PubMed数据库检索系统
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2012-07-13################2012-07-13#######2#读01者2-·作07者-1·编3#者#######Pubmed 检索系统的主要特点关键词自动转换功能在 PubMed 主页的检索提问框中键入检索词,系统将该检索词按顺序与 MeSH Tr a nsl a t i o n Table (MeSH 转换表),J o ur na l s Tr a nsl a t i o n Table (刊名转换表),P hr a se List (短语列表)和Author Inde x (作者索引)等 4 种索引匹配,找到匹配的词即将其转换成索引中相应的词然后进行检索。
1截词检索功能PubMed 允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。
截词功能只限于单词,对词组无效。
如“i nfec t i o n*”包括“i nfec t i o ns ”,但不包括“i nfec t i o n c o nt r o l ”等。
使用截词功能时,P ubM e d 系统 会自动关闭词汇转换功能。
2强制检索功能PubMed 允许使用双引号来强制系统进行短语检索。
例如,在 PubMed 主页的检索提问框中键入“Si ngl e c e ll ”,系统会将其作为一个不可分割的词组在数据库的全部字段中进行检索。
使用双引号检索,会自动关闭词汇转换功能。
3链接功能链接相关文献44.1PubMed 系统中的每条文献记录均有一个相关文献链接,在检索结果的显示状态下,部分记录的右边均有“Re l a t e d Ar t i c l e s ”超链。
点击该链,系统按文献的相关度从高到低显示相关文献。
链接NCBI 数据库PubMed 在其主页上与 NCBI 的 5 个数据库建立了超链接。
这些数据4.2库包括:P r o t e i n[氨基酸(蛋白质)序列]数据库,N uc l eo t i d e (DN A 序列)数据库,P o pse (t 种群、种系发生或突变序列)数据库,St r uc t ur e (分子结构模型)数据库和 Ge no m e (基因组序列)数据库。
PubMed医学文献检索系统PubMed是因特网上重要的免费文献检索系统。
目前全球最著名的医学文献数据库系统是美国国立医学图书馆的MEDLINE,该数据库重数据免费提供给各个检索系统的开发商,因此在因特网上有重多的免费MEDLINE检索系统。
这些系统所涵盖的文献年代、检索结果的输出格式以及检索途径各不相同,但是,目前被医务人员广泛使用的仍然是美国国立医学图书馆的PubMed系统PubMed和NCBI:1.美国国立医学图书馆“NLM”2.早在1879年,编译医学文献的检索刊物IM3.1964年采用计算机进行电子编辑和排版,在此基础上开发了“医学文献分析与检索系统”(即著名的MEDLARS)4.1971年正式建立了钙系统的联机系统,称为“MEDLARS联机检索系统,MEDLARS online,既MEDLINE 系统。
5.PubMed则是NLM的国家生物信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)开发的一个以网络为基础的检索系统,自1997年免费提供服务PubMed ――特点:PubMed具有MEDLINE 所具有的各种检索和数据库优势,同时还具有以下特点:⏹连接广泛:包括对外链接和对内链接,对内指与NCBI其它数据库的链接和PubMed文献相似度计算后的相关文献链接,对外连接指出版商提供的文献全文的连接,有免费和需要注册的。
⏹更新速度快:出版商直接把电子版提供给NLM⏹收录文献范围广:三个层次的数据库:MEDLINE数据库、PreMEDLINE数据库和出版商直接提供的文献数据库等PubMed ――收录范围总体包括:⏹收录年限:1966~⏹收录内容:70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊的文献和一些非医学内容的文献,主要是MEDLINE。
内容涉及医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等学科,另外有非医学内容的文献,如science 和nature中具有地理学方面的文献。
pubmed主题词检索的主要步骤
步骤一:访问PubMed数据库
打开浏览器,访问https://,进入PubMed数据库的官方网站。
步骤二:选择检索类型
根据需要,选择合适的检索类型,如文章标题、摘要、作者等。
步骤三:输入主题词
在搜索框中输入相关的主题词或关键词,例如疾病名称、药物名称等。
步骤四:设置检索条件
根据需求,设置检索条件,如时间范围、文章类型等。
步骤五:点击搜索按钮
点击搜索按钮开始检索相关的文献。
步骤六:查看检索结果
浏览PubMed数据库返回的检索结果,并根据需要进行筛选和排序。
步骤七:阅读文献摘要
点击感兴趣的文献标题,阅读文献的摘要部分,了解文献的内容和结论。
步骤八:获取全文
如有需要,点击文献页面提供的全文链接,获取完整的文献。
4.5 PUBMED4.5.1概况4.5.2PUBMED检索系统的主要特点4.5.3PUBMED检索4.5.4特征栏介绍4.5.1 PubMed概况u PubMed是由美国国立生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)开发的用于免费检索MEDLINE、PreMEDLINE数据库的网上检索系统, 其网址为:/PubMed/。
u内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。
收录了全世界70多个国家和地区的4 000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1 000万余条,时间起自1966年。
4.5.1 PubMed检索系统主界面4.5.2 检索系统特点u词汇自动转换功能1、MeSH转换表(“Vitamin h”“Biotin [MeSH Terms] ORVitamin h [Text word]”)2、刊名转换表(“new england journal of medicine”“N Engl JMed [Journal Name]”)3、短语表(如果PubMed系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词,就会查找短语表。
)4、作者索引(single cell single AND cell)u截词检索功能(通用截词符为*,使用截词功能时,PubMed系统会自动关闭词汇转换功能。
)u强制检索功能(“Single cell”, 看作词组检索。
)u链接功能(链接相关文献、NCBI、外部资源、相关图书)u检索规则(1)and、or、not、Same。
(2)*代表任意多个字符,?代表任意一个字符。
(3)词组或短语:“”(4)字段限定,在检索词后加[字段缩写]。
如aromatherapy [mh],表示限定在主题词表中检索。
u普通检索(1)主题检索(“vitamin c common cold”,进行词汇自动转换)(2)作者检索(“smith ja”[au])(3)刊名检索(gene therapy[ta]J Hand Surg[Am]J Hand Surg Am)u例:检索有关肿瘤的诊断与治疗方面的文献u限定检索在普通检索的基础上,用户可以选择作者、期刊、全文还是文摘、日期、人类或动物研究、性别、语种、出版类型等字段进行限定检索,以缩小检索范围。