基因多态性研究及其应用
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目录引言 (1)研究对象与材料 (3)1研究对象 (3)2治疗方案 (3)3不良反应监测 (3)4仪器与材料 (5)4.1主要实验仪器 (5)4.2主要实验试剂 (6)方法 (7)1PCR法检测基因的分型 (7)1.1基因组的提取 (7)1.2引物设计与合成 (7)1.3PCR扩增 (8)2限制性内切酶片断长度多态性(RFLP)分析和测序 (9)3高效液相色谱法测定MTX动态血药浓度 (10)4统计学处理 (9)结果 (11)1.MTHFR基因型与等位基因分布情况 (11)2.MTHFR基因型与HD-MTX化疗后动态MTX浓度的关系 (11)3.MTHFR基因多态性与MTX毒副作用之间的关联性 (12)讨论 (15)结论 (19)参考文献 (20)综述 (20)综述参考文献 (20)攻读学位期间的研究成果 (31)附录 (32)致谢 (34)学位论文独创性声明、学位论文知识产权权属声明 (35)引言引言白血病是临床上常见的一类造血干细胞恶性克隆疾病,因细胞增殖失控、分化障碍和凋亡受阻等因素所致在骨髓和造血器官和组织内大量增殖,浸润其他组织和器官,影响正常造血功能。
其中急性淋巴细胞白血病(Acute lymphoblastic leukemia,ALL)儿童和青少年中最常见的恶性肿瘤之一,占儿童白血病发病率的一半以上,且以每年1%的速度在增长[1-3]。
急性淋巴白血病的主要临床症状为发热、出血、关节疼痛或贫血为主[4]。
该病发生迅速,恶性程度较高,但对化学药物敏感,癌细胞易杀灭[5]。
临床治疗上以甲氨蝶呤鞘内或者静脉注射为主要化疗方式。
1岁以内白血病患儿的生存率40~50%,1岁以上患儿5年生存率超过90%。
因此,ALL的及时发现和诊断对疾病的治疗具有重要意义。
随着分子生物学水平的快速发展,人们不断地从分子水平探寻疾病的发病机理,多年的临床研究表明,ALL的易感性与ALL基因多态性密切相关[6-8]。
生物学中的遗传多态性研究遗传多态性作为一种遗传变异形式,是指基因在种群中存在多种等位基因的现象。
它在生物学中是一个非常重要的研究方向,因为遗传多态性不仅是生物种群进化的基础,也是生物学各个领域中的重要研究对象。
本文将介绍遗传多态性的概念、发生机制以及在生物学中的应用。
一、遗传多态性的概念遗传多态性(genetic polymorphism)是指在种群中的某一基因有两种或两种以上的等位基因,在一定条件下每种等位基因的频度都大于0.01。
这个概念最初是由英国的遗传学家弗雷德里克·格里菲斯提出的。
遗传多态性是基因水平上的表型变异,通过不同等位基因的组合而表现出来。
在人类学、动物学和植物学等领域中,遗传多态性都是一个非常重要的指标。
在人类学中,遗传多态性可以用来进行人类种群进化和迁徙的研究;在动植物学中,遗传多态性可以用来研究物种的起源、退化、适应性以及遗传资源等方面问题。
二、遗传多态性的发生机制遗传多态性在种群进化中的产生有多种机制。
其中,常见的机制有自然选择、基因漂变、基因流和突变等。
自然选择是指环境对不同等位基因的选择作用,使得一些等位基因被淘汰而另一些等位基因得以保留和扩散。
基因漂变是指由于随机的繁殖和变异过程,等位基因的频率发生了漂移的现象。
基因流是指不同种群之间等位基因的转移,这个过程会导致物种群体的基因组成发生改变。
突变是指基因产生的随机变异,这种变异可以导致等位基因的增加或丢失,从而增加遗传多样性。
三、遗传多态性在生物学中的应用1. 遗传多态性与人类疾病遗传多态性在医学中有着广泛的应用。
通过研究人类基因的多态性,可以发现一些跟疾病相关的基因,从而提高人们对疾病的认识和防治能力。
例如,某些人群中有一个名为APOE的基因,它与阿尔茨海默病有一定的关联,人们可以通过检测APOE基因的多态性来判断是否有患上阿尔茨海默病的风险。
2. 遗传多态性与生态保护遗传多态性也被广泛应用于生态保护领域,尤其是对于野生动物和植物。
