鸡γ-干扰素基因的克隆与序列分析
- 格式:pdf
- 大小:196.39 KB
- 文档页数:4
第27卷第4期 2006年10月 华南农业大学学报 Journal of South China Agricultural University V01.27.No.4 0ct.2oo6
鸡 一干扰素基因的克隆与序列分析
敖艳华,任 涛,孔令辰
(农业部养禽与禽病防治重点开放实验室,华南农业大学兽医学院,广东广州510642)
摘要:为了研究鸡 .干扰素(ChIFN. )基因的功能并进一步探究其在控制家禽传染病方面的应用,根据GenBank已
发表的ChIFN一 cDNA基因序列自行设计引物,应用反转录.聚合酶链式反应(RT-PCR)技术从伴刀豆球蛋白A(co- nA)刺激培养鸡脾淋巴细胞中提取的总RNA中扩增得到ChIFN- ,然后连接到pMD18-T载体上并转化到Topl0感
受态细胞中,获得阳性重组质粒并进行正确性序列测序.核甘酸序列结果表明,试验得到了长为513 bp的ChIFN-
基因,与原鸡(Gullus)IFN一 的同源性可高达100%,其含有1个495 bp的开放性阅读框架,编码164个氨基酸,推测
其成熟蛋白的相对分子质量约为18 000.
关键词:鸡 -干扰素;克隆;序列分析
中图分类号:¥852.4 文献标识码:A 文章编号:1001—411X(2006)04-0086—04
Cloning and Sequencing of Interferon- from Chicken Spleen Cells
AO Yan—hua,REN Tao,KONG Ling—chen
(Key Lab of Poultry Feeding and Disease Control,Ministry of Agriculture,
CoHege of Veterinary Medicine,South China A c.Univ.,Guangzhou 510642,China)
Abstract:To provide a basis for further investigation of the chicken interferon一 (ChIFN一 ),a pair of
primers specific to ChIFN一 were designed and synthesized according to the known sequences from Gen—
Bank,and were used to amplify ChIFN一 cDNA by RT—PCR from total RNA of chicken spleen cells in—
duced by ConA.RT—PCR product was cloned into pMD18一T vector.The recombinant plasmid was identi—
fled by digestion with restriction endonucleases and the nucleotide sequence was determined.The ChIFN一
gene was 513 bp in length,with a 495 bp open reading frame encoding a polypeptide of 164 amino acides.
It was predicted that ChIFN一 can produces a mature protein with the relative molecular mass of approxi—
mately 18 000.
Key words:chicken interferon一 ;clone;sequence analyzing
禽类细胞因子包括淋巴细胞因子(1ympho—
kines)、单核因子(monokines)以及干扰素(IFN)等,
它们对动物机体的免疫应答,对疾病的发生发展具
有十分重要的作用.其中禽类干扰素具有相对的种
属特异性,也具有微弱的抗原性,它按照抗原特异性
可分为I型和Ⅱ型2类,I型包括IFN—Ot、IFN—B等,
Ⅱ型又称免疫干扰素即IFN一 ,其中对IFN一 的研
究很广泛,包括抗微生物的免疫性作用 J、通过融合
作为DNA疫苗佐剂 ,甚至某些疾病的治疗例如结
核 等.目前人的干扰素基因已相继克隆和表达, 并在临床上得到相应的应用 J.在我国,尤其是对
猪干扰素的研究比较深人,猪干扰素 、B、 基因的
分子克隆与序列分析已获得成功 J.与之相比,禽
类干扰素分子水平的研究起步较晚,1995年Schul ̄
等 8圳报道了鸭I型IFN基因及IFN一 基因,夏青
等¨ 、吴光志等¨ 分别报道了北京鸭I型及Ⅱ型
IFN基因,为进行北京鸭干扰素生物制品的研究、从而
为更好地促进养鸭业提供了坚实的理论基础.近几
年,程坚等¨ 对鸡的 一干扰素也进行了较深人的研
究.参考众多学者的研究,本试验采用RT_PCR技术,
收稿日期:2005.11.09
作者简介:敖艳华(1979一),女,硕士研究生;通讯作者:任涛(1968一)男,副教授,博士,E-mail:rentao@scau.edu.an
基金项目:广东省科技计划项目(2004B20201030)
维普资讯 http://www.cqvip.com 维普资讯 http://www.cqvip.com 华南农业大学学报 第27卷
切,出现2条带,一条长度为513 bp,另一条长度约
为2.7 kb,与预期的结果完全相符合(图2).
