转录和转录水平的调控要点
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真核生物转录水平的调控机制一、转录因子转录因子是真核生物转录水平调控的重要环节。
它们可以识别和结合DNA上的特异序列,从而调控基因的表达。
根据结合位点的不同,转录因子可以分为上游启动子元件和增强子元件两类。
上游启动子元件主要包括TATA box和CAAT box等,而增强子元件则是一种具有增强基因转录功能的DNA序列。
二、染色质重塑染色质重塑是真核生物基因表达调控的重要机制之一。
染色质重塑可以改变染色质的结构,从而影响基因的表达。
染色质重塑过程中,染色质重塑复合物可以将核小体从DNA上移除或重新排列,从而改变染色质的可及性。
此外,染色质重塑还可以影响DNA的甲基化水平,进一步调控基因的表达。
三、miRNA和siRNAmiRNA和siRNA是真核生物中的非编码RNA,它们可以通过与mRNA的特异性结合来调控基因的表达。
miRNA和siRNA可以与mRNA 的3'UTR结合,导致mRNA的降解或翻译抑制,从而调控基因的表达。
此外,miRNA和siRNA还可以通过与转录因子或染色质重塑复合物等相互作用,影响基因的转录和表达。
四、转录起始和延伸转录起始和延伸是真核生物转录水平调控的重要环节。
转录起始和延伸过程中,RNA聚合酶可以识别启动子元件并开始转录,然后沿着DNA序列向下游移动并合成RNA。
在这个过程中,转录起始和延伸复合物可以与RNA聚合酶相互作用,从而影响转录的效率和方向。
此外,一些转录因子也可以与RNA聚合酶相互作用,进一步影响基因的表达。
五、转录后修饰真核生物中的RNA聚合酶可以使用各种转录后修饰来修饰其转录产物。
这些修饰可以包括mRNA的加尾、编辑、剪接和稳定性等。
这些过程可以影响mRNA的翻译效率和稳定性,从而影响基因的表达。
此外,一些蛋白质也可以通过磷酸化、乙酰化或甲基化等修饰来影响基因的表达。
六、细胞周期与细胞分化细胞周期和细胞分化是真核生物细胞生命活动中的重要过程,也是转录水平调控的重要方面。
转录调控和转录因子转录调控是指细胞内通过控制基因转录过程来调节基因表达水平的机制,是生物体适应环境变化的关键。
而转录因子作为一类能够结合到DNA上的蛋白质,是转录调控中的重要因素。
本文将从转录调控的基本概念、调控机制和转录因子的分类等方面进行分析。
一、转录调控的基本概念转录调控是指通过控制基因的转录过程来调节基因表达的机制。
细胞内的基因表达是一个精密的调控过程,可以被外界环境以及内部信号分子所调节。
转录调控涉及到一系列的调控机制,包括染色质结构的改变、DNA甲基化、组蛋白修饰等。
这些调控机制共同作用于特定的基因序列,从而调节基因的转录过程。
二、转录调控的机制1. 染色质结构的调控染色质的结构可以通过DNA超螺旋的紧密度和核小体的排列密度来调节。
在染色质结构紧密的区域,DNA的可获得性较低,基因的转录受到抑制。
而在染色质结构相对松弛的区域,DNA的可获得性较高,基因的转录能够进行。
2. DNA甲基化DNA甲基化是一种通过在DNA分子中加入甲基基团来改变DNA的结构和功能的化学修饰。
甲基化通常发生在CpG岛区域,而CpG岛是富含CpG碱基对的区域。
DNA甲基化可以阻碍转录因子与DNA序列的结合,从而抑制基因的转录过程。
3. 组蛋白修饰组蛋白修饰是指通过化学修饰来改变组蛋白的结构和功能。
组蛋白是包裹在DNA上的蛋白质,它的修饰状态可以影响到基因转录的进行。
例如,乙酰化和甲基化等修饰可以促进基因的转录,而乙酰化和泛素化等修饰则会抑制基因的转录。
三、转录因子的分类根据转录因子的结构和功能特点,可以将转录因子分为多种类型。
以下是常见的几类转录因子:1. 转录激活因子转录激活因子能够结合到启动子区域,并与RNA聚合酶等转录因子互相作用,进而促进基因的转录过程。
转录激活因子通常包括DNA结合结构域和活化结构域。
2. 转录抑制因子转录抑制因子能够结合到启动子或增强子区域,从而阻碍RNA聚合酶的结合和基因的转录。
转录抑制因子的结构域和功能与转录激活因子类似,但其作用是相反的。
转录调控的机制
转录调控是指控制基因转录的机制,通过调节基因的表达水平来影响细胞的生理和病理过程。
转录调控可以分为转录前调控和转录后调控两个阶段。
在转录前调控中,转录因子是关键的调控因素。
转录因子是一类结构特殊的蛋白质,它们能够结合到基因启动子区域的特定序列上,并调节基因的转录。
转录因子可以分为激活子和抑制子,分别促进或抑制基因的转录。
不同转录因子之间会发生相互作用,形成复杂的调控网络。
转录后调控则主要由RNA后转录修饰参与。
这些修饰有助于调控RNA的稳定性、翻译效率和局部结构。
其中最重要的后转录修饰包括剪接、RNA编辑、RNA甲基化等。
这些修饰在细胞发育、免疫应答、疾病发生等过程中发挥着重要的作用。
最近发现,非编码RNA也能够参与到转录调控中。
非编码RNA是指在基因组中存在,但不编码蛋白质的RNA分子。
它们能够与DNA、RNA和蛋白质发生相互作用,从而影响基因的表达。
非编码RNA在癌症、神经退行性疾病等多种疾病中发挥着重要的作用。
