生物化学复习提纲2016
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生物化学复习资料第一章蛋白质的结构与功能掌握:1.蛋白质一至四级结构的概念、主要化学键2.蛋白质二级结构的基本形式,肽键、肽单元及模体(motif)、结构域概念。
3.蛋白质重要的理化性质。
熟悉:1.蛋白质的分子组成及特点;氨基酸的化学结构、分类、三字符号及理化性质;肽及多肽链的两端;谷胱甘肽。
2.蛋白质分离和纯化的方法及其原理。
第二章核酸的结构与功能掌握:1.核酸的分类、生物学功能、分子组成、化学结构特点。
2.核酸一级结构的概念及连接键。
3.DNA的碱基组成及Chargaff规则、DNA的双螺旋结构要点。
4.RNA的分类;mRNA和 tRNA的结构特点及功能;rRNA的功能。
5.DNA的变性、DNA的复性及分子杂交。
熟悉:1.核酸的一般理化性质。
2.DNA的超螺旋结构、核小体的组成。
第三章酶掌握:1.酶活性中心的概念、活性中心的必须基团。
2.酶促反应的特点。
3.影响酶的反应动力学因素、米-曼氏方程式、Km与Vm的意义、酶的最适温度、最适pH、可逆性抑制作用的概念、类型及其特点。
4.酶原概念、酶共价修饰的概念、同工酶的概念及特点。
熟悉:1.酶原激活的机理、酶的变构调节、化学修饰调节的特点。
2.酶的分子组成:全酶的组成、辅酶与辅基、金属离子的作用。
第四章糖代谢掌握:1.糖酵解的概念、细胞定位、反应过程、关键酶。
2.糖有氧氧化的概念、细胞定位、反应过程、关键酶或限速酶;3.磷酸戊糖途径的特点及生理意义;4.糖原合成与分解的定义、组织和细胞定位、关键酶和生理意义;5.糖异生的概念、原料、关键酶及生理意义6.血糖的概念、正常人空腹血糖水平、血糖的来源与去路、胰岛素降低血糖的机制、胰高血糖素升高血糖的机制熟悉:1.糖有氧氧化的ATP生成及生理意义。
2.糖原合成和分解的过程及调节;3.糖酵解的ATP生成及生理意义。
4.磷酸戊糖途径的限速酶;5.肾上腺素的调节机制。
了解:1.磷酸戊糖途径的反应过程及调节;糖酵解的调节; 糖原累积症。
生物化学复习提纲文件排版存档编号:[UYTR-OUPT28-KBNTL98-UYNN208]生物化学复习提纲第一章蛋白质化学1. 简述蛋白质的功能:①催化功能-酶②调控功能-激素、基因调控因子③贮存功能-乳、蛋、谷蛋白④转运功能-膜转运蛋白、血红/血清蛋白⑤运动功能-鞭毛、肌肉蛋白⑥结构成分-皮、毛、骨、牙、细胞骨架⑦支架作用-接头蛋白⑧防御功能-免疫球蛋白2. 蛋白质含氮量16%,凯氏定氮法;蛋白质含量 = 每克样品中含氮的克数×凯氏定氮法蛋白质与硫酸和催化剂一同加热消化,分解氨与硫酸结合。
然后碱化蒸馏使氨游离,用硼酸吸收后再以酸滴定,根据酸的消耗量乘以换算系数,即为蛋白质含量3. 酸性氨基酸,碱性氨基酸,芳香族氨基酸,亚氨基酸,含硫氨基酸,含羟基氨基酸酸性氨基酸: Asp、 Glu碱性氨基酸:Arg、Lys、His,另外还有:羟赖氨酸(Hyl)、羟脯氨酸(Hyp)、胱氨酸芳香族氨基酸:Phe、Try、Tyr亚氨基酸:Pro含硫氨基酸:Cys、Met含羟基氨基酸:Ser、Thr4. 必需氨基酸,非必需氨基酸;必需氨基酸:异亮氨酸(Iso)、亮氨酸(Leu)、赖氨酸(Lys)、蛋氨酸(Meth)、苯丙氨酸(Phe)、苏氨酸(Thre)、色氨酸(Try)和缬氨酸(Viline)非必需氨基酸:5. 手性和比旋光度的偏转方向是否有一致性;AA的手性D,L与比旋光度的偏转方向并没有一致性。
6. 具有近紫外光吸收的氨基酸;Tyr/Trp/Phe7. 氨基酸的等电点;①当溶液为某一pH值时,AA主要以兼性离子的形式存在,分子中所含的正负电荷数目正好相等,净电荷为0。
这一pH值即为AA的等电点(pI)。
②在pI时,AA在电场中既不向正极也不向负极移动,即处于两性离子状态。
8;蛋白质的一级结构;蛋白质多肽链的氨基酸排列顺序——蛋白质的一级结构9、肽键中C-N键的性质及肽平面;肽键中C-N键有部分双键性质——不能由旋转组成肽键原处于同平(肽平)10.什么是蛋白质的二级结构,常见的二级结构有哪些,它们有什么特点;⑴①指肽链的主链在空间的排列,或规则的何向、旋转及折叠。
生物化学复习提纲第一章蛋白质的结构与功能1、蛋白质的元素组成:主要有碳、氢、氧、氮、硫。
元索组成特点:各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16%。
