丙型病毒性肝炎基因分型及临床意义
- 格式:pdf
- 大小:101.35 KB
- 文档页数:3
辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义
丙型肝炎病毒(HCV)是一种RNA病毒,是导致慢性肝炎、肝硬化和肝癌的主要原因之一。
HCV的基因组高度变异,由7个基因区域组成,基因区域在不同的亚型之间的变异率
不同。
HCV可分为6个亚型(1a、1b、2a、2b、3a和6a)和多个亚型和基因型的变异。
辽宁是我国北方的一个重要省份,对于此地区的HCV基因型研究具有重要的临床意义。
在辽宁地区,HCV亚型以1b和2a为主,其中1b型约占比例58%~76%,2a型约占比例24%~42%,其他亚型如1a、3a和6a型等的分布较少。
同时,基因型1b的分散程度也很大。
在
临床中,HCV基因型分型对于预测HCV相关疾病的预后,制定个体化治疗方案具有重要的
指导意义。
根据国内外研究,不同基因型的病毒对抗病毒治疗的反应不同,并且与病情发展和治
疗效果有关。
基因型1b的肝炎病毒感染者通常患有比基因型2a更严重的病情,病程更长,治疗反应更差。
而基因型2a的肝炎病毒感染患者则往往更容易治愈。
因此,辽宁地区的HCV亚型和基因型分布情况及其与临床表现和治疗反应的关联研究
对于指导辽宁地区HCV感染者的个体化治疗方案、评估预后、制定预防策略具有重要的临
床意义。
辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义
丙型肝炎病毒(HCV)是一种感染肝细胞并会导致肝炎的病毒。
丙型肝炎是造成慢性肝炎、肝硬化和肝癌的主要原因之一。
在世界范围内,丙型肝炎已经成为公共卫生问题。
HCV是一种RNA病毒,其基因组包含一个单链正股RNA。
HCV的基因组高度变异,导致多种基因分型,目前已经发现7个主要的丙型肝炎病毒基因型(即1-7型)以及多个次型。
各个丙型肝炎病毒基因型在不同地区的分布存在差异。
辽宁地区是中国的一个省份,位于东北地区。
在辽宁地区,丙型肝炎主要分型是1b型。
还有少数的1a型、2a型和3a型。
1b型是最常见的基因型,占据了绝大多数的患者。
1. 基因分型多样性:尽管1b型是主要的基因型,但仍存在其他的基因型,如1a型、2a型和3a型。
这种多样性反映了丙型肝炎病毒的高度变异性以及不同地区的感染流行模式。
3. 临床意义:丙型肝炎病毒基因分型对于丙型肝炎的预后和治疗反应有重要的临床
意义。
研究表明,在1b型与其他基因型相比较时,1b型的患者更容易发展为慢性感染,
并且对标准的抗病毒治疗反应较差。
在临床实践中,基因分型信息被用来指导丙型肝炎的
治疗和预后评估。
辽宁地区丙型肝炎病毒主要分型是1b型,该基因型占据了绝大多数的患者。
这种基因分型的特点对于预测丙型肝炎的预后和治疗反应具有临床意义,为丙型肝炎的治疗提供了
重要参考。
一、丙型肝炎基因型概述丙型肝炎病毒基因型主要分为6型,分别为1型、2型、3型、4型、5型和6型。
其中,1型、2型、3型较为常见,4型、5型和6型较少见。
不同基因型的丙型肝炎病毒在地理分布、病毒复制能力、耐药性等方面存在差异。
1. 1型:广泛分布于全球,是丙型肝炎的主要基因型。
1型病毒复制能力强,易产生耐药性,治疗难度较大。
2. 2型:主要分布在中东和北非地区,在我国较少见。
2型病毒复制能力较弱,治疗难度相对较低。
3. 3型:广泛分布于全球,在我国较为常见。
3型病毒复制能力中等,治疗难度适中。
4. 4型、5型和6型:分布范围较小,在我国较少见。
这三种基因型的病毒复制能力较弱,治疗难度相对较低。
二、丙型肝炎按基因分型治疗方案1. 1型丙型肝炎治疗方案(1)直接抗病毒药物(DAA)联合治疗方案:对于1型丙型肝炎患者,DAA联合治疗方案是目前主流的治疗方法。