总的来说,转录调控是一个复杂的过程,涉及到多种分子的相互作用。
研究转录调控的机制不仅有助于我们理解生命现象的本质,也为疾病的治疗和预防提供了新的思路。
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解释基因表达的调控机制。
> 原题:解释基因表达的调控机制基因表达调控是指在细胞中控制基因转录和翻译的过程。
通过调控基因表达,细胞可以根据内外环境的需求来合成所需的蛋白质。
基因表达调控涉及多个环节和分子机制。
一、转录调控1. 转录因子:转录因子是一类可以与DNA结合的蛋白质,它们能够促进或抑制特定基因的转录。
转录因子的结合位点通常位于基因的启动子区域,它们可以通过调控转录复合物的形成来影响RNA聚合酶的结合和启动转录的过程。
2. 染色质修饰:染色质修饰是指对DNA及其相关的蛋白质进行化学修饰,从而改变染色质结构和可访问性。
例如,DNA甲基化可以抑制某些基因的转录,而组蛋白乙酰化则可以促进基因的转录。
二、转录后调控1. RNA剪接:RNA剪接是一种将RNA前体分子中的内含子去除,将外显子连结起来的过程。
通过不同的剪接方式,可以产生不同的mRNA亚型,从而影响蛋白质的翻译。
2. mRNA降解:mRNA降解是指将mRNA分解为较小的碎片,从而停止蛋白质的合成。
通过调控mRNA的稳定性,可以控制基因的表达水平。
三、翻译调控1. 转运调控:通过调控mRNA的转运过程,可以控制mRNA的定位和稳定性。
这种调控方式可以影响基因的表达水平。
2. 蛋白质修饰:蛋白质修饰是指在翻译后对蛋白质进行化学修饰的过程。
蛋白质修饰可以影响蛋白质的功能、稳定性和亚细胞定位。
综上所述,基因表达调控涉及转录调控、转录后调控和翻译调控等多个层面和分子机制。
这些调控机制相互作用,共同影响基因的表达水平和细胞的功能。
对这些调控机制的深入研究,有助于我们更好地理解生物体的发育、生长和适应环境的能力。
基因表达的调控机制基因表达是指基因通过转录和翻译过程将DNA信息转化为蛋白质的过程。
在细胞内,基因表达的调控机制起着至关重要的作用,决定了细胞的功能和特性。
本文将介绍基因表达的调控机制,包括转录调控、转录后调控和翻译调控。
一、转录调控转录调控是指通过调控基因的转录过程来控制基因表达水平。
转录调控主要包括启动子区域的结构和转录因子的结合。
1. 启动子区域的结构启动子是位于基因上游的DNA序列,包含转录起始位点和调控元件。
调控元件包括增强子和抑制子,它们可以与转录因子结合,促进或抑制转录的发生。
启动子区域的结构可以通过DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质重塑等方式进行调控。
2. 转录因子的结合转录因子是一类能够结合到DNA上的蛋白质,它们通过与启动子区域的调控元件结合来调控基因的转录。
转录因子可以分为激活子和抑制子,激活子能够促进转录的发生,而抑制子则能够抑制转录的发生。
转录因子的结合与DNA序列的亲和性有关,不同的转录因子结合到不同的DNA序列上,从而实现对基因的调控。
二、转录后调控转录后调控是指在转录完成后,通过调控RNA的加工、修饰和稳定性来控制基因表达水平。
转录后调控主要包括RNA剪接、RNA修饰和RNA降解。
1. RNA剪接RNA剪接是指在转录过程中,将前体mRNA中的内含子剪接掉,将外显子连接起来形成成熟的mRNA。
通过剪接的方式,可以产生不同的mRNA亚型,从而调控基因的表达。
RNA剪接的调控主要依赖于剪接因子的结合和剪接位点的选择。
2. RNA修饰RNA修饰是指在转录后,通过添加化学修饰基团来改变RNA的结构和功能。
常见的RNA修饰包括甲基化、腺苷酸转换和伪尿苷酸转换等。
RNA修饰可以影响RNA的稳定性、转运和翻译效率,从而调控基因的表达。
3. RNA降解RNA降解是指通过核酸酶将RNA分解为小片段,从而降低基因的表达水平。
RNA降解的速度受到RNA的稳定性和降解酶的活性的影响。
不同的RNA分子具有不同的稳定性,一些RNA分子具有较长的半衰期,而另一些RNA分子则具有较短的半衰期。
基因转录的机制及调控基因是生物体内掌控生命活动的重要物质基础,而基因转录是人类生命过程中的一项核心活动。
如何更好地理解这项生命过程及其调控机制,一直是相关领域内的一个重大难题。
在本文中,我们将从分子水平上,探讨基因转录的机制及调控。
1. 基因转录机制基因转录的机制是指将基因内的信息转录成RNA,为后续的翻译蛋白质工作打下基础。
在介绍转录机制之前,我们需要先了解基因的组成。
基因由多个位于非编码区域的外显子和内含子组成。
在转录开始前,RNA聚合酶(RNA polymerase)在基因的启动子区域结合,形成前初始化复合体。
这一复合体随后会在启动子的方向上进行解旋,开启DNA双链。
之后,这个复合体将基因序列股票公司下的信息在DNA模板上读取并转录成RNA。
在转录的过程中,RNA聚合酶将RNA分子按照模板DNA中的序列逐个合成。
其中的过程是RNA聚合酶沿着模板DNA的方向走,寻找非编码区域中的启动子,一旦找到这个起始信号,RNA聚合酶就会加载盘状DNA结构,形成开放复合物。
