生物学和地球科学领域数据库共享指南与数据库建设规范
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《现代生物医学进展》杂志简介《现代生物医学进展》,是以刊发基础医学、临床医学和生命科学领域最新研究成果的综合性学术期刊。
本刊由国家新闻出版总署审批、黑龙江省卫生健康委员会主管、黑龙江省森工总医院和哈尔滨医科大学附属第四医院主办、现代生物医学进展杂志社编辑出版。
国内统一刊号CN:23-1544/R,国际标准刊号ISSN:1673-6273,半月刊,铜版纸印刷,彩图,邮发代号:14-12,定价:30.00元/期,全年定价:720.00元/24期。
自2001年创刊以来,我们一直秉承着做好学术传媒的职责,以”更高、更好、更快”为指导方针,瞄准当前生物医学发展的前沿,及时报道国内外具有前瞻性、创新性和学术性的现代生物医学新理论、新方法和新成果,促进学术交流,为科研人员提供一个高质量、高时效的发表、交流的平台。
学术影响及收录情况自2004年被评为国家科技部中国科技论文统计源期刊、中国科技核心期刊以来,本刊的学术影响力不断扩大,特别是在国外的影响力远大于国内。
在2011年美国《化学文摘》公布的被引频次最高的全球千种中学术期刊中,《现代生物医学进展》杂志名列第234位。
根据中国高校科技期刊研究会对外联络委员会国际检索系统咨询部(/ch/index.aspx)公布的统计结果显示,2014年美国《化学文摘(网络版)》共收录本刊《现代生物医学进展》论文人库1030篇,在1813种期刊中名列第5位。
据《2018年版中国科技期刊引证报告(核心版)》统计结果显示,我刊《现代生物医学进展》核心总被引频次为4435次,在全部核心期刊中位居88位。
据2018年中国知网发布的中国学术期刊影响因子年报(自然科学与工程技术),在《基础研究》类别中的65种期刊中,其影响力指数(期刊影响力综合评价指标)学科排序位居第二位(2/65)o目前,本刊已被美国化学文摘(CA),美国剑桥文摘(ProQuest,CSA),英国公共健康研究数据库(Global Health.GH),英国国际农业与生物科学研究中心(CABI Abstracts)数据库、俄罗斯文摘杂志(Abstract Journal,AJ)、波兰哥白尼索引(Index Copernicus, IC).Genamics Journal Seek索引、美国乌利希国际索引(Ulrich's Periodicals Directory)、美国EBSCO全文数据库、WH0西太区医学索引(WPRIM)收录等国际知名数据库以及科技部中国科技论文与引文数据库(CSTPCD)、中国科技文献数据库(CSTDB)、中国期刊全文数据库(CJFD).中国学术期刊综合评价数据库、中国期刊网、《中国学术期刊》(光盘版)、科技部中文科技期刊数据库、《中国生物学文摘》、中国生物学文献数据库、中国生物医学文献数据库(CBM disc)、中文生物医学期刊文献数据库(CMCC)和中文电子期刊服务源(CEPS)等国内权威检索平台收录。
地球科学数据共享材料八海洋科学数据库建设规范(讨论稿)中科院青岛海洋科学研究所地球科学数据共享政策与规范研究组2004年5月目录1.前言 (2)2.海洋科学数据库建设总体要求 (2)2.1 海洋科学数据库总体框架构建 (2)2.2 具体的数据库的建库规范 (2)2.2.1 术语定义 (2)2.2.2 具体数据库的建库流程 (3)2.2.3 具体数据库建设目标 (3)2.2.4 数据库文档 (3)海洋数据库建设规范实例:中国近海和西北太平洋温盐声密数据库建设规范 (4)1.前言 (4)2.