生物信息学 - 浙江大学邮件系统
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浙江大学-浙江大学电子邮件系统浙江大学大学生科研训练计划(SRTP)项目名称:立项负责人姓名:参与项目完成人姓名:立项人所在学院(系):联系电话:电子邮件:填表日期:本科生院教研处制表填表须知1.SRTP宗旨:大学生科研训练计划(Student Research Training Program 简称SRTP)是本科实践教育教学改革的重要举措之一,宗旨是充分发挥我校学科门类齐全、教学资源丰富、师资力量雄厚的优势,通过教师或学生立项,给予一定科研经费的资助,为本科生提供科研训练的机会,使学生尽早进入各专业科研领域,接触学科前沿,了解学科发展动态;增强学生创新意识,培养学生创新和实践动手能力;加强合作交流,培养团队协作精神,提高学生综合素质。
2.结题目的:①进一步规范SRTP组织管理工作;②培养学生申请立项、结题、答辩和撰写研究成果简介的科研训练全过程;③不断总结SRTP工作经验,进一步推进和提高SRTP质量;④鼓励和促进SRTP研究成果的发表和转化;⑤完成SRTP《研究成果简介》和优秀论文的汇编。
3.凡编入浙江大学SRTP指南的项目都要按期、按时填写SRTP项目结题表。
SRTP立项研究时间为1年期项目(每年6月---第二年5月),要求在第二年4月填写项目结题表,学院(系)组织答辩。
4.结题表中第一页SRTP项目《研究成果简介》将作为每期研究成果汇编和评估的主要材料,务必请填表人认真按提纲要求(重点从项目研究结果、成效、特色、创新点和推广应用等依次加以阐述)撰写。
SRTP《研究成果简介》字数控制在600---800文字,不附图表,要求表述明确,字迹清晰,建议用计算机打印一份上交学院(系)本科教学管理科。
学生结题项目负责人务必并将《浙江大学SRTP项目结题表》上传至《浙江大学本科生创新网》。
5.项目结题表填写后及时上交学院(系)本科教学管理科,组织答辩和成绩评定,学院(系)SRTP指导小组审核签署意见,学院盖章后。
浙江大学信息中心网络用户服务指南(2010研新生)为了方便2010新生在学习和工作中尽快熟悉和利用学校网络资源,信息中心将为2010级新生提供试用帐号(含浙江大学电子邮件信箱),帐号名为学号,初始密码为身份证后六位,试用期为一个月(至10月8日止)。
试用期满后,可通过校园卡充值继续使用该帐号(详见)。
现将访问校园网的有关注意事项通知如下:一、学生宿舍连通校园网方式:1、入住玉泉、西溪、华家池、之江校区学生宿舍,先到宿管中心办理IP-MAC地址绑定手续。
服务地址:玉泉校区:周一至周日8:30-11:30,13:00-17:00,1舍104室西溪校区:每周二上午8:30---11:30,西溪12幢122室华家池校区:每周二下午13:00---17:00,华家池3舍230室在非上述时间段内用户如需办理相关业务(绑定IP,),可通过以下几种方式:(1)、如需绑定或修改IP信息,可通过浙江大学学生公寓自助服务平台自助办理,访问:(2)、持有效证件(学生证、身份证)至玉泉校区网管会办公室办理。
时间:周一至周日8:30-11:30,13:00-17:00,地点:玉泉校区1舍104室。
宿舍网络报修热线:879334172、入住紫金港校区学生宿舍,需购买电信201+卡通过认证访问校园网;认证时输入“卡号@zheda”形式的认证信息。
宿舍网络报修热线:88981111校内资源可访问:二、访问互联网设置方法:1、虚拟VPN:点击信息中心主页/,点击“VPN接入”下载VPN客户端安装软件,按说明设置后,利用试用帐户(学号密码)拔号,即可访问教科网定义的地址列表内网络资源,包括QQ在线、病毒库升级、图书馆资料检索等应用。
2、电子邮箱:学号@登录邮件服务器主页收发邮件:三、帐户收费标准:试用期满后,可根据需要在自服务系统选择帐户包月类型并用校园卡缴纳费用。
帐户费用根据校有关文件规定如下:10元包月:可访问教科网允许范围内的网络资源;50元包月:访问资源不受限制。
生物信息学札记(第4版)樊龙江浙江大学作物科学研究所浙江大学生物信息学研究所浙江大学IBM生物计算实验室2017年9月本材料已由浙江大学出版社出版:《生物信息学》,樊龙江主编,2017部分内容可通过下列网址获得:/bioinplant/札记前言第一版这份材料是我学习和讲授《生物信息学》课程时的备课笔记,材料大多是根据当时收集的一些外文资料翻译编辑而成。
学生在学习过程中经常要求我给他们提供一些中文的讲义或材料,这促使我把我的这份笔记整理并放到网上,供大家参考。