M:wide range marker;I:重组质粒双酶切;2:空载体单酶切 M:wide rangemarker;I:degestedwithEcoPd and SalI;2:PUC di— gested witit EcoRI
图2重组质粒双酶切鉴定结果
Fig.2 Identification of recombinant plasmids by digestion with
mstrication endonudease
3讨论 Percent identity 2.3测序结果与序列分析
通过序列测定得到长513 bp的基因,含有1个
长为495 bp的完整开放性阅读框架,共编码164个
氨基酸,与NCBI GenBank上登载的编号为
AF424744的原鸡IFN. 的同源性为100%.分析同
源性较高的前1O个可以看出,前面8个序列均为原
鸡IFN. ,而同源性最低的则为鹤类IFN. 编号为
AJ001678(图3、4).
Nucleoti如substitutions(X 100) 图3 ChIFN一 基因的系统发育树
Fig.3 Phylogenetic tree of ChlFN-^r
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 1 ■■ 0 00廿 96 8 ④ 97 0 99 8 99.6 99 8 99 8 9g.8 g9 4 1 2 0.0曩■ 96 8 95 6 97 0 99.8 99 6 99 8 99 8 99.8 g9 4 2
3 3.1 3.1 _95.8 93.5 96.6 96.4 96.6 96.6 96.6 96.4 3 4 4 4 4 4 4 4 ■一 92 1 95 4 g5.2 g5.4 95 4 95 4 g4 7 4
5 2 9 2.9 6 1 7.4 ■■ 97 2 97、0 97.2 97 2 97.2 g6 8 5 6 0 2 0 2 3 3 4 6 2 7 I 99 8 1 00.O 1 00 0 1 0O O 99 6 6 7 0.4 0 4 3 5 4 8 2.g 0.2 ■■ 99.8 99 8 99.8 g9 4 7 8 0.2 0 2 3.3 4.6 2 7 0.0 0 2 I 1 00 0 1 00.0 99.6 8
9 0 2 0 2 3.3 4.6 2.7 0.0 0 2 13.0 _ :100.0 99 6 9 10 0.2 0 2 3 3 4 6 2 7 0 0 口2 0 0 13.0曩● 99 6 10 11 0.6 0.6 3 5 5 0 3.1 0 4 0.6 0.4 0.4 0 4 ■一 11
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
图4 ChIFN一 基因的核苷酸序列的同源性比较分析
Fig.4 Sequence similarities for Ch/FN-^r
大量的临床试验表明,禽干扰素具有高效、广谱
的抗病毒作用,可以抑制多种禽类疾病相关病毒的
繁殖,例如时秀梅等¨ 应用兽用干扰素诱生剂(由
黄芪、灵芝、党参等提炼制成)对人工感染IBDV和
IL1 的雏鸡进行了防治试验,结果表明该药对IBD
和ILT具有较好的防治效果;Schuhz等 使用鸭重
组I型干扰素抗新城疫、禽流感和水泡性口炎病毒,
有一定的作用,其中对鸭乙型肝炎病毒感染的治疗
效果尤其显著,15 d内IFN可抑制鸭乙型肝炎病毒
在肝细胞中繁殖.有报道说它还具有某些抗寄生虫
活性 和免疫调节功能lL1引,而且IFN. 在各类干扰 素中免疫调节功能最强¨ .因此,研究IFN. 的意
义就显得非常重大.目前已经证明在真核细胞中表
达的鸡重组IFN一 蛋白活性与天然鸡IFN一 相似,同
样具有抗病毒和免疫调节作用,而且重组鸡IFN.
具有佐剂效应 ’J.同时发现鸡IFN. 与H5亚型禽
流感病毒等许多抗原联合应用具有免疫增强作用,
可以提高鸡细胞免疫的水平¨引.
本研究直接从鸡脾脏淋巴细胞中提取mRNA,
并利用RT—PCR成功地扩增和克隆了鸡的IFN一 基
因.分析表明与NCBI GenBank上登载的编号为
AF424744的原鸡IFN. 的序列完全一致.所克隆的
基因为今后进一步体外表达鸡IFN. 蛋白并深入研
究其功能奠定了基础,并且使研究和开发鸡的IFN. ∞ ∞ 啪 一哪 M一 w 肌 ~~一一一一一一一一一 ∞∞∞ ∞如∞ 如∞ 如 加 7
一~一一一~一一一一一一A A A _《A N U X A
维普资讯 http://www.cqvip.com