PubMed使用手册
一、PubMed简介：
PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统，是NCBI的Entrez系统的数据库之一。该系统通过网络途径免费提供包括MEDLINE在内的70多外国家4800多种主要生物医学文献的书目索引文摘数据库，并提供部分免费和付费的全文链接服务。
二、页面介绍:
登录/entrez/ query.fcgi后，你将进入Pubmed的主页面。如图：
主页面左侧框的介绍：
1) MeSH Database你可以用它来分层流览MesH表
2) Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
3) Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
4) Clinical Queries这一部分为临床医生设置，通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围：治疗、诊断、病原学与预后。
5) Related Resources
• Order Documents提供一种收费性质服务，可以使用户在当地得到文献的全文拷贝（费用与发送方式各不相同）。
• Consumer Health提供与MEDLINEplus的链接，MEDLINEplus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。
• Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。
三、检索方法：
1.PubMed基本检索方式(Basic PubMed Search)
进入PubMed基本检索方式主页，在检索框中可以输入任意词，包括文献作者，出版杂志等：
• 键入一个或多个检索词(可以为任意词)，如protein disulfide isomerase ,也可以输入缩略名如pdi等；输入多个词时，可自动识别成词组；但词数太多时，则以逻辑与的方式识别，如可以将protein disulfide isomerase识别成一个词，也有可能将其识别成“protein AND disulfide AND isomerase”尤其是出现数字等符号时不易识别成词组；
PubMed使用指南
PubMed简介
PubMed是美国国家医学图书馆 (NLM) 所属的国家生物技术信息中心 (NCBI) 开发的因特
网生物医学信息检索系统，位于美国国立卫生研究院（NIH）的平台上。该系统通过网络途
径免费提供包括MEDLINE在内的自1950年以来全世界70多个国家4300多种主要生物医
学文献的书目索引和摘要，并提供部分免费和付费全文链接服务。
PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于
WWW的查询系统。
PubMed是NCBI Entrez 数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed 是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务，MEDLINE
是一个拥有1亿字条以上的巨大数据库。
PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接，来自第三方的生物 学数据，序列
中心的数据等等。
PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务，这个数据库归NCBI所有，其内
容包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据、3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线。
PubMed使用指南
1， PubMed使用指南之：如何获取PubMed全文？
当很多人开始了解PubMed，并且逐渐得心应手的时候，都会面临一个棘手的问题，即如何
获取全文？的确，PubMed真正向公众（public）免费开放的只是摘要部分，而绝大部分文
章都没有全文提供。其实，只要我们掌握一些技巧，还是有可能获得一些文章的全文的。
一、PubMed
PubMed上约有5％的文献是可以免费看到全文的，通常这些文献的左上角会有一个Free Full
Text的小标记（ ）。你只要点击这个图标，系统就自动链接入该文献的全文。但有两点值得
注意的是，第一，很多时候，这个图标在PubMed处于显示简要（summary)状态下并不出现，
而只有在选择显示摘要（abstract)时才出现。因此，如果你不只是泛泛浏览，而希望看到全
PubMed检索系统简介
PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心（NCBI）开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆（U.S.National Library of Medicine）最重要的书目文摘数据库，内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊，现有书目文摘条目1000万余条，时间起自1966年。
PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据，可为用户提供基本的文献条目和文摘，其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。
PubMed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据，这种条目带有[MEDLINE
record in process]的说明，并标有[Record as supplied by publisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送，但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围，将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代，例如在综合性的科学杂志（Science或Nature）上发表的地理学文章等。
PubMed 系统的主要特点
1.词汇自动转换功能（Automatic Term Mapping）
在PubMed主页的检索提问框中键入检索词，系统将按顺序使用如下4种表或索引，对检索词进行转换后再检索。
（1）MeSH转换表（MeSH Translation Table），包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词，就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词（题名词和文摘词）进行检索。例如：键入“Vitamin h"，系统将其转换成"Biotin [MeSH Tems]
OR Vitamin h [Textword]"后进行检索。
第3章 PubMed检索
PubMed是因特网上最著名的免费Medline数据库，是由美国国立医学图书馆的生物信息技术中心（National Center for Biotechnology Information ，NCBI)提供的，其网址为：/PubMed/。该系统于1997年开始使用，与以往的Medline光盘数据库相比，它具有收录范围广、更新速度快、界面友好等特点，并且由于NCBI与多家出版商达成协议，出版商在期刊出版之前或在期刊出版的同时，将期刊论文题录提供给PubMed, 通过部分文献的链接可到达出版商的网站，从而获取相应期刊的全文。
3．1 PubMed的收录范围
PubMed的数据主要有4个部分，即Medline、OLDMEDLINE 、In Process Citations、Record Suppled by Publisher。
Medline：与我们通常使用的Medline数据库收录的范围、年代、内容相同，但数据更新速度较快。
OLDMEDLINE:收录了1950－1965年间的美国医学索引（IM）中的题录。
In Process Citations：是一个临时性的数据库，收录准备进行标引的题录和文摘信息，每天都在接受新的数据，进行文献的标引和加工，每周把加工好的数据加入到Medline中，同时从In Process Citations库中删除。In Process Citations中的记录标有[PubMed- in
process]的标记。
Record supplied by publisher：出版商将期刊文献信息电子版提供给PubMed后，每条记录都标有[PubMed- as supplied by publisher]的标记，这些记录每天都在不停地向In Process Citations库中传送，加入到In Process Citations后，原有的标记将改为[PubMed- in process]的标记。
