NMR处理软件-NUTS
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¤NMR处理软件:
♣核磁数据处理软件有:Nuts、MestRe-C、Gifa, NMRNoteBook, Sparky, NMRpipe等。
♣ NUTS可以处理一维及二维核磁数据,其功能包括付立叶变换、相位校正、差谱、模拟谱、匀场练习等几乎所有核磁仪器操作软件的功能, 其演示版可以在/下载;
♣ MestRe-C为处理一维核磁数据的免费软件,功能完善。
其最新版本为4.9.9.6,有兴趣者可以在/
¤Nuts2000软件操作界面:
1. 运行程序双击打开nuts2000程序
2.打开文件鼠标点打开按扭(快捷命令“GA”),选择fid文件,点打开
3.打开后如下图打开时如果有提示一律点“yes”通过
1. 窗函数的设置点菜单中的process—conditions,出来一个对话框,一维图谱一般使用线形窗函数即可,对于氢谱一般把LB设置为0~1,对于碳谱LB可以设置为1~5,具体因情况而定。
2. 窗函数的应用设置好LB的值后,在命令行输入EM,命令行的位置如图所示,也可以输入GM 、LG、TF。
输入后可以看到fid信号变得“光滑”。
3.谱图的傅立叶转换鼠标点傅立叶变化按扭,也可以在命令行输入“FT ”傅立叶变化之后,图谱有‘正’有‘负’,此时需要进行相位校正。
1. 自动相位矫正在命令行输入自动相位矫正命令,常用命令有:“QP”、“AP”、“QA”,三个任选一个即可,若效果不好,可以换另一个命令,若三个命令都不好用,那就进行手动调整相位。
2. 简单手动调整相位用鼠标点相位校正按钮,然后按住鼠标左键不放,左右拉动,直到相位调整到满意为止,若一次调整不好,还可以松开鼠标后再次按住鼠标左右拖动。
命令方式:“PH”,一般结合“ZP”命令应用。
3.PE手动调整相位一、在图形界面上任意位置双击鼠标左键,或者点击工具栏中的放大按扭,将光标移到将要选定区域的起始位置后,按住鼠标左键,拖动鼠标至区域终点,出现红色区域,选定后,按键数字“1”,定义为第一区域。
3.PE手动调整相位二、用相同的方法选定第二区域,按“2”,定义为第二区域。
选择完毕后输入回车(Enter)。
1. 基线校正输入命令“FB”,输入命令“FB”后,如图所示,用鼠标左键进行选择,让你认为是基线的部分变成红色,信号峰变为白色。
2. 基线校正在“FB”状态下,用命令“L”对基线进行基线矫正的计算,命令C为另一种矫正模式,计算完成后输入命令“A”进行矫正。
3. 基线校正若上述两种矫正方式的效果都不好,可以试试Fudge Baseline方法,也许可以达到你预想不到的效果在FB模式下输入命令F即可。
4.基线矫正后的结果:
1. 化学位移定标在图谱中找到参考峰,对其放大,然后对准参考峰按住鼠标左键,出现大的十字形光标。
在在不放松鼠标的情况下,按键“O”,出现对话框,在对话框内输入相应的数值后,若是TMS,则输入数字0,回车
2. 峰值显示,主要命令MH, “PP”输入命令MH,或者点菜单中的process-conditions,在MH栏中填数字1,点ok
输入命令PP,或者点工具栏中的化学位移显示按纽,结果如下:(MH的值相当于一个门槛,高于这个门槛的峰值都会显示,因此MH的值越小,显示的峰值越多。
)
1. 输入命令“ID”,如图所示,左边出现滚动条,拉动滚动条可以调整积分线的大小,使积分线处于软件屏幕内。
2. 输入命令Z,左边又出现一个滚动条,拖动此滚动条可以调整积分线的高低,调整完毕后
回车退出此滚动条,注意回车只能按一次。
(多数情况下可以忽略这一步)
3. 单击鼠标左键出现红色光标线,移动到积分的起点,第二次单击左键,此时出现绿色光标线,移动到积分的终点,第三次单击左键,即完成对某一峰的积分工作。
重复操作即可对每个峰进行积分工作。
按L可以删除最后一个积分
插入注释用图片或文字主要命令“MO”和“NO ”键入或选择命令“MO”,会出现如右图的对话框I: 插入Windows 图元文件(后缀名为wmf)C: 插入剪贴板中预存的图片A: 将当前谱图显示插入谱图中(和IS命令等同,图片质量有所降低)
插入注释用图片或文字图例“MO”主要用于图片的插入
插入注释用图片或文字键入或选择命令“NO”,用鼠标左键点击任意位置或键入命令“A”,出现对话框,输入所需的信息。
在此命令状态下,选定某一文本,按鼠标右键可对其再编译,或删除。
键入“C”,取消所有插入键入“P”,显示实验参数键入“S”,控制是否显示插入的文本
1. 选择需要放大的区域,选择后回车
2. 输入命令“IS”,然后输入命令“A”
若要显示多处放大图,可以重新上述操作
DD:双图谱显示,并对其对比和进行加、减操作先将需要插入的图谱进行一些基本操作(如FT、SR、PE)之后,键入或选择命令“AL”,打开另一个需要对比的图谱,适当处理后,键入命令“DD”,即可调出上一图谱。
用“AM”编译前一谱图。
AS 命令下可以对两个谱图进行加、减等操作。
优点:双谱图显示,可进行加减操作,应用广泛缺点:无法实现多谱图显示
1. 双重谱图的显示DD
“AL”命令:
2.双重谱图的显示DD
图示运用“DD”命令调出上一个图谱
3.双重谱图的显示DD
图示运用“DD”命令调出上一个图谱
将需要对比的谱图进行一般的处理之后,键入或选择命令“BU”,在此命令状态下将当前谱图转入缓存通道中,回车退出“BU”后,即可打开第二张谱图,一般处理完毕后,键入命令“BU”即可对两张图谱进行对比操作,也可以将当前图谱加入其余的缓存通道内,继续打开第三张图谱。
在“BU”命令条件下可以对每个缓存谱图进行处理。
将所有需要对比的谱图放入相应的缓存内后,可以显示每个缓存内的图谱,点击在“BU”状态下“View”菜单下的“Display buffers outside of BU”命令,回车后即可在无BU状态下,显示所有的缓存谱图。
优点:可显示多谱图,并对其进行处理
1. 多重谱图的显示输入命令BU
把当前图谱转移到其它缓冲区
让某个缓冲区的图谱显示或者不显示
二维图谱处理: 1、用宏命令处理 2、手动处理1. 用宏命令处理
♦输入命令ru,选择相应二维宏命令,如cosy.mac。
♦选择二维fid文件,数十秒后便可以处理好
♦改峰高: mh, 改minimum height 数值
♦给上面左边图: 等
♦看谱图: cp (contour) 或ip
输入命令ru,选择相应二维宏命令
选择二维原始fid文件
处理完成后
♦字体设定
在菜单栏中选择“EDIT”下“SET FONTS”中的各个命令,各个版块的字体进行设定♦图谱的复制和粘贴
Copy enhanced metafile to clipboard (Alt-Shift-E)
Copy enhanced metafile to file (Ctrl-Alt-E)
♦把数据转化为ASC格式
菜单File-Export File- 里面有很多选择
具体参考help文件。