常用的DAA药物有索非布韦、达拉他韦、奥比胆、索磷布韦等。
根据患者的具体情况,可选用以下方案:- 索非布韦+达拉他韦:适用于大多数1型丙型肝炎患者,疗程为12周。
- 索非布韦+奥比胆:适用于部分1型丙型肝炎患者,疗程为12周。
- 索非布韦+索磷布韦:适用于部分1型丙型肝炎患者,疗程为12周。
(2)干扰素联合DAA治疗方案:对于部分1型丙型肝炎患者,可采用干扰素联合DAA治疗方案。
干扰素可提高病毒清除率,降低复发风险。
常用方案为干扰素+索非布韦,疗程为12周。
2. 2型丙型肝炎治疗方案(1)DAA联合治疗方案:对于2型丙型肝炎患者,DAA联合治疗方案是首选。
常用方案为索非布韦+奥比胆,疗程为12周。
3. 3型丙型肝炎治疗方案(1)DAA联合治疗方案:对于3型丙型肝炎患者,DAA联合治疗方案是首选。
常用方案为索非布韦+达拉他韦,疗程为12周。
4. 4型、5型和6型丙型肝炎治疗方案(1)DAA联合治疗方案:对于4型、5型和6型丙型肝炎患者,DAA联合治疗方案是首选。
丙型肝炎的临床表现和分型丙型肝炎是一种由丙型肝炎病毒(HCV)引起的肝炎疾病。
该病毒主要通过血液传播,感染后可引起急性或慢性肝炎,并最终导致肝硬化和肝癌。
丙型肝炎的临床表现和分型是对该疾病进行诊断和治疗的重要依据。
一、临床表现丙型肝炎的临床表现多样,从无症状到严重的肝功能损害均可出现。
以下是一些常见的临床表现:1. 急性期表现:在感染后的2-12周内,患者可能会出现乏力、食欲不振、恶心、呕吐、上腹痛等非特异性症状。
部分患者可能会出现黄疸,尿液变深,粪便变浅等肝功能异常表现。
2. 慢性期表现:大约70-85%的丙型肝炎感染者会发展为慢性感染。
慢性期表现常常较为隐匿,患者可能长期无症状或只有轻微不适。
部分患者可能会出现疲劳、肝区不适、食欲减退、体重下降等非特异性症状。
3. 肝硬化和肝癌:长期慢性感染可能导致肝硬化和肝癌的发展。
肝硬化可表现为腹水、黄疸、肝功能进行性恶化等症状,而肝癌可能会出现上腹痛、体重下降、肝肿块等症状。
二、分型丙型肝炎可根据病毒基因组的序列差异分为不同的分型,常见的有6个主要分型(1a、1b、2a、2b、3a、3b)以及一些次要分型。
分型对于预测疾病进展、制定个体化治疗方案以及评估疗效具有重要意义。
不同分型的丙型肝炎在临床表现和疾病进程上可能存在差异。
例如,1b型丙型肝炎常与肝硬化和肝癌的发展风险增加相关,而3a型丙型肝炎则更容易出现脂肪肝和胆汁淤积等病变。
此外,分型还对药物治疗的选择和疗效评估具有指导意义。
不同分型对抗病毒治疗的敏感性存在差异,因此在制定个体化治疗方案时需要充分考虑分型信息。
总结:丙型肝炎的临床表现和分型对于该疾病的诊断和治疗具有重要意义。
临床医生应当充分了解丙型肝炎的不同表现和分型特点,以便更准确地判断疾病的进展和选择合适的治疗方案。
此外,进一步的研究也有助于深入了解丙型肝炎的病理生理机制,为疾病的防控提供更有效的手段。
临床检验中丙型肝炎病毒的常用检测项目及意义丙型肝炎病毒(HCV)为嗜肝性慢性病毒。
HCV感染后,患者的起病和临床症状极不典型,以亚临床感染为多见,容易造成漏诊。
丙肝自然转阴率低,治疗效果差,病程迁延,易早期出现肝硬化、肝癌,死亡率较高,因此HCV的检测对丙型肝炎病毒感染的早期诊断和指导临床治疗有重大的意义。
目前用于HCV感染诊断的常用主要指标有抗-HCV、HCV-cAg、HCV-RNA、丙肝基因型。
现多采用的第三代检测抗-HCVEIA试剂增加了HCV基因组Ns5区表达的蛋白作为抗原,进一步提高了试剂的敏感性,但还存在“窗口期”长、假阳性等问题。
HCV核心抗原出现早,检测敏感性好,特异性高,操作简便、快速,对处于HCV感染“窗口期”的个体检测有很大价值。
HCV-RNA检测灵敏度高、特异性强,具有早期诊断的意义,是EILSA技术的有力补充,常常作为HCV感染的主要确诊手段。
