浙江大学scifinder使用教程
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SciFinder离线结构编辑器使用说明
如果已经成功安装了Java后还是不能正常使用,您也可以下载SciFinder离线结构编辑器,该编辑器具有强大的绘图功能,并允许用户创建离线导入到SciFinder 的结构查询。
下面是详细的使用说明,请参考:
Using the CAS Structure Editor
•运行CAS结构编辑器,如果您想立即将结构导入scifinder中并进行检索,可以同时登陆scifinder
•使用独立编辑器绘制结构,就像你使用SciFinder中基于Java的编辑器一样(注意:独立结构编辑器不支持SMILES,InChl,和CAS号转换功能。
独立结构编辑器中也不包括分子式和分子量的状态栏)。
•如果需要,在Preferences首选项中启动化合价检测功能(独立结构编辑器不支持其他任何验证)
•当您画完结构后,点击Export,将结构保存成cxf文件
进入SciFinder后,点击Explore Substances -> Chemical Structure,点击Browse预览功能导入您保存过的cxf文件,选择您想要的结构检索类型,点击search;对于反应检索也一样,点击go to Explore Reactions -> Reaction Structure,导入您需要检索的结构进行查询
•检索结果呈现形式与通过scifinder中的在线结构编辑面板检索一样,您可以进一步对结果集进行查看和分析
•如果您需要对结构进行修改或限定,您需要返回到CAS 结构编辑器中再进行编辑,将修改后的结构保存成cxf后,继续在scifinder中进行后处理。
scifinder化学结构式检索Scifinder化学结构式检索引言:Scifinder是一种常用于化学领域的专业检索工具,它能够帮助化学研究人员快速准确地获取所需的化学结构式信息。
本文将介绍Scifinder化学结构式检索的基本原理和使用方法,以帮助读者更好地利用该工具开展化学研究。
一、Scifinder的基本原理Scifinder是一种基于化学结构式的检索工具,它通过分析和识别化合物的结构式,从庞大的化学数据库中提取与其相关的文献、专利和实验数据等信息。
其基本原理是通过化学结构式的比对和匹配,寻找具有相似结构和性质的化合物,并提供相关的文献和数据资源。
二、Scifinder的使用方法1. 登录与注册用户需要注册一个Scifinder账号并登录。
用户可以通过所在机构或组织的许可获取登录凭证,并按照要求填写个人信息完成注册。
2. 结构式检索在登录后,用户可以利用Scifinder进行化学结构式的检索。
用户可以输入化合物的结构式或者关键词等信息进行查询。
在输入结构式时,可以使用分子编辑器绘制化合物的结构式,或者直接复制粘贴已有的结构式。
3. 结果筛选与分析Scifinder将根据用户的查询条件,在数据库中检索相关的文献和数据信息,并将结果以列表的形式呈现给用户。
用户可以根据需求对结果进行筛选和排序,以获取最相关的信息。
4. 文献获取与下载在获取到相关的文献信息后,用户可以通过Scifinder提供的链接或DOI获取全文文献。
用户还可以将相关文献保存到个人文件夹或导出到其他文献管理工具进行管理和引用。
5. 数据分析与比较Scifinder不仅提供了文献资源,还包括了大量的实验数据和化学信息。
用户可以通过Scifinder进行数据的分析和比较,以支持其研究工作。
三、Scifinder的优势和应用1. 广泛的数据库资源Scifinder拥有庞大的化学数据库资源,包括了全球范围内的文献、专利和实验数据等。
scifinder使⽤⼿册研发⼯具Scifinder《使⽤说明书》第⼀章 Scifinder数据库介绍1.1 Scifinder数据库1.1.1 检索系统⽀持的检索⽅式:主题检索、物质名称检索、分⼦式检索、结构式检索、亚结构式检索、相似结构式检索、反应式检索、类反应式检索、分析与⼆次检索。
作者、机构名称、杂志名称、专利号、CA号检索结果后处理系统:Scifinder不仅仅包含有分⼦式、反应式和结构式(包括亚结构检索)等多种检索功能,⽽且在得到初步检索结果的基础上还可以进⼀步利⽤超过20个选项的后处理功能以最快的速度找到最精确的答案。
它已经超越了检索⼯具的范畴,⽽成为研发⼈员不可或缺的研发⼯具。
包含的信息量:⼤于2600万条⽂章记录;3000多万个有机⽆机物质,5800多万⽣物序列,1100多万条单步多步反应。
信息时效:1907年-⾄今1.1.2 原⽂下载系统Scifinder具有强⼤的期刊和专利链接,收录了全世界9500多种主要期刊和50多家合法专利发⾏机构的专利⽂献中公布的研究成果,占全球化⼯信息的98%。