基因多态位点1. 引言基因多态位点(Polymorphic Loci)是指在人类或其他生物个体中存在两个或更多的等位基因,其频率大于1%。
这些位点上的多态性是由于基因突变和遗传漂变的结果,可以导致个体间的遗传变异。
基因多态位点对于研究遗传学、人类进化以及个体差异具有重要意义。
本文将介绍基因多态位点的概念、分类、检测方法以及其在医学和生物学领域中的应用。
2. 概念和分类2.1 概念基因多态位点是指在某一特定位置上存在两个或更多等位基因,并且这些等位基因在群体中的频率大于1%。
这些等位基因可以通过单核苷酸多态性(SNP)、插入/缺失(Indel)和串联重复序列(STR)等方式引起。
2.2 分类根据不同的特征和检测方法,基因多态位点可以分为以下几类:•SNP(Single Nucleotide Polymorphism,单核苷酸多态性):是最常见的一种基因多态位点,指在DNA序列中单个碱基发生变异的现象。
SNP可以导致基因型差异,进而影响个体的表型特征。
•Indel(Insertion/Deletion,插入/缺失):指在DNA序列中插入或缺失一段碱基的现象。
Indel多态位点可以导致DNA序列长度的变化,从而影响蛋白质的结构和功能。
•STR(Short Tandem Repeat,短串联重复序列):指在DNA序列中连续重复出现的短片段碱基序列。
STR多态位点是由于不同个体之间重复序列数量和长度的差异所导致。
3. 检测方法为了检测基因多态位点,科学家们开发了多种方法和技术。
下面介绍几种常见的检测方法:3.1 PCR-RFLPPCR-RFLP(Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism)是一种常用的基因分型技术。
它通过先进行PCR扩增目标位点,然后使用限制性内切酶对PCR产物进行酶切,最后通过凝胶电泳分离切割后的DNA片段来确定等位基因。
《蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数的关联性分析》篇一蒙古羊与乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数关联性分析一、引言随着畜牧业的快速发展,对动物遗传资源的深入研究显得尤为重要。
蒙古羊和乌珠穆沁羊作为我国特有的畜禽品种,其遗传特性的研究对于提高其生产性能和育种工作具有重要意义。
BMP15基因作为影响动物繁殖性能的关键基因之一,其多态性对羊的产羔数有着重要影响。
本文旨在分析蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因的多态性及其与产羔数的关联性,为进一步优化育种方案提供理论依据。
二、研究方法本研究采用PCR-RFLP(聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性)技术,对蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因进行多态性分析。
通过统计各基因型个体的产羔数,探讨BMP15基因多态性与产羔数之间的关联性。
三、结果与分析1. BMP15基因多态性分析通过对蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因进行PCR-RFLP 分析,我们发现该基因存在多种基因型。
其中,蒙古羊的BMP15基因型主要为A、B、C三种,而乌珠穆沁羊的BMP15基因型主要为A、D两种。
各基因型在两个品种中的分布存在显著差异。
2. BMP15基因多态性与产羔数的关联性分析统计各基因型个体的产羔数发现,蒙古羊和乌珠穆沁羊中,不同BMP15基因型的个体产羔数存在显著差异。
具体来说,某些基因型的个体产羔数较高,而另一些基因型的个体产羔数较低。
进一步分析表明,BMP15基因多态性与产羔数之间存在显著关联性。
四、讨论本研究表明,蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因存在多种基因型,且各基因型在两个品种中的分布存在显著差异。
