RNA凝胶电泳步骤及注意事项
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rna跑胶讲解
【原创版】
目录
1.RNA 跑胶的概念和原理
2.RNA 跑胶的实验步骤
3.RNA 跑胶的应用和优势
正文
RNA 跑胶,全称为 RNA 聚丙烯酰胺凝胶电泳,是一种常用的 RNA 分离和检测技术。
其原理是利用 RNA 在不同浓度的聚丙烯酰胺凝胶中的迁移速率不同,从而实现对 RNA 的分离和检测。
RNA 跑胶的实验步骤主要包括以下几个步骤:
1.RNA 提取:从生物组织或细胞中提取 RNA,一般使用试剂盒进行提取。
2.RNA 浓度测定:使用比色法或定量 PCR 等方法测定 RNA 的浓度。
3.RNA 跑胶:将 RNA 样品与载 RNA 的缓冲液混合,然后加入聚丙烯酰胺凝胶中,进行电泳。
4.胶片处理:电泳结束后,将胶片进行染色和清洗,然后进行拍照和分析。
RNA 跑胶的应用非常广泛,包括基因表达分析、RNA 结构分析、RNA 功能研究等。
其优势在于可以快速、准确地分离和检测 RNA,而且操作简单,成本较低。
第1页共1页。
琼脂糖凝胶电泳的主要操作步骤哎呀,说到琼脂糖凝胶电泳,这可是实验室里的老朋友了。
每次做DNA 或者RNA的实验,都得和它打交道。
这玩意儿,虽然看起来简单,但操作起来还是得细心点,不然一不小心,你的DNA或者RNA就可能“跑”得乱七八糟的。
好了,不啰嗦了,咱们直接进入正题,聊聊琼脂糖凝胶电泳的主要操作步骤。
首先,得准备琼脂糖。
这玩意儿就像果冻一样,但是它是用在实验室里的。
你得按照一定的比例,把琼脂糖粉末和TAE或者TBE缓冲液混合起来,然后加热到沸腾,让琼脂糖完全溶解。
记得,加热的时候要不停地搅拌,不然琼脂糖会粘在烧杯底部。
接下来,等琼脂糖稍微冷却一点,但还没凝固的时候,加入一点染色剂,比如乙酰胺基苯甲酰胺(EB),这玩意儿能让DNA在紫外光下发光,方便我们观察。
然后,把混合好的琼脂糖倒入模具里,记得在模具的一角留个孔,等会儿用来插梳子。
等琼脂糖凝固了,就可以把梳子插进去了,这样就能形成样品孔。
梳子要轻轻插,别太用力,不然琼脂糖就裂了。
然后,就是准备样品了。
你得把你的DNA或者RNA样品和加载缓冲液混合,加载缓冲液可以让样品在电泳过程中更稳定。
混合好后,就可以把样品加到样品孔里了。
接下来,就是把凝胶放到电泳槽里,加入足够的TAE或者TBE缓冲液,确保凝胶完全浸没在缓冲液中。
然后,就可以接通电源,开始电泳了。
记得,正负极别接反了,不然DNA或者RNA就往回跑了。
电泳的时间和电压得根据你的样品和凝胶的大小来调整,这个就得靠经验了。
最后,等电泳完成后,就可以关掉电源,把凝胶拿出来,放到紫外光下观察了。
这时候,你就能看到你辛辛苦苦分离的DNA或者RNA条带了。
好了,琼脂糖凝胶电泳的主要操作步骤大概就是这样。
虽然听起来有点复杂,但只要你细心点,多做几次,就会越来越熟练的。
毕竟,熟能生巧嘛。
希望这些信息对你有所帮助,祝你在实验室里一切顺利!。
mrna 凝胶电泳介绍mrna凝胶电泳是一种用于分离和分析RNA(核糖核酸)的常用实验技术。
在这个过程中,RNA样本被加入到聚丙烯酰胺凝胶中,并在电场中进行迁移。
凝胶电泳的原理是基于RNA的大小和电荷来进行分离,从而让我们能够对RNA进行定性和定量分析。
凝胶电泳的原理凝胶电泳的原理是基于RNA的分子大小和形状来进行分离。
RNA在凝胶中迁移的速度取决于其大小和电荷。