2、蛋口质组成的基木单位:氨基酸组成人体蛋白质的20种氨基酸均屈于L・a・氨基酸(除廿氨酸外)氨基酸的三字符号:见课本P9 (了解)3 •氨基酸的理化性质①氨基酸的等屯点(pl):在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离了,呈电中性,此时溶液的pH称为该氨基酸的等电点。
大负小」1•:: pH>pI,为阴离子;pH<pI,为阳离子;pH=pI则为两性离子。
3、氨基酸的连接:氨基酸通过(肽键)连接而形成肽。
在甘氨酰丙氨酸分子中连接两个氨基酸的酰胺键称为肽键(是由…个氨基酸的a ■竣基与另一个氨基酸的a ■氨基脱水缩合而形成的酰胺键)。
由更多(大于10个)的氨基酸相连而成的肽链称为多肽链。
4、蛋口质的一级结构:在蛋口质分子中,从N■端至C•端的氨基算排列顺序称为蛋白质的一级结构。
其稳定力是:肽键、二硫键。
蛋白质的二级结构:是指蛋白质分子中的某一段肽链的局部空间结构,也就是该段肽链主链骨架原了的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。
其稳定力是:氢键。
肽单元(肽平面)参与肽键的6个原子C a 1、C、0、N、H和Ca2位于同一平面,构成了肽单元。
二级结构的主要类型包括(4个):◊a■螺旋:(特点)多肽链的主链遵循右手螺旋。
氨基酸侧链伸向螺旋外侧。
每圈含3.6个氨基酸残基,每圈高度0.54nm,氢键封闭环内含13个原子。
肽键的N・H和第4个肽键的拨基氧形成氢键,氢键的方向与螺旋长轴基本平行。
◊ B •折叠◊ B ■转角◊无规卷曲蛋白质的三级结构:是指整条肽链屮全部氨基酸残基的相对空间位置,也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置。
其稳定力是:次级键(如疏水键、盐键、氢键和Van derWaals)o蛋白质的四级结构:蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋口质的四级结构。
生物化学复习纲要生物化学复习纲要第一章绪论一、生物化学的概念及其研究内容二、生物化学领域的研究成果和进展(如遗传物质和遗传密码的确定、人类基因组计划、蛋白质组学等)第二章蛋白质化学一、20种常见氨基酸的结构、符号、分类二、氨基酸等电点的概念及其计算三、氨基酸的化学反应(主要是α-氨基参加的反应及与茚三酮反应)四、氨基酸混合物的分析分离(主要是纸层析和离子交换层析的原理)五、蛋白质各级结构的概念及其作用力。
包括肽平面的概念以及α-螺旋结构的要点、结构域的概念。
六、蛋白质一级结构序列分析(主要是N-端、C-端氨基酸残基鉴定方法、几种蛋白水解酶的作用位点)七、蛋白质性质(胶体性质、沉淀作用、变性作用和别构效应)第三章酶化学一、酶的概念及其作用特点二、酶的化学本质及其组成(全酶的作用特点)三、酶的国际系统分类四、酶活力及比活力的概念及有关计算五、酶的专一性六、米氏方程及其计算,米氏常数(Km)的概念七、可逆抑制作用的类型及其动力学曲线八、影响酶促反应速度的因素九、酶活性中心的概念十、影响酶高催化效率的有关因素十一、酶活性的调节(别构酶及其动力学曲线、共价调节酶及酶原激活的本质)第四章核酸化学一、碱基、核苷及核苷酸的结构二、DNA一级、二级结构的特点、作用力(主要是双螺旋结构)三、tRNA一级、二级、三级结构的特点四、真核生物mRNA与原核生物mRNA在结构上的区别(主要是两端)五、核酸的性质(主要是紫外吸收、变性、复性有关内容)六、DNA和RNA的区分方法第五章维生素和辅酶一、各种维生素的生理功能及其缺乏病二、B族维生素的主要辅酶形式第六章糖代谢一、糖酵解定义及反应历程和能量计算二、TCA循环的反应途径及能量计算三、磷酸戊糖途径的特点及生物学意义四、糖异生作用的概念及其关键步骤五、糖原合成及分解代谢及其关键酶第七章生物氧化一、生物氧化的定义、特点二、呼吸链的概念及其组成、产能部位三、氧化磷酸化、底物水平磷酸化、P/O比的概念四、氧化磷酸化的解偶联作用以及化学渗透假说的主要要点五、自由能变化(△G