丙型肝炎病毒基因分型检测方法研究进展_周一萌
- 格式:pdf
- 大小:196.31 KB
- 文档页数:4
丙型肝炎的检测方法与技术进展丙型肝炎(Hepatitis C)是一种由丙型肝炎病毒(HCV)引起的肝炎疾病。
它是一种全球性的公共卫生问题,据世界卫生组织(WHO)统计,全球约有7100万人感染了丙型肝炎病毒。
丙型肝炎病毒主要通过血液传播,感染途径包括输血、注射毒品、共用针头、器官移植、性传播以及婴儿由感染母亲传播等。
丙型肝炎是一种慢性肝炎,大约70-80%的感染者会发展成慢性感染。
长期的慢性感染可能导致肝硬化、肝癌等严重后果。
因此,及早发现和治疗丙型肝炎对预防并发症的发生至关重要。
一、丙型肝炎的检测方法目前,丙型肝炎的检测主要包括两个方面:抗体检测和病毒核酸检测。
1. 抗体检测抗体检测是最常用的丙型肝炎初筛方法。
它通过检测人体对丙型肝炎病毒的免疫反应,判断是否曾经感染过该病毒。
常用的抗体检测方法包括酶联免疫吸附试验(ELISA)和免疫荧光法(IFA)。
这些方法简单、快速、成本低廉,适用于大规模筛查。
然而,抗体检测不能确定感染者的感染状态,即无法区分急性感染和慢性感染。
因此,对于抗体检测结果阳性的个体,需要进一步进行病毒核酸检测以确定感染状态。
2. 病毒核酸检测病毒核酸检测是确定丙型肝炎感染状态的关键方法。
它通过检测丙型肝炎病毒的RNA或DNA来确定感染者是否存在病毒复制。
常用的病毒核酸检测方法包括聚合酶链反应(PCR)和实时荧光定量PCR。
病毒核酸检测可以确定感染者的病毒载量,即病毒在血液中的浓度。
高病毒载量的感染者通常表示病情较严重,需要及早治疗。
此外,病毒核酸检测还可以用于评估治疗效果和监测病情进展。
二、技术进展近年来,丙型肝炎的检测技术得到了快速发展,主要体现在以下几个方面:1. 新一代测序技术新一代测序技术的出现,使得丙型肝炎病毒的基因组学研究取得了重大突破。
通过对丙型肝炎病毒基因组的测序分析,可以更好地了解其变异情况、毒力差异及耐药性等。
这为疫苗研发、药物研究以及个体化治疗提供了重要依据。
丙型肝炎病毒基因分型的研究进展丙型肝炎病毒是输血后感染肝炎常见的一种病毒,目前其分为6型,其亚型已经超过100个,由于其复制依赖的酶缺乏校对功能,所以易发生突变,这也是丙型肝炎病毒基因组分型的基础。
其分型的命名因为采取的标准及使用的分析方法不一样也有不同的命名系统。
丙型肝炎病毒基因的检测方法很多,但是不简便经济,而且其与丙型肝炎有很大的关系。
标签:丙型肝炎病毒;基因分型;进展研究在如今生活中,除了乙肝是常见肝病外,丙肝患者的比例越来愈高,究其原因主要是人们对于丙肝的感染途径不了解,未对丙肝给予足够的重视。
其传播途径主要有:①输血及血制品,尤其是反复输血及使用血制品者,据统计,输血后肝炎70%以上是丙型肝炎。
②不正规注射。
③伤口未护理。
④性接触。
⑤母婴传播。
在这几种传播途径中,①④⑤最易感染丙肝。
在日常生活中,人们需要采取相关防范措施,以免感染丙肝。
1 HCV的结构HCV的RNA大约有9500-10000bp组成,其5′非编码区有319-341bp,3′非编码区有27- 55bp。
在5′非编码区下有一开放阅读框(ORF),其基因排列顺序为5’C-E1-E2-p7-NS2-NS3-NS4-NS5-3,能编码多聚蛋白前体(一长3014个的氨基酸)。
经宿主细胞及自身蛋白酶作用可裂解成三种结构蛋白,其分别为核心蛋白、糖蛋白、非结构蛋白三种。
HCV基因标记有很多种,如GP72,其基因标记为E2/NS1。
其糖蛋白能产生抗HCV的中和作用。
还有NS2、NS3、NS4等基因标记。
NS2和NS4的功能可能与细胞膜紧密结合在一起。
NS3参与解旋HCV-RNA 分子,具有螺旋酶活性,以辅助RNA复制,NS5参与HCV基因组复制,依赖于RNA的聚合酶活性。
2 HCV的分型及地理差异目前HCV分型尚无统一的定论,这是因为在研究的过程中采取的技术及研究的位置不一致,因而出现了很多基因分型,这些基因分型没有同一的标准。
综合各个国家的研究结果,大致上可分为6型,其亚型很多。
丙肝病毒的基因分型研究丙肝病毒(HCV)是一种由丙型肝炎病毒引起的肝炎。
HCV目前已知有7种基因型和数百个亚型,这些基因型和亚型的分布在世界各地不均。
在病毒的基因分型研究中,HCV的分型是很重要的一部分。
