第七章 系统发育与进化树

基因组学数据分析

研究进化基因组学进展摘要：进化基因组学是利用基因组数据研究差异基因功能、生物系统演化、从基因在水平探索生物进化的学科。随着近年来基因组数据的不断增加，进化基因组学得到了长足的发展。进化基因组学主要包括从基因组水平理解和诠释生物进化和新基因分析研究探索两方面的内容。本文介绍了进化基因组学研究的主要内容和较为常用的方法，以及近年来在细菌、酵母、果蝇进化基因组学方

生物五界：动物、植物、真菌、原生生物和原核生物；生物三界：真细菌、古细菌、真核生物具有催化活性的RNA分子称为核酶（ribozyme）核酶催化的生化反应有：自我剪接、催化切断其它RNA、合成多肽键、催化核苷酸的合成新基因的产生：基因与基因组加倍1）整个基因组加倍；2）单条或部分染色体加倍；3）单个或成群基因加倍。DNA水平转移：原核生物中的DNA水平转移可通

问:基因组学、转录组学、蛋白质组学、结构基因组学、功能基因组学、比较基因组学研究有哪些特点?答:人类基因组计划完成后生物科学进入了人类后基因组时代,即大规模开展基因组生物学功能研究和应用研究的时代。在这个时代,生命科学的主要研究对象是功能基因组学,包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。以功能基因组学为代表的后基因组时代主要为利用基因组学提供的信息。基因组研究应

真菌生命树的系统发生和系统基因组学近二三十年来，分子系统发生学从最初的建立到不断发展，已成为真菌的比较生物学的重要研究手段。曾经仅局限于分类学的系统树如今已广泛地应用到真菌生物学中并为了解主要生命形式的进化、描述复杂的生物群落以及实验生物学的预测提供了广泛的进化进化理论基础。在基因组领域这一趋势愈发显著，系统发生学和基因组学逐渐结合到一起并孕育出了一门崭新的

基因组学基本知识知识讲解

1.什么是基因组学？基因组学有哪些特点？以基因组分析为手段，研究基因组的结构组成、时序表达模式和功能，并提供有关生物物种及其细胞功能进化信息的一门学科。特点：Genome sciences are sequence-based，Genome sciences are data-guided (not so hypothesis-driven)，Genome

基因组学基本知识

功能基因组学及其研究方法

叶绿体系统发育基因组学的研究进展*张韵洁，李德铢＊＊（中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学重点实验室，云南昆明650201）摘要：系统发育基因组学是由系统发育研究和基因组学相结合产生的一门崭新的交叉学科。近年来，在植物系统发育研究中，基于叶绿体基因组的系统发育基因组学研究优势渐显端倪，为一些分类困难类群的系统学问题提出了解决方案，但同时也存在某些问

2009年 第54卷 第9期: 1250 ~ 1261 《中国科学》杂志社SCIENCE IN CHINA PRESS论 文美姑脊蛇Achalinus meiguensis 线粒体基因组全序列及系统发育地位研究王广力①, 何舜平②, 黄松③, 何苗①, 赵尔宓①④*① 四川大学生命科学学院, 成都 610064; ② 中国科学院水生生物研究所, 武汉 430

里白科及其近缘类群的系统发育基因组学研究石松类和蕨类植物是植物界最早登陆的靠孢子繁殖的维管植物,距今有近4亿年的演化历史。其特殊的演化地位对于研究整个植物界的系统发育和环境变迁都具有十分重要的意义。在过去的20多年里,随着分子系统学方法的使用,使得对蕨类植物的演化有了更加深入的理解。但是,在几个关键节点上的系统发育关系依然存在很多争议。例如在薄囊蕨类的基部类

第七章分子系统发育分析 进化树

基因组学基本知识

细首科纽虫分子系统发育及三种纽虫线粒体基因组的研究细首科(Cephalothricidae)隶属纽形动物门古纽目(Palaeonemertea)。由于其有限的形态学特征及形态学鉴定本身的复杂性，而成为分类学中较为混乱的类群之一。有关线细首科系统发育的研究较少，尤其从分子水平上来研究线细首科纽虫系统发育关系目前还未见报道。本研究将以细首科纽虫为研究对象，验证统

系统发育基因组学详解

植物分类学报 46 (6): 795–807 (2008) doi: 10.3724/SP.J.1002.2008.08081 Journal of Systematics and Evolution (formerly Acta Phytotaxonomica Sinica) 基因树冲突与系统发育基因组学研究邹新慧 葛颂*(系统与进化植物学国家重点实验室

构建系统发育树的方法

2017基因组学试题1.什么是基因组（5分）？什么是转录组（5分），简述基因组和转录组的关系和异同之处（15分）？基因组（Genome）：在生物学中，一个生物体的基因组是指包含在该生物的DNA（部分病毒是RNA）中的全部遗传信息，这种遗传信息以核苷酸序列形式存储。基因组包括基因和非编码DNA。因此，基因组应该指单倍体细胞中包括编码序列和非编码序列在内的全部D