在这个开放的复合物内,核苷酸ATP和CTP将会被加入到RNA聚合酶进行转录的正确核苷酸上。
在RNA链终止的位置,有一组专门的因子帮助RNA链与DNA分离,使RNA链释放出来,并终止转录。
2. 注释与剪接基因的转录不仅仅是将基因信息转录成RNA,在实际生命过程中,转录出的RNA还需要进行如下处理:注释、剪接与质控。
注释是指将RNA链标上必要的标签,例如5'端帽、3'端聚合体和NTP加注等,以及在RNA分子中注射需要用到的必要信息。
RNA 剪接是指将内含子部分割除,只留下需要的外显子部分,将RNA链重新折叠,形成新的RNA链分子。
在RNA剪接的过程中,有一些剪接因子会辅助剪接酶在内含子与外显子交界上进行剪接。
这个剪接酶会解析RNA链,将其中的部分区域删除,留下需要的部分区域,再通过远距离的缝合收入对应RNA链分子,形成新的RNA链带有外显子的结构。
基因表达的调控基因表达的调控是生物体中基因活动的一个重要过程,通过调控基因的表达水平,维持细胞的功能和稳态。
基因表达调控涉及多个层次,包括转录水平、转译水平和后转录水平等。
下面将对这些层次的基因表达调控进行详细介绍。
一、转录水平调控转录水平调控指的是通过调节基因的转录过程来控制基因表达的水平。
主要的调控方式包括转录激活和转录抑制。
转录激活因子可以与DNA结合,促进转录因子的结合,从而增强转录过程,而转录抑制因子则能够与DNA或转录因子结合,阻碍转录的进行。
此外,染色质的结构也会对基因的转录起到重要的调控作用,如DNA甲基化、组蛋白修饰等都可以改变染色质的状态,进而影响基因的表达。
二、转译水平调控转译水平调控是指调控基因的转录产物(mRNA)的转译过程。
在细胞中,mRNA需要被翻译成蛋白质才能发挥作用。
转译的调控主要包括转录后修饰和mRNA降解两个方面。
在转录后修饰中,mRNA会经历剪接、剪接调控、RNA编辑等多个步骤,来改变它的结构和功能。
而mRNA降解则通过一系列核酸酶的作用,将mRNA降解成短的片段,从而控制基因的表达。
三、后转录水平调控后转录水平调控是指基因表达的调控发生在转录和转译之后的过程。
在这个阶段,蛋白质会经历一系列的修饰和定位过程,以实现其特定的功能。
这些修饰包括糖基化、磷酸化、乙酰化等,它们可以改变蛋白质的稳定性、定位和相互作用等性质。
此外,许多蛋白质需要通过蛋白酶的作用进行裂解,形成活性的多肽或蛋白质片段。
总结起来,基因表达的调控是一个复杂而精细的过程,涉及多个层次的调控机制。
通过转录水平的调控,可以控制基因的转录过程和染色质的结构状态;通过转译水平的调控,可以调节mRNA的转译和降解过程;而后转录水平的调控,则调节了蛋白质的修饰和定位等过程。
这些调控机制相互作用,共同维持了细胞内基因表达的平衡,保证了生物体的正常功能。
基因表达的调控不仅对细胞发育和生理功能具有重要的影响,还与疾病的发生和进展密切相关。
基因表达的调控机制基因表达是指基因信息转录成RNA,再翻译成蛋白质的过程。
在细胞内,基因表达需要受到严格的调控,以确保细胞在不同环境下能够适应并正常运作。
基因表达的调控机制涉及到多个层面,包括转录水平、转录后调控、翻译水平和蛋白后修饰等。
本文将从这些方面介绍基因表达的调控机制。
1. 转录水平的调控转录是基因表达的第一步,也是调控基因表达的关键环节。
在转录水平,基因的表达可以通过启动子区域的甲基化、转录因子的结合、染色质重塑等方式进行调控。
启动子区域的甲基化可以影响转录因子的结合,从而影响基因的转录活性。
转录因子是一类能够结合到DNA上特定序列的蛋白质,它们可以促进或抑制基因的转录。
染色质重塑是指通过改变染色质的结构来影响基因的可及性,从而调控基因的表达水平。
2. 转录后调控转录后调控是指转录后RNA的修饰和稳定性调控。
在细胞核内,RNA经过剪接、剪切、聚腺苷酸化等修饰过程,形成成熟的mRNA。
这些修饰过程可以影响mRNA的稳定性和翻译效率。
另外,miRNA和siRNA等小RNA也可以通过靶向特定mRNA分解或抑制翻译来调控基因表达。
3. 翻译水平的调控翻译是指mRNA上的密码子被翻译成氨基酸序列的过程。
在翻译水平,基因的表达可以通过启动子区域的结构、mRNA的稳定性、翻译因子的结合等方式进行调控。
启动子区域的结构可以影响翻译因子的结合,从而影响翻译的进行。
翻译因子是一类能够结合到mRNA上特定序列的蛋白质,它们可以促进或抑制翻译的进行。
4. 蛋白后修饰蛋白后修饰是指蛋白质合成后,蛋白质经过翻译后修饰的过程。
在细胞内,蛋白质可以通过磷酸化、甲基化、乙酰化等方式进行修饰,从而影响蛋白质的功能和稳定性。
这些修饰过程可以调控蛋白质的活性、亚细胞定位和相互作用等。
综上所述,基因表达的调控机制涉及到转录水平、转录后调控、翻译水平和蛋白后修饰等多个层面。
这些调控机制相互作用,共同调节基因的表达水平,以适应细胞在不同环境下的需要。
SECTION 5转录与转录水平得调控重点:转录得反应体系,原核生物RNA聚合酶与真核生物中得RNA聚合酶得特点,RNA得转录过程大体可分为起始、延长、终止三个阶段。
真核RNA得转录后加工,包括各种RNA前体得加工过程。
基因表达调控得基本概念、特点、基本原理。
