下载文档原格式
肠道病毒71型VP1蛋白二级结构及B细胞表位的预测王锦;许国章;倪红霞【摘要】The purpose of this study was to predict the secondary structure and B cell epitopes of enterovirus type 71 of VP1 Gene of C4 subgenotype, so as to provide theory evidence for the study of vaccine preparation for EV71. EV71 strains were isolated from hand ,foot and mouth disease in Ningbo in 2010. Homology and phylogenetic analysis based on VP1 with others EV71 have published in GenBank were conducted. The secondary structure of EV71 based on VP1 was analyzed using the GOR4 and SOPMA,and the B cell epitope of EV71 was predicted by combining the hydrophilicity, flexility and surface probability. The Ningbo strain shared the highest homology of nucleotide and amino acid with the type C4a were 93. 6%-99.3% and 98. 35%-100%, phylogenetic analysis revealed that Ningbo strains clusterd within the C4a evolution branch of C4 subgenotype. The secondary structure of EV71 VP1 showed random coils and |3-sheet mainly with a number of antigen index higher section. The B cell epitopes was probably located at the regions of 39-40,159-167.212-220, and 287-290 of VP1 Gene. The secondary structure and B cell epitopes of EV71 VP1 could be predicted by bioinformatics methods, which providing theory evidence for the study of vaccine preparation for EV71.%目的预测C4基因亚型肠道病毒71型的VP1蛋白二级结构及B细胞表位,为EV71疫苗研制提供理论基础.方法本研究将宁波地区EV71分离株与国内外EV71代表株进行同源性分析和并构建亲缘进化树.以VP1基因序列为材料,应用EX-PASY服务器上的GOR4、SOPMA两种方法分析预测蛋白质二级结构,并结合蛋白质的亲水性、柔韧性、表面可能性等指标综合评价VP1蛋白的B细胞抗原表位.结果同源性分析和亲缘进化分析得出,2010年宁波EV71分离株属于C4a基因亚型,与基因库检索到的C4a基因亚型代表株核苷酸和氨基酸同源性较高,分别为93.6％～99.3％和98.3％～100％.VP1蛋白二级结构以无规则卷曲和β-片层为主,有多处抗原指数较高的区段,结合亲水性、柔韧性、表面可能性等指标,综合预测VP1蛋白的B细胞抗原表位在第39～40、159～167、212～220、287～290位氨基酸残基的可能性较大.