此外,BMP15基因多态性与产羔数之间存在显著关联性。
这表明BMP15基因可能是影响蒙古羊和乌珠穆沁羊产羔数的重要遗传因素之一。
在育种工作中,可以通过对BMP15基因的多态性进行检测,选育出产羔数较高的优良个体,进一步提高畜牧业的生產效益。
同时,本研究结果还表明,不同品种的羊在BMP15基因型分布和产羔数方面存在差异,这为进一步开展品种改良和育种工作提供了重要的理论依据。
药物与基因多态性对药物副作用的关联药物的发展与应用是现代医学的重要组成部分,它们可以治疗疾病和改善生活质量。
然而,许多药物应用过程中会出现一些副作用,有时甚至可能对患者产生严重的风险和不适。
不同的个体对同一种药物的反应也有很大的差异,这部分是由基因的多态性所决定。
本文旨在探讨药物和基因多态性对药物副作用之间的关联,以及其对个体化医疗的潜在影响。
一、药物代谢与基因多态性的关系药物在体内的代谢和消除是由一系列的酶催化反应所控制的。
在这一过程中,酶的功能和表达可能受到基因多态性的影响。
例如,细胞色素P450酶(CYP450)是一类常见的药物代谢酶,它们负责氧化和降解许多药物。
在人群中,CYP450基因存在丰富的多态性,导致个体间药物代谢能力的差异。
这些差异可能导致某些患者对特定药物代谢缓慢,从而增加药物在体内的暴露时间,并可能导致副作用的发生。
二、药物靶点与基因多态性的关系药物的疗效通常通过与特定的分子靶点相互作用来产生。
而这些分子靶点的表达和功能可能受到基因多态性的影响。
举例来说,药物靶向特定的受体来调节细胞信号传导通路。
然而,受体的表达和功能可能受到基因多态性的影响,导致不同个体对药物的反应不同。
有些患者可能表达一种变种受体,使得药物无法有效地结合受体,从而降低了疗效。
此外,一些基因变异还可以导致受体抑制或增强的功能改变,从而增加患者出现药物副作用的风险。
三、药物与基因检测在个体化医疗中的应用随着对药物与基因关联研究的深入,个体化医疗逐渐成为可能的现实。
药物与基因检测可以帮助医生了解患者的基因组特征,从而预测患者对药物的反应和副作用风险。
在某些情况下,基于患者基因多态性的药物剂量调整和药物选择已经得到了临床实践的应用。
例如,针对孟鲁斯酶基因的变异可以预测华法林(一种抗凝药物)剂量的个体化调整,以降低出血和血栓的风险。
因此,药物与基因检测的应用将有助于减少药物副作用和提高治疗效果。
四、药物与基因多态性研究的挑战与机遇药物与基因多态性研究面临一些挑战,例如患者基因组数据的获取和分析,药物与基因的复杂关联等。
【综 述】L MP基因多态性与疾病相关性的研究现状王丹妹,莫燕娜,吉丽敏,何佟【摘 要】 低分子量多肽(LMP)基因定位于MHC2Ⅱ类基因区域内的一个基因组,是内源性抗原加工与呈递颇为重要的一种基因。
LMP基因编码的蛋白L M P2与LMP7组成的二聚体,对于抗原肽的降解有着重要的作用,其酶解产物有着严格的空间模式。
由于L M P基因具有多态性,因此酶解产生的抗原肽具有数量或者空间构相的不同,并具有对抗原肽选择性转运的现象。
体内外多种因素可以调节LMP基因的表达和生物活性,从而影响者病毒的感染过程以及肿瘤的发生。
目前LMPP基因与疾病的相关性,以及其多态性与疾病的遗传易感关联日益受到广泛的关注。
本文就这一领域的研究成果做一综述。
【关键词】 L M P;多态性;相关性【中图分类号】 R349.6 【文献标识码】 A 【文章编号】 167424152(2010)0821033203Advance m en t of Correl a ti on between L ow M olecul ar W e i ght Polypepti de Gene Poly m orph is m and D isea ses WAN GD an2m ei,MO Yan2na,J I L i2m in,et al.Hum an B ody Functional L aboratory,Hainan M edical College,Haikou571101,Hainan,Chi2na【Abstract】 Low molecular weight polypep