本文将介绍丙肝病毒的基因分型研究。
一、HCV基因分型的意义HCV感染与肝硬化、肝癌等肝脏疾病密切相关。
由于HCV的基因型和亚型分布不均,不同的基因型和亚型对治疗的反应和预后有所不同。
因此,HCV的基因分型对于合理治疗和预后的判断非常重要。
此外,基因分型也对疫苗的研发和应用有着重要的意义。
二、HCV基因分型研究方法1、序列比对法序列比对法是基于先前已知HCV序列,通过测序分析新的HCV标本,比对其序列的方法。
将新序列与已知序列比对后,可以判断其基因型和亚型。
2、基于引物的多重PCR法PCR技术能够扩增HCV基因组,通过设计一系列引物扩增不同区域的基因序列,从而得到标本中的基因组序列。
此方法准确性高,操作简便,是目前最为常用的分型方法之一。
3、序列共有分析法序列共有分析法是一种基于HCV基因组序列共有区域的分型方法,可以将不同基因型和亚型的序列分别分到足够的统计学群体中,判断其分类归属。
三、HCV基因型分布情况各地区的HCV基因分型和亚型分布存在差异,统计数据显示,目前已知的HCV基因型有1-7型,其中以1、2、3型最为常见。
众所周知,1b型与肝癌的关联度最高,且对标准干扰素基础治疗的反应最不理想。
然而,亚型的分布更加细致,目前已知的HCV亚型达数百种之多。
四、HCV基因分型对治疗的影响HCV感染后的治疗方法主要为干扰素联合利巴韦林等药物的抗病毒治疗。
不同基因型对于治疗的反应和预后有所不同。
研究表明,1型HCV治疗的成功率相对较低,而2、3型HCV的治疗响应相对较高。
此外,HCV基因型的分型也与治疗过程中出现的副作用有关。
总之,丙肝病毒的基因分型是进行丙肝治疗和疫苗研发的前提,对研究HCV感染的流行病学学和预后有着重要的意义。
丙型肝炎病毒基因分型的研究进展解莹;谢晨【摘要】丙型肝炎病毒是一个高度异质性的RNA病毒,目前可分为6个基因型与不同的亚型.本文就 HCV基因型构成、HCV基因分型的检测方法与命名、HCV基因型的流行病学的意义、HCV基因型与疾病严重性、急性HCV感染的转归、IFN-α疗效、HCV基因分型与疫苗的研制等有关的研究作一综述.【期刊名称】《大连医科大学学报》【年(卷),期】2010(032)004【总页数】5页(P470-474)【关键词】丙型肝炎病毒;基因分型;研究进展【作者】解莹;谢晨【作者单位】大连医科大学附属第二医院,传染科,辽宁,大连,116023;大连医科大学附属第二医院,传染科,辽宁,大连,116023【正文语种】中文【中图分类】R512.6+3丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)感染呈全球分布,全世界人群HCV感染率为3.0 %(0.1%~10%)。
在中国HCV的感染率为3.2%,约3800万。
近年来,中国丙型肝炎的诊断率在不断的提高,丙型肝炎新报告病例也不断增加[1]。
HCV 感染后病情隐匿,50%~80%会转变成慢性肝炎,如未经合理治疗,其中10%~30%经10~20年后会发展成肝硬化,1%~3%会发展成原发性肝癌[2,3],严重危害患者的健康和生命。
HCV具有高度异质性,不同地区、不同患者,甚至同一患者在不同病程中HCV分离株,无论是核苷酸序列,还是氨基酸序列均有显著差异[4-6]。
本文就丙型肝炎病毒基因分型及其临床意义作一综述。
1 HCV基因型1.1 HCV基因型构成20世纪70年代初就提出了非甲非乙型肝炎(NANB肝炎)的概念,1975年,英国Lancet杂志首次使用这个名词。
1989年,美国Chiron公司Choo[7]等先采用分子生物学技术成功地将HCV cDNA克隆成功,并在日本东京召开的“国际非甲非乙型肝炎和经血传播的传染病学术会议”上正式命名HCV。
试分析HCV基因分型在丙肝诊断及医学检验中的应用摘要:目的:通过对74例丙型肝炎病毒(HCV)基因分型实验室检测结果并结合临床资料进行分析,探讨HCV基因分型的临床应用价值。
方法:收集我院住院患者抗-HCV和丙型肝炎病毒RNA核酸定量均为阳性的标本,采用丙型肝炎基因分型特异性引物及荧光探针,应用一步法聚合酶链式反应(RT-PCR)结合Taqman技术对HCV进行Ⅰ型和非Ⅰ型的荧光PCR分型检测。
结果:检测74例标本共检出两种基因型,分别为:Ⅰ型基因30例,非Ⅰ型基因44例;74例感染者有输血者40例。