结论 EV71 VP1蛋白多个区段具有抗原潜力通过生物信息学方法预测VP1蛋白二级结构及B细胞表位为EV71疫苗研制提供理论基础.【期刊名称】《中国人兽共患病学报》【年(卷),期】2011(027)010【总页数】4页(P905-908)【关键词】肠道病毒71型;VP1;蛋白质二级结构;B细胞表位【作者】王锦;许国章;倪红霞【作者单位】宁波大学医学院,宁波 315211;宁波市疾病预防控制中心,宁波315010;宁波市疾病预防控制中心,宁波315010【正文语种】中文【中图分类】R373.2肠道病毒71型（Enterovirus 71，EV71）是小RNA病毒科（Picornaviridae）肠道病毒（Enterovirus，EV）A组成员，1969年由Schmidt等从美国加利福尼亚州患有中枢神经系统疾病的婴儿粪便标本中分离到。
肠道病毒71型衣壳蛋白VP1基因部分序列在大肠杆菌中的表达唐启慧;田新贵;林斌;向开军;周荣【期刊名称】《热带医学杂志》【年(卷),期】2008(8)1【摘要】目的克隆、表达和鉴定肠道病毒71型广州株EVGZ06VP1基因部分序列,为制备抗体和基因工程疫苗打下基础。
方法在成功克隆肠道病毒71型广州株EVGZ06全长VP1蛋白基因并测序的基础上,将部分VP1蛋白基因克隆到表达载体pET28a(+)上,构建了重组表达质粒pET28a(+)/(502～891)VP1,转化大肠杆菌BL21,IPTG诱导表达,利用Ni2+亲和层析柱对重组蛋白进行纯化,并用Western blotting和ELISA方法检测其抗原性。
结果重组蛋白在大肠杆菌中可以高效表达,SDS-PAGE显示其相对分子质量为19 000,与预计大小一致。
ELISA和Western blotting实验证实,重组蛋白具有良好的抗原性。
结论本研究成功克隆和表达了肠道病毒71型VP1基因部分序列,为肠道病毒71型诊断试剂和疫苗的开发等进一步的研究奠定了基础。
【总页数】4页(P15-18)【关键词】肠道病毒71型;VP1基因;克隆表达【作者】唐启慧;田新贵;林斌;向开军;周荣【作者单位】中国科学院南海海洋研究所;广州市儿童医院;广州华银医药科技有限公司【正文语种】中文【中图分类】R378.21【相关文献】1.肠道病毒71型衣壳蛋白VP1的原核表达和纯化及其抗原性和免疫原性的验证[J], 朱赟;李剑波;高孟;唐彩华;罗永能2.肠道病毒71型外壳蛋白VP1在大肠杆菌的表达和纯化 [J], 吴亚安;邓丽芬;龚雨婷;陈端萍;谢端;肖承荣;蔡陈珣;赵晓蓉3.肠道病毒71型外壳蛋白VP1全长在大肠杆菌中的高效表达及初步活性测定 [J], 张向颖;修冰水;毛群颖;姚昕;梁争论;张贺秋4.肠道病毒71型衣壳蛋白VP1研究进展 [J], 刘永娟;周井义;赵绍林;苗莉;张春艳;张婷;霍娟;杨自金5.肠道病毒71型外壳蛋白VP1在大肠杆菌中的表达 [J], 周世力;李琳琳;何雅青因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
肠道病毒71型SHZH03株VP1基因在毕赤酵母中的表达周世力;李琳琳;何雅青【期刊名称】《华中师范大学学报（自然科学版）》【年(卷),期】2007(041)002【摘要】利用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)方法扩增得到肠道病毒71型(EV71SHZH03)外壳蛋白VP1基因,经序列测定证实后,构建重组表达质粒VP1/pPIC9K,转化Pichia pastoris 酵母宿主菌Gs115,以Myc-Tag多克隆抗体作为一抗,利用双层滤膜法筛选酵母转化子.甲醇诱导表达.SDS-PAGE分析显示:表达产物的分子量约为30000,与天然VP1大小一致,ELISA实验表明,表达上清液可与EV71患者急性感染期血清呈阳性反应,表明重组蛋白VP1具有免疫原性.