o’)的计算第八章脂代谢一、脂肪酸β-氧化的过程及能量计算二、酮体的组成三、脂肪酸的合成(原料、还原力)四、甘油磷脂的分解与合成五、胆固醇合成的原料第九章氨基酸代谢一、氨基酸脱氨基作用的方式二、以谷氨酸脱氢酶为主的联合脱氨基作用的概念及反应过程三、氨的排泄方式(主要是尿素循环途径)四、必需氨基酸的种类五、一碳单位的概念、种类及来源(哪5种氨基酸可提供一碳单位)第十章核酸代谢一、嘌呤分解代谢及其终产物二、嘌呤、嘧啶核苷酸从头合成的原料及主要路线三、脱氧核糖核苷酸的合成四、DNA半保留复制、半不连续复制的概念及过程五、DNA聚合酶的特点(大肠杆菌DNA聚合酶I、III)六、DNA连接酶催化的反应及能量来源七、DNA损伤修复的方式(主要是切除修复)八、原核生物RNA聚合酶的组成及其催化的转录过程九、启动子和终止子的概念十、真核生物RNA转录后的加工(主要是tRNA和mRNA)十一、逆转录的概念及逆转录酶的活性第十一章蛋白质的生物合成一、遗传密码及其基本特点(包括移码突变、密码子简并性等概念)二、三种核糖核酸在蛋白质生物合成中的作用三、氨基酸活化及氨酰-tRNA合成酶四、蛋白质生物合成的过程(原核生物)五、SD序列和信号肽的概念六、蛋白质生物合成中保证翻译正确性的机制七、蛋白质合成中能量消耗的计算八、蛋白质合成后的加工方式第十二章代谢调控一、代谢调控的三个水平二、代谢途径三个最关键的代谢中间物及其与有关代谢途径联系三、操纵子的概念,熟悉酶诱导和阻遏的操纵子模型作业:一、名词解释1、等电点2、肽平面3、蛋白质的二级结构4、结构域5、别构效应6、Km7、竞争性抑制作用8、酶活性中心9、同工酶10、Tm 11、Cot1/2 12、核酸杂交13、糖酵解14、糖异生作用15、生物氧化16、呼吸链17、氧化磷酸化18、P/O比19、β-氧化20、酮体21、转氨基作用22、联合脱氨基作用23、半不连续复制24、启动子25、密码子26、信号肽27、操纵子28、PCR技术P674:是指通过模拟体内DNA复制方式在体外选择性扩增DNA某个特定区域的技术,包括变性、退火、延伸三个周而复始的步骤。
生物化学基础复习提纲生物化学专业复习提纲第一章糖类本章节包括以下几个知识点1,糖的定义和分类。
2.、葡萄糖代表的单糖的分子结构、分类、重要理化性质。
3,比较三种主要双糖(蔗糖、乳糖、麦芽糖)的组成、连接键的种类及其环状结构。
4,淀粉、糖原、纤维素的组成单位和特有的颜色反应及生物学功能。
5,糖胺聚糖、糖蛋白、蛋白聚糖的定义及键的连接方式。
6,了解糖的生理功能。
,其中必须掌握的重要知识点是第1-4,糖这章很少会出现大题,不过在填空和选择中却每年都会出题,所以大家要注意一下这章中重要知识点,以填空或选择提的形式掌握。
基础阶段,复习时间是从5月份至8月份,对于上面所述的知识点要熟悉,尽量掌握,一些比较零碎的需要加强记忆的知识点,大家最好做一下总结笔记,以便在强化阶段和冲刺阶段较强理解和记忆,得到更好的复习效果。
在复习每一个知识点的过程中,首先要了解知识点,通过反复阅读教材熟悉相应知识点,通过对相应知识点的总结及对应练习题的练习加强对这些知识点的掌握。
当然,在下面的章节中,对于知识点的掌握方法也是一样的,希望大家能尽量按照我所建议的复习要求和方法去做,这样能达到事半功倍的效果。
好,下面就对糖这章的知识点进行一下讲解。
【知识点1】糖的定义和分类:定义糖类是含多羟基的醛或酮类化合物。
化学本质:大多数糖类物质只由C、H、O三种元素组成,单糖的化学本质是多羟基的醛或酮分类:根据分子的结构单元数目,糖可分为单糖、寡糖、多糖。
掌握常见的单糖、寡糖、多糖有哪些【例题1】琼脂和琼脂糖(09)A、主要成分相同,属同多糖B、主要成分不同,属同多糖C、主要成分相同,应用不能代替D、主要成分不同,应用不能代替分析:琼脂糖属于多糖,而琼脂的成分包括琼脂胶和琼脂糖,是一种半乳糖聚合物,不是多糖。
两者主要成分是相同的,两者各有应用上的特点解题:c易错点:区别琼脂和琼脂糖的概念【知识点2】以葡萄糖代表的单糖的分子结构、分类、重要理化性质。
第一章绪论(1学时)1. 生物化学的含义、任务和主要内容2. 生物化学的第一章绪论(1学时)1. 生物化学的含义、任务和主要内容2. 生物化学的发展及在各专业中的地位和作用3. 生物化学在我国的发展及与各专业的关系4. 生物化学的学习方法本章重点:1.熟悉生物化学的含义、主要内容和发展。
2.明确生物化学在各专业中的地位和作用。
建议教学方式:讲授第二章蛋白质化学(7学时)第一节蛋白质的化学概念第二节蛋白质的分类1. 根据分子形状分类2. 根据组成和溶解度分类3. 按功能分类第三节蛋白质的化学组成1. 蛋白质的元素组成2. 氨基酸第四节蛋白质的结构与功能1. 蛋白质的一级结构氨基酸基本连接方式;氨基酸排列顺序;蛋白质一级结构测定原理与方法2. 蛋白质二级结构及二级结构单元、超二级结构、结构域3. 蛋白质三级、四级结构4. 蛋白质分子中的重要化学键5. 纤维状蛋白与球状蛋白的结构与功能第五节蛋白质的重要性质胶体性质,两性解离与等电点,变性与复性,沉淀作用,紫外吸收,呈色反应第六节蛋白质结构与功能本章重点:1.蛋白质构成单位氨基酸的性质。
2.蛋白质的结构、结构与功能的关系。
3.蛋白质的重要性质。
