SDS-PAGE电泳注意事项
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匀浆:1.匀浆缓冲液含有多种蛋白酶抑制剂,降低蛋白酶活性,以防蛋白降解。
2.SDS在匀浆以后再加入,以防起沫。
3.所有操作尽量在冰上进行。
4.94C水浴(或沸水浴)处理的作用是为了是蛋白变性,以防降解(水浴锅事先要打开升温)。
5.PMSF是有毒试剂,处理时注意。
6.操作过程尽量带上手套,以防人手表面的蛋白和脂肪的污染。
7.热水浴后,离心是用的可以控温的离心机,使用前15分钟打开使温度降到4C,即可。
8.离心后分装,可以用枪头先把表面的一层吸走,换取新的枪头在分装。
9.SDS,DDT,PMS是用时临时加入缓冲业的,根据母液的浓度计算所需的量。
制胶:10.APS和TEME是促凝的,根据温度加入的量是可以变动,一般不超过30%。
11.玻璃板一定要洗干净,否则制胶是会有气泡。
12.丙烯酰胺是有毒的,操作时注意安全。
(凝胶以后,聚丙烯酰胺毒性降低。
)13.1.5mm的玻璃板有黑色条带封低,1mm勺玻璃板用白色条带封底。
(封紧以防漏胶)14.凝胶的时间要严格控制好,一般在20-30min。
15.样品处理时,沸水浴使蛋白充分变性以防在电泳时产热蛋白质降解。
一般要5-10分钟。
而且要注意把样品的管口封好,以防沸水浴时冲开(出错了)。
16.点样时,如果孔比较多,尽量点在中央。
(点在边上时,跑出的带是斜的)17.点样前要排尽胶底部的气泡,防止干扰电泳。
18.开始电泳时,电压调到80V,当跑过浓缩胶时电压调到100V。
19.电泳结束后,取胶时,小心把玻璃板翘起(防止再次落下)20.脱色时,尽量多次进行换水。
21.上样量不宜太高,蛋白含量每个孔控制在10卩g-50卩g,,一般V 15卩I.22.做胶时,凝胶时间控制在25min。
梳子不能歪来歪去。
23.上样时,Mark最好标在中间,边上的孔尽量不要上样。
24.制胶时,在加APS前尽量不要搅拌,加入APS后可以轻轻搅拌,不要产生气泡。
注意:温度,时间,光照,APS和TEMEDfE会对凝胶产生影响。
SDS-PAGE电泳过程中常见问题以及解决方法2Q:SDS-PAGE电泳的基本原理?A:SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS(十二烷基硫酸钠),SDS会与变性的多肽,并使蛋白带负电荷,由于多肽结合SDS的量几乎总是与多肽的分子量成正比而与其序列无关,因此SDS多肽复合物在丙稀酰胺凝胶电泳中的迁移率只与多肽的大小有关,在达到饱和的状态下,每克多肽可与1.4g去污剂结合。
当分子量在15KD到200KD之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW为分子量,X为迁移率,k、b均为常数,若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线,未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子量。
Q:配胶缓冲液系统对电泳的影响?A:在SDS-PAGE不连续电泳中,制胶缓冲液使用的是Tris-HCL缓冲系统,浓缩胶是pH6.7,分离胶pH8.9;而电泳缓冲液使用的Tris-甘氨酸缓冲系统。
在浓缩胶中,其pH环境呈弱酸性,因此甘氨酸解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低;而CL离子却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动。
由于导电性与电场强度成反比,这一区带便形成了较高的电压剃度,压着蛋白质分子聚集到一起,浓缩为一狭窄的区带。
