实时荧光定量PCR原理及应用 (2)
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192018年11月总第301期ISSN1672-1438CN11-4994/T作者简介:安钢力,医学硕士,实验师。
聚合酶链反应(polymerasechain reaction PCR)技术是20世纪80年代中期发展起来的一项基因检测即一种体外核酸扩增技术。
它具有许多优点:特异性、易重复、高效性等,可以在几个小时完成过去几天或者更长时间完成的实验,因此这项技术在生物医学领域具有划时代的意义。
但是,传统PCR 技术有它的缺点,它通过电泳对扩增反应的最终产物进行定性分析而不能对起始模板准确定量,同时也无法对扩增反应实时检测且在实验过程中易污染而出现假阳性。
人们为了寻找更为灵敏、快速、简便、高特异性的方法进行了许多探索研究,直到1996 年由美国Applied Biosystems 公司推出了一种新的定量试验技术—荧光定量PCR(Flurogenic Quantitative Polymerase Chain Reaction ,FQ-PCR ;real-time quantitative PCR, RT-qPCR or qPCR),它是通过荧光染料或荧光标记的特异性探针,标记跟踪PCR 产物进行实时监测反应,利用与之相适应的软件对产物进行分析,计算待测样品模板的初始浓度,实现了PCR 从定性到定量质的跨越,具有里程碑意义。
目前,此项技术已应用于干细胞研究、肿瘤学和遗传疾病研究、病原体检测和传染病研究、药物分析、药物基因组学、植物学研究和农业生物科技等多领域研究中[1]。
本文对实时荧光定量PCR 的原理、分类和应用进行阐述。
1 实时荧光定量PCR 技术的原理real-time quantitative PCR 技术是指在PCR 反应体系中加入荧光基团,通过荧光信号不断累积而实现实时监测PCR 全程,然后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
在荧光定量PCR 技术中有2个概念比较重要。
(1)荧光域值(threshold)的设定:PCR 反应的前15个循环的荧光信号作为荧光本底信号,荧光域值的缺省设置是3~15个循环的荧光信号标准偏差的10倍。
实时荧光定量PCR的原理操作及其应用实时qPCR的基本原理是利用DNA模板进行PCR扩增,并通过特定荧光探针或抑制剂标记扩增产物,荧光信号的强度与目标模板数量成正比。
PCR扩增过程中,荧光信号逐渐累积,通过荧光检测系统实时监测荧光的强度变化,可以获取PCR扩增曲线,并通过比较样品的荧光信号与标准曲线建立一个浓度与荧光信号的转换关系,从而确定样品中目标物质的数量。
实时qPCR的操作过程通常包括以下几个步骤:1.准备反应体系:根据所需扩增物质选择合适的引物和探针,并根据样品数量和扩增条件计算所需反应体系的配方。
反应体系中通常包括DNA模板、引物、探针、dNTPs、缓冲液和DNA聚合酶等。
2.设定PCR程序:根据不同引物的特性和样品的要求,设置PCR程序。
PCR程序通常包括一个初始变性步骤,多个循环变性/退火/延伸步骤和一个终止步骤。
循环变性/退火/延伸步骤的温度和时间通常根据引物的需求进行设定。
3.反应体系装填:将反应体系装入PCR管或耐热反应板中,确保样品和反应物均匀分布。
4.实时监测:将PCR反应体系置于实时荧光PCR仪中,根据设定的PCR程序进行扩增,并实时监测荧光信号的累积变化。
5.数据分析:根据荧光信号的变化情况,可以绘制PCR扩增曲线,并通过计算荧光信号的阈值周期数(Ct值)来确定样品中目标物质的相对数量。
比较不同样品的Ct值,可以进行定量分析。
实时qPCR具有广泛的应用。
1.基因表达分析:可以通过实时qPCR检测特定基因在不同组织或样品中的表达水平,从而研究基因在生理和病理过程中的作用。
