研究细菌基因组结构的意义
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细菌的遗传修饰及其作用的研究细菌是一类非常小的单细胞生物,但这并不意味着它们不复杂或不重要。
像人类一样,细菌需要遗传修饰来促进生长和适应环境。
近年来,对细菌的遗传修饰及其作用的研究成为了生物学的热门话题之一。
一、细菌的基因组和遗传变异细菌的基因组通常比较小,但是它们能够快速地进行遗传变异,包括突变、水平基因转移和基因重组。
这意味着细菌可以很快地适应新的环境,比如抵御一些药物或抗生素的作用。
而这些遗传变异是如何发生的呢?主要是由于DNA发生错误复制或修复,从而引起遗传变异。
此外,细菌还能通过水平基因转移或合成或降解有机化合物的过程中吸收其他细菌的DNA序列,从而改变其遗传信息。
二、细菌的遗传修饰及其作用在细菌中,遗传修饰是指通过给基因增加或删除一些特定的化学分子来改变DNA序列的活动或表达。
这些化学分子包括DNA甲基化、RNA编辑和蛋白质翻译后修饰等。
DNA甲基化是细菌中最常见的遗传修饰方式之一,通过在DNA上加上一些甲基基团来影响基因表达和维持某些基因的沉默状态。
这种修饰方式对于细菌的适应性和进化具有重要的作用,比如在生长缓慢或处于休眠状态时保持基因的稳定,并在适当的时候重新启动这些基因。
RNA编辑则是指一种特殊的遗传修饰方式,通过在RNA分子上剪切、插入或删除一些核苷酸来改变RNA分子活性和表达。
这种修饰方式通常会影响蛋白质合成过程,从而影响细胞生长和代谢。
蛋白质翻译后修饰则是指在蛋白质合成后通过给蛋白质附加一些化学分子来改变蛋白质的活性和功能。
这种修饰方式能够影响细菌的生长和适应性,比如让细菌能够在特定环境中生存或受到药物的作用。
三、细菌遗传修饰的应用细菌的遗传修饰不仅仅在生物学中具有重要的研究意义,还具有广泛的应用前景。
比如,利用基因编辑技术可以设计出一些高效的细菌工厂来生产生物燃料、生化原料等化学产品,从而实现可持续发展。
此外,还可以利用细菌的遗传变异和修饰来制备抗生素、肥料、农药等需要的生化产品。
大肠杆菌中的基因组结构和功能研究大肠杆菌是一种广泛存在于环境中和人体肠道内的细菌。
它的基因组结构和功能一直是分子生物学和微生物学研究的热门领域。
随着基因测序技术的发展,我们对大肠杆菌的基因组结构和功能的认识也越来越深入。
基因组结构大肠杆菌的基因组属于革兰氏阴性菌,它是一个圆形的DNA分子,大约有4.6兆碱基对。
它的基因组包含了大约4500个基因,其中有许多基因是与宿主细胞的生长和代谢相关的。
大肠杆菌的基因组还具有多个质粒,这些质粒通常含有一些与环境适应和抗药性相关的基因。
大肠杆菌的基因组中还有许多重复序列和转移元件。
这些序列包括了IS元件、转座子、整合子等等。
它们都能够影响基因表达和基因组稳定性,并在细菌进化中具有重要的作用。
功能研究大肠杆菌中的基因组结构和功能研究主要包括以下几个方面。
基因功能注释随着大肠杆菌基因组测序的完成,相应的基因功能注释也日益完善。
目前已有大量的基因在数据库中被标注了功能和注释信息,这对于后续的基因调控、表达和功能研究提供了重要的数据支持。
转录调控在大肠杆菌中,转录调控是一种重要的基因调控机制。
研究者发现大肠杆菌基因组中存在大约350个调控因子。
这些调控因子通常能够识别特定的DNA序列,在特定条件下调控相应基因的表达。
研究发现,其中的一些调控因子还具有重要的作用,如lac重pressor、trp重pressor等。
新基因鉴定随着转录组和蛋白质组学技术的发展,大肠杆菌中的新基因鉴定越来越重要。
