中国微生物物种多样性研究进展_郭良栋.

生态环境 2005, 14(1): 127-133 Ecology and Environment E-mail: editor@基金项目：国家863高技术研究发展专项资助项目（2002AA601150）作者简介：车玉伶（1972－），女，工程师，硕士研究生，主要研究方向为微生物种群结构解析与功能调控。

E-mail: cheyl02@ 收稿日期：2004-09-20微生物群落结构和多样性解析技术研究进展车玉伶1，王 慧1，胡洪营1，梁 威2，郭玉凤11. 清华大学环境科学与工程系，北京 100084；2. 中国科学院水生物所，湖北 武汉 430072摘要：微生物群落结构和多样性是微生物生态学和环境科学研究的热点内容，对于开发微生物资源，阐明微生物群落与其生境的关系，揭示群落结构与功能的联系，从而指导微生物群落功能的定向调控具有重要意义。

基本按照年代顺序概述了常用的微生物群落结构及多样性解析技术，同时也体现了解析技术由片面向全面、由低分辨水平向高分辨水平的发展过程。

20世纪70年代以前，对环境微生物群落结构及多样性的认识依赖传统的培养分离方法，方法的分辨水平低，认识是不全面的和有选择性的；20世纪70年代和80年代，在微生物化学成分分析的基础上建立了生物标记物方法（醌指纹法、磷脂脂肪酸法等），对微生物群落结构和多样性的认识进入到较客观的层次上；在80和90年代，以DNA 为目标物的现代分子生物学技术（rRNA 基因测序技术、基因指纹图谱等）比较精确地揭示了微生物种类和遗传的多样性，并给出了关于群落结构的直观信息。

指出了每种解析技术的功能特点和局限性，并展望了解析技术的发展趋势是原位、快速、灵敏、高通量和准确定量。

关键词：微生物群落结构；微生物多样性；解析技术；研究进展中图分类号：Q938.1 文献标识码：A 文章编号：1672-2175（2005）01-0127-07微生物群落的种群多样性一直是微生物生态学和环境学科研究的重点。

中国湖泊微生物多样性及方法研究摘要：本文对我国湖水微生物种群多样性分布及研究方法进行综述，有利于阐明淡水湖泊微生物群体对营养环境的反应变化规律，也有利于全面剖析湖泊湿地生态系统的结构与功能，有利于开发利用微生物资源，还可望为预测湖泊生态系统水环境变化提供依据。

关键词：多样性；细菌多样性；16SrRNA1.中国湖泊资源介绍湖泊是由湖盆、湖水及水中所含的矿物质、有机质和生物等所组成的复杂的生态经济系统，是自然万物和人类文明的繁盛之地。

通常按湖水含盐量的高低，将其分为淡水湖、咸水湖和盐湖三类。

中国古代就有关于各大湖的位置、面积、变证、水位、沙情、围垦和渔业等情况的记载。

对全国面积大于10平方公里的湖泊分类统计，其中淡水湖245个，面积3.1万平方公里，储水量约2231亿立方米，其面积和储水量分别占总面积和总储水量的40%和30%。