2.病原体检测:实时qPCR可以用于快速、准确地检测和鉴定病原体,如细菌、病毒和寄生虫等,对于临床诊断和流行病学研究具有重要意义。
3.检测基因突变:实时qPCR可以用于检测个体中基因突变的存在与否,并进行基因型分析,从而研究与疾病相关的突变和遗传变异。
4.微生物学研究:可以通过实时qPCR检测微生物的数量和动态变化,了解其在环境中的分布和生物地理学特征,以及其在食品安全、环境保护等方面的应用。
实时荧光定量PCR技术的原理及应用在PCR扩增反应结束之后,可对扩增产物进行定性和定量的分析。
但是无论定性还是定量分析,分析的都是PCR终产物。
但是在许多情况下,我们所感兴趣的是未经PCR扩增之前的起始模板量。
例如我们想知道某一转基因动植物转基因的拷贝数或者某一特定基因在特定组织中的表达量。
在这种需求下荧光定量PCR技术应运而生。
实时荧光定量PCR技术于1996年由美国Applied Biosystems公司推出,实现了PCR从定性到定量的飞跃。
1.实时荧光定量PCR技术的基本原理在实时荧光定量PCR 反应中,引入了一种荧光化学物质,随着PCR 反应的进行,PCR 反应产物不断累计,荧光信号强度也等比例增加。
所谓实时荧光定量PCR技术,是指通过对PCR 扩增反应中每一个循环产物荧光信号的实时检测从而实现对起始模板定量及定性的分析。
每经过一个循环,收集一个荧光强度信号,这样我们就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,从而得到一条荧光扩增曲线。
一般而言,荧光扩增曲线扩增曲线可以分成三个阶段:荧光背景信号阶段, 荧光信号指数扩增阶段和平台期。
在荧光背景信号阶段,扩增的荧光信号被荧光背景信号所掩盖,无法判断产物量的变化。
而在平台期,扩增产物已不再呈指数级的增加,PCR 的终产物量与起始模板量之间没有线性关系,所以根据最终的PCR产物量不能计算出起始DNA 拷贝数。
只有在荧光信号指数扩增阶段,PCR 产物量的对数值与起始模板量之间存在线性关系,可以选择在这个阶段进行定量分析。
在扩增曲线中:荧光阈值(threshold)是在荧光扩增曲线上人为设定的一个值,它可以设定在荧光信号指数扩增阶段任意位置上,荧光阈值的缺省设置是3~15个循环的荧光本底信号(baseline)标准差的10倍;Ct值的含义是指在PCR循环过程中,荧光信号开始由本底进入指数增长阶段的拐点所对应的循环次数,也就是每个反应管内的荧光信号达到设定的阈值时所经历的循环次数;Rn+表示每点测量的荧光强度,代表反应管含有模板DNA ;Rn-表示荧光基线强度,代表反应管不含有模板DNA,其在理想情况下是一条平线,只具有背景荧光数值;ΔRn表示PCR过程中,探针降解的量,也即PCR产物的量;基线( baseline)是背景曲线的一段,范围为从反应开始不久荧光值开始变得稳定,到所有反应管的荧光都将要但是还未超出背景。
简述实时荧光定量PCR技术的原理
实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR, qPCR)是一种用于检测和定量DNA或RNA的方法。
它结合了传统的PCR技术和荧光探针技术,可以实时监测PCR反应的进程,并根据荧光信号的强度来确定目标物质的数量。
实时荧光定量PCR的原理如下:
1. PCR反应体系:反应体系中包含目标DNA或RNA模板、引物(一对用于扩增目标序列的寡核苷酸片段)、荧光探针和酶。
荧光探针通常由一个与目标序列互补的序列和一个带有荧光物质和荧光物质猝灭物质的序列构成。
2. 扩增过程:PCR反应通过一系列的温度循环来进行。
首先是变性步骤,将DNA 或RNA模板变性为单链。
然后是退火步骤,引物与目标序列互补结合。
最后是延伸步骤,酶在合适的温度下合成新的DNA链。
3. 荧光信号检测:在PCR反应过程中,荧光探针与目标序列的结合会导致荧光信号的释放。
荧光信号的强度与目标序列的数量成正比。