tide(LMP)gene l ocated in the MHC2Ⅱgenes in the regi on of a gene gr oup is en2 dogenous antigen p r ocessing and p resentati on of a very i m portant gene.L M P gene encodes a p r otein di m er composed of LMP2andLMP7,the pep tide has an i m portant r ole in the degradati on of its hydr olyzate has a strict s patial patterns.A s the LMP gene haspoly mor phis m,the pep tide p r oduced by enzy matic or s pace has a number of different confor mati on and on pep tides with selective transfer phenomenon.M any fact ors can regulate in vivo exp ressi on of LMP genes and bi ol ogical activity,thus affecting the p r ocessof those infected with the virus and tu mor occurrence.Currently LMPP genes ass ociated with diseases and their genetic poly mor2phis m and suscep tibility t o diseases are paid increasingly wides p read attenti on.I n this paper,results of research in this field are reviewed.【Key words】 Low molecular weight polypep tide;Poly mor phis m;Correlati on 内源性抗原的处理与提呈在免疫性疾病的发病过程中起着很重要的作用,而与MHC2Ⅰ类分子相关性抗原的处理、提呈途径十分复杂。
遗传多态性与药物代谢的关系研究及其在临床应用中的意义近年来,随着个性化医疗的发展,药物代谢动力学研究越来越受到重视。
药物代谢动力学主要研究人体对药物的代谢过程,包括吸收、分布、代谢和排泄等环节。
其中,药物代谢过程中一个重要的因素是人类遗传多态性。
遗传多态性是指人类基因组中存在不同的序列变异,这些序列变异可能导致人类对药物的代谢能力不同,从而导致药物效果和副作用不同。
遗传多态性对药物代谢的影响主要包括基因型对药物代谢酶的表达水平和活性的影响。
药物代谢酶主要包括细胞色素P450酶、醇脱氢酶、芳香族氧化酶等,它们在人体内参与多种药物的代谢和清除。
基因型的不同可能导致药物代谢酶的表达水平和活性的变化,从而影响药物在体内的代谢过程。
例如,细胞色素P450酶CYP2D6基因的多态性常常会影响华法林等药物的治疗效果。
近年来,癌症治疗中遗传多态性的研究尤为引人关注。
由于肿瘤细胞的异质性,不同肿瘤细胞对同一药物的敏感性存在较大差异,因此选择有效的治疗方案对于治疗癌症至关重要。
由于基因型的差异可能导致药物代谢酶表达水平和活性的变化,从而在癌症治疗中引起个体之间的药物代谢动力学变异,因此基因型与药物代谢动力学的相关性在个性化治疗中具有重要的价值。
当前,许多基因和单核苷酸多态性已被发现,据美国食品药品监督管理局统计,目前已经被批准药物标签备案的有药物166种,涉及98个基因的多态性。
这些研究对于药物的个性化治疗方案的开发和制定具有重要的意义。
例如,根据细胞色素P450酶基因多态性选择用药方案,能够减少患者不良反应和治疗失败的风险,同时提高治疗效果。
同时,药物代谢酶基因多态性也被广泛应用于药物开发领域。