乳糖操纵子得结构、负性调控、正性调控、协调调节、转录衰减、SOS 反应。
难点:转录模板得不对称性极其命名,原核生物及真核生物得转录起始,真核生物得转录终止,mRNA前体得剪接机制(套索得形成及剪接),第Ⅰ、Ⅱ类与第Ⅳ类内含子得剪接过程,四膜虫rRNA前体得加工,核酶得作用机理。
真核基因及基因表达调控得特点、顺式作用元件与反式作用因子得概念、种类与特点、以及它们在转录激活中得作用。
一。
模板与酶:要点1.模板RNA得转录合成需要DNA做模板,DNA双链中只有一股链起模板作用,指导RNA合成得一股DNA链称为模板链(template strand),与之相对得另一股链为编码链(coding strand),不对称转录有两方面含义:一就是DNA链上只有部分得区段作为转录模板(有意义链或模板链),二就是模板链并非自始至终位于同一股DNA单链上。
2.RNA聚合酶转录需要RNA聚合酶。
原核生物得RNA聚合酶由多个亚基组成:α2ββ'称为核心酶,转录延长只需核心酶即可。
α2ββ'σ称为全酶,转录起始前需要σ亚基辨认起始点,所以全酶就是转录起始必需得。
真核生物RNA聚合酶有RN A-polⅠ、Ⅱ、Ⅲ三种,分别转录45s-rRNA; mRNA(其前体就是hnRNA);以及5s—rRNA、snRNA与tRNA、3。
模板与酶得辨认结合转录模板上有被RNA聚合酶辨认与结合得位点。
在转录起始之前被RNA聚合酶结合得DNA部位称为启动子。
典型得原核生物启动子序列就是—35区得TTGA CA序列与—10区得Pribnow盒即TATAAT序列。
真核生物得转录上游调控序列统称为顺式作用元件,主要有TATA盒、、CG盒、上游活化序列(酵母细胞)、增强子等等。
转录前水平的调控方式转录前水平调控是指在转录过程开始之前对DNA序列的调控,包括DNA的甲基化、组蛋白修饰、非编码RNA介导的信号等。
这些调控方式的不同组合可以决定基因转录启动子的可访问性,从而影响基因表达的水平和模式。
本文将详细阐述转录前水平调控的几种主要方式。
1. DNA甲基化DNA甲基化是指DNA上甲基基团的添加,它可以影响DNA的结构和可读性。
在哺乳动物中,DNA甲基化通常发生在CpG二核苷酸位点上。
DNA甲基化的主要功能是抑制基因的转录。
DNA甲基化的机制涉及到DNA甲基转移酶将甲基基团添加到甲基化靶点上。
不同的DNA甲基转移酶在不同的转录因子启动子和表观遗传位点上具有不同的作用。
2. 组蛋白修饰组蛋白修饰是指对组蛋白分子的化学修饰。
组蛋白是染色体的主要成分,它们与DNA相互作用,从而导致DNA的可读性。
组蛋白修饰既可以促进基因的转录,也可以抑制基因的转录。
常见的组蛋白修饰包括乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化和SUMO化等。
3. 非编码RNA介导的信号非编码RNA是一类不编码蛋白质的RNA分子,它们可以通过RNA干扰、RNA结构化、miRNA等途径参与基因表达的调控。
在转录前水平调控中,非编码RNA可以通过多种方式影响基因的转录水平和模式,包括RNA干扰、表观遗传机制和转录抑制等。
4. 转录因子结合和辅助因子影响转录因子是一类调控基因转录的蛋白质,它们结合在DNA上形成一系列复杂的调节网络,从而影响基因的转录。
转录因子包括激活因子和抑制因子,它们可以与基因启动子共同作用,激发或抑制基因的转录。
与转录因子联结的还有辅助因子,这些因子能够影响转录因子的DNA结合、改变染色质结构、调节组蛋白修饰等等。
基因表达的调控机制和表观遗传学基因表达是生物学中一个重要的过程,它对于生物的发育、功能和适应环境都有着至关重要的作用。
而基因表达的调控机制则是影响基因表达的重要因素之一,表观遗传学作为一个新兴的生物学领域则在研究基因表达调控中扮演了重要的角色。
一、基因表达的调控机制基因表达的调控机制主要包括转录水平和转录后水平的调控。
(一)转录水平的调控转录水平的调控主要是指在基因表达的转录阶段中,通过激活或抑制转录因子的作用来控制基因表达。
例如,在细胞中,一些特定的蛋白质分子可以激活某个基因的表达,从而使该基因在转录时被更加频繁地复制和表达。
这就是基因表达调控的一种方式。
(二)转录后水平的调控转录后水平的调控与转录之后的RNA后修饰密切相关。
事实上,RNA后修饰是基因表达调控的一个重要方面。
在RNA后修饰的过程中,可以通过RNA剪切、RNA退火和RNA稳定等机制来对基因表达进行调控。
例如,通过退火的方式,可以使一些长RNA产生结构性变化,从而影响其对于RNA编辑酶的识别。
二、表观遗传学表观遗传学是研究基因在表达过程中的调控机制的一个新兴领域。
它致力于解决基因表达的特异性问题,即为什么同样的基因,在不同的生物体内会表达出不同的作用。
此外,表观遗传学也提供了更具体的方法和技术,可以用来识别疾病和预测个体的发展趋势。
(一)基因剪接基因剪接是表观遗传学中一个重要的领域,它主要探究基因中可能存在的多种剪接形式,以及这些剪接形式对于基因表达的影响。
在基因剪接中,可以通过删除或保留“内含子”序列来控制基因表达。