结论:74例感染者各基因型男女感染的比例差异无统计学意义,通过输血感染丙型肝炎病毒无性别差异。
综合分析,HCV基因分型对丙型肝炎的预防、诊断、治疗、个体化用药以及愈后评估都具有重要意义。
关键词:丙型肝炎病毒;基因分型;检验To analyze the application of HCV genotyping in diagnosis and medical examination of hepatitis c Abstract: objective: to explore the clinical application value of HCV genotyping by analyzing the laboratory test results of 74 cases of hepatitis c virus (HCV) genotyping combined with clinical data.Methods: to collect our anti - HCV and hospitalized patients with hepatitis c virus (HCV) RNA nucleic acid quantitative are all positive specimens, the hepatitis c genotyping specific primers and fluorescent probe, application of one-step polymerase chain reaction (rt-pcr) combined with Taqman technology for HCV Ⅰ and non Ⅰ fluorescence PCR points detection.Results: the test specimens of 74 cases of two genotypes were detected, respectively: Ⅰ type gene 30 cases, non Ⅰ44 genes;There were 40 cases of blood transfusion in 74 cases of infection.Conclusion: there wasno statistically significant difference in the proportion of male and female patients infected with various genotypes in 74 cases, and there was no gender difference in HCV infection through blood transfusion.Based on comprehensive analysis, HCV genotyping is of great significance for the prevention, diagnosis, treatment, individualized medication and postoperative evaluation of hepatitis c.Key words: hepatitis c virus;Genotyping;inspection丙型病毒性肝炎是一种广泛传播的疾病,是导致慢性病毒性肝炎、肝硬化、肝细胞癌的主要病因之一,而这些病变的形成与其病原丙型肝炎病毒(HCV)的某些重要生物学特性有关[1]。
龙源期刊网
丙型肝炎病毒基因分型的基因芯片法检测
作者:濮翔科等
来源:《中国实用医药》2012年第32期
【摘要】目的建立丙型肝炎病毒基因分型的基因芯片检测法,了解丙型肝炎病毒基因型与病毒复制及肝功能损害的关系。
方法收集49例丙型肝炎患者血清标本,建立实验室基因芯片法检测丙型肝炎病毒基因型,采用荧光定量聚合酶链反应检测血清丙型肝炎病毒核糖核酸(HCV RNA)水平,同时检测丙氨酸转氨酶(ALT)、天门冬氨酸转氨酶(AST)等肝功能相关指标。
结果患者49例分为两组,1型丙型肝炎病毒有43例(87.76%),非1型丙型肝炎病毒有6例(12.24%)。
1型与非1型相比较,两组患者血清HCV RNA、ALT水平没有明显差异(P>0.05),但血清AST水平差异有显著性(P。
