桃品种种质资源的RAPD分析
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罐装黄桃种质过氧化物同工酶的酶谱分析
摘 要:采用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术对黄桃六个品种(品系)进行过氧化物同工酶电泳分析,并通过聚类分析法其亲缘关系进行研究。结果表明,供试品种问都有两条共同特征的谱带,同时又蕴涵丰富的多样性。黄金冠与锦绣亲缘关系最为接近,与其他品系间的亲缘关系较远。
关键词:黄桃;过氧化物同工酶;亲缘关系
黄桃新品种‘黄金冠’是聊城大学生命科学学院于20世纪90年代中期从山东省平邑县引种栽培的锦绣黄桃自然杂交实生苗中选出的罐藏、鲜食兼用黄桃优系,经在山东、江苏的多年多点区域试验和生产栽培,性状稳定,综合性状表现优良,2006年9月通过山东省科技厅组织的专家鉴定。
同工酶是基因表达的直接产物,常用作探测基因差异和遗传关系及品种遗传性状的指标。研究供试黄桃新品种‘黄金冠’与常规栽培黄桃‘锦绣’及其它黄桃品系的酶活性差异,进一步研究其亲缘关系,以期为黄桃新品种的选育、品种(品系)鉴别及变异体鉴定等提供科学依据。
1 材料与方法
1.1 材料
材料均取自聊城大学桃育种基地,供试品种(品系)为黄金冠、锦绣、锦黄4号、锦黄3号、锦黄2号、黄桃19号。
1.2 样品制备
称取幼叶1g,放入研钵内,加pH值8.0的提取液3ml(1mol/L HCl 24ml,三羟甲基氨基甲烷3g,加去离子水至50m1),在冰浴中研磨成匀浆,12000r/min离心20分钟,上清液置于4℃冰箱中备用。
1.3 电泳分离及染色
采用垂直平板聚丙烯酰胺凝胶电泳技术测定凝胶制备及电泳条件参见胡能书等(1985)编著的《同工酶技术及其应用》书中的方法,改良联苯法染色。
1.4 数据分析方法
对染色后的胶板拍照测量溴酚蓝的前沿到起点的距离,记录酶带的强弱和酶带之间的距离。根据各酶带的相对迁移率(Rf)及酶带的深浅、宽窄绘制同工酶图谱,而后进行分析。
2 结果与分析
2.1 6个黄桃品种(品系)叶片过氧化物同工
酶的酶谱结构及特征分析
濒危药用植物桃儿七野生居群遗传多样性与遗传结构的SCoT分析
目的:揭示珍稀濒危药用植物桃儿七的遗传多样性水平及居群遗传结构特点。方法:采用新型分子标记SCoT对来源于我国的6个桃儿七野生居群共45个个体进行遗传多态性检测。运用POPGENE软件计算相关遗传参数,UPGMA方法聚类,结合MEGA5软件生成树状图。结果:筛选出的27条引物,共检测到350个位点,其中284个为多态位点,平均每条引物扩增所得多态条带为10.52条。物种水平上,桃儿七6个野生居群的遗传多样性较为丰富,PPB 79.27%,Ne 1.332 7,H 0.210 9,Hsp0.328 6。在居群水平上,遗传多样性水平较低: PPB
10.48%(4.00%~23.71%),Ne 1.0487(1.020 7~1.103 7),H 0.029 7(0.012 9~0.063 1),Hpop 0.046 2(0.019 9~0.098 6)。Nei′s 基因多样性指数计算的居群间遗传分化系数Gst=0.841 1与Shannon′s居群分化系数(Hsp-Hpoppop)/Hsp=0.849
4基本一致,均说明大部分遗传变异存在于居群间。基因流Nm= 0.094 4,表明桃儿七居群间基因交流处于低等水平。Nei′s遗传一致度(I)范围为0.570 8~0.978
7。聚类分析将供试居群分为2 类,相同地理来源或相似生境的材料具有聚为一类的倾向。结论:供试野生桃儿七具有较丰富的遗传多样性,为有效保护和改良种质资源奠定了一定的基础。
标签: 桃儿七;SCoT;遗传多样性;遗传结构
桃儿七Sinopodophyllum emodi(Wall.)Ying为小檗科桃儿七属多年生草本植物,《神农本草经》中以“鬼臼”之名收载,药用历史悠久,其根及根状茎、果实均可药用,具有祛风除湿、活血化瘀、化痰止咳、解毒的功效,用于风湿痹痛、肢体麻木、胃脘疼痛、跌打损伤、劳伤咳嗽等证,并可解铁棒锤中毒。目前,桃儿七地下部分主要作为抗癌药物Vp-16(etoposide)等合成的前体物质鬼臼毒素(podophyllotoxin)的提取原料,果实则为藏药材“小叶莲”(藏族语称“奥勒莫色”)。桃儿七为我国特有种,主要分布于陕西、甘肃、青海、四川、云南、西藏等地,生于海拔1 500~4 300 m的高山灌丛、草丛及路旁。目前,桃儿七的人工栽培尚未规模化,药材主要来源于野生。在利益的驱使下,野生桃儿七掠夺式地被大量采挖,致使植被遭受严重破坏,生境急剧恶化,加之藏医以其果实入药,极大的削弱了群体的天然繁殖能力。