当样品进入分离胶后,由于胶中pH的增加,呈碱性,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直接紧随氯离子之后,同时由于分离胶孔径的缩小,在电场的作用下,蛋白分子根据其固有的带电性和分子大小进行分离。
所以,pH对整个反应体系的影响是至关重要的,实验中在排除其他因素之后仍不能很好解决问题的情况,应首要考虑该因素。
Q:样品如何处理?A:根据样品分离目的不同,主要有三种处理方法:还原SDS处理、非还原SDS处理、带有烷基化作用的还原SDS处理。
1、还原SDS处理:在上样buffer中加入SDS和DTT(或Beta巯基乙醇)后,蛋白质构象被解离,电荷被中和,形成SDS与蛋白相结合的分子,在电泳中,只根据分子量来分离。
sds电泳脱色技巧
SDS-PAGE电泳染色脱色时间较长,如果急于看结果,可以采用以下方法:
1. 将胶转移到适当大小的玻璃平皿中,倒入考马斯亮蓝染色液,液面能覆盖胶面即可,然后用另一平皿盖住表面,放入微波炉中加热,一见沸腾,立即停止,然后放在摇床上摇5分钟左右即可,这样的染色效果很好。
2. 脱色也可采取相同的方法,只不过把考马斯亮蓝染色液换成脱色液,脱色时可以多摇几分钟,多换几次脱色液,效果很好。
采用上述方法需要注意在微波炉中加热时间不可太长,一沸腾立即停止加热,否则容易将染色液渐出。
此外,还有其他一些技巧:
1. 可以在45℃左右的水浴中进行染色和脱色,时间会缩短。
2. 用乙醇和乙酸配脱色液,然后加热脱色,很快的,可加热到马上要沸腾为止。
3. 用蒸馏水洗胶,并放在微波炉里加热。
只是要掌握好时间,时间太长而蛋白的含量又比较低的话,容易脱过了。
4. 加入甲醇-乙酸脱色液后,将其直接放到微波炉里加热一分钟,然后放几张干净的tissue进去(把它叠成条状,沾在脱色皿边上就OK啦!不要和胶混在一起),能吸去很多染料,加快脱色。
以上方法仅供参考,可以根据实际情况选择合适的方法。
SDS-PAGE电泳的操作规程一、样品处理取适量体积的样品溶液(样品含约为0.5-5ug),加入5×样品缓冲液,用振荡器混匀,于95℃水浴中煮5分钟,并于离心机中12000r/min离心5分钟待上样用,煮完后室温冷却。
非还原不用煮。
二、配制凝胶溶液和灌胶A、预先计算好所需浓度胶的体积及配胶所需要的各种试剂的体积,按这些数据依次加入试剂并混匀,然后灌入预先装好并且用双蒸水试漏过的板层中(先是分离胶),在胶的上面加一小层水饱和的异丁醇,置于平整的桌面让其自然凝固。
B、待分离胶凝固后(以胶与异丁醇界面有折射为准),到掉上层的异丁醇,用双蒸水冲洗三次并用吸水纸吸干。
然后灌入预定浓度的、按步骤A配制的浓缩胶,插入加样梳(注意赶走气泡),平置于水平桌面,自然凝固。
C、待凝固后,放置1小时使胶充分交联凝固。
三、电泳1、拔掉梳子,用双蒸水冲洗加样孔,去除杂质及未凝固的胶溶液,然后装好电泳装置,加入电泳缓冲液(如阴阳极缓冲液不同,需要分别加入相应的缓冲液,另外,阴阳极电泳缓冲液不要混在一起)2、用20ul的微量加样枪上样。
3、电泳开始时,恒压模式下用80V的电压电泳,待指示剂溴酚蓝进入分离胶时,把电压提高到130-150V左右,直到溴酚蓝快走出分离胶时,终止电泳,切断电源,拆下凝胶分别切下上、下角标记胶的方向及区别是哪一块胶。
4、清洗胶架、玻璃及其他附件。
四、染色、脱色及结果的分析与保存1、把剥下的胶浸入染色液中,放在脱色摇床上摇1小时。
2、取出凝胶块,用蒸馏水冲洗干净,然后置于脱色液中脱色,摇荡脱色直到底色基本脱完。
3、脱完色的胶用凝胶成像系统照相并进行数据分析处理。
一、试剂的使用与管理1、30%的丙烯酰胺贮存液(棕色瓶中保存)、pH8.8的缓冲液、PH6.8的缓冲液、10%的AP、TEMED用完后请放回4℃冰箱。
2、2×上样缓冲液,用完后请存放于-20℃冰箱的指定位置。
3、中分子量marker请按照说明书配制,配制后于95℃水浴中煮5分钟,冷却后离心,分装到eppendorf管中,每管10 U L。