【总页数】4页(P259-262)【作者】周世力;李琳琳;何雅青【作者单位】江汉大学,医学与生命科学学院,武汉,430056;中国疾病预防与控制中心病,毒基因工程国家重点实验室,北京,100052;深圳市疾病预防与控制中心,广东,深圳,518001【正文语种】中文【中图分类】Q812【相关文献】1.肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型分离株的VP1基因特征分析 [J], 张建华;江炳福;程险峰;游贤惠;孟继鸿2.FMDV VP1基因与HSP70基因在毕赤酵母中的融合表达及免疫特性 [J], 苏春霞;段相国;王秀青;任雪枫;曹瑞兵;周斌;陈溥言3.肠道病毒71型SHZH03株VP1基因的进化分析 [J], 周世力;李琳琳;田波4.O型口蹄疫病毒VP1基因在毕赤酵母中的表达及免疫原性分析 [J], 焦颖;龚劲峰;何校澎;黄辉荣;刘德辉;张春红;吴锋;黄毓茂5.肠道病毒71型衣壳蛋白VP1基因部分序列在大肠杆菌中的表达 [J], 唐启慧;田新贵;林斌;向开军;周荣因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
广东农业科学Guangdong Agricultural Sciences 2024，51（3）：124-135 DOI:10.16768/j.issn.1004-874X.2024.03.012常鑫，蒋智勇，卞志标，徐民生，杨冬霞，杨傲冰，翟少伦. 一株高病毒载量PCV2毒株的基因组特征及［J］. 广东农业科学，2024，51（3）：124-135. CHANG Xin, JIANG Zhiyong, BIAN Zhibiao, XU Minsheng, YANG Dongxia, YANG Aobing, ZHAI Shaolun. Genome characterization and sequence analysis of porcine circovirus type 2 isolated with high viral load［J］. Guangdong Agricultural Sciences, 2024，51（3）：124-135.一株高病毒载量PCV2毒株的基因组特征及序列分析常 鑫1,2，蒋智勇2，卞志标2，徐民生2，杨冬霞2，杨傲冰3，翟少伦2（1.仲恺农业工程学院动物科技学院，广东 广州 510305；2. 广东省农业科学院动物卫生研究所/广东省畜禽疫病防治研究重点实验室/农业农村部兽用药物与诊断技术广东科学观测实验站，广东 广州 510640；3.广东永顺生物制药股份有限公司，广东 广州 511356）摘 要：【目的】了解广东省某猪群中猪圆环病毒2型（Porcine circovirus type 2，PCV2）流行毒株的遗传进化情况，丰富PCV2分子流行病学数据，为当地PCV2疫苗候选株的选用和研发提供参考。
【方法】使用qPCR方法对疑似PCV2的样品进行检测，发现1株具有高病毒载量的PCV2毒株，命名为GD222858。
通过PCR方法进行全基因组分子克隆及遗传进化分析。
２７２ Ａｐｐｌｉｅｄ Ｐｒｅｖ Ｍｅｄ，Ｏｃｔｏｂｅｒ ２０１ １，Ｖｏｌ １７ Ｎｏ．５
文章编号：１６７３—７８５Ｘ（２０１ １）ｏ５—０２７２—０５ 中图分类号：Ｒ ３７３．２ 文献标识码：Ａ
一株肠道病毒７１型广西分离株全基因序列分析 闭福银，谢镇国，陈敏玫，周开娇，康宁，居昱，莫兆军，谭毅 广西壮族自治区疾病预防控制中心（南宁５３００２８）