许多研究者利用这些技术,鉴定出了大量的新基因,其中包括了一些与代谢途径、抗药性和环境适应有关的基因。
基因组稳定性在细菌进化中,基因组稳定性是非常重要的。
大肠杆菌中的基因组稳定性与它的保护性随机DNA修复系统、R-质粒的结构和核苷酸代谢等多个方面有关。
研究人员对这些方面进行了深入探究,为我们对细菌基因组稳定性的了解提供了一定程度的帮助。
结论大肠杆菌是一个重要的微生物模型生物,它的基因组结构和功能一直是分子生物学和微生物学研究的热门领域。
微生物的基因组学:探究微小世界的奥秘微生物是我们周围无处不在的生物体,其中包括细菌、真菌、病毒等等。
它们既是人类的宝库,也是人类的健康威胁。
则是研究微生物基因组的科学,通过对微生物基因序列和表达的研究,揭示出微生物中各种基因的功能和相互关系,以及微生物与环境的互动关系。
本文将深入探究微生物基因组学这一领域的研究内容和应用,以期让读者更好地了解这一领域的研究进展和意义。
一、基因组学的基本概念基因组学是指对生命体系中基因组结构、组成、功能及相互关系等方面进行研究的学科。
它的出现起源于对基因的研究,随着生物信息技术的快速发展,基因组学成为了一个独立的学科,主要研究的是基因组结构、功能、演化和调节等方面。
基因组学既可以从宏观角度探究一个生物体所有基因的全貌,也可以从微观角度研究一个特定基因的结构和功能,因此在许多重要领域得到广泛应用。
二、微生物基因组学的研究内容微生物基因组学主要研究微生物的基因组结构、基因功能以及基因调控等方面。
下面我们将详细探讨这些内容。
1. 基因组结构研究微生物基因组的研究是从细胞的核酸分子开始的,通过分析细胞中的核酸分子,可以了解微生物的基因组结构和组成,从而探讨微生物的基因表达模式和调节机理。
微生物基因组的研究首先要进行测序,目前主要有两种测序方法:Sanger测序和高通量测序(HTP)。
Sanger测序是目前最传统的DNA序列测序技术,它能够测出长达1000bp的DNA序列。
而HTP测序由于技术的不断发展,能够测出14亿bp以上的DNA序列,因此应用越来越广泛。
2. 基因功能研究微生物基因功能的研究是通过基因表达分析、生物信息学分析等方法来了解基因的功能及相互关系。
随着生物信息学技术的不断发展,基因功能预测也变得越来越准确。
通过这些方法,可以对微生物中众多基因的功能进行深入研究,并对这些基因在微生物生长、代谢以及对环境应变等方面的作用做出解释。
3. 基因调节研究基因调节是指在不同的生物学条件下,通过某些因素对基因表达水平的调整,为基因表达提供信号。
医学基因组学研究及其意义随着科技的发展和人们对身体健康的关注度不断提高,基因组学已经成为了医学领域里的重要研究方向之一。
医学基因组学,也称为医学遗传学或者人类遗传学,是一门研究基因与人类疾病之间关系的学科,借助先进的科技手段探索人类基因组的特点,寻找与健康和疾病相关的遗传变异,为临床治疗和#疾病预防提供新方式。
下面,我们将探讨医学基因组学研究的意义以及目前已知的一些成果。
一、医学基因组学研究的意义1、个性化医疗基因组的个体差异直接影响了药物作用、药品代谢、副作用以及对治疗的反应等,这导致了同样的药物在不同的人身上产生了不同的作用,个性化医疗就是立足此而生。
通过基因分析,医生可以结合病人基因信息来选择最好的治疗方案,避免不必要的副作用,提高治疗效果。
例如肝癌的治疗,通过对基因组的研究,肝癌分子小组发现了基因识别技术,该技术能够识别哪些药物会对患者的肝癌起到有效的治疗,这对于治疗肝癌是具有非常重要的意义的。
2、疾病预防疾病的预防是医学基因组学研究的一个重要方向。
通过对病人基因组中的变异及其与所患疾病之间的关系进行研究,医生可以提前预测患病的风险,进而针对性地进行预防。