事实上,药物的研发过程中,药物代谢动力学研究已成为不可或缺的环节。
通过了解药物的代谢途径和代谢动力学特征,可以应用基因型和代谢动力学试验为药物开发提供指导。
近年来,人类遗传多态性研究取得了重要的进展,也为药物治疗提供了更为有效的策略。
人类遗传学中多态性位点鉴定方法人类遗传学是研究人类基因组中的遗传变异并探索其对个体表型和疾病形成的影响的学科。
其中,多态性位点(polymorphic loci)鉴定方法是人类遗传学研究中的重要工具之一。
本文将介绍多态性位点的概念及其在人类遗传学中的应用,包括多态性位点的鉴定方法、应用领域和意义。
多态性位点是指基因组中存在的具有多种等位基因(alleles)的位点。
这些位点上的等位基因频率在人群中存在显著差异,即具有多态性。
多态性位点的发现和鉴定可以用于遗传多样性的研究、群体遗传结构的分析、人类进化的推断以及疾病易感性的评估等方面。
多态性位点的鉴定方法主要有遗传标记法、DNA测序法和基因芯片技术。
遗传标记法是通过利用已知的多态性位点进行间接鉴定,常用的方法包括限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)、微卫星标记法(Microsatellite Marker)和单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)等。
这些方法通过PCR扩增等技术手段,测定位点上等位基因的特定序列或长度,从而实现位点的鉴定。
DNA测序法是直接测定多态性位点的等位基因序列,其中Sanger测序法和下一代测序技术是最常用的方法。
Sanger测序法是通过链终止法将DNA片段逐个碱基测序,并最终确定等位基因序列。
下一代测序技术包括Illumina测序、Ion Torrent 测序和454测序等,具有高通量、高灵敏度和低成本等优点,广泛应用于多态性位点的鉴定与研究。
基因芯片技术是通过将大量特异性探针固定在芯片表面,检测样品中目标序列的方法。
其中,DNA芯片和SNP芯片是最常用的两种类型。
DNA芯片通过比较样品与探针之间的杂交情况,从而确定目标序列的等位基因分布情况。
SNP芯片利用探针固定在芯片上的SNP位点,通过鉴定样品中SNP位点上的等位基因,实现多态性位点的鉴定。
福建汉族人群D1S1656基因座遗传多态性及其在亲权鉴定中的应用目的研究福建汉族人群D1S1656的遗传多态性及其在亲权鉴定中的应用价值。
方法应用荧光标记复合扩增系统对日常检案中收集的521名福建汉族无关个体血样DNA进行PCR扩增,用ABI 3130基因分析仪对扩增产物进行毛细管电泳,用GeneMapper v3.1软件进行基因分型,统计分析D1S1656 基因座的多态信息,并与其他5个群体进行比较。
结果在D1S1656 基因座发现17个等位基因,在福建汉族人群中的个体识别能力为0.948,非父排除率为0.665。
结论D1S1656 基因座在福建汉族人群具有高度多态性,在亲权鉴定中具有重要应用价值。
标签:福建;汉族;D1S1656;短串联重复序列;亲权鉴定短串联重复序列(STR)是基因组中广泛分布、高度多态性的一类分子标记,是群体遗传学和法医血液遗传学高信息基因座的丰富来源。
随着DNA检验在法庭科学领域的广泛应用,新的STR遗传标记被相继发现,该研究即对福建汉族人群D1S1656基因座进行群体遗传学调查并探讨其法医学应用价值。
该研究采用荧光标记复合扩增技术,对521名汉族无关个体进行了D1S1656基因座的分型检测,分析其多态性,计算其个体识别能力和非父排除能力,验证其应用价值。
1 资料与方法1.1 一般资料日常检案中收集的521名汉族无关个体血样、PowerPlex 21TM。
1.2 方法Chelex-100 法提取血液DNA[1]。
采用10 uL体系进行PCR扩增,扩增条件严格按照使用说明书操作,扩增产物在3130基因分析仪上进行毛细管电泳,用Data Collection v2.1软件收集电泳信息,GeneMapper ID v3.1软件分析基因型。