在mrna凝胶电泳中,常用的凝胶有琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶。
琼脂糖凝胶适用于分离大分子RNA(如rRNA),而聚丙烯酰胺凝胶适用于分离小分子RNA(如mrna)。
凝胶电泳需要通过外加电场来使RNA迁移。
电场的方向决定了RNA的迁移方向,正极方向会使带负电荷的RNA向阳极迁移,负极方向会使带正电荷的RNA向阴极迁移。
通常,电场也被设置为水平移动,以确保凝胶上的RNA沿着水平方向均匀迁移。
凝胶电泳的步骤1. 样品制备首先,需要从细胞或组织中提取RNA。
RNA提取方法可能因实验目的而有所不同,但通常包括破碎细胞壁、溶解RNA和去除DNA和蛋白质。
2. 凝胶制备准备琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶。
琼脂糖凝胶通常由琼脂糖和缓冲溶液混合制成。
聚丙烯酰胺凝胶通常需要通过聚合反应形成。
3. 样品加载将样品与RNA加载缓冲液混合,以在凝胶上加载样品。
加载缓冲液通常包含一些染料,如溴化乙锭,以便在凝胶上可视化RNA带。
样品和加载缓冲液混合后,将其加载到凝胶槽中。
4. 电泳将凝胶放入电泳槽中,向槽中加入适当的缓冲液,并连接电源。
打开电源,根据实验的需要设定适当的电压和时间。
5. 可视化和分析电泳结束后,将凝胶从槽中取出,用一些染料(如溴化乙锭)染色。
然后,使用UV台或其他光源观察凝胶上的RNA带,并使用分子量标准品作为参考,确定RNA样本的大小。
凝胶电泳的应用mrna凝胶电泳在生物医学研究中有广泛的应用。
以下是几个常见的应用领域:1.基因表达研究:通过分析mrna的表达模式,可以研究基因在不同条件下的表达水平,从而了解基因功能和调控机制。
琼脂糖凝胶电泳检测RNA质量二.材料与方法1 材料RNA样品2 仪器、用具电泳仪、电泳槽、凝胶样品梳、微波炉、移液器等3 试剂(1) 1×TAE 电泳缓冲液(2) 溴化乙锭溶液(EB)[有毒,小心操作](3) 琼脂糖(4) 6×加样缓冲液4 方法(1) 选择孔径大小适合的点样梳,垂直架在胶版的一端,使点样梳底部离电泳槽水平面的距离为0.5-1mm。
(2) 称取0.25g琼脂糖,加入25ml 1×TAE电泳缓冲液中,微波炉加热使琼脂糖溶解均匀。
(3) 于50ml的离心管中加入1.25μl EB (10mg/ml)。
(4) 待凝胶冷却至50℃左右,将凝胶倒入50ml离心管中。
(5) 将离心管中的凝胶溶液轻轻倒入电泳凝胶板上,除去气泡。
(6) 待凝胶凝固后,小心取出点样梳。
(7) 在电泳槽中加入1×TAE 电泳缓冲液,将胶板放入电泳槽中(点样孔一端靠近电泳槽的负极),使电泳缓冲液没过胶面。
(8) 待测样品中加入1/6体积的6×上样缓冲液,混合后,移液枪点样,记录样品点样顺序及样量。
(9) 连接电泳槽与电泳仪之间的电源线,正极为红色,负极为黑色。
(10) 开启电源,开始电泳,最高电压不超过5V/cm。
(11) 当指示剂跑过胶板的2/3,可终止电泳;切断电源后,将电泳凝胶块放在凝胶成像仪中观察,拍照。
电泳检测:1%琼脂糖凝胶电泳,检测RNA完整性,观察18s、28s条带。
这里,RNA电泳要特别注意胶的浓度和质量。
首先,浓度不宜过高,1%-1.2%为宜。
其次,每次配胶不宜过多,最好现用现配,但是一次配100ml,3-5次可用完也可。
溶胶时一定要溶解彻底并且均匀,否则倒胶时产生气泡,影响电泳效果。