本章难点:1.蛋白质的元素组成及其特点,及蛋白质基本组成单位—氨基酸的结构特点,分类和理化性质。
2.肽的组成及结构特点;肽,肽键,氨基酸残基,氨基末端,羧基末端等概念。
3.蛋白质分子的基本结构(一级结构)和空间结构(二级结构,三级结构,四级结构)的概念,各种结构的组成方式,特点。
4.蛋白质结构与功能的关系;蛋白质的重要性质。
建议教学方式:讲授和讨论思考题:1.如何计算氨基酸的pI?2.什么是蛋白质的一、二、三、四级结构?3.维持蛋白质空间结构的作用力有哪些?4.简述蛋白质结构与功能的关系。
第三章核酸化学(4学时)第一节核酸的种类、分布和组成第二节核酸的结构1. 核酸的一级结构2. 核酸的二、三级结构;DNA的双螺旋结构3. RNA的二、三级结构第三节核酸性质核酸的分子大小、溶解性、紫外吸收光谱、变性、降解以及分离提纯第四节核酸的生物学功能DNA和RNA与遗传信息的传递关系,核酸与蛋白质生物合成的关系,核酸结构改变与生物变异,核酸与病变,核酸及其水解产物在人类生活中的作用本章重点:1.核酸的化学组成及结构。
生物化学复习提纲一、蛋白质化学(一)蛋白质的组成和结构1、氨基酸的结构和分类20 种常见氨基酸的结构通式和特点氨基酸的分类方法(根据侧链性质)2、肽键和多肽链肽键的形成和结构特点多肽链的方向性(N 端和 C 端)3、蛋白质的一级结构定义和测定方法(如 Edman 降解法)一级结构与生物功能的关系4、蛋白质的二级结构α螺旋、β折叠、β转角和无规卷曲的结构特点和形成条件维系二级结构的化学键(氢键)5、蛋白质的三级结构定义和结构特点维系三级结构的化学键(疏水作用、离子键、氢键、范德华力等)6、蛋白质的四级结构概念和多亚基蛋白质的结构特点四级结构与功能的关系(二)蛋白质的性质1、两性解离和等电点蛋白质的两性解离性质等电点的定义和测定方法2、胶体性质蛋白质胶体稳定的原因破坏胶体稳定性的方法(如盐析)3、变性和复性变性的概念和因素(物理因素、化学因素)复性的条件和意义4、沉淀反应盐析、有机溶剂沉淀、重金属盐沉淀等方法的原理和应用5、颜色反应双缩脲反应、茚三酮反应等的原理和应用二、核酸化学(一)核酸的组成和结构1、核苷酸的组成碱基、戊糖和磷酸的结构和种类核苷酸的命名和缩写2、 DNA 的结构DNA 的双螺旋结构模型(Watson 和 Crick 模型)双螺旋结构的特点(碱基互补配对、大沟和小沟等) DNA 的三级结构(超螺旋结构)3、 RNA 的结构mRNA、tRNA、rRNA 的结构特点和功能各种 RNA 在蛋白质合成中的作用(二)核酸的性质1、紫外吸收DNA 和 RNA 的紫外吸收峰值紫外吸收在核酸定量分析中的应用2、变性和复性DNA 变性的概念和特点(增色效应)复性的条件和杂交技术的原理3、核酸的水解酸水解、碱水解和酶水解的特点和产物三、酶学(一)酶的概念和特点1、酶的定义和催化作用酶作为生物催化剂的作用原理酶与一般催化剂的异同点2、酶的特点高效性、专一性、可调节性、不稳定性等3、酶的命名和分类酶的命名方法(系统命名法和习惯命名法)酶的分类(氧化还原酶、转移酶、水解酶、裂合酶、异构酶、合成酶)(二)酶的结构与功能1、酶的活性中心活性中心的概念和组成活性中心与催化作用的关系2、酶原与酶原激活酶原的概念和生理意义酶原激活的机制和实例3、同工酶同工酶的概念和生理意义同工酶在临床上的应用(三)酶的作用机制1、降低反应的活化能活化能的概念酶降低活化能的方式2、酶的催化机制邻近效应和定向效应诱导契合学说酸碱催化、共价催化等(四)影响酶促反应速率的因素1、底物浓度米氏方程和米氏常数的意义底物浓度对反应速率的影响曲线(双曲线)2、酶浓度酶浓度与反应速率的关系3、温度温度对酶促反应速率的影响(最适温度)低温和高温对酶活性的影响4、 pHpH 对酶促反应速率的影响(最适 pH)酶的酸碱稳定性5、抑制剂不可逆抑制剂和可逆抑制剂的作用机制竞争性抑制、非竞争性抑制和反竞争性抑制的特点和动力学特征6、激活剂激活剂的种类和作用机制四、生物氧化(一)生物氧化的概念和特点1、生物氧化的定义和意义生物氧化与体外氧化的异同点2、呼吸链呼吸链的组成成分(NADHQ 还原酶、泛醌、细胞色素还原酶、细胞色素 c、细胞色素氧化酶)呼吸链的电子传递顺序和偶联机制3、 ATP 的生成氧化磷酸化的概念和机制(化学渗透学说)ATP 合酶的结构和作用机制底物水平磷酸化的概念和实例(二)生物氧化过程中能量的产生和转移1、自由能的变化和氧化还原电位自由能变化与反应方向的关系氧化还原电位的概念和测定2、高能化合物高能磷酸化合物(如 ATP、GTP 