整合到宿主细胞的基因组中。
逆转录的发现引起了科学界的巨大兴趣,并对我们对生物学和古生物学的理解带来了深远影响。
逆转录的发现逆转录首先是在20世纪60年代被发现的。
当时,科学家Beljanski在研究毒性的鸟类肿瘤时,发现了一个不寻常的现象:在病毒感染的细胞中,反转录酶会将病毒的RNA基因转录成DNA,然后将这段DNA插入宿主细胞的基因组中。
这个发现引起了科学家们对逆转录过程的关注,奠定了这个领域的研究基础。
逆转录酶的作用逆转录酶是在逆转录过程中起关键作用的酶。
这种酶能够将RNA作为模板,合成出与RNA相对应的DNA序列。
由于DNA是双链结构,所以逆转录酶会在DNA合成过程中合成出与RNA互补的DNA链,形成DNA-RNA杂交复合物。
然后,逆转录酶通过其具有的核酸酶活性消除杂交链,最终合成纯DNA链。
这个过程被称为反转录。
逆转录的重要性逆转录在生物学中具有重要的意义。
首先,逆转录过程帮助我们理解基因组的演化和进化。
由于逆转录酶在转录RNA为DNA的过程中容易产生突变,而且病毒有着相对较高的突变率,逆转录过程促进了基因的多样性和进化。
其次,逆转录也是一种治疗病毒感染的手段。
逆转录酶抑制剂,如反转录酶抑制剂和核苷类似物,已被广泛应用于临床上,用于治疗逆转录病毒感染,如艾滋病。
逆转录的研究还为新药开发提供了潜在的靶点。
逆转录的研究进展随着分子生物学的发展,逆转录的研究也取得了重要进展。
科学家们通过深入研究逆转录过程的分子机制,已经发现了许多与逆转录相关的蛋白质和RNA分子。
逆转录-聚合酶链反应中文实验方法
作者:佚名来源:本站原创 2004-12-20点击:6478 【字体:小大】
逆转录-聚合酶链反应
逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)的原理是:提取组织或细胞中的总RNA,以其中的mRNA作为模板,采用Oligo(dT)或随机引物利用逆转录酶反转录成cDNA。
再以cDNA为模板进行PCR扩增,而获得目的基因或检测基因表达。
RT-PCR使RNA 检测的灵敏性提高了几个数量级,使一些极为微量RNA样品分析成为可能。
该技术主要用于:分析基因的转录产物、获取目的基因、合成cDNA探针、构建RNA高效转录系统。
一、反转录酶的选择
1.Money 鼠白血病病毒(MMLV)反转录酶:有强的聚合酶活性,RNA酶H活性相对较弱。
最适作用温度为37℃。
2.禽成髓细胞瘤病毒(AMV)反转录酶:有强的聚合酶活性和RNA酶H活性。
最适作用温度为4 2℃。
3.Thermus thermophilus、Thermus flavus等嗜热微生物的热稳定性反转录酶:在Mn2+存在下,允许高温反转录RNA,以消除RNA模板的二级结构。
4.MMLV反转录酶的RNase H-突变体:商品名为Super script 和SuperScriptⅡ。
此种酶较其它酶能多将更大部分的RNA转换成cDNA,这一特性允许从含二级结构的、低温反转录很困难的mRNA模板合成较长cDNA。
二、合成cDNA引物的选择
1.随机六聚体引物:当特定mRNA由于含有使反转录酶终止的序列而难于拷贝其全长序列时,可采用随机六聚体引物这一不特异的引物来拷贝全长mRNA。
用此种方法时,体系中所有RNA分子全部充当了cDNA第一链模板,PCR引物在扩增过程中赋予所需要的特异性。
通常用此引物合成的cD NA中96%来源于rRNA。
2.Oligo(dT):是一种对mRNA特异的方法。
因绝大多数真核细胞mRNA具有3’端Poly(A+)尾,此引物与其配对,仅mRNA可被转录。
由于Poly(A+)RNA仅占总RNA的1-4%,故此种引物合成的
cDNA比随机六聚体作为引物和得到的cDNA在数量和复杂性方面均要小。
3.特异性引物:最特异的引发方法是用含目标RNA的互补序列的寡核苷酸作为引物,若PCR反应用二种特异性引物,第一条链的合成可由与mRNA 3’端最靠近的配对引物起始。
用此类引物仅产生所需要的cDNA,导致更为特异的PCR扩增。
二、试剂准备
1.RMA提取试剂
2.第一链cDNA合成试剂盒
3.dNTPmix:含dATP、dCTP、dGTP、dTTP各2mM
4.Taq DNA聚合酶
三、操作步骤
1. 总RNA的提取:见相关内容。
2. cDNA第一链的合成:目前试剂公司有多种cDNA第一链试剂盒出售,其原理基本相同,但操作步骤不一。
现以GIBICOL公司提供的SuperScriptTM Preamplification System for First Strand cDNA Synthesis 试剂盒为例。
(1)在0.5ml微量离心管中,加入总RNA 1-5μg,补充适量的DEPC H2O使总体积达11μl。
在管中加10μM Oligo(dT)12-18 1μl,轻轻混匀、离心。
(2)70℃加热10min,立即将微量离心管插入冰浴中至少1min。
然后加入下列试剂的混合物:
10×PCR buffer 2μl
25mM MgCl2 2μl
10mM dNTPmix 1μl
0.1M DTT 2μl
轻轻混匀,离心。
42℃孵育2-5min。
(3)加入SuperscriptⅡ1μl ,在42℃水浴中孵育50min。
(4)于70℃加热15min以终止反应。
(5)将管插入冰中,加入RNase H 1μl ,37℃孵育20min,降解残留的RNA。
-20℃保存备用。
3.PCR:
(1)取0.5ml PCR管,依次加入下列试剂:
第一链cDNA 2μl
上游引物(10pM)2μl
下游引物(10pM)2μl
dNTP(2mM) 4μl
10×PCR buffer 5μl
Taq 酶(2u/μl)1μl
(2)加入适量的ddH2O,使总体积达50μl。
轻轻混匀,离心。
(3)设定PCR程序。
在适当的温度参数下扩增28-32个循环。
为了保证实验结果的可靠与准确,可在PCR扩增目的基因时,加入一对内参(如G3PD)的特异性引物,同时扩增内参DNA,作为对照。
(4)电泳鉴定:行琼脂糖凝胶电泳,紫外灯下观察结果。
(5)密度扫描、结果分析:采用凝胶图像分析系统,对电泳条带进行密度扫描。
四、注意事项
1.在实验过程中要防止RNA的降解,保持RNA的完整性。
在总RNA的提取过程中,注意避免m RNA的断裂。
2.为了防止非特异性扩增,必须设阴性对照。
3.内参的设定:主要为了用于靶RNA的定量。
常用的内参有G3PD(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)、β-Actin(β-肌动蛋白)等。
其目的在于避免RNA定量误差、加样误差以及各PCR反应体系中扩增效率不均一各孔间的温度差等所造成的误差。
4.PCR不能进入平台期,出现平台效应与所扩增的目的基因的长度、序列、二级结构以及目标DN A起始的数量有关。
故对于每一个目标序列出现平台效应的循环数,均应通过单独实验来确定。
5.防止DNA的污染:
(1)采用DNA酶处理RNA样品。
(2)在可能的情况下,将PCR引物置于基因的不同外显子,以消除基因和mRNA的共线性。