晾胶时,要以稍高于体温为佳,温度过高会导致胶体过软,给点样造成困难。
倒胶时,注意胶的厚度,原则是宁厚勿薄,胶板过薄点样孔盛放不下点样量,样品溢出导致弥散。
胶板如果很厚,一般要晾置20分钟以上,否则胶体晾置不彻底,拔掉梳子会破坏点样孔,同时胶体密度也会变得不均一,影响电泳效果。
琼脂糖凝胶电泳一、步骤:1、制胶(1%):将加入30ml 1×TAE缓冲液和0.6g琼脂糖的三角瓶在微波炉加热至沸腾,摇匀至无颗粒。
2、倒胶:先插梳子,再倒胶。
胶冷却至60℃左右(不烫手)加染料后(胶-GelRed:1ml-1ul或30ml胶+3ulGelRed)缓缓倒入电泳槽(先胶布封口,放好梳子),待胶凝固后取出梳子。
3、加样:1µl RNA + 2µl loading buffer混匀。
(点样孔置负极端即黑对黑,红对红)。
4、电泳:稳压条件下120V电泳,待溴酚蓝移动至接近胶前沿(约1cm)时停止电泳(约25min)。
5、观察结果:紫外分析仪上254nm观察,DNA存在处显亮绿色荧光条带,观察酶切后与未酶切质粒的DNA带位置,拍照。
二、注意事项:1、凝胶制备过程中,溶解的凝胶应及时倒入板中,避免倒入前凝固结块。
倒入板中的凝胶应避免出现气泡,影响电泳结果。
2、巨大的DNA链用普通电泳可能跑不出胶孔导致缺带。
高浓度的胶可能使分子大小相近的DNA带不易分辨,造成条带缺失现象。
3、电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲性能下降,可能使DNA电泳产生条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。
4、如果电泳时电压和温度过高,可能导致出现条带模糊和不规则的DNA带迁移的现象。
特别是电压太大可能导致小片段跑出胶而出现缺带现象。
5、变性的DNA样品可能导致条带模糊和缺失,也可能出现不规则的DNA条带迁移。
在上样前不要对DNA样品加热,用20mM NaCl缓冲液稀释可以防止DNA变性。
6、太多的DNA上样量可能导致DNA带型模糊,而太小的DNA上样量则导致带信号弱甚至缺失。
琼脂糖凝胶电泳(一)材料(二)试剂1、1*TAE2、EB溶液:100mL水中加入1g溴化乙啶,磁力搅拌数小时以确保其完全溶解,分装,室温避光保存。
3、DNA加样缓冲液:0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青,50%甘油(w/v)。
4、RNA甲醛变性胶上样缓冲液:0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯青,1mM EDTA(PH8.0),50%甘油(w/v),用DEPC水配制,高压灭菌备用。
常使用,深黄色应弃用。
波炉中将琼脂糖融化均匀。
在加热过程中要不时摇动,使附于瓶壁上的琼脂糖颗粒进入溶液;加热时应盖上封口膜,以减少水份蒸发。
胶槽底面保持1mm左右的间隙,待胶溶液冷却至50℃左右时,加入最终浓度溶液浸泡染色15分钟),摇匀,轻轻倒入电泳制胶板上,除掉气泡;待凝胶冷缓冲液液面刚高出琼脂糖凝胶面;3.加样:点样板或薄膜上混合DNA样品和上样缓冲液,上样缓冲液的最终稀释倍数应不小于1X。
用10 μL微量移液器分别将样品加入胶板的样品小槽内,每加完一个样品,应更换一个加样头,以防污染,加样时勿碰坏样品孔周围的凝胶面。