等)其他高能化合物(如硫酯键、甲硫键等)五、糖代谢(一)糖的消化和吸收1、食物中糖的种类单糖、双糖和多糖的常见类型2、糖的消化参与消化的酶(如淀粉酶、麦芽糖酶等)消化的部位和产物3、糖的吸收吸收的部位和机制(主动运输、被动扩散)(二)糖的无氧氧化1、糖酵解的过程十步反应的具体过程和酶的作用能量的产生和消耗2、糖酵解的生理意义在缺氧条件下为机体提供能量是某些组织和细胞的主要供能方式(三)糖的有氧氧化1、有氧氧化的过程三个阶段(糖酵解、丙酮酸氧化脱羧、三羧酸循环)的反应过程和酶的作用能量的产生和计算2、三羧酸循环反应过程和特点三羧酸循环的生理意义3、有氧氧化的生理意义(四)磷酸戊糖途径1、反应过程氧化阶段和非氧化阶段的反应2、生理意义生成 NADPH 和磷酸核糖(五)糖原的合成与分解1、糖原的合成合成的途径和关键酶2、糖原的分解分解的途径和关键酶3、糖原合成与分解的生理意义(六)糖异生1、糖异生的途径从丙酮酸等非糖物质合成葡萄糖的过程2、糖异生的生理意义维持血糖浓度的相对稳定补充肝糖原储备六、脂代谢(一)脂类的消化和吸收1、脂肪的消化参与消化的酶(如胰脂肪酶等)消化的产物(甘油一酯、脂肪酸等)2、脂类的吸收吸收的部位和方式(二)甘油三酯的代谢1、甘油三酯的合成合成的部位和原料合成的途径(甘油二酯途径、甘油一酯途径)2、甘油三酯的分解脂肪动员的概念和关键酶脂肪酸的β氧化过程(活化、转运、β氧化、能量产生)(三)磷脂的代谢1、磷脂的合成合成的部位和原料常见磷脂(如卵磷脂、脑磷脂等)的合成途径2、磷脂的分解参与分解的酶和产物(四)胆固醇的代谢1、胆固醇的合成合成的部位和原料合成的过程和关键酶2、胆固醇的转化转化为胆汁酸、类固醇激素等的途径七、氨基酸代谢(一)蛋白质的营养作用1、必需氨基酸和非必需氨基酸必需氨基酸的种类食物蛋白质的营养价值评价2、蛋白质的互补作用概念和意义(二)氨基酸的一般代谢1、氨基酸的脱氨基作用转氨基作用、氧化脱氨基作用、联合脱氨基作用的机制和特点体内主要的转氨酶和 L谷氨酸脱氢酶2、氨的代谢氨的来源和去路鸟氨酸循环的过程和生理意义3、α酮酸的代谢生成非必需氨基酸、转变为糖或脂肪(三)个别氨基酸的代谢1、一碳单位的代谢一碳单位的概念和种类一碳单位的载体和来源一碳单位的生理功能2、含硫氨基酸的代谢甲硫氨酸的代谢(SAM、同型半胱氨酸等)半胱氨酸的代谢(牛磺酸、谷胱甘肽等)3、芳香族氨基酸的代谢苯丙氨酸和酪氨酸的代谢(多巴胺、黑色素等)色氨酸的代谢(5-羟色胺等)八、核苷酸代谢(一)嘌呤核苷酸的代谢1、嘌呤核苷酸的合成从头合成的途径和关键酶补救合成的途径和酶2、嘌呤核苷酸的分解代谢最终产物(尿酸)痛风症的发病机制(二)嘧啶核苷酸的代谢1、嘧啶核苷酸的合成从头合成的途径和关键酶补救合成的途径和酶2、嘧啶核苷酸的分解代谢最终产物九、物质代谢的联系与调节(一)物质代谢的相互联系1、糖、脂、蛋白质代谢之间的相互联系糖可以转变为脂肪和蛋白质脂肪不能大量转变为糖和蛋白质蛋白质可以转变为糖和脂肪2、核酸与物质代谢的相互联系核酸的合成需要糖、脂、蛋白质代谢提供原料核酸的代谢产物可以参与物质代谢的调节(二)代谢调节1、细胞水平的调节酶活性的调节(变构调节、共价修饰调节)酶含量的调节(基因表达调控)2、激素水平的调节激素的分类和作用机制激素对物质代谢的调节作用3、整体水平的调节神经系统对物质代谢的调节饥饿和应激状态下物质代谢的变化。
第一章蛋白质化学名词解释氨基酸的等电点肽键结构域四级结构蛋白质等电点蛋白质变性作用蛋白质的复性二.思考题1.氨基酸的分类2.常见氨基酸种类、英文简写、一般结构特点3.蛋白质二级结构种类及特点4.维持蛋白质二级结构及三级结构的作用力5.蛋白质的紫外吸收特点第二章核酸的化学一.名词解释DNA双螺旋结构减色效应增色效应Tm DNA变性复性退火二.思考题1.嘧啶、嘌呤核苷所形成的糖苷键是怎样相连的?假尿嘧啶核苷与尿嘧啶核苷的区别?2.核酸的种类及分布,核酸的组成3.DNA的二级结构是怎样的?其稳定因素是什么?4.DNA双螺旋结构的多态性是怎样的?5.RNA的种类及作用?6.原核与真核细胞的mRNA在结构上的差异(一级结构)?7.tRNA二级结构有那些特点?其作用如何?三级结构?第三章酶学一.名词解释酶全酶多酶体系(多酶复合体)活性中心必需基团 Km 别构酶酶活力比活力同工酶二思考题1.酶作用的专一性可分为哪几类?2.酶的化学本质是什么?近年来对酶的化学本质有何新的看法(补充)?3.影响酶促反应速度的因素有哪些?4.辅助因子按其化学本质分哪两类?在酶促反应中起什么作用?5.举例说明竞争性、非竞争性、反竞争性抑制剂的动力学作用特点。