咸水湖215个，面积2.8万平方公里，储水量4610亿立方米，面积和储水量分别占总面积和总储水量的36%和62%。

盐湖133个，面积和储水量分别占13%和8%。

干盐湖44个，面积占11%[3]。

2.我国湖泊微生物多样性的研究现状湖泊是重要的淡水系统，是自然界中重要的生态系之一。

由于湖泊生境类型的各不相同，使得湖泊微生物的多样性非常丰富。

2.1古细菌域随着分子生物学技术的发展，人们发现古细菌不只生存于极端的高盐、高温、厌氧等环境中[4]，在非极端环境中同样存在。

古细菌在不同湖泊中的种类和数量分布极其不平衡。

湖泊中大多数的古细菌都属于Eurvarchaeota和Crenarchaeota。

2.2细菌域目前已报到的从湖泊中分离得到的主要细菌类群大多数都属于变形细菌门，拟杆菌门，蓝细菌门，放线菌门，疣微菌门，绿菌门，浮霉菌门，厚壁菌门等。

2.3真核生物域微型真核生物是单细胞真核生物的统称，也地球上数量最多的真核生物，其粒径的大小在0.22 μm和2-3 μm之间。

主要广泛存在于全球海洋生态系统中，其丰度高达102-104CFU/mL，主要包括：甲藻、绿藻等主要种类，并有大量未分类未知菌群的存在，可见其多样性非常丰富。

微生物的分布与多样性研究微生物是指那些无法肉眼看到的微小生物，包括了细菌、真菌、病毒和原生生物等。

微生物虽然体积很小，但是却在我们的身体和周围环境中广泛分布。

研究微生物的分布与多样性，可以帮助我们更好地了解微生物世界，同时也可为医学、农业、环保等领域提供重要的科学支持和应用价值。

一、微生物分布微生物广泛分布于自然界中的各种环境，包括土壤、水体、大气、植物、动物体内以及人类内部等。

以土壤为例，据统计，每立方厘米土壤中典型的杆菌数量可达上万个，灰霉菌和酵母菌数量也非常多。

而在海洋中，微生物数量要更为庞大，仅真菌就占海洋微生物的40%以上。

二、微生物多样性微生物在形态、生理特点、代谢方式和生态环境等方面具有极为丰富的多样性。

比如，细菌的形态包括球形、棒形、螺旋形等多种类型，不同的菌株之间也具有很大的生理和代谢差异；真菌则分为单细胞和多细胞两种，外形也千姿百态，其中的霉菌是微生物界最复杂的生物之一。