1.3 统计方法用χ2检验判断D1S1656的基因型分布是否符合Hardy-Weinberg平衡定律,采用PowerStatsV12软件计算杂合度H(heterozygosity,H)、个体识别力DP(power of discrimination,DP)、非父排除率EP(Power of Exclusion,EP)和多态信息总量PIC(polymorphism information content,PIC),采用Arlequin v3.5软件比较不同群体间等位基因频率差异。
蜜蜂性等位基因csd多态性研究蜜蜂为单双倍数性别决定类型,在蜂群中,蜂王和工蜂是雌性,为二倍体,雄蜂是雄性蜂,为单倍体。
csd基因为蜜蜂性别决定关键基因,当个体具有两个不同的csd等位基因时发育成雌性,只有一个csd等位基因时发育成雄性,具有两个相同的csd等位基因时发育成二倍体雄蜂。
本研究对csd在中华蜜蜂不同地理群体、西方蜜蜂不同亚种、大蜜蜂、小蜜蜂及人工选育的浆蜂中的多态性进行了分析,获得了如下结果:1.不同地理群体中华蜜蜂csd基因的多态性分析选取吉林长白山、海南海口、广西南宁、湖北神农架和江西靖安5个区域的中蜂群体,用每个个体的头部和胸部提取DNA,用csd 基因3区特异引物进行PCR扩增,对目的片段进行克隆,对每个个体挑取1-3个克隆进行测序,总共获得131条csd基因高变区的序列,归属于69个单倍型,其中有9个单倍型为两个以上群体共有。
系统树表明所有的单倍型在分子系统树上很明显的形成两支(TypeⅠ和TypeⅡ),而来自不同地理群体的单倍型则混杂在一起,在系统树上并没有按照地理来源形成五支。
多态性分析表明TypeⅠ的多态性(π=0.06724)显著高于TypeⅡ(π=0.01477).进一步分析五个群体TypeⅠ单倍型的多态性,吉林长白山、江西靖安、广西南宁、海南海口和湖北神农架群体的多态性依次为0.09425,0.09987,0.05096,0.04612,0.03588。
吉林长白山和江西群体的多态性显著高于其它群体。
而吉林长白山群体和江西靖安群体之间,广西南宁群体、海南海口群体和湖北神农架群体之间的的多态性没有显著差异。
采用核苷酸分歧度(Dxy)来表示群体间csd基因核苷酸多态性。
各群体核苷酸分歧度在0.03977-0.09208之间。
其中湖北神农架中蜂与广西南宁中蜂之间分歧度最小,为0.03977。
江西靖安中蜂与吉林长白山中蜂分歧度最大,为0.09208,江西靖安中蜂与湖北神农架中蜂、海南海口中蜂的分歧度也很大。
ApoE基因多态性与缺血性脑卒中的相关性研究ApoE基因是人体中重要的脂质的运输者,对于底物的运输和代谢来说都是重要的。
在1900年代80年代,科学家们发现ApoE基因多态性与缺血性脑卒中存在相关性。
缺血性脑卒中是一种基于神经元丧失和缺血以及缺氧而导致的脑部损伤,是导致残疾和死亡的主因之一。
在本文中,我们将详细探讨ApoE基因多态性与缺血性脑卒中之间的相关性,以及五个证明这种相关性的例子。
ApoE基因有三种多态性:ε2、ε3和ε4。
ε3是最常见的多态性,约占人群的70%,ε4是较少的多态性,约占人群的15%,而ε2则只存在于约8%的人口中。
已经证明,ApoE基因多态性与心血管疾病相关性,如冠心病和动脉粥样硬化,但对于缺血性脑卒中的风险和预后,其贡献值尚未完全明确。
1. 阴性基因多态性和缺血性脑卒中之间的相关性1997年,在欧洲心血管病主题组织的一项研究中,研究者们发现,多数荷兰人缺乏基因多态性是与较高的缺血性脑卒中的风险相关的。
本研究中的449例患者研究结果显示,仅仅26%的患者携带了ε4;ε2则没有被发现。
研究结果支持,阴性基因多态性可能会影响缺血性脑卒中的风险。
2.目的认知功能和ApoE基因多态性之间的关系目的认知功能是指执行任务所需的认知活动,如期望和目的实现等。
在2020年的一项研究中,研究者发现,ApoE基因ε4与目的认知功能之间的负担有关。
尽管这个关系仍需验证,但它可能是由于ε4与低密度脂蛋白等浓度升高导致的,后者是导致炎症和整体认知力下降的主要因素之一。
3. 高脂肪饮食对ApoE基因多态性的影响在2003年的一项研究中,研究者们发现,饮食脂肪摄入的多少可以影响ApoE基因临床表现。
