核磁共振数据处理软件NUTS的使用说明
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核磁共振数据处理软件NUTS的使用说明核磁共振数据处理软件NUTS主要包括以下几个步骤:1、调入图谱;4、FT变换(将FID信号转换成频率域图谱) ;5、相位调节;6、基线校正;7、化学位移定标;8、积分;9、画图。
下面就这些步骤中最基本的内容做简单介绍,详细的说明请查阅该软件的Online Help。
1、调入图谱启动NUTS软件,点击File→Open, 找到核磁数据目录,从该目录或它的子目录中找到名*.fid的文件,调入文件,屏幕上出现FID信号。
4、FT变换键入“FT”,或点击上方FT图标P,将FID信号转变为频率域谱图。
可用右侧滚动条、“PAGE UP”、“PAGE DOWN”或“<”,“>”调节谱峰高度。
5、相位调节相位调节的方法有三种:a自动相位校正:键入“QP”(有时不能正确调节相位);c 分段相位校正:点击ZOOM图标,选择某个图谱区域,键入“1” ;选择其他区域,键入“2” 。
回车(enter),键入“PE”,按住左键(left button),左右移动鼠标,调区域1的相位,右键(right button)调节区域2的相位,完成后回车(enter)退出。
6、化学位移定标Base Level状态下,按住鼠标左键,出现一红色“十”字光标,将光标移至要定标参考峰(TMS或溶剂峰)处,使竖线与峰重叠,按住左键的同时键入“O”,在出现的对话框中输入参考峰(TMS或溶剂峰)的化学位移值,然后点击OK,即可。
必要时可将参考峰放大(方法参见下画图部分)。
8、积分积分的方法有二种:b 手动积分(manual integral):Base Level下,键入“ID”,左边滚动条调节积分线高低。
如积分线不平,键入“B”,按住鼠标左键(left button)调整积分线左边到水平,按住鼠标右键(right button)到水平,完成后回车(enter)。
左键在选定峰的起点双击,出现一条绿线,再在该峰的终点单击,完成该峰的积分,其他峰操作相同。
Nuts 软件(1)输入ft; 输入qp←(该箭头表示需按回车键,下同);(2)选中谱图左侧部分并设为“1”,选中右侧部分并设为“2”←;(3)输入pe, 左键调平“1”区域的基线,右键调平“2”区域的基线←;(如果采用ap自动调平基线,就不需要这个pe操作);(4)左键不松手出现十字交叉红线,同时输入“M”标峰←;dp命令用于标记化学位移值,dp命令下,在峰附近左击即可标记该峰的化学位移值,若在峰附近按K,即取消对该峰化学位移值的标记。
(5)输入ai, id, c, b (自动积分,并可将积分线调整到合适的高度)←; (6)放大积分区域,输入id命令,可在该区域进行积分操作:(I)左键点击一下出现红线,击两下后出现的绿线是积分的起始处;再将红线移动至积分终结处点击一下,完成该峰的积分。
同上,对其它峰进行积分操作。
(II)在已积分峰处按住左键不松手,同时输入“V”,可在弹出对话框中设定该峰的氢的个数。
(III)在已积分峰处按住左键不松手,同时输入“d”,可以删除该峰处的积分。
在积分状态下按“L”键,可以取消最后一次的积分。
(IV)积分相关操作结束后需按回车键;而重新开始积分相关操作,只要先输入id命令再操作即可。
(7)输入dp命令(标峰相关的操作):单击左键可以逐个手动标峰;移动光标至已标峰处并按“k”键,可以删除该处的标峰。
dp命令结束后,需按回车键。
(8)输入no,a:弹出文件名对话框,输入你的文件名,“choose font”可以设置文件名的字体和大小,点“ok”完成。
再按回车键。
Mo 输入分子式(9)点开nuts软件的file菜单:(I)打开printer setup,将“方向”改为“横向”,再点开“属性”按钮并点击“属性”按钮中的“基本”,点击“确定”、“确定”即可。