此外，不同种类的微生物在生态环境等方面也有着显著的差异，比如某些细菌可以在高盐环境中生存，而其他细菌则可以在制酸和高温等严酷环境中生存。

三、微生物的研究方法要研究微生物的分布和多样性，需要使用现代生物技术手段。

常见的微生物研究方法包括菌落计数法、微生物培养法、分子生物学技术和生态学方法等。

1. 菌落计数法：通过对样品进行稀释，然后在富含营养物质的培养基上培养微生物，最后计算出菌落数目来评价样品的微生物数量。

2. 微生物培养法：将样品接种到特定的培养基上，并在不同的环境下进行培养，从而分离出感兴趣的微生物，并了解它们的特点和生态习性。

3. 分子生物学技术：通过对微生物的DNA或RNA进行提取和测序，可以获得微生物的基因组信息，了解微生物的遗传特征和进化关系。

4. 生态学方法：通过采集不同样品中的微生物，并对它们进行DNA测序和分析，可以了解微生物的种类、数量以及它们在不同环境下的分布情况。

四、微生物研究的应用价值随着微生物研究技术的不断发展和深入，微生物在人类生产和生活中的应用日益广泛。

第27卷第12期2015年12月生命科学Chinese Bulletin of Life SciencesV ol. 27, No. 12Dec., 2015文章编号：1004-0374(2015)12-1570-60国家自然科学基金委员会生命科学部2015年度青年基金项目DOI: 10.13376/j.cbls/2015210项目名称申请人依托单位1微生物学暗黑鳃金龟幼虫肠道秸秆降解复合菌系的协同降解机制圣　平江西省科学院滇重楼根茎内生细菌生物多样性研究杨玲玲云南大学根瘤菌适应性进化过程中共生固氮能力丧失的分子机制研究冀照君内蒙古民族大学基于单核苷酸多态性位点的军团菌系统分类和嗜肺军团菌分型研究詹晓勇广州医科大学基于基因组的苏云金芽胞杆菌资源的多样性研究郑金水华中农业大学糖基水解酶第五家族趋异进化同长白山温泉圈微生物适应性进化关系的生物学机制研究王红蕾长春工业大学腾冲热泉嗜热细菌新资源的挖掘及木聚糖酶活性菌株筛选与酶学特性研究明　红新乡医学院药用牡丹内生细菌抗菌抗肿瘤活性次生代谢产物的研究杨瑞先洛阳理工学院恒河猴肠道细菌多样性及抗耐药肺炎病原菌放线菌资源初探朱文勇中国医学科学院医学生物学研究所来源于放线多孢菌的CRISPR/Cas系统的分析及功能鉴定罗晓霞塔里木大学拟黑多刺蚁共生放线菌的种群组成及其代谢新活性化合物研究刘重喜东北农业大学钩丝孢属真菌资源和系统学研究郝玉娥南华大学广义散斑壳属真菌分类与系统发育学研究王士娟安徽农业大学广义透孢黑团壳属Massarina分类与分子系统学研究张　凰昆明理工大学荒漠地衣石果衣真菌(Endocarpon pusillum)抗旱基因的功能分析及利用研究王延延中国科学院微生物研究所孑遗蕨类桫椤属植物内生真菌多样性与生态分布机制臧　威绍兴文理学院金牛肝菌属的起源与区域物种分化研究吴　刚中国科学院昆明植物研究所山东省高盐环境中耐(嗜)盐真菌物种多样性研究潘好芹潍坊科技学院手状孢丝孢菌(cheirosporous hyphomycetes)的资源、分类与分子系统学研究胡殿明江西农业大学印度块菌复合群的系统发育和生物地理学研究乔　鹏山东省农业科学院中国东北地区茎点霉系统分类研究白庆荣吉林农业大学中国红菇属的DNA条形码研究李国杰中国科学院微生物研究所竹种子内生真菌多样性及其抑菌活性的研究申小叶首都师范大学cyAbrB蛋白在高产氢蓝藻—蓝杆藻氢代谢中的调控作用张晓辉西南大学产丁醇梭菌属微生物木糖与葡萄糖同步利用调控机制研究张　杰山东省科学院超嗜热古菌嗜热球菌新型DNA复制蛋白TK1046的性质鉴定与功能分析李　卓国家海洋局第三海洋研究所创新霉素生物合成途径的阐释和异源表达卞小莹山东大学反式-4-羟基-L-脯氨酸合成途径在大肠杆菌中的构建和代谢调控机制研究周海岩浙江工业大学谷氨酸棒杆菌MFS木糖转运蛋白研究李燕军天津科技大学谷氨酸棒杆菌Na+/H+逆向转运蛋白及其在压力应答中的机理研究徐　