pubmed数据库操作
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pubmed文献检索方法摘要:一、PubMed简介二、文献检索方法1.基本检索2.高级检索3.检索策略三、检索实例四、检索技巧1.关键词选择2.运用布尔操作符3.限制检索范围五、文献管理与分析工具六、总结与建议正文:一、PubMed简介PubMed是由美国国立卫生研究院(NIH)开发和维护的一个免费生物医学文献数据库,包含了大量的生物医学、生命科学、化学等领域的研究文献。
它为广大科研工作者、医生和药师等提供了便捷的文献查询途径。
二、文献检索方法1.基本检索在PubMed首页,可以通过输入关键词或输入文献的题名、作者、出版年份等进行基本检索。
基本检索的结果会按照相关性排序。
2.高级检索点击检索框下方的“高级检索”按钮,可以进入高级检索界面。
高级检索允许用户对检索词、检索范围、文献类型等进行更详细的设定,从而提高检索的准确性。
3.检索策略在检索过程中,可以采用一些策略提高检索效果。
例如,使用截词符(*)进行词干检索,或将关键词用引号括起来进行精确检索。
三、检索实例以下是的一个检索实例:假设我们想查找关于“新冠病毒”(SARS-CoV-2)的研究文献,可以在检索框中输入“SARS-CoV-2”或“新冠病毒”,然后点击检索按钮。
检索结果会包括与新冠病毒相关的文章,如病毒基因序列、疫苗研究、治疗方法等。
四、检索技巧1.关键词选择选择合适的关键词是提高检索效果的关键。
可以通过查阅相关领域的专业词典、综述文章等,了解研究领域的主要术语和概念。
2.运用布尔操作符布尔操作符(AND、OR、NOT)在检索过程中起到筛选和组合检索词的作用。
例如,输入“新冠病毒AND 疫苗”,可以检索到同时涉及新冠病毒和疫苗的文章。
3.限制检索范围在检索过程中,可以通过设置文献类型、发表年份、语言等限制条件,缩小检索范围,提高检索的针对性。
五、文献管理与分析工具PubMed提供了多种文献管理与分析工具,如引文导出、文献收藏、文献标签等。
第3章 PubMed检索PubMed是因特网上最著名的免费Medline数据库,是由美国国立医学图书馆的生物信息技术中心(National Center for Biotechnology Information ,NCBI)提供的,其网址为:/PubMed/。
该系统于1997年开始使用,与以往的Medline 光盘数据库相比,它具有收录范围广、更新速度快、界面友好等特点,并且由于NCBI与多家出版商达成协议,出版商在期刊出版之前或在期刊出版的同时,将期刊论文题录提供给PubMed, 通过部分文献的链接可到达出版商的网站,从而获取相应期刊的全文。
3.1 PubMed的收录范围PubMed的数据主要有4个部分,即Medline、OLDMEDLINE 、In Process Citations、Record Suppled by Publisher。
Medline:与我们通常使用的Medline数据库收录的范围、年代、内容相同,但数据更新速度较快。
OLDMEDLINE:收录了1950-1965年间的美国医学索引(IM)中的题录。
In Process Citations:是一个临时性的数据库,收录准备进行标引的题录和文摘信息,每天都在接受新的数据,进行文献的标引和加工,每周把加工好的数据加入到Medline中,同时从In Process Citations库中删除。
In Process Citations中的记录标有[PubMed- in process]的标记。
Record supplied by publisher:出版商将期刊文献信息电子版提供给PubMed后,每条记录都标有[PubMed- as supplied by publisher]的标记,这些记录每天都在不停地向In Process Citations库中传送,加入到In Process Citations后,原有的标记将改为[PubMed- in process]的标记。