尤其在慢性丙型肝炎治療中,HCV-RNA定量检测作为最重要的实验室检测指标。
丙型肝炎的基因分型在临床上主要是决定干扰素和利巴韦林的疗程和用量。
标签: 丙型肝炎病毒;检测;临床检验;临床意义,HCV)是丙型肝炎的病原体,曾被称为肠丙型肝炎病毒(hepatitis C virus道外传播的非甲非乙型肝炎病毒。
1991年被分类为黄病毒科丙型肝炎病毒属。
据美国疾病预防与控制中心(CDC)调查发现,丙型肝炎的发病率约7.1/10万,目前全世界的丙型肝炎病毒(HCV)感染者超过1亿人,其中我国约有4 000万,我国HCV的感染率在0.9%~5.1%。
丙型肝炎自然转阴率低,治疗效果差,病程迁延,且与肝硬化、肝癌等的发生及发展显著相关。
掌握和了解目前临床常用的检测项目的方法和意义,对丙型肝炎的诊断和治疗具有指导性的重大作用。
1 丙肝抗体(抗-HCV)检测丙肝抗体(抗-HCV)检测,是目前临床上最常用的检测技术。
此种检测采用间接酶联免疫法,将已知抗原吸附于固相载体,加入待检标本(含相应抗体)与之结合,洗涤后,加入酶标抗抗体和底物进行测定,是间接检测病毒感染的一种方法。
辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义【摘要】丙型肝炎病毒是一种常见的肝炎病原体,其基因分型对病毒变异和临床表现具有重要影响。
本文通过对辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义的研究,总结了该地区基因分型的特征和临床表现,探讨了不同基因分型在病毒感染及治疗过程中的影响。
通过研究方法和结果的分析,揭示了丙型肝炎病毒基因分型在临床实践中的应用前景及挑战。
本文强调了辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型的重要性,并提出了未来研究的方向。
这些结果对于丙型肝炎病毒的防控及治疗具有重要的指导意义,为临床实践提供了新的思路和策略。
【关键词】关键词:辽宁地区、丙型肝炎病毒、基因分型、特点、临床意义、研究方法、结果、临床应用、重要性、未来研究、结论总结1. 引言1.1 辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义丙型肝炎病毒(HCV)是一种通过血液传播的病毒,全球范围内广泛感染,成为世界卫生组织认定的全球性公共卫生问题。
HCV的基因分型多样,目前已知有7种不同的主要基因型(Genotype 1-7),每种基因型又可细分为若干亚型。
这种基因的多样性不仅影响了患者的临床表现和疗效,还对临床医生的治疗策略提出了挑战。
辽宁地区作为中国东北地区的一个重要省份,丙型肝炎病毒感染的情况较为严重。
辽宁地区的HCV基因型分布具有一定的特点,其中以Genotype 1b和Genotype 2a为主要类型,占据了绝大多数的感染病例。
辽宁地区的HCV基因型亚型也呈现出一定的地域特异性,不同亚型的临床表现和传播途径也存在一定的差异。
对于丙型肝炎病毒基因分型的研究不仅可以帮助医生更好地了解病毒的传播规律和演变趋势,还可以为临床诊断提供更为准确的依据。
通过对病毒基因型的分析,可以指导临床医生选择更合适的治疗方案,提高治疗效果和预后情况。
对辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义的研究具有重要的意义。
2. 正文2.1 丙型肝炎病毒基因分型概述丙型肝炎病毒(HCV)是一种导致慢性肝炎、肝硬化和肝细胞癌的RNA病毒。