宁中国科学院天津工业生物技术研究所第12期1571国家自然科学基金委员会生命科学部2015年度资助项目海洋链霉菌LZ35中对三联苯糖苷的生物合成朱　敬山东大学基于Rho GTP水解酶功能的细胞形态重塑提高酿酒酵母乙醇李　倩大连大学耐受性机理研究基于TALE-TF技术调控纤维堆囊菌埃博霉素高效生物合成叶　伟广东省微生物研究所及其机制研究基于动静态联合调控与优化的甘草酸酵母全合成刘　敏华东理工大学基于土壤微生物宏基因组发掘新颖活性卤化天然产物曹明明南京农业大学酵母菌铁载体新合成途径菌株的构建及其铁载体合成与调控的研究池　哲中国海洋大学耐盐放线菌Streptomyces thermolilacinus SPC6来源的新型羊毛张　琪复旦大学硫肽化合物土曲霉LYT10中衣康酸降解途径的鉴定及其生理意义研究陈　梅中国科学院青岛生物能源与过程研究所微生物降解吡唑醚菌酯的代谢途径及机理研究刘晓璐北京科技大学希瓦氏菌内源性质粒pMR-1中两对毒素-抗毒素系统的功能研究郭云学中国科学院南海海洋研究所新型海洋低温几丁质酶持续作用机制的研究王晓辉大连大学亚麻酸及其氧合物调控黄曲霉毒素合成的机理研究晏石娟广东省农业科学院农业生物基因研究中心一氧化氮在铜绿假单胞菌对异噻唑啉酮类杀菌剂抗性机制中周　刚广东省微生物研究所的分子作用有效供液促进里氏木霉固态发酵高产纤维素酶的机理研究贺　芹南京农业大学转录激活蛋白YLGat1介导氮饥饿与油脂合成偶联的分子机制研究王致鹏中国水产科学研究院黄海水产研究所2型登革热病毒蛋白酶NS2B-NS3p活性构象的晶体结构研究李　华广州医科大学QuikChangeTM定点突变中具有同源末端线性DNA分子形成夏永振山东大学机制的研究YdiV促ClpXP蛋白酶降解FlhDC复合物的分子机制研究李冰清山东省医学科学院基于PPTase对聚酮和聚肽合成酶修饰活化挖掘放线菌天然产物张本印武汉大学细菌角蛋白酶KerF降解角蛋白过程与分子机制边　斐山东省农业科学院分子伴侣CsgE/CsgF调控Curli分泌和组装的结构和功能研究温玉荣西安交通大学马克斯克鲁维酵母细胞壁改构对其表面展示系统的调节作用李　阳河南科技大学YCR007c基因抑制木糖异构酶途径酵母木糖发酵的分子机制研究王　智中国农业科学院作物科学研究所病原细菌中转移酶固有耐药组的发现及其进化研究张　刚中国科学院微生物研究所改造葡聚糖蔗糖酶用于天然产物糖基化的研究梁朝宁中国科学院微生物研究所解脂耶氏酵母双极出芽地标蛋白的鉴定和功能研究李运清济宁医学院枯草芽孢杆菌稳定期高效表达启动子P16功能元件的解析及优化刘晓青中国农业科学院生物技术研究所两种抗菌素中稀有L-别异亮氨酸结构单元生物合成酶的结构秦湘静中国科学院南海海洋研究所与催化机理研究苜蓿中华根瘤LsrB调节3-磷酸甘油代谢的机制研究唐桂容上海大学沙漠核爆区微生物新型RNA伴侣蛋白Csp相关功能域研究周正富中国农业科学院生物技术研究所细菌信使RNA非翻译区衍生小RNA的生物学功能研究王　川复旦大学烟曲霉T-DNA插入突变筛选和分离到的卡泊芬净耐药新基因仲国维南京医科大学batA的功能特征和耐药机制研究雨生红球藻厚壁孢子形成对虾青素合成的相关基因转录调控万民熙华东理工大学的影响机制重组大肠杆菌中靛玉红合成关键酶基因的鉴定、表达及功能研究杜纪坤广东医学院Bacillus 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NS2-5B/GBV-B嵌合病毒对小型灵长类动物狨猴感染性研究李婷婷南方医科大学HSV-2包膜糖蛋白与受体HVEM相互作用介导HIV-1感染非靶标胡　凯中国科学院武汉病毒研究所细胞的研究MVP在甲型流感病毒诱导的细胞因子风暴中的作用及机制研究刘　