小麦TaPK7基因单核苷酸多态性与抗旱性的关系
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作物学报 ACTA AGRONOMICA SINICA 2008,34(9):1537-1543
ISSN 0496—3490;CODEN TSHPA9 http://www.chinacrops.org/zwxb/
E—mail:xbzw@chinajourna1.net.cn
DoI:10.3724/SP.J.1006.2008.01537
小麦TaPK7基因单核苷酸多态性与抗旱性的关系
张洪映 , 毛新国 景蕊莲 谢惠民 , 昌小平
f 中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程/农业部作物种质资源与生物技术重点开放实
验室,北京100081; 西北农林科技大学农学院,陕西杨凌712100)
摘 要:以抗旱性不同的45份六倍体小麦和5份小麦的二倍体近缘种为材料,通过测序检测TaPK7基因的单核苷酸
多态性,研究了TaPK7基因多态性与抗旱性的关系,旨在为发掘利用小麦抗旱基因资源奠定基础。50份材料TaPK7
序列总长220 448 bp,其中有64个SNP和9个InDel,二者的频率分别为1 SNP/3 445 bp和1 InDel/24 494 bp。编码
区的核苷酸多样性 值小于非编码区,可能是由于编码区承受的选择压力较大。同义突变( )与非同义突变(Ks)比值
是0.415,表明该基因受负向选择影响,属于相对保守基因。在编码区检测到16个单核苷酸突变,多存在于抗旱材料
中。共检测到21种单倍型,其中5种为强抗旱材料单倍型,2种为干旱极敏感材料单倍型,1 1种中等抗旱材料单倍型,
另外3种单倍型中同时包括抗旱材料和干旱敏感材料,初步揭示了TaPK7基因的单核苷酸多态性与抗旱性相关。
关键词:小麦;TaPK7基因;单核苷酸多态性;抗旱性;单倍型
Relationship between Single Nucleotide Polymorphism of TaPK7 Gene
and Drought Tolerance in Wheat
ZHANG Hong—Ying , ,MAO Xin—Guo ,JING Rui—Lian ' ,XIE Hui—Min ’ ,and CHANG Xiao—Ping
f National Key Facility for Crop Gene Resources and Genetic Improvement/Key Laboratory of Crop Germplasm&Biotechnology.the Ministry of
Agriculture/Institute ofCrop Sciences,ChineseAcademy ofAgricultural Sciences,Beijing100081; CollegeofAgronomy,NorthwestA&FUniver- sity,Yangling 712100,Shaanxi,China)
Abstract:Protein phosphorylation/dephosphorylation are major signaling events induced by abiotic swesses in higher plants.
Sucrose nonfermenting 1一related protein kinase2(SnRK2),which belongs to serine—threonine protein kinase,plays an important
role in the process of sugar signal transduction.It is reported that the gene family is activated by hyperosmotic stress and relays
the stress signal via phosphorylation.TaPK7 gene,a member of SnRK2 gene family of wheat(Triticum aestivum L.),is involved
in the response to osmostic stress,such as drought,high salt,low temperature,and ABA treatment in wheat seedlings.To investi—
gate the relationship between single nucleotide polymorphism(SNP)in TaPK7 and drought tolerance,45 hexaploid wheat acces—
sions and 5 diploid species of wheat relatives were used to detect SNP of TaPK7 through sequencing.Sixty four SNP and nine
InDel were detected in a total of 220 448 bp nucleotide acids.and the frequencies of SNP and InDel were 1 SNP/3 445 bp and 1
InDel/24 494 bp,respectively.The nucleotide diversity value in non—coding region was higher than that in coding region,which
suggested that the coding region suffered stronger selection pressure than non—coding region.Ka/Ks value of TaPK7 was 0.415,
which indicated that TaPK7 was a conservative gene.Sixteen SNPs were observed in coding region,and most of them happed in
drought—tolerant accessions.A total of 2 1 haplotypes were identified from the plant materials.Among them,7 haplotypes of
TaPK7 were only related to accessions with drought—tolerant or drought—sensitive characteristics,1 1 haplotypes contained me—
dium—drought—tolerant accessions,but 3 haplotypes contained both types of accessions.SNPs in TaPK7 were correlative with
drought tolerance,but it couldn’t explain the mechanism of drought tolerance completely in wheat.
