泉方本地PubMed检索平台简介
- 格式:ppt
- 大小:1.66 MB
- 文档页数:32
PubMed简介及使用说明壹、简介PubMed为美国国家医学图书馆的美国国家生技资讯中心(NCBI)所制作之生物医学相关文献的书目索引摘要型资料库,目前收录1950年以来约1400多万笔生物医学相关书目资料,并提供部分免费及付费全文连结服务,需要收费的全文,读者可自行与出版社接洽。
较之于MEDLINE资料以生物医学、生命科学、生化学、行为科学为主,PubMed 资料库范围更涵盖了如下内容:1. 对于超出学科范围(如:资讯科学、航太科学) 的特定生命科学、医学、化学相关之期刊文章都会收录于本资料库中;2. 收录即将出版的医学论文;3. 已由NLM审核通过并已由PubMed Central典藏的全文文献亦收录之。
美国国家生技资讯中心(NCBI)制作了一系列的生物医学资料库如下:1.PubMed:生物医学文献书目索引摘要资料库。
2.Nucleotide:包含GenBank、RefSeq、PDB资料库中的人类基因序列资料。
3.Protein:整合了SwissProt、PIR、PRF、PDB、GenBank及RefSeq资料库中的资料,并可参照Taxonomy资料库,了解特定种类的蛋白质的在资料库中分类状况的相关说明。
4.Structure:分子构造资料库。
5.Genome:基因组合序列资料库。
6.PopSet:可查询某族群的基因序列,了解该族群演进之相关资料。
7.OMIM:遗传学资料库。
8.Taxonomy:在NCBI基因资料库中提及的微生物的核酸或蛋白质序列的分类状况之相关说明。
9.Books:收录C. elegans II.、Introduction to Genetic Analysis. 7th ed.、ModernGenetic Analysis.、Molecular Biology of the Cell. 3rd ed.、Molecular Cell Biology. 4th ed.、Retroviruses.等六本书。
PubMed中文使用手册一、PubMed 简介PubMed 是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW 的查询系统。
PubMed 是 NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的 MEDLINE、PREMEDLINE 与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有 1 亿字条的巨大数据库。
PubMed 也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。
PubMed 提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归 NCBI 所有,其内容包括:DNA 与蛋白质序列,基因图数据、3D 蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
二、页面介绍(更新很快,但其内容变化一般不大)在你的浏览器中的 URL 地址框中健入/pubmed/并单击回车键后,你将进入 Pubmed 的主页面。
如图:1. 主页面左侧框的介绍(注:Cubby 和 tutorial 为最新加入的):MeSh Browser 你可以用它来分层浏览 MesH 表Single Citation Matcher 通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
Batch Citation Matcher 用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
Clinical Queries 这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在 4 个范围:治疗、诊断、病原学与预后。
Old PubMed (使用以前的 PubMed 查询方式)关于每一项的具体使用方法, 后面将会有详细介绍。
Related ResourcesOrder Documents 提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。
Grateful Med 是对另一个 NLM 基于网络的查询系统的链接。
Grateful Med 也提供 MEDLINE的接入,并且还有一些其他的数据库如 AIDSLINE、HISTLINE 等等。
pubmed检索综述PubMed是生命科学和医学领域的一种重要文献检索工具,被广泛用于学术研究、医学实践和科学进展。
本文将深入探讨如何在PubMed上进行综述检索,以帮助研究人员更有效地获取相关文献,了解领域的最新动态。
1. PubMed简介在讨论综述检索之前,我们首先要了解PubMed的基本情况。
1.1 PubMed的来源PubMed是由美国国立医学图书馆(NLM)提供的免费文献数据库,涵盖了生物医学、生命科学和相关领域的大量文献。
1.2 PubMed的特点PubMed具有广泛的学科覆盖范围,包括医学、生物学、生物化学、药学等,是医学和生命科学领域研究者获取信息的重要工具。