实武汉大学SMARCB1介导HBV cccDNA微染色体染色质重塑调控cccDNA杭小锋中国人民解放军第二军医大学转录的机制研究UB2V2等与人巨细胞病毒相互作用的宿主蛋白的鉴定及功能分析张磊砢中国科学院武汉病毒研究所1574生命科学第27卷γ疱疹病毒间质蛋白ORF45参与病毒形态发生的分子机制研究沈　胜中国科学院生物物理研究所不同冠状病毒nsp16的2’-O-甲基转移酶活性的激活机制差异性杨中正武汉大学的分子机制研究肝细胞癌相关乙肝病毒突变体的构建及功能研究张　琪中国人民解放军南京军区军事医学研究所甲型H7N9禽流感神经氨酸酶耐药分子机理和传播性研究高海女浙江大学利用诱饵多肽分离和鉴定人外周血单个核细胞的HBV受体田景惠泰山医学院轮状病毒P[19] VP8*蛋白与组织血型抗原相互作用的结构孙晓曼中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所与功能基础内质网应激介导疱疹病毒激活潜伏感染EBV的机制研究姚文霞广州医科大学人博卡病毒1型与分化的人气道上皮细胞膜蛋白的相互作用研究刘文宽广州医科大学人副流感病毒3型磷酸蛋白氨基端功能区域的研究张胜威湖北中医药大学外泌体(exosomes)介导肝癌诊断标志物GP73调控丙型肝炎病毒胡龙波广州医科大学粒子释放的分子机制研究我国狂犬病病毒种群划分系统的建立陶晓燕中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所宿主蛋白GRAF抗HIV-1机制研究杨　炜中国科学院生物物理研究所宿主限制因子IFITM3对人肠道病毒71型的抑制及其作用机制叶晓华中国科学院上海巴斯德研究所的研究用计算与实验相结合的方法筛选针对流感病毒聚合酶组装李春峰中国医学科学院的新型抑制剂组蛋白去乙酰化酶9对丙型肝炎病毒生活周期的影响陈继征中国科学院武汉病毒研究所LysKP2和LysKP1在噬菌体JD001侵袭及裂解肺炎克雷伯菌中崔泽林上海交通大学的作用与机制苏云金芽胞杆菌噬菌体受体结合蛋白决定其宿主特异性机制研究袁益辉中国科学院武汉病毒研究所穿透支原体Ferritin蛋白的结构和功能研究李冉辉南华大学重组噬菌体对沙眼衣原体作用及机制的探索邵丽丽天津医科大学2植物学Ca2+调控柑橘属果实分泌囊细胞凋亡的作用机制研究白　玫华南农业大学马铃薯AGP基因控制块茎发育的分子机理研究马浩力西北农林科技大学微管切割蛋白Katanin调控花瓣表皮细胞极性生长和花瓣形态任慧波福建农林大学建成的研究拟南芥组蛋白去乙酰化酶调控维管形成层多能干细胞特性李　慧北京林业大学的分子机制研究豹子花属杂交物种形成研究高云东中国科学院成都生物研究所变豆菜属的分子系统学和生物地理学研究王奇志华侨大学杜鹃花科越橘属南烛组和坛花组的分类学研究童毅华中国科学院华南植物园国产盆距兰属(Gastrochilus)的分类修订刘　强中国科学院西双版纳热带植物园国产千里光属(菊科：千里光族)的分类学研究唐　明江西农业大学毛鳞菊属泛喜马拉雅分支的分子系统学研究王泽欢中国科学院昆明植物研究所亚洲檬果樟属(樟科)的分类学研究刘　冰中国科学院植物研究所东亚和东南亚地区唇鳞苔属分类学研究叶　文中国科学院华南植物园国产金星蕨科的分类学研究李中阳赣南师范学院中国石蕊科地衣共生藻的分类及分子系统学研究李　博太原师范学院中国西南地区膜叶铁角蕨属的多倍体起源和网状进化研究常艳芬中国科学院西双版纳热带植物园喜马拉雅-横断山区高山植物钟花报春组(报春花科)的谱系地理学张彩云华南农业大学研究云南轿子雪山高山树线树木分生组织生长动态及其低温阈限王文礼云南大学豆科植物属水平的生命之树及其时空演化李洪雷华南农业大学第12期1575国家自然科学基金委员会生命科学部2015年度资助项目泛菊亚纲基部类群花粉进化的限制性研究俞　英中国科学院昆明植物研究所红景天属三裂红景天组的物种形成和分化研究张建强陕西师范大学基于叶绿体基因组的石竹目系统发育基因组学研究姚　纲中国科学院昆明植物研究所结合分子系统学、化石和生态位模拟来推导朴属(Celtis L.)