要提醒使用者的是,这份材料仅是根据我对生物信息学的一些浮浅的认识整理而成,其中的错误和偏颇只能请读者自鉴了。
2001年6月第二版自1999年开始接触生物信息学以来,一晃已近六年,而本札记也近四岁了。
2001和2002年中国科学院理论物理所的郝柏林院士在浙江大学首次开设生物信息学研究生课程,我作为他的助教系统地学习了生物信息学;同时,借着我国水稻基因组测序计划的机遇,在他的带领下从2001年开始从事水稻基因组分析,从此自己便完全投入到这一崭新、引人入胜的领域中来。
不断有来信向我索要本札记的电子版文件,同时在不少网站上看到推荐该札记的内容。
生物信息学、基因组学等发展很快,现在再回头审看该札记,有些部分已惨不忍读,这促使我下决心更新它。
但因时间和学识问题,还是有不少部分自己不甚满意,就只有待日后再努力了。
欢迎告诉我札记中的BUG,我的信箱*************.cn或******************.cn。
2005年3月30日第三版近年来高通量测序技术产生的序列数据大量出现(如小RNA和大规模群体SNP数据),本次更新根据这一进展增加了两章内容,分别是第七章有关小RNA的分析和第八章遗传多态性及正向选择检测。
两章内容由我的博士生王煜为主编写,李泽峰和刘云参与了文献整理。
另外还更新了第四章有关水稻基因组分析一节。
2010年1月第四版2014年浙江大学开展本科生教材建设工作,我当时作为系主任要带头,就承诺编写我主讲的《生物信息学》教材。
红河学院《生物信息学》课程教学大纲一、课程基本情况与说明(一)课程代码:(二)课程英文名称:bioinformatics(三)课程中文名称:生物信息学(四)授课对象:生物科学和生物技术专业本科生(五)开课单位:生命科学与技术学院(六)教材:1、生物技术专业:《生物信息学应用技术》,王禄山、高培基编,化学工业出版社,2008年2、生物科学专业:《生物信息学基础》,孙啸、陆祖宏、谢建明编,清华大学出版社,2005年(七)参考书目[1]《生物信息学》,DavidW.Mount著,钟扬等译,高等教育出版社,2003年[2]《基因组数据分析手册》,胡松年、薛庆中编,浙江大学出版社,2003年[3]《生物信息学中的计算机技术(Developing Bioinformatics Computer Skills)》,CynthiaGibas,Per Jambeck著,孙超等译,中国电力出版社,2002年[4]《生物信息学:基因和蛋白质分析的实用指南》,Andreas D. Baxevanis,Francis OuelletteB F著,李衍达、孙之荣等译,清华大学出版社,2000年[5]《生物信息学算法导论(An Introduction to Bioinformatics Algorithms )》,琼斯,帕夫纳著,王翼飞等译,化学工业出版社,2007年(八)课程性质(五号宋体加粗)生物信息学是生命科学领域一门新兴的边缘学科,综合了生物学、计算机学、信息学、统计学等方面的知识。
该学科在学生掌握生物化学、遗传学、分子生物学以及计算机应用、高等数学等相关知识的基础上开设,属于生物类专业的专业课程(必修或选修)。
通过学习,学生能够加深对分子生物学和基因工程等课程的理解,并为进一步学习基因组学(genomics)和蛋白质组学(protemics) 奠定基础。
(九)教学目的1、给学生介绍生物信息学的主要内容以及未来可能的发展方向,为学生构建相关知识体系,开阔学生的视野,为将来进一步学习、科研打下基础。
生物信息学学习心得第一篇:生物信息学生物信息学是上世纪90年代初人类基因组计划(hgp)依赖,随着基因组学、蛋白组学等新兴学科的建立,逐渐发展起来的生物学、数学和计算机信息科学的一门交叉应用学科。
目前生物信息学的研究领域主要包括基于生物序列数据的整理和注释、生物信息挖掘工具开发及利用这些工具揭示生物学基础理论知识等领域。
生物信息学作为新型交叉应用学科,可以依托本校已有的计算机科学、信息学、生物学和数学等学科优势,充分展现投入少、见效快、起点高的特色,推动学校学科建设和本科教学水平。
本实验指导书中的8个实验均设计为综合性开发实验,面向生物信息学院全体本科学生和研究生,以及全校对生物信息学感兴趣的其他专业学生开放。
生物信息学实验室将提供系统的保障,包括采用mail服务器和linux帐号管理等进行实验过程管理和支持。
限选《生物信息学及实验》的生物技术专业本科生至少选择其中5个实验,并不少于8个学时,即为课程要求的0.5个学分。
其他选修者按照课时和学校相关规定计算创新学分。
实验一熟悉生物信息学网站及其数据的生物学意义实验目的:培养学生利用互联网资源获取生物信息学研究前沿和相关数据的能力,熟悉生物信息学相关的一些重要国内外网站,及其核酸序列、蛋白质序列及代谢途径等功能相关数据库,学会下载生物相关的信息数据,了解不同的数据文件格式和其中重要的生物学意义。