［摘要】目的了解肠道病毒７１型ＣＺ０１株的全基因组分子特征。方法应用覆盖病毒全基因组的１５对特异性 引物对毒株进行ＲＴ—ＰＣＲ扩增，ＰＣＲ产物直接测序，拼接后得到全基因序列，应用ＣｌｕｓｔａｌＸ（１．８１、ＤＮＡＳＴＡＲ、Ｍｅｇａ ４．１等生物软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析。结果ＣＺ０１株病毒全基因组核苷酸序列 长度为７ ４０６ｂｐ，与中国大陆北京毒株ＢＪ０８一ＺＯ１ １－４和安徽阜阳毒株Ｆｕｙａｎｇ．Ａｎｈｕｉ／１７．０８／２整个基因组核苷酸同源性为 ９８．８％和９８．５％，氨基酸同源性分别为９９．７％和９９．６％；与ＥＶ７１国际标准株ＭＳ／７４２３／８７和ＢｒＣｒ基因组核苷酸同源性仅 为８１．７％和８０．Ｏ％，氨基酸同源性为９５．６％和９４．９％。对外壳蛋白ＶＰ１编码区进行种系发生分析显示ＣＺ０１株为ｃ４亚型 的毒株。结论ＥＶ７１型病毒ＣＺ０１株全基因组的组成和结构符合肠道病毒特征，与其它ＥＶ７１型病毒具有相同的基因 组结构，ＣＺ０１株是ＥＶ７１型的Ｃ４亚型的毒株。 ［关键词】 肠道病毒；ＥＶ７１；全基因组；序列分析 Ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ ａｎ ｅｎｔｅｒｏｖｉｒｕｓ ７１ ｓｔｒａｉｎ ｉｓｏｌａｔｅｄ ｉｎ Ｇｕａｎｇｘｉ Ｐｒｏｖｉｎｃｅ ＢＩ Ｆｕ—ｙｉｎ，ＸＩＥ Ｚｈｅｎ－ｇｕｏ，ＣＨＥＮ Ｍｉｎ－ｍｅＬ ｅｔａ１．Ｇｕａｎｇ￣ｉＺｈｕａｎｇＡｕｔｏｎｏｍｏｕｓ Ｒｅｇｉｏｎ ＣｅｎｔｅｒｆｏｒＤｉｓｅａｓｅＰｒｅｖｅｎｔｉｏｎ ａｎｄ Ｃｏｎｔｒｏｌ，Ｎａｎｎｉｎｇ５３００２８，Ｃｈｉｎａ ［Ａｂｓｔｒａｃｔ】Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ Ｔｏ ｕｎｄｅｒｓｔａｎｄ ｔｈｅ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ａｎｄ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｅｎｔｅｒｏｖｉｒｕｓ ７１（ＥＶ７１）ｉｓｏｌａｔｅｄ ｉｎ Ｇｕａｎｇｘｉ Ｐｒｏｖｉｎｃｅ．Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｔｈｅ １５ ｐａｉｒｓ ｏｆ ｐｒｉｍｅｒ ｃｏｖｅｒｉｎｇ ｖｉｒａｌ ｇｅｎｏｍｅ ｗｅｒｅ ｕｓｅｄ ｔｏ ａｍｐｌｉｆｙ ｏｖｅｒｌａｐｐｅｄ ｇｅｎｅ ｆｒａｇｍｅｎｔｓ ｂｙ ＲＴ－ＰＣＲ ａｎｄ ｔｈｅ ｐｒｏｄｕｃｔｓ ｏｆ ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｗｅｒｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｄ ｄｉｒｅｃｔｌｙ．Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ｓｏｆｔｗａｒｅｓ ｗｅｒｅ ｕｓｅｄ ｔｏ ａｎａｌｙｚｅ ｔｈｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ，ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎｄ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅ ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ Ｃｌｕｓｔａｌ Ｘ（１．８），ＤＮＡＳｔａｒ， ａｎｄ Ｍｅｇａ（４．１）．