的生物杨美青中国科学院昆明植物研究所地理进化历史木质素多聚体合成相关的LAC基因家族的进化研究刘平丽北京林业大学葡萄科崖爬藤属的系统发育和多样化研究鲁丽敏中国科学院植物研究所人工合成水稻杂交种和四倍体核质协同进化宫　磊东北师范大学广西崇左地区更新世岩溶洞穴堆积物孢粉研究及古生态环境重建李素萍中国地质科学院地质研究所保守型植物抗病基因——XTNX类基因的起源及演化研究张艳梅江苏省中国科学院植物研究所东亚—北美间断分布草本菝葜类群的物种形成和谱系地理学研究李　攀浙江大学还亮草(毛茛科)不同类型花瓣身份决定的分子机制研究张文根江西农业大学横断山区高山垫状植物与其它植物双向协作共存机制及其陈建国中国科学院昆明植物研究所对高山生态系统功能及意义研究基于群体转录组研究南荻早期适应的分子机制徐　芹中国科学院植物研究所基于转录组的花瓣状苞片遗传调控机制和演化模式的研究余　岩四川大学毛茛属植物适应水生环境的关键基因及功能验证研究赵淑颖中国科学院武汉植物园远志科龙骨花的发生、发育及其分子机理研究胡　瑾深圳市仙湖植物园管理处植物C类MADS-box基因的分子进化和功能分化研究公丕昌中国科学院植物研究所盗蜜对高山植物麻花艽自交率和近交衰退的影响张　婵河南师范大学两型花柱克隆植物波缘报春克隆生长对有性繁殖的协同作用朱兴福中国科学院西双版纳热带植物园拟南芥PPR蛋白FBA2调控叶绿体ATP合酶基因表达的分子机理研究李文静中国科学院植物研究所拟南芥叶绿体蛋白HPE1参与光合作用调控及其作用机理研究靳红磊中山大学RND1调控根瘤形成和侧根发育分子机制的研究张晓伟中国科学院上海生命科学研究院植物磺肽素在豆科植物根瘤发育过程中的功能及作用机制研究于亮亮上海大学PPR184参与玉米籽粒发育和线粒体细胞色素c成熟的分子机理研究孙　峰山东大学拟南芥MGT6在高镁条件下运输镁离子的作用机制研究毛丹丹湖南师范大学印度芥菜BjHMA4转运蛋白C-末端结构域的位置和功能研究王建武榆林学院高粱茎秆蜡层缺失突变体sb1基因克隆及功能研究张丽霞辽宁省农业科学院脂类代谢重要基因ACBP在水稻脂类降解中的作用机制及功能研究孟　威东北林业大学AHA1调节气孔免疫的分子机制周朝阳中国科学院遗传与发育生物学研究所DELLA家族在花生干旱/高盐胁迫响应中的功能研究侯　蕾山东省农业科学院NtMTP蛋白在烟草Cd转运及分配过程中的功能分析刘继恺西南科技大学Raf36介导拟南芥感染寄生疫霉菌的机制研究赵　华西北农林科技大学TIFY 转录因子参与水稻耐寒过程的机理研究黄小贞贵州大学不同染色体倍性桦木属树种的水力结构研究郝广友中国科学院沈阳应用生态研究所番茄DDB1与ATR激酶互作参与基础免疫应答的分子机理研究张丹凤合肥工业大学脉冲电场作用对植物释放负离子的机理研究吴仁烨福建农林大学帽结合蛋白CBP20/CBP80调控植物响应冷胁迫的机理研究孔祥翔中国科学院昆明植物研究所拟南芥丙酮酸转运体参与植物干旱胁迫响应的分子机制研究李春龙山东大学拟南芥抗铝毒的转录调控机制丁忠杰浙江大学拟南芥组蛋白HIS1-3与WRKY1互作调控盐胁迫响应的分子机理樊婷婷合肥工业大学染色质重构蛋白CHR5在拟南芥抗病免疫反应中的功能研究邹保红南京农业大学鼠耳芥ARGONAUTE2/5基因在植物锌/镉耐受性和超富集中许长征西南大学的作用机制水稻OsSLC7基因在其胁迫反应和生长发育中的功能机制研究李生平中国科学院福建物质结构研究所水稻OsSRO1c基因在干旱胁迫诱导的叶片衰老中的功能研究游　均中国科学院武汉植物园水平基因转移参与小立碗藓耐旱的功能研究关艳龙中国科学院昆明植物研究所。