例如,一些基因分析公司提供了基因检测服务,可以帮助个人了解自身在心脏病、癌症、肥胖、糖尿病等常见疾病的发病风险,为预防该类型的疾病提供科学依据。
3、疾病诊断医学基因组学研究还可以帮助医生快速确认病人的疾病类型及其病因,促进病情的早期诊断。
例如通过某些临床检测和基因测序技术可以迅速确定某种癌症是由哪种癌基因突变所导致,及时施以充分的治疗和干预,提高治愈率和生存期。
二、医学基因组学已知的一些成果1、面向个性化医疗的基因组测序技术目前,面向个性化医疗的基因组测序技术已经得到广泛研究和应用。
以癌症为例,传统的手段通常要求患者接受放射性物质常规扫描,但是这种方法不仅痛苦且精度不高;而通过基因组测序技术,可以迅速分析患病的导因,为治疗提供具有个性化的有效方案。
大肠杆菌基因组的解析与分析大肠杆菌是一种归属于肠道菌群的细菌,在它们的代谢过程中,产生了多种有益物质,它们也是研究细菌基因组较多的一个物种。
解析大肠杆菌基因组可以对其生物学特性进行深入地研究,这对我们了解大肠杆菌的生态、代谢、药物耐受性等方面的知识都有着重要的意义。
一、基因组结构大肠杆菌的基因组是一个圆形DNA分子,长度为4.6-4.8万个碱基对。
它包含了约4000个基因和多个重复序列。
基因组中的核酸序列与其它生物存在许多相似之处,但也有一些不同之处,其中一部分与肠道菌群的生境有关。
大肠杆菌基因组的核心区域是一些绝大部分菌株都拥有的共同区域,这些区域包含许多重要的代谢与生物学功能。
大肠杆菌基因组的核心区域中还包含了许多编码极具特征性的蛋白质的基因,比如E. coli长链脂肽合成酶(LspA)等等。
基因组中的其它序列则表现为大肠杆菌的型态和性状上的差异,又称为可变区域。
可变区域存在于E. coli的质粒、组蛋白和定位元件等区域,并受到不同环境条件的选择作用。
在细胞适应环境因素改变的过程中,这些可变区域的序列稳定性将会受到调节从而使适应尽可能进行。
二、基因组分析方法现在,我们可以应用基因芯片、传统文库测序和全基因组测序等多种手段来分析大肠杆菌的基因组,以解析其完整的DNA序列和各个基因在DNA中的位置。
其中,全基因组测序技术是最常用的、最为可靠的分析方法。
全基因组测序技术可以对大肠杆菌的每一个基因进行测序,找到这些基因的开放阅读框,进而进行基因识别和编码区域分析。
同时,利用基因组之间的比对技术,在大肠杆菌之间进行多个比较,进一步鉴定相关基因以及相关区域的同源性程度,比如发现可移动元件等。
使用全基因组测序技术可以快速且准确地鉴定基因组间的差异,比如序列变异、基因缺失和其他基因的扩增,同时,还可以分析表达的途径,预测潜在的功能以及分析大肠杆菌的分子演化史。
三、分析结果基于全基因组测序的分析方法,我们可以得到大肠杆菌的完整的基因组序列,开发出了大肠杆菌的功能基因组。
基因组的名词解释微生物学简介微生物学是研究微观生物的科学,其中包括细菌、真菌、病毒等微生物的分类、结构、功能以及它们对人类和环境的影响。
基因组是一个重要的概念,它指的是一个生物体内所有基因的组合。
基因组的解析在微生物学领域具有重要意义,不仅有助于理解微生物的生态系统和代谢途径,还为疾病诊断和治疗提供了新的线索。
一、基因组的定义和组成基因组是一个生物体内所有基因的集合。
基因是由核糖核酸(DNA或RNA)编码的遗传信息单位,它决定了一个生物体的性状和功能。
在微生物学中,细菌和真菌的基因组通常以DNA形式存在,而病毒的基因组可以是DNA或RNA。
基因组的组成包括两部分:非编码区和编码区。
非编码区主要包括调控元件,如启动子、转录因子结合位点等,它们调控基因的表达。
编码区包括使基因转录为蛋白质的编码序列。