实时荧光定量PCR系统可以实时监测荧光信号的强度,并记录下来。
4. 分析和定量:通过实时荧光定量PCR系统记录的荧光信号强度曲线,可以确定PCR反应的阈值周期数(CT值)。
CT值表示在达到阈值信号强度时,PCR 反应的循环数。
根据CT值,可以计算出目标序列在初始反应体系中的起始数量。
实时荧光定量PCR技术具有高灵敏度、高特异性和高准确性的特点,广泛应用于基因表达分析、病原体检测、突变分析等领域。
实时荧光定量PCR技术的原理及其应用引言实时荧光定量PCR(Polymerase Chain Reaction)技术是一种细胞遗传学和分子生物学研究中常用的分子检测技术。
它能够迅速、准确地进行DNA或RNA的定量测量,并在许多领域中广泛应用,例如基因表达分析、病原微生物检测和病毒定量等。
本文将重点介绍实时荧光定量PCR技术的原理和一些典型应用。
实时荧光定量PCR技术原理实时荧光定量PCR技术是在传统PCR反应的基础上发展而来的一种PCR变体。
其原理可以简单概括为光信号的实时检测和荧光强度的定量分析。
实时荧光定量PCR技术的具体步骤如下:1.引物与探针设计在实时荧光定量PCR反应中,合适的引物和探针设计是至关重要的。
引物用于在反应中特异性地扩增目标DNA或RNA序列,而探针则用于荧光信号的检测。
引物和探针的设计需要确保其与目标序列的亲和力和特异性,以避免非特异性扩增和假阳性结果。
2.标定曲线制备为了进行定量分析,需要事先制备一条标定曲线。
标定曲线通常是通过浓度已知的目标序列的一系列稀释样品制备的。
这些稀释样品经过PCR扩增后,荧光信号的强度与初始浓度呈线性关系。
通过测量待测样品的荧光信号强度,并利用标定曲线进行外推,可以获得目标DNA或RNA的定量结果。
3.PCR反应体系组装PCR反应体系的组装需要考虑到引物和探针的最优浓度,以及反应缓冲液、酶和模板DNA或RNA的最佳配比。
此外,反应体系中还需要加入辅助成分,如酶抑制剂和荧光染料,以提高PCR反应的特异性和灵敏度。
4.实时荧光检测及数据分析在PCR反应进行过程中,荧光信号会随着目标DNA或RNA的扩增而增强。
实时荧光定量PCR仪会实时监测和记录荧光信号的变化情况,并生成扩增曲线。
通过分析荧光信号的增长速度和荧光信号的峰值,可以确定目标DNA或RNA的起始浓度。
实时荧光定量PCR技术应用1. 基因表达分析实时荧光定量PCR技术在基因表达分析中被广泛应用。
实时荧光定量PCR的原理及应用1. 简介实时荧光定量PCR(Real-time quantitative polymerase chain reaction,简称qPCR)是一种强大的分子生物学技术,能够在同一反应体系中完成DNA扩增和定量,具有高灵敏度、高特异性和高精确性的优势。
本文将介绍实时荧光定量PCR 的原理和应用。
2. 原理实时荧光定量PCR基于传统PCR技术的基础上,引入荧光染料或探针来实时监测PCR反应过程中产生的增量扩增DNA量。
其原理如下:1.DNA模板的变性:通过加热将DNA模板的双链DNA变性成两个单链。
2.引物结合:待扩增的特定DNA序列的引物(Forward primer和Reverse primer)与模板DNA的互补序列结合。
3.DNA聚合酶扩增:DNA聚合酶沿着模板DNA链酶解附近的单链DNA,并将新的DNA链合成。
4.荧光信号监测:引入特定的荧光染料(如SYBR Green)或探针(如TaqMan探针),实时监测PCR反应体系中DNA扩增量的变化。
5.数据分析:使用特定的PCR仪器记录和分析荧光信号,根据荧光信号的变化量确定目标DNA序列的起始量。