SDS-PAGE电泳注意事项sds是阴离子去污剂,作为变性剂和助溶试剂,它能断裂分子内和分子间的氢键,使分子去折叠,破坏蛋白分子的二、三级结构。
强还原剂如巯基乙醇,二硫苏糖醇能使半胱氨酸残基间的二硫键断裂。
在样品和凝胶中重新加入还原剂和sds后,分子被裂解成多肽链,裂解后的氨基酸侧链和sds融合成蛋白-sds胶体,所带的负电荷大大少于了蛋白原有的电荷量,这样就消解了相同分子间的电荷差异和结构差异。
浓缩胶的作用是有堆积作用,凝胶浓度较小,孔径较大,把较稀的样品加在浓缩胶上,经过大孔径凝胶的迁移作用而被浓缩至一个狭窄的区带。
共聚丙烯酰胺凝胶由单体丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺生成而变成,催化剂生成的常用方法存有两种:化学生成法和光生成法。
化学生成以过硫酸铵(ap)为催化剂,以四甲基乙二胺(temed)为快速剂。
不连续体系由电极缓冲液、浓缩胶及分离胶所组成。
浓缩胶是由ap催化聚合而成的大孔胶,凝胶缓冲液为ph6.7的tris-hcl。
分离胶是由ap催化聚合而成的小孔胶,凝胶缓冲液为ph8.9tris-hcl。
电极缓冲液是ph8.3tris-甘氨酸缓冲液。
2种孔径的凝胶、2种缓冲体系、3种ph值使不连续体系形成了凝胶孔径、ph值、缓冲液离子成分的不连续性,这是样品浓缩的主要因素。
sds-共聚丙烯酰胺凝胶电泳经常应用于纯化过程中纯度的检测,提纯的蛋白质通常在sds电泳上要只有一条拎,但如果蛋白质就是由相同的亚基共同组成的,它在电泳中可能会构成分别对应于各个亚基的几条拎。
上样缓冲液的作用:形成sds-蛋白复合物,使其带负电;sds和巯基乙醇使蛋白质解离,综上两点为了在电泳中,只根据分子量来分离。
sds促进作用:回去蛋白质电荷、离解蛋白质之间的氢键、中止蛋白分子内的亲水性促进作用、回去多肽卷曲,除了并助溶剂的促进作用。
2.sds-page电泳凝胶中各主要成分的作用(1)铀与拆分胶凝结的优劣轻易关系到电泳顺利是否,与促凝剂及环境密切相关。
S D S-聚丙烯酰胺凝胶电泳SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳该技术首先在1967年由Shapiro建立,1969年由Weber和Osborn进一步完善。
一、原理聚丙烯酰胺凝胶是由丙烯酰胺 (简称Acr) 和交联剂N,N’—亚甲基双丙烯酰胺(简称Bis)在催化剂作用下,聚合交联而成的具有网状立体结构的凝胶,并以此为支持物进行电泳。
聚丙烯酰胺凝胶电泳可根据不同蛋白质分子所带电荷的差异及分子大小的不同所产生的不同迁移率将蛋白质分离成若干条区带,如果分离纯化的样品中只含有同一种蛋白质,蛋白质样品电泳后,就应只分离出一条区带。
SDS是一种阴离子表面活性剂能打断蛋白质的氢键和疏水键,并按一定的比例和蛋白质分子结合成复合物,使蛋白质带负电荷的量远远超过其本身原有的电荷,掩盖了各种蛋白分子间天然的电荷差异。
因此,各种蛋白质-SDS 复合物在电泳时的迁移率,不再受原有电荷和分子形状的影响,而只是棒长的函数。
这种电泳方法称为SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(简称SDS—PAGE)。
由于SDS-PAGE 可设法将电泳时蛋白质电荷差异这一因素除去或减小到可以略而不计的程度,因此常用来鉴定蛋白质分离样品的纯化程度,如果被鉴定的蛋白质样品很纯,只含有一种具三级结构的蛋白质或含有相同分子量亚基的具四级结构的蛋白质,那么SDS—PAGE 后,就只出现一条蛋白质区带。
SDS—PAGE 可分为圆盘状和垂直板状、连续系统和不连续系统。
本实验采用垂直板状不连续系统。
所谓“不连续”是指电泳体系由两种或两种以上的缓冲液、pH 和凝胶孔径等所组成。
1.样品的浓缩效应在不连续电泳系统中,含有上、下槽缓冲液(Tris—Gly,pH8.3)、浓缩胶缓冲液(Tris—HCl,pH6.8)、分离胶缓冲液(Tris—HCl,pH8.8),两种凝胶的浓度(即孔径)也不相同。