(注意:加样前要先记下加样的顺序和点样量)。
4.电泳:加样后的凝胶板立即通电进行电泳,DNA的迁移速度与电压成正比,最高电压不超过5V/cm。
当琼脂糖浓度低于0.5%,电泳温度不能太高。
样品由围降低。
当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约1cm处时,停止电泳。
5.观察和拍照:电泳完毕,取出凝胶。
在波长为254nm的紫外灯下观察染色条带。
于凝胶成像系统中拍照并保存之。
(二)在含有甲醛的凝胶上进行的RNA电泳(选做)配制23 mL甲醛电泳胶:0.336g琼脂糖溶于20mL DEPC水中,冷却至60?C,加入5mL的5x甲醛变性胶电泳缓冲液和5.5mL的甲醛,在通风橱内倒胶,冷却30分钟后使用。
甲醛变性胶RNA样品的制备:1μL RNA,5?甲醛变性胶电泳缓冲液0.5μL,甲的EB。
步骤:4.小心地进行点样,记录样品次序与点样量;然后开始电泳,电压为3-4V/cm。
rna跑胶讲解摘要:1.RNA 跑胶简介2.RNA 跑胶的实验原理3.RNA 跑胶实验操作步骤4.RNA 跑胶结果分析5.RNA 跑胶在生物学研究中的应用正文:RNA 跑胶是一种在凝胶电泳中分离和检测RNA 分子的实验技术。
通过RNA 跑胶,我们可以对RNA 分子进行定性和定量分析,了解其在细胞或组织中的表达情况。
RNA 跑胶广泛应用于生物学研究,包括基因表达谱分析、转录本鉴定、RNA 编辑研究等。
实验原理:RNA 跑胶基于RNA 分子在聚丙烯酰胺凝胶中的电泳行为。
RNA 分子在聚丙烯酰胺凝胶中的迁移速率与其分子大小和所带电荷有关。
通过不同浓度的聚丙烯酰胺凝胶进行电泳,可以将RNA 分子按大小分开。
染色后,可以观察到不同大小和颜色的RNA 带。
实验操作步骤:1.RNA 提取:从细胞或组织中提取总RNA。
2.RNA 分离:利用酒精沉淀或离心方法,将RNA 与蛋白质和其他杂质分离。
3.RNA 电泳:将RNA 样品加到聚丙烯酰胺凝胶中,进行电泳。
4.凝胶染色:将电泳后的凝胶放入染色液中,用荧光染料或银染料染色。
5.结果观察:在紫外灯下观察凝胶,记录RNA 带的位置和颜色。
RNA 跑胶结果分析:通过观察凝胶上的RNA 带,可以了解RNA 分子的相对分子质量和表达水平。
通常,RNA 带越粗,表示该RNA 分子在样品中的含量越高。
通过比较不同样本之间的RNA 带,可以分析基因在不同条件下的表达差异。
在生物学研究中,RNA 跑胶技术可以帮助我们揭示基因表达调控的机制,研究生物过程和疾病发生发展的分子机制。
此外,RNA 跑胶还可以与其他实验技术相结合,如实时荧光定量PCR(qPCR)和高通量测序技术,以提高实验的准确性和通量。
总之,RNA 跑胶作为一种重要的实验技术,在生物学研究中发挥着重要作用。
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mrna琼脂凝胶电泳
mRNA琼脂糖凝胶电泳是一种常用的实验技术,用于分离和
检测mRNA分子。
mRNA是一种被转录出来的RNA分子,包含了从DNA中编
码信息以合成蛋白质的遗传信息。
mRNA琼脂糖凝胶电泳可
以将mRNA分子按照大小进行分离,以便研究其转录水平、
表达模式以及其他特征。
实验过程中,首先需要从细胞或组织中提取总RNA。
总RNA
中含有mRNA、rRNA和tRNA等多种RNA分子。
为了选取mRNA分子,可以利用oligo(dT)寡核苷酸的亲和性选择,使
