生物技术制药重点及名词解释
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实用文档 生物技术制药
第一章 绪论 药学一级学科分类:药物化学、药剂学、药理学、药物分析、生药学及微生物与生化药学二级学科
★生物技术与生物技术药物的概念 生物技术药物的分类 按用途分类:治疗药物、预防药物、作为诊断药物(免疫诊断试剂、酶诊断试剂、器官功能诊断药物、放射性核素诊断药物、诊断用单克隆抗体(McAb)、诊断用DNA芯片) 按作用类型分类:细胞因子类药物、激素类药物、酶与辅酶类药物、疫苗、单克隆抗体药物、反义核酸药物、RNA干扰(RNAi)药物、基因治疗药物 按生化特性分类:多肽类药物、蛋白质类药物、核酸类药物、聚乙二醇(PEG)化多肽或蛋白质药物 ★生物技术药物的特性 理化性质特性:相对分子量大、结构复杂、稳定性差 药理学作用特性:活性与作用机制明确、作用针对性强、毒性低、体内半衰期短、有种属特异性、可产生免疫原性 生产制备特性:药物分子在原料中的含量低、原料液中长存在降解目标产物的杂质、制备工艺条件温和、分离纯化困难、产品易受有害物质污染 质量控制特性:质量标准内容的特殊性、制造项下的特殊规定、检定项下的特殊规定(原液、半成品及成品检定等等)
第二章 基因工程制药 蛋白类药物的特点:
结构确证不完全性、具有种属特异性、多功能性、免疫原性
临床前安全性评价的特殊性:蛋白类药物安全性担忧的性质和来源;受试物的纯度;相关动物的选择;
给药剂量的选
择;免疫原性;遗传毒性和致癌性(一般不进行常规的遗传毒性实验);药代动力学 真核细胞表达制品的安全性问题:
生产细胞DNA残留的影响、生产用血清的影响
基因工程药物稳定性研究的相关问题:药物浓度、温度、湿度和水分、氧、光照、pH
基因工程药物的缺陷:生物利用度低,
半衰期短;异体蛋白具有免疫原性
基因工程菌的修饰改造方法:构建突变体、构建融合蛋白、PEG修饰(降低免疫原性、增加水溶性、延长t1/2)
基因工程制药基本环节 上游阶段:制备目的基因→构建重组质粒→构建工程细胞 下游阶段:培养工程细胞→分离纯化产物→除菌→半成品、成品检定→包装
基本工具:目的基因、各种酶(切割酶、连接酶、修饰酶等)、载体、宿主细胞 酶切结果:5’粘性末端、3’粘性末端、平头末端 1U核酸内切酶的酶活性:指在最佳反应条件下反应1小时,完全水解1mg标准DNA所需的酶量 影响限制性内切酶反应的因素: DNA样品的纯度: DNA的甲基化程度:核酸限制性内切酶不能够切割甲基化的核苷酸序列。在基因克隆中要使用甲基化酶缺陷型细菌菌株制备质粒DNA。 酶切反应的温度 DNA的分子结构 反应缓冲液组成 实用文档 反应时间、反应体积等 工具酶 核酸限制性内切酶:识别、水解外源的双链DNA分子上特定的核苷酸序列。主要存在于原核微生物中。 • 同裂酶:指来源不同,识别序列相同的酶;进行同样的切割,产生相同的末端 • 同尾酶:来源不同,识别序列不同,但产生相同的粘性末端 DNA甲基化酶:具有宿主专一性,对宿主自身DNA上特定核苷酸进行甲基化修饰,避免被自身限制性内切酶水解 DNA连接酶 • T4噬菌体连接酶:连接双链DNA切口,或带粘性末端或平头末端的DNA片段 • 大肠杆菌DNA连接酶:连接双链DNA切口,或带粘性末端的DNA片,不能连接带平头末端的DNA片段 聚合酶:以DNA或RNA为模板,将核苷酸连续加至3’-OH末端,合成方向为5’→3’。DNA聚合酶、RNA聚合酶 • 大肠杆菌DNA聚合酶Ⅰ:5’→3’DNA聚合酶活性;5’→3’DNA外切酶活性;3’→5’DNA外切酶活性;RNA H酶活性 • Klenow酶:不具备5’→3’DNA外切酶活性 • T4噬菌体DNA聚合酶:不具备5’→3’DNA外切酶活性。外切酶活性比Klenow酶强200倍,对单链DNA作用强于双链DNA • T7噬菌体DNA聚合酶:不具备5’→3’DNA外切酶活性 • Taq DNA聚合酶 • 反转录酶:催化以RNA或DNA为模板,合成DNA;具有RNA H酶的活性 • 末端脱氧核苷酸转移酶:催化dNTP沿5’→3’聚合,逐个加于线性DNA分子的3’末端;不需要模板