在这种条件下,缓冲系统中的HCl 几乎全部解离成Cl-,两槽中的Gly (pI=6.0,pK a=9.7)只有很少部分解离成Gly 的负离子,而酸性蛋白质也可解离出负离子。
SDS-PAGE电泳过程中常见问题以及解决方法几乎所有蛋白质电泳分析都在聚丙烯酰胺凝胶上进行,而所有条件总要确保蛋白质解离成单个多肽亚基并进可能减少其相互间的聚集,最常用的就是SDS-PAGE 电泳技术,关于大家在此过程中经常遇到的问题进行一些讨论:Q:SDS-PAGE电泳的基本原理?A:SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS(十二烷基硫酸钠), SDS会与变性的多肽,并使蛋白带负电荷,由于多肽结合SDS的量几乎总是与多肽的分子量成正比而与其序列无关,因此SDS多肽复合物在丙稀酰胺凝胶电泳中的迁移率只与多肽的大小有关,在达到饱和的状态下,每克多肽可与1.4g去污剂结合。
当分子量在15KD到200KD之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式:logMW=K-bX,式中:MW为分子量,X为迁移率,k、b均为常数,若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线,未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子量。
Q:配胶缓冲液系统对电泳的影响?A:在SDS-PAGE不连续电泳中,制胶缓冲液使用的是Tris-HCL缓冲系统,浓缩胶是pH6.7,分离胶pH8.9;而电泳缓冲液使用的Tris-甘氨酸缓冲系统。
在浓缩胶中,其pH环境呈弱酸性,因此甘氨酸解离很少,其在电场的作用下,泳动效率低;而CL离子却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子就介于二者之间泳动。
由于导电性与电场强度成反比,这一区带便形成了较高的电压剃度,压着蛋白质分子聚集到一起,浓缩为一狭窄的区带。
当样品进入分离胶后,由于胶中pH的增加,呈碱性,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直接紧随氯离子之后,同时由于分离胶孔径的缩小,在电场的作用下,蛋白分子根据其固有的带电性和分子大小进行分离。
所以,pH对整个反应体系的影响是至关重要的,实验中在排除其他因素之后仍不能很好解决问题的情况,应首要考虑该因素。
SDS-PAGE教程1 SDS-PAGE原理SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,是在聚丙烯酰胺凝胶系统中引进SDS(十二烷基硫酸钠), SDS会与变性的多肽,并使蛋白带负电荷,由于多肽结合SDS的量几乎总是与多肽的分子量成正比而与其序列无关,因此SDS 多肽复合物在丙稀酰胺凝胶电泳中的迁移率只与多肽的大小有关,在达到饱和的状态下,每克多肽可与 g去污剂结合。
当分子量在15 KDa到200 KDa 之间时,蛋白质的迁移率和分子量的对数呈线性关系,符合下式:log MW = K – bX,式中:MW为分子量,X为迁移率,k、b均为常数,若将已知分子量的标准蛋白质的迁移率对分子量对数作图,可获得一条标准曲线,未知蛋白质在相同条件下进行电泳,根据它的电泳迁移率即可在标准曲线上求得分子量。
SDS-PAGE [Laemmli法]这种方法帖出来,大家是不是感觉非常的陌生呢其实这种发方法很普遍,现在大部分的实验室都是用Laemmli法跑电泳的。
如今实验室中用的最多的蛋白电泳是源于Laemmli于1970年发表在nature上的一篇文章中的方法,这篇文章很特别,不仅被引用的次数较多,而且该篇并不是专门阐述蛋白电泳方法上的提出和改进问题,而是对噬菌体头部包装过程中的蛋白进行分析过程中用到电泳分析方法而已,所以阐述如何操作的文字只有那么一小段(但相当经典),这是SDS-PAGE(不连续系统)的首次成功应用。