二、基因组的结构和大小基因组的结构与生物体的类型和大小有关。
细菌的基因组通常是环状DNA,而真菌和病毒的基因组多为线状DNA或RNA。
基因组的大小则是指基因组中包含的碱基对数目。
细菌的基因组大小通常在几百万至几千万碱基对之间,其中包含几千至几万个基因。
真菌的基因组较大,通常在几千万至几十亿碱基对之间,含有几千至几万个基因。
病毒的基因组大小则相对较小,通常只有几千至几十万碱基对。
三、基因组的进化和演化基因组的进化是指基因组在长期进化过程中经历的变化。
基因组的演化是指基因组在狭义上的进化,即指代表一个物种或群体的基因组和其祖先基因组之间的差异。
基因组的进化和演化涉及到基因的重组、突变和选择等机制。
通过这些机制,基因组可以适应不同的环境条件和生存压力,导致新基因的出现和旧基因的消失。
四、基因组在微生物学研究中的应用基因组在微生物学研究中有着广泛的应用。
首先,基因组可以帮助研究人员理解微生物的演变和物种起源。
通过比较不同微生物的基因组,可以揭示它们之间的关系和进化历史。
其次,基因组也是研究微生物的生态学过程和代谢途径的重要工具。
细菌的结构与功能细菌是一类微生物,广泛存在于我们生活的各个领域中,包括土壤、水体、人体内等。
了解细菌的结构与功能对于认识它们的生命特征以及处理与细菌相关的问题具有重要意义。
本文将介绍细菌的结构以及它们在自然界中的各种功能。
一、细菌的结构细菌的结构相较于其他生物,较为简单。
它们由以下几个主要部分组成。
1. 细胞壁细菌的细胞壁一般呈现出固定的形式,它是由多糖和蛋白质组成的。
细胞壁是细菌维持形态稳定性的重要组成部分,它可以对外界环境的变化作出响应。
2. 细胞膜细菌的细胞膜是位于细胞壁内,在细菌的结构中起着重要的作用。
它不仅能够限制物质的进出,还起到对细胞内环境进行维持和调节的功能。
同时,细菌细胞膜上还存在着许多与环境对接的受体,这些受体能够感知外界信号,从而对其做出相应的反应。
3. 核心区细菌的核心区包含了细菌基因组的DNA。
与其他生物相比,细菌的DNA结构较为简单,通常呈现为一个环形的结构。
细菌的遗传信息都存储在核心区中,它能够影响细菌的功能和特征。
4. 细胞质细菌的细胞质是细菌内部的主要液体部分,它包含了许多重要的物质,如酶、储能物质等。
细胞质在维持细菌生命活动中起到了至关重要的作用。
二、细菌的功能细菌在自然界中扮演着多种多样的角色,对于维持生态平衡以及人类的健康具有重要的作用。
1. 分解与循环物质许多细菌具有分解有机物的能力,它们能够分解废物和死物,将有机物分解为无机物,如氮、磷等。
这对于保持生态系统的平衡以及循环物质起到了重要作用。
2. 生物固氮一些细菌能够实现生物固氮的过程,将空气中的氮转化为植物可吸收的形式,从而提供植物生长所需的养分。
这对于农田的肥力维持以及植物生长具有重要意义。
3. 产生抗生素某些细菌能够产生抗生素来抑制其他病原微生物的生长,起到防御和竞争的作用。
这些细菌的发现对于医学的发展具有重要的意义。
4. 参与人类健康细菌在人体内也存在着重要的作用。
例如,人体内的某些细菌能够帮助消化食物,维持肠道的健康;一些乳酸菌具有抑制其他致病菌生长的功能等等。
细菌的基因组学研究一、细菌基因组学简述细菌基因组学是研究细菌基因组的结构,组成及其作用的学科。
细菌基因组通常被定义为细菌生存所必需的全部基因并包括了与代谢、结构和细胞生命周期等相关的信息。
随着基因序列技术的迅速发展,人们对于细菌基因组的理解得到了大幅度提高。
基于基因组在不同类型细菌中相同或者不同的成分,可以发现不同细菌中基因组的差异性。
细菌基因组中含有全体基因,包括了一些能让细菌生存繁衍所需的基因。
