单核苷酸多态性研究进展
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单核苷酸多态性在人类疾病中的作用研究单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是指基因序列中单个核苷酸的变异。
在人类基因组中,SNP数量高达数百万,且人与人之间差异较大。
这些变异可能对基因功能造成影响,与许多疾病的发病机制有关。
SNP与遗传性疾病SNP是一种常见的遗传变异,与遗传性疾病密切相关。
例如,外显子基因突变可以导致乳腺癌、肝癌、卵巢癌等常见癌症的发生。
除此之外,SNP也与许多常见疾病的风险相关,如心血管疾病、糖尿病、自身免疫性疾病等。
SNP对基因表达的影响SNP位于基因序列中,可能会影响基因表达。
例如,某些SNP与乳腺癌发生风险有关,其作用机制主要包括影响基因的表达,包括上游调节元件和显性编码区域。
通过影响转录因子的结合能力,SNP可以影响并且改变基因的表达模式,从而发挥不同的影响。
这些变化可能导致基因编码的蛋白质产生缺陷,或者增加突变的风险。
SNP与个体反应的差异SNP可能决定了个体对药物反应的差异。
例如,使用治疗癌症的药物间充质细胞毒性药物的时候,某些SNP可能会导致这种药物在某些人身上没有有效作用,也可能导致其他人产生毒性反应。
因此,预测个体对药物的反应可以更好地指导药物治疗。
SNP与环境因素的交互作用SNP可能会通过交互作用影响个体对环境因素的反应。
例如,一项研究表明,某些SNPs与木尘暴露相关,可能会导致气道炎症和哮喘的风险增加。
变异体型的基因可能会导致对某些环境因素更敏感,也可能解释为什么一些个体暴露于环境因素的时候没有出现健康问题,而另一些出现了健康问题。
SNP与疾病风险评估根据人类基因组计划的成果,识别SNP可以为预测疾病风险提供可靠的线索。
通过分析个体基因组,可以预测其罹患某种疾病的风险,并制定个性化的治疗和预防计划。
例如,家族性乳腺癌基因突变的女性携带者的罹患乳腺癌的风险非常高,可以通过对此类基因进行测序,进行早期筛查和治疗,以减少罹患乳腺癌的风险。
miRNA-499及相关单核苷酸多态性在肿瘤中的研究进展发表时间:2015-02-03T10:11:14.500Z 来源:《医药界》2014年11月第11期供稿作者:李贻情黄耀(通讯作者)[导读] miR-499及其单核苷酸多态性(rs-3746444)与肿瘤(乳腺癌)的研究现状。
李贻情黄耀(通讯作者)(广东医学院附属福田医院外二科广东深圳518033)【中图分类号】R730.5【文献标识码】A【文章编号】1550-1868(2014)11【摘要】摘要:MicroRNAs(miRNAs)与肿瘤的关系是近几年的研究热点。
大量的实验研究表明,MicroRNAs及其相关单核苷酸多态性在基因中的调控,可能在肿瘤形成、发展、转移中发挥着主导作用。
目前随着多种新技术的出现并对MicroRNAs研究的进一步深入,关于miR-499及单核苷酸多态性(rs3746444)与肿瘤的关联性和用于治疗肿瘤的研究有了深入进展。
本文拟就miR-499及单核苷酸多态性在肿瘤中的相关研究进展作一综述。
【关键词】Micorna-499;miRNA-499相关单核苷酸多态性(rs3746444);肿瘤(乳腺癌)微小RNA(microRNA,miRNA)是一类高度保守、长度约23个核苷酸的内源性非编码单链RNA,通过与其靶基因结合而进一步发挥其调控作用。
miRNA相关单核苷酸多态性是基因水平上因为单个核苷酸的变异引起DNA序列的多态性。
现阶段,随着基因水平研究的进一步深入,发现肿瘤的发生、发展与多数miRNA及相关单核苷酸关系密切,而且,人类在部分肿瘤正在尝试用miRNA去诊治。
1.miR-499的生成、作用及相关单核苷酸多态性miRNA-499(miR-499)是2005年由Bentwich等[1]利用计算机模拟分析和miR芯片技术新发现的一种微小RNA。
多种种属的大部分都已被确定位于Myh7b编码基因的内含子中。
编码miRNA的基因在细胞核内RNA聚合酶Ⅱ催化下转录生成初级miRNA(pri-miRNA),而后pri-miRNA被加工成pre-miR NA即miRNA前体,经载体输送至胞质;miRNA前体被剪切成20-25个核苷酸长度的双链成熟体miRNA,在RNA解旋酶作用下,双链成熟miRNA分解为成熟的单链miRNA和对应的互补链,后者被水解,而成熟的单链miRNA结合到RNA诱导的基因沉默复合物(RISC)中,形成RISC复合物。
-128-第27卷第2期Vol.27, No.22007年2月Feb.2007生 殖 与 避 孕Reproduction & Contraception randc@单核苷酸多态性在原因不明习惯性流产中的研究进展刘 梅 龚 伊 张先君(江苏省分子医学生物技术重点实验室, 南京师范大学生命科学学院, 南京, 210097)【摘要】 原因不明习惯性流产(URSA)是多基因控制的复杂疾病,占习惯性流产的40%-80%。