其中能直接链接原⽂的化⼯类核⼼期刊1365种,约占全球英⽂版电⼦化⼯类期刊总数的90%,⼏乎包含了所有⾼影响因⼦期刊。
1.2 Scifinder的化学学科覆盖事实上,Scifinder数据库囊括了⾃20世纪以来所有与化学相关的资料,以及⼤量⽣命科学及及其它科学学科⽅⾯的信息。
1.2.1 ⽣命科学领域遗传学、基因组学、酶学、蛋⽩质组学、实验内科学、⽣物化学、⽣物技术学、分⼦⽣物学、微⽣物学、细胞⽣物学、药理学等能够保证将9⼤主要专利组织2⽇内发布的与⽣物加⼯⽅法、蛋⽩质组技术、新遗传学⼯艺,及其它对现代药品开发⾄关重要的课题等相关的专利收录进来;通过Scifinder访问遗传学、酶学、⽣物化学、⽣物技术学及更多科学信息。
⽤户可查找:摘⾃细胞、科学、核酸研究、现代药品开发资料及其它知名期刊的科学信息。
研发工具Scifinder《使用说明书》第一章 Scifinder数据库介绍1.1 Scifinder数据库1.1.1 检索系统支持的检索方式:主题检索、物质名称检索、分子式检索、结构式检索、亚结构式检索、相似结构式检索、反应式检索、类反应式检索、分析与二次检索。
作者、机构名称、杂志名称、专利号、CA号检索结果后处理系统:Scifinder不仅仅包含有分子式、反应式和结构式(包括亚结构检索)等多种检索功能,而且在得到初步检索结果的基础上还可以进一步利用超过20个选项的后处理功能以最快的速度找到最精确的答案。
它已经超越了检索工具的范畴,而成为研发人员不可或缺的研发工具。
包含的信息量:大于2600万条文章记录;3000多万个有机无机物质,5800多万生物序列,1100多万条单步多步反应。
信息时效:1907年-至今1.1.2 原文下载系统Scifinder具有强大的期刊和专利链接,收录了全世界9500多种主要期刊和50多家合法专利发行机构的专利文献中公布的研究成果,占全球化工信息的98%。
其中能直接链接原文的化工类核心期刊1365种,约占全球英文版电子化工类期刊总数的90%,几乎包含了所有高影响因子期刊。
1.2 Scifinder的化学学科覆盖事实上,Scifinder数据库囊括了自20世纪以来所有与化学相关的资料,以及大量生命科学及及其它科学学科方面的信息。
1.2.1 生命科学领域遗传学、基因组学、酶学、蛋白质组学、实验内科学、生物化学、生物技术学、分子生物学、微生物学、细胞生物学、药理学等能够保证将9大主要专利组织2日内发布的与生物加工方法、蛋白质组技术、新遗传学工艺,及其它对现代药品开发至关重要的课题等相关的专利收录进来;通过Scifinder访问遗传学、酶学、生物化学、生物技术学及更多科学信息。
用户可查找:摘自细胞、科学、核酸研究、现代药品开发资料及其它知名期刊的科学信息。
1.2.2 传统化学领域有机化学高分子——聚合物、塑料、纺织、橡胶粘合剂等应用化学和化学工程——加工、工业化学、金属/合金、陶瓷、环境等物理化学、无机化学和分析化学1.3 Scifinder检索路径汇总第二章 Scifinder 检索界面2.1 Scifinder检索界面登录Scifinder 后出现一下界面(默认为新任务窗口):2.2 Scifinder 主检索界面点击新任务(New Task)按钮,出现Scifinder 主检索界面,这是各个检索路径的共同起点,是进入检索的入口。
scifinder检索方法
Scifinder是一个专门用于化学、生物和相关科学领域的文献检索工具,它提供了丰富的化学信息资源和文献数据库。
要使用Scifinder进行检索,首先你需要访问Scifinder的官方网站并注册一个个人账户。
一般来说,你需要通过所在机构或组织的许可才能获得使用权限。
一旦你获得了账户权限,你可以按照以下步骤使用Scifinder 进行检索:
1. 登录,使用你的个人账户信息登录Scifinder系统。
2. 关键词检索,在搜索框中输入你感兴趣的关键词,可以是化合物名称、化学反应、化合物性质、文献题目等。
3. 高级检索,如果你想要更精确地检索文献,可以使用高级检索功能,通过设定各种检索条件来缩小检索范围。
4. 分析结果,浏览检索结果,可以根据相关性、时间、作者等条件对结果进行排序和筛选。
5. 获取文献信息,点击文献标题可以查看文献的详细信息,包括摘要、作者、期刊信息等。
6. 下载文献,如果你需要获取全文,可以通过Scifinder提供的链接或者文献DOI直接下载文献的全文。
此外,Scifinder还提供了化合物结构和反应式的检索功能,可以通过输入化学结构或者反应式来检索相关信息。
总之,Scifinder是一个功能强大的化学信息检索工具,通过合理的关键词选择和高级检索功能的运用,可以帮助你快速准确地获取所需的化学信息和文献资源。
希望这些信息能够帮助到你。
启动结构图标屏幕1点击,切换到物质检索界面。
2 点击结构式面板缩略图。
(1)(2)注意:如果初次使用结构式画图板,需要按照提示下载JA V A插件。
1绘画结构窗口Untitled (未命名)开启。