赤峰地区丙肝基因分型及其临床意义分析尚明全;李连友;李连兴【摘要】目的探讨赤峰地区丙肝基因分型及其临床意义.方法选取2012年1月-2016年12月赤峰地区796例HCV患者作为研究对象,分析基因型与HCVRNA 含量、AST含量、ALT含量的相关性.结果 HBV、HCV重叠感染者中混合基因型高于单纯HCV感染,x2=32.24,P<0.01.1型(1a+1b)基因型HCV感染患者血清HCVRNA病毒载量、AST、ALT水平均高于2型(2a)、3型(3a+3b)、6型(6a)基因型HCV感染者,均P<0.05.结论赤峰地区HCV基因型呈现多样化散在分布,其中以1b型基因型为主,HCV基因型与病毒载量、肝脏损伤程度密切相关.【期刊名称】《中国卫生标准管理》【年(卷),期】2017(008)005【总页数】3页(P2-4)【关键词】基因分型;丙型肝炎病毒;赤峰地区【作者】尚明全;李连友;李连兴【作者单位】赤峰市医院检验科,内蒙古赤峰024000;赤峰市医院检验科,内蒙古赤峰024000;赤峰市医院科教科,内蒙古赤峰024000【正文语种】中文【中图分类】R512.33丙型肝炎病毒(HCV)是丙型病毒性肝炎的致病原,据流行病学统计,当前全球有1.3~2.1亿慢性HCV感染患者,流行率约为3.00%[1]。
研究显示,不同的HCV基因型及基因亚型对患者肝细胞的损伤程度不一致,基因型直接影响着治疗的效果,且HCV基因型分布存在明显的地域性差异[2]。
本研究为全面了解赤峰地区HCV基因型的分布情况及其临床特点,检测了2012年1月—2016年12月赤峰地区HCV感染者的基因分型,以期为丙肝的防治方案提供科学参考依据。
1.1 一般资料选取2012年1月—2016年12月赤峰地区796例HCV患者作为研究对象,采集患者的外周静脉血。
其中774例为单纯HCV感染,22例为HBV、HCV重叠感染。
所有患者均为赤峰地区户籍,均为汉族。
HCV基因型在流行病和临床上的意义
钟华平;赵伟;沈玲
【期刊名称】《世界感染杂志》
【年(卷),期】2007(7)2
【摘要】近年来丙型肝炎病毒(Hepatitis C Virus, HCV)基因型愈来愈受到大家的关注,Simmonds分型法现在应用最为广泛,其分布不仅具有明显的"三间"流行病学特征,而且研究还发现HCV基因型存在多种生物学活性,与传播途径、临床类型、肝病严重程度、临床多样性、抗病毒疗效和疫苗的研发等密切相关.故本文就从HCV基因分型及在流行病和临床上的意义作一概述.
【总页数】5页(P97-101)
【作者】钟华平;赵伟;沈玲
【作者单位】东南大学医学院附属南京市第二医院,江苏,南京,210003;东南大学医学院附属南京市第二医院,江苏,南京,210003;东南大学医学院附属南京市第二医院,江苏,南京,210003
【正文语种】中文
【中图分类】R373.2
【相关文献】
1.HCV基因型研究进展及临床意义 [J], 赵努恩吉雅;乌云;刘艾芹
2.不同基因型HCV临床意义及干扰素治疗效果探讨 [J], 毕蔓茹;康岚;张坤;杨宝山
3.HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型分析 [J], 邓浩辉; 李晓强;
高洪波; 陈伟烈
4.PBMCs和血浆中HCV基因型的临床意义 [J], 孙亚臣;岳希全;云庆军
5.HCV基因型和HCVRNA检测在丙型肝炎病毒母婴传播中的意义 [J], 孟祥伟;孙中华;冯丽华;孙逊
因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
丙型肝炎的全基因组测序与分型鉴定丙型肝炎是一种由丙型肝炎病毒(HCV)引起的肝炎,全球范围内广泛存在。
丙型肝炎的全基因组测序与分型鉴定是研究该病毒的重要手段,对于疾病的诊断、预防和治疗具有重要意义。
一、丙型肝炎病毒的全基因组测序丙型肝炎病毒的全基因组测序是通过对病毒基因组的高通量测序技术进行全面扫描,获取病毒基因组的完整序列信息。
这项技术的出现为研究丙型肝炎提供了重要的工具,可以深入了解病毒的遗传变异、流行病学特征以及与宿主之间的相互作用。