其选择性地结合到mRNA的多聚A尾部上。
接下来,将提取得到的mRNA样品加入琼脂糖凝胶电泳片中。
琼脂糖凝胶电泳片是一种具有不同孔隙大小的糖凝胶材料,可以使RNA分子根据其大小而在凝胶中移动。
在电泳过程中,电流通过琼脂糖凝胶,使RNA分子向正极方
向移动。
由于不同大小的RNA分子在凝胶孔隙中的阻碍程度
不同,因此会产生不同的迁移速度。
较小的mRNA分子会快
速迁移,而较大的rRNA和tRNA分子迁移速度较慢。
电泳结束后,通过染色或探针杂交等方法可以可视化和检测琼脂糖凝胶上的RNA分子。
常用的染色方法有Ethidium Bromide染色和Silver染色。
通过mRNA琼脂糖凝胶电泳可以得到关于mRNA的一些重要信息,如转录水平的相对量、表达模式的差异以及特定mRNA的大小等。
这些信息对于理解基因调控、生物学过程的研究以及诊断疾病等方面具有重要意义。
实验原理RNA电泳可以在变性及非变性两种条件下进行。
非变性电泳使用1.0%--1.4%的凝胶,不同的RNA条带也能分开,但无法判断其分子量。
只有在完全变性的条件下,RNA的泳动率才与分子量的对数呈线性关系。
因此要测定RNA分子量时,一定要用变性凝胶。
在需快速检测所提总RNA样品完整性时,配制普通的1%琼脂糖凝胶即可实验材料、器具及药品蘑菇的总RNA溶液。
电泳仪,电泳槽,电子天平,移液器,枪头,微波炉,紫外透射检测仪等。
琼脂糖,1XTAE电泳缓冲液,0.5μg/ml溴化乙锭(EB)10X载样缓冲液。
实验步骤(1)用1×TAE电泳缓冲液制作琼脂糖凝胶,加1×TAE电泳缓冲液至液面覆盖凝胶。
(2)在超净工作台上,用移液器吸取总RNA样品4μl于封口膜上。
在实验台上再加入5μl 1×TAE电泳缓冲液及1μl 的10X载样缓冲液,混匀后,小心加入点样孔。
(3)打开电源开关,调节电压至100V,使RNA由负极向正极电泳,约30min后将凝胶放入EB染液中染色5min,用清水稍微漂洗。
在紫外透射检测仪上观察RNA电泳结果。
RNA的变性琼脂糖凝胶检测试剂:(1)MOPS缓冲液(10*):0.4mol/L 吗啉代丙烷磺酸(MOPS)(Ph7.0),0.1mol/L Na Ac, 10mol/L EDTA。
(2)上样染料:50%甘油,1mmol/L EDTA ,0.4%溴酚蓝,0.4%二甲苯蓝。
(3)甲醛。
(4)去离子甲酰胺。
(5)电泳槽清洗:去污剂洗干净(一般浸泡过夜)——水冲洗——乙醇干燥——3%H2O2灌满——室温放置10分钟——0.1%DEPC水冲洗。
操作:(1)将制胶用具用70%乙醇冲冼一遍,晾干备用。
(2)配制琼脂糖凝胶。
①称取0.5g琼脂糖,置干净的100ml 锥形瓶中,加入40ml蒸馏水,微波炉内加热使琼脂糖彻底溶化均匀。
②待胶凉至60--70 ℃,依次向其中加入9ml 甲醛、5ml 10X MOPS缓冲液和0.5ul 溴化乙锭,混合均匀。
RNA电泳
试剂:
琼脂糖(Agarose)、甲醛、甲酰胺、MOPS、EDTA、DEPC水。
步骤
一5 x MOPS-EDTA Buffer的配制(0.1 M MOPS pH7;5mM EDTA;10mM NaAc)
1.称量20.9g的MOPS,置于1L烧杯中。
2.加700mL DEPC水溶解。
3.用2N NaOH调节pH至7.0
4.在上述溶液中加入10mL的1M的NaAC
5.溶液中加入10mL的0.5M的EDTA pH=8.0
6.加DEPC水定容至1L