2. 关键词的选择与构建在进行PubMed检索时,选择和构建合适的关键词是获取准确结果的关键。
2.1 主题词与自由词利用PubMed的主题词(MeSH词)和自由词进行关键词选择,以确保检索结果的广泛性和准确性。
2.2 同义词与扩展词考虑使用相关的同义词和扩展词,以涵盖不同表达方式的文献,提高检索的全面性。
2.3 关键词的组合合理组合关键词,使用AND、OR、NOT等逻辑运算符,构建复杂而精确的检索式,以确保检索结果符合研究目的。
3. 高级检索与筛选PubMed提供了丰富的高级检索和筛选功能,帮助研究者更精准地定位所需文献。
3.1 时间范围的设定通过设定检索时间范围,可以获取最新的研究成果,同时限制检索结果的数量。
3.2 文献类型的筛选在高级检索中,可以选择特定的文献类型,如综述、临床研究、病例报告等,以便更有针对性地获取信息。
3.3 作者、期刊和机构的限定通过指定作者、期刊或机构,可以进一步缩小检索结果的范围,确保文献的质量和相关性。
4. 利用PubMed工具优化检索PubMed提供了多种工具和功能,帮助用户更方便、更快速地进行文献检索。
4.1 My NCBI账户的建立通过建立My NCBI账户,用户可以保存检索历史、创建自定义检索、设置提醒等,提高检索的效率和个性化。
PubMed医学文献检索系统PubMed是因特网上重要的免费文献检索系统。
目前全球最著名的医学文献数据库系统是美国国立医学图书馆的MEDLINE,该数据库重数据免费提供给各个检索系统的开发商,因此在因特网上有重多的免费MEDLINE检索系统。
这些系统所涵盖的文献年代、检索结果的输出格式以及检索途径各不相同,但是,目前被医务人员广泛使用的仍然是美国国立医学图书馆的PubMed系统PubMed和NCBI:1.美国国立医学图书馆“NLM”2.早在1879年,编译医学文献的检索刊物IM3.1964年采用计算机进行电子编辑和排版,在此基础上开发了“医学文献分析与检索系统”(即著名的MEDLARS)4.1971年正式建立了钙系统的联机系统,称为“MEDLARS联机检索系统,MEDLARS online,既MEDLINE 系统。
5.PubMed则是NLM的国家生物信息中心(National Center for Biotechnology Information, NCBI)开发的一个以网络为基础的检索系统,自1997年免费提供服务PubMed ――特点:PubMed具有MEDLINE 所具有的各种检索和数据库优势,同时还具有以下特点:⏹连接广泛:包括对外链接和对内链接,对内指与NCBI其它数据库的链接和PubMed文献相似度计算后的相关文献链接,对外连接指出版商提供的文献全文的连接,有免费和需要注册的。
⏹更新速度快:出版商直接把电子版提供给NLM⏹收录文献范围广:三个层次的数据库:MEDLINE数据库、PreMEDLINE数据库和出版商直接提供的文献数据库等PubMed ――收录范围总体包括:⏹收录年限:1966~⏹收录内容:70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊的文献和一些非医学内容的文献,主要是MEDLINE。
内容涉及医学、护理、牙科、兽医、健康保健系统、前临床医学等学科,另外有非医学内容的文献,如science 和nature中具有地理学方面的文献。
PubMed简介及使用说明壹、简介PubMed为美国国家医学图书馆的美国国家生技资讯中心(NCBI)所制作之生物医学相关文献的书目索引摘要型资料库,目前收录1950年以来约1400多万笔生物医学相关书目资料,并提供部分免费及付费全文连结服务,需要收费的全文,读者可自行与出版社接洽。
较之于MEDLINE资料以生物医学、生命科学、生化学、行为科学为主,PubMed 资料库范围更涵盖了如下内容:1. 对于超出学科范围(如:资讯科学、航太科学) 的特定生命科学、医学、化学相关之期刊文章都会收录于本资料库中;2. 收录即将出版的医学论文;3. 已由NLM审核通过并已由PubMed Central典藏的全文文献亦收录之。
美国国家生技资讯中心(NCBI)制作了一系列的生物医学资料库如下:1.PubMed:生物医学文献书目索引摘要资料库。
2.Nucleotide:包含GenBank、RefSeq、PDB资料库中的人类基因序列资料。
3.Protein:整合了SwissProt、PIR、PRF、PDB、GenBank及RefSeq资料库中的资料,并可参照Taxonomy资料库,了解特定种类的蛋白质的在资料库中分类状况的相关说明。
4.Structure:分子构造资料库。
5.Genome:基因组合序列资料库。
6.PopSet:可查询某族群的基因序列,了解该族群演进之相关资料。
7.OMIM:遗传学资料库。
8.Taxonomy:在NCBI基因资料库中提及的微生物的核酸或蛋白质序列的分类状况之相关说明。
9.Books:收录C. elegans II.、Introduction to Genetic Analysis. 7th ed.、ModernGenetic Analysis.、Molecular Biology of the Cell. 3rd ed.、Molecular Cell Biology. 4th ed.、Retroviruses.等六本书。