全基因组测序技术的发展使得研究者能够获得丙型肝炎病毒的完整基因组序列,包括核心区、非结构区以及外膜蛋白等。
这些序列信息对于深入了解病毒的生物学特性、传播途径以及抗病毒治疗的研究具有重要意义。
二、丙型肝炎病毒的分型鉴定丙型肝炎病毒的分型鉴定是通过对其基因组序列进行比对和分析,将其分为不同的亚型和基因型。
目前已经发现了丙型肝炎病毒的7个主要基因型(1-7型)和多个亚型。
不同的基因型和亚型在地理分布、传播途径以及病毒特性等方面存在差异。
分型鉴定对于丙型肝炎的流行病学研究和疫苗研发具有重要意义。
不同基因型和亚型的病毒在不同地区的流行程度存在差异,了解这些差异可以帮助制定针对性的预防和控制策略。
此外,分型鉴定还可以为疫苗的研发提供重要依据,因为不同基因型和亚型的病毒可能对疫苗的有效性产生影响。
三、全基因组测序与分型鉴定在丙型肝炎研究中的应用全基因组测序和分型鉴定在丙型肝炎的研究中发挥着重要作用。
通过全基因组测序,研究者可以获取大量的病毒序列信息,进而分析病毒的遗传变异和演化规律。
这有助于研究病毒的传播途径、感染机制以及抗病毒药物的研发。
同时,通过分型鉴定可以了解不同地区、不同人群中丙型肝炎病毒的基因型和亚型分布情况,为疫苗的研发和流行病学研究提供重要依据。
此外,全基因组测序和分型鉴定还可以帮助临床医生制定个体化的治疗方案,根据病毒的基因型选择最合适的抗病毒药物。
总结:丙型肝炎的全基因组测序与分型鉴定是研究该病毒的重要手段,可以深入了解病毒的遗传变异和流行病学特征。
辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义丙型肝炎病毒(HCV)是一种引起丙型肝炎的病原体,它主要通过血液传播,诱发慢性肝炎、肝硬化、肝细胞癌等严重肝脏疾病。
HCV具有高变异性和复制速度快的特点,致使它在世界范围内形成了多种不同的基因型。
辽宁地区作为我国东北地区的一个重要省份,对于HCV的基因分型以及其临床意义的研究显得尤为重要。
本文将就辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义进行详细介绍。
1. 基因分型分类HCV的基因组是一个单链的RNA,包括核心蛋白(C)、E1、E2、p7、NS2、NS3、NS4A、NS4B、NS5A和NS5B等部分。
目前已知的HCV基因分型主要分为1-6型,每个基因型又可以细分为不同的亚型。
在辽宁地区,以基因分型1b和2a最为常见,占到了约80%的比例。
还有基因分型3a、3b、6a等少量亚型出现。
2. 基因变异性HCV的高变异性是其病原体特点之一,不同基因型之间的核苷酸序列同源性仅为60%-80%。
而同一基因型内部亚型之间的同源性也仅在85%-95%之间,这使得HCV对于人类免疫系统产生干扰,同时也给抗病毒治疗带来了难度。
3. 流行病学特点研究显示,HCV的基因型在不同地区的分布存在较大的差异性。
辽宁地区的HCV基因型主要受到了中国东北地区的影响,而其临近的韩国和日本等地区的基因型也对其产生了一定的影响。
在一些人群中,还存在多种混合感染的情况,这增加了病毒基因分析的难度。
二、丙型肝炎病毒基因分型的临床意义1. 对治疗方案的影响HCV的基因分型对于抗病毒治疗的疗效和方案选择有着重要的意义。
目前,针对不同基因型的HCV病毒,治疗方案会有所不同。
对于基因型1的患者,常规的治疗方案可能需要联合使用干扰素和利巴韦林等药物,但对于基因型2和3的患者,可能只需要较短时间的使用直接抗病毒药物即可。
了解患者的HCV基因型对于选择治疗方案至关重要。
2. 对疾病转归的影响研究表明,不同的HCV基因型对于患者的疾病转归和预后也存在一定的影响。
辽宁地区丙型肝炎病毒基因分型特点及其临床意义