绘画化学结构工具原子和化学键选择目前的原子选择放大率框New开启新的结构图标窗口。
Import从本地电脑中导入一个已保存的文件。
如果想导入Chem Draw保存的文件必须导入格式为.mol的文件Export 把画板上的结构式保存到本地电脑中。
Save as template 把当前的结构式保存为模板。
Print 打印当前结构式Cut 剪切当前画板上的结构式。
该图标只有在选中了一个结构式之后才可以使用。
Copy 复制画板上已选中的结构式。
该图标只有在选中了一个结构式之后才可以使用。
Past 粘帖已复制的结构式。
该图标只有在复制一个结构式之后才可以使用。
Modification 撤销前一步操作。
Redo 恢复前一步已撤销的操作。
Repaint更新画图面板Check Overlaps 检查面板上是否有重叠的部分。
Preference 结构式画图板板个性化设置。
个性化设置共分为四个部分。
粘贴板(Clipboard),颜色(Color),结构画法(Structure Drawing),工具栏(Toolbars)。
z Clipboard可以设置粘贴板中结构式的格式。
z颜色(Colors)可以设置结构式画图面板键的颜色、原子的颜色。
检查化合价 固定键的长度固定键与键之间的长度显示工具栏提示原子和键显示形式给出原子编号z Toolbars 可以设定面板下方显示的常用原子垂直的工具板提供绘制和修改化学结构的工具。
要使用工具,先点击图标。
再将鼠标点击到结构图标窗口,图标内容便会自动显示。
z铅笔工具(Pencil)这是用来绘制结点和键。
先选择出原子和键,点击铅笔工具图标,鼠标会变成铅笔形状,可以开始绘制。
绘制方法:1. 将鼠标点击在你想开始绘制的位置。
目录:第一章 SciFinder Web新功能 1-1 反应检索新功能 1-2物质检索新功能 1-4沟通协作新功能 1-8更多便利的使用方式 1-10第二章 文献检索(Explore reference) 2-1 主题检索 (Explore References)2-2系统分类 (Categorize)2-4分析功能 (Analysis)2-5通过分析功能进行二次检索2-6导出分析结果 2-7限定功能(Refine) 2-8定题服务(Keep Me Posted) 2-10如何查看定题服务(Keep Me Posted)的结果 2-10获取相关物质(Get Related Substances) 2-11获取相关反应(Get Related Reactions) 2-12获取引用与被应用文献(Get Citing/Cited References) 2-12链接全文(Full Text) 2-13保存结果(Save) 2-13查看已保存的结果 2-14对已保存文献结果集进行组合 2-15打印结果(Print) 2-16导出结果(Export) 2-17通过导航条获取之前某步的检索结果 2-18回顾检索历史 2-18作者姓名检索(Author Name) 2-19机构名称检索(Company Name) 2-20期刊和专利检索 2-20第三章 SciFinder结构图标 3-1 绘画结构窗口(Structure Drawing Screen)3-2水平工具栏 3-3垂直工具栏3-5结构检索(The Structure Query Drawing)3-18检索多个结构碎片 (Search Multiple Fragments)3-21结构式画图面板和反应式面板的切换3-21第四章完全相同化学结构检索(Exact Chemical Structure Search) 4-1 完全相同化学结构检索 (Exact Chemical Structure Search) 4-2计算特性 (Predicated Properties) 4-5实验特性 (Experimental Properties) 4-6保留物质 (Keep Selected) 4-7分析和限定结果 (Analysis / Refine) 4-7物质的相关文献4-8 (Reference Information related to Substances)检索更多的相关信息 (Get Related...) 