3. 应用实时荧光定量PCR技术在许多领域中有广泛的应用,主要包括以下方面:3.1 疾病诊断与检测实时荧光定量PCR可以用于快速检测和诊断各种疾病,例如:•新型冠状病毒(COVID-19)检测•癌症标志物的检测•细菌和病毒感染的检测•遗传性疾病的检测3.2 基因表达分析实时荧光定量PCR可以用于研究基因的表达水平,包括:•基因表达差异分析•基因调控网络的研究•基因表达谱的分析•转录因子的研究3.3 环境监测实时荧光定量PCR可以应用于环境监测领域,用于检测和量化环境中的微生物和污染物,例如:•水质监测中细菌和病毒的检测•土壤中污染物降解菌的鉴定和定量•空气中微生物的检测3.4 遗传学研究实时荧光定量PCR在遗传学研究中也有广泛的应用,包括:•DNA定量和质量检测•突变检测和鉴定•群体遗传学分析•基因组学研究4. 总结实时荧光定量PCR技术是一种准确、高效、灵敏的分子生物学技术,广泛应用于医学、生物学、环境科学和农业等领域。
实时荧光定量PCR技术的原理及应用(图)、实时荧光定量PCR原理(一)定义:在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号累积实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。
(二)实时原理1、常规PCR技术:对PCR扩增反应的终点产物进行定量和定性分析无法对起始模板准确定量,无法对扩增反应实时检测。
2、实时定量PCR技术:利用荧光信号的变化实时检测PCR扩增反应中每一个循环扩增产物量的变化,通过Ct值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析3、如何对起始模板定量?通过Ct值和标准曲线对起始模板进行定量分析• 4、几个概念:(1 )扩增曲线斬确餅扩増曲钱图占横坐标:tr增褥环飒(Cv'cle) t纵坐标丈5?光强度每个摘环进行一次荧光信号的牧集(2) 荧光阈值:荧光伫卩阈『i (threshold ):□FTLStS环信号柞均荧光本底信号^baseline),即样本的荧光誉景值和開性对照的黄光值□黄光城嵋的缺省设置是”鮎十蓮环的茨光信号的恬准俄菱的10信口手动设■;忌剧慕丈于样本的荧光背倉值和阴性对黑的荧光星高值F同时要尽虽遥择进人指数期的最初阶段.并且保证回归系数大于699□真正的信号I荣光信号超过域值CT值的重现性:纵轴:菟光信号星楫轴;pcRwgimCt值的特点’■相同模板进行9就扩增,终点处产物量不恒定,・Ct值则极貝重现性5、定量原理:理想的PCR反应:X=Xo*2n非理想的PCR反应:X=Xo (1+Ex) nn:扩增反应的循环次数X :第n次循环后的产物量Xo:初始模板量Ex :扩增效率5、标准曲线: "ind «r口模板DNA®越多.荧光达到域值的循环数越少,即仕值越小口Log浓度与循环数呈线性关系,通过已知起始拷贝数的标准品可作出标准曲线,根据样品G值*就可以计算岀样品中所含的模板量6、绝对定量1 )确定未知样品的C(t )值2)通过标准曲线由未知样品的C(t)值推算出其初始量7、DNA的荧光标记:二、实时荧光定量PCR的几种方法介绍方法一:SYBR Gree n 法(一)工作原理1、SYBR Green 能结合到双链DNA的小沟部位2、SYBR Green 只有和双链DNA结合后才发荧光3、 变性时,DNA 双链分开,无荧光4、 复性和延伸时,形成双链 DNA , SYBR Green 发荧光,在此阶段采集荧光信号r1■ 一 11J1 w-" -1 -_____________________ - ______________________________ 1-|--1 ■Tm 值:DNA 解链一半时的温度1/! ■ /“I 1 I1au i〈TTm[14■<W4$14Vl[iHHfW Awe]•将温度与荧光强度的变化求导乜Cdl/dT)脏解曲涉务析卜出睨杂吃 其悒&關出现非料异性荧 光’因此宦量丁准确U 模板DNAfi g 多.荧光达到 域值的循环数越少□ Log 浓度与循环数呈线性关 系,根据样品G 值.就可以计算 出样品中所含的模板量PCR 反应体系的建立及优化:1、SYBR Green 使用浓度:太高抑制Taq 酶活性,太低,荧光信号太弱,不易检测2、 Primer :引物的特异性高,否则扩增有杂带,定量不准3、 MgCI2的浓度:可以降低到1.5mM,以减少非特异性产物4、 反应Buffer 体系的优化5、 反应温度和时间参数:由酶和引物决定6、 其他与常规 PCR 相同 (二) 应用范围 1、起始模板的测定;2、 基因型的分析;3、 融解曲线分析:可以优化PCR 反应的条件,对常规PCR 有指导意义,如对primer 的评价;可以区分单一引物、引物二聚体、变异产物、多种产物。