细菌基因组也可以进行分析以帮助研究细菌的生存机制、分类学和疾病发生机制的探究。
二、细菌基因组的构造细菌基因组主要由以下三部分组成:核糖核酸(DNA)序列、表达DNA整合过程的一系列蛋白质以及负责DNA复制的蛋白质。
在一些高等细胞中,核酸通过双倍体以及多倍体形式的染色体组织,但对于很多细菌而言,基因组常以一排线性结构显现(噬菌体则为线性形成环绕式的结构)。
细菌鞭毛常由一些基因决定;对于不同类型的细菌,鞭毛的数量、长度及部位均可能不同,而鞭毛则通过启动蛋白质以及公共基因来实现持续运作。
三、细菌基因组的解析对于细菌基因组学的研究目前主要通过两种方式进行,一种是自上而下的策略;另一种则是自下而上的方法。
自上而下的方法主要通过对整个基因组的测序,从而识别出基因组中的所有基因。
这种方法可以形成很好的基础来进行下一步的研究,例如基因的表达功能和基因在微生物界的分类地位。
自下而上的方法则主要侧重于对基因集体的研究,进而了解其在之中的特异性。
这种方法主要通过研究可定制的小组件,例如单个酶、细胞表面蛋白质等来分析基因组信息。
四、细菌基因组的扩增与其他活细胞一样,细菌细胞也能够复制自己的DNA。
同时,细菌基因组复制过程也需要多个复制酶才能完成。
新生细胞繁殖时,会把儿子细胞的基因组进行复制,最终将原细胞分裂成等大的两部分细胞(母细胞和儿细胞)。
五、细菌基因组分析的应用细菌基因组分析的应用是非常广泛的,其中包括以下几个方面:对于微生物群落的建立及其多样性的研究;对于细菌的病原性和抗药性以及基因转移的分析;对于能源代谢及其它的代谢过程等基因表达方面的研究。
细菌学的研究进展及应用探索随着科技与生活水平的提高,人们对生命科学的研究与应用也越来越广泛而深入。
其中,细菌学作为一个重要的研究领域和应用领域,得到了越来越多的关注和投入。
本文将从细菌学的基础知识、最新研究进展以及应用方面进行探讨,旨在展示细菌学近年来的发展与前景。
一、细菌学的基础知识细菌是一类简单的单细胞生物,其大小通常只有1-2微米,但是数量庞大,且分布广泛。
细胞壁、质膜、细胞质、核酸和一些酶是细菌的基本结构,这些结构使得细菌能够在对抗自然环境、寻找食物等方面具有强大的适应能力。
细菌是地球上最古老的生命形式之一,其存在时间可以追溯到40亿年前。
细菌学通过对细菌的形态、组成、生长、代谢、遗传等方面的研究,为人类认识细菌的危害、利用以及与之共存的方式提供了基础性的知识。
二、细菌学的最新研究进展随着生命科学研究的不断深入和技术水平的提高,细菌学的研究也在不断进行着突破性的探索。
下面将介绍细菌学领域的一些最新研究进展。
1、鉴定新型细菌近年来,人们对很多新型细菌的发现和鉴定进行了深入研究。
其中,有些细菌对人体的健康产生很大的影响。
比如,新冠病毒就是近年来在全球范围内引起大规模传播的一种新型冠状病毒。
此外,还有蒸汽菌属、腐球菌属、氨基酸杆菌属等新型细菌的发现也成为了细菌学研究的热点。
2、细菌基因组的研究细菌是生物界中最早被接受而且最具代表性的模型生物之一。
细菌基因组的解析已经在人类基因组计划建立之前开始,几乎所有的生命科学领域都涉及到了基因组学。
细菌基因组的解码在近年来也取得了长足的进展。
目前,科学家已经测定了5,000多种细菌的基因组序列,这种研究对于充分理解细菌的基本结构和功能具有十分重要的意义。
3、细菌的代谢调控细菌代谢是一系列复杂的生化反应过程,包括碳水化合物、脂肪酸和氨基酸等小分子有机物的合成和分解。
近些年来,科学家通过对细菌代谢方面的研究,成果有望在人类健康领域发挥重要的作用。
例如,学者利用现代分子技术在细菌中制备人体所需要的乳酸和阿斯匹林等分子,为人类做出了一定的贡献。