微生物多样性与肠道菌群的关联性研究肠道是人体内最大的微生物生态系统之一，其中存在着复杂的微生物群落，包括细菌、真菌和病毒等。

这些微生物通过共生关系与人体相互作用，对人体的健康和免疫系统发挥重要作用。

微生物多样性是指微生物群落中不同种类的微生物的丰富度和多样性水平。

近年来，微生物多样性与肠道菌群的关联性的研究取得了一系列重要发现，为人们更好地理解肠道微生物群落的组成和功能奠定了基础。

首先，微生物多样性的研究揭示了不同人群之间的肠道微生物群落差异。

人体的肠道微生物群落具有个体差异和地域差异。

通过对不同地区和不同健康状况的人群进行微生物多样性研究，发现不同地域和不同群体之间的微生物多样性存在明显的差异。

这些差异可能与饮食结构、生活习惯、环境因素等有关。

例如，素食者和草食动物的肠道微生物群落相比于肉食者和食肉动物的群落更为多样化。

其次，微生物多样性与肠道健康的关系备受研究关注。

研究发现微生物多样性丰富的肠道菌群和健康状况密切相关。

微生物多样性的降低与多种疾病的风险增加有关，包括肥胖症、炎症性肠病、自身免疫性疾病等。

这些研究结果表明，微生物多样性的提高对维持肠道健康和抵抗疾病具有重要作用。

此外，微生物多样性的变化与肠道菌群的失衡相关。

肠道微生物群落的失衡指微生物群落中某些菌种的数量和种类发生改变，其中某些有益菌数量减少，有害菌增加。

肠道菌群的失衡常见于使用抗生素、肠胃感染和不良饮食习惯等状况下。

这种失衡状态可能导致肠道疾病的发生，并对免疫系统产生负面影响。

通过微生物多样性的研究可以了解肠道菌群的失衡情况，为预防和治疗肠道相关疾病提供参考依据。

总结起来，微生物多样性与肠道菌群的关联性的研究为我们认识肠道微生物群落的结构与功能提供了深入的理解。

通过研究微生物多样性，我们可以更好地了解肠道微生物群落的差异、与健康的关系以及失衡状态的形成机制。

未来研究应该进一步探索微生物多样性与肠道菌群之间的相互作用机制，并为肠道菌群的调控和治疗提供更多的科学依据。

微生物物种多样性研究进展微生物是分布最为广泛的生命形式，几乎分布到地球上的所有生境，可利用各种有机化合物、无机盐等作为能源，在有氧或无氧条件下，在寒冷的极地、高达100℃的热泉或高盐碱度等极端环境中生活。

微生物具有丰富的物种和遗传多样性，并以高度的变异性适应不同的生境。

作为生态系统中的重要组分，微生物在自然界的物质与能量循环、生态系统的演替以及生物多样性的维持中发挥重要的生态功能。

微生物与人类的生活休戚相关，在直接或间接地为人类提供了极其丰富的物质资源的同时，也为人类带来了巨大危害。

Woese和Fox(1977)以核糖体RNA(rRNA)的小亚基(原核生物的16S、真核生物的18S基因)序列为依据，提出了独立于真细菌(Eubacteria)和真核生物 (Urkaryotes) 之外的第三种生命形式——古菌 (Archaea)，认为它和真核生物以及真细菌是从一个具有原始遗传机制的共同祖先分别进化而来。

随后 Woese等(1990)提出了三域(Domain)分类系统，将地球上的生物分别归为细菌域(Domain Bacteria)、古菌域 (Domain Archaea)和真核生物域(Domain Eukarya)，其中古菌在进化谱系上更接近真核生物，但在细胞构造上与细菌较为接近，同属原核生物而真菌与动物、植物等生物属于真核生物域。

我国地域辽阔，跨越热带至寒温带，气候条件多样，地理环境与生态系统类型复杂，是世界上生物多样性最丰富的国家之一。

而多样的生境蕴藏着丰富的微生物多样性。

特别是近年来微生物多样性的研究由传统的培养方法，逐渐转向以免培养的分子生物学技术为主，如DNA的指纹图谱、分子杂交、克隆文库测序、高通量测序(pyroseqencing)、稳定性同位素探测(stable isotope probing，SIP)、基因芯片(gene chip)以及转录组学等技术。