该研究对抗氧化剂治疗后的动脉粥样硬化受试者进行了两年的随访,在这期间,受试者吃了两种不同的饮食:低脂肪和高脂肪饮食。
结果显示,高脂肪饮食可以增加ApoE基因ε4携带者心血管病和缺血性脑卒中的风险。
4. ApoE基因多态性与抗血小板药物的反应在2000年的一项大型研究中,包括80个国际医学中心,研究者发现,ApoE基因多态性可以影响抗血小板药物的反应。
FATP1基因多态性及其与鸡屠宰性状的相关性研究的开题
报告
一、研究背景
家禽屠宰性状对养殖业具有重要的影响,而这些性状又受到遗传因素的控制。
FATP1(长链脂肪酸转运蛋白1)基因编码一个细胞质膜上的蛋白质,它能够促进脂肪酸的转运和储存,并且在肥胖等代谢疾病的发生中起重要作用。
因此,FATP1基因多态性可能会对鸡的生产性能和屠宰性状产生影响。
二、研究目的
本研究旨在探究FATP1基因多态性与鸡屠宰性状的相关性,并为改良鸡的生产性能提供科学依据。
三、研究内容和方法
1.研究对象:
选用纯种内蒙古土鸡作为研究对象,共计300只,其中150只为肉用鸡,150只为蛋用鸡。
2.提取DNA:
在家禽鸡的wing veins采血20μL,加入0.2 mL EDTA-Anticoagulant管中,室温下鸡1h,离心3000 r/min 5min,吸去悬浮液,加入500μL ice-cold TE buffer中,振荡溶解,在95℃水浴中离心2 min后置冰上静置,取上清液即所需DNA。
3.多态性分析:
采用聚合酶链反应和限制酶切等技术,分析FATP1基因的多态性,包括单核苷酸多态性(SNP)和插入/缺失多态性等。
4.性状评价:
对研究对象进行屠宰性状评价,包括体重、肌肉率、脂肪率、胸深、胸宽、腿长等指标,通过统计分析,探究FATP1基因多态性与屠宰性状的相关性。
四、研究意义
本研究可为改良鸡的生产性能提供科学依据,探究FATP1基因在鸡屠宰性状中的作用,为养殖业的发展提供技术支持。
催乳素基因多态性及其与小尾寒羊的研究动物遗传育种与繁殖学:代鸥指导教师:李学伟教授本研究以小尾寒羊(142只)、湖羊(40只)、特克塞尔羊(36只)、多赛特羊(36只)和考力代羊(28只)这五个绵羊品种为实验材料,应用PCR-SSCP对PRL基因的DNA编码序列的多态性进行了分析,并进一步对该基因与小尾寒羊高繁殖力之间的关系进行了研究。
结果表明:5个绵羊品种在引物2的扩增产物中均存在单核苷酸多态性,其中只有多赛特羊未检测出DD型,而其余4个绵羊品种均检测出CC、CD和DD型。
小尾寒羊、特克塞尔羊、多赛特羊和考力代羊这四个绵羊品种在其他四个引物扩增产物中均未检测到单核苷酸多态性。
然而,只有湖羊的5对引物的PCR扩增产物在整个DNA编码序列中均检测到多态性。
克隆测序后连接出绵羊PRL基因DNA编码序列的总长度为926bp,与牛的PRL基因DNA全序列(登录号:AF426315)相应区域的同源性高达98.25%,与NCBI上公布的绵羊的PRL基因mRNA(登录号:NM_001009306)的同源性高达98%(野生型)、97%(突变型)。
绵羊PRL基因野生型和突变型的DNA编码区的同源性为98.7%(914/926),该编码区一共编码240个氨基酸,野生型和突变型之间的氨基酸同源性为98.75%(237/240)。
在整个催乳素基因的DNA编码区,经检测野生型和突变型一共存在12处碱基突变,但是只有3个突变为有义突变,所导致的氨基酸突变分别为:第27位氨基酸发生了从Leu 到Pro的突变,第149位氨基酸发生了Ala到Val的突变,第206位氨基酸发生了Tyr到His的突变。
对五个品种具有多态性的引物的扩增片段进行χ2适合性检验,结果表明:引物2扩增片段在特克塞尔羊群体中的分布显著地偏离了Hardy-Weinberg平衡(P<0.05),而在小尾寒羊、湖羊、多赛特羊和考力代羊中都保持了Hardy-Weinberg平衡 (P>0.05)。
PNPLA3基因多态性与脂肪肝的关系及机制研究脂肪肝是一种常见的肝脏疾病,其主要特点是肝细胞内脂肪的过度积累,导致肝细胞的损伤和炎症反应。