这种方法具有调节基因表达的能力,可以有效地控制基因在不同生物体中的表达差异。
(二)DNA甲基化与组蛋白修饰基因表达调控与DNA甲基化和组蛋白修饰密切相关。
在这种调控机制中,可以通过改变DNA中的甲基化程度和组蛋白修饰状态来调节基因表达。
例如,在DNA甲基化过程中,可以通过改变一些氨基酸残基的化学性质来改变基因结构和功能。
细胞核内的转录和转录因子调控细胞核内的转录过程是生物体中基因表达的一个重要环节,通过转录过程,细胞可以将基因的信息转化为RNA,然后再通过翻译过程合成蛋白质。
这样的过程对于细胞的正常功能和发育至关重要。
在细胞核内的转录过程中,转录因子扮演着关键的调控角色,它们可以选择性地结合到DNA上,促进或抑制基因的转录过程。
本文将介绍细胞核内转录过程的基本原理以及转录因子的调控机制。
一、细胞核内的转录过程细胞核内的转录过程是DNA信息传递到RNA的过程。
具体而言,当细胞需要合成特定蛋白质时,转录过程会被启动。
首先,DNA的双链解旋,并且一个称为RNA聚合酶的酶将合成一个新的RNA链,该链与DNA的一个链的序列互补,并以5'→3'的方向合成。
这个合成的RNA链被称为mRNA(messenger RNA),因为它携带了DNA的信息,并将其传递到细胞质中进行蛋白质合成。
二、转录因子的概述转录因子是一类可以结合到DNA上的蛋白质,它们可以选择性地启动或抑制特定基因的转录。
转录因子通过与DNA上的特定序列结合,招募RNA聚合酶,从而调控基因的转录水平。
转录因子的结合位点通常位于基因的启动子区域,这是一个相对较短的DNA序列。
三、转录因子的调控机制转录因子的活性可以通过多种机制来调控。
以下是几个常见的调控机制:1. 进入或离开细胞核:一些转录因子在特定条件下可以进入或离开细胞核。
例如,一些激活转录因子在细胞外受到信号刺激后会进入细胞核,与DNA结合并激活特定的基因转录。
2. 底物诱导:一些转录因子的活性可以通过底物分子的结合来调节。
当底物结合到转录因子上时,其空间构象发生改变,从而影响其DNA结合能力。
这种方式可以确保转录因子仅在特定条件下激活。
3. 磷酸化和去磷酸化:转录因子的活性可以通过磷酸化和去磷酸化等修饰方式进行调控。
磷酸化通常会增强转录因子的活性,而去磷酸化则会减弱其活性。
这些修饰通常由细胞内的激酶和磷酸酶等酶催化。
原核生物基因表达调控机理及意义研究在生物界中,原核生物与真核生物是两类不同的生物体系。
其主要区别在于原核生物没有细胞核和其他复杂细胞器,其基因组由单一环状DNA分子组成,因此研究原核生物的基因表达调控机理对于理解细胞生命活动有着重要的意义。
原核生物基因表达的调控机理主要包括转录水平和转录后水平两个方面。
其中,转录水平主要是指影响基因的转录过程,而转录后水平则是指影响基因译码和蛋白质后翻译、修饰等过程。
下面将具体介绍两个方面的机制。
一、转录水平的调控大多数原核生物具有单个RNA聚合酶所需的全部因子,这意味着RNA聚合酶的活性可能无法被其他因子所调节。
在这种情况下,也就只能依靠DNA相绑定的蛋白质对RNA聚合酶基因进行调节。
最常见的调节方式是一组由反应型蛋白质组成的复合物,这些蛋白质与RNA聚合酶一起结合,形成一种酶促复合物。
通常,该复合物主要通过两种方式产生转录调节:反应型蛋白群与DNA结合的区域可提高或降低RNA聚合酶的结合亲和力,或者允许其他转录因子与RNA聚合酶相互作用。
此外,还有几个反应型蛋白质涉及到转录控制。
例如,亚硫酸盐还原酶(trxA和trxB)能够作为还原剂释放亚硫酸根离子,这种离子可在市场上使用,也可以用作DNA反应型蛋白质还原和肽键形成过程的反应原料。
这些反应型蛋白质涉及的生理调节行为仍需更详细地了解。
二、转录后水平的调控转录后调节主要是指影响RNA翻译和修饰等过程的调节。
通常,这种调节是通过RNA结合蛋白质的基因或RNA调节基因端口(转录和行为)进行的。
在大多数原核生物中,也存在一组RNA区域,这些区域的突变或缺失可以影响RNA的稳定性和翻译能力。
这些“稳定性序列区域”(SSRs)或“翻译能力序列区域”(TRSs)形成一组锚定分子,这些锚定分子促进RNA稳定性或转运。
虽然这些RNA的所有功能尚未完全理解,但已知它们参与调节RNA的复制、转录和翻译等过程。
同时,某些RNA还具有翻译后调控作用。
生物分子的调控生物分子的调控是维持生物体正常生理功能和适应环境的重要过程。
它涉及到许多调控机制和分子间的相互作用,以确保各种生物分子在相应的时间和位置表达和功能。
本文将介绍常见的生物分子调控机制,包括转录调控、转录后调控、翻译调控和后转录调控等。
一、转录调控转录调控是指通过调控DNA的转录过程来控制基因表达水平。
这一过程主要通过转录因子与DNA结合来实现。
转录因子是一类具有特定序列结合能力的蛋白质,它们可以与启动子区域上的特定序列结合,促进或抑制基因的转录。
转录调控可通过增加或减少转录因子的表达、改变转录因子与DNA的结合能力等方式来实现。
二、转录后调控转录后调控是指在RNA合成完成后,通过调控RNA的稳定性和后修饰来影响基因表达水平。
这一过程主要包括RNA剪接、RNA修饰、RNA降解等。
RNA剪接是指将RNA前体经过剪接反应切割成不同的剪接体,以产生多种不同的mRNA。