pubmed数据库的使用方法本文以 pubmed中的一篇文章 Inhibition of Notch pathway attenuates the progression of human immunodeficiency virus-associated nephropathy. 为例来说明pubmed数据库的使用方法。
在pubmed中检索到该篇文章后,网址是 /pubmed/23389453在页面左侧稍微靠上的地方,显示有该文章所属的期刊名字,如下图所示:上图中棕色横线标注处显示的就是收录该文章的期刊的名字(是缩写),鼠标移动到该缩写的期刊名字上后,会弹出提示框显示该期刊的全名。
棕色横线标注处同行的后边是这篇文章在该期刊中是哪一年的哪一期以及该文章的doi编号等信息。
双击棕色横线标注处的链接,将可以查看该期刊的更多详细信息。
页面的右上角有时候会显示出该篇文章的全文获取链接,如下图所示:在上图的棕色横线标注处,有时可以看到一个矩形的图标,那就是该篇文献的全文下载链接。
点击该链接将来到收录该文章全文的期刊或者数据库的该篇文章的网络下载页面,例如该篇文献的网络下载页面如下图所示:上图红色链接标注处出现了一个登陆框,要求进行登陆,这表明你没有下载该篇文献的权限。
上图中绿色横线标注处是当你有此篇文献下载权限时,点击下载文献全文的位置。
没有该篇文献全文下载权限的话,是无法下载到此文献的,如果您是通过seek68数字图书馆提供的pubmed入口来到此页面,则有很大机会直接就具有该篇文献的下载权限,如下图所示:上图是通过seek68提供的pubmed入口下载文献有该篇文献下载权限时出现的页面,大家可以比较与上一图的不同之处,即没有出现登陆框,并且绿色横线标注处也有所不同,提示您点击绿色横线标注处的链接即可以下载到此文章。
不过pubmed并不是对所有文章都给出全文下载链接,此时就需要根据pubmed所揭示的该文章被收录于什么期刊或者什么数据库等信息,来到相应的期刊或数据库网址中下载文章。
PubMed中文使用手册(一)PubMed简介:PubMed是美国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的查询系统。
PubMed是NCBI Entrez数个数据库查询系统下中的一个。
PubMed是提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE与其他相关数据库接入服务,MEDLINE是一个拥有1亿字条的巨大数据库。
PubMed也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接,来自第三方的生物学数据,序列中心的数据等等。
PubMed提供与综合分子生物学数据库的链接与接入服务,这个数据库归NCBI所有,其内容包括:DNA与蛋白质序列,基因图数据、3D蛋白构象,人类孟德尔遗传在线。
(二)页面介绍:(更新很快,但其内容变化一般不大)在你的浏览器中的URL地址框中健入/pubmed/并单击回车键后,你将进入Pubmed的主页面。
如图:1. 主页面左侧框的介绍(注:Cubby和tutorial为最新加入的)MeSh Browser你可以用它来分层浏览MesH表Single Citation Matcher通过填表的形式输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
Batch Citation Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4个范围:治疗、诊断、病原学与预后。
Old PubMed(使用以前的PubMed查询方式)关于每一项的具体使用方法,后面将会有详细介绍。
Related ResourcesOrder Documents提供一种收费性质服务,可以使用户在当地得到文献的全文拷贝(费用与发送方式各不相同)。
Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。
Grateful Med也提供MEDLINE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。
pubmed检索步骤-回复Pubmed检索步骤:从主题到有效结果在进行学术研究时,一个重要的步骤是通过PubMed进行文献检索。