Keywords:Wheat;TaPK7 gene;Single nucleotide polymorphism;Drought tolerance;Haplotype
基金项目:国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2006AAl00201);国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2004CB117205)
作者简介:张洪映(1982一),女,硕士研究生,研究方向:小麦抗旱节水遗传育种。E—mail:zhangying198215@163.tom 通讯作者(C0rresp0nding authors):景蕊莲,E-mail:jingrl@caas.net.cn;谢惠民,E-mail:Huiminx@nwsuaf.edu.cn
Received(收稿日期):2008—01—14;Accepted(接受日期):2008—03 30.
维普资讯 http://www.cqvip.com 作物学报 第34卷
干旱缺水是制约农业生产发展的重要因素。20
世纪90年代以来,全国每年平均受旱面积达2 667
万hm ,造成粮食减产7~8千万吨l1】。小麦是人类最
主要的粮食作物,研究并利用其抗旱基因资源的多
样性,对于抗旱性的遗传改良具有重要意义。生物
蛋白质的磷酸化和脱磷酸化是逆境条件下体内能量
代谢和信号传递中的重要反应,蛋白磷酸化通过蛋
白激酶催化完成。蛋白激酶在渗透等非生物胁迫的
信号转导中起关键作用_2】。SnRK2属于蔗糖非发酵
相关蛋白激酶 引。在烟草 、大豆 1等植物中SnRK2
基因家族参与对渗透胁迫的应答反应。小麦TaPK7
基因是SnRK2基因家族成员之一,实时定量
RT PCR检测发现,小麦幼苗中TaPK7参与对高渗、
高盐、低温和ABA处理的应答反应,尤其对高渗和
高盐胁迫反应迅速,其1 h的表达量就达到对照的
1 5.3倍和23.9倍 J。单核苷酸多态性(single nucleo.
tide polymorphism,SNP)是基因组DNA上某一特定
核苷酸由于转换、颠换、插入、缺失等变化而造成
的DNA序列多态性,作为新一代高通量的遗传标记,
在植物多样性、群体遗传、系统进化与功能基因组
学等领域发挥了重要作用 J。SNP广泛而稳定地存在
于植物基因组中,基因的SNP多态性影响基因的功
能。目前,SNP标记在拟南芥 剐、水稻 、马铃薯 。]
等植物中已得到应用。因此,研究小麦抗旱相关基
因的SNP多态性与抗旱性的关系对于发掘利用优异
抗旱基因资源具有重要意义。本研究以抗旱性不同
的六倍体小麦和小麦二倍体近缘种为材料,通过测
序筛查TaPK7的单核苷酸多态性,研究该基因多态
性与抗旱性的关系,为发掘利用小麦抗旱基因资源
奠定基础。
1材料与方法
1.1植物材料
供试材料(表1)种子均由中国农业科学院国家种
质资源库提供,包括45份六倍体小麦,其中极强抗
旱、强抗旱、中等抗旱、干旱敏感和干旱极敏感材
料分别为4、1 1、17、4、9份。5份小麦的二倍体
野生近缘种,含1份乌拉尔图小麦(Triticum urartu,
AA),1份栽培一粒小麦(Triticum monococcum,AA),
1份拟斯卑尔脱山羊草(Aegilops speltoides,SS,B基
因组供体),2份粗山羊草(Ae.tauschii,DD)。
1.2小麦苗期抗旱性鉴定
根据GB/T 21 127—2007“小麦抗旱性鉴定评价技 术规范”(http://www.sac.gov.cn/templet/default)进行
小麦苗期抗旱性鉴定。在长60 cm、宽40 cm、高15
cm的塑料箱中装入10 cm厚耕层土(中等肥力壤土),