(如丙二酸,磺胺类药物等)6.诱导锲合学说的内容是什么?其解决了什么问题?7.Km有什么意义?怎样求法?影响Km值变化因素有哪些?8.国际生化协会酶学委员会将酶分为哪几类?醛缩酶、葡萄糖异构酶、谷丙转氨酶各属于第几类酶类?9.别构酶(变构酶)是否属于米氏酶?在调整细胞内各个酶促反应中有何生理学意义?维生素一.名词解释Tpp NAD+ NADP+ NADPH+H+ coASH FH4 FAD FADH2二.思考题1.FAD,FMN,NAD+,NADP+,Tpp是何种维生素的衍生物,在催化反应中起什么作用?2.泛酸、磷酸吡哆醛、生物素、四氢叶酸是哪种辅酶组成成分,这些辅酶有何作用?3.糖酵解过程中需要哪些维生素参与?4.为什么说维生素,尤其是B族维生素对机体新陈代谢很重要?5.脱羧酶、羧化酶、转氨酶的辅酶是什么?熟记书中所列的B族维生素的名称,辅酶形式及生理作用第五章糖代谢1.简述蔗糖的合成与降解途径2.简述淀粉的合成与降解途径3.糖酵解过程定义?是否需要O2,是否发生氧化还原反应?其关键酶是什么?写出关键酶催化的反应结构式。
糖类:1、单糖,寡糖,多糖,复合糖定义。
单糖:凡不能被水解为更小分子的糖。
如:核糖、葡萄糖。
寡糖:凡能被水解成少数(2—10个)单糖分子的糖。
多糖:凡能被水解成多个单糖分子的糖。
如:淀粉 n葡萄糖复合糖:与非糖物质结合的糖。
如:糖蛋白等。
衍生糖:糖的衍生物。
如:糖酸、糖胺等。
2、重要的二糖:麦芽糖,蔗糖,乳糖的基本单位以及糖苷键。
麦芽糖——葡萄糖+葡萄糖(α-1,4糖苷键)乳糖——半乳糖+葡萄糖(β-1,4糖苷键)蔗糖——葡萄糖+果糖(α,β(1→2) 糖苷键)3、重要的多糖:糖原,淀粉,纤维素的基本单位。
在重要的多糖里面淀粉的种类以及各个性质。
淀粉:1)直链淀粉:葡萄糖分子以α(1-4)糖苷键缩合而成的多糖链。
可溶于热水,250~300个糖分子,遇碘呈紫蓝色,易老化,粘度小。
2)支链淀粉:分子中除有α(1-4)糖苷键外,还在分支点处有α(1-6 )糖苷键。
每一分支有20-30个葡萄糖基,各分支卷曲成螺旋。
>6, 000个糖分子,遇碘呈紫红色,不易老化,粘度大。
糖原:α-D-葡萄糖多聚物。
同支链淀粉;区别在于分支程度更高,分支链更短平均每8-12个残基发生一次分支。
纤维素:由D-葡萄糖以β(1-4)糖苷键连接起来的线形聚合物。
4、定义:糖苷键,糖原,还原性糖糖苷键:由糖的半缩醛羟基与配糖体缩合后形成的化学键。
糖原:动物体内的储存多糖,相当于植物体内的淀粉,也称动物淀粉。
还原性糖:含有有游离半缩醛羟基的单糖或寡糖。
5、菲林反应6、糖的生物学功能作为能源作为碳源作为结构性物质细胞识别和信息传递的重要参与者。
脂类:1、脂类的定义脂肪酸与醇作用生成的酯及其衍生物,称为脂质或脂类。
2、脂类的分类(1)单脂:由各种高级脂肪酸与醇类形成的酯。
如油脂(2)复脂:除了含脂肪酸和各种醇以外,还含有其他成分的脂。
磷脂:结合磷酸糖脂:结合糖分子脂蛋白:结合蛋白分子3、脂类的生物学功能机体代谢燃料和储能形式;生物膜的重要组分(磷脂);与细胞识别、种特异性、组织免疫等密切相关;具营养、代谢及调节功能(胆固醇);保护、保温作用;4、碘值:指100g油脂卤化时所能吸收碘的克数。
生物化学复习提纲2015第一章蛋白质化学1.蛋白质、氨基酸的基本知识,名称、分类,重要的鉴定反应:氨基的反应,PITC,肽段顺序推导蛋白质的分类:简单蛋白:除氨基酸以外不含其他成分的蛋白质(清蛋白,球蛋白,谷蛋白,醇溶谷蛋白,组蛋白,精蛋白,硬蛋白)结合蛋白(conjugated protein):除由氨基酸组成蛋白质部分外,还含有非蛋白成分,这些非蛋白成分,有时称辅基(prosthetic group)或配基(核蛋白,脂蛋白,糖蛋白,磷蛋白,卟啉蛋白,黄素蛋白,金属蛋白)根据蛋白质的分子外形分类⏹球状蛋白质(globular proteins)⏹纤维状蛋白质(fibrous proteins)根据蛋白质功能分类⏹结构蛋白质(structural proteins)⏹酶蛋白(enzymes)⏹运输蛋白质(transport proteins)⏹运动蛋白质(kinesis proteins)⏹贮藏蛋白质(storage proteins)⏹防御蛋白质(defensive proteins)蛋白质的水解:酸水解:优点是不容易引起水解产物的消旋化。
缺点是色氨酸被沸酸完全破坏;含有羟基的氨基酸如丝氨酸或苏氨酸有一小部分被分解;天冬酰胺和谷氨酰胺侧链的酰胺基被水解成了羧基。
碱水解:由于水解过程中许多氨基酸都受到不同程度的破坏,产率不高。
部分的水解产物发生消旋化。
该法的优点是色氨酸在水解中不受破坏。
酶水解:应用酶水解多肽不会破坏氨基酸,也不会发生消旋化。
水解的产物为较小的肽段。