(II)打开page setup,取消“Border Box Printed on page”和“Parameters Printed on Page”勾选项,再点击“ok”即可。
n核磁数据处理软件有:NUTS、MestRe-C、Gifa等,NUTS可以处理一维及二维核磁数据,其功能包括付立叶变换、相位校正、差谱、模拟谱、匀场练习等几乎所有核磁仪器操作软件的功能, 其演示版可以在/下载;MestRe-C为处理一维核磁数据的免费软件,功能完善。
其最新版本为2.3,有兴趣者可以在c.es/jsgroup/MestRe-C/MestRe-C.html 处查看有关信息即下载;Gifa可以处理一至三维核磁数据,为运行在LINUX操作系统中X-Window上的免费软件,有关信息可查看http://www.cbs.univmontp1.fr/GIFA/。
n下载原始数据和n运行软件NUTs 可下载NUTs的服务器10.13.51.8710.13.51.238n获取NMR原始文件打开NMR原始文件(可从服务器上下载)。
一般文件名为FID 快捷命令“GA”n谱图的傅立叶转换和翻转快捷命令“SR ”快捷命令“FT ”n相位调整常用命令“QP”、“AP”、“QA自动相位调整“PH”一般结合“ZP”命令应用“PE”手动相位调整n相位调整用“PE”命令对谱图作手动调整一、在图形界面上任意位置双击鼠标左键,将光标移到将要选定区域的起始位置后,按住鼠标的左键,拖动鼠标至区域终点,出现红色区域,选定后,按键“1”,定义为第一区域;用相同的方法选定第二区域,按“2”,定义为第二区域。
选择完毕后输入回车(Enter)n相位调整用“PE”命令对谱图作手动调整二、键入命令“PE”后,按住鼠标的左键,左右拖动对第一区域进行相位调整,调整完毕后,松开左键,按住右键,左右拖动对第二区域进行相位调整,调整完毕后,松开左键,输入回车(Enter)即完成手动相位调整。
用“PE”命令对谱图作手动调整后的结果n确定零点或标准位移标,将光标移动到目标峰位置后,在不放松情况下,按键“O”,出现对话框,在对话框内输入相应的数值后,回车。
NUTS 核磁软件使用方法简介
1.移动文件:把1r复制到pdata目录下, 目录顺序pdata-1-1r
2.黏贴结构式:1) chemdraw中复制结构式
2) NUTS中,输入MO,单击import clipboard,调整大小,EXIT MO
3.标位移:1) 滚轮上下调整峰高度
2) 按左键,出现十字标线,下移至适合位置,同时按M
4.缩放:1) 放大:双击左键,划取放大区域,单击右键,enter
2) 缩小:双击右键,还原初始大小
5.积分:1) 进入积分:输入ID
2)(峰左边)双击左键,(峰右边)单击左键
3) 标1H:左键单击目标峰同时按V,修改Current Value值
4) 数值上移:左键单击数值同时按1
数值下移:左键单击数值同时按3
5) 删除积分:左键单击数值同时按D
6) 退出积分:enter
7) 显示积分:Ctrl+I
6.输出PDF: 1) 设定区域:输入ZOF,Start 12,End -0.5,2次enter
2) 横向打印:目录顺序File—Printer setup—landscape
3) 打印机:目录顺序File—Printer setup—Adobe PDF
4) 打印:目录顺序File—Print
wo.wangqi@。
核磁共振数据处理软件NUTS的使用说明
核磁共振数据处理软件NUTS主要包括以下几个步骤:
1、调入图谱;
4、FT变换(将FID信号转换成频率域图谱) ;
5、相位调节;
6、基线校正;
7、化学位移定标;
8、积分;
9、画图。
下面就这些步骤中最基本的内容做简单介绍,详细的说明请查阅该软件的Online Help。
1、调入图谱
启动NUTS软件,点击File→Open, 找到核磁数据目录,从该目录或它的子目录中找到名*.fid的文件,调入文件,屏幕上出现FID信号。
4、FT变换
键入“FT”,或点击上方FT图标P,将FID信号转变为频率域谱图。