细菌基因组的结构和功能
细菌和病毒一样同属原核生物,因而细菌基因组的结构特点在许多方面与病毒的基因组特点相似,而在另一些方面又有其独特的结构和功能。
本节首先介绍细菌染色体基因组的一般结构特点,然后再具体介绍大肠杆菌染色体基因组
的结构和功能。
1细菌染色体基因组结构的一般特点
(1)细菌的染色体基因组通常仅由一条环状双链
DNA分子组成细菌的染色体相对聚集在一起,形成一
个较为致密的区域,称为类核(nucleoid)。
类核无
核膜与胞浆分开,类核的中央部分由RNA和支架蛋白
组成,外围是双链闭环的DNA超螺旋。
染色体DNA通
常与细胞膜相连,连接点的数量随细菌生长状况和不同的生活周期而异。
在DNA链上与DNA 复制、转录有关的信号区域与细胞膜优先结合,如大肠杆菌染色体DNA的复制起点(OriC)、复制终点(TerC)等。
细胞膜在这里的作用可能是对染色体起固定作用,另外,在细胞分裂时将复制后的染色体均匀地分配到两个子代细菌中去。
有关类核结构的详细情况目前尚不清楚。
(2)具有操纵子结构(有关操纵子结构详见基因表达的调控一章)其中的结构基因为多顺反子,即数个功能相关的结构基因串联在一起,受同一个调节区的调节。
数个操纵子还可以由一个共同的调节基因(regulatorygene)即调节子(regulon)所调控。
(3)在大多数情况下,结构基因在细菌染色体基因组中都是单拷贝但是编码rRNA的基因rrn往往是多拷贝的,这样可能有利于核糖体的快速组装,便于在急需蛋白质合成时细胞可以在短时间内有大量核糖体生成。
(4)和病毒的基因组相似,不编码的DNA部份所占
比例比真核细胞基因组少得多。
(5)具有编码同工酶的同基因(isogene)例如,在
大肠杆菌基因组中有两个编码分支酸(chorismicacid)
变位酶的基因,两个编码乙酰乳酸(acetolactate)合成
酶的基因。
(6)和病毒基因组不同的是,在细菌基因组中编码
顺序一般不会重叠,即不会出现基因重叠现象。
(7)在DNA分子中具有各种功能的识别区域如复制
起始区OriC,复制终止区TerC,转录启动区和终止区等。
这些区域往往具有特殊的顺序,并且含有反向重复顺序。
(8)在基因或操纵子的终末往往具有特殊的终止顺序,它可使转录终止和RNA聚合酶从DNA链上脱落。
例如大肠杆菌色氨酸操纵子后尾含有40bp的GC丰富区,其后紧跟AT丰富区,这就是转录终止子的结构。
终止子有强、弱之分,强终止子含有反向重复顺序,可形成茎环结构,其后面为polyT结构,这样的终止子无需终止蛋白参与即可以使转录终止。
而弱终止子尽管也有反向重复序列,但无polyT结构,需要有终止蛋白参与才能使转录终止。
2大肠杆菌染色体基因组的结构和功能
大肠杆菌染色体基因组是研究最清楚的基因组。
估计大肠杆菌基因组含有3500个基因,已被定位的有900个左右。
在这900个基因中,有260个基因已查明具有操纵子结构,定位于75个操纵子中。
在已知的基因中8%的序列具有调控作用。
大肠杆菌染色体基因组中已知的基因多是编码一些酶类的基因,如氨基酸、嘌呤、嘧啶、脂肪酸和维生素合成代谢的一些酶类的基因,以及大多数碳、氮化合物分解代谢的酶类的基因。
另外,核糖体大小亚基中50多种蛋白质的基因也已经鉴定了。
除了有些具有相关功能的基因在一个操纵子内由一个启动子转录外,大多数基因的相对位置可以说是随机分布的。
如控制小分子合成和分解代谢的基因,大分子合成和组装的基因分布在大肠杆菌基因组的许多部位,而不是集中在一起。
再如,有关糖酵解的酶类的基因分布在染色体基因组的各个部位。