实时荧光定量PCR的原理操作及其应用实时荧光定量PCR的基本原理是在PCR反应体系中添加一种或多种荧光标记的探针,它与目标序列的特定区域互补,当探针与目标序列结合时,荧光信号被激发,产生荧光发射。
随着PCR反应的进行,目标序列的数量增加,荧光信号也随之增强。
通过实时监测PCR扩增过程中的荧光信号强度的变化,可以推断出起始模板的数量。
操作上,实时荧光定量PCR主要分为两个步骤:反转录和PCR。
首先,反转录将RNA逆转录合成cDNA,得到DNA模板。
然后,在PCR反应中,将DNA模板与荧光标记的探针、引物和核酸酶混合,开始PCR扩增。
PCR反应体系中的荧光探针在PCR扩增过程中的特定温度下与目标序列结合,产生荧光信号。
荧光信号被特定的光学设备检测和记录,得出PCR产物的数量。
实时荧光定量PCR具有广泛的应用领域。
在基因表达分析方面,qPCR可以用来定量测量特定基因的转录水平,研究基因的表达模式和差异。
在病原微生物检测方面,qPCR可以快速、准确地检测和鉴定细菌、病毒和寄生虫等病原体。
在遗传疾病诊断和监测方面,qPCR可以检测一些突变、插入或缺失等遗传变异,并进行遗传病的筛查与诊断。
此外,qPCR还可以用于检测和定量分析环境样品中的微生物、植物和动物等生物种群,了解物种多样性、群落结构和生态系统功能。
实时荧光定量PCR的优点包括高灵敏度、高特异性、高准确性和高重复性。
与传统PCR方法相比,qPCR不需要进行凝胶电泳分析,减少了实验操作的时间和手动操作的误差。
另外,荧光定量PCR还可以采用多通道检测不同靶标,提高实验的高通量性。
然而,实时荧光定量PCR也有一些局限性。
首先,荧光标记的探针需要根据目标序列的特点设计,设计不当可能会导致假阳性或假阴性结果。
其次,荧光信号的准确性受到反应物质的浓度和质量的影响,需要进行严格的实验操作和数据分析。
此外,实时荧光定量PCR的设备和试剂比传统PCR更昂贵,需要专业的实验室设施和经验。
实时定量荧光pcr原理
实时定量荧光PCR(quantitative Real-Time PCR)是一种基于PCR技术的高效、准确且可靠的DNA分析方法。
其主要原理
是通过在PCR反应过程中实时监测DNA扩增产物的累积量,从而定量测定起始DNA模板的数量。
实时定量荧光PCR的核心是使用荧光探针的方法来定量检测PCR反应过程中的DNA扩增产物。
在PCR反应中,荧光探
针包含一个荧光染料和一个荧光素(quencher)分子。
当探针
与PCR反应中的模板DNA序列互补结合时,荧光染料与荧光素分子之间距离较远,荧光信号强度较高。
而当PCR反应进
行到延伸阶段,DNA聚合酶酶活将荧光探针的酶切位点切除,导致荧光染料与荧光素分子之间距离缩小,荧光信号强度降低。
根据荧光信号的变化情况,可以推算出PCR反应过程中DNA
扩增产物的实时累积量。
为了实现定量测定,实时定量荧光PCR还需要设置一个标准
曲线。
首先,制备一系列包含已知浓度的DNA标准品,然后
通过实时定量荧光PCR测定这些标准品的荧光信号。
根据标
准品荧光信号与其对应浓度之间的关系,构建标准曲线。
最后,通过比较待测样品的荧光信号与标准曲线,可以确定样品中的DNA起始数量。
实时定量荧光PCR在科学研究和临床诊断中具有广泛应用。
它可以用于分析基因表达水平、研究遗传变异、检测病原体等。
相比传统的定量PCR方法,实时定量荧光PCR具有灵敏度高、
精确性好、操作简便等优点,成为分子生物学领域中不可或缺的实验技术之一。