现在我们在实验室进行的SDS-PAGE试剂的配方仍然是沿用了它的数据,许多论文在描述其SDS-PAGE时引用Laemmli方法,目前常用的具有浓缩胶和分离胶的不连续SDS-PAGE的基础的确来自Laemmli方法,但也略有差别例如一些缓冲液的具体组成。
你也许会恍然大悟:原来我们用的就是Laemmli!SDS-PAGE各试剂配制方法30%聚丙烯酰胺溶液-----30%(w/v)Acrylamide【组分浓度】【配制方法】将29克丙烯酰胺和1克N,N’-亚甲丙烯酰胺溶于总体积为60ml温热(37℃左右)的去离子水中,充分搅拌溶解,补加水至终体积为100ml。
sds page凝胶电泳步骤以SDS-PAGE凝胶电泳步骤为标题的文章SDS-PAGE凝胶电泳是一种常用的蛋白质分离和测量方法,其步骤包括蛋白质样品的制备、样品加载、电泳运行、染色和图像分析等。
本文将详细介绍SDS-PAGE凝胶电泳的步骤及相关注意事项。
一、蛋白质样品的制备准备要分离的蛋白质样品,并将其加入样品缓冲液中,以使蛋白质溶解并保持其天然构象。
样品缓冲液通常包含Tris-HCl缓冲液、甘油、SDS和β-巯基乙醇等成分,用于维持样品的pH值和还原环境,使蛋白质完全展开。
二、样品加载将制备好的蛋白质样品加载到凝胶孔中。
通常使用微量吸管或微量注射器将样品缓冲液缓慢地注入凝胶孔中,确保样品完全进入凝胶中。
三、电泳运行将已加载样品的凝胶板放置在电泳槽中,确保凝胶完全浸泡在电泳缓冲液中。
然后将电泳槽连接到电源,并设置合适的电压和电流参数。
根据需要,可以选择常规电泳或快速电泳。
在电泳过程中,蛋白质样品会在凝胶中被电场推动,根据其分子大小和电荷不同,被分离成不同的带状条带。
较小的蛋白质分子迁移速度较快,而较大的蛋白质分子迁移速度较慢。
四、染色电泳结束后,需要对凝胶进行染色以可视化蛋白质带状条带。
常用的染色方法有银染色和Coomassie蓝染色。
银染色对蛋白质敏感性高,但操作繁琐;而Coomassie蓝染色操作简单,但对蛋白质敏感性相对较低。
五、图像分析通过使用分析软件或图像扫描仪,将染色后的凝胶图像数字化,并进行分析。
可以测量蛋白质带状条带的相对迁移距离和相对强度,进而确定蛋白质的分子大小和相对丰度。
在进行SDS-PAGE凝胶电泳实验时,还需要注意以下事项:1. 准备工作确保操作台和仪器干净,并准备好所需的试剂和设备。
避免在实验过程中发生交叉污染。
2. 样品加载在加载样品时,应避免空气泡和溢出。
确保样品均匀地加载到凝胶孔中,以获得清晰的带状条带。
3. 电泳运行条件根据蛋白质样品的大小和分离需求,选择合适的电压和电流参数。
SDS是阴离子去污剂,作为变性剂和助溶试剂,它能断裂分子内和分子间的氢键,使分子去折叠,破坏蛋白分子的二、三级结构。
强还原剂如巯基乙醇,二硫苏糖醇能使半胱氨酸残基间的二硫键断裂。
在样品和凝胶中加入还原剂和SDS后,分子被解聚成多肽链,解聚后的氨基酸侧链和SDS 结合成蛋白- SDS胶束,所带的负电荷大大超过了蛋白原有的电荷量,这样就消除了不同分子间的电荷差异和结构差异。
浓缩胶的作用是有堆积作用,凝胶浓度较小,孔径较大,把较稀的样品加在浓缩胶上,经过大孔径凝胶的迁移作用而被浓缩至一个狭窄的区带。
聚丙烯酰胺凝胶由单体丙烯酰胺和甲叉双丙烯酰胺聚合而成,催化聚合的常用方法有两种:化学聚合法和光聚合法。
化学聚合以过硫酸铵(AP)为催化剂,以四甲基乙二胺(TEMED)为加速剂。
不连续体系由电极缓冲液、浓缩胶及分离胶所组成。
浓缩胶是由AP催化聚合而成的大孔胶,凝胶缓冲液为pH6.7的Tris-HCl。
分离胶是由AP催化聚合而成的小孔胶,凝胶缓冲液为pH8.9 Tris-HCl。
电极缓冲液是pH8.3 Tris-甘氨酸缓冲液。