RNA修饰是指通过添加或去除特定化学修饰物来改变RNA的性质和功能。
RNA降解则是指通过酶的作用将RNA降解为小碎片,从而降低mRNA的稳定性和表达水平。
三、翻译调控翻译调控是指在mRNA被翻译成蛋白质的过程中,通过调控翻译起始复合物的形成和翻译速率来影响蛋白质的合成。
这一过程主要包括转录后修饰、调控启动子区域上的特定序列和调控转运RNA的结合等。
转录后修饰是指通过特定的化学修饰和蛋白质结合来改变mRNA 的结构和功能。
调控启动子区域上的特定序列可以影响翻译起始复合物的形成和蛋白质的合成。
调控转运RNA的结合可以促进或抑制mRNA与转运RNA的结合,从而调控翻译的进行。
四、后转录调控后转录调控是指在蛋白质合成完成后,通过调控蛋白质的稳定性、定位和修饰来影响其功能。
这一过程主要包括蛋白质的降解、蛋白质的修饰和蛋白质的定位等。
蛋白质的降解是指通过泛素化作用和蛋白酶的作用将蛋白质降解为小碎片。
蛋白质的修饰是指通过磷酸化、甲基化、乙酰化等化学修饰来改变蛋白质的性质和功能。
转录水平和翻译后修饰在真核细胞中的调控和控制机制真核细胞是生物学中一类重要的细胞类型,与原核细胞相比,其特点在于拥有更加复杂的细胞结构和更加精细的基因表达调控机制。
在真核细胞中,基因表达调控主要包括转录水平和翻译后修饰两个层面。
这两个层面的调控和控制机制既有相似之处,也有明显的差异。
转录水平的调控和控制机制转录水平是指DNA序列转录成mRNA的速率,是基因表达的关键环节。
在真核细胞中,转录水平主要受到转录因子、染色质和mRNA稳定性等多种因素的调控。
第一,转录因子的作用。
转录因子是一类在基因转录过程中发挥关键作用的蛋白质,主要分为转录激活因子和转录抑制因子。
转录激活因子的主要作用是增强基因转录水平,而转录抑制因子则起到抑制基因转录的作用。
第二,染色质结构的调控。
在真核细胞中,DNA和组蛋白一起形成染色质的基本单位——核小体。
染色质的紧密度对转录水平产生重要作用。
乙酰化和去乙酰化等化学修饰作用可以增强或降低染色质的紧密度,从而影响转录水平。
第三,mRNA稳定性的调控。
mRNA在合成后的寿命长短决定了其在基因表达中的重要程度。
mRNA稳定性受到多种调控因素的影响,其中包括外界刺激、RNA降解途径以及RNA的复合物等。
翻译后修饰的调控和控制机制翻译后修饰是指蛋白质在翻译完成后,通过一系列化学修饰来调节蛋白质的功能和特性。
在真核细胞中,翻译后修饰主要包括糖基化、磷酸化、甲基化等多种形式。
第一,糖基化的作用。
糖基化是一种最常见的翻译后修饰形式,可以通过分子图谱等多种技术手段进行检测。
糖基化可以影响蛋白质的抗原性、稳定性以及代谢途径等方面。
第二,磷酸化的作用。
磷酸化是一种重要的翻译后修饰形式,将磷酸基添加到特定的氨基酸残基上,从而改变蛋白质的电荷、构象和降解途径等方面。
磷酸化是细胞中一种非常常见的信号转导方式,可以参与到多种生理和病理过程中。
第三,甲基化的作用。
甲基化是一种比较特殊的翻译后修饰形式,可以通过DNA甲基化和蛋白质甲基化实现。
蛋白表达的调控方式蛋白表达是指在基因水平上,基因信息通过转录和翻译转化为蛋白质的过程。
蛋白质在生物体内具有重要的调节和功能作用,因此在各种生物学研究和工业应用领域都有广泛应用。
以下是蛋白表达的调控方式。
(1)转录调控转录调控是指在转录水平上对蛋白表达进行调控的方式。
转录调控主要包括DNA序列上的启动子、核素间区域和转录因子等多个因素的调控作用。
转录因子在启动子或核素间区域与DNA结合,从而促进或抑制转录的进行。
(2)转移RNA调控转移RNA是一类将氨基酸转移到蛋白质合成位置的RNA分子。
在翻译过程中,转移RNA的选择性与扶持性等特征对蛋白表达的倍率和种类有着重要的影响。
因此,对于不同的细胞类型和环境压力,转移RNA的表达量和空间特性会发生变化,对蛋白质合成过程产生影响。
(3)RNA后转录调控RNA后转录调控主要包括RNA剪接、RNA编辑和RNA降解等多个机制。
其中,RNA剪接是指原始RNA在剪接前体RNA过程中去掉非编码区,生成成熟mRNA的方式;RNA编辑是指通过插入、删除或替换核苷酸的方式修饰mRNA序列,从而改变信使RNA的版本和蛋白产生的特性;RNA降解是指细胞通过RNA酶和RNase调节mRNA稳定性的过程,从而影响mRNA的寿命和蛋白表达水平。
(4)蛋白后转录调控蛋白后转录调控主要包括蛋白翻译后修饰、组合和定位等机制。
其中,蛋白翻译后修饰是指蛋白合成后通过磷酸化、脂肪酰化、甲基化等方式修饰蛋白质的功能和稳定性;蛋白组合是指将多个蛋白质组装成一个功能完整的蛋白,从而扩展蛋白的功能和稳定性;蛋白质定位是指通过信号肽和其他定位信号将蛋白质分配到细胞的不同组分,从而发挥相应的生物学作用。
总结起来,蛋白表达的调控方式非常复杂,涉及到在转录、RNA后转录和蛋白后转录等多个层次的作用,不同的调控机制相互影响,综合调节蛋白表达水平和品质。
SECTION 5转录和转录水平的调控重点:转录的反应体系,原核生物RNA聚合酶和真核生物中的RNA聚合酶的特点,RNA的转录过程大体可分为起始、延长、终止三个阶段。