丙型肝炎病毒(HCV)是一种RNA病毒,是引起慢性肝炎、肝硬化、肝癌等重要疾病的主要病原体之一。
HCV基因组分型根据全基因组序列的不同,目前已分为7个主要类型(HCV-1至HCV-7)和数十个亚型。
各地区HCV分型的特点不同,对HCV分型的研究有助于了解各地区的病毒流行情况,指导临床治疗和预防控制工作。
我国大部分地区HCV主要分型为1b型和2a型,而辽宁地区的HCV主要分型则以1b型为主。
研究发现,1b型HCV感染的慢性肝炎和肝癌发生率较高,且易于发生药物耐药性。
因此,对于辽宁地区的HCV相关疾病的治疗,应注意1b型HCV病毒的特点,采用个体化治疗方案,以提高治疗效果。
此外,辽宁地区HCV病毒的一些新型亚型也有发现,如3b型、6a型等。
这些新型亚型的流行情况和病毒特性尚需进一步研究,以更好地指导当地的预防和治疗工作。
总之,辽宁地区HCV分型研究对于当地的临床诊治和预防控制工作具有重要的指导作用。
需要不断加强和深入研究,以更好地保障人民群众身体健康。
第48卷 第5期2012年10月青岛大学医学院学报ACTA ACADEMIAE MEDICINAE QINGDAO UNIVERSITATISVol.48,No.5October 2012[收稿日期]2012-04-12; [修订日期]2012-08-09[基金项目]青岛市卫生科技发展计划资助项目(2010WSZD08)[作者简介]黄艳秋(1979-),女,硕士研究生,主治医师。
[通讯作者]史昌河(1963-),男,副主任医师,硕士生导师。
丙型病毒性肝炎基因分型及临床意义黄艳秋,史昌河(青岛大学医学院传染病学教研室,山东青岛 266071)[摘要] 丙型病毒性肝炎病原体为丙型肝炎病毒(HCV),以输血为主要传播途径。
HCV基因组为单股正链RNA病毒,有较高的复制率及变异率,在人体内呈准种分布。
目前根据Simmonds命名系统可将其分为6个基因型。
HCV基因分型在丙型病毒性肝炎的流行病学研究、病毒载量、病情转归及抗病毒治疗等方面均有重要意义。
特别在抗病毒治疗方面,HCV基因分型是制定抗病毒治疗方案,预测抗病毒疗效的重要依据。
[关键词] 肝炎,丙型;基因分型;综述[中图分类号] R512.6 [文献标志码] A [文章编号] 1672-4488(2012)05-0468-03 丙型病毒性肝炎是临床工作中较为常见的一种病毒性肝炎,病原为丙型肝炎病毒(HCV),感染后可引起肝脏急、慢性炎症,极少数发展为重症肝炎。
输血及血制品曾是丙型病毒性肝炎最重要的传播途径,但近年来,随着筛查方法的改进,此种传播方式已得到明显控制,目前注射、器官移植、血液透析、性传播及母婴传播亦较常见。
人类对HCV普遍易感,而且感染后高达80%的病人转为慢性感染,如果不进行及时和正确的抗病毒治疗,有相当比例的病人会发展为肝硬化、肝癌和肝衰竭,产生严重的临床后果。
丙型病毒性肝炎在全球感染率为3%,因此全世界约有1.7亿人曾感染过HCV[1],但各国的感染率不尽相同,我国HCV感染率约为3.2%,属于高流行区。
1 HCV基因组的结构和功能1.1 HCV基因组的基本结构HCV基因组为单股正链RNA,可分为3′非编码区、5′非编码区及编码区(ORF)3个区域,ORF可编码一个病毒蛋白前体,在宿主和蛋白酶裂解的共同作用下该蛋白前体可生成至少10种蛋白。
根据所编码蛋白的功能不同,编码区又分为结构基因和非结构基因,其中结构基因编码的4种蛋白包括核心蛋白、包膜蛋白1(E1)、E2、P7,这些蛋白参与病毒的组装,又被称为结构蛋白。
非结构基因翻译编码的蛋白有非结构蛋白2(NS2)、NS3、NS4A、NS4B、NS5A、NS5B,这些蛋白主要参与病毒复制,故又称非结构蛋白或功能蛋白。
HCV基因组的变异率高,这一特点使之在人体内呈现准种分布,基因组中E1和E2区是变异率最高的区域,而5′及3′非编码区则是最保守的区域。