丙型肝炎病毒抗体的检测及其临床应用进展【摘要】:象其它传染病一样,丙型肝炎是社会医学工作者所面临的又一个重要课题:目前,全球约有2亿人感染丙肝,其中在发展中国家的感染率、发病率尤高。
美国疾病控制中心(Centers for Disease Control and Prevention,CDC)在2000年的统计数据,美国有一万人死于丙肝感染;据估计,到2010年,丙肝的死亡率将可能超过艾滋病。
1988~1989年,对引起非甲非乙型肝炎(Non-A and non-B hepatitis,NANBH)的病原体研究取得了突破性进展,从一患有慢性NANBH的黑猩猩外周血中分离得到的一种RNA病毒揭开了丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus,HCV)的研究序幕;利用该段特异序列,表达了一个特异性克隆,并得到了一个可延长的融合蛋白(C100)。
美国强生OCD公司(Ortho-Clinical Diagnostics,a Johnson & Johnson company)利用该蛋白作为包被抗原、以酶联免疫吸附实验技术(Enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)为基础,研制出了最初的第一代商业性抗-HCV临床检测试剂;同时,OCD与其合作伙伴——美国凯荣公司(Chiron Corporation)共同在全世界范围内享有抗-HCV检测的专利权。
近十几年来,OCD公司不断努力,先后又研制出了抗-HCV的ELISA二代、三代检测试剂并推向市场;随着这些高质量检测试剂的研制成功及其在献血员筛查中的广泛应用,世界范围内输血后HCV感染的发生率已经大大下降,从而为安全输血提供了可靠的保证。
一. 抗-HCV IgG检测目前对HCV抗体主要以检测IgG为主,所采用的均为间接法;IgM类抗体的检测主要用于一些临床研究。
1. 酶联免疫吸附实验(ELISA)检测原理:ELISA检测抗-HCV IgG系利用固定在固相载体(如普通酶标板、聚苯乙烯试管及小球、磁性微粒子等)上的HCV重组表达和/或人工合成多肽抗原,捕捉待测样品中的抗-HCV IgG,然后,通过加入酶(辣根过氧化物酶HRP、碱性磷酸酶ALP等)标记的抗-人IgG检测所捕捉到的特异性抗-HCV IgG。
丙型肝炎病毒(HCV)检验技术进展研究作者:吴雪花来源:《健康必读·下旬刊》2012年第12期【中图分类号】R446.11【文献标识码】A【文章编号】1672-3783(2012)12-0499-02【摘要】:防控丙型肝炎传染源及阻断传播途径最为有效的手段就是早期准确诊断并及时发现HCV感染者。
从传染源和传播途径两方面控制丙型肝炎[1],笔者将对丙型肝炎病毒临床检验技术进展研究。
【关键词】HCV抗原检测核心抗原核酸检测技术(NAT)同时检测自1989年建立了丙肝病毒抗-HCV检测方法以来,随着医学检测技术和仪器的不断发展,丙型肝炎的检测技术一直处于不断发展中。
到目前为止,丙型肝炎检测技术主要有抗-HCV检测、HCV-RNA核酸扩增检测、HCV核心抗原的检测以及同时检测抗-HCV和HCV核心抗原4种类型。
笔者将对丙型肝炎临床检验技术进展研究如下。
1抗-HCV的检测最早出现的HCV检测技术是抗-HCV的检测。
由于HCV在病人外周血液中的含量及病毒抗原的含量很低,这就使得用常规方法难以直接检测,经过十几年的不断改进和发展,其检测方法又演变出多种,如:双抗原夹心ELISA、间接酶联免疫吸附实验(间接ELISA)、重组免疫印迹法(RIBA)、蛋白芯片检测法以及免疫层析法。
在这些方法之中,重组免疫印迹法(RIBA)是抗体检测的金标准,蛋白芯片检测法主要用于抗-HCV的分型。
而ELISA由于其操作简单,检测设备廉价,因此成为应用最广的抗体检测技术。
根据出现时间的先后以及使用抗原的不同,抗-HCV检测技术可分成三代。
第一代抗-HCVIgG试剂盒所用的抗原来自病毒基因组非结构区(C100),它的使用使HCV的输血感染率下降了80%以上。
但其缺陷是:灵敏度较低,抗体检出时间较晚,敏感性也较高,达到80%~90%,但假阳性较高。
第二代试剂除了包被C100抗原外又加入了HCV核心区多肽C22—3和非结构区抗原C33C。