真核RNA的转录后加工,包括各种RNA前体的加工过程。
基因表达调控的基本概念、特点、基本原理。
乳糖操纵子的结构、负性调控、正性调控、协调调节、转录衰减、SOS 反应。
难点:转录模板的不对称性极其命名,原核生物及真核生物的转录起始,真核生物的转录终止,mRNA前体的剪接机制(套索的形成及剪接),第Ⅰ、Ⅱ类和第Ⅳ类内含子的剪接过程,四膜虫rRNA前体的加工,核酶的作用机理。
真核基因及基因表达调控的特点、顺式作用元件和反式作用因子的概念、种类和特点. 以及它们在转录激活中的作用。
一.模板和酶:要点1.模板RNA的转录合成需要DNA做模板,DNA双链中只有一股链起模板作用,指导RNA合成的一股DNA链称为模板链(template strand),与之相对的另一股链为编码链(coding strand),不对称转录有两方面含义:一是DNA链上只有部分的区段作为转录模板(有意义链或模板链),二是模板链并非自始至终位于同一股DNA单链上。
2.RNA聚合酶转录需要RNA聚合酶。
原核生物的RNA聚合酶由多个亚基组成:α2ββ'称为核心酶,转录延长只需核心酶即可。
α2ββ'σ称为全酶,转录起始前需要σ亚基辨认起始点,所以全酶是转录起始必需的。
真核生物RNA聚合酶有RNA-polⅠ、Ⅱ、Ⅲ三种,分别转录45s-rRNA; mRNA(其前体是hnRNA);以及5s-rRNA、snRNA和tRNA。
3.模板与酶的辨认结合转录模板上有被RNA聚合酶辨认和结合的位点。
在转录起始之前被RNA聚合酶结合的DNA部位称为启动子。
典型的原核生物启动子序列是-35区的TTGACA序列和-10区的Pribnow盒即TATAAT序列。
真核生物的转录上游调控序列统称为顺式作用元件,主要有TATA盒、、CG盒、上游活化序列(酵母细胞)、增强子等等。
和顺式作用元件结合的蛋白质都有调控转录的作用,统称为反式作用因子。
反式作用因子已发现数百种,能够归类的称为转录因子(TF),相应于RNA-polⅠ、Ⅱ、Ⅲ的是TFⅠ、TFⅡ、TFⅢ。
TFⅡ又有A、B、C、D、E、F多种及其亚类。
基本概念:1.不对称转录: 两重含义,一是指双链DNA只有一股单链用作转录模板(模板链);二是对不同基因同一单链上某些区段作为模板链而另一些区段作为编码链,即模板链并非永远在同一单链上。
2.编码链: DNA双链上不用作转录模板的那一段单链,因其碱基序列除由T代替U而外,其他与转录产物mRNA序列相同而得名。
3.σ(sigma)因子: 原核生物RNA聚合酶全酶的成份,功能是辨认转录起始区,这种σ因子称σ70,此外还有分子量不同,功能不同的其他σ因子。
基本要求:掌握转录与复制的区别,转录的不对称性,原核生物的RNA聚合酶的组成及各亚基的功能,真核生物RNA聚合酶的分类、性质及功能,原核生物启动子的结构特点,了解真核生物RNA聚合酶的组成,研究转录起始区的方法。
二.转录过程1.转录起始:转录的起始就是生成由RNA聚合酶,模板和转录5'端首位核苷酸组成的起始复合物。
原核生物RNA5'端是嘌呤核苷酸(A、G),而且保留三磷酸核苷的结构,所以其起始复合物是:pppG-DNA-RNA聚合酶。
真核生物起始,生成起始前复合物(PIC)。
例如RNA-pol-Ⅱ转录,是由各种TFⅡ相互辨认结合,再与RNA聚合酶结合,并通过TF结合到TATA盒上.2. 转录延长:转录的延长是以首位核苷酸的3'-OH为基础逐个加人NTP即形成磷酸二醋键,使RNA逐步从5'向3'端生长的过程。
在原核生物,因为没有细胞膜的分隔,转录未完成即已开始翻译,而且在同一DNA模板上同时进行多个转录过程。
电镜下看到的羽毛状图形和羽毛上的小黑点(多聚核糖体),是转录和翻译高效率的直观表现。
3.录终止:转录的终止在原核生物分为依赖Rho因子与非依赖Rho因子两类。
Rho因子有ATP酶和解螺旋酶两种活性,因此能结合转录产物的3'末端区并使转录停顿及产物RNA脱离DNA模板。
非依赖Rho因子的转录终止,其RNA产物3'-端往往形成茎环结构,其后又有一串寡聚U。
茎环结构可使因子聚合酶变构而不再前移,寡聚U则有利于RNA不再依附DNA模板链而脱出。
因此无论哪一种转录终止都有RNA聚合酶停顿和RNA产物脱出这两个必要过程。
真核生物转录终止是和加尾(mRNA的聚腺昔酸poly A)修饰同步进行的。
RNA上的加尾修饰点结构特征是有AAAUAA序列。
基本概念:1.转录起始前复合物(pre-initiation complex,PIC):是真核生物转录因子与RNA 聚合酶一同结合于转录起始前的DNA区域而成的复合物。
2.加尾修饰点:真核生物mRNA转录不是在mRNA的位置上终止,而是在数百个核苷酸之后,研究发现在编码链读码框架的3'端之后,常有一组共同序列AATAAA,再下游还有相当多GC的序列,这些序列称为加尾修饰点,转录越过修饰点后,mRNA在修饰点处被切断,随即加入polyA。
3.Rho因子:是原核生物转录终止因子,有ATP酶和解螺旋酶活性。
转录终止也可不依赖Rho因子。
基本要求:掌握原核生物的转录起始复合物的形成过程,真核生物转录起始及起始前复合物(PIC)的生成,RNA聚合酶Ⅱ催化的转录起始过程中各种TFⅡ的作用,转录延伸过程中的化学反应,原核生物的转录终止的两种形式,真核生物的转录终止的修饰点。