中国近海和西北太平洋温盐声密数据库建设规范 (4)2.1适应范围 (4)2.2引用标准 (5)2.3技术术语定义/解释 (6)2.4 编码、属性表命名规则 (7)2.5 元数据标准 (8)2.6 文档格式 (8)2.7 数据库建设流程 (8)2.8 数据质量控制 (10)2.9 数据库汇交(集成)(汇交至的方法和途径等) (14)1.前言海洋科学是一门综合性的学科,涵盖物理海洋学、海洋地质学、海洋生物学、海洋化学等多个学科,研究工作中所涉及、积累的数据也是多种多样各不相同,如物理海洋方面水文数据是记录着某一经纬度、某一时间、某一航次、某一深度的海水温度、盐度和密度信息;海洋地质方面基础地质数据记录着某一区域海底深度及海底地貌等信息;而海洋生物方面又可能是某一物种或某一标本的属性等,因此各方面的数据库建设也各不相同,建设规范也就各不相同。
根据这种情况作为海洋科学数据库的建库单位,一方面我们对整体的数据库建设有建设规范(总体要求);另一方面,要求每一个具体的数据库要通过建库的工作确定各自的规范和标准,这个规范、标准是代表海洋所水平的,基本也就是代表科学院水平的,而且要求进行必要的鉴定工作成为国家水平的。
2.海洋科学数据库建设总体要求2.1 海洋科学数据库总体框架构建海洋科学数据库可以粗略地分成海洋水文子库、海洋地质子库和海洋生物子库三个部分,每个部分又包含了自成系统的多个具体的数据库。
生物信息数据库资源查寻及共享吴耀生(广西医科大学生化教研室 南宁 530021) 生物信息数据库已成为现代生物医学研究不可缺少的一项研究工具。
目前世界上最主要的生物信息数据库的国际网站有美国国立生物信息中心数据库(N CBI ,Na tio nal Cente r fo r Bio lo gical Info rmation,Ge nBank,h ttp ://ww w.ncbi.nlm .nih .g ov /)[1],欧洲分子生物学数据库(EM BL ,h ttp ://w /embl /)[2],日本的DN A 数据库(DD BJ,DN A Da taba se of J a pa n,http ://w w w.ddbj.nig.ac.jp /)[3]。
在今天的生物学研究中,计算机与实验设备已完全同等重要。
我们特别需要依赖于计算机对大量累积的DN A 序列数据进行快速分析。
实际上这已触发了信息生物学的延生和发展。
为使现有的生物信息数据资源能充分利用,实现资源共享,有必要对目前世界上三大重要的生物信息数据库及其相应的国际网站做一些介绍。
1 生物信息数据库一般概况1.1 美国国立生物信息中心(N CBI ,ht tp ://ww w .ncbi .nlm.nih.g ov /)N CBI 是美国国立生物信息中心N atio nal Center for Bi-ological Info rma tion 的缩写,该机构建立于1988年11月4日,是美国国立卫生研究院(N IH)医学图书馆(N L M )的一个分支。
N CBI 创建了生物医学公共数据库GenBa nk ,引领着计算机生物学研究的潮流。
该机构不但发展软件工具进行基因组数据的分析,也大量收集并发布生物医学信息,其宗旨是为了更好地认识影响人类健康和疾病的分子过程。
大量的分子生物学数据的累积使人们有必要利用计算机对大量的生物医学数据进行处理分析。
大数据技术在生物科学中的应用在当今的数字化时代,数据已经成为了各个领域的核心。
生物科学作为一门技术高度发达的学科,也在广泛应用各种新的数据技术,其中大数据技术成为了生物科学中应用最广泛的一种技术。
本文将介绍大数据技术在生物科学中的应用,并探讨其对生物科学领域的影响。
一、大数据技术在生物科学中的应用1、生物信息学生物信息学是目前最流行的生物科学领域之一。