长期以来,脂肪肝的病因一直是医学界的焦点之一。
随着科技的进步,对脂肪肝病因的研究也越来越深入。
近年来,PNPLA3基因多态性成为了研究脂肪肝的热点之一。
PNPLA3基因是人类体内一种重要的脂酶,其编码的肝脏脂酶主要负责使脂肪水解成为燃料或合成甘油三酯。
PNPLA3基因多态性包括rs738409和rs2294918两种,其中rs738409多态性被认为与脂肪肝有关。
一些研究发现,PNPLA3基因rs738409多态性与脂肪肝的发生密切相关,不同基因型的人群脂肪肝的患病率也不同。
例如,在人种间的比较研究中,发现亚洲人、高加索人和非洲人的rs738409多态性频率分别是27%、49%和17%,由此可以看出,rs738409多态性存在人种差异。
不同的基因型对脂肪肝的危险性也不同,GG型的人群患脂肪肝的风险最高,GA型次之,而AA型的人群患脂肪肝的风险最低。
这些研究表明PNPLA3基因rs738409多态性与脂肪肝存在明显关联。
PNPLA3基因rs738409多态性与脂肪肝的关联机制还不完全清楚。
但一些研究表明,该基因的多态性会影响肝内甘油三酯的代谢。
PNPLA3基因表达过多或高风险基因型容易受到外界影响,在甘油三酯的分解和代谢方面出现问题,从而导致脂肪聚积在肝细胞中。
此外,PNPLA3基因多态性还可能影响肝细胞的生命过程和信号转导等机制,从而导致脂肪肝的发生。
最近的研究还发现,PNPLA3基因rs738409多态性与无病症性肝脏脂肪的存在有关。
这些无病症性肝脏脂肪不仅是脂肪肝的前兆,而且也与心血管疾病等疾病密切相关。
因此,我们需要深入研究PNPLA3基因rs738409多态性与无病症性肝脏脂肪的关联,以便更好地预测和防治脂肪肝及相关疾病。
总之,PNPLA3基因rs738409多态性与脂肪肝的发病率密切相关,该基因的多态性会影响肝内甘油三酯的代谢,从而导致脂肪聚积在肝细胞中,发挥着脂肪肝发病的重要作用。
《蒙古羊和乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数的关联性分析》篇一蒙古羊与乌珠穆沁羊BMP15基因多态性及其与产羔数的关联性分析一、引言在畜牧养殖业中,羊的繁殖性能是决定其经济效益的关键因素之一。
基因多态性研究对于提升羊的繁殖性能具有重要意义。
本文以蒙古羊和乌珠穆沁羊为研究对象,对其BMP15基因的多态性及其与产羔数的关联性进行分析,以期为提高羊的繁殖效率和育种工作提供理论依据。
二、材料与方法1. 研究对象选择健康的蒙古羊和乌珠穆沁羊作为研究对象,确保其血统纯正。
2. 采样与DNA提取从两种羊群中随机选取个体,采集其血液样本,并提取基因组DNA。
3. PCR扩增及测序采用PCR技术对BMP15基因进行扩增,并对其进行测序。
4. 数据处理与分析将测序结果进行数据处理,利用生物统计学方法分析BMP15基因多态性与产羔数之间的关联性。
三、结果与分析1. BMP15基因多态性分析通过对蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因进行测序和数据分析,发现该基因存在多种基因型和等位基因的多态性。
2. BMP15基因多态性与产羔数的关系通过对两种羊群的产羔数与BMP15基因型进行关联性分析,发现BMP15基因的多态性与产羔数之间存在显著关联。
具体表现为某些基因型和等位基因与高产羔数相关联,而其他基因型则与低产羔数相关联。
3. 讨论BMP15基因是影响羊繁殖性能的重要基因之一,其多态性可能影响羊的生殖能力。
通过分析发现,蒙古羊和乌珠穆沁羊在BMP15基因上存在差异,这可能是导致两者繁殖性能差异的原因之一。
此外,不同基因型与产羔数之间的关联性,为育种工作提供了重要的参考依据。
在育种过程中,可以通过选择具有高产羔数相关基因型的个体进行繁殖,以提高羊群的繁殖效率。
四、结论本文通过对蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因多态性及其与产羔数的关联性进行分析,得出以下结论:1. 蒙古羊和乌珠穆沁羊的BMP15基因存在多种基因型和等位基因的多态性。