应用微卫星标记分析中国地方鸡种的遗传变异
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维普资讯 安徽农业科学 2007,年
降温至4℃结束程序。
1.2.3电泳及结果分析。PCR反应结束后,在产物中加入
2.5 3.0 l的加样缓冲液,取8 I混合样于10%非变性聚
丙烯酰胺凝胶180 V电泳3 4 h,并用硝酸银染色法显色,
以pBR 322 DNMMsp I Marker为分子量标准,凝胶成像系统
拍照分析等位基因片段大小,判渎基因型。
1.2.4数据统计及分析。根据试验个体微卫星标记基因
和测定的生长性状表型值资料,采用SAS软件的一般线性
模型(GLM)过程,用最小二乘法进行微卫星位点与各生长
性状间的相关分析,确定显著影响生长性状的微卫星位点,
进而对其标记进行不同基因型问生长性状表 值的多重比
较。采用以下线型模 进行最小二乘法分析:
,,
式中,,, 为第i类基因型中第 个个体的生长性状表型值;
为生长性状的群体均值;p.为第i种微卫星标 基因型的
固定效应;e//为随机误差效应。
2结果与分析
2.1微卫星多态・ 和电泳结果由表2可见,5对做 星标
记、 均等位基因为5.6个,最高为7个,最低为4个;5个微
卫星标记的平均杂合度和多态信息含量分别为0.742 6、
0.678 5,与其他人的研究相近16-7]。微卫星引物ADI 298、ADLI76
扩增产物的聚苯烯酰胺电泳结果如 2、3昕永一
表2 各位点在玫瑰冠鸡中的杂合度、多态信息含量、 等位基因数及频率
1 2 3 4 5 6 7 8 M
… 一16O 147
_ :
9O
注:泳道1-8为PCR产物;M为Marker(pBR 322):下图 。
图2微卫星座位ADL 298的部分扩增结果
1 2 3 4 5 6 7 8 M
= 列
图3微卫星座位ADL176的部分扩增结果
2.2微卫星位点与生长・性状的相关分析在统计分析中,
按7卯 型至少有4个观察值时才予以考虑。对各微卫
2008筇第44卷第13瀚 Genetics and Breeding・遗惩璃秘
新扬州鸡不同周龄蛋品质与
微卫星标记关联分析
顾华兵 ,陈宽维 ,徐文娟 ,王志跃2朱文奇 ,李慧芳
(1.江苏省家禽科学研究所,江苏扬州 225003; 2。扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州 225009)
摘 要:选择家禽基因组中的20个微卫星标记,对新扬州鸡群体192个个体的基因组DNA进行PCR扩增,分 析各标记与40、60周龄哈氏单位、蛋重和蛋壳强度的关系。结果表明:ADL217和ADL260与40周龄哈氏单位显
著相关(P<0。05);ADL176与40周龄蛋重与显著相关。MCW239、ADL260与60周龄的哈氏单位显著相关(P< 0.05);ADL176、MCW239与60周龄蛋重显著相关;LEI229与60周龄的蛋壳强度显著相关(P<0。05)。
关键词:微卫星标记;蛋品质;新扬州鸡 中图分类号:S831.1 文献标识码:B 文章编号:0258—7033(2008)13-0009—04
微卫星(microsatellite)标记作为第2代分子遗传
标记已在评价遗传多样性I ]、群体进化、绘制系统
发生树、血缘关系鉴定、核基因组研究以及基因定位
等研究中广泛应用,由于微卫星在真核生物基因组
中均匀而广泛分布,而且有许多微卫星序列分布在
目的基因附近甚至基因内,因此这些微卫星序列可
作为追踪相应目的基因的分子标记,进行基因定位,
而且可以作为分子遗传标记进行标记辅助选择,加
快育种进程。
新扬州鸡为扬州大学畜牧兽医学院1960年在原
扬州优良地方草鸡的基础上,经本品种选育,引入美
国新汉夏血液,经过杂交选育、品系繁殖等方式,历时
23年培育的一个优质蛋肉兼用型品种,已被列入《中
国家禽品种志》。它既有中国地方鸡种特有的许多优
良性状,又具有引入品种的特点,深受广大消费者的
欢迎。新扬州鸡核心群多年来一直实行封闭繁育,现
2007年8月 第16卷第3期 中央民族大学学报(自然科学版) Journal of the CUN(Natural Sciences Edition) Aug.2OO7 V01.16 No.3
独龙鸡种群遗传结构及遗传多样性初步研究
黄耀江 ,许 宙 ,黄玉路 ,周文化 ,和志军 ,
安 迪 ,刘 越 ,冯金朝
(1.中央民族大学生命与环境科学学院,北京 100081;2.中南林业科技大学生命科学与技术学院,长沙071012; 3.云南省贡山独龙族怒族自治县畜牧兽医局,云南673500;4.中国民族地区环境资源保护研究所,北京100081)
摘要:独龙鸡是一个古老的地方鸡种,其分类地位和系统地位还不明确.本研究用26对微卫星引物对独 龙鸡群内遗传多样性进行检测,25个微卫星位点在独龙鸡中呈现丰富的多态性,共检测到9o个等位基因,其 中ADID166位点的等位基因数8个,为最多;而ADLO112、LEIO166、MCW0067、ADL0268、MCW0294和MCWO078 两个位点的等位基因数达9个,为最少,独龙鸡在MCW103和LE1094微卫星位点上有其特有的等位基因,它拥 有其他鸡种所不具有的遗传基因,表明独龙鸡是我国一个新发现的独立鸡种. 关键词:独龙鸡;遗传多样性;研究 中强分类号:o38 文献标识码:A 文章编号:1005—8o36(20o7)03—0202—04
1 引 言
“微卫星DNA”又称为“简单重复序列(simple sequencerepeats,SSR)”,是由2~6个核苷酸为重复单位
组成的长达几十个核苷酸的重复序列,广泛分布于真核基因组中,因重复单位数目不同及重复程度的不 完全而呈现高度多态性.相对于其他遗传标记,因其分布较广泛、多态信息含量高 数量多、分布均匀、呈 共显性遗传,以及分析方便快速等优点,已被多次应用到分析鸡品种的遗传多样性的研究中¨ .
独龙鸡是我国云南少数民族独龙族祖祖辈辈养的鸡.纯种的独龙鸡分布在独龙江流域最北边,缅甸
利用15个微卫星标记分析淮河流域3个地方鸭种间的遗传关系
刘伟
【期刊名称】《中国家禽》
【年(卷),期】2010(32)10
【摘 要】利用15个微卫星标记分析了淮河流域的巢湖鸭、高邮鸭、淮南麻鸭3个地方鸭品种的多态信息含量(PIC)、杂合度以及群体间的遗传关系。结果表明3个群体的平均多态信息含量为0.5747,其中最高的是淮南麻鸭,为0.6030,最低的是高邮鸭,为0.5270,巢湖鸭为0.5940;3个群体的平均观察杂合度为0.4716,其中最高的是淮南麻鸭,为0.4989,最低的是巢湖鸭,为0.4288,高邮鸭为0.4870。各群体间的遗传距离(DA和DS)计算结果显示,巢湖鸭和淮南麻鸭的遗传距离最近,聚类结果也完全相同。3个地方品种的聚类结果与其地域分布吻合。
【总页数】4页(P14-17)
【作 者】刘伟
【作者单位】安徽省农业科学院畜牧兽医研究所
【正文语种】中 文
【中图分类】S858.31
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