4-9物质供应目录数据(Catalog Information of Substances) 4-9物质管制和注册数据 (Regulatory Information of Substances) 4-10物质反应数据 (Reaction Information of Substances) 4-10返回历史检索界面(Back To The History Interface)4-11第五章亚结构检索 (Substructure Search) 5-1 亚结构检索(Substructure Search) 5-2进行亚结构检索5-4 (Performance of Substructure Search)分析结果 (Analyzing Answer) 5-5分析物质的商业来源 (Commercial Availability) 5-6分析物质原子组成 (Elements)5-7分析物质是否可以用于反应 (Reaction Availability)5-8分析物质的研究角色 (Substance Role)5-9限定结果 (Refining Answer)5-11限定化学结构 (Chemical Structure) 5-12限定是否包含同位素 (Isotope-Containing) 5-13限定是否包含金属 (Metal-Containing) 5-13限定是否提供商业来源(Commercial Availability) 5-14限定是否提供理化性质(Property Availability) 5-14限定理化性质 (Property Value) 5-15限定是否有文献报道(Reference Availability) 5-16限定原子附属(Atom Attachment) 5-16返回历史检索界面(Back To The History Interface)5-17第六章相似结构检索 (Similarity Search) 6-1 相似结构检索简介(Introduction of Similarity Search) 6-2进行相似结构检索(Performance of Similarity Search) 6-4比较:完全相同结构检索、亚结构检索和相似结构检索6-7 (Differences between Exact Chemical Structure Search,Substructure)相似结构检索的参考文献(Reference Data of Similarity Search) 6-10返回历史检索界面(Back To The History Interface)6-10第七章化学反应检索 (Reaction Search) 7-1 从结构去检索反应式7-2 (Search from One Side of Reaction)进行化学反应检索(Performance of Reaction Search) 7-4多步反应显示 (Display Multi-steps Reaction) 7-6保留反应(Keep reaction)7-7化学反应的文献 (References of Reaction) 7-8分析反应结果(Analyze Reaction Result) 7-9分析反应作者(Analyze Reaction Author Name)7-10分析反应催化剂(Analyze Reaction Catalyst)7-11分析反应组织机构名(Analyze Reaction Company/Organization)7-13分析反应文献类型(Analyze Reaction Document Type)7-14分析反应期刊名(Analyze Reaction Journal Name)7-15分析反应语种(Analyze Reaction Language)7-16分析反应步数(Analyze Reaction Number of Steps)7-17分析反应产率(Analyze Reaction Product Yield 7-18分析反应出版年限(Analyze Reaction Publication Year)7-19分析反应溶剂(Analyze Reaction Solvent)7-20限定反应结果(Refine Reaction Result)7-21限定反应化学结构(Refine Reaction Structure)7-22限定反应产率(Refine Reaction Product Yield)7-23限定反应步数(Refine Reaction Number of Steps)7-23限定反应类型(Refine Reaction Classification)7-24排除反应类型 (Excluding Reaction Classification) 7-24指定反应物/试剂和产物7-25 (Define the Reactants/Reagents and Products)以官能团检索 (Search by Functional Group) 7-27组合官能团和结构检索7-30 (Search by Combination of Functional Group and Structure)返回历史检索界面(Back To The History Interface)7-31Appendix A 智能检索: SciFinder怎样去检索结构A1-A3 Appendix B CAS Registry:物质特性参考表B1-B41.进行反应的相似检索通过相似的反应中心和反应结构特性去检索一步反应的相似反应。