目前,桃儿七野生群体数目和群体规模在不断变小,分布区域日渐缩减,资源面临濒危的境地,早在1992年即已被列入《中国珍稀濒危植物名录》,并被《中国植物红皮书-稀有濒危植物》收录[1],为国家三级保护植物。近年来,人们逐渐认识到保护桃儿七资源的重要意义,并开展了资源分布调查、野生变家种等保护工作,但大多数保护活动仍然是在缺乏基本的生物学研究尤其是保护遗传学研究的情况下进行的,很难制定科学的保护措施。此外,笔者等的研究表明,不同产地与小生境生长的桃儿七(居群),其生物量及地下部分中的鬼臼毒素的含量均存在较大差异[2-3],提示桃儿七药材质量可能与其遗传特性有关。为合理保护和利用桃儿七资源,有必要研究其遗传多样性,分析其遗传结构。
分子标记及其在核桃种质资源研究中的应用
摘要介绍了分子标记技术的类型,以及目前常用的几种分子标记技术(rflp、aflp、rapd、ssr、issr等)的基本原理、特点,综述了分子标记技术在核桃种质资源研究中的应用情况,并对目前分子标记研究存在的问题及前景作了分析。
关键词分子标记;核桃;种质资源;应用
中图分类号q819文献标识码a文章编号
1007-5739(2009)14-0347-04
分子标记也称为dna分子遗传标记,或dna标记,是继形态学标记、细胞学标记及生化标记之后,近年来被广泛应用的一种新的遗传标记。分子标记从分子水平反映生物个体间或种群间具有差异特征的dna片段,直接反映基因组dna间的差异,从而为解释各物种间的亲缘关系奠定了技术理论基础[1]。dna标记能对各个发育时期的个体、组织、器官进行检测,不受发育阶段及环境的影响,且遗传稳定、数量丰富。dna分子标记对生物的影响表现为中性,有些标记为共显性,且对选择隐性基因控制的性状十分有利。至dna标记诞生到现在,发展迅猛,日臻成熟。目前,dna标记被广泛地应用于植物遗传育种、基因定位、基因克隆以及分子辅助选择等研究领域。
我国是核桃属(juglans)植物分布中心之一,原产于我国的有5个种,其中核桃(j. regia l.)和铁核桃(j. siggillata l.)具有极大的商业坚果栽培价值[2-5]。随着核桃属作物大规模商业化的快速发展,以及品种选育、鉴定、推广及种质资源收集和保护工作的深入开展,形态描述、地理来源以及同工酶等方法由于自身存在局限性而难以满足核桃属植物研究和开发的需要,分子标记技术将成为上述工作的有效工具。
1分子标记的类型
dna分子标记大多以电泳谱带的形式体现,大致可分为两大类[1]。第1类是非pcr依赖的分子标记(基于southern杂交的分子标记),包括限制性片段长度多态性标记(restriction fragment
SSR分析50份桃种质资源遗传多样性
周平;郭瑞;张小丹;姚启英;廖汝玉;颜少宾;金光;杨凌
【摘 要】Genetic diversity of 50 Prunus persica germplasms was analyzed
using 16 pairs of SSR primers.The results showed that the polymorphism
information contents of the individual sites ranged from 0.04 to 0.37 with
an average of 0.24.The 50 peach germplasms could be classified into 3
groups according to thecluster analysis of the unweighted pair group
method witharithmetic mean.They were medium late-maturing,medium
early-maturing and low-temp early-maturing peaches.In addition,the low-temp germplasms with excellent over-all properties in the hot and humid
southern regions could be grouped by themselves.The ornamental
varieties were genetically far remote from the common peaches.A genetic
analysis indicated that some of the local germplasms found in Fujian were