它涉及到基因数据、蛋白质序列数据、代谢物数据等各种生物分子的信息。
生物信息学的主要任务是:高通量技术下分析生命系统的各种分子部分之间是如何相互联系的,即找出“生物网络”;开发生物信息平台、数据库及计算工具以解决实验数据分析和生物信息的管理问题。
大数据技术在生物信息学领域中的应用主要有以下几个方面:(1)通过高通量测序技术生成海量的基因序列数据,对基因的功能、调控机制、进化历史等进行研究和分析;(2)利用大规模基因芯片,对全基因组的表达、甲基化和拷贝数变异等进行研究;(3)基于代谢组学数据对生物代谢物的生物化学性质和生物物理特性进行细致的分析。
2、分析各种生物分子数据生物分子数据是大量表达生物体生命活动信息的数据,微生物、细胞、蛋白质等分子数据的重要性越来越受到各个领域的重视。
大数据技术在分析各种生物分子数据方面,主要有以下几个方面:(1)基于蛋白质、代谢物和微生物数据的分析;(2)各种小分子的反应动力学模拟;(3)研究细胞表面和生物分子上的各种化学反应和交互作用,包括相互调节、相互作用和相互反应等。
3、大数据技术在基因组学中的应用基因组学是研究生物个体基因组构成和功能的学科。
现在主要是利用高通量测序技术,建立了出多种生物基因组测序数据库,并对不同的生物进行了基因组学研究。
大数据技术在基因组学中的应用主要有以下几个方面:(1)基于大数据分析工具的基因组异常检测,可用于检查缺失、拷贝数变异、基因融合等;(2)基于高通量测序技术的金属结合蛋白定位研究;(3)人类基因组对人类疾病发生的研究;4、大数据技术在系统生物学中的应用系统生物学考虑细胞、生物学、生物整体及其机能的高度集成,以探寻生命现象中物质和信息交互的动态规律。
功能基元序构原标题:【政策】国家基金:发布功能基元序构的高性能材料基础研究重大研究计划2022年度项目指南功能基元序构的高性能材料是指以功能基元为基本单元,通过空间序构构成具有突破性、颠覆性宏观性能的高性能材料。
“功能基元”是在原子、分子尺度和宏观尺度之间引入具有特定功能的中间结构单元,序构指人工设计制造的特定结构单元堆垛、排列方式,如有序结构、长、短程有序结构、梯度结构等。
功能基元序构的材料可以突破元素种类的限制,为探索具有变革性和颠覆性的高性能材料提供了更大的空间。
一、科学目标本重大研究计划瞄准材料科学前沿,通过功能基元序构构建高性能新材料,满足信息、结构、能源和极端服役条件对材料的需求,解决其中的关键科学问题与技术问题,揭示功能基元序构材料中蕴含的规律,建立相应的理论,发展材料设计的新原理和先进制备技术,逐步实现按需设计变革性和颠覆性新材料的目标,提高我国在材料科学领域的整体创新能力。
二、核心科学问题本重大研究计划将组织材料、信息、数理、化学等学科的科学家共同开展研究,拟解决的核心科学问题如下:(一)功能基元的本征特性(如物理化学性质、微纳结构、形态、尺寸、分布等)对宏观性能的影响规律及其调控机理,关注功能基元的临界尺寸效应和量子限域效应,明确功能基元(如铁电畴、铁磁畴、孪晶、组分、结构、低维量子材料、人工谐振单元等)与材料的宏观性能(如力、热、光、声、电、磁)之间的关联,发现和构筑影响材料宏观新奇物性的关键功能基元。
(二)序构对材料宏观性能优化增强的作用规律。
序构(如有序结构、长、短程有序结构、梯度结构、无序结构等)引发的功能基元间的耦合、增强效应;明晰序构影响材料宏观性能的物理机制。
(三)功能基元序构的协同关联效应。
揭示功能基元序构的协同关联作用机制;发现超越功能基元本身的高性能,甚至全新的性能;阐明“功能基元+序构”与宏观性能的关联;建立按需设计功能基元序构高性能材料的方法。
(四)功能基元序构高性能材料的制备科学与表征技术。