实时荧光定量pcr原理实时荧光定量PCR(qPCR)是一种用于检测DNA或RNA的定量分析技术,它结合了PCR技术和实时荧光检测技术,可以实现对目标序列的快速、准确和高灵敏度的定量检测。
本文将介绍实时荧光定量PCR的原理及其在科研和临床诊断中的应用。
首先,实时荧光定量PCR的原理是基于PCR技术和荧光探针技术的结合。
在PCR过程中,DNA或RNA模板会被特异性引物引导进行扩增,同时荧光探针与目标序列结合并释放出荧光信号。
随着PCR的进行,目标序列的数量会不断增加,荧光信号也会随之增加。
利用荧光检测仪器可以实时监测PCR反应体系中的荧光信号强度,从而实现对PCR反应过程的实时监测和定量分析。
实时荧光定量PCR的优势在于其高灵敏度、高特异性和高准确性。
相比于传统的终点荧光定量PCR,实时荧光定量PCR可以在PCR反应过程中实时监测目标序列的扩增情况,从而可以准确地确定起始模板的数量。
此外,实时荧光定量PCR还可以通过荧光探针的设计实现多重PCR反应的同时检测,大大提高了检测的通量和效率。
在科研领域,实时荧光定量PCR被广泛应用于基因表达分析、病原微生物检测、基因突变分析等领域。
通过实时监测PCR反应过程中的荧光信号,可以准确地确定不同样本中目标基因的表达水平,从而揭示基因在生理和病理过程中的作用。
在临床诊断中,实时荧光定量PCR也被用于病原微生物的检测和基因突变的筛查,其高灵敏度和高特异性使其成为临床诊断的重要辅助手段。
总之,实时荧光定量PCR作为一种高效、准确的定量分析技术,已经成为科研和临床诊断中不可或缺的工具。
其原理简单、操作方便,可以快速、准确地实现对DNA或RNA的定量分析。
随着技术的不断进步和发展,相信实时荧光定量PCR在科研和临床诊断中的应用前景将更加广阔。
实时荧光定量pcr检测原理实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR)是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。
这种方法通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析。
Real-timePCR是在PCR扩增过程中,通过荧光信号,对PCR进程进行实时检测。
由于在PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系,所以成为定量的依据。
实时荧光定量PCR的基本原理是利用DNA聚合酶的5’-3’外切酶活性,在DNA合成过程中检测荧光信号的变化。
当DNA聚合酶与特定荧光染料标记的DNA引物结合时,荧光染料会被标记在引物的3’端。
在PCR反应过程中,每当DNA聚合酶添加一个核苷酸到引物3’端时,聚合酶的外切酶活性将荧光染料从引物上切割下来,释放出荧光。
通过实时检测荧光信号的变化,可以实时监测DNA的合成过程。
实时荧光定量PCR的定量原理是利用PCR扩增的指数时期,模板的Ct值和该模板的起始拷贝数存在线性关系。
在PCR扩增的指数时期,随着循环次数的增加,DNA产物的量呈指数增长。
在这个阶段,每个循环的DNA产物量与上一个循环的DNA产物量成比例。
因此,通过实时检测荧光信号的变化,可以确定PCR进程中的DNA产物量。
由于每个模板的起始拷贝数不同,因此不同模板的Ct值也不同。
通过比较不同模板的Ct值,可以确定模板的起始拷贝数。
实时荧光定量PCR具有许多优点,如高灵敏度、高特异性和高自动化程度。
它可以用于多种类型的样本检测,包括血液、组织、细胞培养液等。
此外,实时荧光定量PCR还可以用于基因表达分析、突变检测和病原体鉴定等应用。
实时荧光定量PCR是一种非常有用的技术,可以用于多种类型的样本检测和分析。
它的基本原理是利用DNA聚合酶的外切酶活性和荧光染料标记的引物来实时监测DNA的合成过程。
