2015年pubmed数据库使用指南
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PubMed完全攻略第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述有位退休的老教授不止一次的向我感叹:"你们现在真是幸福,我们那时候要查一篇相关的文献,要到图书馆一本一本目录去检索。
尤其是做一些别人不太做的课题时,要搜集几篇有用的文献,竟要花上3,4个月时间,而你们现在……。
"趁他打顿的时候,我告诉他,"快的话,可能只要3秒钟"。
从他两个厚厚的酒瓶底后面露出一丝羡慕的眼神。
我可以想见他当时在一大堆期刊中埋头查阅的情形,但对于现在的医学工作者来说,我已经无法想像,如果我们失去PubMed,世界将会怎样。
尽管在因特网上,类似于PubMed的医学文献检索系统并不少,但就其信息量,使用的方便程度,更新速度等多方面因素而言,PubMed都首屈一指。
还有非常重要的一点,正如它的名字(PubMed=Public+Medicine)所暗示的, PubMed是免费向公众开放的。
无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed 所给你带来的无穷便利。
俗话说,喝水不忘掘井人。
PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。
有不少西方人有在饭前祈祷感恩的习惯,不知道我们是否也有必要每次使用PubMed 前都感谢NCBI呢?PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。
其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代,通常而言,这已经足够早了,很少有人会需要查阅在此之前的文献。
当然,研究生物医学史的工作者可能是个例外。
而最新的文献几乎就在此时此刻。
与PubMed挂钩的出版商会自动向PubMed提供最新的文献摘要,而往往在这个时候文献还没有正式出版。
所以尽管生物医学的文章从被期刊接受到出版往往要好几个月的时间,但借助于PubMed,我们仍旧可以随时掌握最新的动向,从而大大有利于自己的临床和研究工作。
PubMed使用手册【基本查询方法】∙一个检索词:一个单词:在文本框中输入检索词,按GO查询。
含两个单词以上的检索词:需要加双引号,注意是英文输入状态下的双引号。
如:"ultrasonic diagnosis"是正确的,“ultrasonic diagnosis”是错误的∙两个以上的检索词:可使用 AND、OR 连接各检索词。
如:"three dimensional ultrasound" AND thyroid ∙可以在“limit”菜单下限制文献出版的时间、语种等等。
【完全手册】PubMed 系统的主要特点1.词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping)在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。
(1)MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。
如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词(题名词和文摘词)进行检索。
例如:键入"Vitamin h",系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。
(2)刊名转换表(Journal Tanslation Table),包括刊名全称、MEDLINE 形式的缩写和ISSN号。
该转换表能把键入的刊名全称转换为"MEDLINE缩写[Journal Name]"后进行检索。
如:在检索提问框中键入:"new england journal of medicine", PubMed将其转换为"N Engl J Med [Journal Name]"后进行检索。
(3)短语表(Phrase list)。
PubMed中文使用手册Jeffrey Wu(一)PubMed简介:PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。
PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。
PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。
PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
(二)页面介绍:(更新很快,但其内容变化一般不大)在你的浏览器中的URL地址框中健入/pubmed/并单击回车键后,你将进入Pubmed的主页面。
如图:1. 主页面左侧框的介绍(注:Cubby和tutorial为最新加入的)MeSh Browser你可以用它来分层浏览MesH表Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
Batch Citation Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。
Old PubMed (使用以前的PubMed查询方式)关于每一项的具体使用方法, 后面将会有详细介绍。
Related ResourcesOrder Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。
Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。
Grateful Med也提供MEDLINE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。
P u b M e d中文使用手册work Information Technology Company.2020YEARPubMed中文使用手册(一)PubMed简介:PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。
PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。
PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。
PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
(二)页面介绍:(更新很快,但其内容变化一般不大)在你的浏览器中的URL地址框中健入/pubmed/并单击回车键后,你将进入Pubmed的主页面。
如图:1. 主页面左侧框的介绍(注:Cubby和tutorial为最新加入的)MeSh Browser你可以用它来分层浏览MesH表Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
Batch Citation Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。
Old PubMed (使用以前的PubMed查询方式)关于每一项的具体使用方法, 后面将会有详细介绍。
Related ResourcesOrder Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。
Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。
PubMed检索系统简介PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE 数据库的网上检索系统。
MEDLINE是美国国立医学图书馆(U.S.National Library of Medicine)最重要的书目文摘数据库,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。
收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1000万余条,时间起自1966年。
PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。
它每天都在不断地接受新数据,可为用户提供基本的文献条目和文摘,其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。
PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据,这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明,并标有[Record as supplied by publisher]的标识。
这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送,但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围,将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代,例如在综合性的科学杂志(Science 或Nature)上发表的地理学文章等。
PubMed 系统的主要特点1.词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping)在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。
(1)MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。
如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord 词(题名词和文摘词)进行检索。
例如:键入“Vitamin h",系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。
PubMed医学文献检索系统PubMed是因特网上重要的免费文献检索系统。
目前全球最著名的医学文献数据库系统是美国国立医学图书馆的MEDLINE,该数据库重数据免费提供给各个检索系统的开发商,因此在因特网上有重多的免费MEDLINE检索系统。
这些系统所涵盖的文献年代、检索结果的输出格式以及检索途径各不相同,但是,目前被医务人员广泛使用的仍然是美国国立医学图书馆的PubMed系统PubMed和NCBI:1.美国国立医学图书馆“NLM”2.早在1879年,编译医学文献的检索刊物IM3.1964年采用计算机进行电子编辑和排版,在此基础上开发了“医学文献分析与检索系统”(即著名的MEDLARS)4.1971年正式建立了钙系统的联机系统,称为“MEDLARS联机检索系统,MEDLARS online,既MEDLINE 系统。
5.PubMed则是NLM的国家生物信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)开发的一个以网络为基础的检索系统,自1997年免费提供服务PubMed ――特点:PubMed具有MEDLINE 所具有的各种检索和数据库优势,同时还具有以下特点:⏹连接广泛:包括对外链接和对内链接,对内指与NCBI其它数据库的链接和PubMed文献相似度计算后的相关文献链接,对外连接指出版商提供的文献全文的连接,有免费和需要注册的。
⏹更新速度快:出版商直接把电子版提供给NLM⏹收录文献范围广:三个层次的数据库:MEDLINE数据库、PreMEDLINE数据库和出版商直接提供的文献数据库等PubMed ――收录范围总体包括:⏹收录年限:1966~⏹收录内容:70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊的文献和一些非医学内容的文献,主要是MEDLINE。
内容涉及医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等学科,另外有非医学内容的文献,如science 和nature中具有地理学方面的文献。