进一步发现,大肠杆菌和与其分类关系上相近的其他肠道菌如志贺氏杆菌属(Shigella)、沙门氏菌属(Salmonella)等具有相似的基因组结构。
伤寒沙门氏杆菌(Salmonellatyphimurium)几乎与大肠杆菌的基因组结构相同,虽然有10%的基因组序列和大肠杆菌相比发生颠倒,但是其基因的功能仍正常。
这更进一步说明染色体上的基因似乎没有固定的格局,相对位置的改变不会影响其功能。
在已知转录方向的50个操纵子中,27个操纵子按顺时针方向转录,23个操纵子按反时针方向转录,即DNA两条链作为模板指导mRNA合成的机率差不多相等。
在大肠杆菌染色体基因组中,差不多所有的基因都是单拷贝基因,因为多拷贝基因在同一条染色体上很不稳定,极易通过同源重组的方式丢失重复的基因序列。
另外,由于大肠杆菌细胞分裂极快,可以在20分钟内完成一次分裂,因此,携带多拷贝基因的大肠杆菌并不比单拷贝基因的大肠杆菌更为有利;相反,由于多拷贝基因的存在,使E.coli的整个基因组增大,复制时间延长,因而更为不利,除非在某种环境下,需要有多拷贝基因用来编码大量的基因产物,例如,在有极少量乳糖或乳糖衍生物的培养基上,乳糖操纵子的多拷贝化可以使大肠杆菌充分利用的乳糖分子。
但是,一旦这种选择压力消失,如将大肠杆菌移到有丰富的乳糖培养基上,多拷贝的乳糖操纵子便没有存在的必要,相反,由于需要较长的复制时间,这种重复的多拷贝基因会重新丢失。
大肠杆菌染色体基因组中,大多数rRNA基因集中于基因组的复制起点oriC的位置附近。
这种位置有利于rRNA基因在早期复制后马上作为模板进行rRNA的合成以便进行核糖体组装和蛋白质的合成。
从这一点上看,大肠杆菌基因组上的各个基因的位置与其功能的重要性可能有一定的联系。
3 细菌基因组研究所提供的机遇和挑战
目前,微生物界正面临在下一世纪中如何发展的严峻问题。
在20世纪微生物学科为生命科学及人类的健康作出了卓越的贡献。
全世界唯一被消灭的天花,痘苗的发展及应用起了关键作用。
由于微生物基因组较小,将会超过其它生物更快地完成基因组的结构与功能分析,获得的信息将会首先被应用于药物、疫苗产品的开发和疾病的防治。
例如最近对2株不同的幽门螺杆菌基因组分析和对比,发现1994年自美国分离的菌株199与1987年自英国分离的菌株26695,仅有(6~7)%的基因结构差异。
这些不同基因的半数集中在一个高变区中。
曾有学者认为,幽门螺杆菌可引起不同临床疾病但也可对人有利,其机理可能与菌的基因结构相关。
目前的结果揭示应重点研究这些菌株特异区基因,同时应研究与定居基因表达相关的序列,此外还应考虑过去被忽视的机体因素在幽门螺杆菌致病中的地位。
通过对比幽门螺杆菌和最近完成全基因测序的空肠弯曲菌,发现两种菌仅有17%不同的基因序列。
其中,幽门螺杆菌有独特的基因使之能在胃酸存在的条件下生存并分解尿素。
弯曲菌则比螺杆菌有2倍多的起调控作用的基因。
这些基因可能使弯曲菌能适应多种环境,如人肠腔、鸟肠道、牛奶中。
因弯曲菌能在外环境中生存,在美国去年引起的腹泻患者达30万人。
又如至今未能在体外培养的梅毒螺旋体基因组为1 138 006bp,其毒力因子由一个12个潜在的膜蛋白家族和数个可能的溶血素组成。
对比梅毒与引起Lyme病的螺旋体基因组,也发现了致病性的诸多基因。
结核杆菌基因组的分析也已完成,含4 411 529 bp,编码约4 000个基因。
发现该菌有大量基因是编码脂类合成与分解酶,发现2个富含甘氨酸的新家族,可能是引起该抗原变异的来源。
即使尚未完成全基因组分析,国外已对肺炎链球菌、肠球菌和乳球菌的关键基因序列进行了开发研究。
最值得我们重视的是,这是个新领域,是可以进行创新研究的高起点。