单核苷酸多态性(SNP)是识别URSA 致病基因或易感基因的有效手段,可从基因水平上阐明URSA 的发病机理,为URSA 的预防、治疗和预后提供一定的指导。
本文就SNP 在URSA 中的研究作一初步的概括。
关键祠: 单核苷酸多态性; 原因不明习惯性流产中图分类号: R714.21 文献标识码: B 文章编号: 0253-357X(2007)02-0128-05基金项目: 江苏省高校自然科学基金项目(06KJD330103)通讯作者: 刘 梅; Tel: +86-25-83598779;Fax: +86-25-83598779; E-mail: meiliunj@习惯性流产(recurrent spontaneous abortion ,RSA)是指连续2次或2次以上的自然流产,临床发病率约为2%-5%,远高于其机会期望值0.3%[1]。
RSA 病因复杂:染色体异常、解剖因素、内分泌异常、免疫因素、血型不合、感染甚至精神因素等均可导致习惯性流产的发生等。
此外,仍有40%-80%的RSA 患者病因不明,即原因不明习惯性流产(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)。
由于不能做到对“症”下药,目前URSA 治疗效果很不理想,探讨和研究URSA 的发病机理也因此成为医学和生物学备受关注的研究方向之一。
对于疾病尤其是复杂疾病的发生,从根本上讲是遗传因素和环境因素交互作用的结果,是基因在环境诱导下的异常表达所致。
单核苷酸多态性与疾病遗传易感性的关联研究众所周知,遗传因素非常重要,可以影响人类健康和寿命。
研究人员已经证明,单核苷酸多态性在体内的作用对疾病遗传易感性有着重要的影响。
本文将讨论单核苷酸多态性和疾病遗传易感性之间的关系,并讨论如何有效地研究这些过程。
1. 单核苷酸多态性(SNP)的定义单核苷酸多态性是一种遗传变异的形式,影响人的表型和生理功能。
实际上,DNA序列的每一个位置都可能存在SNP。
当一种SNP在一个人中存在时,DNA中的这个碱基会被一个替代碱基所取代,从而影响基因的表达。
SNPs通常存在于非编码区域,但也有可能在编码区域中有影响,从而导致蛋白质结构和功能的变化。
2. SNP与疾病遗传易感性研究表明,SNPs在疾病的发生和发展中起着重要的作用。
通过比较SNP在疾病组和正常组中的差异,可以发现某些SNP与特定疾病的易感性有着显著的关联。
例如,APOL1基因的SNP rs73885319和rs60910145与肾病的易感性密切相关。
另一个例子是SNP rs8034191位于INTERLEUKIN-23RECEPTORS基因上,与类风湿关节炎的易感性有关。
这些研究表明,SNP与疾病遗传易感性之间的联系是明显的。
3. SNP研究单核苷酸多态性研究的挑战在于数据量庞大。
近年来,随着高通量技术的兴起,SNP研究的速度和效率得到提高。
现在,SNP芯片和测序技术能够快速分析大量的SNP,从而为研究人员提供关于SNP与特定疾病相关性的信息。
同时,现代计算机和云计算技术的发展,也提高了SNP研究的数据分析能力。
4. 结语单核苷酸多态性在疾病遗传易感性的研究中发挥了重要的作用。
尽管SNP研究的过程很复杂,但通过现代高通量技术和计算机科学的应用,能够更好地理解SNP与特定疾病之间的关系。
在今后的研究中,将继续深入探讨SNP研究对实现个体化医疗的作用。
结核分枝杆菌基因组单核苷酸多态性研究进展刘海灿;万康林【摘要】@@ 目前,随着结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis,M.tuberculosis)H37Rv、CDC1551、H37Ra、F11和KZN 1435等菌株全基因组测序工作的完成,以及新一代核酸测序技术的飞速发展,使得结核分枝杆菌研究进入新阶段,即可以从基因组水平对其进行更深入的研究[1~3].【期刊名称】《医学研究杂志》【年(卷),期】2011(040)004【总页数】4页(P6-8,2)【作者】刘海灿;万康林【作者单位】102206,北京,中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室;102206,北京,中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室【正文语种】中文目前,随着结核分枝杆菌 (M ycobacterium tuberculosis,M.tubercu losis)H37Rv、CDC1551、H 37Ra、F11和KZN 1435等菌株全基因组测序工作的完成,以及新一代核酸测序技术的飞速发展,使得结核分枝杆菌研究进入新阶段,即可以从基因组水平对其进行更深入的研究[1~3]。