载体:(vector)来源于质粒、噬菌体或病毒的DNA分子,可供插入或克隆目的基因或DNA,并具有运载外源DNA导入宿主细胞的能力。 质粒载体:共价闭合环状DNA(cccDNA);开环DNA(ocDNA);线状DNA(lDNA) • 质粒的三个重要性质:遗传传递的能力;遗传交换的能力;不相容性 • 用于克隆的质粒的三个要素:复制子、选择标记、多克隆位点 • 常用质粒载体:克隆载体、表达载体、突变载体、报告载体 λ噬菌体载体:插入型载体、置换载体 • 来源于噬菌体DNA,因可以插入较大DNA片段,常用于构建基因组文库和cDNA文库。
目的基因的常用制备方法 化学合成法:前提:基因的DNA的序列已知。小于100bp的片段:直接合成,最常用固相亚磷酸三酯法。 大片段目的基因:小片段粘接法、大片段酶促法 PCR法:前提:已知待扩增目的基因或DNA片段两侧的序列,根据该序列化学合成聚合反应必需的双引物。 基因文库法:鸟枪法:适用于原核细菌目的基因的克隆分离 cDNA文库法(与mRNA互补的DNA)并非所有的mRNA分子都具有polyA结构;仅限于克隆蛋白质编码基因;mRNA含量少且t1/2短,对酶和碱极为敏感,分离纯化困难 第一链:mRNA模板,引物 (polyT) ,逆转录酶,dNTPs 第二链:自身引导法:取得的双链cDNA5’端会有几对碱基缺失(NaOH,煮沸;Klenow酶,dNTPs;S1内切酶) 引导合成法:获得的cDNA能保持完整的5’端序列(TdT, Dctp;NaOH;退火;Klenow酶,dNTPs) 基因文库的完备性:指在构建的基因文库中任一基因存在的概率,它与基因文库最低所含克隆数N之间的关系可用下式表示:N= ln(1–P) /ln(1–f),P=完备性,f=克隆片段的平均大小/生物基因组的大小 双酶切产生的粘性末端,最常用,可以确保连接方向的正确性 影响连接效率的因素:连接方式;目的基因与载体的浓度比例摩尔数比大于1;连接温度、时间、酶的活性、反应缓冲体系 重组DNA导入宿主细胞 实用文档 导入大肠杆菌:CaCl2法;转染法 导入酵母:电转化法;化学转化法;原生质转化法 导入链霉菌:原生质转化法;电穿孔法 重组DNA导入哺乳动物细胞:显微注射法;DEAE葡聚糖转染法;DNA-磷酸钙转染法;阳性脂质体介导法;电穿孔法;细胞融合法;病毒感染法
重组子的筛选与鉴定 遗传标记筛选法:抗生素抗性筛选法;α互补筛选法(蓝白斑筛选——载体含有LacZα基因,X-gal培养基,成功导入的菌落显示为蓝斑);营养缺陷型筛选法;噬菌斑筛选法 核酸分子杂交法:菌落原位杂交法;DNA印迹法;RNA印迹法 限制性内切酶图谱法:琼脂糖凝胶电泳鉴定各片段分子量,含有目的基因的为阳性克隆 DNA序列测定法 目的基因表达产物测定法
原核细胞表达的特点及选择 大肠杆菌(首选,遗传背景研究清楚;适合大规模生产(成本低,周期短,效率高,操作简单)、芽孢杆菌、链霉菌等 缺点:缺乏翻译后修饰系统;容易以包涵体形式存在;外源蛋白容易被宿主酶系统水解 ★ 外源基因表达的调控原件:复制子、启动子(表达效率的关键因素)和终止子、核糖体结合位点(即SD序列及SD序列到起始密码子AUG的距离)、识别翻译后修饰信号 用于原核表达的载体必须具备的条件:具有复制子、灵活的克隆位点和方便的选择标记、很强的启动子、阻遏子(一般有)、强的终止子,所产生的mRNA应具有翻译起始信号(起始密码子AUG以及SD序列) ★ 外源基因在大肠杆菌中的表达方式 胞内表达: 非融合蛋白表达:蛋白质接近天然状态,易被降解,易形成包涵体。有原核多肽基因 融合蛋白表达:表达效率高;产物稳定;可以切除原核多肽,获得天然外源蛋白 分泌表达:有信号肽基因,形成周质表达或细胞外表达 ★ 外源蛋白表达效率的影响因素 外源基因密码子:大肠杆菌具有偏好密码子和稀有密码子,外源基因应尽量设计成为大肠杆菌的偏好密码子 mRNA的结构:改变一级结构;降低5’端二级结构稳定性;调控3’端非翻译区二级结构 表达载体的选择:表达方式;强的复制子(拷贝数高);强的启动子(转录效率高);高效率的核糖体结合位点;强的终止子(提高mRNA稳定性);适应范围广;稳定性高;产物易纯化。 外源蛋白的稳定性:采用融合蛋白形式表达;采用蛋白酶缺陷的突变菌株
真核细胞表达的特点及选择 常用的真核表达系统:酵母表达系统、昆虫细胞表达系统、哺乳动物细胞表达系统 大肠杆菌和酵母表达系统的比较 大肠杆菌 巴斯德毕赤酵母 载体 原核载体 穿梭载体 调控序列 原核 原核和真核 表达形式 包涵体、融合蛋白、分泌 分泌 翻译后修饰 基本无 有 生产方式 发酵,操作简单、经济 发酵,操作较简单、较经济 ★ 酵母表达体系的影响因素