7.用0.45um滤膜过滤后避光保存
二RNA样品处理方法
混合均匀后,70°C加热5min,迅速冷却至室温。
(PCR仪操作)
三甲醛变性琼脂糖凝胶的制备
加1g琼脂糖到31mL DEPC水中,另加10mL 5 x MOPS-EDTA Buffer煮沸溶解。
加入DEPC 水定容至41mL。
将溶液冷却至60°C左右,加入9mL 37%甲醛,倒入胶槽中静置1小时。
(胶中加入EB染料)
四电泳
混匀电泳槽中的1 x MOPS-EDTA Buffer电泳液,加样,10v/cm条件下电泳约1小时。
电泳期间每隔15min混匀电泳槽中的电泳液一次。
� RNA 琼脂糖凝胶电泳:配制:1. 0.5M EDTA(pH=8.0 :100ml :称取 18.61g Na 2EDTA ·2H 2O (分子量 372.24 ,加 80ml ddH 2O 剧烈搅拌, 用 NaOH 调节 PH 值至 8.0(约需 2g NaOH . 高压灭菌,室温保存。
2. 50×TAEloading buffer:(Tris acetate-EDTA buffer 电泳缓冲液组分:2MTris-乙酸;100mM EDTA(pH=8.0500mL:称 121.1g Trisbase(分子量 121.14 ,加 800ml ddH 2O 溶解,加 57.1ml 乙酸和 50ml 0.5M EDTA 溶液(pH=8.0 ,搅拌, ddH 2O 定容至 500mL . 室温保存。
3. 1×TAEloading buffer:取 20ml 50×TAE, ddH 2O 定容至 1L. 室温保存。
4. 100×Sybergreen :500ul :取 495ul 1×TAE于 1.5ml 离心管,加入 5ul Sybergreen 原液混匀,4℃锡纸避光保存。
注意:Sybergreen 原液需稀释 10000倍;6×DNAloading buffer 上样缓冲液需稀释六倍,最终稀释倍数应不小于 1×。
步骤:1. 制备 1%琼脂糖凝胶 (大胶用 70ml, 小胶用 50ml ,我们用 30ml:称 0.3g 琼脂糖置于 100ml 锥形瓶中,加入 30ml 1×TAE ,瓶口倒扣小烧杯。
微波炉加热煮沸 3次,至琼脂糖全部融化,摇匀,即成 1.0%琼脂糖凝胶液。
2. 胶板制备 :取电泳槽内的有机玻璃内槽 (制胶槽洗干净 , 晾干 , 放入制胶玻璃板 . 取透明胶带将玻璃板与内槽两端边缘封好 , 形成模子 . 将内槽置于水平位置 , 并放好梳子 .将冷却到 65℃左右的琼脂糖凝胶液混匀小心地倒入内槽玻璃板上 , 使胶液缓慢展开 , 直到整个玻璃板表面形成均匀胶层 . 室温下静置直至凝胶完全凝固 , 垂直轻拔梳子 , 取下胶带 , 将凝胶及内槽放入电泳槽中 . 添加 1×TAE 电泳缓冲液至没过胶板为止 . 3. 加样 :样品制备:(10ul 体系 /样品槽于 0.25ml 离心管中样品 RNA (最后加 :2ul /3ul/5ul6×DNA loading buffer:10/6=1.7ul100×Sybergreen :0.1ulDEPC 水:至 10ul(注意 :加样前要先记下加样的顺序 . 分别将样品加入胶板的样品小槽内 , 每加完一个样品 , 应更换一个枪头 , 以防污染 , 加样时勿碰坏样品孔周围的凝胶面 .4. 电泳 :加样后的凝胶板立即通电进行电泳 , 电压 60-100V , 样品由负极 (黑色向正极(红色方向移动 . 电压升高 , 琼脂糖凝胶的有效分离范围降低 . 当溴酚蓝移动到距离胶板下沿约 1cm 处时 , 停止电泳 .5. 电泳完毕后 , 取出凝胶 , 利用科 212凝胶成像系统 , 在紫外灯(trans UV 下观察拍照保存 .DNA 存在则显示出红色荧光条带 . RNA 完美提出应该是三条带:28, 18, 5.8。