通过比较不同模板的Ct值,可以确定模板的起始拷贝数,从而实现定量分析。
实时荧光定量PCR原理及应用一、原理:1.荧光探针原理:a. TaqMan探针:TaqMan探针是由小分子荧光染料和一个捕获目标序列的DNA探针构成。
在PCR过程中,TaqMan探针会结合到特定的目标序列上,当DNA聚合酶在PCR反应中扩增特定序列时,探针被加性外切酶活性所降解,导致荧光信号逐渐降低,通过荧光信号的减弱来量化目标DNA的数量。
b. SYBR Green探针:SYBR Green探针是一种可以与双链DNA特异性结合的染料,当SYBR Green与PCR产物结合时,荧光信号增加。
通过测量荧光信号的增加来量化目标DNA的数量。
c. Molecular Beacons:Molecular Beacons是由在末端带有荧光分子和淬灭荧光的猝灭体构成的。
在PCR过程中,当Molecular Beacons与目标序列匹配时,荧光信号释放,通过测量荧光信号的释放来量化目标DNA的数量。
2.PCR反应原理:a.变性:将含有目标DNA序列的模板DNA样品与引物和荧光探针混合,加热至高温,使DNA双链解除成两股单链DNA。
b.引物结合:将反应体温度降低,引物结合到目标DNA序列的特定区域,并与模板DNA进行互补组装。
c.扩增:在DNA聚合酶的作用下,引物在模板上逐渐沿着DNA链延伸,产生新的DNA片段。
每一轮PCR循环结束后,荧光信号会相应地增加。
二、应用:1.目标基因表达分析:可以用实时荧光定量PCR测定特定目标基因的表达水平,从而研究基因的功能、调控机制或者生理功能的变化。
2.病原体检测:实时荧光定量PCR可以检测和定量各种病原体,例如病毒、细菌、真菌等。
常见的应用包括检测呼吸道病原体、性传播疾病病原体、食物中污染的细菌等。
3.肿瘤检测:实时荧光定量PCR可以用于肿瘤相关标志物的检测,帮助早期筛查和诊断肿瘤。
4.遗传突变检测:可以通过实时荧光定量PCR检测人类基因中的突变位点,提供遗传病检测和个体基因组分析的支持。
实时荧光定量pcr的原理和方法实时荧光定量PCR(qPCR)是一种分子生物学技术,用于检测和定量特定DNA或RNA序列的存在和相对丰度。
它可以在短时间内快速、准确地测量目标序列的数量,并在许多领域中被广泛应用,包括基因表达分析、病原体检测和基因突变分析等。
实时荧光定量PCR的主要原理是通过放大DNA模板,并使用荧光探针或染料进行实时监测。
这些荧光探针通常是DNA寡核苷酸序列,带有一个共振能量转移对(RET pair),由一个荧光引物(donor)和另一个荧光引物(acceptor)组成。
在初始的PCR循环中,通过在高温下使DNA变性,使两个引物和DNA分离。
在下一个低温的退火步骤中,这两个引物会与DNA互补结合。
当两个引物结合到DNA模板上时,它们的荧光引物也会接近彼此,从而使共振能量转移发生,导致荧光信号减弱或消失。
这种现象被称为荧光淬灭。
当PCR循环继续进行时,每个复制周期会以指数级增加DNA模板的数量。
由于引物的结合会导致荧光淬灭,因此在每个PCR循环的末尾,荧光信号将与DNA模板的数量成正比。
实时荧光定量PCR中常用的荧光探针有探针PCR和SYBR Green。
探针PCR使用两个引物和一个荧光探针,该探针带有一个荧光团和一个辅助荧光团。
在荧光探针与DNA模板结合时,两个荧光团之间的共振能量转移会发生,导致荧光信号的减弱。
SYBR Green则是一种将DNA结合的染料,在PCR循环中,SYBR Green会与所有DNA结合,并发出荧光信号。
使用探针PCR时,可以通过测量荧光信号的减弱来确定目标DNA的存在量。
而使用SYBR Green时,可以通过测量荧光信号的增加来判断目标DNA的数量。
实时荧光定量PCR的操作过程如下:1. DNA提取和纯化:从样品中提取所需的DNA或RNA,并经过纯化处理,以去除可能干扰PCR反应的杂质。
2. 引物设计:设计适合的引物和荧光探针,以在PCR反应中特异性地扩增目标序列。