Ｒｅｓｕｌｔｓ Ｔｈｅ ｆｕｌｌ—ｌｅｎｇｔｈ ｏｆ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｏｆ ＣＺＯ１ ｓｔｒａｉｎ ｗａｓ ７４０６ ｂｐｓ，Ｔｈｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｈｏｍｏｌｏｇｉｅｓ ｏｆ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｇｅｎｏｍｅｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ＣＺ０１ ｓｔｒａｉｎ ａｎｄ Ｂｅｉｊｉｎｇ ｓｔｒａｉｎ（ＢＪ０８－Ｚ０１ １－４）ａｎｄ Ａｎｈｕｉ Ｆｕｙａｎｇ ｓｔｒａｉｎ（１７．０８／２）ｗｅｒｅ ９８．８％ａｎｄ ９８．５％ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．ｗｈｉｌｅ ｔｈｅ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｈｏｍｏｌｏｇｉｅｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ｔｈｅｍ ｗｅｒｅ ９９．７％ａｎｄ ９９．６％ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．Ｔｈｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｈｏｍｏｌｏｇｉｅｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ＣＺ０１ｓｔｒａｉｎ ａｎｄ ｔｗｏ ｓｔａｎｄａｒｄ ｓｔｒａｉｎｓ ｆＭＳ／７４２３／８７ ａｎｄ ＢｒＣｒ）ｗｅｒｅ ｏｎｌｙ ８１．７％ａｎｄ ８０．０％ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ． ｗｈｉｌｅ ｔｈｅ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｈｏｍｏｌｏｇｉｅｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ｔｈｅｍ ｗｅｒｅ ９５．６％ａｎｄ ９４．９％ｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＶＰ１ ｃｏｄｉｎｇ ｒｅｇｉｏｎ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｔｈｅ ＣＺ０１ ｓｔｒａｉｎ ｗａｓ ｔｈｅ Ｃ４ ｓｕｂ－ｇｅｎｏｔｙｐｅ．Ｃｏｎｃｌｕｓｉｏｎ Ｔｈｅ ｇｅｎｏｍｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｏｆ ＣＺ０１ ｓｔｒａｉｎ ｗａｓ ｃｏｎｓｉｓｔｅｎｔ ｗｉｔｈ ｅｎｔｅｒｏｖｉｒｕｓ．ＣＺ０１ ｓｔｒａｉｎ ｗａｓ ｔｈｅ Ｃ４ ｓｕｂ—ｇｅｎｏｔｙｐｅ．ｂｅｌｏｎｇｉｎｇ ｔｏ ｅｎｔｅｒｏｖｉｒｕｓ ７ １ 【Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ］ Ｅｎｔｅｒｏｖｉｒｕｓ；ＥＶ７ １；Ｇｅｎｏｍｅ；Ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎａｌｙｓｉｓ
近年来肠道病毒７１型Ｈｕｍａｎ Ｅｎｔｅｒｏｖｉｍｓ ７１，ＥＶ７１） 在广西的流行呈上升趋势，不断在各个地区的儿童中 发生手足口病（Ｈａｎｄ—Ｆｏｏｔ—Ｍｏｕｔｈ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＨＦＭＤ）疫 情。为了解ＥＶ７１病毒在广西的流行和变异情况，本 实验室对ＥＶ７１型广西病毒株（ＣＺ０１）全基因组核苷酸 序列进行了测定分析，为广西ＥＶ７１病毒的流行病学 调查及手足口病的防控提供理论基础。 １材料与方法 １．１ 毒株及病例背景待测病毒株是２０１０年广西疾 病预防控制中心（ｃＤｃ）分离并保存的病毒株。