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实验原理RNA电泳可以在变性及非变性两种条件下进行.非变性电泳使用1。
0%--1。
4%的凝胶,不同的RNA条带也能分开,但无法判断其分子量。
只有在完全变性的条件下,RNA的泳动率才与分子量的对数呈线性关系。
因此要测定RNA分子量时,一定要用变性凝胶。
在需快速检测所提总RNA样品完整性时,配制普通的1%琼脂糖凝胶即可实验材料、器具及药品蘑菇的总RNA溶液. 电泳仪,电泳槽,电子天平,移液器,枪头,微波炉,紫外透射检测仪等。
琼脂糖,1XTAE电泳缓冲液,0。
5μg/ml溴化乙锭(EB)10X载样缓冲液。
实验步骤(1)用1×TAE电泳缓冲液制作琼脂糖凝胶,加1×TAE电泳缓冲液至液面覆盖凝胶。
(2)在超净工作台上,用移液器吸取总RNA样品4μl于封口膜上。
在实验台上再加入5μl1×TAE电泳缓冲液及1μl 的10X载样缓冲液,混匀后,小心加入点样孔。
(3)打开电源开关,调节电压至100V,使RNA由负极向正极电泳,约30min后将凝胶放入EB染液中染色5min,用清水稍微漂洗.在紫外透射检测仪上观察RNA电泳结果。
RNA的变性琼脂糖凝胶检测试剂:(1)MOPS缓冲液(10*):0。
4mol/L 吗啉代丙烷磺酸(MOPS) (Ph7。
0),0。
1mol/L NaAc,10mol/L EDTA。
(2)上样染料:50%甘油,1mmol/L EDTA,0.4%溴酚蓝,0。
4%二甲苯蓝.(3)甲醛.(4)去离子甲酰胺。
RNA抽提到电泳步骤RNA抽提是一种常用的实验方法,用于从细胞或组织中提取RNA分子。
RNA抽提的步骤通常包括样本的收集、细胞破碎、RNA溶解和纯化。
在RNA溶解和纯化的步骤中,常常使用电泳方法来检测和分离RNA分子。
下面将详细介绍RNA抽提到电泳的步骤。
1.样本收集:收集需要提取RNA的样本,可以是细胞、组织或其他生物材料。
收集样本时应注意避免RNA的降解,最好在液氮中快速冷冻样本。
2.细胞破碎:将样本中的细胞破碎以释放RNA。
破碎方法可以是机械破碎或化学破碎。
机械破碎可以通过高压均质器、超声波或玻璃珠破碎器等方式进行。
化学破碎则是利用化学试剂解离细胞膜。
3. RNA溶解:将破碎的细胞溶解以释放RNA。
常用的方法是使用三氯醋酸(Trizol)试剂。
将细胞破碎物与Trizol混合,经离心后,RNA会溶解于上清液中。
4.RNA纯化:从溶解的细胞破碎物中纯化RNA分子。
RNA纯化的方法有很多种,常用的包括酚-氯仿萃取和柱层析法等。
5.RNA电泳:将纯化后的RNA样品进行电泳分析。
RNA电泳主要是通过凝胶电泳的原理进行分离和检测RNA分子。
- 准备电泳凝胶:通常使用琼脂糖凝胶,如琼脂糖琼脂糖凝胶(agarose gel)或聚丙烯酰胺凝胶(polyacrylamide gel)。
根据需要选择不同的分辨率和分离范围。
- 加载RNA样品:将纯化的RNA样品与一定体积的缓冲液混合,如甘氨酸-EDTA(glycine-EDTA)缓冲液或Tris-EDTA(TE)缓冲液。