我国学者利用先进的分子生物学技术，极大地提高了我国微生物多样性的研究水平。

庐山石韦内生真菌多样性及地下部分显微结构观察詹寿发;彭琴;陈晔;樊有赋;甘金莲;任林【摘要】[Objective]Endophytic fungi resources and distribution regularity of Pyrrosia sheareri (Bak.)Ching were studied in order to provide references for better protection and management of P. Sheareri. [ Method ]The endogenous fungi from P. Sheareri were isolated into different parts (root, stem, leaf, and petiole) and identified based on morphological characteristics. The microstructure of the adventitious roots and rhizomes were observed using paraffin section and microtechnique. [ Result ]Fifty-three strains of endophytic fungi were separated from P. Sheareri, amongst which 50 strains belonged to 14 genera,7 families,5 orders, and 2 classes,while the other 3 strains belonged to Rhizoctonia and Sclerotium of Agno-mycetales. Phomopsis was the dominant genus in the 16 genera, accounting for 18.87% of the total strains, followed by Phyllosticta and Cephalosporium, which accounted for 15.09% and 13.21% of total strains, respectively. Adventitious roots of P. Sheareri have similar structure with primary roots of seed plants and the vascular bundle of rhizome had no cambium. [ Conclusion ] Endophytic fungi in P. Sheareri showed rich diversity; the cortical parenchyma was the main dwelling region for endophytic fungi.%[目的]探索庐山石韦(Pyrrosia sheareri)内生真菌资源和分布规律,为更好地保护和开发利用庐山石韦资源提供依据.[方法]从庐山石韦不同部位(根、茎、叶、叶柄)分离纯化内生真菌,运用形态学特征对菌株进行分类鉴定；采用石蜡切片法和显微技术观察庐山石韦不定根与根状茎的显微结构.[结果]从庐山石韦中分离得到53株内生真菌,其中50株分别属于14个属、7个科、5个目、2个纲,另外3株为无孢目的丝核菌属(Rhizoctonia)和小菌核属(Sclerotium).在16属内生真菌中,以拟茎点霉属(Phomopsis)为优势属,占总株数的18.87％,其次是叶点霉属(Phyllosticta)和头孢霉属(Cephalosporium),分别占总株数的15.09％和13.21％.庐山石韦不定根的结构与种子植物初生根结构相似,其根状茎维管束无形成层.[结论]庐山石韦植物内生真菌具有丰富的多样性,皮层薄壁组织是内生真菌主要的寄居区域.【期刊名称】《南方农业学报》【年(卷),期】2012(043)009【总页数】5页(P1320-1324)【关键词】庐山石韦;显微结构;内生真菌;生物多样性【作者】詹寿发;彭琴;陈晔;樊有赋;甘金莲;任林【作者单位】九江学院生命科学学院,江西九江332000;九江学院生命科学学院,江西九江332000;九江学院生命科学学院,江西九江332000;九江学院生命科学学院,江西九江332000;九江学院生命科学学院,江西九江332000;九江学院生命科学学院,江西九江332000【正文语种】中文【中图分类】Q939.5【研究意义】庐山石韦［Pyrrosia sheareri（Bak.）Ching］为水龙骨科石韦属蕨类植物，主要分布于长江以南各省区，生长在海拔500～2290 m的岩石缝中或树干上。

80 中国医药生物技术 2011年2月第6卷第1期Chin Med Biotechnol, February 2011, V ol. 6, No. 1·行业动态·生物医药重大新药研发创制将获400亿资金支持有关部门计划“十二五”期间投向生物医药产业的重大新药研发、创制领域专项资金将在 400 亿元左右，比“十一五”期间翻了一番多。

在具体支持领域中，对生物制品研发的支持力度明显加大。

在这 400 亿元专项资金中，中央财政拨款 100 亿元，其余为地方各级政府配套资金及企业自筹资金。

而“十一五”期间投入相同领域的专项资金额度为 178 亿元。

权威人士透露，即将出台的生物医药产业“十二五”规划重点突出了对生物制品研发及产业化的支持力度，提出在2015 年前争取实现 10 个以上拥有自主知识产权的生物技术药品产业化工程。

根据生物医药产业“十二五”规划，在基本药物研究开发、工艺改进、技术创新、规模化生产等方面取得研究突破的医药企业有望获得专项资金支持。

生物制品领域具体包括基因工程、细胞工程、酶工程等。

为实现上述目标，我国将出台与生物制品研发相关的专项支持政策，例如用生物药技术改造传统药物专项、用酶法替代化学药生产专项等。

目前我国已有 200 多家医药企业在开展生物制品药物的研发生产，但生物制品在整个医药生产总值的占比只有10% 左右。

专家预测，随着政策支持力度的“加码”，生物制品“十二五”期间有望取得重大研发突破。

我国创新微生物药物研发获重大进展过去 5 年中国创新微生物药物筛选与发现研究获进展，目前已拥有 12 万株，40 万份的药用微生物菌株和 20 万个微生物发酵提取品，微生物产物高通量筛选模型 150 多个，获得了一批微生物药物先导化合物或候选物，为创新微生物药物研发奠定了良好基础。

中国医学科学院医药生物技术研究所所长蒋建东透露这一信息时称，中国是拥有生物多样性最多的国家，具有研究开发利用微生物药用资源优势。