2.氨基酸、多肽的等电点计算、光吸收性质、甲醛滴定的原理氨基酸等电点:中性:对于侧链基团不解离的氨基酸有:pI = (pK1+pK2)/2酸性:pI=(pK1+pKR)/2碱性:pI=(pK R+pK2)/2多肽等电点:酸性:pI=1/2(pK’R+ pK’ -COOH)碱性:pI= pK’R+lg(等电点侧链解离数/未解离数)甲醛滴定的原理:向AA溶液中加入过量的甲醛,用标准NaOH滴定时,由于甲醛与Aa中的-NH2作用形成-NH.CH2OH -N (CH2OH)2等羟甲基衍生物而降低了氨基的碱性,相对地增强了-NH3+的酸性解离,使Pk'2减少了2-3个pH单位,NaOH滴定的曲线A向pH低的方向转移,滴定终点也移动pH9附近。
光吸收性质蛋白质在280nm处有强烈的光吸收⏹Phe、Tyr、Trp⏹Trp贡献最大3.肽键的特点,肽平面肽键的特点:(1)酰胺键:由于酰胺氮上的孤对电子与相邻羰基的共振作用,表现出高稳定性1.C-N具40%双键性质2.C=O具40%单键性质3.共振杂化体(2)亚氨基(-NH-)pH 0-14没有明显的解离和质子化倾向肽键是一个平面,称肽平面。
可以有反式顺式结构,但旋转能障高,反式稳定(Pro 例外)(3)蛋白质中的每一个氨基酸单位称氨基酸残基(residue)1.蛋白质一级结构的概念,分析方法,N-,C-末端、Edmen降解,二硫键定位等蛋白质的一级结构:蛋白质的共价结构,即蛋白质分子内部通过共价键连接而形成的结构形式分析方法,N-,C-末端:N端:(1)二硝基氟苯(DNFB or FDNB法),Sange试剂(2)丹磺酰氯(DNS)法原理:与DNFB相同优点:DNS具强烈的荧光,检测灵敏度可以达到1⨯10-9mol比DNFB法高100倍(3)苯异硫氰酸酯(PITC)法:逐个脱去。
此法的特点是能够不断重复循环,将肽链N-端氨基酸残基逐一进行标记和解离。
(4)氨肽酶法:氨肽酶:可以从多肽链的N端逐个降解氨基酸的肽链外切酶亮氨酸氨肽酶(LAP):水解以Leu为N末端的肽键速度为最大C端:肼解法,还原法.羧肽酶法二硫键定位:(1)胃蛋白酶水解(2)过甲酸打开二硫键(3)双向电泳法分析2.常见蛋白酶的水解位点,水解方式:胰蛋白酶,胰凝乳蛋白酶作用特点,内切酶,外切酶3.蛋白质二级结构:定义,α-螺旋、β-折叠的结构要点,二面角蛋白质的二级结构:是指肽链的主链在空间的排列,或规则的几何走向、旋转及折叠。
它只涉及肽链主链的构象及链内或链间形成的氢键α-螺旋:(1)肽链内每个残基Cα的成对二面角φ和ψ各自取同一数值:φ=-57°ψ=-48°(2)右手、左手螺旋。
均由L-型Aa残基构成,右手α-螺旋和左手α-螺旋不是对映体,蛋白质中α-螺旋几乎均为右手的,右手的比左手的稳定(3)每圈螺旋占3.6个AA残基,沿螺旋轴方向上升0.54nm。
肽链内形成氢键,氢键的取向几乎与轴平行,第一个氨基酸残基的酰胺基团的-C=O基与第四个氨基酸残基酰胺基团的-NH基形成氢键。
(4) α-螺旋是不对称的分子结构,具有旋光能力,天然α-helix的不对称因素引起右旋。
α-螺旋结构中重复性结构命名:第一个数字表示每圈螺旋包含的残基数,下标数字表示氢键封闭的环所包含的主链原子数,同时也可标出氢键封闭的环内的重复单位数常见的螺旋形式螺旋(n=3):非整数螺旋,蛋白质中α-螺旋结构的主要类型。
①3.613②3螺旋(n=2):一般只出现在β-转角内10螺旋(n=4): 紧缩螺旋,某些核酸结合蛋白③4.416β-折叠:(1)两条或多条几乎完全伸展的多肽链侧向聚集在一起,相邻肽链上的-NH和C =O之间形成有规则的氢键,这样的多肽构象就是β-折叠。
(2)平行式:各肽链的排列极性(N→C)是同一方向的,Φ=-119°ψ=+113°,重复周期0.65nm,常见于球状蛋白(3)反平行式:相邻肽链的极性相反,Φ=-139°ψ=+135°重复周期0.70nm,常见于纤维状蛋白(4)所有的肽键都参与链间氢键的交联,氢键与肽链的长轴接近垂直。
多肽主链为据齿状折叠构象,侧链的Cα-Cβ键几乎垂直于折叠片平面,侧链R 基交替地分布在片层平面的两侧二面角:Φ角--绕C-N1键旋转的角度,Ψ角--绕Cα-C2键旋转的角度 ,每一对αΦ、Ψ 称肽平面的二面角.4.蛋白质三级结构:定义,稳定因素、超二级结构,结构域,胶原蛋白结构蛋白质的三级结构:是指在二级结构基础上,肽链的不同区段的侧链基团相互作用在空间进一步盘绕、折叠形成的包括主链和侧链构象在内的特征三维结构蛋白质表现完整生物活性的最低构象要求,即只有具有了完整的三级结构,才能表现出蛋白质的生物活性稳定因素:氢键、疏水键、离子键和范德华力等。