了解原核生物RNA聚合酶的各种亚基与真核生物的各种转录因子之间的关系即拼版理论,原核生物转录空泡的形成及转录产物的释放过程。
三.真核RNA的转录后加工1.mRNA转录后加工真核生物转录生成的RNA,多需经加工后才具备活性,这一过程称为转录后修饰,mRNA转录后修饰包括首、尾修饰和剪接。
加尾修饰是和转录终止同步的,5'端修饰主要是指生成帽子结构,即把5'-pppG转变为5'-pmGpppG。
其过程需磷酸解、磷酸化和碱基的甲基化。
mRNA由hRNA加工而成。
真核生物基因由内含子隔断编码序列的外显子,是断裂基因。
内含子一般也出现在转录初级产物hRNA。
切除内含子,把外显子连结在一起,就是剪接加工。
在电镜下看到加工过程,内含子往往被弯曲成套索状,因此称为套索RNA。
现在知道剪接加工中,需要由多种Sn-RNA与蛋白质共同组成的并接体。
并接体和hnRNA上的内含子边界序列辨认结合。
剪接过程先由含鸟苷酸的酶提供3'-OH对其中内含子5'-端的磷酸二酯键作亲电子攻击使其断裂。
断裂的外显子3'-OH对内含子3'-端的磷酸二酯键作亲电子攻击,使刚断出的外显子完全置换了内含子,两个外显子就相连起来,因此这个过程称二次转酯反应。
2.tRNA转录后加工tRNA的转录后修饰,除了剪接加工外,还包括tRNA链上稀有碱基的形成,以及加上3'端的CCA序列。
3.rRNA的转录后加工rRNA加工多采用自我剪接的形式。
自我剪接的RNA本身形成一种特别的二级结构,称为锤头结构。
锤头结构是指复合的茎环组成形态,但其中某些序列上必需是特定的碱基所占据。
这种RNA结构,不需要任何蛋白质,就可以水解RNA链上某一特定位点的磷酸二酯键。
也就是说,这是一种起催化作用的RNA,现称为核酶。
核酶的发现,对酶学、分子生物学,进化生物学都是重要的理论更新,而且,医学上已开始利用人工设计的核酶,去消灭一些作为病原体的RNA病毒或消除一些不利于生命活动的细胞内RNA。
基本概念:1. 剪接修饰:RNA转录初级产物含有非编码组分,通过剪接除去非编码组分,把编码组份连接起来。
剪接修饰最常见的是靠并接体协助的二次转酯反应,此外还可有自我剪接及需酶的剪接等剪接方式。
2. 外显子:定义为断裂基因上及其转录初级产物上可表达的序列。
或转录初级产物上通过拼接作用而保留于成熟的RNA中的核苷酸序列或基因中与成熟RNA相对应的DNA序列.3. 内含子:早期定义为核酸上的非编码序列。
随着内含子功能的被拓宽,建议用"转录初级产物上通过拼接作用而被去除的RNA序列或基因中与这种RNA序列相对应的DNA序列"较全面。
4. 并接体:由snRNA和蛋白质组成的核糖核酸蛋白(核蛋白)复合物。
其功能是结合内含子两端的边界序列,协助RNA的剪接加工。
5. 核酶(ribozyme):具有催化功能(酶的作用)的RNA分子。
核酶能起作用的结构,至少含有3个茎(RNA分子内配对形成的局部双链),1至3个环(RNA分子局部双链鼓出的单链)和至少有13个一致性的碱基位点。
基本要求:掌握真核生物mRNA转录后5ˊ-端加帽;3ˊ-端加尾及mRNA链进行剪接修饰,tRNA及rRNA的转录后加工过程,了解内含子的其他剪接方式及功能,核酶的应用。
转录水平的调控一、基因表达调控基本概念与原理1、基因表达的概念基因是一段DNA分子,编码一种多肽链或RNA。
基因通过转录和翻译产生具有一定功能的蛋白质的过程。
大多数基因的表达产物是蛋白质,部分基因如rRNA和tRNA 基因的表达产物是RNA.2、基因表达的特点(A)、时间特异性或发育阶段特异性、(B)、空间特异性或组织细胞特异性,(C)、有两种表达方式,管家基因几乎在所有的细胞和所有的发育阶段持续表达,基本不受环境因素的影响,只受启动子调节。
另外一些基因的表达受环境因素的诱导或阻遏。
(D)、基因表达可在多层次上受到调节如基因、转录、转录后加工翻译和翻译后加工等水平上进行调节。
但最主要的是转录水平的调节,本章讨论的内容是原核基因和真核基因转录水平的调节。
3、基因转录激活的基本要素:(A)、特异的DNA调节序列是调节基因转录的DNA片段,如原核生物操纵子调控区中的启动序列、操纵序列、CAP蛋白结合位点和真核基因的启动子、增强子和沉默子等。
(B)、调节蛋白是调节基因转录的蛋白因子,如原核生物的阻遏蛋白和CAp蛋白、真核生物的基本转录因子和特异转录因子等。
、(C)、RNA聚合酶是催化基因转录最主要的酶。
原核生物只有一种RNA聚合酶,催化所有RNA的转录。
真核生物有三种RNA聚合酶,催化不同RNA的转录。
DNA调节元件和调节蛋白可以通过影响RNA聚合酶的活性来调接基因转录激活。
二、原核基因转录调控1.原核基因表达调节的特点:(A)σ因子决定RNA聚合酶识别特异性,帮助RNA聚合酶识别不同启动子,对不同基因进行转录。
(B)、转录调节普遍采用操纵子模式, 原核生物功能相关的基因往往串联地排列在一起,在一个共同的调控区的调节下,一起转录生成一个多顺反子,最终表达产物是一些功能相关的酶或蛋白质,它们-起参与某种底物的代谢或某种产物的合成。