2种孔径的凝胶、2种缓冲体系、3种pH值使不连续体系形成了凝胶孔径、pH值、缓冲液离子成分的不连续性,这是样品浓缩的主要因素。
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳经常应用于提纯过程中纯度的检测,纯化的蛋白质通常在SDS 电泳上应只有一条带,但如果蛋白质是由不同的亚基组成的,它在电泳中可能会形成分别对应于各个亚基的几条带。
注意问题
1.样品处理
上样缓冲液的作用:形成SDS-蛋白复合物,使其带负电;SDS和巯基乙醇使蛋白质解离,综上两点为了在电泳中,只根据分子量来分离。
SDS作用:去蛋白质电荷、解离蛋白质之间的氢键、取消蛋白分子内的疏水作用、去多肽折叠,还有助溶剂的作用。
2. SDS-PAGE电泳凝胶中各主要成分的作用
(1)浓缩与分离胶凝固的好坏直接关系到电泳成功与否,与促凝剂及环境密切相关。
3. 提高SDS-PAGE电泳分辨率的途径
待凝胶在室温凝固后,可在室温下放置一段时间使用。
忌即配即用或4度冰箱放置,前者易导致凝固不充分,后者可导致SDS结晶。
一般凝胶可在室温下保存4天,SDS可水解聚丙烯酰胺。
4. .“微笑”(两边翘起中间凹下)形带原因
主要是由于凝胶的中间部分凝固不均匀所致,多出现于较厚的凝胶中。
处理办法:待其充分凝固再作后续实验。
5. “皱眉”(两边向下中间鼓起)形带原因
主要出现在蛋白质垂直电泳槽中,一般是两板之间的底部间隙气泡未排除干净。
处理办法:可在两板间加入适量缓冲液,以排除气泡。
6. 带出现拖尾现象
主要是样品融解效果不佳或分离胶浓度过大引起的。
处理办法:加样前离心;选择适当的样品缓冲液,加适量样品促溶剂;电泳缓冲液时间过长,重新配制;降低凝胶浓度。
7. 带出现纹理现象
主要是样品不溶性颗粒引起的。
处理办法:加样前离心;加适量样品促溶剂。
8. 溴酚蓝不能起到指示作用
实验中常会遇到溴酚蓝已跑出板底,但蛋白质却还未跑下来的现象。
主要与缓冲液和分离胶的浓度有关。
处理办法:更换正确pH值的Buffer;降低分离胶的浓度。
9. 电泳的条带很粗
电泳中条带很粗是常见的事,主要是未浓缩好的原因。
处理办法:适当增加浓缩胶的长度;保证浓缩胶贮液的pH正确(6.7);适当降低电压;10. 电泳电压很高而电流却很低呢
比如电压50v以上,可电流却在5mA以下。
主要是由于电泳槽没有正确装配,电流未形成通路。
包括:a.内外槽装反;b.外槽液过少;c.电泳槽底部的绝缘体未去掉(比如倒胶用的橡胶皮)。
11.浓缩胶与分离胶断裂、板间有气泡对电泳影响
一般对电泳不会有太大的影响。
前者主要原因是拔梳子用力不均匀或过猛所致;后者是由于在解除制胶的夹子后,板未压紧而致空气进入引起的。
12. 凝胶时间不对,或慢或快
通常胶在30MIN-1H内凝。
如果凝的太慢,可能是TEMED,APS剂量不够或者失效。
APS 应该现配现用,TEMED不稳定,易被氧化成黄色。
如果凝的太快,可能是APS和TEMED 用量过多,此时胶太硬易裂,电泳时易烧胶。
13. 电泳时间比正常要长
可能由于凝胶缓冲系统和电级缓冲系统地PH选择错误,即缓冲系统地PH和被分离物质的等电点差别太小,或缓冲系统的离子强度太高。
14. 分离胶加上后为什么要立即加水
加入分离胶后,立即覆一层双蒸水,一是为了使分离胶界面保持水平,用水就可以把它压平,使蛋白质分子跑时在同一水平线上;二是阻止空气中的氧气对凝胶聚合的抑制作用。
注意:SDS-PAGE电泳关键在于胶是否制得均匀平整,当然这跟灌胶用的模具和方法有一定关系。
加入TEMED和过硫酸铵后丙烯酰胺开始聚合,但是过硫酸铵易被氧化,所以操作要迅速,而且最后要液封,保证模具内不漏气才能使胶聚合的很好。
同时不要把制胶用的玻璃板中间压太紧,这样会使中间的胶偏薄,水封时要小心加入水不要剧烈扰动胶层,使某些地方的胶被稀释,总之一句话确保胶的各部分电阻率均匀,这样跑出的条带才不会歪掉。
制胶水平比较好的胶从胶板上取下后应该是平整的,而不是某些地方翘起。