毒株分 离自黄Ｘ×，男，２岁，散居儿童，２０１０年４月１９日 作者简介：闭福银（１９８０一），男（壮族），广西天等人，主管技师， 主要从事病毒性疾病的实验室研究工作。 发病，２０１０年４月２２日死亡，病例症状主要有发热 （３９．２℃）、心律失常，被医院诊断为病毒性脑炎。 １．２试剂ＲＮＡ提取试剂盒（ＱＩＡＧＥＮ Ｒｎｅａｓｙ Ｍｉｎｉ Ｋｉｔ）和ＲＴ－ＰＣＲ（ＱＩＡＧＥＮ（￣）ＯｎｅＳｔｅｐ ＲＴ－ＰＣＲ Ｋｉｔ）均购 自美国ＱＩＡＧＥＮ公司。 １．３引物来源引物序列参考文献 ，由上海生工生 物工程技术服务有限公司合成。 １．４￣－ＲＮＡ提取将细胞培养物反复冻融３次后， 取上清１００ Ｌ按ＲＮＡ提取试剂盒的说明书进行操作。 １．５ ＲＴ—ＰＣＲ反应体系 ５×ＱＩＡＧＥＮ ＯｎｅＳｔｅｐ ＲＴ—ＰＣＲ Ｂｕｆｆｅｒ １０ Ｌ，ｄＮＴＰｓ ２ Ｌ，ＱＩＡＧＥＮ ＯｎｅＳｔｅｐ ＲＴ—ＰＣＲ Ｅｎｚｙｍｅ Ｍｉｘ ２ Ｌ，Ｒｎｓｉｎ ０．２ Ｌ，Ｒｎａｓｅ—ｆｒｅｅ ｄｄＨ２０ ２８．８ Ｌ，Ｕｐｓｔｒｅａｍ ｐｒｉｍｅｒ １ Ｌ，Ｄｏｗｎｓｔｒｅａｍ ｐｒｉｍｅｒ １ Ｌ，Ｔｅｍｐｌａｔｅ ＲＮＡ ５ Ｌ。反应条件：５Ｏ℃ 应用预防医学２０１１年１０月第１７卷第５期 ３０ｒａｉｎ ９５℃１５ｍｉｎ，然后９４ｏＣ４５ｓ、５５℃４５ｓ、７２ｏＣｌｍｉｎ， ３５个循环，最后７２￣Ｃ１０ｒａｉｎ。ＰＣＲ产物送北京博迈德 科技发展有限公司测序。 １．６序列比对和进化分析核苷酸及氨基酸序列分 析和同源性比较利用ＤＮＡＳｔａｒ软件完成，进化树通过 ＭＥＧＡ４．１软件采用邻接法（Ｎｅｉｇｈｂｏｒ－ｊｏｉｎｉｎｇ）绘制，用 于比较分析的毒株序列来自ＧｅｎＢａｎｋ，见表１。
２结果 ２．１ ＥＶ７１病毒ＣＺ０１株全基因组序列测定分析经 过序列测定、拼接、比对并分析岳，获得ＥＶ７１病毒ＣＺ０１ 株的全基因组核苷酸序列，全长长度为７ ４０６ ｂｐ，其中 Ａ占２７．０７％，Ｇ占２３．９４％，Ｃ占２４－３３％，Ｔ占２４．６６％， 腺嘌呤核苷酸和尿嘧啶核苷酸丰富（Ａ＋ｕ＝５１．７３％）， ５’端非编码ｘＫ（５’ＵＴＲ）长７４３ｂｐ，病毒基因组在７４４～７ ３２５ 之间仅有一个开放阅读框（ＯＲＦ）全长６ ５８２个核苷 酸，编码２ １９４个氨基酸的多聚蛋白（Ｐｏｌｙｐｒｏｔｅｉｎ），３’端非 编码ｘＥ（３’ＵＴＲ）长８１ｂｐ。广西毒株ＣＺ０１基因组的组成 和结构符合肠道病毒的特征。毒株在编码区及非编 码区均没有核苷酸的缺失和插入。病毒基因组结构 符合肠道病毒的特征。 ２．２种系发生分析以Ｃｏｘ．Ａ１６作为外群，对ＥＶ７１ 病毒ＣＺ０１株与其他毒株的外壳蛋白ＶＰ１编码区进行 遗传进化分析（见图１），广西病毒株ＣＺ０１与Ｆｕｙａｎｇ． Ａｎｈｕｉ／１７．０８／２、ＢＪ０８一Ｚ０１１－４、ＧＸ／ＬＺ０８—０４／０８／ＣＨＮ、 ＥＶ７１／ＬａｎｚｈｏｕＯ１、 Ｚｈｅｊｉａｎｇ０８、 ＳＨＺＨ９８ 和 ３２５４－ＴＡＩ一９８集中在一个大分支上，属于ＥＶ７１病毒 Ｃ４亚型，与国际标准株ＢｒＣｒ和ＭＳ／７４２３／８７的进化关 系较远。 ２３病毒基因组核苷酸同源性比较ＥＶ７１病毒ＣＺ０１ 株与其他ＥＶ７１Ｃ４亚型毒株核苷酸同源性比较结果见 表２。从全基因组、５＇ＵＴＲ、编码基因、Ｐ１、Ｐ２、Ｐ３ 和３’ＵＴＲ的比较来看，ＣＺ０１与其他地区ＥＶ７１Ｃ４亚型 毒株核苷酸同源性均较高，但与云南分离株ＫＭ１８６／０９ 和ＫＭＭ０９的同源性相对较低，在８８．９％～９４．５％之间； 与１９９８年广东深圳分离株ＳＨＺＨ９８的同源性最低。 ２．４病毒编码蛋白氨基酸同源性比较 由核苷酸序 列推导的氨基酸序列同源性比较结果显示，ＣＺ０１与 其他地区毒株的同源性均较高，但与云南分离株 ＫＭ１８６／０９和ＫＭＭ０９的同源性相对较低；与１９９８年 广东深圳分离株ＳＨＺＨ９８的同源眭最低，仅为９５．８％。 见表３。
表１ 研究中相关比较的毒株 ２７３