PubMed是一个免费的、由美国国家医学图书馆维护的生物医学文献数据库,在该数据库中,你可以搜索并访问数百万篇医学、生物医学和健康科学方面的期刊文章。
本文将详细介绍如何使用PubMed进行检索,以及一些技巧和注意事项,以确保你找到的结果是有效且有价值的。
第一步:明确主题和目的在开始之前,我们应当明确自己的研究主题和目的。
对于这个示例,我们将以“运动对健康的影响”作为主题进行检索。
这个主题非常广泛,我们可能需要进一步缩小范围或明确研究的特定方面。
第二步:使用关键词进行初始化搜索关键词是你最常用的工具,以确保找到的文章与你的研究主题相关。
将你的关键词输入到PubMed的搜索栏中,点击搜索按钮,将会得到一系列与关键词相关的文章列表。
在这个例子中,我们可以输入“exercise and health”作为初始搜索关键词。
注意,关键词应当简明扼要,并尽可能涵盖你研究主题的不同方面。
第三步:筛选和缩小范围初始搜索结果往往会产生大量的文章,但并不是每篇文章都与你的主题有关。
这时,你需要筛选和缩小范围,以找到最相关的文章。
你可以使用多种方法来缩小搜索结果的范围,其中一种常用的方法是使用筛选器。
筛选器可以根据文章的出版日期、文章类型、作者、研究范围等标准进行筛选。
你可以根据自己的需要,使用这些筛选器来优化搜索结果。
此外,你还可以添加其他关键词、使用逻辑操作符(如“AND”、“OR”、“NOT”)来进一步缩小范围,甚至可以利用高级搜索功能来更精确地找到相关文章。
在这个例子中,我们可以使用筛选器将文章的出版日期限定在过去5年内,将文章类型限定为研究论文,以缩小搜索结果的范围。
第四步:评估和筛选文章在筛选和缩小搜索结果范围后,我们需要对找到的文章进行评估,以确定哪些文章是与我们的研究主题相关且有效的。
pubmed的主要检索规则
PubMed是一个免费的生物医学文献数据库,主要包含了生物
医学、生命科学和相关领域的学术文章。
以下是PubMed的主
要检索规则:
1. 使用关键词检索:用户可以在PubMed的搜索框中输入与所
需信息相关的关键词,例如特定疾病、研究领域、药物名称等。
可以使用布尔运算符(AND、OR、NOT)来组合关键词,以
便更精确地进行检索。
2. 使用限制条件:用户可以使用限制条件来缩小检索结果的范围。
例如,可以通过选择特定时间范围、特定语言、特定研究类型(如临床试验、回顾性研究等)来限制检索结果。
3. 使用注册号检索:用户可以使用PubMed的搜索框来搜索特
定文献的注册号,如PubMed唯一的标识号(PMID)或国际
标准序列号(ISBN)等。
4. 使用高级搜索:PubMed还提供了高级搜索选项,用户可以
使用更多的搜索条件和筛选器来进行更精确的检索。
例如,用户可以在高级搜索中指定作者、期刊、出版日期等限制条件。
5. 使用Mesh词检索:PubMed还使用了医学主题词(Medical Subject Headings,简称Mesh)的术语系统来标注和分类文章。
用户可以使用Mesh词来更精确地检索文章并获得相关的研究
结果。
需要注意的是,PubMed的检索规则可能会根据平台的更新而有所变化。
因此,用户在使用PubMed检索时应根据具体的要求和搜索介面的提示进行操作。
PubMed数据库一.检索Genbacev O 等撰写的关于“胎盘氧张与胎儿生长的关系”的文章。
要求写出:①第一篇文章的原文出处,②第一篇原文后附第一篇参考文献中的第一作者的姓名。
操作步骤:1.在地址栏中输入/pubmed,进入PubMed2.在检索栏中输入 placenta growth oxygen genbacev o,点击Go3.点击题录中作者姓名如: Genbacev O,得到文摘,点击出处下方免费获取全文(free textarticle)红色按钮。
4.在原文最后找到Reference(参考文献),得到第一篇作者姓名。
二.用MeSH Database 检索肾衰竭饮食疗法的文献。
要求:第一作者Rao M的工作单位及E-mail地址。
操作步骤:1.进入PubMed主页,点击主页左侧中MeSH Database,进入MeSH Database网页2.在检索栏中输入renal failure, 点击Go3.在主题词注释页中,点击kidney failure。