1.2 HCV各区段基因组的结构和功能①5′UTR:它是HCV基因组中最保守的区域。
HCV 5′UTR包括4个保守的结构区域,其中结构域Ⅱ~Ⅳ构成内部核糖体进入位点(IRES),IRES能够在不依赖于HCV蛋白作用的前提下启动下游HCV编码区基因的翻译,因而抗病毒药物的靶向定位点常为丙型病毒性肝炎病毒的IRES。
②3′UTR:3′UTR位于HCV 3′末端,由200~235个核苷酸组成。
其中可变区具有基因型的特异性,在此区域内不同基因型之间存在核苷酸序列的差异。
不同的基因型其HCV多聚U区的长度亦不相同。
部分研究结果显示,不同的HCV型甚至同型不同株型之间3′UTR的交换都会导致HCV不能复制。
因而得出结论,只有当病毒具有完整的3′UTR才能发挥其正常的作用。
另有研究结果显示,宿主细胞内部所固有的多聚嘧啶束结合蛋白或自身抗原若与HCV基因组中的3′UTR结构部分(尤其是X尾)结合,丙型病毒性肝炎病毒核糖核酸的翻译效率和稳定性均可增强。
③核心蛋白:丙型病毒性肝炎病毒基因组的342~914核苷酸位点系核心蛋白基因的位点。
编码核心蛋白,核心蛋白的功能之一是与糖蛋白作用组装出完整的HCV病毒颗粒。
在核心蛋白的氨基端内,高度保守的抗原表位含量非常丰富。
核心蛋白在与病毒RNA靶向结合的前提下可调节HCV基因组的翻译,并且核心蛋白的基因调节作用与原发性肝癌的发生关系密切,主要因为核心蛋白可抑制P53启动因子这一重要肿瘤抑制基因的活性。
核心蛋白在人体感染HCV后通过对大量基因的调控作用抑制了机体的免疫应答,从而促进了HCV对肝细胞及外周血单核细胞等人体细胞的持续感染,此外核心蛋白能加速感染细胞内脂质小体的形成,诱导肝细胞变性。
④包膜区:在HCV结构中,病毒的外膜常由包膜蛋白构成。
第915~1490nt位点和1491~2789位点共同构成了包膜区基因,分别编码E1和E2蛋白。
其中,E2氨基端具有高度变异性,HVR1和HVR2均为E2氨基端的两个高变区。
丙型病毒性肝炎病人的E2突变增加常由干扰素治疗诱发,HVR1序列也会在慢性感染的形成过程中不断改变。
E2结构中还含有若干个中和抗体表位,至少有一个中和抗体表位位于HVR1。
由此可知,免疫反应常以E2为主导靶向目标。
此外,病毒受体、CD81、低密度脂蛋白等物质的受体均可与E2蛋白发生相互作用,故E2蛋白具备的另一个重要作用就是介导病毒附着和进入感染细胞内部。
因此,在研究和开发HCV疫苗这一方向上,深入地研究膜5期黄艳秋,等.丙型病毒性肝炎基因分型及临床意义469蛋白的抗原变异及宿主应答规律是一个重要的切入点。
⑤非结构区:NS2、NS3、NS4和NS5这4个共计可编码6种NS蛋白的区段构成了非结构基因。
NS2基因编码217个氨基酸,在非结构区中比较,各分离株间NS2区同源性最低,其具体的生物学效应不明。
631个氨基酸由NS3基因编码,同时具有多种酶的活性,如NS2-3蛋白酶活性、丝氨酸蛋白酶活性等,其中,RIG-1a和TLR3信号系统可被NS3的丝氨酸蛋白酶有效抑制,使宿主细胞的防御反应受到严重影响,故丙型肝炎病人应用丝氨酸蛋白酶抑制剂可有效抑制病毒的复制。
由此可知,这一靶位的发现为抗病毒药物研发提供了强大的助力。
HCV基因组的5313~5474nt位点是NS4A蛋白的基因位点,NS4A蛋白与NS3可形成稳态的复合蛋白,这样可调节丝氨酸蛋白酶的活性。
NS5基因编码蛋白为NS5a及NS5b,在HCV多种蛋白的成熟和RNA复制中NS5a发挥了重要作用,同时对宿主细胞的多种基因表达加以调控,并影响干扰素的疗效,这就是为什么干扰素治疗丙型病毒性肝炎成功率低的原因之一。
2 HCV的基因分型及命名我国于2004年颁布的《丙型肝炎防治指南》中明确指出[2],在制定抗病毒治疗个体化方案以及判定治疗难易程度时,HCV-RNA的基因分型有着重要的意义。