近年来,有许多从基因水平研究结核分枝杆的菌种鉴定、菌株分型、分子进化以及药物敏感性检测等的文献报道[4~10]。
本文将就结核分枝杆菌基因组单核苷酸多态性 (single nuc leotide po lymorphism s,SNP)的鉴定、检测方法及其应用研究进行综述。
SNP主要是指基因组水平上由单个核苷酸变异引起的基因组DNA序列多态性,这种多态性包括单个碱基的转换 (transition)、颠换 (transversion)、插入(insertion)和缺失 (deletion)等 4种形式,但研究中通常认为 SNP仅包括转换和颠换两种形式。
SNP可位于基因组的基因编码区、非基因编码区和基因间隔区,如果 SNP发生在基因编码区,但未造成基因编码的氨基酸序列改变,称为同义 (synonymous)SNP,若造成基因编码的氨基酸序列改变或肽链被提前终止,则称为非同义(non-synonymous)SNP。
人类单核苷酸多态性与疾病发生风险的关联性研究人类单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms, SNP)是指在基因组的某个位置,由于单个核苷酸的变异而导致的基因多态性。
这种变异可能引起蛋白质结构或表达的改变,进而对个体的生理、代谢和疾病发生风险等方面产生影响。
目前,基因多态性与疾病的病理机制、发病率以及基因检测等方面都在科学研究的范畴内。
SNP在人类基因组中分布广泛,据估计,人类基因组中共有约1000万个SNP。
然而,这些SNP并非都与疾病发生风险相关。
有些SNP可能分布在基因的非编码区域或者与基因功能无关,对健康状况没有影响。
目前,大量的研究表明一些SNP与疾病的风险显著相关。
例如,APOE基因的ε4等位基因是阿尔兹海默病(Alzheimer‘s disease, AD)的最重要遗传风险因素之一。
另一方面,超过100个SNP被与糖尿病、高血压、心脏病、癌症等疾病的风险有关联。
此外,SNP与药物安全和有效性等方面也有着密切的关联。
在疾病预测和诊断方面,个体的基因谱图可能起到重要作用。
除了APOE基因的ε4等位基因,一些其他SNP与阿尔兹海默病、帕金森病、脑卒中等神经系统疾病的风险有关联。
在癌症诊断方面,SNP也能为早期筛查和预测治疗效果提供指引。
例如,修复基因MTHFR的C677T多态性被认为与乳腺癌的风险有关。
然而,基因功能和疾病的发生是极为复杂的生理过程。
SNP与疾病的风险存在诸多复杂的相互作用和调控机制。
一些SNP与环境因素以及生活习惯的交互作用导致了疾病的发生。
例如,CYP2C9和VKORC1基因等位基因与华法林使用的效果有关。
不同的SNP可能对基因组中的不同基因、调控元件、微小RNA等具有不同的调控作用。
因此,在研究SNP与疾病的关联性时需要考虑到多方面的因素,涉及多学科的知识。
当前,人们采用大数据分析、区域关联分析、人工智能等技术解决SNP 与疾病风险关联性的问题。
单核苷酸多态性和性状遗传的相关研究随着基因测序技术的不断进步和普及,越来越多的人开始关注单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)和性状遗传的相关研究。
单核苷酸多态性是指基因序列中的一个单核苷酸变异,这种变异不仅是个体间遗传差异的主要来源之一,还与许多疾病的发生密切相关。
性状遗传是指某一种具有遗传基础的性状在不同个体间呈现不同的表现,这种表现可以是定量或定性的。
人类的身高、体重、皮肤颜色等性状都有明显的遗传基础,而通过研究单核苷酸多态性与性状遗传之间的关系,可以更好地理解这种遗传现象。
目前,单核苷酸多态性与性状遗传的研究已经涉及到人类生理、心理、疾病等各个领域。
下面,我们就来看看这个研究领域中一些重要的进展和研究思路。
一、单核苷酸多态性与生物学进化生物演化是指生命体系的进化历程,其不断变异和适应环境的能力使得物种不断地进化和适应环境。
基因测序技术使得我们能够精确地了解物种内部的遗传差异,从而更好地了解动物进化史和地理分布。
许多研究表明,不同物种的单核苷酸多态性差异明显,许多物种的进化和遗传差异也与单核苷酸多态性相关。
例如,新疆准噶尔盆地的野驴和中国其它地区野驴的单核苷酸差异为0.11%,而与马的差异则为0.92%。
这种差异反映了物种进化的历史,也有助于我们更好地保护和管理野生动物种群。
二、单核苷酸多态性与疾病风险人们对于疾病的发生和治疗一直有着极大的关注。
通过与疾病风险相关的SNP的研究,可以更好地了解疾病的遗传基础,为疾病的治疗和预防提供有力的支持。
例如,骨质疏松症就与多种SNP相关,而了解SNP的变异频率和位点信息,有助于医生更好地评估和预防疾病的发生。
三、单核苷酸多态性与药物反应药物反应性是指不同人体对于同一种药物的反应不同,这主要是由于遗传因素所致。
SNP与药物代谢酶的活性有关,因此研究SNP与药物反应间的关系,也可以对药物剂量、疗效等方面进行更好的预测。