实验原理:利用互联网资源检索相关的国内外生物信息学相关网站,如:ncbi、sanger、tigr、kegg、swissport、ensemble、中科院北京基因组研究所、北大生物信息学中心等,下载其中相关的数据,如fasta、genbank格式的核算和蛋白质序列、pathway等数据,理解其重要的生物学意义。
实验内容:1.浏览和搜索至少10个国外和至少5个国内生物信息学相关网站,并描述网站特征;2.下载各网站的代表性数据各10条(组)以上,并说明其生物学意义;3.讨论各网站适合做何种生物信息学研究的平台,并设计一个研究设想。
生物信息学学习心得第一篇:生物信息学生物信息学是上世纪90年代初人类基因组计划(hgp)依赖,随着基因组学、蛋白组学等新兴学科的建立,逐渐发展起来的生物学、数学和计算机信息科学的一门交叉应用学科。
目前生物信息学的研究领域主要包括基于生物序列数据的整理和注释、生物信息挖掘工具开发及利用这些工具揭示生物学基础理论知识等领域。
生物信息学作为新型交叉应用学科,可以依托本校已有的计算机科学、信息学、生物学和数学等学科优势,充分展现投入少、见效快、起点高的特色,推动学校学科建设和本科教学水平。
本实验指导书中的8个实验均设计为综合性开发实验,面向生物信息学院全体本科学生和研究生,以及全校对生物信息学感兴趣的其他专业学生开放。
生物信息学实验室将提供系统的保障,包括采用mail服务器和linux帐号管理等进行实验过程管理和支持。
限选《生物信息学及实验》的生物技术专业本科生至少选择其中5个实验,并不少于8个学时,即为课程要求的0.5个学分。
其他选修者按照课时和学校相关规定计算创新学分。
实验一熟悉生物信息学站及其数据的生物学意义实验目的:培养学生利用互联资源获取生物信息学研究前沿和相关数据的能力,熟悉生物信息学相关的一些重要国内外站,及其核酸序列、蛋白质序列及代谢途径等功能相关数据库,学会下载生物相关的信息数据,了解不同的数据件格式和其中重要的生物学意义。
实验原理:利用互联资源检索相关的国内外生物信息学相关站,如:ncbi、sanger、tigr、kegg、swissport、ensemble、中科院北京基因组研究所、北大生物信息学中心等,下载其中相关的数据,如fasta、genbank格式的核算和蛋白质序列、pathway等数据,理解其重要的生物学意义。
实验内容:1. 浏览和搜索至少10个国外和至少5个国内生物信息学相关站,并描述站特征;2. 下载各站的代表性数据各10条(组)以上,并说明其生物学意义;3. 讨论各站适合做何种生物信息学研究的平台,并设计一个研究设想。
浙江大学大学生科研训练计划(SRTP)第十五期项目结题表项目名称:立项负责人姓名:参与项目完成人姓名:立项人所在学院(系):联系电话:电子邮件:填表日期:本科生院教研处制表填表须知1.SRTP宗旨:大学生科研训练计划(Student Research Training Program 简称SRTP)是本科实践教育教学改革的重要举措之一,宗旨是充分发挥我校学科门类齐全、教学资源丰富、师资力量雄厚的优势,通过教师或学生立项,给予一定科研经费的资助,为本科生提供科研训练的机会,使学生尽早进入各专业科研领域,接触学科前沿,了解学科发展动态;增强学生创新意识,培养学生创新和实践动手能力;加强合作交流,培养团队协作精神,提高学生综合素质。
2.结题目的:①进一步规范SRTP组织管理工作;②培养学生申请立项、结题、答辩和撰写研究成果简介的科研训练全过程;③不断总结SRTP工作经验,进一步推进和提高SRTP质量;④鼓励和促进SRTP研究成果的发表和转化;⑤完成SRTP《研究成果简介》和优秀论文的汇编。
3.凡编入浙江大学SRTP指南的项目都要按期、按时填写SRTP项目结题表。
SRTP 立项研究时间为1年期项目(每年6月---第二年5月),要求在第二年4月填写项目结题表,学院(系)组织答辩。
4.结题表中第一页SRTP项目《研究成果简介》将作为每期研究成果汇编和评估的主要材料,务必请填表人认真按提纲要求(重点从项目研究结果、成效、特色、创新点和推广应用等依次加以阐述)撰写。
SRTP《研究成果简介》字数控制在600---800文字,不附图表,要求表述明确,字迹清晰,建议用计算机打印一份上交学院(系)本科教学管理科。
学生结题项目负责人务必并将《浙江大学SRTP项目结题表》上传至《浙江大学本科生创新网》。
5.项目结题表填写后及时上交学院(系)本科教学管理科,组织答辩和成绩评定,学院(系)SRTP指导小组审核签署意见,学院盖章后。