将样品加载到凝胶上的样品孔或井中。
-电泳运行:将装有RNA样品的凝胶安装在电泳槽中,并加入足够的缓冲液使之能够浸没整个凝胶。
连接电源进行电泳运行。
电泳条件包括电流大小、电场强度和运行时间等。
-可视化:电泳运行完成后,需要对凝胶进行染色或标记,以便于可视化和分析RNA分子的迁移情况。
常见的染色方法包括乙溴化乙锭染色和银染色法。
-分析和定量:通过比较RNA分子在凝胶上的迁移距离,可以初步了解RNA的大小和相对浓度。
RNA凝胶电泳步骤及注意事项
1%的RNA琼脂糖凝胶电泳可以用来检测RNA的完整性,本实验的主要目的是熟悉植物总RNA非变性胶电泳
操作原理和操作方法与步骤。
一、实验目的
掌握植物总RNA非变性胶电泳的原理和方法。
二、实验原理
RNA电泳可以在变性及非变性两种条件下进行。
非变性电泳使用1.0%--1.4%的凝胶,不同的RNA条带也
能分开,但无法判断其分子量。
只有在完全变性的条件下,RNA的泳动率才与分子量的对数呈线性关系。
因
此要测定RNA分子量时,一定要用变性凝胶。
在需快速检测所提总RNA样品完整性时,配制普通的1%琼脂
糖凝胶即可。
三、实验材料、器具及药品
蘑菇的总RNA溶液。
电泳仪,电泳槽,电子天平,移液器,枪头,微波炉,紫外透射检测仪等。
琼脂糖,
1XTAE电泳缓冲液,0.5μg/ml溴化乙锭(EB)10X载样缓冲液。
四、实验步骤
(1)用1×TAE电泳缓冲液制作琼脂糖凝胶,加1×TAE电泳缓冲液至液面覆盖凝胶。
(2)在超净工作台上,用移液器吸取总RNA样品4μl于封口膜上。
在实验台上再加入5μl 1×TAE电泳缓冲液及1μl 的10X载样缓冲液,混匀后,小心加入点样孔。
(3)打开电源开关,调节电压至100V,使RNA由负极向正极电泳,约30min后将凝胶放入EB染液中染色
5min,用清水稍微漂洗。
在紫外透射检测仪上观察RNA电泳结果。
试剂:
(1)MOPS缓冲液(10*):0.4mol/L 吗啉代丙烷磺酸(MOPS) (Ph7.0),0.1mol/L NaAc, 10mol/L EDTA。
(2)上样染料:50%甘油,1mmol/L EDTA ,0.4%溴酚蓝,0.4%二甲苯蓝。
(3)甲醛。
(4)去离子甲酰胺。
v电泳槽清洗:去污剂洗干净(一般浸泡过夜)——水冲洗——乙醇干燥——3%H2O2灌满——室温放置10分钟——0.1%DEPC水冲洗。
操作:
(1) 将制胶用具用70%乙醇冲冼一遍,晾干备用。
(2) 配制琼脂糖凝胶。
①称取0.5g琼脂糖,置干净的100ml 锥形瓶中,加入40ml蒸馏水,微波炉内加热使琼脂糖彻底溶化均匀。
②待胶凉至60--70 ℃,依次向其中加入9ml 甲醛、5ml 10X MOPS缓冲液和0.5ul 溴化乙锭,混合均匀。
③灌制琼脂糖凝胶。
(3) 样品准备:
①取 DEPC处理过的500ul小离心管,依次加入如下试剂: 10x MOPS缓冲液2ul,甲醛3.5ul,甲酰胺(去离子)10ul,RNA 样品 4.5ul,混匀。
②将离心管置于60℃水浴中保10分钟,再置冰上2分钟。
③向管中加入3ul 上样染料,混匀。
(4)上样。
(5)电泳:电泳槽内加入1XMOPS缓冲液,于7.5V/ml 的电压下电泳。
(6)电泳结束后,在紫外灯下检查结果。
小结:RNA琼脂糖凝胶电泳中务必去除RNASE酶的污染,所有的试剂需用DEPC水配制,所用的器材也要
的DEPC处理并灭菌,防止RNA被降解。