4. 选副主题词(subheadings) 中的diet therapy (饮食疗法),选择send to下的Search Boxwith AND。
5.在返回结果页的检索框中"Kidney Failure/diet therapy"[MESH]后输入Rao M,点击PubMedSearch。
三.查找Challis DE作为第一作者发表于Pediatric Research 2000,47(3):309-15上的论文,并写出其他合著者。
操作步骤:1. 进入PubMed主页,在主页的左侧栏中点击Single Citation Matcher。
2. 按要求输入著者、刊名、卷、年等信息,点击search 按钮。
基因序列获取与同源性对比一.用NCBI查找人类抗癌基因(human antioncogene)的核酸序列报告,要求:写出序列号和碱基数,并拷贝原序列(Origen)。
概述:
PubMed是一个生命科学领域的文献数据库,是生物医学文献检索的重要工具。
本文对PubMed数据库的使用做一个简要介绍,以帮助读者更好地利用这个数据库进行文献检索。
1. PubMed数据库的结构和特点:
PubMed数据库是由美国国立卫生研究院(NIH)的国家医学图书馆(NLM)开发维护的。
它是一个免费的公共数据库,收录了生物医学和生命科学领域的大量学术文献,包括期刊文章、会议论文、学位论文等。
2.检索策略:
(1)关键词检索:根据文献的关键词进行检索。
关键词可以是疾病名、药物名、基因名等。
使用AND、OR、NOT等逻辑符号来组合关键词,以缩小或扩大范围。
(2)高级检索:在PubMed的高级界面中,可以通过使用多个字段、设置日期范围、对检索结果进行限定等方式,更精确地进行文献检索。
3.结果筛选和排序:
(1)限制结果:通过在界面的左侧面板中选择相关选项,可以限制结果的类型、语言、年份等。
(2)排序方式:结果默认按相关性排序,但也可以按出版日期、被引用次数等进行排序。
4.期刊和发表者信息:
5.数据库更新与同步:
(1)PubMed数据库每周更新,保持最新的文献信息。
(2)可以通过RSS订阅或设置自动更新来获取最新的文献信息。
6.其他功能和工具:。
pubmed 教程--pubmed使用全攻略(1)第一章进入PubMed魔法学校--PubMed 概述无论何时何地,你只要在浏览器地址栏中输入:/pubmed/就可以立刻进入PubMed的界面并开始享受PubMed所给你带来的无穷便利。
进入PubMed的主界面后,首先映入我们眼帘的就是页面上方的检索框和功能键(如下图)。
这是PubMed的核心部分。
大部分工作,我们只要利用这"一框五键"(检索框,Limit键, Preview/Index键, History键,Clipboard键和Details键)即可完成。
在主界面的左侧框(如左图),有:• Journal Browser 期刊浏览• MeSh Browser可以用它来分层流览MeSH表• Single Citation Matcher(单引文匹配)输入期刊的信息可以找到某单篇的文献或整个期刊的内容。
• Batch Citution Matcher用一种特定的形式输入期刊的信息一次搜索多篇文献。
• Clinical Queries这一部分为临床医生设置,通过过滤的方式将搜索的文献固定在4 个范围:治疗、诊断、病原学与预后。
• Old PubMed (使用旧式的PubMed查询方式)3) Related Resources• Order Documents可以使用户在当地得到文献的全文,但这是要收费的,至于如何免费获得文献全文,我将在后面的有关章节中详述。
• Grateful Med是对另一个NLM基于网络的查询系统的链接。
Grateful Med也提供MEDLI NE的接入,并且还有一些其他的数据库如AIDSLINE、HISTLINE等等。
• Consumer Health提供与MEDLINEplus的链接,MEDLINEplus是与消费者健康信息相关的国家医学图书馆的网络节点。
• Clinical Alerts此部分的目的是加快NIH资助的临床研究成果的发布。