实时荧光定量PCR原理操作及其应用实时荧光定量PCR的原理是通过PCR反应循环进行DNA扩增,同时使用特定的荧光探针进行反应监测。
通常使用SYBR Green I染料或荧光探针(例如TaqMan探针或Molecular Beacons)来标记扩增的目标序列。
SYBR Green I染料可以与双链DNA结合,并产生荧光信号,使荧光信号量和PCR产物量成正比。
而荧光探针则与靶标区域特异性杂交,并在PCR 反应中产生荧光信号。
1.DNA/RNA提取:从样品中提取目标DNA或RNA,确保提取的质量和纯度满足后续PCR反应的需求。
2.引物设计:设计和合成适当的引物,用于扩增目标序列。
引物应该具有高特异性,确保只扩增目标序列,而不出现非特异性扩增。
3.qPCR反应体系:配置PCR反应体系,包括引物、模板DNA/RNA,核酸酶、聚合酶、缓冲液和荧光探针(如果使用)。
4.PCR反应程序:设置PCR反应程序,通常包括初步变性、扩增和检测阶段。
PCR循环次数根据目标序列的丰度和检测灵敏度来确定。
5.监测荧光信号:在PCR反应过程中实时监测荧光信号的强度。
根据荧光信号大小可以计算目标序列的拷贝数。
1.基因表达分析:通过qPCR可以定量检测和分析基因在不同生物样品(如组织、细胞)中的表达水平。
2.病原体检测:qPCR可以快速检测和定量病原微生物(如细菌、病毒、真菌)的DNA或RNA,用于临床诊断和流行病学调查。
3.突变分析:qPCR可以检测和定量基因突变,用于遗传病的诊断和研究。
4.体外诊断:qPCR可以用于检测和定量很多疾病相关的生物标志物,如肿瘤标志物、心脏病标志物等,用于疾病的早期诊断和疗效评估。
5.生物学研究:qPCR可以用于研究和分析基因调控、DNA修复、细胞周期等生物过程,以及研究新的基因和基因功能。
总之,实时荧光定量PCR技术可以实时、准确和敏感地定量检测并扩增DNA或RNA的特定序列,具有广泛的应用前景,对于许多研究和诊断领域都具有重要意义。
实时荧光定量PCR技术的原理与应用PCR技术是分子生物学中非常重要的分析手段,具有高效、灵敏、快速的特点。
而实时荧光定量PCR技术是PCR技术的一种重要应用,因其具有高精准、可靠性强的特点,在医学、生物工程等领域得到广泛应用。
本文将介绍实时荧光定量PCR技术的原理、优点和应用,以便更好地了解和应用该技术。
一、实时荧光定量PCR技术的原理实时荧光定量PCR技术是PCR技术进一步发展的产物,是一种可以对PCR扩增反应进行实时监测和测量的技术。
实时荧光定量PCR技术采用荧光探针来定量PCR扩增产物,具有高灵敏度、高精准度、自动化程度高等优点。
实时荧光定量PCR技术的基本原理是利用特殊荧光探针来定量PCR扩增产物。
荧光探针用于测量PCR扩增反应的进行程度,它具有独特的结构和物理性质。
荧光探针由两部分组成,一部分是荧光染料,另一部分是与染料相连的标记序列。
在PCR过程中,荧光探针与PCR扩增产物结合后,在DNA聚合酶的作用下,标记序列被切断,导致荧光染料释放出来,从而使荧光强度发生变化。
荧光强度的变化与PCR扩增产物量呈正比关系,样品产量越多,荧光信号越强,反之越弱。
二、实时荧光定量PCR技术的优点实时荧光定量PCR技术具有以下优点:1. 灵敏度高:实时荧光定量PCR技术可以检测极低数量的DNA分子,可以检测单个DNA分子。
2. 精准性高:实时荧光定量PCR技术可以精确测量PCR扩增产物的数量,可以避免使用传统的分析方法中存在的误差和测量误差。
3. 可靠性强:实时荧光定量PCR技术可以消除PCR扩增反应中的不确定性因素,减少用户操作的干扰,提高检测的可靠性和准确性。
4. 实时检测:实时荧光定量PCR技术可以在PCR扩增反应进行的同时,实时检测PCR扩增产物数量的变化情况,从而可以及时判断PCR反应的质量和结果。
三、实时荧光定量PCR技术的应用实时荧光定量PCR技术在医学、生物工程、农业等领域得到了广泛的应用。