qRT-PCR实验操作流程
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Q-PCR实验流程一、①实验前准备,每天早上到实验室后,先把超净工作台的紫外灯打开15-20分钟。
②超净台前做实验,需佩戴干净的橡胶手套/一次性薄膜手套,RNA抽提需带口罩。
③取EP管/枪头时需用镊子,不可以用使用过的手套直接取用.取完EP管/枪头后,袋子及时封好。
④橡胶手套须放入超净台照射紫外,实验操作过程中不得带出超净台,移液器在一天工作结束后调至最大量程,并用75%乙醇清洁移液器,枪头盒及超净台面。
⑤实验进行的过程中或观看实验时,没有带口罩不要在超净台前讲话。
二、总RNA抽提1)细胞培养皿中细胞样品用1*PBS洗两次后,用1ml枪将PBS吸干净,加入1ml Trizol (Invitrogen)溶液,吹打混匀,并吸至1.5ml RNase free EP 管中使细胞充分裂解,室温静置5min;组织样品用液氮充分研磨,加入1ml Trizol (Invitrogen)溶液,混匀,室温放置5min使其充分裂解;(管盖与管壁都需标记样品名称)2)加入200μl氯仿,剧烈振荡混匀30s,使水相和有机相充分接触,室温静置3—5min;(离心时离心管按顺序排放,离心完毕,离心管的顺序也按顺序排好,与第一步的顺序一致)3) 4℃下,14,000g离心15min,可见分为三层,RNA在上层水相,移至另一个新的RNase free EP管;(用20-200ul的枪吸取上清,吸上清时,枪头应沿着液面上层吸取上清,枪头不可碰到、吸到中间层)4)沉淀RNA:加入等体积异丙醇,轻柔地充分混匀(颠倒6-8次)(不应用振荡器混匀),室温静置10min;5)4℃下,14,000g离心10min,收集RNA沉淀(如离心后仍不见EP管底部有沉淀,应将EP管放置在-80度冰箱过夜,继续在4℃下,14,000g 离心10min,收集RNA沉淀),去上清;6)用75%乙醇洗涤两次(12,000g离心5min)(加入乙醇后只需轻轻颠倒EP 管即可,不用振荡器震荡或枪头吸打沉淀),超净台风干;沉淀不能过干或过湿,过干则不易溶解,过湿则乙醇残留。
qrt-pcr操作流程qRT-PCR操作流程引言qRT-PCR(quantitative reverse transcription polymerase chain reaction)是一种广泛应用于基因表达研究的技术,通过逆转录将RNA转化为cDNA,再利用聚合酶链反应(PCR)技术进行扩增和检测。
本文将详细介绍qRT-PCR的操作流程。
1. 实验前准备在进行qRT-PCR实验之前,需要准备以下材料和设备:- RNA样本:提取需要研究的组织或细胞中的总RNA。
- 逆转录试剂盒:包括逆转录酶、随机引物、dNTPs等。
- PCR试剂盒:包括聚合酶、引物、dNTPs等。
- qRT-PCR仪器:包括逆转录仪和实时荧光定量PCR仪。
- 实验耗材:包括离心管、PCR管、PCR板等。
2. RNA逆转录a. 将RNA样本与逆转录试剂混合,并在逆转录仪中进行反应。
通常情况下,逆转录反应体系包括RNA样本、逆转录酶、随机引物、dNTPs等。
b. 根据逆转录试剂盒的说明书,设置逆转录反应的温度和时间。
一般来说,逆转录反应的温度范围为42-55°C,反应时间为30-60分钟。
3. cDNA合成a. 将逆转录反应得到的cDNA样品与PCR试剂混合,并在PCR仪器中进行扩增反应。
通常情况下,PCR反应体系包括cDNA样品、聚合酶、引物、dNTPs等。
b. 根据PCR试剂盒的说明书,设置PCR反应的温度和时间。
一般来说,PCR反应包括初始变性步骤(95°C,3-5分钟)、循环扩增步骤(95°C,15-30秒;引物退火温度,30-60秒;72°C,15-30秒)、终止步骤(72°C,5-10分钟)等。
c. 根据所需的扩增产物大小,设置PCR反应的循环次数。
一般来说,循环次数在25-40次之间。
4. 实时荧光定量PCRa. 将PCR反应产物与实时荧光定量PCR试剂混合,并将混合物加入PCR板中。