可用右侧滚动条、“PAGE UP”、“PAGE DOWN”或“<”,“>”调节谱峰高度。
5、相位调节
相位调节的方法有三种:
a自动相位校正:键入“QP”(有时不能正确调节相位);
c 分段相位校正:点击ZOOM图标,选择某个图谱区域,键入“1” ;选择其他区域,键入“2” 。
回车(enter),键入“PE”,按住左键(left button),左右移动鼠标,调区域1的相位,右键(right button)调节区域2的相位,完成后回车(enter)退出。
6、化学位移定标
Base Level状态下,按住鼠标左键,出现一红色“十”字光标,将光标移至要定标参考峰(TMS或溶剂峰)处,使竖线与峰重叠,按住左键的同时键入“O”,在出现的对话框中输入参考峰(TMS或溶剂峰)的化学位移值,然后点击OK,即可。
必要时可将参考峰放大(方法参见下画图部分)。
8、积分
积分的方法有二种:
b 手动积分(manual integral):Base Level下,键入“ID”,左边滚动条调节积分线高低。
如积分线不平,键入“B”,按住鼠标左键(left button)调整积分线左边到水平,按住鼠标右键(right button)到水平,完成后回车(enter)。
左
键在选定峰的起点双击,出现一条绿线,再在该峰的终点单击,完成该峰的积分,其他峰操作相同。
完成积分后,选定一个特征的峰,设定积分参考值,将光标置于所选峰上,键入“V”,在出现的对话框中输入所定的积分值,回车。
与积分相关的一些其他指令:
a.在积分状态下,键入“C”,可消除所有积分(cancel all integrals);
b.在积分状态下,将光标置于所选峰上,键入“D”,可消除所选峰的积分(delete the integral);
c.在积分状态下,将光标置于所选峰上,键入“1”,“2”或“3”可使积分值出现在不同高度(adjust the height of integral)。
9、画图(paste molecular)
a 选定画图区域:Base Level下,用光标点击“ZO”图标,单击鼠标右键(right button),即可将红色区域放大,回车(enter)退出该功能;单击右键可使图谱恢复原来大小;
b Peak Picking:BASE LEVEL下,按住鼠标左键,出现一红色“十”字光标,将光标移置于最低所要峰的高度,键入“M”;回车(enter)退出该功能;
c PPm与Hz单位转换:Base Level下,键入“DP”,然后重复键入“H”可使Peak的单位在Hz与PPm之间转换;回车退出该功能;
d 编辑Title:Bas
e Level下,键入“NO”,然后键入“A”,在出现的对话框中直接输入图谱的Title, 键入“P”,可将参数表置于图谱中,(键入“C”,可清除所有文本(delete all text and molecular),)点击OK,用鼠标拖住红色框可调整Title和参数表在图谱中的位置。
回车退出该功能;
10.Print
a print
b printer setup
c page setup
d printer dialog
f 键入“PL”或点击“Print”图标,图谱即可打印出。
使用NUTS打印核磁图谱会出现两个两个问题
1图谱上的的字会变的很小.
2每次打印会打印出一张错误的图谱
解决方案
当设置好核磁图谱需要打印时.
1 点击Print,选择“横向”,点“确定”。
这时候打印机是无法打印出文件来,但我们的第一个问题就解决了。
2 点击Printer Dialog,选择打印到文件,并任意输一文件名,完成后再返回正常设置。
3 点击Print Setup,“确定”。
4 点击“Print”,可正常打印出谱图。
以上可以节省纸张和碳粉,请大家务必照做.如有那位同事有更好的办法改进,请告诉我们!
谱图保存
在“Base level”状态下,按“Control+C”; 然后在画图板里“Paste”,将此文件保存为“Jpeg”格式即可。
Exercise:。