疏水键,在蛋白质三级结构中起着重要作用超二级结构:在蛋白质中,特别是球状蛋白质中,若干相邻的二级结构单元组合在一起。
彼此相互作用,形成有规则,在空间上能辨认的二级结构组合体充当三级结构的构体,称为超二级结构。
在结构的组织层次上高于二级结构,但没有构成完整的结构域① αα型② βαβ型③ βββ型胶原蛋白结构:胶原蛋白在体内以胶原纤维的形式存在。
其基本组成单位是原胶原蛋白分子胶原蛋白的二级结构是由三条肽链组成的三股螺旋,这是一种右手超螺旋结构。
螺距为8.6nm,每圈每股包含30个残基。
其中每一股螺旋又是一种特殊的左手螺旋,螺距为0.95nm,每一螺圈含3.3个残基,每一残基沿轴向的距离为0.29nm5.蛋白质四级结构:定义,稳定因素、别构效应, 红细胞携氧机制,意义蛋白质的四级结构:是指由多条各自具有一、二、三级结构的肽链通过非共价键连接起来的结构形式由多个亚基聚集而成的蛋白质常常称为寡聚蛋白稳定因素:亚基间的疏水作用别构效应:指蛋白质与配基结合改变蛋白质的构象,进而改变蛋白质的生物活性的现象别构蛋白质(allosteric protein):具有别构效应的蛋白质,多为寡聚蛋白,包括活性部位和调节部位红细胞携氧机制,意义:血红蛋白的结构与功能①组成:4个亚基组成,成年人红细胞由α、β两种亚基各两条构成每条肽链都卷曲成球状,都有一个空隙容纳一个血红素,它们都能与氧气结合。
以α2β2四聚体形式存在一分子Hb能与4分子氧气结合②分析Hb与氧气结合,发现Hb的4个亚基和4个氧气结合时平衡常数(Keq)并不相同。
而是有4个不同的平衡常数,Hb与最后一个氧气结合时其结合力最大Hb与氧气结合将影响其四级结构,即亚基与亚基之间的相对位置发生变动,这种变化增强了Hb和O2的亲和力6.蛋白质的化学性质,光吸收、颜色反应、双缩脲反应,变性、复性蛋白质的化学性质:胶体性质,酸碱性质蛋白质胶体溶液的稳定性与它的分子量大小、所带的电荷和水化作用有关颜色反应:① 双缩脲反应:与CuSO4碱性溶液反应,生成紫红色或蓝紫色的复合物,540nm 处有最大光吸收② 米伦反应,乙醛酸反应,坂口反应,酚试剂光吸收: 蛋白质在280nm处有强烈的光吸收Phe、Tyr、Trp,Trp贡献最大变性沉淀因素:⏹高温⏹强酸碱⏹重金属盐⏹有机试剂:溶剂、脲、胍、生物碱⏹去垢剂:SDS(十二烷基磺酸钠)7.蛋白质的分离纯化和鉴定:一般过程、常用方法,差速离心(单位)、密度梯度离心、SDS-PAGE,层析分离原理,分子排阻层析、亲和层析,蛋白质组学。
蛋白质分离提纯的得率、纯化倍数等的计算一般过程:(1)前处理(分离组织--破碎细胞---去其他组分)常用方法(①超声粉碎,②微研磨,③酶消化④超速离心)注意问题:保持蛋白质的完整和活性(2)粗分级常用方法:盐析法、等电沉淀、有机溶剂(3)细分级(进一步提纯)常用方法:层析、电泳(4)结晶蛋白质分离纯化常用技术:1,沉降分离:蛋白质分子量、形状的不同会产生密度和沉降速度的差异①差速离心(单位):利用蛋白质分子在离心力场的作用下沉降速度的差异分离不同蛋白质单位离心力场下,物质的沉降速度与分子量和分子形状有关,在生物化学中常用沉降系数表征分子量沉降系数定义:单位离心力场下的沉降速度(1-vp)为浮力因子f:摩擦系数Svedberg单位:10-13秒,S②密度梯度离心:利用物质在密度与其相同的溶液中不会沉降的特点区分不同密度的物质2,层析、色谱① 分配层析:一般原理:利用待分离物质在流动相和固定相中分配系数的不同,使物质间出现移动速度的差异,从而区分不同的物质常用方式:分配柱层析, 滤纸层析. 薄层层析, 离子交换层析, 气相色谱离子交换层析原理:利用不同离子在不同的pH下与固定相结合强度的差异,使待分离的物质在特定条件下与固定相中的同型离子发生交换,而与固定相结合,从而区分不同物质洗脱方式::①分段洗脱②梯度洗脱分子排阻层析:原理:利用具有不同孔径的多孔网状结构的凝胶珠作为分离介质,小分子由于扩散作用进入凝胶颗粒内部而被滞留;大分子被排阻在凝胶颗粒外面,在颗粒之间迅速通过。
又称凝胶过滤、分子筛亲和层析:原理:利用待分离蛋白质与固定相中相应配体的特异性结合,将目标蛋白质与其他物质分开一般步骤⏹制备交联有配体的层析柱⏹蛋白质上样,平衡⏹杂质洗脱⏹可溶性配体洗脱目标蛋白质3.电泳⏹①SDS-PAGE:用聚丙烯酰胺凝胶作为支持物,可以将凝胶分别作成浓缩胶和分离胶两部分.⏹浓缩胶一般孔径较大,pH6.8,分离胶一般孔径较小,pH8.8⏹样本加入SDS(十二烷基磺酸钠)、巯基乙醇、尿素处理,使蛋白质分子带上均匀的负电荷,分子形状变为一致的杆状分子,消除电荷差异和分子形态差异的影响。