qPCR实验操作流程`Q-PCR实验流程一、①实验前准备,每天早上到实验室后,先把超净工作台的紫外灯打开15-20分钟。
②超净台前做实验,需佩戴干净的橡胶手套/一次性薄膜手套,RNA抽提需带口罩。
③取EP管/枪头时需用镊子,不可以用使用过的手套直接取用。
取完EP管/枪头后,袋子及时封好。
④橡胶手套须放入超净台照射紫外,实验操作过程中不得带出超净台,移液器在一天工作结束后调至最大量程,并用75%乙醇清洁移液器,枪头盒及超净台面。
⑤实验进行的过程中或观看实验时,没有带口罩不要在超净台前讲话。
二、总RNA抽提1)细胞培养皿中细胞样品用1*PBS洗两次后,用1ml枪将PBS 吸干净,加入1ml Trizol (Invitrogen)溶液,吹打混匀,并吸至RNase free EP管中使细胞充分裂解,室温静置5min;组织样品用液氮充分研磨,加入1ml Trizol (Invitrogen)溶液,混匀,室温放置5min使其充分裂解;(管盖与管壁都需标记样品名称)2)加入200μl氯仿,剧烈振荡混匀30s,使水相和有机相充分接触,室温静置3-5min;(离心时离心管按顺序排放,离心完毕,离心管的顺序也按顺序排好,与第一步的顺序一致)3)4℃下,14,000g离心15min,可见分为三层,RNA在上层水相,移至另一个新的RNase free EP管;(用20-200ul的枪吸取上清,吸上清时,枪头应沿着液面上层吸取上清,枪头不可碰到、吸到中间层)4),5)沉淀RNA:加入等体积异丙醇,轻柔地充分混匀(颠倒6-8次)(不应用振荡器混匀),室温静置10min;6)4℃下,14,000g离心10min,收集RNA沉淀(如离心后仍不见EP管底部有沉淀,应将EP管放置在-80度冰箱过夜,继续在4℃下,14,000g离心10min,收集RNA沉淀),去上清;7)用75%乙醇洗涤两次(12,000g离心5min)(加入乙醇后只需轻轻颠倒EP管即可,不用振荡器震荡或枪头吸打沉淀),超净台风干;沉淀不能过干或过湿,过干则不易溶解,过湿则乙醇残留。
组织miRNA提取和qRT PCR组织mirna提取和qrt-pcr组织miRNA提取(e.z.n.a.mirnakit)器具和耗材e、 Z.n.a.mirna试剂盒、一套取样器、旋涡、离心机、离心管架、各种规格的离心管(15ml、1.5ml)、各种规格的无核糖核酸酶吸盘(1ml、200ul、10ul)、镊子、砂浆、研磨棒、保温杯(用于液氮):氯仿、75%乙醇、100%乙醇、rnase-free水操作步骤:准备工作1.实验前一天,将研钵和研磨棒浸入84消毒剂中24小时,并在实验前30分钟加入液氮冷却。
2.实验前清洁试验台,用75%乙醇擦拭2张试验台,并在试验台和使用的仪器盒上喷洒不含RNase的水;3.将15ml离心管在液氮中提前预冷。
4.向RWBwash缓冲液中加入48ml无水乙醇。
5.将冻存样品从-70℃冰箱转移至装有液氮的保温杯中。
组织研磨和均质1.取冰冻组织材料50-100mg置于放有液氮的研钵中,在研钵中加液氮研磨成粉末(尽量细),注意持续补充液氮;2.用在液氮中预冷的1ml吸头转移组织粉末至提前预冷的15ml离心管中3.待液氮完全蒸发后加入1mlrna-solv试剂,室温下孵育2-3min4.向每1ml RNA溶剂试剂中加入200ul氯仿,盖上试管,剧烈摇匀,在冰中培养10min,12000g,在4℃下离心15min5.将不超过80%的上清液转移到新的2ml离心管中,加入1/2体积的无水乙醇,涡旋震荡。
除去largerna6.将硅胶柱放入2ml集液管中,从第5步的混合液中抽出700ul,加入Hibindmaic柱(如果量大,混合液可多次通过柱过滤),将所有液体移入柱内,旋涡振动。
收集管和硅胶柱在室温下离心30-60s,每次10000g。
将离心后的流出物放入新的2ml收集管(用于提取小RNA)7.将剩余混合液重复第6步,流出液转移到相同的收集管中。
纯化的miRNA8.估计6和7步中流出液的总量,加入0.9倍体积的无水乙醇,涡旋震荡混匀。