由于HCV的高复制率以及复制时的高突变率,因而不同HCV毒株间基因组有较高的变异。
这也是HCV基因组分型的基础[3]。
HCV基因组呈现高度异质性,当不同的HCV基因组间的核苷酸变异率大于28%时,可将其分为不同的型,当不同的HCV基因组间的核苷酸序列变异率在10%~28%之间时,则将其归为不同的亚型,而准种则是由同一亚型内的病毒基因组的微小差异造成的[4]。
目前Simmonds命名系统较为普遍接受。
对来自全球的所有HCV毒株基因序列进行比较分析,可将它们分为6个基因型及至少80多个基因亚型[5]。
我国存在1a、1b、2a、2b、3a等基因型,以1b和2a为主,占70%~80%。
3 HCV基因型的地理分布特征HCV基因型分布有显著的地域性差异[6]。
基因型1a是首先被鉴定出核苷酸序列的HCV基因组。
常经由输血传播的基因型1b是现阶段最常见的基因型别,在亚洲大部(如中国、日本等)和欧美国家,70%以上的HCV感染病例均为1b型,而2a和2b这两种基因型在上述地区所占比例仅在10%~30%左右。
基因型3在印尼、印度及东南亚等地区占有较高比例。
在南非丙型肝炎人群中基因型5所占比例接近40%。
部分东南亚地区国家、中国大陆西南边境和港澳台地区以基因型6为主体。
在我国南方地区基因型1b的感染率占总感染人群的90%以上,自南向北感染2a型人群呈递增趋势。
不过,近年来我国的HCV基因型感染分布态势有了新的变化。
谢尧等[7]调查了我国南北地区9个城市219例慢性丙型病毒性肝炎病人,对这些病人所感染的HCV进行分型后表明,HCV基因型在我国南北地区的分布和流行无显著性差异。
张帆等[8]对重庆地区77例丙型病毒性肝炎病人的采血样品进行Core/E1区的测序和进化树分析,结果显示,基因型1b在重庆地区广为流行(38%),并按照比例递减排列依次检测出基因型6a(19%)、3a(16%)、3b(14%)和2a(13%),未发现1b与2a型。
张立新等[9]对山东地区96例慢性丙型肝炎病人的血清HCV基因分型检测结果显示,山东地区HCV感染以非2(1b)型占优势,2(2a)型感染较少,分析还显示不同的感染途径之间基因型分布没有差异。
LU等[10]对中国昆明、广州等9个地区共148例丙型病毒性肝炎病人血液样本进行多基因区段测序并予以进化树分析,结果表明,在珠三角地区范围内1b仍是主要流行基因型,6a型检出率上升,成为该地区第二位流行基因型,而2a型则下降至第三位。
此外,昆明和广州的相关部门还相继发现了基因型6的亚型(6v)感染人群。
而西南地区基因型分布特点则表现为以1b型为主,2a、3a、3b、6a等多种基因型共存。
雷华等[11]进行了昆明地区病毒基因分型研究,其研究共选取了176份HCV-RNA阳性血清标本,结果显示,3b(43.18%)、3a(22.73%)、1b(18.75%)为昆明地区HCV感染的主要基因型,且基因型3b感染居主体地位。
叶莺[12]对福建省丙型肝炎流行特征研究显示,福建省HCV流行型主要为6a及1b型,其次为2a及3b型,但不同人群间流行型别有差异,吸毒人群中3b亚型占有较大比例,无偿献血人群前两位也是6a及1b型,但第三位由2a型取代3b型。
临床病例中流行主要型别为1b型。
这种地域分布特征并不是一成不变的,受到感染率的增加、传播途径的改变、移民等相关因素的影响,一些国家和地区的病毒基因型和亚型的分布亦会随之而发生改变。
4 HCV基因型与HCV-RNA载量HCV基因型与HCV-RNA载量间的关系目前还存在争议。
研究显示,非1型病人的血清HCV-RNA含量低于1型[13]。
BLATT等[14]研究了美国6 807例丙型病毒性肝炎病人的基因型及血清HCV-RNA含量,结果显示,2型和3型感染者其血清HCV-RNA含量低于基因型1型感染者。
该研究还发现,基因型3b、3a感染者体内病毒含量低于1b型。